河北省卢龙县1999～2001年婴幼儿杯状病毒腹泻流行病学研究

目的 研究河北省卢龙县5岁以下婴幼儿杯状病毒腹泻的流行特点。方法 应用酶联免疫吸附试验(ELISA)和逆转录—聚合酶链反应(RT—PCR)方法检测人类杯状病毒(HuCVs)。部分阳性标本的PCR产物经克隆测序，结合参考毒株相应的核苷酸序列进行进化分析。利用住院腹泻患者粪便样本中HuCVs的检出率，估计HuCVs腹泻住院率。结果 HuCVs检出率为31．6％，住院患者HuCVs阳性率为17．5％，主要分布在3～17月龄婴幼儿，发病主要集中在冬季。11株测序病毒之间的核苷酸序列同源性为55．1％～100％，均属于诺瓦克病毒(NLV)GⅡ遗传组。卢龙县2000年HuCVs流行株为NLVGⅡ-4和GⅡ-7，2001年为NLVGⅡ-3和GⅡ-7。初步估计HuCVs腹泻患者住院率为3．6‰。结论 河北省卢龙县婴幼儿中存在不同基因型杯状病毒感染，以NLVGⅡ组毒株为主，其疾病负担仅次于轮状病毒。     

2008年广州市婴幼儿诺如病毒感染流行特征及基因型研究

目的了解广州市5岁以下婴幼儿诺如病毒感染状况及对诺如病毒阳性株进行基因型分析。方法收集广州市2008年5家病毒性腹泻监测点医院的门诊临床诊断为病毒性腹泻的5岁以下患儿临床资料及粪便标本692份,采用ELISA方法检测轮状病毒、腺病毒、星状病毒和诺如病毒抗原,将诺如病毒抗原阳性的标本用RT-PCR方法进行诺如病毒核酸扩增,阳性产物回收、纯化并测序,结合GenBank中的相关序列进行型别流行特点分析。结果 692份标本中,ELISA方法检测4种病毒的阳性率分别为轮状病毒31.9%(221/692)、诺如病毒21.2%(147/692)、腺病毒6.1%(42/692)、星状病毒1.2%(8/692),混合感染占6.8%(47/692)。诺如病毒腹泻病例发病高峰在9—11月份,占51.7%(76/147),2岁以下病例数占91.8%(135/147)。临床症状以腹泻、呕吐、发热、腹痛为主。147份诺如病毒ELISA阳性标本中RT-PCR方法检测诺如病毒核酸阳性率为84.4%(124/147),经测序及与GenBank中的相关序列比对,证实124份均属诺如病毒GⅡ遗传组,其中1份是GⅡ2型,其余均为GⅡ4型,GⅡ4型中又有不同分支。结论诺如病毒是广州市5岁以下儿童病毒性腹泻的常见病原之一,仅次于轮状病毒,常见于2岁以下婴幼儿,流行优势株基因型为GⅡ4型。     

广州市儿童秋冬季诺如病毒感染检测分析

目的 研究广东省广州市5岁以下儿童秋冬季急性病毒性腹泻诺如病毒的感染情况、基因型别和流行优势毒株.方法 采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测诺如病毒(NVs),部分阳性标本的PCR产物经纯化、测序,结合参考毒株相应的核苷酸序列进行进化分析.结果 NVs的检出率为23.88%(112/469).35株测序病毒之间的核苷酸序列同源性为70.4%～100%,均属于GH遗传组.广州市2003年秋冬季测序的11株NVs 5株为GⅡ-4;5株为GⅡ-3;另1株不能确定其型别;2004年测序的11株10株为GⅡ-4;1株为GⅡ-3;2005年所测序的13株均为GⅡ-4.结论 广州市婴幼儿秋冬季病毒性腹泻存在不同基因型NVs感染,以NV GⅡ组毒株为主,其中GⅡ-4型为流行优势株.     

南宁市散发性腹泻诺如病毒分子流行病学分析

目的 研究广西南宁市散发性腹泻病例中诺如病毒( norovirus,NV)感染的分子流行病学特征.方法 对2007年1月- 2008年12月南宁市某医院门诊696例散发腹泻病例进行流行病学资料分析,并应用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应对其粪便标本进行NV及其基因组别检测;随机选择部分阳性标本进行核苷酸序列测定和遗传进化树分析,确定基因型.结果 在696份粪便标本中,NV核酸检测阳性183份,总阳性率26.30％,其中180份(98.36％)属于基因Ⅱ组(genogroupⅡ,GⅡ),另外3份(1.64％)为基因Ⅰ组(GⅠ);随机选择30株GⅡ组NV进行核苷酸序列分析,绝大多数属于GⅡ.4基因型(26株),其余为GⅡ.12(2株)、GⅡ.7(1株)、GⅡ.16(1株);3株GⅠ组NV分属于GⅠ.2、GⅠ.4、GI.8型;NV所致散发性腹泻在冬春季节呈现高发.NV阳性检出率无性别和年龄组差异.结论 NV是南宁市散发性腹泻病例的主要病原体,优势毒株为GⅡ.4型,同时存在多种其他基因型感染.     

成都地区腹泻病例人杯状病毒感染状况研究

目的 了解成都地区2010年7～12月之间人杯状病毒感染性腹泻的情况.方法 采集成都市2家哨点医院2010年7～12月之间腹泻病人的大便标本501份,采用RT-PCR方法,对501份大便标本同时进行诺如病毒、札如病毒核酸检测.结果 501份标本中检出阳性122份,核酸阳性率为24.35％ (122/501),其中诺如病毒GⅠ型1份,占阳性标本的0.82％ (1/122);诺如病毒GⅡ型100份,占阳性标本的81.97％ (100/122);札如病毒18份,占阳性标本的14.75％(18/122);诺如病毒GⅡ型和札如病毒共同感染3份,占阳性标本的2.46％ (3/122).5岁以下儿童患者标本病毒核酸阳性检出率为24.3％ (109/449),其中诺如病毒GⅡ型的检出率最高;5～18岁患者标本病毒核酸阳性检出率为14.29％(1/7),标本检验结果为诺如病毒GⅡ型;18岁以上患者标本阳性检出率为26.67％ (12/45),其中诺如病毒GⅡ型检出率最高.9、10、11 3个月病毒核酸检出率较高,其中9月份病毒核酸检出率最高为36.51％ (23/63).结论 成都地区人杯状病毒感染性腹泻的病原体以诺如病毒GⅡ型为主,主要在秋冬季节高发,且婴幼儿和成人同样容易感染.     

苏州市婴幼儿轮状病毒腹泻分子流行病学研究

目的 研究苏州市5岁以下婴幼儿轮状病毒腹泻分子流行病学特征。方法 对2001年9月～2002年8月期间在苏州大学附属儿童医院就诊的5岁以下腹泻患儿进行调查。收集腹泻患儿粪便标本检测轮状病毒并对轮状病毒阳性标本用ELISA、PCR法进行分型研究。结果 共检测标本775份，轮状病毒阳性274份，检出率35．35％；血清分型发现，轮状病毒腹泻G分型以G3(40．15％)和G1(28．42％)为主要流行株，基因P分型结果以P[4](39．68％)为主，尚发现较多不常见G／P组合和未分型病毒株。结论 苏州市婴幼儿轮状病毒腹泻，以G3和P[4]最多见，但有较多未分型病毒株，应继续进行轮状病毒腹泻的监测。     

广州市2003—2007年诺如病毒胃肠炎暴发疫情分析

目的分析广州市2003—2007年诺如病毒性胃肠炎流行特征，为制定该病的预防控制策略提供科学依据。方法采用描述性流行病学方法对广州市2003—2007年诺如病毒性胃肠炎暴发疫情资料进行分析。结果2003—2007年，广州市共报告22起群体性诺如病毒性胃肠炎暴发疫情，共计病例934例，每起疫情的罹患率波动在0．88％～37．93％之间。10—12月为发病高峰；男女性别比为1．25：1；发病年龄最小的5月龄，最大的91岁，10—39岁共发病572例，占总病例数的61．24％；13起疫情发生在学校，学生病例数占发病总数的58．78％。所有疫情均未找到明确的感染来源。22起疫情的病例均以呕吐、腹痛、腹泻、发热为主，儿童病例以呕吐为主，成人病例以腹泻为主。22起疫情共采集粪便标本219份，检出诺如病毒抗原81份，阳性率为36．99％，其余标本均未检测到诺如病毒抗原。结论广州市诺如病毒胃肠炎暴发疫情主要发生在秋冬季，多发生在学校等人群聚集的单位，及时采取控制措施可避免疫情扩散。     

2012-2014年湖南省感染性腹泻哨点医院儿童诺如病毒感染及基因型别分析

目的 了解湖南省感染性腹泻哨点医院儿童诺如病毒的感染状况及基因型别。 方法 2012年1月-2014年12月采集湖南省哨点医院腹泻患儿的粪便标本,应用诺如病毒特异性引物进行扩增,选择扩增阳性产物进行基因测序和进化分析。 结果 936份粪便标本RT-PCR检测诺如病毒核酸,阳性100份,阳性率10.68%。对40份诺如病毒核酸阳性标本进行基因序列测定与分析,38份为GⅡ型,其中31份为GⅡ.4型。在31株GⅡ.4型中,Sydney 2012和GII.4 Den Haag 2006b各栓出14株。 结论 2012-2014年湖南省哨点医院儿童腹泻病例中诺如病毒的感染率较高,GⅡ.4是优势株,其中GⅡ.4 sydney 2012和Den Haag 2006b是主要型别。     

南宁市2007～2008年诺如病毒感染所致成人腹泻散发病例的流行病学特征和诺如病毒基因型分布

目的研究诺如病毒(Norovirus,NV)感染所致成人腹泻散发病例的流行病学特征和NV基因型分布。方法对南宁市2007～2008年某医院门诊696例成人腹泻散发病例资料进行流行病学分析,并采集粪便标本,应用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应检测NV及其基因组别。随机选择部分阳性标本进行NV衣壳蛋白N/S区核苷酸序列测定,确定基因型。结果NV所致散发性成人腹泻在冬春季节呈现高发。在696份散发成人腹泻的粪便标本中,NV核酸检测阳性183份,总阳性率26.30%。其中180份(98.36%)NV属于基因Ⅱ组(GenogroupⅡ,GⅡ),另外3份(1.64%)为基因Ⅰ组(GⅠ)。随机选择10株GⅡNV进行核苷酸序列分析,它们均属于GⅡ.4基因型,而3株GⅠNV分属于GⅠ.2、GⅠ.4、GⅠ.8基因型。结论NV是南宁市2007～2008年成人腹泻散发病例的主要病原体,优势毒株为GⅡ.4型,也存在GⅠ型NV感染。     

农村婴幼儿病毒性腹泻流行病学调查

目的为预防控制婴幼儿病毒性腹泻的流行提供病原学和流行病学依据。方法以河北省卢龙县医院和妇幼保健院因腹泻住院治疗的患儿为监测对象，采用流行病学调查方法对腹泻病患儿进行检测调查。结果1236份粪便样本轮状病毒阳性率为46％；398份轮状病毒阴性样本中杯状病毒阳性率为31．6％；2种病毒腹泻感染率以12月龄的患儿所占比例最高．分别为39．3％和27．4％，其中轮状病毒9月龄患儿感染率为26．1％．6月龄为14．4％；而杯状病毒6，9，3月龄患儿感染率分别为25．6％，17．9％和16．2％。轮状病毒和杯状病毒感染发病月份基本一致，主要集中在当年12月至次年2月，分别占全年病例的86％和65％。轮状病毒毒株鉴定结果：G3型（45％）最常见，其次为G1型（35％），Q型（8％），G4型（3％），G9型（0．6％），混合感染（1％），未分型（8％）；杯状病毒经DNA测序均属于诺瓦克病毒（NLV）GⅡ遗传组。流行株为NLVGⅡ-4，GⅡ-7和GⅡ-3。结论婴幼儿病毒性腹泻的病原主要是轮状病毒，其次是杯状病毒。     

北京市某些医院内腹泻暴发与诺如病毒的相关性研究

目的确定2006年11-12月北京市某些医院内发生的住院患者腹泻爆发性流行的病原及其分子生物学特点。方法首先检测腹泻标本中轮状病毒抗原并用聚丙烯酰胺凝胶电泳进行轮状病毒核酸检测,然后用逆转录-聚合酶链反应进行诺如病毒核酸检测,对检测阳性标本进行诺如病毒VP1全基因的扩增;并对其中一例进行全基因克隆、测序和分析。另外对来自不同医院的2份阳性标本中的VP1的5′端部分序列进行测序分析。结果30份腹泻患者粪便标本中共有17份检测为诺如病毒阳性,总阳性率为56.7%,每一家医院送检标本的阳性率都在42.9%以上。对其中一份标本的诺如病毒VP1全基因序列测定和分析显示为GⅡ-4型诺如病毒。另2份标本中的部分序列测定显示与全基因序列高度保守,只有1个核苷酸的差异,因此也提示为GⅡ-4型诺如病毒。结论诺如病毒是北京地区医院内腹泻暴发的重要病原,此次暴发极可能是由GⅡ-4型诺如病毒引起。     

人类杯状病毒医院感染调查研究

目的 调查研究广州地区人类杯状病毒(HuCV)的感染流行特征.方法 收集广东省中医院病毒性腹泻粪便标本380份,用荧光定量PCR方法检测样本中的HuCV[包括诺瓦克样病毒(NLVs)和扎幌样病毒(SLVs)]核酸.结果 人类杯状病毒总检出率为28.68％,其中NLVs和SLVs检出率分别为22.89％、7.11％;HuCV在4个季度的感染率分别为46.29％、10.09％、6.42％和36.70％;另外,1例样本同时感染了GⅡ型NLVs和GⅡ型SLVs,有4例样本同时感染了 G Ⅰ、GⅡ型NLVs.结论 HuCV是导致广州地区病毒性腹泻的重要病原体之一,高发期集中在第一、四季度,诺瓦克样病毒在HuCV感染中占主导作用;广州地区存在着HuCV不同基因型的混合感染.     

Pediatric hospitalizations attributable to rotavirus gastroenteritis among Cambodian children: Seven years of active surveillance, 2010–2016

BackgroundEach year, approximately 1,066 Cambodian children under five years old die of diarrhea, and 51% of these deaths are due to rotavirus gastroenteritis. Quantifying childhood hospitalizations caused by severe rotavirus infections is also important in demonstrating disease burden caused by this virus. The objective of this study is to update and confirm the current burden of pediatric hospitalizations attributable to rotavirus gastroenteritis among Cambodian children using seven years of continuous active, prospective surveillance from 2010 to 2016. We also characterize the circulating rotavirus genotypic strains during this period.MethodsActive surveillance for rotavirus gastroenteritis was conducted from January 2010 through December 2016 at a national hospital in Phnom Penh, Cambodia. Children <60 months of age who were hospitalized for acute gastroenteritis (AGE) were consented and enrolled. Information on gender, age, clinical characteristics, and month of onset were collected. Stool specimens were collected and tested by enzyme immunoassay for the presence of rotavirus antigen, and genotyping was performed on rotavirus test-positive specimens to characterize predominant rotavirus strains during the surveillance period.ResultsOf 7007 children enrolled with AGE and having specimens collected, 3473 (50%) were attributed to rotavirus gastroenteritis. The majority of rotavirus hospitalizations occurred in children younger than two years old (92%). Year-round rotavirus transmission was observed, with seasonal peaks during the cooler, dry months between November and May. Genotypic trends in rotavirus were observed over the surveillance period; the predominant rotavirus strains changed from G1P[8] (2010–2012), to G2P[4] (2013–2014), the emergence of genotype G8P[8] in 2015, and G3P[8] in 2016.ConclusionsRotavirus is the leading cause of severe acute gastroenteritis hospitalizations in Cambodian children under five years old, with 50% of such hospitalizations attributable to rotavirus. Over 90% of rotavirus hospitalizations occurred in children under 2 years of age. Changes in the predominant rotavirus strains occurred over time among these unvaccinated children. This information is important to understand and prioritize the current potential impacts upon child health that could be achieved through the introduction of rotavirus vaccines in Cambodia.     

浙江省2006-2007年暴发性胃肠炎中诺如病毒的分子流行病学分析

目的 分析浙江省2006-2007年暴发性病毒性胃肠炎中诺如病毒感染的分子流行病学特征.方法 收集监测期间暴发性病毒性胃肠炎疫情患者的粪便标本及相关流行病学资料.采用RT-PCR及荧光定量RT-PCR检测诺如病毒.随机选掸部分阳性标本扩增部分多聚酶区和衣壳蛋白片段,进行序列测定,结合诺如病毒I(GI)、Ⅱ(GⅡ)基因型参考株进行进化分析.结果 诺如病毒感染暴发性胃肠炎共5起,发生时间均集中于9-12月,送检标本63份,诺如病毒检测阳性45份.序列分析结果显示,浙江省诺如病毒序列与诺如病毒GⅡ/4型参考株同源性最高,其中与北京2006年、荷兰2006年诺如病毒GⅡ/4型变异株最为接近,核苷酸同源性分别为99.7%和98.5%～99.0%.诺如病毒与北京、荷兰流行的GⅡ/4型变异株处于同一分支.结论 诺如病毒是浙江省病毒性腹泻暴发疫情的重要病原体,流行时间集中于秋季,其流行株为GⅡ/4型变异病毒株.     

中国2006—2007年诺如病毒胃肠炎暴发及其病原学特征分析

目的 了解中国2006-2007年诺如病毒胃肠炎暴发及其病毒基因型别.方法 收集2006-2007年19起胃肠炎暴发的流行病学资料以及腹泻粪便样本,用RT-PCR方法对201份粪便标本进行诺如病毒、轮状病毒、星状病毒、腺病毒和札如病毒检测,对扩增产物进行序列测定.用Clustal X 1.83和MEGA4.0生物软件对诺如病毒序列进行序列比对和系统进化分析.结果 诺如病毒是引起病毒性胃肠炎暴发的主要病原之一(12/19,63.2%).在12起诺如病毒胃肠炎暴发中,变异株GⅡ-4/2006b是引起暴发的流行优势株(11/12,91.7%),其他型别包括GⅡ-17、GⅡ-6和GⅡ-3.诺如病毒引起的疫情暴发主要集中在冬春季节(12月至4月),发生场所多样,且各年龄组人群均有发病.同时,12起诺如病毒暴发中有2起与其他腹泻病毒混合感染,且在同一起暴发中病原具有病毒多样性和基因型别多样性.结论 诺如病毒是2006-2007年引起胃肠炎暴发疫情的主要病原之一,变异株GⅡ-4/2006b为流行优势株.     

Molecular and epidemiological trend of rotavirus infection among infants and children in Japan

This study investigated the prevalence of group A, B, and C rotavirus (RAV, RBV, RCV) and adenovirus (AdV) infections in infants and children with acute gastroenteritis in Japan from July 2006 to June 2007. A total of 628 fecal specimens collected from infants and children with acute gastroenteritis in five different places (Maizuru, Tokyo, Sapporo, Saga and Osaka) in Japan during the period of July 2006–June 2007 were examined for RAV, RBV, RCV and AdV by RT-multiplex PCR. RAV was further characterized to G-typing and P-typing by RT-multiplex PCR and sequencing method. It was found that 123 (19.6%) fecal specimens were positive for RAV followed by AdV of 4.5%. RBV and RCV could not be detected in this study. Serotype G1 (58.5%) was identified at high levels followed by G9 (20.3%), G2 (11.4%), and G3 (7.3%). P genotyping revealed P[8] as predominant (84.6%) followed by P[4] (13.8%) and P[6] (1.6%). During the 2006/2007 rotavirus season, G1P[8] strains were most common with G9P[8], G2P[4], G3P[8], G1P[4] and G9P[6] also detected. It is clear from this study that RAV is still the cause of diseases in Japan. To our knowledge, this is the first report of RV P[6] strain in humans in Japan.     

广州市1起诺如病毒急性胃肠炎暴发的实验室检测

目的确定1起学校急性胃肠炎暴发原因。方法采集病例粪便标本,直饮水标本,采用实时荧光定量(Real-time)PCR和RT-PCR方法检测病毒核酸,阳性标本测序分析。结果 5份粪便标本中3份呈诺如病毒阳性,2份直饮水标本均呈诺如病毒阳性。3份病例粪便标本病毒株核苷酸序列一致,均为GⅡ-4型,提示病毒同源。结论对诺如病毒进行核酸检测,证实该疫情为一起诺如病毒GⅡ-4型引起的急性胃肠炎暴发。     

北京地区诺如病毒分子生物学特点初步研究

目的了解北京地区诺如病毒的分子生物学特点。方法收集北京市2007年1—3月非细菌性胃肠炎暴发和散发病例，采集患者粪便标本，使用逆转录聚合酶链反应（RT—PCR）对粪便标本进行诺如病毒RNA检测，对RT—PCR阳性标本的PCR产物进行克隆测序。结果检测38例粪便标本，共有27例阳性。随机选择其中4例PCR产物进行克隆测序，获得4株诺如病毒序列进行比对分析，结果显示，该4株病毒序列与诺如病毒GⅡ／4型参考株同源性最高，其中与荷兰和日本提交的诺如病毒GⅡ／4型变异株最为接近，同源性分别为97．8％～98．5％和95．2％～95．9％。系统发生树分析表明，该4株诺如病毒与荷兰、日本流行的GⅡ／4型变异株处于同一分支上。结论北京地区存在诺如病毒GⅡ／4型变异株流行，其与2006年荷兰和日本的诺如病毒流行株属同一类GⅡ／4型变异株。