2013-2014年梅州市诺如病毒感染性腹泻监测分析

目的 了解梅州市诺如病毒感染性腹泻流行病学特征.方法 收集2013年4月至2014年12月期间梅州市感染性腹泻哨点医院监测门诊的腹泻病例的粪便标本,采用实时荧光定量RT-PCR检测诺如病毒GⅠ和GⅡ基因组.结果 共收集腹泻病例粪便标本766份,诺如病毒核酸检测阳性92份,阳性率为12.01％;阳性标本中诺如病毒基因型GⅡ型91份(98.91％),GⅠ型1份(1.09％).全年均可检出诺如病毒,病毒检测阳性率高峰期集中在9-11月.不同性别间、不同年龄组之间诺如病毒检出阳性率差异无统计学意义(x2=1.51,P＞0.05,x2=2.30,P＞0.05).结论 诺如病毒是梅州市感染性腹泻常见病原,GⅡ型基因型为优势流行株;诺如病毒感染性腹泻全年均可发生,高峰期出现在秋冬季节;人群对诺如病毒普遍易感.     

上海某高校一起诺如病毒感染性腹泻暴发疫情调查

目的调查一起高校腹泻暴发疫情的感染来源、传播途径和危险因素。方法应用描述流行病学和病例对照研究分析此疫情的流行病学特征、传播方式和危险因素。对学校食堂开展卫生学调查。运用RT-PCR进行诺如病毒的核酸检测,并进行致病菌的检测。结果本次疫情共持续4 d 5 h,病例共62名,罹患率0.89%。临床表现以腹泻为主[57例(91.94%)],平均年龄23岁,男36名,女26名。病例对照研究示:第五食堂就餐可能是引起发病的危险因素[χ~2=45.69,P0.05],24份病例粪便标本诺如病毒核酸检测,9份标本诺如GⅡ型阳性;20份厨工(无症状)肛拭子诺如病毒核酸检测,5份标本诺如GⅡ型阳性。结论这是一起诺如GⅡ型病毒导致的感染性腹泻暴发疫情,食源性传播后出现人传人,可能是食堂从业人员污染食物所致。     

青海省西宁市某幼儿园一起诺如病毒暴发疫情调查及分子流行特征分析

目的 调查分析一起由诺如病毒引起的某幼儿园胃肠炎暴发疫情感染来源及分子流行病学特征。方法 采用描述性流行病学方法分析疫情的流行病学特征及感染来源。采集病例的粪便、呕吐物和周围环境的擦拭物，提取核酸病毒RNA后，进行实时荧光核酸检测诺如病毒GⅡ型，GⅡ型阳性产物采用特异性引物分别扩增病毒ORF2区直接测序，采用BLAST和Mega 3.0软件进行序列比对和系统进化分析其分子生物学特征。结果 累计搜索21例诺如病毒病例，罹患率为2.53%(21/831),病例主要集中在3～4岁儿童共19例，占总病例的90.48%,男女性别比为0.62∶1;疫情持续时间为5 d,首发病例发病时间距离疫情报告时间为2.5 d;采集22份标本，其中8例病例，病例标本14份，病例标本阳性检出率为57.14%(8/14),环境标本8份，环境标本阳性检出率为12.50%(1/8);病例标本粪便阳性检出率为87.50%(7/8);经过实时荧光RT-PCR检测有9份标本为诺如病毒GⅡ型阳性，分子分型显示均由GⅡ.17引起。结论 该疫情由诺如病毒GⅡ.17引起的人与人传播；粪便标本阳性检出率较高；低年龄组为主要防控人群。     

广西首次在急性胃肠炎病例中检出GⅠ型诺如病毒

目的研究南宁市某医院门诊急性胃肠炎病例中GⅠ型诺如病毒的感染状况。方法应用荧光定量RT—PCR法对2007年1月-2008年12月南宁市某医院门诊腹泻病例标本进行GⅠ型诺如病毒RNA检测,并对GⅠ型阳性标本进行测序验证。结果在所检测的696份粪便悬液标本中,检出4份GⅠ型阳性,经核酸测序证实为GⅠ型诺如病毒。结论在广西的急性胃肠炎病例中存在GⅠ型诺如病毒感染。     

广州市门诊5岁以下儿童诺如病毒感染基因型分析

目的了解2007-2008年广州市监测点医院门诊5岁以下儿童病毒性腹泻散发病例中诺如病毒感染状况及基因型别。方法收集广州市2007-2008年监测点医院门诊临床诊断为病毒性腹泻的患儿临床资料及粪便标本954份,采用ELISA方法检测诺如病毒、轮状病毒,将诺如病毒抗原阳性的标本用RT-PCR方法进行诺如病毒核酸扩增,将阳性产物回收、纯化并测序,结合GenBank中的相关序列进行型别流行特点分析。结果 954份标本中,ELISA方法检测各种病毒的抗原阳性率为诺如病毒18.8%(179/954),其中07年12.2%(32/262),08年21.2%(147/692),轮状病毒30.8%。诺如病毒腹泻病例发病高峰在8～11月份,2岁以下病例数占全部病例的91.6%,病例集中在6～23月龄。RT-PCR方法检测诺如病毒核酸阳性率为80.4%(144/179),144份诺如病毒核酸阳性标本经测序及与GenBank中的相关序列比对证实有1份是GⅡ2型,其余全部为GⅡ4型。结论诺如病毒是广州市门诊5岁以下儿童病毒性腹泻的常见病原之一,仅次于轮状病毒,常见于2岁以下婴幼儿,2007-2008年流行优势株基因型为GⅡ4型。     

北京市一起诺如病毒GⅡ.2感染引起的学校突发公共卫生事件调查

目的通过对一起急性胃肠炎暴发疫情进行调查处置,分析引起暴发的危险因素,为有效地防控诺如病毒感染引起的急性胃肠炎疫情提供依据。方法采用现场流行病学调查方法收集学校基本情况和患儿相关资料,对其进行流行病学特征分析,采集病例、食堂工作人员、保洁人员的便标本进行实验室检测。结果此次疫情时间为2017年3月14～24日,历时11 d,共报告疑似病例84例,罹患率12. 48%,病例集中于三年级和四年级。实验室检测结果显示22份病例粪便标本中检出诺如病毒GⅡ核酸阳性12份,阳性率54. 55%; 29份密接粪便标本中检出诺如病毒GⅡ核酸阳性6份,阳性率20. 69%。结论本次疫情为一起诺如病毒GⅡ型感染引起的急性胃肠炎暴发,传播途径是由于人与人之间的密切接触,校内日常消毒措施不到位和隐形传染源未能有效隔离可能是暴发的主要原因。     

淮安市诺如病毒聚集性感染病原监测分析

目的 了解淮安市诺如病毒聚集性感染流行病学特征，为制定诺如病毒性腹泻的防制措施提供依据。方法 对“中国疾病预防控制信息系统”病毒性腹泻数据进行描述，收集2018—2020年淮安市诺如病毒聚集性感染病例标本进行监测分析。结果 2018—2020年淮安市共发生诺如病毒聚集性感染16例，报告病例256例，主要发生在托幼机构、小学和初中等场所，实验室检测样本331份，核酸阳性报告112份，检出诺如病毒阳性率为33.84%,聚集性感染多发生在4月和11月，主要以诺如病毒GⅡ型为主，且存在多个型别的流行，诺如病毒GI型与GⅡ型检测阳性率差异有统计学意义(χ²=845.6,P<0.05)。结论 诺如病毒聚集性感染易发生在幼儿园和学校等集体单位，感染型别以诺如病毒GⅡ型为主，流行趋势由GⅡ.4型向GⅡ.8型转变，应加强校园监督管理，采取病例隔离和环境消毒等综合干预措施以控制诺如病毒感染性腹泻的传播。     

天津市某小学诺如病毒疫情调查分析

目的:根据该学校诺如病毒暴发的流行病学调查资料,掌握诺如病毒传播危险因素,为控制疫情提供科学方法。方法:根据现场流行病学调查资料、食品样品、环境样品、患者呕吐物、腹泻物用荧光定量PCR方法检测诺如病毒。结果:该校有6个年级86个班,共计893例,55例发病,罹患率为6. 16%。其中发病班级涉及14个班,病例发病最多为3年11班,共计26例,罹患率为55. 32%;其次为3年14班,出现8例,罹患率17. 02%;教师发病2例,罹患率为0. 84%。实验结果为23份患者的粪便检出14份诺如病毒GⅡ型阳性,4份呕吐物有1份为诺如病毒GⅡ型阳性。根据实验室结果排除食源性致病菌导致的食物中毒。结论:根据流行病学现场调查资料及样品检测结果,及时采取有效的疫情消毒隔离防控措施未出现新发病例,本次疫情判定为诺如病毒GⅡ型引起的感染性腹泻。     

两起诺如病毒感染疫情的分子流行病学特征分析

目的了解广州市海珠区2014年5月和2015年3月发生的两起诺如病毒感染性腹泻疫情的分子流行病学特征。方法采用实时荧光RT-PCR检测肛拭子标本中诺如病毒RNA,选取部分阳性标本进行核酸序列测定并进行同源性分析。结果在这两起疫情采集的61份肛拭子标本中,诺如病毒GⅡ型阳性38份。经测序比对后,2014年5月的流感疫情中检测出1株GⅡ-6型和1株GⅡ-9型;2015年3月的流感疫情中检测出2株GⅡ-6型和1株GⅡ-5型。结论广州市海珠区两起疫情存在两种基因型诺如病毒的混合感染。     

广州市群体性食物中毒事件中诺如病毒分子流行病学分析

【目的】初步了解广州市社区食物中毒事件中诺如病毒的分子流行病学情况。【方法】在2003年10月至12月期间，从5个不同流行现场，采集急性期胃肠炎患者的粪便标本76份，用RT—PCR对标本中的诺如病毒核酸进行扩增，将阳性产物回收、纯化并测序，与GenBank中的相关序列进行比较分析，绘制系统发生树。【结果】76份样品中共检出阳性36份，阳性率为47．37％。从5个流行现场获得5个代表株，分别为DX1106、PY1106、HM1121、PY1202和HD1219，其中DX1106与PY1202的序列完全一致，而其他毒株间的序列同源性在35％-85％之间。系统发生树分析发现5个代表株都属于GⅡ组诺如病毒，但分属于不同的基因型。其中DX1106与PY1202株属于GⅡ-3型，HM1121和HD1219株属于GⅡ-4型，PY1106株介于GⅡ-6、7、8型之间，尚不能确定型别。【结论】广州市存在诺如病毒引起的食物中毒，流行优势株为GⅡ组，但其基因型别存在多样性。     

急性腹泻患儿诺如病毒检测和分型

目的了解苏州地区急性腹泻患儿诺如病毒的分子特征和基因型别。方法收集苏州地区2009年9月-2010年3月共153份5岁以下急性腹泻患儿粪便或肛拭标本,用多重RT—PCR方法检测诺如病毒,选择部分阳性扩增片段进行基因序列测定,并对序列进行系统进化分析。结果急性腹泻患儿诺如病毒检出率为16．34％（25／153）,均为诺如病毒Ⅱ型,且诺如病毒基因型别均为GⅡ-4／2006b变异株。结论诺如病毒是2009～2010年引起苏州地区急性腹泻患儿重要的病原之一,诺如病毒GⅡ-4／2006b变异株或类似株可能是2009～2010年苏州地区流行的优势株。     

2006年深圳市急性肠胃炎的流行病学和病毒学调查

目的研究2006年深圳市急性肠胃炎发病的主要病因。方法收集深圳急性肠胃炎粪便样本200份（包含122份散发样本和78份暴发样本）,采用RT—PCR的方法进行急性肠胃炎相关病毒检测。结果44％（88／200）的样本为诺如病毒阳性,9％（18／200）为轮状病毒A阳性,2％（4／200）为星状病毒阳性,2％（4／200）为肠道腺病毒阳性,还有8％（16／200）的样本为混合感染。其中散发样本中检出腺病毒、轮状病毒、星状病毒和诺如病毒GI、诺如病毒GII5种病毒,而诺如病毒GII是3次暴发样本中的唯一病原。对22例NoVGII阳性样本测序后的系统发育分析表明NoVGII．4variants2006bcluster是造成2006年深圳市肠胃炎暴发的主要诱因．其次为NoVGII．12和GII．4Hunter簇。结论NoVGII．4是2006年流行于深圳的主要病毒株．     

昌江县某电厂一起诺如病毒暴发疫情的调查

目的 了解诺如病毒感染引起腹泻暴发的特点和流行原因,探讨暴发疫情调查处理的经验,为制定防治对策提供科学依据,预防今后类似事件的发生。方法 采用描述流行病学的方法对昌江县某电厂2016年3月份发生的一起诺如病毒暴发疫情进行调查和分析。结果 本次疫情该电厂第一食堂就餐人员及食堂员工出现腹泻、呕吐等症状的病例41例（含病例搜索）,罹患率为1.64%。采集就餐人员病例和食堂员工肛拭子37份标本,其中10份检出诺如病毒阳性（GⅠ型8份、GⅡ型2份）,10份阳性标本中6例为患者(注：食堂员工4例、到食堂就餐人员2例) 、4例为隐性感染者。经对患者和隐性感染者居家隔离治疗,终末消毒食堂餐具、厨房、餐厅等疫点、疫区,开展爱国卫生运动和健康教育等综合措施后疫情得到控制。结论 本起疫情是由诺如病毒GⅠ型、GⅡ型混合感染引起的急性胃肠炎暴发,可疑的传播途径是食堂员工感染了诺如病毒,在食堂工作过程中,污染了食物、食堂的环境等,导致食堂其他员工和到食堂就餐人员被感染而引起暴发疫情。严格食堂食品卫生安全监督检查,开展健康教育是控制疫情的关键。     

一起幼儿园诺如病毒感染暴发疫情的调查

目的 查明荆州市某乡镇某幼儿园一起腹泻暴发疫情的致病因子、传染源和传播途径。方法 制定病例定义开展病例搜索,通过面访和电话调查开展现场流行病学调查,采用回顾性队列研究进行分析。开展现场卫生学调查,利用RT-PCR方法对病例标本、环境标本进行检测。结果 疫情从2月13开始至2月18日结束,共发生诺如病毒感染病例91例,罹患率为18%（91/520）。回顾性队列研究未发现可疑餐次。幼儿园对呕吐物未采取消毒措施,也未采用人员疏散措施。检出7份老师肛拭子、2份幼儿肛拭子、1份食堂工作人员（帮厨）肛拭子和1份环境标本（幼儿用碗）为诺如病毒GII型核酸阳性。结论 本次疫情为一起由诺如病毒引起的腹泻暴发,可疑传染源为首发病例,传播途径主要为接触传播。     

深圳市龙华区2019年札如病毒基因分型以及进化分析

目的 分析2019年深圳市龙华区札如病毒的基因型别,掌握辖区内札如病毒的流行情况。方法 采用实时荧光定量PCR对283份龙华区感染性腹泻疫情样本进行轮状病毒、诺如病毒和札如病毒核酸检测,对札如病毒阳性样本核酸采用RT-PCR（反转录-聚合酶链式反应）扩增,并对扩增产物进行序列测定和遗传进化分析。结果 2019年龙华区共发生感染性腹泻聚集性疫情24起,共采集283份样本。其中由诺如病毒引起15起（占62.5%）,札如病毒引起4起（占16.6%）,札如和诺如病毒共同引起1起（占4.1%）,未检测出病原体4起（占16.6%）。283份感染性腹泻疫情样本中,诺如病毒检测阳性率为17.7%（50/283）;札如病毒阳性率为8.1%（23/283）,轮状病毒未检出,所有病例无混合感染情况。23例札如阳性样本有5例VP1条带扩增成功,扩增效率为21.7%,基因亚型鉴定分析结果表明2株为GII.3型,3株为GII.4型。结论 在2019年龙华区腹泻疫情方面,GⅡ.3和GⅡ.4型是札如病毒的主要型别。诺如依然是龙华区感染性腹泻中引起散发和暴发的首要病原体,星状,轮状,腺状仅在散发病例中发现,而札如已成为引起急性腹泻病的重要病原体,应尽快开展龙华区对札如病毒的常规检测和进一步的分子分型工作。     

宁夏2010年肠道病毒71型进化分析

目的分析2010年宁夏回族自治区手足口病(HFMD)患者中肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)分离株基因特征。方法收集宁夏2010年手足口病患者粪便,咽拭子和疱疹液标本,进行病毒分离培养和Real-time RT-PCR检测后,对鉴定为EV71毒株的VP1编码区进行核苷酸序列测定分析。结果共收集各类标本994份,分离获得EV71 225株,对所有EV71毒株的VP1编码区基因进行序列测定,选择其中53株进行序列分析。宁夏分离株与A、B、C型基因型代表株核苷酸同源性分别为80.0%～81.5%、82.4%～84.7%和87.2%～99.1%;氨基酸同源性分别为93.9%～94.3%、96.3%～97.6%和97.6%～100%,与C4a亚型同源性最高为95.6%～99.1%,在系统发生树上,这53株毒株与C4基因型代表株聚为一簇,属于C4亚型中的C4a分支,而且提示至少存在4条病毒传播链。结论 2010年EV71的C4a亚型在宁夏有较广泛的流行,是宁夏流行的绝对优势基因亚型,其流行存在多条传播链。     

浙江省急性腹泻患儿中肠道病毒检测分析研究

目的 探讨浙江省急性腹泻患儿的常见病毒组成.方法 采集5岁以下（≤5岁）急性腹泻患儿的811份粪便标本,采用ELISA方法检测A组轮状病毒（RV）,应用多重PCR方法同时检测B/C组RV、诺如病毒（NoV）、札如病毒（SaV）、肠道腺病毒（AdV）、星状病毒（AstV）,并利用RT-PCR对RV的阳性标本进行G、P分型.结果 811份粪便样本中,RV、NoV、SaV、AdV 及AstV总的阳性比例分别为25.52%、18.37%、4.44%、2.71%和1.23%;65份（8.01%）混合感染标本中以RV和NoV混合感染所占比例最大（56.92%）; 116份RV的G/P分型中,G3型（37.93%）、G1型（32.75%）和P[8]型（57.76%）是RV的优势型别,且G3/P[8]（27.59%）是混合感染最主要的组合.结论浙江省五种常见腹泻病毒及其混合感染的流行状况,为临床治疗和疾病监测提供参考价值.     

急性呼吸道感染患儿人类博卡病毒检测与分析

目的 探讨人类博卡病毒（HBoV）与儿童急性呼吸道感染（ARTI）的关系。方法 RT-PCR检测2006年11月-2008年4月连续2个冬春季儿科418例呼吸道感染鼻咽分泌物标本的HBoV。结果 HBoV阳性率为5．0％（21／418）。阳性者年龄在4月～5岁。下呼吸道感染HBoV阳性率11．1％（17／153）显著高于上呼吸道感染的1．5％（4／265）（χ^2=18．741,P〈0．001）。结论 HBoV是本地区冬春季儿童呼吸道感染、尤其是下呼吸道感染的的重要病原之一。     

液相芯片检测轮状病毒和诺如病毒方法的建立

目的建立一种多重PCR结合液相芯片技术同时检测A型轮状病毒、GI型诺如病毒和GII型诺如病毒的方法。方法建立多重PCR扩增方法,将PCR产物与偶联核酸探针的微球混合物进行杂交,利用Luminex 200液相芯片检测仪来检测杂交结果。对建立的A型轮状病毒、GI型诺如病毒和GII型诺如病毒液相芯片检测方法进行灵敏度、干扰性分析,并应用该方法对68份粪便样品的核酸进行检测。结果灵敏性实验结果表明,该方法对GII型诺如病毒的检测灵敏度较高,检出限为10 pg/PCR;对轮状病毒的检出限为100 pg/PCR;该方法对GI型诺如病毒的检测灵敏度较低,检出限为1 ng/PCR。干扰性实验结果表明,轮状病毒、GI型诺如病毒和GII型诺如病毒的液相芯片检测,当病毒之间的模板量不同时(1∶1、1∶2、2∶1、1∶5、5∶1、1∶10、10∶1、1∶100、100∶1),仍能够准确检测;对68份临床粪便样品的核酸进行检测,检测出A型轮状病毒样品19份,GI型诺如病毒样品1份,GII型诺如病毒样品18份;轮状病毒和GII型诺如病毒混合感染1份,GI和GII型诺如病毒混合感染1份。结论本研究建立的轮状病毒和诺如病毒液相芯片检测方法通...     

广州儿童秋冬腹泻中人类杯状病毒感染的分子流行病学研究

目的了解广州某医院秋冬季儿童腹泻中人类杯状病毒（HuCV）感染的分子流行病学特点。方法连续2个秋冬季腹泻流行季节收集临床诊断为病毒性腹泻患儿的粪便标本。采用ELISA检测轮状病毒，RT-PCR检测HuCV。部分阳性标本PCR产物进行纯化、测序，结合参考株相应核苷酸序列进行进化分析。结果诺瓦克样病毒（Norwalk-like virus，NLVs）阳性率为12-35％（80／648），扎幌样病毒（Sapporo-like virus，SLVs）阳性率为0．31％（2／648）。NLVs各月阳性率无显著性差异，主要感染2岁以下患儿。2003年流行株为GⅡ-3群和GⅡ-4群，2004年为GⅡ-4群。2株SLVs均为GⅠ-1群。结论NLVs是广州地区秋冬季节儿童腹泻的重要病原体，其流行株为GⅡ-3群、GⅡ-4群病毒株， 但在不同的时间段可能存在不同的流行优势株；广州地区存在SLVs所致感染，与我国报告的SLV基因型不同。