广东省2007年度非伤寒沙门菌监测及病原学特征分析

目的 了解广东省腹泻病患者中非伤寒沙门菌感染情况和菌株的血清型别、分布、耐药性变化.方法 对纳入研究的腹泻病患者进行非伤寒沙门菌检测,对分离到的菌株进行血清分型、药物敏感性试验和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型.结果 2007年度共检测1128份腹泻粪便标本,分离到71株沙门菌,阳性检出率为6.29%;共分得29种血清型,肠炎和鼠伤寒沙门菌居多;大多数沙门菌对常用的头孢类和喹诺酮类抗生素敏感,鼠伤寒沙门菌的耐药率普遍较肠炎和斯坦利沙门菌高;除肠炎沙门菌外,其余的血清型没有同一PFGE型别的菌株;用Xba Ⅰ酶切17株肠炎沙门菌可分为PFGE-XbaⅠ 1～8型,其中PFGE-XbaⅠ 4型为优势型别.用Sfi Ⅰ和Not Ⅰ酶对12株肠炎沙门菌进行再分型,综合用Xba Ⅰ/Sfi Ⅰ/Not Ⅰ三种酶的结果 发现仍有三组菌的PFGE图谱是完全一致的.结论 2007年度广东省非伤寒沙门菌的感染多数为散发病例,头孢类和喹诺酮类抗生素是治疗非伤寒沙门菌感染的首选药物.     

伤寒、副伤寒沙门菌耐药性以及viaB基因PCR分析

目的了解长沙地区伤寒、副伤寒沙门菌对抗生素的敏感性以及毒力基因的携带情况。方法纸片扩散法检测32株伤寒、副伤寒沙门菌对6种抗生素的敏感性;PCR扩增viaB基因片断进行检测。结果在测定的6种抗生素中,耐药性最高的为萘啶酸,耐药率达37.5%,而敏感性较高的为头孢噻肟和环丙沙星,敏感率分别为100%和93.8％。32株伤寒和副伤寒沙门菌经PCR检测后,有19株伤寒沙门菌在约469bp处,检测到阳性条带,其余1株伤寒以及12株副伤寒沙门菌未检出viaB毒力基因。结论第三代头孢和第三代的喹诺酮类抗生素仍可作为临床治疗伤寒副伤寒的首选药物,但应注意喹诺酮类药物的耐药趋势;Vi毒力基因在伤寒沙门菌中普遍存在,可广泛应用于疫苗制备和伤寒沙门菌的快速检测。     

一起鼠伤寒沙门菌引起食物中毒的病原鉴定与同源性分析

目的对引起本次食物中毒主要病原菌鼠伤寒沙门菌进行生物学鉴定,血清学分型以及分子的溯源分析,研究分析其相关性,从而达到准确溯源的目的。方法对3份患者肛拭子样本和1份食品样本分离到的沙门菌进行菌株鉴定,采用美国临床实验室标准化研究所CLSI标准推荐微量肉汤稀释法,对分离株进行15种抗生素敏感实验,利用限制性内切酶Xba I酶切沙门菌基因组进行脉冲场凝胶电泳,通过Bio Numerics 6.6软件对电泳图谱进行同源性比较。结果3份患者样本和1份食品留样中共检出鼠伤寒沙门菌4株,均对氨苄西林、四环素、红霉素耐药。运用PFGE对所分离到的鼠伤寒沙门菌进行基因分型,其PFGE图谱相似性系数为100%。结论本次食源性疾病暴发疫情是由进食被鼠伤寒沙门菌污染的食品所致,通过PFGE对致病菌进行溯源,分析其溯源关系,能追踪到菌株来源,PFGE可有效应用于食物中毒溯源分析及分子流行病学研究。     

北京市不同来源非伤寒沙门菌的分子分型和耐药性分析

目的分析北京市不同来源非伤寒沙门菌的分子流行病学特征及耐药情况。方法对腹泻患者粪便和食品中分离的53株非伤寒沙门菌进行血清分型,并对所有菌株进行PFGE分型和抗生素敏感性检测。结果腹泻患者粪便来源和食品来源沙门菌的血清型分布不同,食品中分离到6株鼠伤寒沙门菌单项变种1,4,[5],12:i:-。53株非伤寒沙门菌通过PFGE分型分为31个不同的带型,每个带型包含1~10株菌,同一血清型菌株PFGE带型聚集成簇。抗生素敏感性结果显示,79.25%的菌株对至少一种抗生素耐药,其中多重耐药菌株14株。耐药率高的前三种抗生素分别是:萘啶酸60.38%、四环素35.85%、甲氧苄啶/磺胺甲恶唑18.88%。两种来源的印第安纳沙门菌的耐药情况严重。结论北京市不同来源非伤寒沙门菌的耐药情况比严重,多重耐药菌株的PFGE带型多样,加强耐药监测和分子分型网络化、合理使用抗生素意义重大。     

东莞市不同来源副溶血性弧菌的病原学特征分析

目的了解东莞市不同来源的副溶血性弧菌的病原学特征,为疾病防控提供实验依据。方法实验菌株来源为2012—2013年分别从东莞市食品监测、食物中毒患者及散发病例中分离的43株副溶血性弧菌。根据GB 4789.7—2013对43株副溶血菌株进行生化鉴定及血清学分析;运用K-B纸片法对菌株进行12种抗生素药敏试验;应用实时荧光PCR扩增法检测菌株的tdh、trh基因;并经限制性内切酶NotⅠ酶切后进行脉冲场凝胶电泳（PFGE）分子分型。结果 43株副溶血菌株中,食物中毒患者、散发病例分离株血清型主要为O3∶K6,占所有病例分离株的83.3%（15/18）,25株食品分离株血清型呈多样化分布,无优势血清型;43株副溶血性弧菌对氨苄西林（敏感率为0.0%,0/43）和头孢噻吩（敏感率为20.9%,9/43）敏感率低,对环丙沙星、磺胺复合、亚胺培南完全敏感（敏感率为100.0%,43/43）;毒力基因结果显示,病例分离株均只携带tdh基因,食品分离株均不携带tdh、trh基因;PFGE分子分型结果显示,腹泻散发病例、食物中毒患者分离株带型相对集中,食品分离株带型相对分散,相同血清型的菌株同源性较高,不同食物中毒患者分离株PFGE带型一致。结论食品分离株种类繁多且致病性较低,病例分离株同源性较高且致病性较高。     

上海市闵行区鼠伤寒沙门菌病原学与PFGE分型研究

目的了解2015年-2017年闵行区腹泻病监测点鼠伤寒沙门菌的病原学及脉冲场凝胶电泳(PFGE)特征。方法按照《上海市腹泻病综合监测实施方案》进行沙门菌分离鉴定;药物敏感试验采用纸片扩散法(K-B法);PFGE参照Pulse Net China沙门菌PFGE分子分型标准操作规程。结果鼠伤寒沙门菌在2015年-2017年检出率呈逐年增长趋势;鼠伤寒沙门菌对10种抗生素耐药率为四环素56.32%、萘啶酸31.03%、氯霉素20.69%、复方新诺明17.24%、头孢噻肟8.05%、头孢呋辛8.05%、庆大霉素5.75%、环丙沙星3.45%、头孢西丁1.15%、诺氟沙星1.15%,存在多重耐药。PFGE将87株鼠伤寒沙门菌分为62个带型,每个带型含1株~5株菌,分为A、B两大聚类,相似度为57.2%~100%。结论经过多种抗生素共同作用筛选得到的菌株成为鼠伤寒沙门菌扩散的主要来源,在PFGE优势克隆系中能体现。PFGE技术为聚集性病例的追踪溯源提供了分子生物学依据。     

2008—2013年北京市17株伤寒和副伤寒沙门菌耐药和分子分型研究

目的分析2008—2013年北京市17株伤寒、副伤寒沙门菌耐药及分子分型。方法对2008-2013年通过对北京市肠道门诊监测系统分离到的17株伤寒、副伤寒沙门菌进行生化鉴定、血清分型并运用纸片法进行药敏检测;利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型。结果 17株伤寒、副伤寒沙门菌对三代头孢菌素类药物头孢他啶敏感率达100%,头孢噻肟和头孢曲松敏感率均为93.75%,对氟喹诺酮类药物环丙沙星敏感率为93.75%,萘啶酸耐药率达31.25%。其中16株伤寒、副伤寒沙门菌可分为15种PFGE带型,带型分布较分散。结论北京市伤寒、副伤寒沙门菌分离株对3代头孢类抗生素及环丙沙星敏感;PFGE分子型别较多,无聚集性。     

综合医院非伤寒沙门菌感染腹泻患者病原学分析

目的了解综合医院腹泻患者非伤寒沙门菌感染情况,分析非伤寒沙门菌的血清分型、耐药性和分子特征。方法对2009年9月-2011年6月腹泻病患者送检的767份粪便标本进行非伤寒沙门菌检测,对分离到的菌株进行血清分型、药物敏感性试验和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型。结果从767份腹泻粪便标本中分离到36株非伤寒沙门菌,阳性检出率为4.56%;以儿童为主,占65.71%;共分为10种血清型,主要以鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌为主,分别占37.14%和28.57%;10个血清型非伤寒沙门菌对头孢类和环丙沙星的敏感率>84.00%,除斯坦利沙门菌和山夫登宝沙门菌外,其他血清型均对多种抗菌药物产生不同程度的耐药或交叉耐药;将13株鼠伤寒沙门菌和10株肠炎沙门菌共分离出19个PFGE分型,其中2株肠炎沙门菌PFGE同型,3株鼠伤寒沙门菌PFGE同型,存在不同耐药谱。结论综合医院引起感染性腹泻的非伤寒沙门菌主要为鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌,儿童多见;非伤寒沙门菌多药耐药严重,临床在应用氟喹诺酮类治疗非肠外沙门菌属感染时,应根据药敏结果慎重选择。     

江苏省2012-2015年伤寒/副伤寒沙门菌耐药及分子分型研究

目的 回顾性分析2012-2015年江苏省伤寒/副伤寒沙门菌的耐药表型和分子分型特征。方法 采集江苏省伤寒/副伤寒监测病例的血液和粪便标本,分离培养伤寒/副伤寒沙门菌后进行生化鉴定和血清分型;采用Kirby-Bauer纸片法检测菌株对抗菌药物的敏感性;应用PFGE技术对伤寒和甲型副伤寒沙门菌进行分子分型。结果 134株伤寒沙门菌和甲型副伤寒沙门菌对萘啶酸的耐药率最高,分别为61.2%和86.7%,其余抗生素的耐药率均低于15.0%。伤寒和甲型副伤寒沙门菌中只耐1种抗生素的菌株最多,多重耐药菌在伤寒沙门菌中占2.6%,而在甲型副伤寒沙门菌中占13.3%。2015年伤寒沙门菌的全敏感菌株构成比较2012年增加了44.3%,同年副伤寒沙门菌中出现了耐5种和6种抗生素的多重耐药株。甲型副伤寒沙门菌可分为8种PFGE型别,多重耐药株与其他菌株条带相似性低,不同型别与耐药谱有对应关系;伤寒沙门菌可分为68种PFGE型别,不同型别间变异度较大,与耐药谱无对应关系。结论 2012-2015年江苏省伤寒/副伤寒沙门菌对抗生素的耐药性总体随时间降低,耐药种类数有所增加。伤寒沙门菌株PFGE带型呈现多样性,无耐药谱对应性;而甲型副伤寒菌株PFGE带型较少,有耐药谱对应性。需要加强重点地区重点型别菌株的监测。     

温州市伦敦沙门菌和德尔卑沙门菌耐药性和分子特征研究

目的 分析2014年-2018年温州市伦敦沙门菌和德尔卑沙门菌临床分离株耐药性和分子型别特征。方法 对2014年-2018年食源性疾病腹泻患者分离得到的25株伦敦沙门菌和20株德尔卑沙门菌采用微量肉汤稀释法进行15种抗菌药物的敏感试验,并运用脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)进行分子分型。结果 实验菌株除对3种抗生素敏感外,对其余12种抗生素均有不同程度的耐药,有34株多重耐药(占75. 56%)。四环素耐药率最高(占91. 11%); 25株伦敦沙门菌用XbaⅠ酶切获得16种带型,相似度为66. 5%～100%。20株德尔卑沙门菌用XbaⅠ酶切获得10种带型,相似度为75. 4%～100%。结论 温州市食源性沙门菌耐药状况严重,PFGE带型呈现出多样性的同时又具有较显著的优势带型特点。部分带型与其对应的耐药谱具有一定的关联性。     

Molecular subtyping of Salmonella enterica serovar Typhi isolates from Colombia and Argentina

Salmonella Typhi is the etiological agent of typhoid fever with 16 million annual cases estimated worldwide. In Colombia and Argentina it is a notifiable disease but many cases have only a clinical diagnosis. Molecular subtyping of S. Typhi is necessary to complement epidemiologic analysis of typhoid fever. The aims of this study were to determine the genetic relationships between the strains circulating in both countries and to evaluate possible variations in the distribution of 12 virulence genes. A total of 136 isolates were analyzed by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) with XbaI following PulseNet protocols and analysis guidelines. Eighty-three different PFGE patterns were identified, showing high diversity among the strains from both countries. Three outbreaks, two in Colombia and one in Argentina, were caused by strains of different PFGE types. In Colombia, two PFGE patterns were found predominantly, which included 36.6% of the isolates from that country. No association was found between the PFGE patterns and the year or place of isolation of the strains, the age of the patients or type of sample. However, several clusters were detected, which included isolates recovered predominantly either from Colombia or Argentina. Most of the strains (97%) exhibited a single virulence profile, suggesting that the pathogenicity markers analyzed are of limited value for strain discrimination and do not correlate with the origin of the isolates (intestinal vs. extra-intestinal). Since the creation of PulseNet Latin America, this was the first international study conducted in South America. The PFGE types identified were incorporated into the Regional S. Typhi PulseNet Database and are now available for comparison with those of strains isolated in other regions. This information will be used for active surveillance, future studies, and outbreak investigations.     

2008年-2010年上海市部分伤寒副伤寒沙门菌耐药分析及分子分型

目的:了解上海市2008年-2010年伤寒、副伤寒沙门菌的耐药及分子分型特点,初步掌握伤寒、副伤寒沙门菌的分子流行特点,为今后的防制工作提供科学依据。方法:采用WHO推荐的改良K-B纸片法,对18株伤寒、副伤寒沙门菌进行13种抗生素敏感性试验;运用脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)方法对18株伤寒、副伤寒沙门菌进行分子分型及聚类分析。结果:18株伤寒副伤寒沙门菌对利福平100%耐药,对奈啶酸的耐药率为44.4%,其中伤寒沙门菌对奈啶酸的耐药率为37.5%,5株甲型副伤寒沙门菌对奈啶酸100%耐药,乙型副伤寒对奈啶酸无耐药株。所有菌株对其他11种抗生素均敏感;18株伤寒、副伤寒沙门菌共产生16种PGFE带型,有3株甲型副伤寒沙门菌表现为同一PFGE型别。结论:2008年-2010年伤寒、副伤寒沙门菌对抗生素的敏感性较高;甲型副伤寒沙门菌之间有较高的同源性,伤寒沙门菌的PFGE带型比较分散。     

广西壮族自治区1994-2013年伤寒流行病学特征及菌株耐药分析

目的 分析1994-2013年广西地区伤寒流行特征、菌株耐药特征及其变迁。方法 采用描述流行病学方法分析1994-2013年广西地区伤寒疫情报告资料,对分离自伤寒病例475株沙门菌,利用纸片扩散法及肉汤微量稀释法检测抗菌药物最小抑菌圈和抑菌浓度（MIC）,依据CLSI 2012版敏感判定标准,判定菌株的耐药情况。结果 20年间广西地区共报告伤寒病例57 928例,年均发病率为6.29/10万,病死率为0.03%。<20岁人群发病较高,发病无性别差异,病例以农民和学生为主,主要分布在广西北部地区,全年均有发病,发病高峰在5-10月。2001-2013年发生13起大的暴发疫情,传播方式以水型为主。475株菌对第三代头孢类抗生素头孢噻肟和氟喹诺酮类诺氟沙星的敏感率为100%,对四环素、氯霉素、氨苄西林、庆大霉素的敏感率约为98%,对环丙沙星的敏感率为89.89%;对链霉素、复方新诺明的敏感性较低,为67.73%和65.89%。发现1株环丙沙星耐药、47株环丙沙星敏感性降低的菌株。暴发株与散发株耐药情况无差别。有28株菌耐≥3种抗生素,首次发现1株同时对氨苄西林、氯霉素、链霉素、复方新诺明、四环素、萘啶酸（ACSSxT-NAL）耐药的多重耐药菌株。多耐药株多见于伤寒小范围暴发疫情。结论 广西地区伤寒发病水平仍较高,且菌株出现对临床常用的氟喹诺酮类药物敏感性降低及多重耐药现象,应加强疫情及耐药监测。     

深圳市龙岗区近年伤寒沙门菌耐药性及脉冲场电泳分子分型研究

目的了解深圳市龙岗区近年伤寒沙门菌的耐药性和同源性。方法收集深圳市龙岗区2004—2007年肠道传染病和食物中毒样品中的伤寒沙门菌并用生化和血清学方法进行鉴定,采用改良K-B法进行药敏试验,伤寒沙门菌基因组经限制性内切酶XbaI酶切后,采用脉冲场电泳（PFGE）获得电泳图谱,再利用BioNumerics软件对电泳图谱进行同源性分析。结果共分离到17株伤寒沙门菌,所有菌株均对青霉素和苯唑西林耐药,对第3代头孢菌素、氨基糖苷类、氟喹诺酮类、氯霉素和复方新诺明敏感。64.7%的菌株对3种或以上抗生素中度耐药或耐药。BioNumerics分析结果显示,共有14个不同的PFGE带型出现,除2株以外其余15株分布于3个相似性在85%以上的簇内。结论深圳市龙岗区伤寒沙门菌的耐药已经成为一种非常普遍的现象,需加强监测。氟喹诺酮类和第3代头孢菌素类抗生素在临床上治疗伤寒沙门菌感染仍然可以取得满意效果。深圳市龙岗区可能存在3个伤寒沙门菌的流行克隆,其传播可能是该区伤寒沙门菌发生的主要原因。     

2011—2020年湖南省伤寒、副伤寒流行病学特征和菌株耐药分析

目的 分析2011—2020年湖南省伤寒、副伤寒流行特征和菌株耐药情况,为做好伤寒、副伤寒防控工作提供依据。方法 收集2011—2020年湖南省伤寒、副伤寒监测数据,采用描述性流行病学方法分析三间分布特征,对各市州分离上送的67株伤寒、副伤寒沙门菌采用梅里埃VITEK2 Compact 全自动细菌鉴定及药敏分析系统进行细菌鉴定和药敏分析。结果 10年间湖南省共报告伤寒、副伤寒病例9 888例,死亡0例,年均发病率1.47/10万。发病人群以农民、散居儿童、学生为主,5—9月为高发季节,主要集中在湘南和湘西地区。2011—2020年湖南省共报告4起伤寒、副伤寒暴发疫情,暴发场所均为学校,传播途径均为水型传播。67株伤寒、副伤寒菌对头孢他啶、氨曲南和厄他培南100%敏感;对哌拉西林/他唑巴坦、头孢吡肟和复方新诺明敏感率为98.5%;对氨苄西林/舒巴坦敏感率为97.0%;对头孢唑林、头孢替坦、阿米卡星、庆大霉素和妥布霉素敏感性较低（＜10%）。55.3%菌株对三类及以上抗生素耐药,发现1株同时对8种抗生素耐药。结论 湖南省伤寒、副伤寒发病呈持续低发状态,局部地区存在暴发。菌株多重耐药现象严重,应加强疫情及耐药监测。     

Animal models paving the way for clinical trials of attenuated Salmonella enterica serovar Typhi live oral vaccines and live vectors

Attenuated Salmonella enterica serovar Typhi (S. Typhi) strains can serve as safe and effective oral vaccines to prevent typhoid fever and as live vectors to deliver foreign antigens to the immune system, either by the bacteria expressing antigens through prokaryotic expression plasmids or by delivering foreign genes carried on eukaryotic expression systems (DNA vaccines). The practical utility of such live vector vaccines relies on achieving a proper balance between minimizing the vaccine's reactogenicity and maximizing its immunogenicity. To advance to clinical trials, vaccine candidates need to be pre-clinically evaluated in relevant animal models that attempt to predict what their safety and immunogenicity profile will be when administered to humans. Since S. Typhi is a human-restricted pathogen, a major obstacle that has impeded the progress of vaccine development has been the shortcomings of the animal models available to assess vaccine candidates. In this review, we summarize the usefulness of animal models in the assessment of the degree of attenuation and immunogenicity of novel attenuated S. Typhi strains as vaccine candidates for the prevention of typhoid fever and as live vectors in humans.     

Emergence of ceftriaxone resistant Salmonella enterica serovar Typhi in Eastern India

In view of widespread isolation of fluoroquinolone (FQ) resistant Salmonella enterica serovar Typhi globally, third generation cephalosporins (ceftriaxone) are used as alternative drugs for treatment of typhoid fever in recent years. But reports on emergence of third generation cephalosporin resistant S. Typhi have been documented from various countries including India posing threat in future use of this drug for typhoid treatment. Here, we report on genomic analysis of a third generation cephalosporin resistant S. Typhi strain isolated for the first time from Eastern India, Kolkata during 2019. The study strain was phenotypically resistant to ceftriaxone, ampicillin. Whole genome sequencing revealed the presence of conjugative IncX3 plasmid carrying bla_SHV-12 gene on it. The study strain belongs to H58 haplotype (4.3.1.2) and ST1 type. Comparison of phylogenetic analysis of the study strain with other cephalosporin resistant S. Typhi strains across the world revealed that three strains isolated from Western part of India during 2016 were its closest neighbours. Hence close monitoring of cephalosporin resistant S. Typhi strains are of great importance to control the furure use of this antibiotic for the treatment of typhoid fever.     

福建省50株沙门菌PFGE指纹图谱研究

目的 分析福建省鼠伤寒及肠炎沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)指纹图谱,研究其分型特征.方法 收集2009年50株沙门菌临床分离株,其中30株鼠伤寒沙门菌分离自婴幼儿腹泻患者,20株肠炎沙门菌分离自感染性腹泻患者.选择XbaⅠ酶对沙门菌染色体DNA进行酶切,H9812作为脉冲场凝胶分子量标准.采用PFGE技术分析电泳酶切...     

2016—2019年北京市海淀区副溶血性弧菌血清型、毒力基因及分子分型研究

目的　综合分析北京市海淀区副溶血性弧菌血清型分布、毒力基因携带情况和PFGE分型结果,并找出其相关性,从而掌握海淀区副溶血性弧菌的流行特征。方法　对2016—2019年北京市海淀区检出的63株副溶血性弧菌进行血清分型、毒力基因检测和PFGE分型试验。结果　海淀区副溶血性弧菌最优势流行株的血清型为O3:K6,毒力基因组合为tlh+tdh+,占比69.8%（44/63）;63株副溶血性弧菌经PFGE聚类分析得到37种带型,各带型之间相似度为84.8%～100.0%,其中,61株副溶血性弧菌聚集形成5个簇（带型相似度≥90%）;4年间共出现了8次一定时间内（发病日期间隔≤90 d）分离得到的菌株血清型、毒力基因和PFGE带型均一致的情况。结论　海淀区副溶血性弧菌的污染来源相对固定且单一。副溶血性弧菌血清分型和PFGE之间无特殊相关性;毒力基因相同的菌株,PFGE带型相似度更高。     

ESBL-Producing Salmonella enterica Serovar Typhi in Traveler Returning from Guatemala to Spain

We report a case of typhoid fever in a traveler returning to Spain from Guatemala that was caused by Salmonella enterica serovar Typhi which produced an extended-spectrum β-lactamase (ESBL). This finding demonstrates the presence of ESBL-producing S. enterica ser. Typhi strains in the Americas. Enhanced surveillance is necessary to prevent further spread.