基于生物信息学分析胰腺导管腺癌中SPP1的表达与预后的关系及其作用机制

目的 探讨分泌磷蛋白1 (SPP1)在胰腺导管腺癌中的表达与预后的关系及其作用机制。方法 应用高通量基因表达数据库（GEO）、基因表达谱动态分析（GEPIA）数据库,挖掘分析胰腺导管腺癌中SPP1的表达情况,并应用Kaplan-Meier Plotter数据库进行生存分析,通过DAVID及STRING在线分析SPP1可能参与调控的信号通路,构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。采用免疫组化方法检测56例胰腺导管腺癌和39例正常胰腺导管组织中SPP1的表达情况。采用Kaplan-Meier法进行生存分析。结果GEPIA及GEO数据库中与正常对照组织比较,胰腺导管腺癌中SPP1呈现高表达（P <0.01）。免疫组化结果显示SPP1在胰腺导管腺癌中的阳性表达率显著高于正常胰腺导管组织（P <0.01）,并且与胰腺导管腺癌的分化程度相关（P <0.05）,组织分化程度越低,SPP1阳性表达率越高（r=0.338,P <0.05）。Kaplan-Meier Plotter及GEPIA数据库生存分析结果显示,与SPP1低表达患者比较,SPP1高表达胰腺癌患者的总生存时间显著减少（...     

ARL4C在睾丸生殖细胞肿瘤中的表达及临床意义

目的:探讨ADP-核糖基化因子-4C（ARL4C）在睾丸生殖细胞肿瘤（TGCT）中的表达及其临床意义。方法:收集GEPIA数据库及天津医科大学第二医院2015-2019年睾丸生殖细胞肿瘤病人临床及病理信息，探索ARL4C在睾丸生殖细胞肿瘤中的表达情况及其对预后的影响，免疫组化、RT-qPCR及Western验证，通过STRING数据库寻找其可能的作用机制。结果:与正常组织相比，ARL4C在胆管癌、多形性胶质母细胞瘤、肾透明细胞癌、急性髓系白血病、肺鳞状细胞癌、卵巢浆液性囊腺癌、胰腺癌、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤、胃腺癌、睾丸生殖细胞肿瘤、胸腺瘤、子宫内膜癌等多种恶性肿瘤中均呈现高表达状态（均P＜0.05），在睾丸生殖细胞肿瘤中生存分析显示高表达ARL4C的患者生存时间减少（P＜0.05），GEPIA数据库提示ARL4C与DIRAS1有相互作用，相关系数为0.45（P＜0.05）。免疫组化验证DIRAS1在睾丸生殖细胞肿瘤中呈现低表达状态。结论:ARL4C在睾丸生殖细胞肿瘤中高表达，且其高表达与预后不良相关。     

TRIM21与胰腺癌临床病理特征及免疫浸润的相关性分析

目的：探讨三结构域蛋白家族成员21(tripartite motif 21,TRIM21)在胰腺癌中的表达及其与临床病理特征、预后及免疫浸润的关系。方法：应用Oncomine与GEPIA数据库分析TRIM21在胰腺癌中的mRNA表达水平;利用基因富集分析（gene set enrichment analysis,GSEA）预测TRIM21可能参与的信号通路;TIMER数据库分析TRIM21在胰腺癌中的表达水平与免疫细胞浸润丰度的相关性,并通过Kaplan-Meier Plotter数据库进行验证;免疫组织化学染色（immunohistochemistry,IHC）检测TRIM21在87例胰腺癌组织及36例癌旁组织中的蛋白水平,并分析其与临床病理特征、预后的关系。结果：TRIM21在胰腺癌组织中明显高表达,且与患者无复发生存时间负相关（P=0.041）;GSEA分析证实TRIM21参与胰腺癌患者免疫相关信号通路;TIMER数据库分析显示胰腺癌中TRIM21表达水平与B细胞（P=7.87e-06）、CD8+T细胞（P=1.18e-04）、巨噬细胞（P=1.43e-02）、中性粒细胞（P=2...     

蛋白激酶CI的表达与胰腺癌的相关性分析

目的 研究蛋白激酶CI(PRKCI)在胰腺癌组织中的表达,阐明其对胰腺癌的诊断及预后的作用,并进一步分析PRKCI与肿瘤微环境中免疫细胞浸润的相关性。方法 利用Oncomine、GEPIA、HPA和CCLE数据库分别分析PRKCI在胰腺癌组织和细胞系中的表达,利用GEPIA分析PRKCI的表达与胰腺癌患者预后的关系,利用String数据库分析与PRKCI相互作用的蛋白,利用TIMER研究PRKCI的表达与肿瘤纯度和免疫细胞浸润的相关性。结果 胰腺癌组织中PRKCI mRNA和蛋白的表达水平均高于癌旁正常胰腺组织,且PRKCI在胰腺癌细胞系中呈高表达。PRKCI高表达的胰腺癌患者的总生存期和无病生存期明显低于低表达患者(P<0.01),且与胰腺癌患者的分期显著相关。与PRKCI相互作用的蛋白有CDC42、NUMB、SQSTM1等,主要参与炎症反应、蛋白质磷酸化等过程。胰腺癌中PRKCI的表达与CD4⁺T细胞数目、PD-L1基因和CTLA-4基因的表达呈负相关性。结论 PRKCI在胰腺癌中呈高表达,PRKCI mRNA的表达水平与患者的预后和免疫细胞浸润显著相关,其可能成为治疗胰腺癌的潜在靶点。     

MUC4和ErbB2在胰腺癌中的表达及临床意义

目的 探讨MUC4和ErhB2在胰腺癌中的表达及临床意义。方法 免疫组化SP法检测60例胰腺癌．12例慢性胰腺炎及8例正常胰腺组织标本中MUC4和ErbB2蛋白的表达。结果 MUC4和ErbB2在胰腺癌中的表达率较慢性胰腺炎及正常胰腺组织均明显升高（P＜0．01）；ErbB2随胰腺癌病理分化程度的降低．阳性表达率逐渐增高（P〈0．05）；MUC4和ErbB2在临床Ⅲ～Ⅳ期胰腺癌中的表达率均明显高于Ⅰ～Ⅱ期（P〈0．05），在伴淋巴结转移的39例胰腺癌患者中的表达率亦较无淋巴结转移者明显升高（P＜0.05或P＜0.01）。结论 MUC4可能是一个特异的胰腺癌肿瘤相关标志物．与ErbB2共同在胰腺癌的发生、发展中发挥重要作用。     

基于数据挖掘分析KIF2C在肝细胞癌的表达及临床意义

目的：通过数据挖掘分析肝细胞癌中KIF2C基因的表达并探讨其临床意义。方法：使用Oncomine和GEPIA数据库分析KIF2C在肝细胞癌组织中的表达情况;通过GEPIA数据库进行KIF2C的表达程度与病理分级及肝细胞癌生存期的相关性分析;最后利用STRING数据库分析与KIF2C相互作用的蛋白。结果：通过Oncomine和GEPIA数据库分析显示,在mRNA水平上,KIF2C在肝细胞癌中显著高表达（P=0.000）,表达水平与其预后为负相关（P=0.000）,且肝癌病理分级越高,KIF2C表达水平越高。通过STRING数据库分析显示与KIF2C相关的蛋白有PLK1、AURKB、CENPA等。结论：通过对肿瘤基因数据库进行挖掘发现,KIF2C在肝细胞癌组织中明显高表达且与患者预后相关,为肝细胞癌的致病机制研究和抗肿瘤靶向治疗提供了理论支持。     

基于Oncomine数据库及生物信息学方法分析KIF11在浆液性卵巢癌中的表达及临床意义

目的：探究驱动蛋白家族成员11(KIF11)在浆液性卵巢癌中的表达及临床意义。方法：应用Oncomine、GEPIA数据库分析KIF11 mRNA在卵巢癌与正常卵巢中的表达情况;应用Kaplan-Meier Plotter分析KIF11表达水平与卵巢癌预后的关系;应用免疫组化法检测89例浆液性卵巢癌组织及26例正常卵巢组织中KIF11蛋白表达水平,分析KIF11蛋白表达水平与卵巢癌患者临床病理特征的相关性。结果：Oncomine数据库示,浆液性卵巢癌组织中KIF11 mRNA的表达高于正常卵巢组织（P<0.05）。GEPIA数据库示,KIF11 mRNA在卵巢癌中高表达（P<0.05）。Kaplan-Meier Plotter分析示,KIF11高表达组卵巢癌患者的总生存期（OS）、无进展生存期（PFS）低于低表达组（P<0.05）。免疫组化示,KIF11蛋白在浆液性卵巢癌中高表达率高于正常卵巢（P<0.05）,浆液性卵巢癌中KIF11高表达与淋巴结转移（P=0.001）、FIGO分期（P=0.005）及组织分级（P=0.002）有关。结论：KIF11 mRNA及...     

PARP14在胰腺癌中的表达及生物学功能研究

目的：检测PARP14在胰腺癌中的表达及意义,并探讨其对胰腺癌细胞生物学功能的影响。方法：利用人类肿瘤相关的基因表达汇编（gene expression omnibus, GEO）和癌症基因组图谱（the cancer genome atlas, TCGA）中的胰腺癌基因表达谱数据,分析PARP14在胰腺癌及癌旁中的表达差异,并进一步通过TCGA数据库分析PARP14表达量与总体生存期和无病生存期的关系（Kaplan-Meier法和Log-rank检验）。在人胰腺癌细胞株BXPC-3和CFPAC-1中干扰PARP14后,分别通过CCK8增殖实验和集落形成实验检测其对胰腺癌细胞增殖能力的影响。结果：GEO数据显示PARP14在胰腺癌组织中的表达显著高于其在癌旁组织中的表达,差异具有统计学意义（P<0.001）。TCGA数据表明胰腺癌中高表达PARP14组患者的总体生存期显著低于低表达组的患者（P<0.05）。体外实验表明,干扰PARP14后,胰腺癌细胞增殖能力明显降低（P<0.05）。结论：PARP14在胰腺癌中高表达并与预后负相关,且其高表达与胰腺癌细胞增殖能力相关,PARP14可能成为胰腺癌预后预测及治疗的靶点。     

胃癌组织神经元再生相关蛋白的表达及临床意义研究

目的探讨神经元再生相关蛋白（NREP）在胃癌组织中的表达及临床意义。方法选取2021年3月至8月在宁波市医疗中心李惠利医院接受D2根治术的20例胃癌患者的胃癌组织和对应的癌旁正常组织作为研究标本,采用在线生物信息数据库（Oncomine、GEPIA、Ualcan数据库）分析胃癌组织NREPmRNA的表达。采用基因芯片分析胃癌组织差异表达基因以验证NREPmRNA表达情况。采用人类蛋白质图谱（HPA）分析胃癌组织NREP蛋白的表达。免疫组化检测胃癌组织和癌旁正常组织NREP蛋白的表达。采用Kaplan-Meierplotter数据库分析胃癌患者NREPmRNA表达与预后的关系。结果Oncomine、GEPIA、Ualcan数据库分析显示,胃癌组织NREPmRNA表达水平高于癌旁正常组织（P＜0.05）。基因芯片分析发现NREPmRNA在胃癌组织中高表达,其表达水平比癌旁正常组织高至少2.8倍（P＜0.05）。胃癌组织NREP蛋白高表达比例高于癌旁正常组织（P＜0.05）。多因素分析显示,NREP高表达是胃癌患者预后不良的独立危险因素之一（P＜0.05）。NREPmRNA低表达胃癌患者总生存时间、无进展生存时间均优于高表达胃癌患者（均P＜0.05）。结论NREP在胃癌组织中高表达,且其高表达与患者预后不良密切相关。NREP或可成为评估胃癌预后和指导治疗的生物标志物。     

胰腺癌组织中硫酸软骨素蛋白多糖4的表达及其临床意义

目的 探讨硫酸软骨素蛋白多糖4(chondroitin sulfate proteoglycan 4,CSPG4)在胰腺癌(pancreatic carcinoma)中的表达及其临床意义.方法 收集2007年6月至2010年6月西南医院肝胆外科的胰腺导管腺癌及正常胰腺组织(距肿瘤边缘＞2 cm)标本各160例,其中男性124例,女性36例;年龄33～75(56.98±10.75)岁.应用免疫组织化学染色法检测其中CSPG4的表达,分析CSPG4的表达与临床病理参数的相关性;采用Kaplan-Meier法分析胰腺癌中CSPG4的表达与患者预后的关系,Cox回归模型分析胰腺癌患者预后的影响因素.结果 胰腺导管腺癌组织中CSPG4的阳性表达率显著高于正常胰腺组织(46.25％ vs 10.00％,P＜0.01).胰腺癌中CSPG4的表达与有无淋巴结转移或血管侵犯、肿瘤T分期、TNM分期显著相关(P＜0.01).胰腺癌中CSPG4阳性表达患者术后总生存率显著低于阴性表达者(P＜0.01).CSPG4的表达是影响胰腺癌患者预后的独立危险因素之一(P＜0.01).结论 CSPG4在胰腺导管腺癌中异常高表达,其表达水平是评估患者预后的独立预测指标,提示CSPG4可能成为胰腺癌治疗的一个新靶点.     

4'-氯-4"-苄氧基-保泰松的合成

目的:研究保泰松氯化物的合成方法.方法:以对氯苯胺为原料,经过重氮化偶合、苄基化、锌粉还原和环合反应合成4' -氯-4'-苄氧基-保泰松.结果:经红外、核磁和质谱证实.最终所得化合物为4'-氯-4'-苄氧基-保泰松,合成总收率达29.6%.结论:该方法操作简单,反应条件温和,有利于工业化生产.     

4-氨基-4-甲基哌啶二对甲苯磺酸盐的合成

目的 合成二肽基肽酶4抑制剂ABT-279和K-579的重要中间体4-氨基4-甲基哌啶二对甲苯磺酸盐.方法 以4-哌啶甲酸乙酯为原料,经N-Boc保护、烷基化、酰胺化、Hofmann降解和N-Boc脱保护5步反应,制备得4-氨基4-甲基哌啶二对甲苯磺酸盐.结果 4-哌啶甲酸乙酯为原料合成目标化合物的总收率为49.5%....     

3－碘－苯并吡喃－4－酮与2－硫代－6－氧代嘌呤的反应

３－碘－苯并吡喃－４－酮（Ⅰ）与２－硫代－６－氧代嘌呤发生Ｍｉｃｈａｅｌ加成反应，合成了２－（２－羟基苯甲酰）－５－氧代嘌呤并［１，２－ｂ］噻唑。化合物的结构经元素分析、核磁共振谱、红外光谱和质谱予以证实。     

4-取代氨基甲酰胺基-4-脱氧-4′-去甲基表鬼臼毒素衍生物的合成及其抗肿瘤活性

根据鬼臼毒素类化合物C_4位氮取代衍生物构效原理,设计并合成了11个4-取代氨基或烃氧甲酰胺基表鬼臼毒素类似物。从鬼臼毒素出发,经溴代、水解、叠氮化、还原以及酰化等六步反应合成标题化合物。体外抗肿瘤活性试验表明这类化合物具有较为显著的生物活性,多数化合物对L1210白血病肿瘤细胞与KB细胞生长抑制活性超过临床用药依托泊甙。     

4-取代氨基甲酰胺基-4-脱氧-4′-去甲基表鬼臼毒素衍生物的合成及其抗肿瘤活性

根据鬼臼毒素类化合物C_4位氮取代衍生物构效原理,设计并合成了11个4-取代氨基或烃氧甲酰胺基表鬼臼毒素类似物。从鬼臼毒素出发,经溴代、水解、叠氮化、还原以及酰化等六步反应合成标题化合物。体外抗肿瘤活性试验表明这类化合物具有较为显著的生物活性,多数化合物对L1210白血病肿瘤细胞与KB细胞生长抑制活性超过临床用药依托泊甙。     

3－乙酰苯并吡喃的合成

由邻羟基苯乙酮合成３－二甲氨基－１－（２－羟基苯基）－１－丙烯酮，在与乙酸酐反应得３－乙酰苯并吡喃－４－酮。经元素分析，＇ＨＮＭＲ，ＭＳ等证实其分子结构。     

编者·作者

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3─碘─苯并吡喃─4─酮与2─硫代胞嘧啶的反应

根据具有α·β不饱和羰基的３─碘─苯并吡喃─４─酮对Ｍｉｃｈａｅｌ加成反应有良好反应活性的特点，利用３─碘─苯并吡喃─４─酮与２─硫代胞嘧啶反应合成出新的化合物，经元素分析，＇ＨＮＭＲ，（１３）ＣＮＭＲ，ＭＳ等证实其分子结构。     

IL-4与IL-10调控CD4+ T细胞CXC趋化性细胞因子受体4的研究

目的研究IL-4和IL-10对CD4+ T细胞上CXC趋化性细胞因子受体4（CXCR4）表达的调控。方法采用流式细胞术,实时定量逆转录PCR（RT-PCR）,细胞因子的趋化性分析以及Scatchard分析法检测CXCR4和CXCR4 mRNA。结果 IL-4和IL-10能够显著上调或下调CD4+ T细胞上CXCR4的表达。SDF-1诱导的CD4+ T细胞趋化性同样也受到IL-4和IL-10的调控。IL-4和IL-10能分别上调或下调CD4+ T细胞中CXCR4的mRNA表达。在新鲜分离的CD4+ T细胞上只存在一种亲和力的CXCR4（Kd 6.3 nmol*L-1）。而IL-4刺激的CD4+ T细胞存在两种不同亲和力的CXCR4（Kd1 4.4 nmol*L-1和Kd2 14.6 nmol*L-1）。IL-4和IL-10通过环腺苷酸和环鸟苷酸双重信号途径对CD4+ T细胞上CXCR4表达的调控与Ca2+激活刺激无关。IL-4和IL-10可能是通过CD26来调控CXCR4在CD4+ T细胞上的表达。结论 IL-4和IL-10对CXCR4-SDF-1受体-配体对的调节,在HIV侵袭和炎症感染进程有关的细胞因子环境中起着重要作用。     

3-碘-苯并吡喃-4-酮与2-巯基苯并咪唑的反应

具有-不饱和羰基的3-碘-苯并吡喃-4-酮对Michael加成反应有良好反应活性。利用2-巯基苯并咪唑亲核试剂合成出新的3-碘-苯吡喃-4-酮衍生物。