首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
相似文献
 共查询到19条相似文献,搜索用时 125 毫秒
1.
目的:检测丝裂原激活蛋白激酶4(MAP4K4)在胰腺癌中的表达及意义,并研究其对胰腺癌细胞增殖功能的影响。方法:检索GEPIA和Oncomine数据库,分析MAP4K4在胰腺癌以及正常胰腺组织中的表达;检索GEPIA和OncoLnc数据库,分析MAP4K4的表达量与胰腺癌患者生存期之间的关系。免疫组化检测MAP4K4在人胰腺癌及癌旁组织中的表达并分析其与胰腺癌患者临床病理参数的相关性以及生存分析。qRT?PCR和Western blot检测MAP4K4在人胰腺癌细胞株中的表达。慢病毒感染人胰腺癌细胞株CFPAC?1和MIA PaCa?2构建MAP4K4过表达及干扰细胞株,CCK?8和克隆形成实验研究其增殖能力变化。结果:GEPIA和Oncomine数据库显示MAP4K4在人胰腺癌中的表达显著高于正常胰腺组织(P<0.01)。GEPIA和OncoLnc数据库表明胰腺癌中高表达MAP4K4组患者的总体和无病生存期显著低于低表达组患者(P<0.01)。免疫组化表明MAP4K4在人胰腺癌组织中的表达高于癌旁组织并与肿瘤大小、肿瘤分化相关(P<0.05),生存分析提示MAP4K4高表达的胰腺癌患者生存时间显著低于MAP4K4低表达的患者(P<0.05)。MAP4K4过表达及干扰胰腺癌细胞株构建成功,过表达后胰腺癌细胞株增殖能力明显增加而干扰后显著降低(P<0.05)。结论:MAP4K4在胰腺癌中表达增高并与预后负相关,且促进胰腺癌细胞增殖。  相似文献   

2.
目的:探讨炭疽毒素受体2(anthrax toxin receptor 2,ANTXR2)在胰腺癌组织和细胞中的表达、临床意义和细胞功能,验证miR-145-5p在胰腺癌细胞中调控ANTXR2的作用机制。方法:分析GEO和TCGA数据库中胰腺癌的转录数据和临床数据。通过CCK-8实验、流式细胞术、划痕实验和Transwell实验进行细胞功能验证。采用miRNA靶点预测数据库反向预测可能通过ceRNA机制抑制ANTXR2表达的miRNA,并使用双荧光素酶报告实验进行验证。结果:ANTXR2在胰腺癌组织和细胞中的表达均上调(均P<0.05),ANTXR2上调预示着原发肿瘤等级(P<0.05)、肿瘤细胞分化等级(P<0.05)和总体生存期(P<0.05,HR=1.72)均较差。ANTXR2可以促进胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭(均P<0.05)。ANTXR2是miR-145-5p下游的靶标(P<0.01),miR-145-5p可以通过抑制ANTXR2的表达抑制胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭。结论:ANTXR2在胰腺癌组织和细胞中过表达,促进胰腺癌细胞增殖、迁移和侵...  相似文献   

3.
目的检测microRNA-107(miR-107)在肝癌中的表达及意义,并探讨其对肝癌细胞增殖能力的影响。方法利用公共基因 表达数据库(TCGA数据库和GEO数据库)中的肝癌microRNA表达谱数据库,分析miR-107在肝癌及癌旁的表达水平;收集22 例肝癌及其相应癌旁新鲜组织标本,qRT-PCR方法检测miR-107的表达水平;收集53例石蜡包埋的肝癌组织标本,qRT-PCR方 法检测miR-107表达水平并分析其在肝癌中的临床意义。在人肝癌细胞株Huh7中过表达或沉默miR-107,通过MTT方法检测 其对肝癌细胞增殖能力的影响。结果miR-107在肝癌组织中的表达显著高于其在癌旁组织中的表达,差异具有统计学意义 (P<0.05)。在肝癌组织中,miR-107与肿瘤大小呈正相关关系(P=0.032)。体外实验结果表明,过表达miR-107后肝癌细胞增殖 能力明显增强(P<0.0001),而沉默miR-107后细胞增殖能力明显降低(P<0.0001)。结论miR-107在肝癌中表达上调,其高表达 与肝癌细胞增殖密切相关,miR-107可能是一个与肝癌的发生发展相关的基因。  相似文献   

4.
目的: 利用生物信息学方法筛选结肠癌核心基因,并通过体外实验进行验证,挖掘潜在的结肠癌分子标志物。方法:从GEO数据库下载GSE23878、GSE37182和GSE74602数据集,应用R语言筛选结肠癌和癌旁组织的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),并对DEGs进行GO富集分析、KEGG信号通路分析。利用STRING数据库构建蛋白质相互作用(protein protein interaction, PPI)网络,采用Cytoscape软件筛选结肠癌核心基因。利用TCGA数据库验证核心基因表达及预后价值,采用细胞转染及MTT法进一步验证核心基因的功能。结果:3个数据集筛选出270个共有DEGs,GO富集分析显示DEGs参与生长负调控、细胞外基质组织、细胞外结构组织等生物学过程,KEGG信号通路分析DEGs主要富集于Wnt、NF-κB、细胞周期等信号通路。PPI筛选出11个核心基因。经GEPIA数据库验证,MYC、TIMP1、UBE2C、SOX9、AURKA、COL1A1、CDC20、TOP2A和CENPF在结肠癌中高表达,而CAV1和CXCL12低表达。进一步生存分析显示,AURKA高表达与结肠癌患者总体生存期呈正相关(P<0.05),TIMP1高表达与结肠癌患者总体生存期呈负相关(P<0.05),COL1A1高表达与结肠癌患者无病生存期呈负相关(P<0.05)。细胞转染及MTT实验结果显示,过表达AURKA、TIMP1可显著促进结肠癌细胞增殖。结论:筛选出可能参与结肠癌发生的11个核心基因,其中AURKA和TIMP1表达变化可能与结肠癌患者预后相关。  相似文献   

5.
摘要:目的 探讨鞘氨醇激酶1(sphingosinekinase1,Sphk1)在胰腺癌与正常胰腺及临近癌旁组织间的表达差异, 及其表达与临床预后和免疫细胞浸润水平的相关性,并在体外探索其对胰腺癌细胞增殖和迁移能力的影响。方法 利 用 TCGA、GEO 数据库分析胰腺癌、正常胰腺组织及胰腺癌旁组织中Sphk1的转录水平;Kaplan-MeierPlotter数据库分 析Sphk1表达量与胰腺癌患者预后的相关性;Cibersort数据库分析 Sphk1与胰腺癌组织免疫细胞浸润水平的关系; GSEA 软件分析挖掘Sphk1发挥功能的潜在机制。利用过表达质粒构建 Sphk1过表达的胰腺癌细胞系,应用 CCK8法 和平板克隆实验检测细胞增殖能力;Transwell实验检测细胞迁移能力。结果 Sphk1在胰腺癌组织中表达量显著高于 正常胰腺组织(P<0.05)和胰腺癌癌旁组织(P<0.01);与 Sphk1高表达组患者相比,低表达组具有更长的总生存期 [HR=1.91(1.13~3.22),Log-rankP=0.013]和无复发生存期[HR=2.88(1.26~6.58),Log-rankP=0.009];Sphk1 表达与肿瘤大小、临床分期及病理学分级相关;GSEA 分析显示:Sphk1显著富集于血管新生、上皮间质转化、缺氧、炎症 反应、NF-κB及代谢等通路;免疫浸润分析提示:Sphk1促进滤泡辅助性 T 细胞、调节性 T 细胞、未分化巨噬细胞和树突 状细胞浸润,抑制静息记忆 CD4+ T细胞、M1型巨噬细胞、静息态肥大细胞及单核细胞浸润;体外细胞实验显示:过表达 Sphk1可以显著增强 BxPC-3胰腺癌细胞的增殖和迁移能力。结论 过表达 Sphk1可以增强人胰腺癌细胞 BxPC-3的 增殖和迁移能力,其潜在机制可能是影响胰腺癌肿瘤免疫微环境。  相似文献   

6.
目的研究趋化因子CXCL14在骨肉瘤细胞和组织中的表达及其与患者预后的关系。方法利用RT-PCR、酶联免疫吸附
法(ELISA)和荧光定量PCR技术检测4种骨肉瘤细胞株及40对骨肉瘤及癌旁肌肉中CXCL14的表达,CCK8细胞增殖实验、克
隆形成实验观察CXCL14对U2OS细胞增殖的影响,免疫组化检测CXCL14在骨肉瘤组织中的表达,并运用Kaplan-Meier 法进
行生存分析。结果CXCL14在骨肉瘤细胞株中的表达均高于正常成骨细胞,而且其在骨肉瘤组织的表达也显著高于癌旁肌肉
组织(P<0.01)。干扰CXCL14表达能抑制U2OS的生长(P<0.05),经两条CXCL14干扰RNA处理后U2OS克隆形成率分别为
(4.93±0.25)%和(5.03±0.0.31)%,均显著低于阴性对照组(8.03±1.16)%,差异有统计学意义(P<0.05)。Kaplan-Meier生存分析
显示,CXCL14高表达的患者预后比低表达组差(P=0.02)。结论CXCL14在骨肉瘤中高表达,它能促进骨肉瘤细胞的增殖并与
患者不良预后相关,提示其可能成为潜在的治疗靶点。
  相似文献   

7.
目的:分析头颈部鳞状细胞癌中整合素α5(integrin α5,ITGA5)的表达与预后的相关性。方法:利用TCGA 数据库中头颈部鳞状细胞癌的RNA表达数据集和相应的临床随访信息,提取mRNA表达谱进行差异分析,并在GEO数据库中进一步验证。结果:通过TCGA表达谱数据分析发现ITGA5 mRNA在肿瘤组织中的表达明显高于正常组织,且Kaplan?Meier 分析显示ITGA5高表达组的患者总体存活时间明显缩短(P < 0.05)。在GEO数据库中验证后证实ITGA5 mRNA表达水平是1个独立的预后指标,对预测患者生存具有较好的敏感性和特异性。结论:ITGA5与头颈部鳞状细胞癌患者的生存预后密切相关,可能作为新的预后标志物。  相似文献   

8.
目的:探究ATP结合盒亚家族C成员4(ABCC4)基因在前列腺癌(PCa)中的表达,分析ABCC4对PCa肿瘤免疫微环境(TME)的影响。方法:使用GEO数据库中的GEO2R计算PCa与癌旁组织的差异表达基因。通过GEPIA2数据库探究ABCC4基因在PCa中的表达。将从UCSC Xena数据库下载的TCGA中的PCa数据分为ABCC4基因高、低表达组。使用clusterprofafiler R包进行GO分析和基因集富集分析(GSEA)。利用TISIDB数据库、ESTIMATE和CIBERSORT分析ABCC4基因表达与免疫指标的相关性。结果:PCa组织中ABCC4基因表达高于癌旁组织(P<0.05)。ABCC4高表达组PCa患者生存能力较差。在GSEA中,ABCC4低表达组中Th1和Th2细胞分化通路被激活,ABCC4基因可能在PCa的TME中起作用。TISIDB分析证实ABCC4基因表达与NK和T细胞丰度呈负相关关系(P<0.05)。ABCC4基因高表达与免疫检查点基因低表达有关。ESTIMATE和CIBERSORT分析表明,ABCC4基因表达可抑制PCa的免疫细胞浸润...  相似文献   

9.
摘要:目的运用RNA干扰(RNA inteference,RNAi)技术阻断胰腺癌细胞株PANC1中OCT4基因表达,并研究该基因沉默
后对细胞增殖与凋亡的影响。方法利用阳离子脂质体LipofectamineTM2000 将化学合成的人Octamer binding factor 4
(OCT4)的小干扰RNA转染入胰腺癌细胞株PANC1 中。RT-PCR法测定胰腺癌细胞内OCT4 mRNA的表达。Western
Blot测定OCT4、PARP。CCK8法测定细胞生长曲线观察细胞增殖的抑制情况。流式细胞仪测定细胞凋亡率的变化。结
果化学合成的人OCT4siRNA能有效地抑制PANC1细胞中OCT4的表达(P<0.05)。OCT4 siRNA组中细胞增殖减慢,凋
亡率较对照组明显增加(P<0.05)。干扰OCT4能够激活PARP的表达。结论体外实验初步证明OCT4基因在胰腺癌细
胞株增殖分化与凋亡方面扮演重要角色。通过沉默其表达可抑制胰腺癌细胞株PANC1增殖并诱导其凋亡。  相似文献   

10.
目的:研究死亡结构域相关蛋白(DAXX)在胃癌中的表达与定位,并探讨小泛素化修饰(SUMO)的DAXX对胃癌细胞恶性表型的影响。方法:生物信息学分析肿瘤基因图谱(TCGA)计划中DAXX在胃癌中的表达与预后;RT-qPCR检测各胃癌细胞系中DAXX的mRNA水平。收集2017 年1月至6 月温州医科大学附属第二医院育英儿童医院胃癌术后患者20 对癌和癌旁组织,免疫组化检测DAXX的表达。CCK-8 和划痕实验分别检测DAXX对细胞增殖和迁移的作用。Western blot检测DAXX的核-浆蛋白分布及其对SUMO-2/3的影响。结果:生物信息学分析显示,DAXX在胃癌中的表达水平高于癌旁组织,但其表达高低对患者生存预后无影响(P =0.52);免疫组化结果显示胃癌组织DAXX的阳性率高于癌旁,且在细胞核中高表达;RT-qPCR证实胃癌细胞系中DAXX的mRNA表达量升高。CCK-8 和划痕实验提示DAXX明显抑制细胞增殖(P <0.05)并促进细胞迁移(P <0.01)。Western blot显示DAXX核-浆蛋白分布差异,且存在SUMO-2/3修饰。结论:DAXX在胃癌组织中高表达,且主要定位于细胞核。DAXX可能通过与SUMO-2/3结合,抑制胃癌增殖和促进转移。  相似文献   

11.
目的: 研究低氧诱导条件下胰腺癌细胞中高迁移率族蛋白1(high mobility group box 1 protein,HMGB1)的分泌途径。方法: 经GEO和TCGA数据库分析HMGB1在胰腺癌样本中的表达;低氧处理胰腺癌PaTu8988细胞0,6,12,24,48 h,免疫印迹法检测培养上清液中HMGB1的含量;采用外泌体提取试剂盒分离常氧和低氧培养液中的外泌体,运用透射电镜观察外泌体膜结构,运用免疫印迹法检测外泌体中的HMGB1以及外泌体标志蛋白CD9、CD63、CD81以及HSP70的表达;利用免疫荧光法和激光扫描共聚焦显微镜观察HMGB1在PaTu8988细胞中的定位情况。结果: 数据库分析结果表明,与健康胰腺组织相比,HMGB1在胰腺癌组织中呈高表达(P<0.01),且高表达者生存期明显短于低表达者(P<0.05)。低氧处理48 h,细胞培养上清液中的HMGB1含量最多,明显高于6,12,24 h。透射电镜观察到培养上清液中有微囊泡结构,直径在100 nm左右,蛋白质免疫印迹法检测到外泌体膜标志蛋白CD9,CD63,CD81,HSP70的表达和外泌体中HMGB1的表达。免疫荧光结果显示,低氧情况下HMGB1和外泌体共定位增多。 结论: 低氧处理条件下,胰腺癌细胞中HMGB1可通过外泌体途径释放到细胞外。  相似文献   

12.
目的 检测Wnt5a基因在不同胰腺组织中的蛋白表达水平,探讨其在胰腺导管腺癌(pancreatic ductal adenocarcinoma,PDAC)发生中的作用,为胰腺癌的早期诊疗提供新线索。方法 免疫组化SP法检测Wnt5a在21灶正常胰腺导管(normal pancreatic duct,NP)、73灶胰腺上皮内瘤变(pancreatic intraepithelial neoplasia,PanIN)-1、29灶PanIN-2、16灶PanIN-3、20例胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(intraductal papillary mucinous neoplasm,IPMN)腺瘤(IPMN-adenoma,IPMA)、13例IPMN交界瘤(IPMN-borderline,IPMB)、19例IPMN黏液癌(IPMN-carcinoma,IPMC)及50例PDAC组织中的蛋白表达。分析Wnt5a的表达与PDAC患者临床病理特征及患者术后生存期的关系。结果 随着组织病变级别升高,Wnt5a表达逐渐增强,各组Wnt5a的免疫组化评分分别为NP (0)、PanIN-1 (1.90±1.192)、PanIN-2 (3.03±1.322)、PanIN-3 (4.88±1.455)、IPMA (1.40±0.940)、IPMB (2.62±1.502)、IPMC (3.00±1.374)、PDAC (3.11±2.635)。Wnt5a的表达与肿瘤的增殖活度、远处转移、TNM分期及患者术后生存期相关(P<0.05),Wnt5a高表达组、低表达组的中位生存期分别为15个月和21个月(P=0.015)。结论 Wnt5a参与了PDAC的发生、发展;Wnt5a表达增强是PDAC的早期事件;Wnt5a的持续表达和过度表达影响了胰腺癌的增殖、侵袭和转移过程,并预示患者预后不良。  相似文献   

13.
目的 探讨长链非编码RNA (long non-coding RNA,LncRNA) LOC100506123对胰腺癌细胞增殖及迁移的影响.方法 采用实时定量PCR (qRT-PCR)技术检测胰腺癌组织及细胞系(AsPC-1、BxPC-3、Panc-1、CFPAC-1,以正常胰腺导管上皮细胞HPDE为对照)中LOC 100506123的表达情况.并通过siRNA技术下调LOC 100506123表达,构建siRNA经Lipofectamine 2000TM脂质体转染细胞(对照组为siR-NC,实验组为siR-1、siR-2),采用CCK-8、Transwell小室实验分别检测胰腺癌细胞增殖和转移能力.结果 ①LncRNA LOC100506123在胰腺癌组织及细胞系中表达显著升高(P<0.05).②下调LOC 100506123表达,胰腺癌细胞的增殖及迁移能力显著降低(P<0.05).结论 高表达的LncRNALOC100506123能促进胰腺癌细胞的增殖及迁移.  相似文献   

14.
目的:观察甾醇O-酰基转移酶1(SOAT1)在肝细胞癌(HCC)组织及癌旁组织中的表达,探索其与患者预后及临床病理特征之间的相关性。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库收集HCC数据集,下载SOAT1 mRNA表达谱及预后资料,比较SOAT1 mRNA在50例正常肝组织与374例HCC组织中的表达,分析表达量与患者预后相关性。收集53例HCC患者石蜡组织标本,采用免疫组织化学方法检测癌和癌旁组织中SOAT1的蛋白表达水平,并分析其与临床病理特征之间的相关性。结果:TCGA数据库数据分析显示,与癌旁正常组织比较,SOAT1在HCC中表达显著升高(P<0.01)。预后生存分析发现SOAT1高表达患者的5年生存率较低(P< 0.05)。免疫组织化学结果显示,与癌旁组织相比,HCC组织中SOAT1蛋白表达量显著升高(P<0.05)。癌组织中SOAT1蛋白表达量与肿瘤临床分期及微血管癌栓形成相关(P<0.05)。结论:SOAT1在HCC组织中表达增高,并与HCC癌患者的临床病理特征密切相关,其表达与肿瘤恶性程度高度相关。  相似文献   

15.
目的探讨转录因子SOX12在肺腺癌中的表达及其与临床预后的关系。方法采用大型癌症基因组数据库分析SOX12在 肺腺癌中的表达水平,然后分别采用免疫组织化学(IHC)和半定量PCR方法检测36例肺腺癌癌组织、15例距肿瘤边缘5 cm以 上癌旁正常组织和21例正常肺组织中SOX12 的表达情况,同时通过Kaplan-Meier Plotter 数据库获取了866例肺腺癌患者和 675例肺鳞癌患者的生存数据,分析SOX12基因表达水平对患者总生存期(OS)和进展后生存期(PPS)的影响。结果TCGA数 据库和GEO(GSE40419)样本集提示SOX12的表达水平在肺腺癌组中显著高于癌旁组(P<0.001),同时IHC和半定量PCR结果 均显示SOX12 在肺腺癌组织中的表达高于癌旁正常组织和正常肺组织,差异具有统计学意义(P<0.001);分析Kaplan-Meier Plotter数据库显示SOX12基因表达水平高的肺腺癌患者较表达水平低的患者OS和PPS短,差异具有统计学意义(P<0.05);而 SOX12基因表达水平对肺鳞癌患者的OS和PPS均无明显影响。结论转录因子SOX12在肺腺癌组织中呈明显高表达水平,且 其表达水平与患者的生存和预后关系密切,SOX12可能成为预测肺腺癌发生发展的辅助指标。  相似文献   

16.
目的: 探讨叉头框C2(forkhead box C2,FOXC2)在胰腺癌中的表达及其与胰腺癌患者预后的相关性。方法: 利用Oncomine数据库分析FOXC2 mRNA在胰腺癌及癌旁组织中的表达;收集112例胰腺患者癌组织及相应癌旁组织,采用qRT-PCR和免疫组织化学染色检测FOXC2的表达,并分析其与临床病理参数的关系。应用Kaplan-meier法分析FOXC2表达对患者生存时间的影响。结果: Oncomine数据库中FOXC2 mRNA在胰腺癌癌组织中表达明显高于癌旁组织(tBadea=4.074,tPei= 3.741,P均<0.05);FOXC2蛋白主要表达于胰腺癌细胞胞核,且癌组织免疫组化评分明显高于癌旁组织( t=7.571,P<0.05);FOXC2 mRNA在胰腺癌组织中表达明显高于癌旁组织( t=13.79,P<0.05);有淋巴结转移的癌组织中FOXC2阳性表达率高于无淋巴结转移的癌组织(χ 2 =16.998,P<0.01),胰腺癌Ⅲ期FOXC2阳性表达率高于Ⅰ期( χ 2=15.688,P<0.001)和Ⅱ期( χ 2=10.678,P=0.001)。FOXC2阳性组胰腺癌患者的中位生存时间显著短于阴性组( χ 2=10.32,P=0.001 3),FOXC2阳性表达(HR=2.569,P=0.003)可作为预测胰腺癌预后的独立因素。 结论: FOXC2在胰腺癌组织中呈高表达,且与胰腺癌患者的预后高度相关。  相似文献   

17.
目的研究miR-431-5p对胰腺癌细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的影响和潜在的分子机制。方法qRT-PCR检测人正常胰腺上皮细胞hTERT-HPNE和胰腺癌细胞CFPAC-1和PANC-1中miR-431-5p表达水平。转染miR-431-5p模拟物至胰腺癌CFPAC-1细胞中过表达miR-431-5p后,MTT法测定细胞增殖活性,Transwell检测细胞迁移和侵袭,流式细胞术检测细胞凋亡,Western blotting检测细胞中Cyclin D1、p21、Bax、Bcl-2、E-cadherin、MMP-2和丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)蛋白表达。双荧光素酶报告基因实验验证miR-431-5p与AKT1的调控关系。结果与hTERT-HPNE细胞相比,胰腺癌细胞PANC-1和CFPAC-1中miR-431-5p表达量降低(P < 0.05)。过表达miR-431-5p后,CFPAC-1细胞活性、迁移和侵袭细胞数降低,凋亡率升高,Cyclin D1、Bcl-2和MMP-2蛋白表达水平降低,p21、Bax和E-cadherin蛋白表达水平升高,差异均有统计学意义(P < 0.05~P < 0.01)。双荧光素酶报告基因实验结果显示,miR-431-5p在CFPAC-1细胞中靶向负调控AKT1表达。同时过表达miR-431-5p和AKT1后,CFPAC-1细胞活性、迁移和侵袭细胞数升高,凋亡率降低,Cyclin D1、Bcl-2和MMP-2蛋白表达水平升高,p21、Bax和E-cadherin蛋白表达水平降低,差异均有统计学意义(P < 0.05)。结论miR-431-5p通过靶向抑制AKT1降低胰腺癌CFPAC-1细胞的增殖、迁移和侵袭能力,并促进细胞凋亡,可能是胰腺癌的潜在分子治疗靶点。  相似文献   

18.
目的 本研究的目的是探讨长链非编码RNAlinc00460在胃癌中的作用及其与胃癌患者临床病理特征和预后的关系。方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)胃癌数据集系统评估linc00460的差异表达。然后,纳入88名接受胃癌手术的患者采用实时定量PCR验证TCGA结果。检测胃癌细胞株和正常人胃上皮细胞中linc00460的表达情况。采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)方法预测linc00460的调控基因。将AGS细胞分别转染linc00460过表达质粒(pcDNA-linc00460)和阴性对照序列(pcDNA3.1),分别采用Western Blot检测相关蛋白表达和CCK-8法检测两组细胞的增殖情况。结果 我们发现并证实linc00460在胃癌组织和细胞中显著高表达(P < 0.05);高linc00460表达与患者M分期相关;linc00460表达与胃癌患者总生存期之间存在强烈的负相关(P < 0.05);且Cox比例风险模型的单变量和多变量分析证实其为胃癌相关独立生存预测因子(P < 0.05)。linc00460高表达样本富集了linc00460高表达样本富集到P53类介质对DNA损伤反应信号转导的调控(P=0.002)、P53类介质对信号转导的正向调节作用(P<0.001)、细胞分裂的正向调节(P<0.001)、核分裂的正向调节(P=0.002)等基因集。AGS细胞过表达质粒pcDNA-linc00460转染组中linc00460表达水平显著高于pcDNA3.1组,差异有统计学意义(P<0.05)。Western Blot检测结果表明linc00460可下调P53蛋白表达,上调Bcl-2和Cyclin B1表达。CCK-8结果表明pcDNA- linc00460组AGS细胞增殖指数均显著高于pcDNA3.1组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 linc00460在胃癌组织中高表达,且其高表达的患者预后较差,linc00460可能通过上调P53信号通路促进胃癌细胞生长,linc00460可能参与了胃癌的恶性进展。  相似文献   

19.
目的:检测SOX7基因在胰腺癌细胞株中的表达及其启动子区的甲基化状态,初步探讨两者之间的关系?方法:采用RT-PCR检测SOX7基因在胰腺癌细胞株BXPC-3?CFPAC-1?PANC-1和SW1990中的表达水平?重亚硫酸盐测序PCR(bisulfite sequencing PCR,BSP)和结合重亚硫酸盐的限制性内切酶法 (combined bisulfite restriction analysis,COBRA)检测启动子区域甲基化状态?采用去甲基化药物5-氮杂胞苷(5-aza-2-adeoxycytidine,5-aza-dC)处理各细胞株后,检测SOX7基因的mRNA表达和甲基化状态变化?结果:在胰腺癌细胞株BXPC-3?CFPAC-1中SOX7基因的mRNA呈阳性表达,而在PANC-1和SW1990中SOX7基因表达沉默;与BXPC-3?CFPAC-1相比,PANC-1和SW1990中SOX7基因启动子区甲基化率较高?经过去甲基化处理后,PANC-1与SW1990中SOX7启动子区的甲基化率下降,基因重新表达?结论:胰腺癌细胞株PANC-1和SW1990中的SOX7基因表达与启动子区甲基化状态有关,启动子区的高甲基化导致PANC-1? SW1990中SOX7基因的表达沉默?  相似文献   

设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号