18F-FDG PET/CT对皮肌炎抗MDA5抗体及预后的预测价值

目的:分析抗黑色素瘤分化相关基因5(MDA5)抗体阳性皮肌炎患者的肌肉FDG代谢、肿瘤发生率以及肺间质性改变在¹⁸F-FDG PET/CT的影像特征及其鉴别抗MDA5抗体阳性皮肌炎的价值。 方法:回顾性分析2016年6月至2019年7月在上海交通大学医学院附属仁济医院接受¹⁸F-FDG PET/CT检查的75例(34例抗MDA5抗体阳性,41例抗MDA5抗体阴性)皮肌炎患者[男21例、女54例,年龄(52.3±14.3)岁]和30名健康对照者[男10名、女20名,年龄(53.5±11.8)岁]的影像和临床资料,测定并计算肌肉SUV max及肌肉SUV max平均值(mSUV max);统计皮肌炎患者合并肿瘤性病变的情况;测定皮肌炎合并间质性肺炎患者肺炎病灶的SUV max。采用两独立样本 t检验、单因素方差分析、SNK检验和 χ²检验分析数据;行ROC曲线分析肌肉mSUV max鉴别抗MDA5抗体阳性皮肌炎的诊断效能。 结果:健康对照者、抗MDA5抗体阳性和抗MDA5抗体阴性皮肌炎患者的肌肉mSUV max分别为0.39±0.05、0.66±0.21和0.87±0.29( F=39.93, P<0.001);皮肌炎患者的肌肉mSUV max均高于健康对照者( q值:6.76、12.63,均 P<0.001);抗MDA5抗体阴性患者高于抗MDA5抗体阳性患者( q=5.79, P<0.001)。ROC AUC为0.74,当肌肉mSUV max取最佳阈值0.75时,在皮肌炎中鉴别出抗MDA5抗体阳性的准确性为74.7%(56/75)。抗MDA5抗体阴性患者中,恶性肿瘤6例(14.6%,6/41);抗MDA5抗体阳性患者中,无恶性肿瘤病例(0/34;χ²=5.41, P=0.020)。抗MDA5抗体阴性伴发间质性肺炎11例(26.8%, 11/41),抗MDA5抗体阳性伴发间质性肺炎33例(97.1%, 33/34;χ²=37.81, P<0.001);抗MDA5抗体阳性患者肺炎FDG代谢高于抗MDA5抗体阴性患者(SUV max:3.65±1.83和2.38±1.27;t=2.13, P=0.039)。 结论:抗MDA5抗体阳性皮肌炎患者的肌肉FDG代谢高于健康对照者,但低于抗MDA5抗体阴性患者。抗MDA5抗体阳性患者肿瘤性病变发生率低于抗MDA5抗体阴性患者。抗MDA5抗体阳性患者发生间质性肺炎的比例和严重程度均高于阴性患者。¹⁸F-FDG PET/CT对于鉴别抗MDA5抗体阳性皮肌炎具有一定价值。     

基因工程FR-008/杀念菌素脱羧衍生物发酵过程优化

以组合生物合成技术得到的基因工程FR-008／杀念菌素脱羧衍生物CS103为研究对象，在摇瓶水平进行培养条件的初步优化。确定了接种量、接种时间、发酵过程pH、装液量等初步条件。对3.7L发酵罐水平的培养条件进行优化，确定了最适搅拌转速和通气量，并初步建立了补料分批发酵工艺。结果表明，接种时间30h、接种量为10％、控制pH6.5-7.0、搅拌转速450r／min、通气量200L／h，发酵过程维持发酵液残余葡萄糖浓度5g／L左右，在3.7L发酵罐基因工程FR-008／杀念菌素脱羧衍生物CS103产量达到99.87μg／ml。本研究为基因工程FR-008／杀念菌素工业化生产工艺提供了依据。     

中国南海海绵共附生真菌种群多样性及抑菌活性

目的揭示南海海绵共附生真菌的种群多样性,并筛选具有抑菌活性的真菌菌株。方法采用6种不同的真菌培养基、3个不同培养温度对中国南海10种海绵共附生真菌进行分离培养,并采用牛津杯法进行抑菌活性筛选。结果共分离培养得到177株真菌菌株。基于RFLP分析得到24株代表性菌株,基于18SrRNA基因的分子鉴定证明分别属于子囊菌门(Ascomycota)下的4个目10个属,真菌比例最高的目为Euro-tiales(37.5%)和Hypocreales(41.6%)。部分菌株显示了对革兰阳性细菌和革兰阴性细菌的广谱的抑菌活性。结论揭示的丰富的海绵共附生真菌及其抑菌活性对于深入研究和利用海绵共附生真菌具有重要价值。     

奇迹束丝放线菌合成安丝菌素过程中支链氨基酸的添加效果分析

安丝菌素是一类重要的聚酮抗生素,由AP 1,AP 2,AP 3,AP 3′和 AP 4 5个组分组成,其中AP 3的活性最强,通常作为发酵的目标产物。奇迹束丝放线菌合成安丝菌素的摇瓶实验发现,添加支链氨基酸（BCAAs）可明显影响安丝菌素的产量以及组分。为了进一步验证支链氨基酸对安丝菌素生物合成的作用,选用合成培养基并在不同时段添加支链氨基酸进行发酵实验,实验结果显示,发酵48 h后加入0.5 g/L缬氨酸（Val）能使AP 3增产1倍左右;而在同一时刻添加等量的亮氨酸（Leu）和异亮氨酸（Ile）对AP 3的抑制作用较明显,产量分别下降了58.8%和83.3%,且添加Leu和Ile分别使得AP 4与AP 2组分增加。此外,添加Ile可使琥珀酸与乙酸的积累量都明显上升,而添加Val使得细胞分泌琥珀酸和乙酸明显变少,这意味着奇迹束丝放线菌代谢支链氨基酸不仅影响对聚酮途径以及侧链合成,对细胞的代谢状态也有一定影响。     

基于元基因组的南海海绵Theonella swinhoei共生微生物次级代谢潜力研究

目的 揭示中国南海海绵Theonella swinhoei共生微生物次级代谢潜力。方法 用Illumina Hiseq 2000测序仪对T. swinhoei元基因组DNA进行测序,用MG-RAST平台对共生微生物种群结构和功能进行分析,并比较此海绵与其它海绵的次级代谢差异。用fragment recruitment方法评估T. swinhoei元基因组中具有代表性的微生物在此种海绵和其它生境中的丰度。用antiSMASH预测T. swinhoei元基因组中次级代谢产物生物合成基因簇,并通过序列比对分析其来源。结果 T. swinhoei共生微生物主要包括Proteobacteria(30.5%)、Actinobacteria(6.2%)、Poribacteria(3.6%)、Firmicutes(3.5%)、Chloroflexi(2.6%)和Cyanobacteria(2.1%)。Candidatus Entotheonella sp. TSY1和Candidatus Entotheonella sp. TSY2在T. swinhoei中的丰度比其它生境高很多。T. swinhoei共生微生物中聚酮合酶模块和相关蛋白(COG3321)以及非核糖体肽合成酶模块和相关蛋白(COG1020)基因的比例比其它海绵共生微生物中的比例高。次级代谢产物生物合成基因簇除来自Candidatus Entotheonella外,还有许多来自未知的共生细菌和可能的蓝细菌。结论 中国南海海绵T. swinhoei共生微生物具有很强的次级代谢潜力,为研究海绵天然产物微生物来源提供了依据,同时为进一步开发利用T. swinhoei共生微生物资源提供了基础。     

α-1,3-N-乙酰半乳糖胺基转移酶p.M142I突变导致A_x亚型的分子机制研究

目的 :以一个血型A_x亚型家系为研究对象,探讨我国人群血型中产生A_x亚型的潜在分子机制。方法:采用血清学方法鉴定该家系成员的ABO血型,测定血浆α-1,3-N-乙酰半乳糖胺基转移酶活性,行DNA直接测序和克隆后测序分析ABO基因序列,并构建3D分子模型,就发现的突变对α-1,3-N-乙酰半乳糖胺基转移酶稳定性改变(ΔΔG)的影响进行预测。结果 :血清学鉴定和DNA测序分析显示,先证者的血型为A_xB亚型,其2个女儿分别为A型和AB型,其ABO基因型分别为AW.38/B.01、A1.02B.01、A1.02/AW.38。先证者和其A型女儿的第7外显子均存在c.426GC杂合突变,导致α-1,3-N-乙酰半乳糖胺基转移酶的氨基酸发生p.M142I改变。分子模建分析提示,该基因突变改变了蛋白局部氨基酸间氢键的数目,从而导致氨基酸间作用力发生改变,而动力学改变,ΔΔG值升高表明其蛋白稳定性降低。结论:α-1,3-N-乙酰半乳糖胺基转移酶p.M142I突变可能通过降低了酶的稳定性导致A_x表现型,而其深入机制有待体外实验进一步研究。     

虫草属真菌的生物活性及机制研究现状与展望

虫草是一类珍稀的药用真菌资源,其代谢产物和牛物活性具有多样性特点,在功能性食品和牛物医药领域展现出巨大的应用前景.虫草物种资源丰富,其中冬虫夏草是我国最名贵三大补益类中药之一.该文重点针对虫草及其代谢产物的牛物活性与作用机制的最新进展进行述评,并对该类资源研发过程存在的问题进行了分析,为今后发展提供了新思路.     

微生物药物产生菌功能基因组学研究进展

微生物药物是一类化学结构和生物活性多样的次级代谢产物,近年来其多个产生菌基因组序列已经被测定完成,在此基础上开展的功能基因组研究方兴未艾,并在抗生素生物合成、形态分化、调控、系统发育与进化以及次级代谢产物挖掘等方面有着新的发现,展现出广阔的研究前景.本文重点阐述了四种重要抗生素产生菌功能基因组学的研究现状,集中于青霉素高产的遗传机制、红霉素产生菌红色糖多孢菌基因组与转录组分析、链霉素产生菌灰色链霉菌中A因子调控网络、阿维菌素产生菌作为次级代谢物异源表达的通用宿主与超高产菌株构建以及新型天然产物的挖掘等研究内容,同时简要介绍了当前我国微生物药物产生菌基因组学的研究概况,并从基础与应用两个角度对其未来发展趋势进行了展望.     

鞘糖脂与肿瘤疾病相关性研究进展

［摘要］　鞘糖脂作为存在于生命体细胞膜表面的双亲性糖脂分子,具有维持质膜稳定性、介导细胞识别黏附、调节信号转导等重要生物学功能。特异性的鞘糖脂被发现在众多的肿瘤疾病中呈异常表达并参与相关分子机制,与疾病发展进程密切相关,其作为肿瘤疾病诊断标志物以及免疫治疗的重要靶点被广泛研究。该文针对不同种类鞘糖脂与肿瘤疾病的相关性研究进展进行了综述。     

中国南海海绵和珊瑚共附生真菌多样性及其抑菌活性研究

目的揭示中国南海海绵和珊瑚共附生真菌多样性及其抗菌活性。方法采用9种不同的真菌培养基对海绵和珊瑚中的共生真菌进行分离培养和纯化,根据真菌18SrDNA对所分离的真菌进行鉴定,使用MEGA 5.2软件对所分离真菌进行系统发育分析。采用圆形滤纸片法进行抑菌活性筛选。结果从采自南海的6种海绵与3种珊瑚中共分离得到106株真菌菌株,通过形态分析和序列分析排重得到41株独立真菌菌株。18SrDNA序列比对结果分析显示,分别属于子囊菌门(Ascomycota)的11个目和担子菌门(Basidiomycota)的4个目,共计26个属。其中子囊菌门所占比例最高为93.4%,剩下的6.6%为担子菌门。通过抑菌活性筛选显示部分真菌对革兰氏阳性细菌和革兰氏阴性细菌具有广谱抗菌活性。结论本研究揭示了中国南海海绵和珊瑚共附生真菌丰富的种群多样性及部分真菌的抑菌活性,为进一步开发利用海绵和珊瑚共附生真菌及生产活性物质奠定了基础。