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1.
目的 开发一套能高效准确地从GWAS Catalog公开数据库中筛选全基因组关联研究(GWAS)的R脚本。方法 参考既往研究制定GWAS的筛选原则。将人工在GWAS Catalog的筛选过程抽象为标准的算法,2名程序员共同撰写R脚本(gwasfilter.R)后,由他人多次对脚本进行测试。结果 采用gwasfilter.R筛选GWAS包含6个步骤。该脚本内置5个主要函数,可以同时根据“是否有验证人群”“样本量大小”和“研究人群种族”等条件对GWAS进行筛选。筛选单个性状时,程序用时不超过1秒。结论 gwasfilter.R操作简便,筛选过程高效而标准化,可灵活应用于GWAS筛选。脚本源代码网址:https://github.com/lab319/gwas_filter。  相似文献   
2.
随着分子生物学技术的发展,使得早期对疾病基因水平的诊断成为可能。这些技术广泛地应用于流行病学研究,逐步形成分子流行病学这门学科。 分子流行病学研究常常需要用经济、快速、安全的方式获取DNA标本,并要使所获得的DNA达到相对较高的质量和产量。外周血是最易获取DNA分子的生物标本,本研究模拟大规模流行病学研究时血液标本采集、处理、检测的实际情况,旨在发现不同DNA提取方法、血液标本类型以及保存对DNA标本产量、质量的影响。  相似文献   
3.
目的评价社区综合干预对杭州城区初中生体力活动的短期影响。方法采用平行对照、非随机分组的类实验设计,在下城、拱墅区的社区、工作单位、学校和医疗机构开展2年社区综合干预,对居民进行健康教育的同时营造支持性环境,同期西湖区为对照区,通过比较干预前后两次横断面调查结果进行评价。结果干预区和对照区体力活动累积时间干预后高于干预前,差异有统计学意义(均为P0.001)。干预区周末总静坐行为(除做作业以外)时间达到2 h/d及以上比例干预后(58.3%)低于干预前(67.2%),差异有统计学意义(P0.001),对照区差异无统计学意义(P0.064)。结论社区综合干预可以影响干预区初中生在一定程度上减少周末总静坐行为(除做作业以外)时间,但未见显著提高体力活动时间,需考虑持续干预进行远期追踪评估。  相似文献   
4.
目的 分析排便频率与结直肠癌发病风险的前瞻性关联。方法 研究对象来自于中国慢性病前瞻性研究,基线调查开展的时间为2004年6月至2008年7月,在剔除基线时自报患有恶性肿瘤的个体后,最终有510 134人纳入分析。本研究使用的随访数据截止到2016年12月31日,采用Cox比例风险回归模型计算排便频率和结直肠癌发病的关联。结果 研究对象平均随访9.9年,随访期间3 056人发生结直肠癌;在分癌种分析时,纳入结肠癌1 548例,直肠癌1 475例。控制潜在混杂因素后,与排便频率基本1次/d者相比,排便频率>1次/d者发生结直肠癌、结肠癌和直肠癌的HR值分别为1.24(95% CI:1.12~1.39)、1.12(95% CI:0.95~1.31)和1.37(95% CI:1.18~1.59)。按随访时间进行亚组分析,随访前5年对应的HR值分别为1.59(95% CI:1.36~1.86)、1.43(95% CI:1.14~1.80)和1.76(95% CI:1.41~2.19);随访5年后,上述关联均无统计学意义(交互P<0.05)。与排便频率基本1次/d者相比,排便频率更低者的发病风险无统计学意义。结论 排便频率>1次/d者在随访前5年发生结直肠癌的风险升高。异常增加的排便频率作为一个容易识别的症状,应该在自我健康管理和结直肠癌早期筛检的实践工作中加以重视。  相似文献   
5.
目的 了解杭州市城区不同特征人群的体力活动相关建成环境主观感知情况。方法 采用多阶段分层随机抽样方法在杭州市城区抽取25~59岁常住居民开展面对面问卷调查。社区步行环境量表简版(NEWS-A)用于评价居民对社区内住宅密度、场所设施多样性、公共服务可及性、街道连通性、步行道和自行车道适宜性、美观舒适度、交通安全、治安8个建成环境维度的主观感知。采用两水平logistic回归模型分析社会人口学特征和BMI等个体因素对居民建成环境主观感知的影响。结果 共纳入1 362例常住居民,性别、婚姻状况、是否有工作与建成环境主观感知各维度得分关联均无统计学意义。调整其他因素影响后,年龄45~59岁与街道连通性感知得分呈正相关(OR=2.02,95%CI:1.30~3.15)。大专及以上文化程度与人口密度感知得分存在正相关(OR=1.97,95%CI:1.29~3.00),与场所设施多样性感知得分呈负相关(OR=0.65,95%CI:0.43~0.97)。超重肥胖与步行道/自行车道(OR=0.67,95%CI:0.48~0.95)和社区治安得分(OR=0.75,95%CI:0.57~0.99)均呈负相关。相对于Ⅰ类区域,Ⅲ类区域居民对场所设施多样性(OR=0.11,95%CI:0.04~0.30)、公共服务可及性(OR=0.33,95%CI:0.11~0.95)、街道连通性(OR=0.30,95%CI:0.11~0.86)、交通安全(OR=0.39,95%CI:0.17~0.91)的主观感知得分更低。结论 杭州市城区居民对体力活动相关的建成环境主观感知与年龄、文化程度、BMI和居住区域存在相关性,开展人群体力活动的环境干预时需要考虑个体特征。  相似文献   
6.
目的 描述分析中国双生子出生体重变化趋势。方法 使用中国双生子登记系统在中国8个省份收集的1995-2012年出生的双生子人群(共10 827对),采用病例回顾方法分析出生体重各指标情况和变化趋势。结果 调整性别、卵型、出生地区后,出生年份每推迟5年,双生子出生体重平均值降低0.01 kg(P=0.041).随着时间变化,双生子优势方出生体重、劣势方出生体重均不同程度地降低,出生体重相对差与出生体重不一致率在2007年以后有升高趋势。结论 1995-2012年中国双生子出生体重呈下降趋势,出生体重不一致率逐渐上升。考虑到出生体重不一致与某些不良健康结局的风险存在关联,应对双生子出生体重不一致予以重视。  相似文献   
7.
中国10个地区成年人食物摄入频率特征差异的分析   总被引:2,自引:2,他引:0       下载免费PDF全文
目的 描述中国慢性病前瞻性研究(CKB)项目10个地区人群食物摄入频率特征的地区差异。方法 CKB项目于2004-2008年在城市和农村各5个地区募集自愿参加的30~79岁常住居民进入队列并完成基线调查。本研究分析10个项目地区中512 891名30~79岁队列成员12组食物的摄入频率,描述各食物组摄入频率特征的地区差异。结果 南方城市(99.0%)和南方农村(99.9%)人群每天摄入的谷类食物以大米为主,北方农村(99.0%)和北方城市如青岛(88.4%)人群则以面食为主。河南人群每天摄入杂粮人群比例最高(98.8%)。甘肃人群每天摄入新鲜蔬菜比例最低(74.0%)。在南方城市人群每天摄入新鲜水果、腌制蔬菜、肉类及其制品比例高于农村地区,北方也存在相同现象。北方城市(37.1%)和农村(14.6%)人群每天摄入蛋类及其制品高于南方城市(6.5%)和农村(6.9%)。北方城市地区人群每天摄入豆制品、乳类及其制品比例最高,其中哈尔滨人群每天摄入豆制品比例最高(10.0%),青岛人群每天摄入乳类及其制品比例最高(34.3%)。结论 CKB项目研究人群谷类食物、蛋类及其制品、豆制品摄入频率存在南北差异,肉类及其制品、家禽及其制品、水产/海产品、新鲜水果、腌制蔬菜、乳类及其制品摄入频率存在城乡差异。  相似文献   
8.
目的 描述中国慢性病前瞻性研究(CKB)10个地区人群肺功能指标水平和气流受限现患率的地区差异。方法 剔除基线调查时肺功能指标异常个体后,分析10个地区512 495名30~79岁调查对象肺功能指标水平(FEV1和FVC)和气流受限(分别采用GOLD标准和LLN标准进行判断)现患率的地区差异。结果 10个地区男性的FEV1(2.66 L)和FVC(3.16 L)均高于女性(1.99 L和2.35 L);河南和哈尔滨人群FEV1和FVC高于其他地区。基于GOLD标准的气流受限现患率:男性(5.13%)高于女性(3.75%);农村人群高于城市(男性:6.32% vs. 3.47%;女性:4.26% vs. 2.97%);四川人群现患率最高(男性为13.34%,女性为10.70%),其次是苏州、河南和湖南。基于LLN标准的气流受限现患率(男性为6.93%,女性为6.29%)略高于GOLD标准,但地区差异近似。结论 CKB的10个地区人群无论在肺功能指标水平和气流受限现患率上均存在明显的地区差异。  相似文献   
9.
目的了解社区医务人员的膳食营养培训情况,以及培训是否与社区诊疗过程中增进的营养干预意识及行为相关联。方法选取杭州市下城区、拱墅区、西湖区的846名社区医务人员,采用问卷调查了解医务人员膳食营养技能培训情况、营养干预意识及干预行为等。应用Logistic回归分析影响技能培训的因素,采用Cochran-Mantel-Haenszel检验探索营养培训、营养干预意识、干预行为之间的关系。结果社区医务人员以女性为主,占78.49%。接受过膳食营养技能培训的医务人员占78.95%。工作时间是影响医务人员接受营养培训的主要因素。营养培训与营养咨询准备之间存在趋势性关联,随着培训的增加,营养咨询准备的自我评价越高(P〈0.05)。同时,营养培训也与增加的营养干预意识及行为相关联。随着培训种类的增加,医务人员对不健康饮食风险、接诊时常规询问患者的饮食习惯、建议患者给自己孩子树立健康饮食榜样3方面认识态度认识均有显著提高(P〈0.05)。营养培训的增加也同时增进了医务人员的营养干预行为,接受营养培训较多的医务人员,会为更多的社区就诊患者进行血压、体重、血胆固醇的测量,与患者交流平衡膳食、合理营养重要性以及给予肥胖患者减重建议(P〈0.05)。结论应进一步加强对社区医务人员的营养知识与干预技能培训,不断提升以社区为基础的慢性病综合干预措施效果。  相似文献   
10.
王元  吕筠 《首都医药》2014,(12):13-15
目的了解目前北京市朝阳区商业区各类别餐饮服务单位在食品安全管理、场所设施、生产经营等方面的现状,分析北京市朝阳区餐饮服务单位目前存在的主要问题及这些问题存在的原因。方法将研究区域内所有餐饮单位作为研究对象进行整群抽样,共抽取1027户餐饮单位最近一次量化评分表共计1027份。对不同类型餐饮服务单位评分情况用单因素方差分析(one-way ANOVA)进行统计分析,使用卡方检验对不同检查内容合格率情况进行分析。结果①不同类别餐饮单位之间评分分布差异有统计学意义(P〈0.01);②8个检查项目的得分差异均有统计学意义(P〈0.05);③不同类别餐饮单位之间,在食品安全制度建立等21个检查内容在合格率差异上有统计学意义(P〈0.05)。结论北京市朝阳区商业区餐饮单位总体量化等级以良好为主,应重点对中小餐饮单位的制度建立与执行、设备设施、采购贮存、添加剂管理等工作加强监督管理。  相似文献   
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