2019年安徽省皖北、皖中和皖南地区细菌耐药差异性分析

  目的  分析2019年安徽省皖北、皖中和皖南地区细菌临床分布和耐药差异性，为不同地区临床医生选择抗菌药物提供合理参考。  方法  收集2019年安徽省细菌耐药监测网38家成员单位临床分离菌株按地区分成皖北、皖中和皖南地区，采用WHONET 5.6软件和SPSS 17.0软件进行统计分析。  结果  皖北地区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌检出率高于皖中和皖南地区，铜绿假单胞菌和鲍曼不动杆菌对头孢哌酮/舒巴坦耐药率分别为20.8%和60.4%；皖中地区耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌高于皖北和皖南地区，肺炎克雷伯菌对头孢菌素类耐药率＞40.0%，对亚胺培南和美洛培南耐药率＞20.0%；皖南地区耐甲氧西林葡萄球菌对氨基糖苷类和喹诺酮类耐药率高于皖北地区。  结论  安徽省不同地区之间细菌耐药差异明显，需根据本地区细菌耐药情况合理选用抗菌药物。     

新生儿携带MRSA和MSSA的现状及其耐药谱分析

  目的  了解新生儿耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（methicillin-resistant staphylococcus aureus,MRSA）和甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌（methicillin-sensitive staphylococcus aureus,MSSA）的携带现状及其耐药情况。  方法  采用横断面研究,于2015年8月-11月,对深圳市龙华区人民医院和观澜医院的1 834名新生儿进行棉拭子采样、菌株分离鉴定及药物敏感试验。  结果  新生儿金黄色葡萄球菌（staphylococcus aureus,SA）、MRSA、MSSA的携带率分别为3.27%（60/1 834）、0.82%（15/1 834）、2.45%（45/1 834）。MRSA与MSSA对青霉素、红霉素的耐药率较高,对利奈唑胺的耐药率均小于10%。MRSA对红霉素、莫西沙星、克林霉素的耐药率均高于MSSA（均有P < 0.05）;MRSA的多重耐药率高达80.00%,风险是MSSA的12.36倍。  结论  该地区新生儿SA尤其是MRSA多重耐药率较高,且MRSA耐药情况比MSSA更严重。     

青海省2016—2019年学生肺结核病流行特征分析

  目的  研究青海省学生肺结核流行特征,为预防控制学生结核病提供科学依据。  方法  收集2016—2019年青海省学生肺结核资料,分析流行特征,使用ArcMap 10.8绘制疾病空间分布图。  结果  青海省2016—2019年学生肺结核报告病例累计2 691例,各年报告发病率为46.10/10万、68.59/10万、73.49/10万、85.96/10万,呈逐年上升趋势(χ2=116.45,P < 0.01)。每年3—9月高发;患者以18岁及以上学生人群为主,女生多于男生,其中藏族学生报告病例最多;青海南部地区学生肺结核疫情最为严重,以玉树、果洛两地居多,但西宁市2018—2019年肺结核疫情上升迅速。  结论  青海省学生肺结核疫情较为严重,学校应该加强结核病预防宣传教育,重点关注青海南部地区与西宁地区。     

1001名 HIV感染者鼻腔 MRCoNS与 MS-CoNS耐药谱比较

  目的  探究广州市人类免疫缺陷病毒（human immunodeficiency virus,HIV）感染者鼻腔凝固酶阴性葡萄球菌（coagulase-negative staphylococci,CoNS）携带情况和耐药谱特征。  方法  对广州市某医院艾滋病门诊部HIV感染者鼻腔分离出的CoNS进行药敏试验和耐药基因检测。  结果  1 001名HIV感染者鼻腔CoNS和耐甲氧西林凝固酶阴性葡萄球菌（methicillin-resistant coagulase-negative staphylococci,MRCoNS）携带率分别为57.44%和48.15%,MRCoNS对青霉素、红霉素和复方新诺明耐药率较高,主要携带Aac（6'）-aph（2'）、ermC和linA耐药基因。MRCoNS（80.69%）与甲氧西林敏感凝固酶阴性葡萄球菌（methicillin-susceptible coagulase-negative staphylococci,MSCoNS）（39.66%）多重耐药率差异有统计学意义（χ2=100.27,P < 0.001）。  结论  广州市HIV感染者鼻腔CoNS和MRCoNS携带率及多重耐药率均较高,与MSCoNS相比MRCoNS可增加6.36倍多重耐药风险。     

浙江地区耐多药结核分枝杆菌基因突变特征分析

  目的  分析浙江地区耐多药结核分枝杆菌(M.tuberculosis complex, MTBC)异烟肼(isoniazid, INH)和利福平(rifampicin, RIF)耐药相关基因突变特征。  方法  对患者痰标本阳性培养物进行菌种鉴定,提取耐多药菌株DNA,应用PCR法对inhA、katG和rpoB RRDR区进行扩增,并将扩增产物直接进行基因测序。  结果  共鉴定出3 317株MTBC,对应的患者中初治为3 009例,复治为308例,耐多药结核病(multidrug-resistant tuberculosis, MDR-TB)为84例,占比为2.53%(84/3 317)。其中,在INH耐药方面,47株分别在katG(315)或inhA(-15/-8)发生单位点突变,19株同时出现katG(315)和inhA(-15/-8)突变,18株未检测出上述基因突变,基因型同表型的符合率为78.57%(66/84),突变频率最高的位点是Ser315Thr,占47.62%(40/84)。在RIF耐药方面,79株在rpoB(511、512、513、516、522、526和531位点)出现突变,2株同时出现511/513和511/516突变,突变频率最高的位点是Ser531Leu,占58.33%(49/84),3株未检测出rpoB突变,基因型同表型的符合率为96.43%(81/84)。  结论  浙江地区MDR-TB流行株基因突变仍然集中在常见的基因位点,表明在本地区利用Xpert MTB/RIF筛查MDR-TB患者仍具有较高的应用价值。     

2015-2017年度韶关市结核病就诊患者耐多药情况分析

  目的  探析位于粤北山区的韶关市2015-2017年度耐多药肺结核患者（multi drug resistant pulmonary tuberculosis,MDR-TB）的筛查情况。  方法  回顾性分析562例可疑MDR-TB患者及新患者的临床资料,所有患者均接受了传统药敏试验,统计异烟肼（isonicotinyl hydrazide,INH）、利福平（rifampicin,RFP）、乙胺丁醇（Ethambutol,EMB）、链霉素（streptomycin,SM）、氧氟沙星（ofloxacin,Ofx）、卡那霉素（kanamycin,Km）耐药情况及MDR-TB筛查结果。  结果  传统药敏试验结果中,SM的耐药率最高,达19.22%（108/562）,KM的耐药率最低,为4.45%（25/562）。562例患者的传统确诊结果显示,MDR-TB检出率为6.94%（39/562）。MDR-TB检出率在性别、年龄、文化程度、地区之间均无统计学意义（均有P>0.05）;不同患者类型的MDR-TB检出率之间有统计学意义（P < 0.001）。  结论  肺结核患者耐药率顺位依次为链霉素、异烟肼、利福平、乙胺丁醇、氧氟沙星和卡那霉素。复治组患者的单耐药率、耐多药率均高于初治组。应以复治患者为重点,扩大筛查范围,及时治愈初治患者。     

男男同性恋人群治疗前HIV-1流行毒株及其变异研究

  目的  了解掌握男男同性恋者(men who have sex with men, MSM)人群治疗前人类免疫缺陷病毒Ⅰ型(human immunodeficiency virus type one, HIV-1)流行毒株与基因变异特点。  方法  使用In-house方法进行耐药基因型检测,通过系统进化分析和HIV-1耐药数据库比对确定基因型和基因变异情况。  结果  石家庄市MSM人群中共有5种HIV-1基因型毒株在流行,CRF01_AE是最主要流行毒株,占到56.8%(25/44),其次是CRF07_BC 29.5%(13/44),URFs 9.1%(4/44),B亚型2.3%(1/44)和CRF55_01B 2.3%(1/44)。URFs主要包括CRF01_AE/B和CRF01_AE/C两种重组模式。χ2检验显示不同基因型毒株在婚姻状况、年龄和首次CD4+ T淋巴细胞中的分布差异均有统计学意义(均有P < 0.05)。发现1例MSM在HIV-1 NNRT编码区225位点处发生了耐药基因突变(P225H),原发耐药率为2.3%(1/44),可导致依非韦伦(EFV)和奈韦拉平(NVP)中度耐药。  结论  加强MSM人群中HIV-1流行和耐药监测研究对控制本市HIV疫情发展具有重要意义。     

肺炎克雷伯菌中CRISPR调控耐药机制及其分布特征与分离地点的关系

  目的  了解呼吸道标本肺炎克雷伯菌中成簇规律间隔短回文重复序列（clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR）对耐药的调控机制,并分析其CRISPR分布特征与分离地点的关系。  方法  收集并提取120株肺炎克雷伯菌的基因组DNA,通过扩增CRISPR/Cas（clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated）系统相关基因CRISPR 1、CRISPR 2来确定CRISPR阳性菌株。CRISPR阳性菌株的耐药表型用BD Phoenix-100细菌鉴定仪进行检测,利用CRISPR Target寻找间隔序列同源噬菌体或质粒,并在Center for Genomic Epidemiology上查找同源质粒或噬菌体的耐药信息并检测间隔序列所在菌株的耐药基因,分析两者携带耐药基因的关系。采用CRISPR Finder分析CRISPR并运用多序列比对分析间隔序列的一致性。  结果  CRISPR1、CRISPR2阳性率分别为12.50%和13.33%;间隔序列同源质粒与其所在菌株均携带共同的耐药基因,且菌株的耐药表型与其携带的耐药基因高度符合;相同地点菌株的CRISPR分布具有极高相似性。  结论  肺炎克雷伯菌通过将外来质粒的耐药基因片段整合到菌株的基因组中实现对菌株耐药性的调控;CRISPR中间隔序列的分布与菌株分离地点密切相关,为临床治疗和感染控制工作提供理论依据。     

2007—2020年武汉市耐药肺结核高危人群耐药流行趋势

  目的  回顾性分析2007—2020年武汉市耐药肺结核高危人群耐药流行趋势。  方法  对2007年1月1日—2020年12月31日武汉市新登记的5 139例耐药肺结核高危人群进行筛查, 采用描述性研究、趋势χ2检验和多因素非条件logistic回归分析模型进行统计分析。  结果  武汉市耐药肺结核高危人群结核分枝杆菌总耐药率为35.51%(1 600/4 506),6种抗结核药物的任何耐药频度依次为:异烟肼(isoniazid,H)>利福平(rifampin,R)>链霉素(streptomycin,S)>氧氟沙星(ofloxacin,O)>乙胺丁醇(ethambutol,E)>卡那霉素(Kanamycin,K)。2007—2020年除O耐药率外,总耐药率、耐多药率和H、R、S、E、K耐药率均呈上升趋势(R耐药率:P=0.002,其余均有P < 0.001)。2015—2020年耐药、耐多药、H、E、S、O、K耐药率均无上升趋势,R耐药率呈上升趋势(P=0.002)。  结论  2007—2020年武汉市耐药肺结核高危人群耐药疫情呈上升趋势。虽然2015—2020年未呈上升趋势,但仍迫切需要加强对此类人群的管理和控制。     

2014-2018年中国大陆地区淋病流行趋势及空间分布特征

  目的  探讨2014-2018年中国大陆地区淋病流行趋势及空间分布特征,为确定重点防控区域和制定有针对性的防控策略提供参考依据。  方法  基于2014-2018年中国大陆地区31个省、自治区和直辖市(港澳台地区除外)淋病报告发病数据,应用地理信息系统(geographic information system, GIS)进行空间自相关分析、冷热点分析、克里金(Kirging)插值预测,采用ArcGIS 10.6软件实现可视化地图绘制。  结果  2014-2018年中国大陆地区淋病发病率总体呈上升趋势,2014-2018年淋病发病率的空间分布呈空间正相关特征(Moran’I=0.335, Z=3.581, P＜0.001),且发病热点区域主要集中在江苏省、上海市、浙江省和福建省等东南沿海地区。Kirging插值预测结果显示:2014-2018年淋病发病率总体呈“东南高中西低”的空间分布格局,发病率高值区与热点分析结果一致。  结论  2014-2018年中国大陆地区淋病发病呈现空间聚集性分布,需加强热点区域淋病防控工作。     

河南省扩大免疫规划阶段流行性腮腺炎流行特征和时空聚集性

  目的  分析河南省2008-2019年流行性腮腺炎的时空分布特征，识别高危聚集区，为流行性腮腺炎的防控提供科学建议。  方法  基于中国传染病监测信息报告管理系统，通过描述性流行病学方法分析河南省2008-2019年流行性腮腺炎三间分布特征。采用ArcGIS 10.7软件进行三维趋势分析和结果可视化呈现，应用SaTScan 9.4软件进行时空扫描分析。  结果  河南省2008-2019年累计报告223 499例流行性腮腺炎，年平均报告发病率为19.68/10万；病例主要集中在5~10岁儿童和青少年，占病例总数的50.61%；每年的3-7月及11月-次年1月为发病高峰。三维趋势分析显示，河南省流行性腮腺炎发病由南向北逐渐升高，且东部略高于西部；时空扫描统计结果显示:共识别到6个时空聚集区，主要聚集区位于北部安阳地区，包含4个县区，聚集时间为2008-2013年。  结论  2008-2019年河南省流行性腮腺炎发病水平呈平稳的波动趋势，且存在明显季节性规律，5~10岁的儿童和青少年为其主要发病人群，2008-2019年河南省流行性腮腺炎存在时空聚集性，主要聚集区呈动态变化，近两年东南部地区出现聚集区，应重点关注。     

基于百日咳时间序列特征的聚类分析

  目的  利用时间序列特征提取方法对中国25个省级行政区的百日咳发病数据进行聚类, 根据聚类结果分析出各地区百日咳不同的发病模式, 为中国实施百日咳疾病防控统一规划提供科学依据。  方法  提取全国25个省级行政区百日咳时间序列的9个全局特征, 利用主成分分析将9个指标转化为3个主成分组成的特征矩阵进行层次聚类分析。选择最佳聚类数划分百日咳时间序列不同的发病模式。  结果  层次聚类最佳聚类数为3类, 即对应百日咳的3种发病模式, 分别为无周期性有季节性无趋势性模式(共9个省级行政区)、无周期性有季节性有趋势性模式(共10个省级行政区)和有周期性有季节性有趋势性模式(共6个省级行政区)。  结论  时间序列特征提取的层次聚类能够很好地将相似模式紧密的分在一组, 并准确的划分出中国25个省级行政区百日咳疫情的发病模式, 聚类结果可为相关部门制定不同省份百日咳的防控措施提供理论依据。     

2010-2019年中国艾滋病流行时空分布特征

  目的  分析2010-2019年中国AIDS发病数据的时空分布特征。  方法  AIDS发病数据来源于中国卫生年鉴和公共卫生科学数据中心,人口学数据来源于国家统计局。使用线性趋势χ2检验和分级地图分析AIDS流行趋势,运用GeoDa 1.18软件进行全局和局部空间自相关分析,运用SaTScan 9.7软件进行时空扫描分析。  结果  中国AIDS发病率线性趋势χ2检验值为30.432(P＜0.001);分级地图显示中国发病率地理分布差异较大,表现出“南重北轻、西高东低”的空间格局。全局空间自相关分析得到Moran’s I值从2010年的0.196上升至2019年的0.383,表明存在空间正自相关性,且相关程度不断增强。局部空间自相关分析结果表明,广西壮族自治区和云南省一直为高-高聚集模式,2012年贵州省由低-高聚集转变成高-高聚集,2014年河南省由高-低聚集转变为低-低聚集,2016-2019年高-高聚集模式新增湖南省、四川省和重庆市。时空扫描分析共探测出3个聚集区域,在时间和空间上具有一定的聚集性。  结论  中国AIDS疫情在空间上具有地域差异性,空间聚集性逐年增强,且西南地区高-高聚齐区域不断扩大,根据时空特征分析制定针对性防控策略,可达到区域协作和合理分配资源的作用。