毛囊闭锁三联征一家系致病基因精细定位研究

目的 对1例毛囊闭锁三联征家系进行连锁分析精细定位研究,确定其致病基因位点.方法 应用覆盖1号染色体1p21.1～1q25.3区域的17个微卫星标记对该家系进行基因分型、连锁分析和单倍型分析.结果 在1号染色体上的微卫星标记DIS2 707处获得最大LOD值为2.11(重组率θ=0.00).通过单倍型分析将该家系致病基因定位在微卫星标记D1S2 715和D1S484之间的染色体1q21.3～1q23.2区域.结论 该研究提示1p21.1～1q25.3(61.8cM)是毛囊闭锁三联征致病基因连锁区域,并将致病基因支持连锁范围缩小至1q21.3～1q23.2(9.8 cM)区域.     

毛囊闭锁三联征伴Dowling-Degos病一家系致病基因定位研究

目的：通过对一家系4代毛囊闭锁三联征患者进行致病基因连锁分析定位研究,定位毛囊闭锁三联征家系致病基因,探索毛囊闭锁三联征遗传学发病机制。方法：收集毛囊闭锁三联征伴发Dowling-Degos病家系成员血样并提取DNA,作角蛋白5基因扩增和直接测序;选取覆盖1p21.1～1q25.3区域的12个微卫星标记,应用CEQ8800测序仪对该家系个体样本进行微卫星标记的基因分型,利用Linkage软件（5.2 Version）进行连锁分析。结果：该家系成员中未发现角蛋白5基因突变;在染色体1p21.1～1q25.3区域上的微卫星标记处均获得小于－2的LOD值（重组率θ=0.00）。结论：该毛囊闭锁三联征伴发Dowling-Degos病家系与1p21.1～1q25.3区域不存在连锁,毛囊闭锁三联征可能存在遗传异质性。     

一个先天性甲状腺功能亢进症家系的排除性定位分析

目的 对一个常染色体显性遗传的先天性甲状腺功能亢进症家系,进行与已知致病基因TSHR和THRB的连锁分析以确定此家系致病基因是否为这2个已知基因.方法 选择3个与TSHR和THRB紧密连锁的微卫星标记物D14S74、D3S2338和D3S1266,进行微卫星标记的基因连锁分析,采用Genemapper 3.5软件分析数据. 结果 3个微卫星标记物的LOD值均小于1,显示该家系致病基因与这3个位点均不连锁,提示该家系可能存在新致病基因. 结论 常染色体显性遗传类型的先天性甲状腺功能亢进症可能有新致病基因.     

遗传连锁分析法对一常染色体显性遗传性视网膜色素变性家系的基因定位研究

目的：对一个常染色显性遗传性视网膜色素变性（autosomal dominant retinitis pigmentosa,ADRP)大家系进行基因定位。方法：收集ADRP家系，对该家系成员进行详细眼科检查确诊为视网膜色素变性（retinitis pigmentosa,RP），采集外周血3－5ml并抽提DNA；采用多个已知遗传标记与该家系致病基因位点进行连锁分析。结果：两点连锁结果显示该家系致病基因位点与遗传标记1D3S1292连锁，在θ=0.1时得到最大LOD分数2．73。结论：由于D3S1292位于3号染色体长臂21区（3q21)，从而将该家系致病基因位点大致定位于3q21附近。     

应用遗传连锁分析法对伴传导功能障碍的扩张型心肌病家系致病基因的定位

目的: 对一个常染色体显性遗传扩张型心肌病(familial dilated cardiomyopathy,FDCM)家系进行基因定位。方法: 收集FDCM 家系, 对该家系成员进行详细心血管内科检查确诊为扩张型心肌病,且伴发有传导功能障碍;采集外周血3～5 mL,并抽提基因组DNA;选取与该表型相关的已定位区间CMD1A(1q21.2-q21.3),CMD1H(2q14-q22), CMD1E(3p22-p25)和CMD1F(6q22-23)内的共计18个微卫星DNA标记,在该家系中进行排除性定位分析;最后,进行全基因组扫描及连锁分析。结果：①已定位区间的18个微卫星DNA标记位点的LOD值均<-2,证实该家系与已知DCM位点不连锁;②全基因组扫描及两点连锁分析结果显示,该家系致病基因位点与遗传标记D3S1614(3q26)连锁, 在θ= 0时得到最大LOD值2.68。结论: 该家系与已知的4个DCM位点均不连锁,其致病基因位于D3S1614（3q26）附近的一个新位点。     

一个单纯性下颌前突家系的遗传研究

目的对一个中国汉族单纯性下颌前突家系进行遗传研究,为找到其致病机制奠定基础。方法先对这一单纯性下颌前突家系的遗传模式进行判断,再根据侯选区域法,对1p36、6q25、19p13．2、1p22．1、3q26．2、11q22、12q13．13、12q23区域利用微卫星位点进行基因分型,并用Linkage和Genehunter等软件对基因分型的结果进行参数和非参数连锁分析,分析此次实验家系的下颌前突致病基因是否存在于这些侯选区域。结果此家系共21人,有11例患者,其中10例是直系家属,5例男性患者,5例女性患者。该家系在1p36,6q25,19p13．2,1p22．1,3q26．2,12q13．13,12q23区域分析结果LOD值均小于0。而在11q22区域,微卫星位点D1IS1886与D11S4206之间（遗传距离为3．1cm）,LOD值分别为0．59和0．63,NPL值分别为1．18、1．19。结论该汉族单纯性下颌前突家系为单基因遗传。最有可能的遗传模式为常染色体显性或不完全外显性遗传。中国汉族可能存在其他未报道过的基因位点,拟下一步做全基因组扫描确认。     

一个疑似X连锁型视网膜色素变性家系的遗传连锁分析的研究

目的对一个疑似X连锁型视网膜色素变性(X-linked retinitis pigmentosa,XLRP)家系进行分析,确定其致病基因的所在位点。方法选取已知XLRP候选基因附近的微卫星位标,用多点参数分析方法计算其最大优势对数值(LOD score),并通过对家系成员单倍型分析,确定该家系致病基因所在的染色体位置。结果位于X染色体长臂的微卫星标记DXS8043与该例遗传家系间最大LOD值小于-2,其他位于X染色体短臂的11个微卫星标记与该例遗传家系LOD值保持在0.5上下,无明显的高值。单倍型结果表明该家系中2例患者兄弟(Ⅲ1、Ⅲ6)和他们的携带者母亲(Ⅱ2)在DXS8051与DXS1214之间拥有在正常成员中不存在的基因型,表明该基因型与疾病共分离,进一步确定了他们X性连锁遗传模式,并且可将致病基因初步定位于DXS8051与DXS1214之间的RP23和RP6基因。结论可以排除该例家系的致病位点与X染色体长臂上的RP24基因的连锁,高度怀疑连锁位点存在于X染色体的短臂的RP23和RP6基因,需另增加位标的信息量,以进一步缩小致病基因所在的具体范围。     

一常染色体显性遗传寻常型鱼鳞病家系致病基因的定位

目的 研究一常染色体显性遗传寻常型鱼鳞病家系的致病基因。方法 采用基因组扫描方法,利用1号染色体上的微卫星标记对该家系进行连锁分析,然后对候选基因FLG的部分编码区及外显子与内含子交界处进行突变检测。结果 在D1S2696得到最大两点连锁LOD值3．46（0=0）,单体型分析将疾病基因定位在D1S2726-D1S305之间约15cM范围内;在FLG基因的外显子非重复序列及部分重复序列未发现与疾病相关的突变。结论 该寻常型鱼鳞病家系的致病基因位于D1S2696附近,其致病基因可能是除FLG以外的其他基因。     

第九届国际皮肤科学大会学术精粹(二)

遗传性皮肤病 目前因遗传因素而罹患的皮肤病有300多种,许多遗传性皮肤病的致病基因已定位,有的致病基因已经被克隆并了解其相关产物。遗传性对称性色素异常症是一种以肢端对称分布色素沉着和色素减退斑为特征的常染色体显性遗传病,在日本人和中国人中较常见。安徽医科大学用覆盖染色体1q11-q21区域的高密度的微卫星多态标记对两个中国汉族遗传性对称性色素异常症的家系进行基因分型、连锁分析和单倍型分析,将该病的致病基因缩小在1号染色体上9.4cm区域     

甘肃地区一遗传痉挛性截瘫家系致病基因的定位

目的：对中国甘肃地区一个常染色体显性遗传痉挛性截瘫家系致病基因的初步定位研究．方法：用常见的常染色体显性遗传痉挛性截瘫的3个基因区域内的10个微卫星位点D14S264、D14S75、D14S69、D14S266、D14S66、D2S2347、D2S2255、D2S2351，D15S128、GABRB3对该家系致病基因进行等位基因共享分析及连锁分析．结果：该家系致病基因在SPG4基因区域的D2S2351位点连锁(θ=0，最大LOD值为2．71)．结论：该家系致病基因在SPG4基因座，疾病基因是spastin．     

Chromosome 14q may harbor multiple tumor suppressor genes in primary glioblastom a multiformec

目的：评价染色体14q的（杂合性）丢失是否与原发性多形性胶质母细胞瘤的发生发展有关,并确定14q上可能存在的共同杂合性丢失区域。方法：应用聚合酶链反应（PCR）为基础的微卫星分析方法,采用14个荧光标记的多态性（微卫星）标记,检测了20例原发性多形性胶质母细胞瘤（GBM）染色体14q的杂合性丢失（LOH）状况。结果：50％（10/20例）GBM在染色体14q上至少有一个微卫星标记存在LOH,其中5个病例的所有被检测标记都表现为LOH或不能提供信息。在位于14q32.1的D14S65位点、14q23-31的D14S63-D14S74位点间区域检测到的LOH率最高,分别为57.1％、46.7％-47.1％。在本研究中的所有位点,均未检测到微卫星不稳定。结论：染色体14q上的等位基因丢失可能在GBM发病机制中起着重要作用,14q32.1上的D14S65位点、14q23-31上的D14S63-D14S74位点间区域可能存在与GBM相关的多个肿瘤抑制基因。     

A missense mutation S228P in the CRYBB1 gene causes autosomal dominant congenital cataract

Background Congenital cataract is a highly heterogeneous disorder at both the genetic and phenotypic levels. This study was conducted to identify disease locus for autosomal dominant congenital cataracts in a four generation Chinese family. Methods Family history and clinical data were recorded. All the members were genotyped with microsatellite markers which are close to the known genetic loci for autosomal congenital cataracts. Two-point Lod scores were obtained using the MLINK of the LINKAGE program package （vet 5.1）. Candidate genes were amplified by polymerase chain reaction （PCR） and direct cycle sequencing. Results The maximum Lod score of Zmax=2.11 was obtained with three microsatellite markers D22S258, D22S315, and D22S1163 at recombination fraction θ= 0. Haplotype analysis showed that the disease gene was localized to a 18.5 Mbp region on chromosome 22 flanked by markers D22S1174 and D22S270, spanning the β-crystallin gene cluster. A c.752T→C mutation in exon 6 of CRYBB1 gene, which resulted in a heterozygous S228P mutation in predicted protein, was found to cosegregate with cataract in the family. Conclusions This study identified a novel mutation in CRYBB1 gene in a Chinese family with autosomal dominant congenital cataract. These results provide strong evidence that CRYBB1 is a pathogenic gene for congenital cataract.     

散发性结直肠癌3号染色体等位基因杂合缺失

目的 了解散发性结直肠癌（SCRC）3号染色体等位基因杂合缺失（LOH）发生情况。探讨其与临床病理特征间的关系,并对3号染色体上可能的SCRC相关基因进行初步定位。方法 用覆盖3号染色体的13个微卫星标记对83例散发性结直肠癌进行LOH扫描分析。结果 3号染色体至少有两个位点发生LOH者占39%（29/74）,3p所选4个位点中至少有一个发生LOH者占37%（27/74）,3q所选9个位点中至少有一个发生LOH者占53%（39/74）。整条染色体上以D3S1300（3q14.2)位点LOH率最高,达54%（23/43）。3qLOH在远端结直肠癌较近端高发,3q及D3S1300LOH阳性肿瘤多表现为浸润型生长和局部侵犯,并多发于大于50岁的老年患者。结论 3号染色体存在散在分布及区域性高频等位基因LOH,并与SCRC临床病理资料相关,提示其上SCRC相关基因的存在。高频LOH位点D3S1300的发现,提示3p14.2附近区域的FHIT基因可能作为肿瘤抑制基因在结直肠癌的发生发展中发挥作用。     

人肺腺癌染色体8p21～p22杂合性缺失精细作图

目的　在染色体 8p2 1 8p2 2界定发生于中国人肺腺癌的杂合性缺失 (LOH)的最小区域 ,为定位克隆肺腺癌相关抑癌基因提供线索。方法　利用 32例肺腺癌患者肿瘤组织检测位于 8p2 1～p2 2的 17个微卫星多态性标记的LOH频率 ,并且探讨各位点LOH与病理分级和临床分期的关系。结果　在 32例肺腺癌患者组织中有 31例 (96 6 7% )存在至少 1个位点的LOH ;主要集中于 3个区域 :位于 8p2 2的D8S2 5 4～ 2 6 1、D8S182 7～ 1731以及D8S1135。所检测位点中仅D8S2 6 1位点的LOH发生频率与肺腺癌分期呈正相关 (P <0 0 5 )。结论　 8p2 2区域可能存在位于D8S2 5 4～ 2 6 1,D8S1135和D8S182 7～ 1731的、与中国人肺腺癌相关的抑癌基因     

Allele loss on chromosome 9q22.2-22.3 in sporadic basal cell carcinoma in Chinese

ＯｂｊｅｃｔｉｖｅＴｏｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｔｈｅｒｏｌｅｏｆａｌｅｌｅｌｏｓｓｏｎｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ９ｉｎｔｈｅｐａｔｈｏｇｅｎｅｓｉｓｏｆｂａｓａｌｃｅｌｃａｒｃｉｎｏｍａ（ＢＣＣ）ｂｙｅｘａｍｉｎｉｎｇｔｈｅｌｏｓｓｏｆｈｅｔｅｒｏｚｙｇｏｓ...     

Chromosome 6q deletion mapping in human ovarian tumor, a common deletion region between D6S1649 and D6S311

Objective： To explore the loss of heterozygosity（LOH） on chromosome 6q in ovarian cancer, and localize a minimum area in deletion region. Methods： 93 ovarian tumors were analyzed for LOH studies with 10 microsatellite markers spanning chromosome 6q. To further localize a minimum area in deletion region. Nineteen microsatellite markers were used to refined a minimum area. Results： Forty three tumors （46%） were demonstrated allelic losses, which spanned less than two megabase areas, franked by a distal marker D6S311 and a proximal marker D6S1649, and likely harbored ovarian tumor suppressor gene （s）. With analysis of density of LOH, increased DNA copy number at loci of 6q was demonstrated between D6S1649 and D6S311. Conclusion： It is possible that duplication after the allelic loss might be a main mechanism that leads to carcinogenesis in ovarian tumor. The refinement of these candidate tumor suppressor genes loci might facilitate future loss of heterozygosity studies and enable the isolation of candidate genes from this region.     

食管鳞状细胞癌 5q23.1-q23.2杂合性丢失的研究

[目的] 分析食管癌 5号染色体长臂上 5q23.1 q23.2区域的杂合性丢失,为食管癌候选抑癌基因定位缩小范围.[方法] 用 PCR银染技术,检测 50例配对食管鳞状细胞癌标本 6个微卫星标记的杂合性丢失情况.[结果] 在检测的微卫星标记中,D5S471和 D5S592杂合性丢失率高达 47%和 41%.[结论] D5S471和 D5S592附近可能存在食管癌的候选抑癌基因.     

High frequency loss of heterozygosity in the region of the DBH locus in bladder cancer

Ｂｌａｄｄｅｒｃａｒｃｉｎｏｍａｉｓｔｈｅｆｏｕｒｔｈｍｏｓｔｃｏｍｍｏｎｃａｎｃｅｒｗｉｔｈａｒｉｓｉｎｇｉｎｃｉｄｅｎｃｅａｎｄｔｈｅｌｅａｄｉｎｇｃａｕｓｅｏｆｄｅａｔｈｉｎｍｅｎ Ａｐｐｒｏｘｉｍａｔｅｌｙ 70 %ｏｆｎｅｗｔｕｍｏｒｓａｒｅｓｕｐｅｒｆｉｃｉａｌ,ａｎｄｈａｖｅａｇｏｏｄｐｒｏｇｎｏｓｉｓ Ｔｈｅｒｅｍａｉｎｉｎｇ 30 %ａｒｅｍｕｓｃｌｅ ｉｎｖａｓｉｖｅｗｉｔｈａｐｏｏｒｐｒｏｇｎｏｓｉｓ 1 　Ａｎｕｍｂｅｒｏｆｃｙｔｏｇｅｎｅｔｉｃａｎｄｍｏｌｅｃｕｌａｒａｎａｌｙｓｅｓｈ…     

A novel candidate locus on chromosome 11p14.1-p11.2 for autosomal dominant hereditary spastic paraplegia

Background Hereditary spastic paraplegia （HSP） is a group of inherited neurodegenerative disorders with the shared characteristics of slowly progressive spasticity and weakness of the lower limbs. Thirteen loci for autosomal dominant HSP have been mapped. Methods A Chinese family with HSP was found in the Shandong province and Inner Mongolia Autonomous Region of China and genomic DNA of all 19 family members was isolated. After exclusion of known autosomal dominant loci, a genome wide scan and linkage analysis were performed. Results The known autosomal dominant loci of SPG3A, SPG4, SPG6, SPG8, SPG9, SPG10, SPG12, SPG13, SPG17, SPG19, SPG29, SPG31 and SPG33 were excluded by linkage analysis. The results of a genome wide scan demonstrated candidate linkage to a locus on chromosome 11 p14.1-p11.2, over an 18.88 cM interval between markers D11 S1324 and D11 S1933. A maximal, two point LOD score of 2.36 for marker D11S935 at a recombination fraction （e） of 0 and a multipoint LOD score of 2.36 for markers D11S1776, D11S1751, D11S1392, D11S4203, D11S935, D11S4083, and D11S4148 at θ=0, suggest linkage to this locus. Conclusion The HSP neuropathy in this family may represent a novel genetic entity, which will facilitate discovery of this causative gene.