基于肠道菌群探讨甘草泻心汤对伊立替康致小鼠腹泻的影响

目的 研究甘草泻心汤对化疗相关腹泻小鼠肠道菌群的影响。方法 将小鼠随机分为对照组、模型组、洛哌丁胺（阳性药,0.4 mg·kg^-1）组和甘草泻心汤高、低剂量（16.4、4.1 g·kg^-1）组;采用连续4 d ip 55 mg·kg^-1伊立替康诱导小鼠化疗相关腹泻模型;记录小鼠首次排便时间、稀便级、稀便率和腹泻指数;采用试剂盒测定小鼠肠道消化酶活力及炎症因子水平;采用高通量测序技术分析结肠内容物肠道菌群变化。结果 与对照组比较,模型组小鼠首次排便时间显著缩短（P<0.01）,稀便级、稀便率和腹泻指数显著升高（P<0.01）;消化酶乳酸脱氢酶（LDH）、淀粉酶（AMS）和脂肪酶（LPS）活力显著降低（P<0.01）;炎症因子白细胞介素1β （IL-1β）、环氧化酶2 （COX-2）、细胞间黏附分子1 （ICAM-1）和肿瘤坏死因子α （TNF-α）水平显著升高（P<0.01）;肠道菌群α多样性Simpson指数显著升高（P<0.05）;肠道菌群β多样性差异较大;变形菌门、梭杆菌门、变形菌纲、梭杆菌纲、肠杆菌目、梭杆菌目、拟杆菌科、丹毒丝菌科、埃格特菌科和拟杆菌属丰度显著升高（P<0.01）,Muribaculaceae和norank_f__Muribaculaceae丰度显著降低（P<0.01）。与模型组比较,甘草泻心汤高、低剂量组小鼠首次排便时间显著延长（P<0.05、0.01）、稀便率和腹泻指数显著降低（P<0.05、0.01）,高剂量组稀便级显著降低（P<0.01）;高、低剂量组各消化酶活力显著回升（P<0.05、0.01）;高、低剂量组各炎症因子水平显著降低（P<0.05、0.01）;高剂量组Simpson指数显著降低（P<0.05）,β多样性更趋近对照组,显著回调各优势物种丰度的显著性变化（P<0.05、0.01）。结论 甘草泻心汤对于伊立替康诱导的腹泻小鼠具有明显的治疗作用,可能是其通过调整腹泻小鼠肠道菌群实现。     

鹦鹉热衣原体肺炎7例

目的 分析鹦鹉热衣原体肺炎病人的临床特征,提高临床医师对鹦鹉热衣原体肺炎诊断及治疗方法的认识。方法回顾分析2021年6月至2022年2月铜陵市人民医院收治的7例鹦鹉热衣原体肺炎病人的病例资料,结合近5年该病的相关文献对比研究。结果 7例病人均为散发病例,6例在秋冬季节发病,6例病人在发病前有明确鸟类或家禽接触史。入院时常见症状包括高热（100%）、咳嗽（42.9%）、胸闷（14.3%）、纳差乏力（57.1%）、肌肉酸痛（14.3%）和腹泻（28.6%）。4例重症鹦鹉热衣原体肺炎病人均出现呼吸衰竭,其中2例出现急性呼吸窘迫综合征（ARDS）。实验室检查数据显示白细胞正常或略有增加,淋巴细胞绝对值下降,C-反应蛋白（CRP）明显升高（100%）,降钙素原（PCT）波动较大。多伴有肝功能损害（85.7%）,肌酐（Cr）异常（57.1%）,乳酸脱氢酶（LDH）升高（100%）,肌酸激酶（CK）升高（57.1%）。多数病例合并低钾血症（71.4%）、低钠血症（85.7%）和D-二聚体升高（85.7%）。动脉血气分析提示多数病例存在氧分压（PO2）低（66.7%）,二氧化碳分压（PCO2）低（83...     

高通量测序技术联合瞬态诱发性耳声发射技术在新生儿遗传性聋筛查中的应用价值研究

目的 探究高通量测序（NGS）技术联合瞬态诱发性耳声发射（TEOAE）技术在新生儿遗传性聋筛查中的应用价值。方法采用整群随机抽样方法,根据纳入、排除标准选取2018年1月至2020年10月承德市中心医院625例新生儿作为研究对象,均于出生后3～7 d内行新生儿遗传性聋筛查,筛查方法采用NGS技术和TEOAE技术,并于出生后1个月、2个月采用TEO-AE技术进行第1、2次复筛,统计NGS技术、TEOAE技术筛查结果,分析NGS技术联合TEOAE技术筛查新生儿遗传性聋的价值。结果 本组共纳入625例新生儿,NGS技术筛查结果显示6.08%存在耳聋基因异常,主要为GJB2基因（2.40%）、SLC26A4基因（2.72%）异常,0.80%存在≥2个耳聋基因位点异常;TEOAE技术初筛8.48%的新生儿未通过,第1次、2次复筛未通过率分别为6.40%、5.12%;NGS技术、TEOAE技术筛查新生儿遗传性聋的曲线下面积（AUC）分别为0.920、0.880,二者联合筛查的AUC最大,为0.976,联合筛查的灵敏度、特异度分别为95.65%、99.50%。结论 NGS技术、TEOAE技术均为新生...     

PIK3R2基因错义变异所致MPPH综合征I型患儿遗传学分析

目的：总结1例罕见的巨脑畸形-多小脑回-多指（趾）畸形-脑积水（MPPH）综合征Ⅰ型患儿的临床特点及基因检测结果。方法：回顾性总结2021 年1月在温州医科大学附属第一医院新生儿科确诊的1例MPPH I型患儿的临床表现、影像学检查和基因检测结果等病例资料。并通过文献复习,分析和总结国内外已报道的MPPH I型综合征病例的临床特征及遗传学特点。同时对患儿进行全外显子组检测,对候选变异用Sanger测序进行家系验证。结果：先证者携带PIK3R2 基因c.1117（p.Gly373Arg）杂合错义变异,国内既往未见报道,其父母未携带相同变异。相关文献报道的16例MPPH I型患儿主要表现为不同程度的脑积水、巨脑畸形、癫痫发作、多指（趾）畸形、发育迟缓及智力发育障碍。共报道了3个基因突变位点,其中p.Gly373Arg杂合变异最多（14例）,罕见变异包括p.Leu401Pro变异1例和p.Asp557His变异1例。结论：PIK3R2 基因c.1117G＞A（p.Gly373Arg）杂合错义变异可能是该患儿发生MPPH I的原因,脑积水考虑与该综合征相关,其母亲再次怀孕时需接受产前诊断。     

米氏克雷伯菌合并白色念珠菌感染致不明原因发热一例并文献复习

目的:探讨联合应用宏基因组学和培养组学技术对米氏克雷伯菌合并白色念珠菌感染所致不明原因发热患者的病原检测、分离和治疗措施。方法:分析济南市疾病预防控制中心联合山东大学齐鲁医院对2019年7月1日收治的1例米氏克雷伯菌合并白色念珠菌感染导致的不明原因发热患者的诊疗过程,并复习相关文献。结果:该患者主动脉层术后持续间断发热,经抗真菌治疗后效果不佳,经宏基因组学测序联合培养组学技术分离病原提示疑似米氏克雷伯菌合并白色念珠菌感染,调整使用头孢哌酮钠舒巴坦钠联合卡泊芬净抗感染治疗后,患者发热症状消失,实验室指标恢复正常后出院。结论:米氏克雷伯菌感染较少见,且易误诊为其他克雷伯菌,应用宏基因组学联合培养组学技术可尽早明确该病原所致感染,以进行针对性的抗感染治疗。     

基于单细胞测序及蛋白质组数据分析尿酸转运蛋白在肾脏的精细表达定位

目的利用单细胞测序、微量蛋白质组学及免疫组化三部分数据深入分析肾脏尿酸转运蛋白的细胞分布及表达丰度。 方法利用2个成人健康肾脏的单细胞测序数据集(GSE131685)分析12个肾脏尿酸转运基因的细胞定位及表达丰度,进一步利用激光微切割联合质谱检测大鼠肾小管14个区段蛋白质数据集12个蛋白的定位和丰度,最后利用ProteinAtlas数据库检索上述蛋白在肾脏中的免疫组化染色结果。 结果单细胞测序数据集GSE131685中,12个尿酸转运蛋白集中表达于近端小管细胞,而在KIT数据集中,除了ABCG2、SLC22A12和SLC22A13外,其余都集中表达于近端肾小管S1,S2和S3段细胞。KEAT蛋白数据集的分析结果与KIT数据结果类似：ABCG2,SLC17A3,SLC22A12,SLC22A6和SLC22A8在近端小管S1,S2和S3段有显著的表达,尤其是SLC22A6仅富集在S2段肾小管,而ABCG2在S3段有较强的富集,其它的蛋白表达丰度相对较低。ProteinAtlas的免疫组化数据显示出与单细胞测序及蛋白质组的结果有较大的差异：ABCC2、SLC17A4、SLC22A6、SLC22A11、SLC22A12、SLC22A13及SLC2A9显示在近端小管比较特异的表达定位,其中ABCC2、SLC22A6、SLC22A11和SLC22A13信号较强。ABCC4、ABCG2和SLC16A9的表达丰度相对较低,特异性较差。 结论尿酸转运蛋白在肾脏主要集中表达于小管的S1,S2和S3段细胞,蛋白质组数据和单细胞测序数据比较接近。单细胞测序及微切割的微量蛋白组学是研究蛋白精细定位的良好工具。本研究为今后研究尿酸转运蛋白的功能及研发降尿酸药物提供基础依据。     

二代测序技术应用于脑脊液检测在结核性脑膜炎中的早期诊断价值

目的评价二代测序技术应用于脑脊液检测在结核性脑膜炎（TBM）患者中的早期诊断价值。 方法前瞻性纳入2018年2月2日至2018年8月2日于山东省胸科医院就诊的临床怀疑TBM的患者共50例,并跟踪随访其诊疗结局。送检脑脊液标本均进行二代测序,测序所得原始序列与病原微生物数据库进行对比得到最终结果。二代测序结果以检测到结核分枝杆菌复合群唯一比对序列为阳性,未检测到唯一比对序列为阴性。以符合脑脊液结核分枝杆菌培养阳性、涂片阳性、Xpert MTB/RIF检测阳性及结核分枝杆菌核酸检测阳性等4项中至少1项即为确诊TBM患者;临床可疑TBM且抗结核治疗有效为临床诊断患者;有其他病原学依据或临床排除TBM者为非TBM患者。分析二代测序在TBM早期诊断中的敏感性和特异度。 结果确诊为TBM患者22例中Xpert MTB/RIF检测阳性13例,培养阳性6例,结核分枝杆菌核酸PCR检测阳性5例,临床诊断为TBM患者12例,非TBM患者16例。在确诊及临床诊断患者中,二代测序技术检测到结核分枝杆菌复合群系列20例,敏感性为58.8%（20/34）,特异度为100%（16/16）。在确诊患者中,二代测序的敏感性为63.6%（14/22）;在同步进行结核分枝杆菌培养、Xpert MTB/RIF检测与二代测序的50例标本中,以临床诊断为标准,3种方法的特异度均为100%（16/16）;传统方法、Xpert MTB/RIF检测及二代测序的敏感性分别为29.4%（10/34）、38.2（13/24）和58.8（20/34）,前两种检测方法与二代测序敏感性差异均有统计学意义（McNemar检验：χ² = 8.333、P = 0.013,χ² = 8.333、P = 0.065）。传统方法与二代测序联合检测的敏感性高达82.4%（28/34）。 结论二代测序技术能够较快速地检测脑脊液中的结核分枝杆菌复合群,且其敏感性和特异度均较高,可作为TBM的早期诊断指标。二代测序联合传统检测方法可提高检出率。     

临床基因检测报告规范与基因检测行业共识探讨CSCD

二代测序技术（next generation sequencing,NGS）在临床的应用为广泛开展遗传病的基因检测、病因诊断、治疗及预防奠定了基础,但同时也伴随着一系列的问题,其中很重要的一个环节就是基因检测报告缺乏统一或基本的标准。首届“临床基因检测标准与规范专题研讨会”于2017年10月28日在深圳召开,来自全国138家机构的250多位遗传学专家、临床专家及第三方检测机构的代表共同探讨了遗传病基因检测报告的标准和规范问题。本文根据此次研讨会专家的意见和建议,就遗传病基因检测报告的原则、规范以及基因检测行业的发展进行了讨论,并发布了临床基因检测报告规范共识,以促进检测报告的规范化和标准化,推进我国基因检测行业的健康有序地发展。     

三个先天性遗传性白内障家系的致病基因突变分析CSCD

目的明确3个有家族史的先天性白内障家系的致病基因及突变类型,为家系的遗传咨询及产前诊断提供依据。 方法应用外显子组结合目标区域捕获测序芯片对先证者进行突变基因及突变位点捕获,Sanger测序对家系成员进行验证。结果家系1为多形性白内障,家系2为蓝点状白内障,家系3为珊瑚状白内障。3个家系的遗传方式均符合常染色体显性遗传。家系1患者均检测出CRYβB2基因c.463C〉T（p.Q155X）无义突变,家系2患者均检测出CRYGD基因c.43C〉T（ p．R14C）错义突变,家系3患者均检测出CRYGD基因c.70C〉A（p.P23T）错义突变;这些突变均表现为基因型与疾病共分离。结论家系1、2和3的致病性突变分别为CRYβB2基因c.463C〉T（p.Q155X）突变、CRYGD基因c.43C〉T（p.R14C）突变和CRYGD基因c.70C〉A（p.P23T）突变,本研究结果为家系的遗传咨询及产前诊断提供了依据.     

一例3p26．3-pter缺失及7q31．33-qter重复患儿的临床表型与遗传学分析CSCD

目的明确1例发育落后合并多发畸形患儿染色体拷贝数变异（copy numbervariants,CNVs）的性质及来源,并分析其与表型的相关性。方法应用常规G显带分析患儿及其父母的外周血染色体核型,应用二代测序（next generation sequencing,NGS）技术对患儿进行检测。结果G显带分析显示患儿的3号染色体存在结构异常,其父亲的染色体核型为46,XY,t（3;7）（p26;q31）,其母亲核型未见异常。NGS检测显示患儿染色体3p26．3-pter区存在约2．16Mb的微缺失,7q31．33-qter区存在约34．24Mb的重复。结论患儿3号染色体的结构异常源自其父亲的t（3;7）平衡易位,其核型为46,XY,der（3）t（3;7）（p26．3;q31．33）pat。3p26．3-pter区微缺失和7q31．33-qter区重复是导致患儿异常表型的原因。