肝癌细胞株HepG2蛋白双向电泳条件的优化

目的优化双向电泳条件,以获得高分辨率、重复性好的蛋白质双向电泳图谱。方法比较不同的细胞总蛋白质裂解液、不同的蛋白上样量、不同的等电聚焦电泳条件,选择最佳双向电泳条件。结果确定了适合肝癌细胞株HepG2的最佳细胞总蛋白质裂解液5、最佳蛋白上样量650μg和最佳等电聚焦电泳条件为最大电压34kV、30min。结论优化双向电泳方法获得的肝癌细胞株HepG2蛋白质双向电泳图谱高分辨率、重复性好。     

GSFs细胞蛋白质组双向电泳图谱的建立

目的：建立GSF细胞蛋白质组双向电泳图谱。方法：用含10％胎牛血清的DMEM培养液培养GSF细胞，胰酶消化后收集细胞，加入细胞裂解液使细胞充分裂解，离心后取上清液进行第一向等电聚焦电泳和平衡，再进行第二向SDS-PAGE（十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳）和银染显色及图像扫描与分析。结果：通过对GSF细胞蛋白提取液进行双向电泳，在17cm pH5～8IPG胶条上可得到重复性及分辨率均较好的蛋白位点。结论：GSF细胞蛋白质组双向电泳图谱的建立。为其蛋白质组学的进一步研究奠定了基础。     

大鼠脑组织蛋白质双向电泳技术的建立

目的：建立大鼠脑组织蛋白质双向电泳技术。方法：利用不同体积的裂解液提取大鼠脑组织中的蛋白质，并通过不同的蛋白质上样量（1mg，2mg，3mg），进行双向电泳，考马斯亮蓝染色，图谱分析。结果：在等电点3～10，分子量6．5～200ku范围内分离得到蛋白质斑点为，1mg蛋白质上样量为546个蛋白质斑点，2mg为780个，3mg为805个斑点。2mg蛋白质上样量的双向电泳图谱更清晰，分离更好。结论：成功建立了大鼠脑组织蛋白质的双向电泳技术。     

用双向电泳及蛋白质印迹技术筛选乳腺癌相关抗原

目的：应用双向电泳及免疫印迹技术分析乳腺癌MCF-7细胞总蛋白,寻找乳腺癌相关抗原。方法：提取乳腺癌MCF-7细胞总蛋白,双向电泳技术（2-DE）对总蛋白进行分离后转膜,将健康人血清（对照组）和乳腺癌患者血清（实验组）作为一抗进行蛋白质印迹（Western blotting）分析,寻找杂交蛋白点的差异。结果：MCF-7总蛋白双向电泳考马斯亮蓝染色图谱共检测到248个蛋白质斑点,Western blotting显示实验组抗原抗体反应点23个,对照组为13个,找到10个差异蛋白点。结论：乳腺癌患者血清中的抗体表达水平有改变,这10个差异蛋白点有可能是乳腺癌相关抗原。     

蛋白质组学技术对肝癌细胞株HepG2的G2/M期细胞的热激蛋白的鉴定

目的：采用蛋白质组学技术鉴定肝癌细胞株HepG2的G2／M期细胞内的热激蛋白。方法：提取肝癌细胞株HepG2的G2／M期细胞的蛋白质，采用双向电泳的方法分离蛋白质，应用图像扫描仪及质谱（MALDI—TOF—MS）分析鉴定HepG2的G2／M期细胞表达的蛋白质。结果：采用双向电泳技术分离，并用质谱成功鉴定出HepG2的G2／M期细胞的热激蛋白。结论：肝癌细胞株HepG2的G2／M期细胞内的热激蛋白的成功鉴定，为探讨HSP在细胞生长和增殖中的作用奠定了基础，并为临床上肿瘤的治疗提供参考依据。     

人结肠腺癌Lovo细胞系蛋白质双向凝胶电泳技术的建立及其优化

目的优化人结肠癌Lovo细胞系的蛋白质样品制备方法,建立人结肠癌Lovo细胞系的双向凝胶电泳(2-DE)图谱.方法分别用磷酸盐缓冲液和等渗蔗糖溶液冲洗细胞,胰酶酶解后裂解和皿上直接裂解的方法提取所培养Lovo细胞的总蛋白质,利用固相pH梯度双向凝胶电泳技术进行分离,凝胶经银染显色后,用Melanie 4软件分析2-DE图谱.结果以等渗蔗糖缓冲液冲洗细胞并经皿上直接裂解的方法所提取Lovo细胞总蛋白质进行双向电泳,可获得分辨率高、重复性好的人结肠癌Lovo细胞系2-DE图谱.结论以等渗蔗糖溶液冲洗细胞结合皿上直接裂解是一种较好的细胞蛋白质双向电泳样品制备方法,初步建立了分辨率较高且重复性好的人结肠癌Lovo细胞系蛋白质双向凝胶电泳图谱.     

免疫共沉淀结合双向电泳分离相互作用蛋白质的方法优化

目的：建立和优化有针对性的免疫共沉淀（CO-IP）与双向电泳（2DE）-质谱联合的技术来鉴定相互作用蛋白质。方法：利用特异性抗体通过CO-IP对细胞全蛋白中的目标蛋白进行富集,用不同洗脱液洗脱目标及其相互作用蛋白,并行2DE分离。结果：对CO-IP过程、洗脱液成分、上样量等关键步骤进行优化,得到满意的2DE图谱。结论：成功优化CO-IP与2DE分离技术,为通过蛋白质组学研究信号通路中重要蛋白质的相互作用提供有效方法。     

PC12细胞蛋白质组学研究技术及二维电泳图谱的建立

目的：建立PC12细胞的蛋白质组学研究的技术体系,全面展示PC12细胞的蛋白质表达谱。方法：提取PC12细胞的蛋白质,建立固相pH梯度双向电泳图谱,应用图像扫描仪及ImageMaster 2D Evolution分析软件获得蛋白质点的数字化和匹配性信息,挑选匹配良好的高峰度蛋白点,进行基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）的鉴定。结果：成功构建出PC12细胞的双向电泳图谱,并用MALDI-TOF-MS成功鉴定出19种PC12细胞的蛋白质,分属于以下6类：分子伴侣及相关功能蛋白、细胞结构/骨架蛋白、代谢相关蛋白、凋亡相关蛋白、激素结合相关蛋白和神经内分泌相关蛋白。结论：PC12细胞样品的蛋白质样品双向电泳图谱重复性良好,初步建立了PC12细胞的蛋白质组学研究技术,证明以PC12细胞为模型的神经系统疾病蛋白质组学研究的可行性。     

人角质形成细胞蛋白质双向电泳技术的建立和优化

目的 建立和优化人角质形成细胞蛋白质组研究样品制备方法和双向电泳技术条件.方法 体外无血清培养人角质形成细胞,以裂解液成分、上样量的选择和等电聚焦参数为侧重点,通过比较分析不同条件下电泳图谱,建立最佳双向电泳技术条件.结果 成功建立了人角质形成细胞总蛋白制备方法,优化了人角质形成细胞双相电泳技术,获得了重复性和分辫率都较理想的角质细胞总蛋白质双向电泳图谱.结论 优化后的双相电泳条件为人角质形成细胞蛋白质组学分析奠定基础.     

人肝癌细胞株QGY-7701蛋白质组学研究技术及二维电泳图谱的建立

目的:建立人肝癌细胞株QGY-7701蛋白质组学研究技术.方法:利用两种不同的裂解液提取细胞蛋白,进行双向电泳,经PDQuest软件分析与比较后,挑选匹配良好的10个蛋白点,进行基质辅助激光解析/电离-飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)的鉴定.结果:建立了稳定的人肝癌细胞株QGY-7701的双向电泳图谱,裂解液Ⅱ比裂解液Ⅰ提取的蛋白质量多25%,2-DE胶上蛋白点数多32%,从10个候选蛋白中鉴定出9个有意义的蛋白(P＜0.05).结论:初步建立了人肝癌细胞株QGY-7701的蛋白质组学研究技术,为进一步开展药物蛋白质组学研究奠定基础.     

曲古抑菌素A刺激肝癌细胞株HepG2的蛋白质组学分析

目的：通过对比分析曲古抑菌素A刺激肝癌细胞株HepG2 24h与对照组的蛋白质组表达谱,探讨参与曲古抑菌素A抗肿瘤作用的分子机制提供实验依据。方法：采用双向电泳技术结合生物信息学分析方法对曲古抑菌素A刺激肝癌细胞株HepG2 24h后及对照组的细胞全蛋白进行比较蛋白质组学分析。结果：获得了7个有明显规律性变化的差异表达蛋白点,其中一个蛋白点表达量有所升高,6个差异蛋白点表现为明显下调趋势。结论：本研究发现的这些差异表达蛋白质可能直接或间接参与了曲古抑菌素A抗肿瘤的分子机制。     

不同分化喉鳞状细胞癌蛋白质组差异表达的研究

目的 研究不同分化程度喉鳞状细胞癌黏膜组织蛋白质组的差异表达.方法 用固相pH梯度双向凝胶电泳分离不同分化程度喉癌黏膜组织总蛋白质,行考马斯亮蓝染色,Image Master 2D软件分析所获得的双向凝胶电泳图谱,找出差异表达的蛋白质点.结果 获得分辨率和重复性均较好的双向凝胶电泳图谱,发现13种蛋白质与喉癌分化密切相关.其中有7种蛋白质在高分化喉癌组织中表达上调,6种蛋白质表达明显下调.结论 利用固相pH梯度双向凝胶电泳技术分离不同分化喉鳞状细胞癌黏膜组织总蛋白质,建立了重复性较强的不同分化喉鳞状细胞癌黏膜组织蛋白质组表达图谱,且两者蛋白质的表达明显不同,可能与喉癌不同分化程度的发病机制有关.     

温莪术蛋白双向电泳技术的建立

目的：建立温莪术的双向电泳技术（2-DE）体系。方法：采用TCA／丙酮沉降法提取蛋白,并用超迷离心去除杂质。采用固相pH胶条在IPGphor TM Ⅲ等电聚焦系统上进行等电聚焦,采用Bio-Rad电泳仪进行SDS-PAGE电泳,以银染法染色。结果：得到了上百个点的双向电泳图谱。结论：本研究成功建立了温莪术蛋白双向电泳技术体系。     

白头翁对体外培养阴道毛滴虫蛋白质差异表达的影响

目的：寻找阴道毛滴虫的特异蛋白质并探讨白头翁对其蛋白质差异表达的影响。方法：用固相pH梯度二维凝胶电泳分离阴道毛滴虫总蛋白,凝胶用银染显色,PDQuest7.4.0软件分析。结果：正常对照组找到蛋白质点平均（435±17）个,匹配率为92.5%;白头翁组找到蛋白质点平均（343±9）个,匹配率为94.9%。定性分析,正常组和白头翁组共有58个表达差异点,其中只在正常组中表达的点有45个,只在白头翁组表达的点有13个;定量分析,白头翁组和正常组比较,表达增加大于2倍的点有43个,降低50%以上的点有50个。结论：建立了阴道毛滴虫正常组和白头翁组的二维凝胶电泳图谱,识别了151个差异表达的蛋白质,白头翁杀灭阴道毛滴虫的过程中上述蛋白质发生了质或量的改变。     

HeLa细胞蛋白质组双向电泳技术的建立

目的:建立和优化HeLa细胞蛋白质组分析所需的样品处理方法和双向电泳技术.方法:用三种不同配方的裂解液提取HeLa细胞中的蛋白质,进行双向凝胶电泳,用Amersham ImageMaster VDS-CL型凝胶成像系统获取凝胶图像,以PDQuest(7.4.0)软件进行比较分析.结果:联合使用硫脲和尿素有利于蛋白质的提取,增加碱性蛋白点的检出数量;广谱蛋白酶抑制剂的使用可大大增加双向电泳可检出的蛋白点数,同时使可检出的碱性蛋白点明显增加.结论:本文建立了HeLa细胞双向电泳分析方法,提高了2-DE图谱中蛋白位点的分辨率和重复性,获得了较为理想、清晰的双向电泳图谱,为其蛋白质组学进一步研究奠定了基础.     

宫颈永生化细胞和癌细胞胞膜差异蛋白质组学研究

目的建立HPV-16阳性的宫颈上皮永生化细胞（H8细胞株）和宫颈癌细胞（CaSKi细胞株）胞膜蛋白双向电泳图谱,寻找特征性的差异蛋白点。方法提取两种细胞胞膜蛋白质进行双向凝胶电泳（2-dimensronal gel electrophore-sis,2-DE）,建立电泳图谱,然后筛选出差异点进行基质辅助激光解吸飞行时间串联质谱（matrix-assisted laser desorption/i-onization time-of-flight tandem mass spectrometry,MALDI-TOF-MS/MS）分析,鉴定出蛋白质。结果获得了分辨率和重复性均较好胞膜蛋白2-DE图谱,并分析找出了13个的差异蛋白点,对其中3个显著差异点进行质谱分析和初步鉴定。结论建立了H8和Caski细胞胞膜蛋白2DE图谱,并初步发现LRC8D、EDAR、MTX1蛋白在宫颈癌前病变和宫颈癌细胞胞膜中存在差异表达,为宫颈癌及癌前病变的诊断及癌变机制提供了帮助。     

吗啡耐受大鼠脊髓蛋白质组双向电泳图谱的建立与差异蛋白鉴定

目的：建立吗啡耐受大鼠腰段脊髓组织蛋白质组双向凝胶电泳(two-dimensional gel electrophoresis,2-DE)图 谱,比较分析吗啡耐受大鼠腰段脊髓组织中蛋白质组的变化和差异表达,鉴定出差异表达的蛋白质点并进行验证。 方法：将16只鞘内置管雄性SD大鼠随机分为吗啡耐受组(MT组,n=8)和生理盐水组(NS组,n=8),取其腰段脊髓组织 蛋白以固相pH梯度等电聚焦(immobilized pH gradients isoelectric focusing,IPGIEF)为第一向,十二烷基硫酸钠-聚丙烯 酰胺凝胶电泳(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electroporesis,SDS-PAGE)为第二向进行2-DE,应用PDQuest分析 软件对考马斯亮蓝染色的2-DE图谱进行图像分析,对差异蛋白质点进行基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrixassisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)分析,并利用Mascot查询软件搜索Swiss- Prot数据库进行生物信息学分析。采用蛋白质印迹法验证部分差异蛋白。结果：MT组和NS组大鼠脊髓组织2-DE图谱 中各分离出约1 000个清晰的蛋白质点,其中明显差异表达的蛋白有36个。采用MALDI-TOF-MS分析,并利用Mascot查 询软件搜索Swiss-Prot数据库,共搜索到14个蛋白质,与NS组比较,MT组中表达下调的蛋白质点有2个,表达上调的 蛋白点有12个。采用蛋白质印迹法对其中的NADH脱氢酶及伽玛烯醇化酶蛋白质点进行验证,结果与蛋白质组学结 果一致。结论：初步建立了吗啡耐受大鼠脊髓组织蛋白质组双向电泳图谱,证明吗啡耐受可以引起脊髓中多种蛋白 质的表达改变。     

蛋白质组学技术应用于动脉瘤性蛛网膜下腔出血后脑血管痉挛的可行性研究

目的：探讨蛋白质组学技术用于动脉瘤性蛛网膜下腔出血（SAH）后脑血管痉挛（CVS）研究的可行性.方法：收集22例动脉瘤性SAH患者发病后第1天的脑脊液,按CVS程度将脑脊液标本分成3组：无痉挛组（对照组）、轻中度痉挛组、重度痉挛组.采用双向凝胶电泳分离各组混合脑脊液总蛋白,然后比较无痉挛组与轻中度痉挛组及重度痉挛组之间的双向凝胶电泳图谱.筛选出差异表达的蛋白质点,对差异点用4800 MALDI-TOF/TOF质谱仪进行鉴定.检索NCBInr数据库,确定差异表达的蛋白质.结果：无痉挛组与轻中度痉挛组及重度痉挛组差异表达2倍以上的蛋白质斑点有68个,成功鉴定并命名不同的差异表达蛋白23个.结论：运用蛋白质组学技术成功找到与CVS可能相关蛋白,为动脉瘤性SAH后CVS的发病机制的研究提供了新方法.