| 深圳市龙华区2019年札如病毒基因分型以及进化分析 |
| |
| 引用本文： | 郝夏琼,任燕,许少坚,李锦宗,满云翔,赖晓玲,全德甫,曹赫,林启辉.深圳市龙华区2019年札如病毒基因分型以及进化分析[J].中国热带医学,2021,21(3):247-250. |
| |
| 作者姓名： | 郝夏琼 任燕 许少坚 李锦宗 满云翔 赖晓玲 全德甫 曹赫 林启辉 |
| |
| 作者单位： | 深圳市龙华区疾病预防控制中心,深圳市公共卫生应急检测重点实验室,深圳市传染病预防控制重点实验室,广东 深圳 518109 |
| |
| 基金项目： | 深圳市三名工程项目(No.SZSM201809085);深圳市龙华区科创项目(No.201802)。 |
| |
| 摘 要： | 目的 分析2019年深圳市龙华区札如病毒的基因型别,掌握辖区内札如病毒的流行情况。方法 采用实时荧光定量PCR对283份龙华区感染性腹泻疫情样本进行轮状病毒、诺如病毒和札如病毒核酸检测,对札如病毒阳性样本核酸采用RT-PCR（反转录-聚合酶链式反应）扩增,并对扩增产物进行序列测定和遗传进化分析。结果 2019年龙华区共发生感染性腹泻聚集性疫情24起,共采集283份样本。其中由诺如病毒引起15起（占62.5%）,札如病毒引起4起（占16.6%）,札如和诺如病毒共同引起1起（占4.1%）,未检测出病原体4起（占16.6%）。283份感染性腹泻疫情样本中,诺如病毒检测阳性率为17.7%（50/283）;札如病毒阳性率为8.1%（23/283）,轮状病毒未检出,所有病例无混合感染情况。23例札如阳性样本有5例VP1条带扩增成功,扩增效率为21.7%,基因亚型鉴定分析结果表明2株为GII.3型,3株为GII.4型。结论 在2019年龙华区腹泻疫情方面,GⅡ.3和GⅡ.4型是札如病毒的主要型别。诺如依然是龙华区感染性腹泻中引起散发和暴发的首要病原体,星状,轮状,腺状仅在散发病例中发现,而札如已成为引起急性腹泻病的重要病原体,应尽快开展龙华区对札如病毒的常规检测和进一步的分子分型工作。
|
| 关 键 词： | 札如病毒 进化分析 基因分型 疫情暴发 |
| 收稿时间： | 2020-06-12 |
Genotyping and evolutionary analysis of Sapovirus in Longhua District of Shenzhen in 2019 |
| |
| HAO Xia-qiong,REN Yan,XU Shao-jian,LI Jin-zong,MAN Yun-xiang,LAI Xiao-ling,QUAN De-fu,CAO He,LIN Qi-hui.Genotyping and evolutionary analysis of Sapovirus in Longhua District of Shenzhen in 2019[J].China Tropical Medicine,2021,21(3):247-250. |
| |
| Authors: | HAO Xia-qiong REN Yan XU Shao-jian LI Jin-zong MAN Yun-xiang LAI Xiao-ling QUAN De-fu CAO He LIN Qi-hui |
| |
| Institution: | Longhua District Center For Disease Control and Prevention, Shenzhen Key Laboratory of Public Health Emergency Detection, Key Laboratory For Infectious Disease Control and Prevention, Shenzhen,Guangdong 518109, China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Sapovirus evolutionary analysis genotyping outbreaks |
| 本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《中国热带医学》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《中国热带医学》下载免费的PDF全文 |
|
