江苏省首例人感染ST1型猪链球菌的快速检测及分子特征分析

目的对2014年江苏省一起疑似人感染猪链球菌病的病原菌进行实验室快速检测并分析其分子特征。方法采用实时荧光PCR方法对病人标本中提取的DNA进行猪链球菌血清2型特异基因检测,运用PCR方法进行猪链球菌毒力基因鉴定及多位点序列分析。结果病人标本中检测到猪链球菌种特异基因(16srRNA)和血清2型荚膜多糖编码基因(cps-2J),5种毒力基因(mrp,sly,ef,gapdh,fbps)全部阳性,多位点序列分析结果为ST1型。结论该病例的病原菌为携带5种毒力基因的ST1型猪链球菌血清2型菌株,该型别在江苏省尚属首次报道。     

人感染H7N9禽流感流行病学研究进展

通过整理WHO网站公布的疫情数据,Pubmed文献数据库上发表的人感染H7N9禽流感流行病学、临床、免疫等相关文献,对人感染H7N9禽流感的疫情概况、流行特征及影响因素、预防控制措施等进行综述。该疾病从2013年2月从我国华东地区开始流行,目前主要分布在我国华东、华南,蔓延全国多省市。冬春季是高发季节,禽类是传染源,主要通过接触传播,60岁以上有基础疾患的男性和禽类环境暴露者是高危人群。临床表现以重症肺炎为主,儿童感染后疾病谱以轻症病例为主。预后主要受年龄、基础疾患、免疫反应、遗传基因影响。做好三早预防、控制传染源、及时开展风险评估与沟通,多部门合作是防控的主要措施。     

152例狂犬病死亡病例调查分析

在自上世纪九十年代中期我省狂犬病疫情出现逐渐回升的趋势，特别是近两年报告病例数成倍增长。为了摸清我省狂犬病发病的流行病学特点，对收集的152份病例资料进行分析，为进一步采取控制措施提供依据。     

基于生态位模型的人感染H7N9禽流感病毒潜在风险区预测分析

目的利用Maxent生态位模型研究H7N9传染病与环境因素的关系,并在此基础上预测禽流感疫情的潜在风险区域。方法共选择254例江苏省范围内经过临床确诊的H7N9病例作为样本,构建生态位模型,利用ROC曲线下面积(AUC)来验证构建的生态位模型的有效性;同时,利用变量刀切法(Jackknife)来评价各环境变量对H7N9暴发的贡献;在此基础上,利用构建的生态位模型来预测江苏省12月份H7N9传染病暴发的潜在风险区。结果在江苏省境内,温度、日照强度、降水量和NDVI是影响H7N9禽流感疫情暴发的最主要的环境因素;通过分析12月份的潜在风险区预测图可以发现,江苏省苏南地区,尤其是苏州、无锡、常州3市是H7N9疫情暴发的高风险区。结论当江苏省境内出现持续的低温、日照时间短、气温潮湿的天气时,应密切关注禽流感疫情暴发的可能性。     

2009-2017年江苏省手足口病病原谱及柯萨奇A16型的分子流行病学研究

目的 描述2009-2017年江苏省手足口病(HFMD)病原谱及柯萨奇A16型(CVA16)的流行病学、基因变异及遗传进化特征。方法 对2009-2017年江苏省手足口病发病资料和病原学检测情况进行统计分析,选取120株CVA16病毒分离株进行VP1区全长基因序列测定,并对核苷酸及氨基酸序列进行同源性比较及系统进化分析。结果 2009-2017年江苏省共报告手足口病1 013 771例。其中, 手足口病肠道病毒阳性病例37 389例,主要病原构成为EV71(39.85%)和CVA16(30.13%);重症病例中,以EV71为主要病原,CVA16及其他肠道病毒引起的重症病例较少。CVA16在每年的3~7月和9~11月出现流行高峰,主要感染1~4岁年龄段儿童,男性比例高于女性。江苏省地区流行的CVA16毒株属于B1a亚型和B1b亚型,其中B1b亚型为优势流行基因亚型。120株CVA16病毒分离株VP1区核苷酸及编码氨基酸序列同源性分别为87.5%~100%、97%~100%。结论 2009-2017年,江苏省地区流行的CVA16具有明显的时间、人群分布特征;120株CVA16分离株属于B1a亚型和B1b亚型。CVA16分离株核苷酸序列变异较大,但氨基酸同源性较高,推断存在一定的同义突变。     

HBsAg阳性孕妇HBsAg、HBeAg和HBVDNA关系探讨

目的研究HBsAg阳性孕妇血清HBVDNA载量与HBsAg、HBeAg滴度之间的关系。方法入组乙肝疫苗母婴阻断效果研究队列892例未经抗病毒治疗孕妇,经雅培Architect i2000分析仪检测其血清HBsAg和HBeAg,并用雅培全自动实时荧光定量系统m2000定量检测HBVDNA水平。结果 HBeAg阳性组中,HBVDNA阳性率为95.65%;HBeAg阴性组中,HBVDNA阳性率为30.08%,差异有统计学意义(P<0.05)。不同浓度组HBeAg和HBVDNA检测结果比较,差异有统计学意义(P<0.05)。不同载量HBVDNA组,HBeAg差异有统计学意义(P<0.01),且随HBVDNA含量增加而增加,成正相关(r=0.71,P<0.01);HBsAg差异也有统计学意义(P<0.01),随HBVDNA含量增加而增加,成正相关(r=0.53,P<0.01)。结论在未经抗病毒治疗的HBsAg阳性孕妇中HBVDNA载量与HBsAg、HBeAg滴度均呈正相关,HBsAg可以较好的反映HBV复制水平。     

乙肝病毒慢性感染者HBeAg?ALT水平分布及其影响因素的现况调查

目的:调查分析人群中乙肝病毒(HBV)慢性感染者e抗原(HBeAg)?丙氨酸氨基转移酶(ALT)的分布特征及影响因素,以指导慢性HBV感染者的人群防治?方法:对乙型肝炎表面抗原(HBsAg)阳性者开展调查问卷和HBeAg?ALT实验室检测,分析HBeAg?ALT水平分布特征及其影响因素?结果:共调查3 815例HBsAg阳性者,HBeAg阳性率为11.7%,ALT大于40 U/L和80 U/L的比例分别为15.6%?5.7%?男性ALT异常率高于女性,低年龄组HBeAg阳性率高?ALT异常率低,在有抗病毒治疗史人群中,ALT异常率仍达34.9%,无抗病毒治疗史者中有3.4%ALT大于 80 U/L?结论:不同性别?年龄人群HBV慢性感染后临床特征有明显差别,需加强慢性HBV感染者的随访工作并探索提高抗病毒治疗效果的药物和方法?     

2013-2022年江苏省柯萨奇病毒A6型全基因组序列特征分析

目的 研究江苏省2013-2022年分离到的柯萨奇病毒A6型(CV-A6)全基因组序列特征及对全基因组各编码区进行遗传进化分析,以期从分子流行病学特征的角度解释CV-A6取代肠道病毒A71和柯萨奇病毒A16成为江苏省引起手足口病(HFMD)主要病原的原因。方法 选取2013-2022年间江苏省地区流行的35株CV-A6毒株进行全基因组测序,采用DNASTAR、MEGA7.0和Similarity plots3.5.1等软件对获取的全基因组序列进行比对、相似性分析、系统进化分析和基因重组分析,对P1编码区和3D区主要氨基酸变异位点进行分析。结果 35株CV-A6江苏毒株的全基因组核苷酸和氨基酸序列相似性分别为87.5%～99.6%和97.0%～99.8%,与CV-A6原型株Gdula/USA/1949的全基因组核苷酸序列相似性仅为80.3%～81.0%,氨基酸序列相似性为94.7%～95.3%。基于VP1序列的系统进化树结果显示,2013-2022年江苏省有34株CV-A6分离毒株分属于D3a基因亚型,1株分属于D2基因亚型;基于3D区进化树划分不同重组模式,2013-2022年江苏省流...     

AllGlo探针Real-time RT-PCR检测发热伴血小板减少综合征病毒

目的建立基于AllGlo探针Real-time RT-PCR技术检测发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)的方法。方法根据SFTSV基因组S片段的相对保守序列设计引物和AllGlo探针,建立和优化Real-time RT-PCR反应体系,对其敏感性、特异性和稳定性进行评价,并检测临床疑似SFTSV病例标本,与普通RT-PCR法、病毒分离法和抗体检测法进行比较。结果所建立AllGlo探针Real-time RT-PCR法检测SFTSV核酸,标准曲线方程为y=-3.38x+46.03(y为Ct值,x为核酸拷贝数log值),r20.998,扩增效率为97.6%,Ct值变异系数(CV)均1.2%,检测限为1.00×103 copy/mL。与汉坦病毒、H1N1、H3N2、登革病毒1~4型均无交叉。检测362份疑似病例标本,SFTSV核酸阳性检出率11.9%,高于普通RT-PCR法、病毒分离法和抗体检测法(P值均0.05)。结论建立的AllGlo探针Real-time RT-PCR法,操作简单、快速,灵敏性、特异性较高,可用于SFTSV核酸检测。     

耶尔森菌病诊断团体标准解读

耶尔森菌病是我国丙类法定报告传染病“其他感染性腹泻”中的一种，是一种较为重要的食源性疾病，但我国在诊断上一直缺乏依据或标准。中华预防医学会组织中国CDC传染病预防控制所等单位撰写《耶尔森菌病诊断（T/CPMA 005－2019）》团体标准，以“合法性、科学性、先进性、可行性”为原则，给出了耶尔森菌病的明确定义，对其诊断依据、原则和主要鉴别诊断等进行了规定，并提供了耶尔森菌病的流行病学和临床表现作为资料性附录，耶尔森菌病的实验室检测作为规范性附录，为我国各级医疗机构和CDC工作人员进行耶尔森菌病的诊断提供准确依据和方法，解决在临床个案和暴发事件中耶尔森菌病无法明确诊断的问题。