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目的 筛选与胃癌预后存在关联性的微小RNAs(miRNAs)生物标志物,构建风险评分模型用于患者预后评估。 方法 基于人类癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据库下载胃癌miRNAs表达谱数据及样本相关临床信息,通过“DESeq2”软件包对miRNAs表达谱进行差异分析。采用单因素Cox回归分析和Kaplan-Meier生存分析筛选与预后存在关联性的miRNAs,并将预后miRNAs纳入多因素Cox回归分析用于预后风险评分模型的构建。通过“timeROC”软件包绘制受试者工作特征曲线(ROC),对模型效能进行评价。最后通过在线数据库对miRNAs可能结合的信使RNAs(mRNAs)进行预测,并通过基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)预测其功能。 结果 以log2 | Fold Change |>1,P<0.05为标准,筛选得到248个胃癌组织中差异表达的miRNAs。通过单因素Cox回归分析及Kaplan-Meier生存分析筛选到6个与患者总体生存率有关联性的差异表达的miRNAs,随后使用多因素Cox回归分析成功构建胃癌miRNAs预后风险评分模型,风险评分=0.048 35×miR-181b-1 +0.112 06×miR-548d-1+0.068 00×miR-675+0.075 87×miR-708+1.175 21×miR-4640+0.089 89×miR-4709。Kaplan-Meier生存曲线结果显示,风险评分高的患者预后较差(P<0.001);模型5年总体生存率ROC曲线下面积(AUC)为0.776,证明该模型能够有效预测胃癌患者预后风险。GO和KEGG功能分析结果显示,模型miRNAs分子参与多个肿瘤相关代谢通路。 结论 成功构建了miRNAs预后风险评分模型,且该模型对胃癌患者生存状态具有良好的预测效能。 相似文献
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目的 通过构建快速、灵敏的凝血酶检测技术,为多种血管栓塞性疾病,如脑静脉窦血栓形成(cerebral venous sinus thrombosis,CVST)的早期诊断和治疗提供新的策略。方法 利用所筛选的高特异性凝血酶适配体设计发夹结构变构探针,用于高特异性识别凝血酶并将凝血酶信号转化为核酸信号。在变构探针识别凝血酶后,适配体结合凝血酶引发变构探针变构,暴露Cas12a活性部分。CRISPR-Cas12a系统识别活性部分后,其反式切割特性被触发,开始无序切割周围存在的单链DNA荧光探针,导致标记在荧光探针两端的荧光基团(Cy3)和淬灭基团(BHQ)分离,使处于被淬灭状态的Cy3荧光重新出现。所产生的荧光信号的强度与体系中存在的凝血酶浓度呈正相关。结果 通过荧光实验证实所设计的变构探针对凝血酶表现出极高的识别特异性和稳定性;在所优化的实验条件下,该方法表现出良好的检测性能,检测限为0.23 pmol/L。结论 该方法结合了高灵敏度、低成本和良好的便携性等优点,为凝血酶相关疾病的检测与精准诊断提供了强有力的技术支持。 相似文献
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王传新 《山东大学学报(医学版)》2018,56(10):18-23
外泌体是一种直径为50~200 nm的双层脂质包裹体结构,可携带多种蛋白质、脂质及核酸,在细胞间信息传递中发挥重要作用,其作为一种新型生物标志物已成为近年临床关注的热点。研究发现,肿瘤细胞分泌的外泌体在肿瘤免疫、血管生成、肿瘤微环境调节等肿瘤发生发展过程中均扮演重要角色,并有可能成为药物的天然载体用于肿瘤治疗。随着蛋白组学、基因组学等技术的发展,外泌体的生物学特点和功能研究进一步深入,外泌体提取及检测技术不断进步,为肿瘤临床诊断与治疗提供了新的思路和契机。 相似文献
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目的 获得针对CA50靶点的高亲和力、高特异性抗体,建立体外诊断CA50检测试剂盒,提高肿瘤诊断的特异性和灵敏度。 方法 PCR 技术获得单链抗体( ScFv)基因并克隆入pcomb3XSS噬粒载体,通过电转化获得ScFv噬菌体抗体库。用CA50特性识别表位LST a(唾液酸化-乳糖-N-四糖a)的抗原淘洗筛选,获得针对CA50靶点的特异性抗体基因序列。随机挑选克隆测序,验证ScFv抗体库的多样性。利用重叠PCR技术获得人鼠嵌合抗体基因,经过抗体表达纯化及配对筛选建立双抗体夹心法CA50检测试剂盒。同时收集临床诊断阳性样本54例和临床阴性对照样本146例,利用该研究建立的CA50检测试剂盒与罗氏CA50试剂盒进行平行对照,评价其检测相关性。 结果 建立噬菌体抗体库的容量为2.5×108,具有较好的多样性。24个PCR鉴定阳性克隆测序,结果为20个正确插入且插入序列均不相同。经过3轮淘洗筛选出5个阳性克隆,经过抗体配对筛选建立的CA50试剂盒临床样本检测结果与罗氏的临床相关性(r=0.98)。 结论 通过噬菌体展示抗体库技术成功筛选出了针对CA50的高特异性、高亲和力抗体,为CA50检测在相关肿瘤辅助诊断中的应用提供可能性。 相似文献
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目的 探究N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)调控因子甲基转移酶样蛋白3(methyltransferase-like 3,METTL3)在结直肠癌奥沙利铂(oxaliplatin,OXA)耐药中的作用。方法 采用浓度梯度法构建OXA耐药细胞株HCT116/OXA,CCK-8分析其耐药性;采用Dot blot及m6A RNA甲基化定量ELISA实验检测细胞RNA m6A水平,RNA-seq及qRT-PCR筛选差异m6A调控因子,Western blot验证METTL3表达水平;利用腺病毒感染技术在HCT116细胞过表达METTL3,CCK-8检测各组细胞的增殖活性;通过对GEO数据库中HCT116细胞敲除METTL3的MeRIP-seq和RNA-seq数据与耐药细胞RNA-seq联合分析,筛选耐药相关的METTL3介导m6A修饰调控的下游靶基因及信号通路;TCGA数据库分析METTL3与患者预后的相关性。结果 HCT116/OXA细胞对OXA的耐药性明显高于其亲代细胞(P<0.01);与HCT116相比,耐药细胞的RNA m6A水平异常上调(P<0.01),且伴随METTL3的mRNA和蛋白水平升高;过表达METTL3明显增强HCT116细胞对OXA的耐药性(P<0.01);多组学数据联合分析筛选的METTL3介导m6A修饰调控的与耐药相关的关键基因主要富集在ABC转运蛋白、干细胞多能性调节信号通路、TGF-β信号通路等;METTL3高表达与结直肠癌患者的不良预后明显相关(P<0.01)。结论 METTL3介导的m6A修饰可能通过调节ABC转运蛋白、调节干细胞多能性的信号通路、TGF-β信号通路等经典耐药信号通路促进结直肠癌OXA耐药。 相似文献
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目的观察血浆血栓调节蛋白(TM)、凝血酶-抗凝血酶复合物(TAT)、组织型纤溶酶原激活物-纤溶酶原激活物抑制剂复合物(t-PAIC)、纤溶酶-α_2纤溶酶抑制剂复合物(PIC)4项指标与肺癌病情发展及手术疗效的关系。方法采用化学发光酶免疫法测定山东大学第二医院2016年9月至2017年12月158例肺癌患者[非小细胞肺癌(NSCLC)患者113例,小细胞肺癌(SCLC)患者45例]、53例肺良性疾病患者及60例健康对照者血浆TAT、TM、t-PAIC、PIC水平,分别比较肺癌组、肺良性疾病组与健康人对照组,肺癌组有或无转移组,以及肺癌患者手术前后组上述4项指标的差异。结果肺癌组血浆TAT、TM、t-PAIC、PIC水平均高于肺良性疾病组和健康人对照组(P均0.01),但肺良性疾病组与健康人对照组比较差异均无统计学意义(P均0.05);肺癌转移组血浆TAT、TM、t-PAIC、PIC水平均高于无转移组(P均0.01或P均0.05),其中SCLC组有或无转移组血浆t-PAIC水平差异未见统计学意义(P0.05);肺癌手术后7~10 d血浆TAT、TM、t-PAIC、PIC水平均较术前下降,差异均有统计学意义(P均0.001)。结论肺癌患者血浆TAT、TM、t-PAIC、PIC水平升高,4项血栓分子标志物可能与肺癌病情进展有关。 相似文献
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摘要:目的:观察血浆血栓调节蛋白(TM)、凝血酶-抗凝血酶复合物(TAT)、组织型纤溶酶原激活物-纤溶酶原激活物抑制剂复合物(t-PAIC)、纤溶酶-α2纤溶酶抑制剂复合物(PIC)4项指标与肺癌病情发展及手术疗效的关系。 方法:采用化学发光酶免疫法测定山东大学第二医院2016年9月至2017年12月158例肺癌患者[非小细胞肺癌(NSCLC)患者113例,小细胞肺癌(SCLC)患者45例]、53例肺良性疾病患者及60例健康对照者血浆TAT、TM、t-PAIC、PIC水平,分别比较肺癌组、肺良性疾病组与健康人对照组,肺癌组有或无转移组,以及肺癌患者手术前后组上述4项指标的差异。 结果:肺癌组血浆TAT、TM、t-PAIC、PIC水平均高于肺良性疾病组和健康人对照组(P均<0.01),但肺良性疾病组与健康人对照组比较差异均无统计学意义(P均>0.05);肺癌转移组血浆TAT、TM、t-PAIC、PIC水平均高于无转移组(P均<0.01或P均<0.05),其中SCLC组有或无转移组血浆t-PAIC水平差异未见统计学意义(P>0.05);肺癌手术后7~10 d血浆TAT、TM、t-PAIC、PIC水平均较术前下降,差异均有统计学意义(P均<0.001)。 结论:肺癌患者血浆TAT、TM、t-PAIC、PIC水平升高,4项血栓分子标志物可能与肺癌病情进展有关。 相似文献
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目的 筛选健康对照与不同进展期胰腺癌患者的血清外泌体差异蛋白质,绘制差异蛋白质表达图谱,并分析差异蛋白质参与的生物学过程。 方法 采用非标记定量蛋白质组学进行外泌体蛋白质检测,筛选差异蛋白质并进行生物信息学分析;利用蛋白免疫印迹对与胰腺癌进展相关的蛋白质进行血清学验证。 结果 在对照组、胰腺癌未转移组和转移组样品中共检测到2 242个蛋白质。通过不同分组差异蛋白质分析,共鉴定出664个差异具有统计学意义的蛋白质,主要参与囊泡介导转运、局灶黏附、细胞外基质(ECM)受体相互作用等信号通路。此外,鉴定到在3组间差异均有统计学意义的蛋白质5个,验证发现富亮氨酸α2糖蛋白1(LRG1)在胰腺癌转移组外泌体中表达量较高。 结论 对照组、胰腺癌未转移组和转移组间蛋白质表达存在差异,差异蛋白质主要富集于局灶黏附、细胞外基质受体相互作用等信号通路,且在3组间表达均有差异的外泌体蛋白质LRG1可能成为监测胰腺癌进展的血清学标志物。 相似文献
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可穿戴传感技术因其无创、便携等特征被广泛用于生物医学领域,尤其是对检验医学生物标志物的监测发挥重要作用。随着可穿戴传感技术从传统刚性结构到柔性贴片的发展,其灵敏度、特异性、稳定性、实用性等性能获得极大提升。本文就可穿戴传感技术在检验医学中的应用与挑战进行综述,分析其在葡萄糖、电解质等小分子监测中的优势与不足,展望其未来发展方向,为推动检验医学新技术发展提供参考。 相似文献