尼洛替尼和伊马替尼对慢性粒细胞 白血病表达谱的影响

目的 探索尼洛替尼和伊马替尼对慢性粒细胞白血病（CML）细胞基因表达谱的影响,阐明酪氨酸 激酶抑制剂（TKI）抑制白血病的分子机制。方法 从在线基因表达数据库中下载表达谱数据集GSE19567, 利用BRB-ArrayTools 软件进行质量控制并筛选差异表达基因（DEGs ）,然后分别对差异基因进行GO 功能 富集分析、KEGG 通路富集分析、pathway 互作网络和基因互作网络分析。结果 共筛选出差异基因519 个, 其中177 个上调表达,342 个下调表达。GO 富集分析发现DEGs 主要涉及小分子代谢、血液凝固、转录调控、 细胞增殖与凋亡调控等生物过程,发挥的分子功能集中在蛋白结合、蛋白二聚化、序列特异性DNA 结合和 ATP 结合等。KEGG 富集分析发现代谢通路、PI3K-Akt 信号通路、Jak-STAT 信号通路和HIF-1 信号通路 等pathway 显著富集。网络分析挖掘出的核心基因有SHMT 2、CBS 、CTH 、HK 2,核心pathway 包括MAPK 信号通路、细胞周期和细胞凋亡等。结论 酪氨酸激酶抑制剂影响了CML 细胞代谢通路和信号转导通路的相 关基因,通过细胞周期阻滞和诱导凋亡等机制抑制白血病,为白血病的靶向治疗提供了基础。     

干扰LINC00308促进miR-634对前列腺癌细胞增殖与凋亡的影响

【摘要】 目的 研究干扰长链非编码RNA（lncRNA）LINC00308是否通过促进微小RNA（miRNA） 634影响前列腺癌细胞的增殖与凋亡。 方法 实时荧光定量PCR（qRT PCR）检测前列腺癌组织中LINC00308的表达。利用LINC00308小干扰RNA（si LINC00308）转染前列腺癌细胞PC 3M和DU145，构建干扰LINC00308的细胞，采用qRT PCR检测LINC00308和miR 634的表达水平，流式细胞术评估细胞的周期与凋亡，蛋白质印迹法（Western Blot）检测细胞核相关抗原Ki67（Ki67）、天冬氨酸特异性半胱氨酸蛋白酶3（Caspase3）蛋白的表达。starBase在线工具预测结合双荧光素酶报告实验分析LINC00308对miR 634的靶向调控。在PC 3M和DU145细胞中转染miR 634 mimic，利用上述方法检测miR 634在细胞增殖凋亡中的作用。 结果 前列腺癌组织中的LINC00308表达水平明显高于癌旁组织（P＜005）。干扰LINC00308显著提高PC 3M和DU145细胞的miR 634的表达水平、G0 G1期细胞比例、细胞凋亡率和Caspase3蛋白水平，明显降低S期细胞比例、Ki67蛋白水平（P＜005）。LINC00308靶向调控miR 634的表达。转染miR 634 mimic显著增加PC 3M和DU145细胞的G0 G1期细胞比例、凋亡率和Caspase3蛋白水平，明显减少S期细胞比例和Ki67蛋白水平（P＜005）。 结论 干扰LINC00308可以促进miR 634的表达，阻滞前列腺癌细胞周期，并诱导细胞凋亡。     

基于二代测序技术ghrelin作用后人卵巢癌细胞差异表达lncRNA的生物信息学分析

目的 分析二代测序技术ghrelin作用后的人卵巢癌细胞株SK-OV-3中长链非编码RNA（lncRNA）的差异表达。方法 从对照组（不添加ghrelin）和实验组（添加600 ng/mL ghrelin 24 h）的人卵巢癌细胞株SK-OV-3中分别提取RNA进行测序，筛选出实验组发生差异表达的lncRNA，对其进行靶基因预测并将预测结果与差异mRNA取交集，对取交集后的基因进行GO分析和KEGG通路分析。结果 筛选获得差异表达的lncRNA有236个（上调130个，下调106个）；差异表达mRNA有71个（上调66个，下调5个）。差异表达lncRNA靶基因与差异表达mRNA取交集筛选获得57个基因。GO和KEGG通路富集分析结果显示：这些差异表达lncRNA主要与精、赖氨酸跨膜转运，氧化应激反应及发育过程相关，并且主要富集在细胞因子受体信号通路、胰高血糖素和胰岛素信号通路及癌症相关信号通路上。结论 ghrelin作用后的人卵巢癌细胞中lncRNA的表达有差异，其可能参与卵巢癌的发生、发展，提示ghrelin可能在卵巢癌治疗中具有重要作用。     

加权基因共表达网络分析在鉴定卵巢癌干细胞特性关键基因的应用

  目的  探讨关键干细胞特性基因在卵巢癌的诊断和治疗中的意义。  方法  加权基因共表达网络分析（WGCNA）方法筛选出关键模块和基因;基因集富集分析（GSEA）和单细胞测序数据分析关键基因上调组高表达的信号通路;pRRophetic预测卵巢癌的化疗药物的敏感性;流式细胞术检测SKOV3细胞和肿瘤干细胞中CD44及CD117的表达情况;实时荧光定量（qRT）-PCR证实关键基因在卵巢癌干细胞中的表达;GeneMANIA分析鉴定出核心基因。  结果  WGCNA结果显示在转录水平上筛选出15个关键基因,其在多种肿瘤中高表达,参与细胞周期、DNA修复、E2靶点和G2M检查点通路,且与化疗药物敏感性有显著的关联性。CD44+CD117+细胞在SKOV3细胞和卵巢癌干细胞中的比例分别为（1.20±0.34）%、（37.17±1.80）%,差异有统计学意义（P<0.05）。qRT-PCR证实WGCNA结果中7个关键基因（BUB1、CDC20、CCNB2、DLGAP5、KIF4A、NEK2、NUSAP1）在卵巢癌干细胞中高表达,并且BUB1可能起着核心的作用。  结论  本研究通过构建基因共表达网络筛选出7个干细胞特性关键基因,尤其是BUB1,可能成为潜在的卵巢癌基因生物标志物。     

基于GEO数据库生物信息学方法分析子宫内膜癌相关基因和候选通路

目的：通过生物信息学方法分析与子宫内膜癌（EC）发生发展相关的关键基因和候选通路,探讨EC的发病机制和治疗靶点。方法：自公共基因芯片数据库（GEO）下载EC芯片数据集GSE17025和GSE63678,使用GEO2R在线分析工具和R软件筛选EC癌组织与癌旁组织的差异表达基因（DEGs）,并对DEGs进行基因本体论（GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路分析,采用String数据库进行蛋白质-蛋白质互作网络（PPI）分析,最后采用Cytoscape软件对PPI网络进行可视化并进行模块分析。结果：对芯片数据集GSE17025和GSE63678进行DEGs分析后共获取100个共同上调基因和106个共同下调基因。GO富集分析DEGs主要富集于有丝分裂染色体分离、核分裂和细胞器分裂等生物学过程;KEGG信号通路分析DEGs主要富集于细胞周期、miRNA、p53信号通路和2型糖尿病等信号通路。通过Cytoscape软件分析,PPI网络中细胞分裂周期基因20（CDC20）、极光激酶A（AURKA）、细胞周期蛋白B1（CCNB1）、泛素E3连接酶（DTL）、中心体相关蛋白55（CEP55）、细胞周期蛋白依赖性激酶1（CDK1）、驱动蛋白家族成员11（KIF11）、母体胚胎亮氨酸拉链激酶（MELK）、细胞周期蛋白B2（CCNB2）和苯并咪唑出芽抑制解除同源物蛋白1（BUB1）被筛选为关键基因。结论：细胞周期相关基因与通路调控网络的失调可能是EC发病的主要机制。     

miR-222-3p通过靶向调节Bim蛋白表达参与肾细胞癌的发生发展

目的: 检测miR 222 3p在肾细胞癌组织中的表达,探讨其参与肾细胞癌发生发展的分子机制。方法: 运用qRT PCR检测15对肾细胞癌组织和对应癌旁组织miR 222 3p的表达水平。生物信息学预测miR 222 3p的靶基因,荧光素酶报告实验验证其靶向调控作用。运用免疫组化和蛋白质印迹技术检测癌组织中靶基因蛋白表达水平。进一步通过脂质体瞬时转染技术实现肾细胞癌细胞株769 P中miR 222 3p过表达,采用流式细胞术检测miR 222 3p对细胞凋亡的影响。结果： qRT PCR结果显示,miR 222 3p在肾细胞癌组织的表达水平显著高于癌旁组织（P<0.01）。生物信息学预测显示,抗凋亡蛋白Bim是miR 222 3p潜在的靶基因。荧光素酶报告实验证实,过表达miR 222 3p可抑制含有Bim 3’ UTR的荧光素酶报告基因的荧光素酶活性,但对Bim 3’ UTR突变体的荧光素酶活性没有影响。免疫组化结果显示,肾细胞癌组织中Bim蛋白免疫组化阳性反应程度明显低于相应的癌旁组织（P<0.01）;蛋白质印迹结果进一步证实Bim蛋白在肾细胞癌组织中的表达较癌旁组织明显下调（P<0.01）。进一步在769 P细胞中瞬时过表达miR 222 3p后,发现Bim蛋白水平明显下调（P<0.01）,但Bim mRNA水平无明显变化。流式细胞术检测结果显示,过表达miR 222 3p可显著抑制769 P细胞的凋亡（P<0.01）。 结论： miR 222 3p可通过靶向作用于抑癌基因Bim表达抑制肾癌细胞的凋亡,在肾癌的发生发展中起重要作用,miR 222 3p/Bim轴为肾细胞癌治疗提供新的途径。     

MicroRNA⁃141靶向致癌基因Bmi⁃1抑制胰腺癌细胞的增殖

目的：探讨miR?141调控胰腺癌细胞增殖的机制。方法：采用qRT?PCR检测正常胰腺细胞和4种胰腺癌细胞株中miR?141的表达。从Gene Expression Omnibus数据库（GEO）下载包含36例胰腺癌样本和16例正常样本的GSE71533 miR?141表达文件,分析miR?141在胰腺癌及癌旁的表达差异。Western blot 检测Bmi?1在正常胰腺细胞和4种胰腺癌细胞株中的表达。荧光素酶报告基因检测miR?141和Bm?1之间的靶向关系。通过CCK8、平板克隆形成检测Bmi?1和miR?141对胰腺癌细胞增殖能力的影响。结果：qRT?PCR显示与正常胰腺细胞相比,miR?141在胰腺癌细胞中表达下调;GSE71533数据集分析结果也显示miR?141在胰腺癌组织中下调;Western blot分析结果表明Bmi?1在胰腺癌细胞中高表达,双荧光素酶实验表明miR?141锚定在Bmi?1的3′非编码区,下调Bmi?1可以抑制胰腺癌细胞的增殖;上调miR?141可以降低Bmi?1的蛋白质表达水平,从而抑制胰腺癌细胞中细胞增殖。结论：miR?141通过靶向Bmi?1在胰腺癌中起抑制作用,在胰腺癌诊疗中具有潜在功能。     

基于多重数据库的肾癌转移相关基因生物信息分析及功能初探

［摘要］目的: 通过生物信息学技术探讨肾癌转移瘤细胞与原发性肾癌细胞基因表达差异，寻找关键的差异基因及与其可能相关的分子机制。方法: 从GEO基因芯片数据库中下载人肾癌转移瘤和原发性肾癌的相关基因芯片数据GSE85258，用GCBI在线工具分析肾癌转移瘤和原发性肾癌的差异表达基因。分析差异表达基因GO及Pathway；筛选出既符合GO又符合Pathway的差异基因；将差异基因之间的相互作用及共表达关系构建基因网络图；构建差异基因Pathway网络图。通过体外细胞侵袭实验验证差异基因在肾癌细胞中的功能。结果： GSE85258数据集中共筛选出3 000个差异基因，其中表面活性蛋白2(SFTPA2)升高最显著，SLC17A3降低最明显。GO分析显示，差异基因主要参与DNA依赖性转录，信号转导，小分子代谢过程等多个生物学功能。Pathway分析显示，差异基因主要参与内质网蛋白质加工，代谢途径，癌症途径等生物学过程。差异基因相互作用分析显示MAPK1为核心信号传递中介，PRKCA、NRAS、NOS1等基因与其直接作用。差异基因间共表达既有正相关也有负相关，其中与周围基因关系最多的10个基因，互为正相关。Pathway网络分析显示MAPK信号通路是上下游通路最多的信号通路，其包含细胞周期、细胞凋亡、P53信号通路、癌症途径等与肿瘤发生相关的信号通路。侵袭实验显示，抑制SFTPA2表达可降低肾癌细胞的侵袭能力(t=18.44，P <0.01)。结论： 肾癌转移瘤细胞与原发性肾癌细胞存在表达差异基因，其中SFTPA2、MAPK1、PRKCA、NOS1可能是关键差异基因，其可能参与MAPK信号通路等，促进肾癌转移。     

microRNA⁃1调控神经嵴细胞进而影响颅面发育

目的：采用基因敲除斑马鱼模型,观测microRNA?1（miR?1）对神经嵴细胞（neural crest cell,NCC）和颅面发育的影响。方法：用CRISPR/Cas9基因敲除系统敲除斑马鱼miR?1,观察其神经嵴衍生物的表型。原位杂交检测NCC诱导分化相关基因的表达,并用实时定量PCR （qRT?PCR）等检验与凋亡相关基因的表达。结果：基因敲除组斑马鱼下颌骨严重萎缩,色素细胞延迟出现。原位杂交显示,受精后24 h,tfap2a、dlx3b、ngn1和snailb表达下降。qRT?PCR结果证明miR?1影响凋亡相关基因的表达。结论：miR?1参与NCC的调控进而影响颅面发育,其可能通过凋亡相关通路而发挥作用。     

受甲基化调控的lncRNA在乳腺癌中的表达谱及意义

目的：研究乳腺癌细胞去甲基化处理株和亲本株的lncRNA的差异表达情况,并从差异表达谱中筛选lncRNA,探讨受DNA启动子甲基化调控的lncRNA是否参与乳腺癌发生与发展。方法：取乳腺癌BT474细胞株去甲基化处理后,采用高通量lncRNA芯片技术分别检测去甲基化组和亲本组中lncRNA的表达谱,并在BT474、MB231和BT549三株乳腺癌细胞株及乳腺癌组织中应用qRT-PCR技术检测lncRNA的表达。同时寻找lncRNA的基因甲基化位点,并以重亚硫酸盐测序法（BSP）确定甲基化情况。结果：去甲基化株和亲本株lncRNA表达谱发生了显著的变化。qRT-PCR检测结果与芯片检测结果基本一致。qRT-PCR检测发现乳腺癌细胞株中lncRNA uc003lxs及uc002btf相比正常乳腺上皮细胞株表达升高（P＜0.01）,乳腺癌组织中lncRNA uc003lxs及uc002btf相比癌旁组织表达升高（P＜0.01）。BSP方法显示相比正常乳腺上皮细胞株,乳腺癌细胞株中lncRNA uc003lxs及uc002btf DNA甲基化水平显著降低（P＜0.01）;相比癌旁组织,乳腺癌组织中lncRNA uc003lxs及uc002btf DNA甲基化水平显著降低（P＜0.01）。结论：乳腺癌细胞株去甲基化处理后lncRN表达谱发生显著变化,并在差异表达谱中筛选出lncRNA uc003lxs及uc002btf,为研究受甲基化调节的lncRNA调控乳腺癌发生发展奠定前期的研究基础。     

长链非编码 RNALOC100288637在原发性肝癌中差异性表达的生物学意义及相关机制研究

目的：研究长链非编码 RNA （LncRNA ） LOC100288637在肝癌中的表达差异,对肝癌细胞增殖的影响及相关机制。方法分析GEO数据集GSE58043和GSE10694,得出LOC100288637及hsa‐miR‐101‐3p在肝癌组织中差异表达,RNA‐hy‐brid分析LOC100288637与hsa‐miR‐101‐3p的结合具有可能性。逆转录‐聚合酶链式反应在组织和细胞水平检测LOC100288637表达量。荧光原位杂交观察LOC100288637在细胞中的定位。敲低LOC100288637后CCK‐8检测细胞增殖情况。过表达hsa‐miR‐101‐3p后,检测 LOC100288637的变化。结果 LOC100288637在肝癌组织中的表达量高于癌旁组织（ P＜0．05）;LOC100288637在肝癌细胞系中的表达量高于肝细胞系（P＜0．05）。LOC100288637在 HepG2细胞核质均有表达,以细胞质居多。敲低LOC100288637后 HepG2细胞增殖活性降低（P＜0．01）。过表达hsa‐miR‐101‐3p后,LOC100288637表达量下降（P＜0．05）。结论 LncRNA LOC100288637可能在肝癌发生,发展过程中起重要作用并接受hsa‐miR‐101‐3p靶向调控影响肝癌细胞的增殖。     

长链非编码RNA LINC00152在食管鳞癌组织中的表达及临床意义

目的：探索长链非编码RNA（lncRNA）LINC00152在食管鳞癌组织中的表达及临床意义。方法：选取2008年1月至2013年12月在温州医科大学附属第一医院行手术切除并经病理科确认的95例食管鳞癌患者。采用lncRNA microarray基因芯片技术,对食管鳞癌患者转移组和非转移组间癌组织和对应的癌旁正常组织lncRNA的相对表达水平进行检测,寻找差异表达的lncRNA;应用qRT-PCR技术对差异表达的lncRNA在鳞癌组织样本中进行验证;分析目标lncRNA表达水平与临床特征的相关性;绘制ROC曲线评价LINC00152作为食管鳞癌转移预测因子的效能;检索国际基因芯片lncRNA数据库相关数据,分析LINC00152表达水平和生存期的关系。结果：LncRNA microarray基因芯片实验发现食管鳞癌转移组和非转移组间lncRNA相对表达量5倍以上差异表达的共有10条;qRT-PCR验证实验发现3条lncRNA（MIR205HG、LINC00152和FOXD2-AS1）的表达量在组间差异有统计学意义（P＜0.05）;统计分析发现LINC00152的相对表达量和食管鳞癌的淋巴结转移具有相关性（P＜0.01）;ROC曲线分析显示LINC00152判断食管鳞癌转移的AUC为0.781（95%CI=0.512～0.824,P=0.032）;国际基因芯片食管癌组织数据库检索结果显示,LINC00152的高表达预示较差的生存期。结论：LINC00152可能参与了食管鳞癌的转移发生过程,是食管鳞癌预后判断新的生物标志物。     

长链非编码RNA GAS5对人乳腺癌细胞株增殖和侵袭能力的影响

目的:探讨长链非编码RNA GAS5对人乳腺癌细胞增殖、侵袭及迁移生物学活性的影响。方法:qRT-PCR方法检测3株乳腺癌细胞株SKBR-3、 MDA-MB-231及MCF-7中LncRNA GAS5的表达;LncRNA GAS5干扰片段和过表达载体分别转染LncRNA GAS5高表达以及低表达的乳腺癌细胞株,qRT-PCR方法检测转染后LncRNA GAS5的表达;磺酰罗丹明B染色法检测细胞的增殖能力;Transwell和划痕实验检测细胞的侵袭及迁移能力。结果:LncRNA GAS5在乳腺癌SKBR-3细胞中表达量最低,MCF-7细胞中表达量最高（P<0.01）;SKBR-3以及MCF-7细胞分别转染LncRNA GAS5过表达载体和干扰片段后,SKBR-3细胞LncRNA GAS5表达量增高,MCF-7表达量降低（P<0.01）;下调LncRNA GAS5的表达,细胞的增殖能力升高,侵袭及迁移能力增强（P<0.01）;过表达LncRNA GAS5之后,细胞的增殖能力、侵袭和迁移能力减弱（P<0.01）。结论:LncRNA GAS5是涉及到乳腺癌发展的一个新型的分子,有可能成为乳腺癌治疗的潜在靶点。     

HOST2 lncRNA靶向结合miR-211干预卵巢癌细胞转移的机制研究

目的〖KG*2〗探讨HOST2 lncRNA靶向结合miR-211干预卵巢癌细胞转移的机制。 〖HTH〗方法〖KG*2〗实时荧光定量聚合酶链反应（quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR）检测7种卵巢癌细胞系中HOST2 lncRNA及miR-211表达水平,选取其中差异表达最高卵巢癌细胞作为候选细胞系;双荧光素酶报告基因实验检测卵巢癌细胞中HOST2 lncRNA与miR-211间靶向相关性。将细胞分为转染无序HOST2 lncRNA及miR-211对照物的对照组、转染HOST2 lncRNA过表达载体的HOST2组、共转染HOST2 lncRNA与miR-211 mimic的（HOST2+miR-211）组。细胞划痕实验、Transwell小室实验及裸鼠腹腔移植瘤实验分别检测HOST2 lncRNA靶向miR-211对卵巢癌细胞体内外转移能力的影响;Western Blot检测卵巢癌细胞内转移相关蛋白的表达变化。 〖HTH〗结果〖KG*2〗HOST2 lncRNA在7种卵巢癌细胞中显著高表达,miR-211在7种卵巢癌细胞中显著低表达,二者表达存在显著负相关关系,其中SKOV3细胞中HOST2 lncRNA及miR-211表达差异最高（P＜0.01）。双荧光素酶报告实验显示野生型HOST2报告基因质粒共转染miR-211 mimic后SKOV3细胞内荧光素酶活性较对照组受到显著抑制;过表达HOST2 lncRNA促进细胞划痕愈合、体外侵袭和迁移及裸鼠体内腹腔移植瘤的转移,反之共转染miR-211 mimic后抑制过表达HOST2 lncRNA促进的细胞体内外的转移;Western Blot结果显示过表达HOST2 lncRNA显著提高细胞内SOX4、Snail1及N-cadherin蛋白表达,下调E-cadherin蛋白表达,反之共转染miR-211 mimic后逆转上述蛋白表达变化（P＜0.01）。 〖HTH〗结论〖KG*2〗HOST2 lncRNA可能通过作为内源竞争RNA竞争性结合miR-211促进卵巢癌细胞体内外的转移。     

βB2基因敲除小鼠睾丸组织长链非编码RNA的差异性表达分析

目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)在βB2基因敲除小鼠睾丸中的表达及其影响睾丸发育的可能机制.方法 采用lncRNA芯片技术,筛选野生型(WT)和βb2基因敲除(KO)小鼠睾丸组织(均n=3)中lncRNA及信使RNA(mRNA)表达谱的变化;对差异表达lncRNA和mRNA进行GO数据库分析及KEGG数据库分析,建立调控网络图;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证差异表达的lncRNA和mRNA,探讨调控通路.结果 (1)两组小鼠睾丸组织差异表达的lncRNA共140条,mRNA共477条;(2)通过GO数据库分析,筛选出差异表达lncRNA共12条,其中上调7条,下调5条;(3)经KEGG数据库进行路径分析,发现差异表达mRNA主要经由Ca2+信号、配体-受体相互作用等信号通路起作用;(4)用关联矩阵法建立了lncRNA和mRNA共表达网络图,共有17个节点,12条连接,包含9条lncRNA和8条mRNA;其中Rsl1由3条lncRNA调控,Lpo和Mpo各由2条lncRNA调控,Hdac1、Ephb4等各由1条lncRNA调控.(5) qRT-PCR分析结果表明,在βB2基因敲除小鼠睾丸组织中,lncRNA A-30-P01019163和P2rx7的表达均下调(P＜0.05).结论 lncRNA与βB2基因的晶状体外功能密切相关,其中lncRNA A-30-P01019163可能通过调控下游P2rx7 mRNA的表达影响睾丸组织细胞周期及信号转导,进而调控睾丸发育.     

lncRNA SOX2OT在卵巢癌细胞系中的表达及其对卵巢癌生物学行为的影响

目的 探讨lncRNA SOX2OT在卵巢癌细胞系中相对表达情况,评估其对卵巢癌生物学行为的影响。 方法 将2017年4月—2019年4月宁波市鄞州人民医院治疗的112例卵巢癌患者纳入研究,分析卵巢癌及卵巢癌旁组织、卵巢癌细胞系lncRNA SOX2OT表达情况,并测试其影响增殖及周期、迁移状况。 结果 卵巢癌组织内SOX2OT mRNA表达(3.50±0.13)高于癌旁组织(1.59±0.21,t=81.045,P<0.01);HO-8910PM细胞株内lncRNA SOX2OT表达(5.78±0.04)高于HO-8910细胞株(1.05±0.11,t=405.918,P<0.05)。空白对照组克隆细胞数、迁移细胞数、侵袭细胞数高于siSOX2OT-1组、siSOX2OT-2组;阴性对照组克隆细胞数、迁移细胞数、侵袭细胞数高于siSOX2OT-1、siSOX2OT-2组(均P<0.01)。子宫内膜样癌、浆液性卵巢癌、黏液性卵巢癌lncRNA SOX2OT表达分别为4.12±0.25、3.68±0.42、3.44±0.31,组间差异无统计学意义(均P>0.05)。 结论 lncRNA SOX2OT在卵巢癌细胞系中呈异常高表达,敲低lncRNA SOX2OT表达可对卵巢癌细胞的增殖及迁移、侵袭进行抑制,加快卵巢癌细胞凋亡。      

长链非编码RNA CCAT2在肝癌中的作用及其机制

目的 探讨长链非编码RNA CCAT2(LncRNA CCAT2)在肝癌中的作用及机制.方法 选取我院2013年1-6月60例肝癌及其癌旁组织,采用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测其组织中CCAT2的表达,同时培养正常肝细胞L02和人源性肝癌细胞系HepG、H2P、SMMC和HLE细胞,采用qRT-PCR检测细胞中CCAT2的表达,采用siRNA干扰细胞CCAT2表达后,在24、48、72、96 h用CCK-8检测SMMC和HLE细胞增殖;Transwell实验分析细胞迁移和侵袭情况;采用流式细胞仪分析CCAT2对SMMC和HLE细胞周期分布和凋亡的影响;Western blot检测P53、Bcl-2、Caspase-8蛋白的表达.结果 在肝癌组织和肝癌细胞中,CCAT2的表达显著升高(P均＜0.05),CCAT2高表达的患者预后和生存率均较低(P均＜0.05).肝癌细胞中低表达的CCAT2能显著抑制肝癌细胞增殖、迁移和侵袭(P均＜0.05).肝癌细胞中低表达的CCAT2也能使肝癌细胞周期停留在Go/G1期并促进细胞凋亡(P均＜0.05).采用siRNA干扰细胞CCAT2表达后,肝癌细胞中P53和Caspase-8蛋白的表达显著升高(P均＜0.05),Bcl-2蛋白的表达显著降低(P＜0.05).结论 CCAT2在肝癌组织和细胞系中高表达,siRNA干扰CCAT2表达后能够抑制细胞增殖、迁移、侵袭以及促进肝癌细胞的凋亡,其机制可能通过升高P53和Caspase-8蛋白的表达和降低Bcl-2蛋白的表达有关.     

顺铂耐药卵巢癌的差异表达基因和信号通路富集分析

目的 分析顺铂耐药卵巢癌的差异表达基因和信号通路.方法 用美国国立信息中心NCBI的GEO数据库获得顺铂耐药卵巢癌基因集GSE15372, 通过R与Bioconductor软件进行差异表达基因分析;再利用DAVID在线工具对顺铂耐药卵巢癌差异表达基因进行GO本体分析、KEGG通路分析.结果 差异倍数在2倍以上、FDR值小于0.05为标准, 筛选出上调差异表达基因和下调差异表达基因获得差异表达基因211个, 其中上调基因120个, 下调基因91个;基因富集分析发现差异表达基因集中在黏着斑、TGF-β信号通路等生物过程 (P<0.05) .结论 顺铂耐药卵巢癌存在一些特异的差异表达基因, 有部分信号通路在顺铂耐药卵巢癌中明显富集.