利用基因芯片筛选大肠癌中细胞增殖相关基因

目的 用基因芯片技术筛选大肠癌中细胞增殖相关基因. 方法 利用HG-U133 Plus2.0基因芯片.对大肠癌组织和正常组织基因表达谱进行检测,并利用生物信息学方法对检测结果进行分析. 结果 ①癌组织与正常组织比较,表达差异2倍以上基因共有1 200个,其中表达上调的474个,表达下调的726个.②在1 200个基因中,共有127个基因与细胞的增殖功能相关,其中表达上调的66个,表达下调的61个. 结论 127个细胞增殖相关基因可为大肠癌的基因治疗提供靶点.     

大肠癌组织与癌旁正常组织基因差异表达图谱及信号通路研究

目的筛查人大肠癌肿瘤组织与相应癌旁正常组织差异表达基因。方法应用NimbleGen基因芯片检测4例大肠癌肿瘤组织及相应癌旁正常组织基因表达谱,并以RT-PCR技术对部分基因芯片检测结果进行验证,利用生物信息学方法对检测结果进行分析。结果大肠癌肿瘤组织和癌旁正常组织差异表达基因共5042条,其中表达水平上调3399条,下调1643条,这些基因涉及多个信号通路。结论本研究结果可为寻找大肠癌分子标记物和探索大肠癌发生的分子机制提供实验依据。     

利用全基因组寡核苷酸筛选大肠癌差异表达基因

目的筛查人大肠癌组织与相应正常大肠粘膜差异表达基因。方法应用美国AffymetrixHG—U133寡核苷酸芯片（代表迄今所知的32264个人类全基因．包括19308个已知的人类基因和12956个EST簇）检测9例大肠癌组织及相应正常大肠粘膜基因表达谱，并以实时荧光定量PCR技术对基因芯片检测结果进行验证；综合运用交集补集、秩和检验及t检验比较两组表达谱数据结果获得大肠癌组织与正常大肠粘膜组织差异表达基因和ESTs3125个（包括肿瘤上调基因ESTs974个、下调基因ESTs2151个）；大肠癌组织表达而相应正常粘膜不表达的ESTs245个：大肠癌组织不表达而正常粘膜表达的ESTs162个；最重要的大肠癌差异表达基因ESTs17个。本研究所筛得之大肠癌差异表达基因80．1％未见报道。结论综合运用交集补集分析、t检验、秩和检验对基因谱数据进行挖掘的策略，可为寻找大肠癌分子标记物和从整体上探讨大肠癌发生的分子机制奠定基础。     

利用全基因组寡核苷酸筛选大肠癌差异表达基因

目的 筛查人大肠癌组织与相应正常大肠粘膜差异表达基因。方法 应用美国AffymetrixHG-U133寡核苷酸芯片(代表迄今所知的32264个人类全基因,包括19308个已知的人类基因和12956个EST簇)检测9例大肠癌组织及相应正常大肠粘膜基因表达谱,并以实时荧光定量PCR技术对基因芯片检测结果进行验证;综合运用交集补集、秩和检验及t检验比较两组表达谱数据。结果 获得大肠癌组织与正常大肠粘膜组织差异表达基因和ESTs3125个(包括肿瘤上调基因ESTs974个、下调基因ESTs2151个);大肠癌组织表达而相应正常粘膜不表达的ESTs245个;大肠癌组织不表达而正常粘膜表达的ESTs162个;最重要的大肠癌差异表达基因ESTs17个。本研究所筛得之大肠癌差异表达基因80.1%未见报道。结论 综合运用交集补集分析、t检验、秩和检验对基因谱数据进行挖掘的策略,可为寻找大肠癌分子标记物和从整体上探讨大肠癌发生的分子机制奠定基础。     

应用基因芯片技术初步探讨散发性甲状旁腺腺瘤基因表达谱

目的应用基因芯片技术研究散发性甲状旁腺腺瘤基因表达谱的改变,为进一步阐明其早期诊断和发病机理奠定基础。方法抽提正常甲状旁腺和甲状旁腺腺瘤组织中的mRNA来制备探针,经杂交、洗涤后,通过计算机扫描分析正常甲状旁腺和甲状旁腺腺瘤组织基因表达谱的差异情况。结果腺瘤组与正常组的ratio值相比,如以2倍为界,有2302条基因表达发生明显变化,其中1012条基因表达水平明显上调,1290条明显下调。以5倍为界,有10条基因上调,27条下调。基因的功能涉及运输、细胞黏附、信号转导、转录和离子结合等。结论高通量基因芯片技术筛选出大量的散发性甲状旁腺腺瘤相关基因,对这些基因功能的研究可能有助阐明其早期诊断及发病机理。     

基因芯片技术对先天性巨结肠症相关基因的筛选

目的应用基因芯片技术筛选先天性巨结肠症(hirschsprung disease,HD)病变组织与自身正常组织之间的差异表达基因。方法采用全人类基因组表达谱芯片检测4对HD及其正常切缘组织的基因表达谱,并用RTPCR技术对个别差异表达基因进行验证。结果筛选出有表达意义的基因12 125个。筛选4对标本的差异表达基因共622个,其中下调基因584个(93.89%),上调基因38个(6.11%)。6个基因芯片与RT-PCR检测结果一致:其中碳酸酐酶平均上调76.05倍(芯片结果9.7倍),T细胞分化蛋白平均上调7.2倍(芯片结果5.3倍),细胞凋亡通路相关基因caspase-7平均上调3.04倍(芯片结果2.5倍),心脏和神经脊衍生蛋白2平均下调0.32倍(芯片结果0.23倍),神经降压素受体1平均下调0.32倍(芯片结果0.19倍),微管蛋白β-2B平均下调0.30倍(芯片结果0.19倍)。结论 HD组织与正常结肠组织间在基因的表达层面存在明显差异,筛选得到的基因可能参与了HD病变发生发展的生物学过程。     

大肠腺瘤细胞凋亡及肿瘤相关基因的初步研究

目的探索大肠腺瘤特异性相关基因。方法用基因芯片技术研究大肠腺瘤的基因表达谱,筛选出的差异表达基因,并以RT-PCR对部分差异表达基因进行检测来验证芯片结果。结果大肠腺瘤的282特异性差异表达的基因,基因上调85个,下调197个。结论大肠腺瘤有多种基因发生差异表达,其中癌基因与抑癌基因肿瘤相关基因及细胞凋亡基因是大肠腺瘤的相关基因。     

基因芯片技术筛选大鼠ARDS差异表达基因的研究

目的 用全基因表达谱芯片技术筛选大鼠急性呼吸窘迫综合征(ARDS)的差异表达基因并对其进行分析,以进一步阐明ARDS发病的分子机制.方法 分别从正常和ARDS大鼠肺组织中提取总RNA,分离纯化mRNA,经逆转录合成掺入生物素标记的cDNA探针,然后与基因芯片(涵盖27044转录本,代表22012个基因)杂交,扫描芯片荧光信号图像,用Sam3.0进行统计处理,用博奥生物分子功能注释系统V4.0进行功能分析.随机选择3个差异表达基因,用荧光定量KT-PCR.验证.结果 芯片检测结果显示,在ARDS大鼠肺组织中,表达上调1.5倍以上的基因有73个,下调1.5倍以上的基因有298个.其中,代谢相关基因上调的有1个,下调的有34个;免疫相关基因上调的有3个,下调的有7个;信号传导相关基因上调的有2个,下调的有9个;神经相关的基因上调的有3个,下调的有3个.结论 全基因表达谱芯片技术是筛选AR.DS差异表达基因的有效方法,用该法筛选出一些差异表达基因,为初步阐明ARDS的发病机制奠定了基础.     

HERG1基因表达与大肠癌诊断相关性研究

目的:比较HERG1(Human ether-a-go-go-related gene)基因在大肠癌组织(癌变组)、癌旁组织(癌旁组)和腺瘤组织(腺瘤组)中的表达水平,为大肠癌早期诊断和治疗提供更有特异性和敏感性的生物学标志和分子治疗靶点。方法:利用免疫组化方法检测42例大肠癌标本和其相应癌旁组织标本、50例腺瘤标本中的HERG1蛋白表达水平。结果:HERG1基因在42例大肠癌标本中均有表达(100%),癌旁组织中无表达(P<0.01),在50例腺瘤标本(直径≥0.4 cm)表达15例(30.0%),两者差异有统计学意义(P<0.01)。结论:HERG1基因在原发性大肠癌组织中高表达,这一基因可能成为敏感的大肠癌标志物。     

基因芯片筛选早期子宫颈鳞癌淋巴转移相关基因

目的应用基因芯片技术筛选早期子宫颈鳞癌淋巴转移相关基因。方法利用代表人类全基因组的Affymetrix U133 plus 2．0基因表达谱芯片筛查淋巴转移的早期子宫颈鳞癌组织、未转移子宫颈鳞癌组织及正常子宫颈上皮之间的基因表达差异,并进行生物信息学分析。结果与未转移子宫颈鳞癌相比,淋巴转移宫颈癌2倍以上差异表达的基因322条,其中表达上调的基因182条,表达下调的基因140条;4倍以上差异基因37条,其中在淋巴转移组织中上调基因21条,下调基因16条。差异表达基因的功能分类包括：DNA依赖的转录调节基因、发育基因、免疫反应基因、蛋白质水解基因和细胞问信号传导基因等。而三组间两两比较发现,在正常子宫颈与无转移宫颈癌组织中表达无差异的基因中,发现转移组和未转移组表达水平具有2倍以上差异的基因有23条,其中在转移组中,上调基因16条,下调基因7条。与正常子宫颈相比,未转移组中表达上调的基因中有8条基因在转移组表达下调;与正常组相比。未转移组中表达下调的基因中有6条基因在转移组表达上调。在所有未转移宫颈癌组织较正常宫颈组织表达上调的基因中,未发现在转移组有进一步表达上调的基因;在所有未转移宫颈癌组织较正常宫颈组织表达下调的基因中,也未发现在转移组有进一步表达下调的基因。结论早期子宫颈鳞癌淋巴转移是复杂的多基因作用的结果。本实验初步提供了宫颈癌发生淋巴转移的总体基因表达改变图谱。     

结直肠癌缺陷基因蛋白在大肠肿瘤中的表达及临床意义

目的：探讨结直肠癌缺陷基因在大肠腺瘤－癌演序中的蛋白表达及其临床意义。方法：以结直肠癌缺陷基因蛋白胞内部分独特氨基酸链的单抗15041A为一抗，免疫组化ABC法检测21例大肠粘膜、40例伴不同程度不典型增生大肠腺瘤、21例大肠癌组织的蛋白表达情况。结果：结直怕癌缺陷基因蛋白表达率，大肠粘膜及轻度不典型增生大肠腺瘤100％，中度不典型增生腺瘤93％，明显高于重度不典型增生腺瘤（45％）及大肠瘤（33％），P＜0．05。结论：结直肠癌缺陷基因蛋白表达缺失与大肠腺瘤演变及大肠癌发展相关，免疫组化法检测结直肠癌缺陷基因蛋白发现癌前病变，研究大肠瘤演变及大肠癌发展具有重要意义。     

大肠腺癌和腺瘤AEG-1基因的表达及意义

目的 探讨AEG-1在大肠癌中的表达及其临床病理意义.方法 采用免疫组化的方法 检测60例正常大肠粘膜、22例大肠腺瘤和60例大肠腺癌中AEG-1的表达.结果 大肠腺癌和腺瘤中AEG-1的阳性率分别为91.7%和90.9%,明显高于正常大肠粘膜组织的23.3%,两者之间差异有统计学意义(P<0.001),其中大肠腺癌的...     

C-erbB-2、Bmi-1 及PTEN 基因在大肠癌组织中的表达及意义

目的 研究C-erbB-2、Bmi-1 及PTEN 基因在大肠癌组织中的表达及其临床意义。方法 选取50 例大肠癌标本及50 例癌旁正常大肠黏膜组织进行免疫组化检测,并分析C-erbB-2、Bmi-1 及PTEN 基因在两者中的表达及三种基因之间相关性研究。结果（1）C-erbB-2、Bmi-1 基因在大肠癌组织中的表达均明显高于在正常大肠组织中的表达,PTEN 基因在大肠癌组织中表达显著低于在正常大肠组织中的表达,差异有统计学意义。（2）C-erbB-2、Bmi-1 基因与大肠癌的淋巴转移、分化程度、浸润深度、Ducks 分期呈正相关,其与大肠癌的发生、发展及生物学行为具有促进作用;而PTEN 基因与大肠癌的淋巴转移、分化程度、浸润深度、Ducks 分期呈负相关,与大肠癌的发生、发展及生物学行为具有抑制作用。（3）大肠癌组织中C-erbB-2、Bmi-1 及PTEN 基因之间具有相关性,其中C-erbB-2、Bmi-1 基因在大肠癌的发生发展过程中成正相关;C-erbB-2、PTEN 基因在大肠癌的发生发展过程中呈负相关;Bmi-1、PTEN 基因在大肠癌的发生发展中呈负相关。结论 C-erbB-2、Bmi-1 和PTEN 基因在大肠癌发生发展中起一定作用,联合检测可能成为预后、靶向治疗的标志物。     

Caspase-3基因在大肠癌、大肠腺瘤中的表达及其与细胞凋亡的关系

目的探讨大肠癌、大肠腺瘤中Caspase-3基因的表达及其与细胞凋亡的关系。方法采用免疫组化S-P法和原位末端标记法分别检测28例大肠癌、10例大肠腺瘤及5例正常大肠黏膜中Caspase-3基因的表达水平及细胞凋亡。结果Caspase-3基因在大肠癌、大肠腺瘤和正常黏膜组织中表达分别为46．4％（13／28）、60．0％（6／10）、80.0％（4／5），三者之间有显著性差异（P〈0．01）。大肠癌、大肠腺瘤中细胞凋亡指数显著高于正常黏膜组织（P〈0．01），凋亡指数与肿瘤的分化程度有关（P〈0．01），与病理类型、Dukes分期无关。大肠癌、大肠腺瘤中Caspase-3基因表达与细胞凋亡指数密切相关，阳性表达的细胞平均凋亡指数明显高于阴性表达的平均凋亡指数（P〈0．01），而正常黏膜组织中二者无显著性差异（P〉0．05）。结论肿瘤早期阶段的细胞凋亡异常和过度增生，可能是大肠癌的发病原因之一，作为细胞凋亡的调控因子，Caspase-3可能在大肠癌的发生发展中起重要作用。     

FHIT基因在结直肠癌组织中的异常表达

目的:探讨FHIT基因与结直肠癌发生之间的关系.方法:采用逆转录巢式酶链免疫反应,对41例结直肠癌组织及其配对的癌旁正常组织和25例良性腺瘤的FHIT基因进行检测.结果:在15例(38.9%)结直肠癌组织中检测到异常FHIT转录本,配对正常组织和良性腺瘤均未检测到异常转录本;测序证实异常转录本缺失3～5个FHIT外显子.异常FHIT转录本与结直肠癌患者的年龄、性别、肿瘤部位、大小、血清癌胚抗原(CEA)的水平、组织学类型均无相关性(P＞0.05);与分化程度、病理分期、淋巴转移、远处转移相关(P＜0.05).结论:异常FHIT转录本的表达是结直肠癌发生中的常见事件,FHIT基因异常与结直肠癌的发生发展有关.     

大鼠结直肠腺瘤—癌序列模型的APC蛋白表达及意义

目的 探讨SD大鼠结直肠“腺瘤-癌”序列模型不同病变阶段正常组织、腺瘤和癌变组织中结肠腺瘤性息肉病基因（adenomatous polyposis coli,APC）蛋白表达水平的变化.方法 采用1,2-二甲基肼盐建立结直肠“腺瘤-癌”序列动物模型.按30mg·kg^-1体质量,每周皮下注射1次,连续注射20周.造模完成后取同时存在正常、腺瘤和癌组织的30例SD大鼠结直肠组织标本,用免疫组化染色方法检测APC蛋白的表达水平.结果 APC阳性表达率在癌、腺瘤、正常组织中均不同（P＜0.05）;APC阳性率正常组高于腺瘤组和癌变组,腺瘤组高于癌变组（P ＜0.0125）.免疫染色结果显示,在腺瘤-癌序列进展过程中,阳性细胞数与染色强度逐渐下降.结论 SD大鼠“腺瘤-癌”序列动物模型中,APC蛋白在不同阶段表达水平不同,可作为预测结直肠癌发生的早期肿瘤标志物.