甲型H1N1流行性感冒临床特征分析

对3499例甲型H1N1流行性感冒病例进行流行病学调查和咽拭子采样,用实时荧光定量聚合酶链反应方法检测患者甲型H1N1流行性感冒病毒核酸,分析患者临床特点和排毒时间.结果 显示,有13例（0.37%）为隐性感染,症状中出现最多见为发热（86.77%）,平均咽拭子转阴时间为发病后6 d,未发现与咽拭子转阴时间的临床相关因素。     

71例新型冠状病毒肺炎不同病程生物学样本核酸检测分析

目的 对新型冠状病毒肺炎（coronavirus disease 2019, COVID-19）患者在不同病程阶段不同生物学样本新型冠状病毒（SARS-CoV-2）进行核酸检测,并分析其临床意义。 方法 采用横断面观察性研究设计,收集烟台市奇山医院1月24日—2月28日COVID-19确诊患者病例的相关临床资料,应用实时荧光逆转录聚合酶链反应检测技术,在疾病不同阶段采集鼻/咽拭子、痰液样本进行SARS-CoV-2核酸检测。对危（重）型及普通型患者的核酸阴转时间进行统计学分析。 结果 共纳入71例确诊患者,男性40例,女性31例。患者首发症状80.3%为发热,57.8%为咳嗽。普通型病例57例（占80.3%）,轻型病例5例（占7.0%）,重型病例8例（占11.3%）,危重型病例1例（占1.4%）。治愈出院40例,平均住院（22.78±6.19）d;鼻咽拭子和痰液样本在发病的1、2、3、4和5周的核酸检出率分别为100.0%和87.5%、48.6%和88.2%、44.7%和86.1%、19.1%和58.7%、11.5%和33.3%。鼻咽拭子的假阴性率在发病的1、2、3、4和5周分别为12.5%、52.9%、、44.1%、42.9%、20.0%。同期两种样本送检结果一致率在发病第1周及第5周较高;发病1周无病毒学核酸检测阴转的病例,发病2周有2例（占3.9%）,3周有12例（占23.5%）,4周有20例（占39.2%）,5周有16例（占31.4%）,5周后有1例（占2.0%）。第4~5周病毒核酸转阴率最高（占70.6%）;危（重）型和普通型病人的核酸阴转时间分别为（30.00±3.54）d和（24.00±5.84）d ,差异有统计学意义（P<0.05）。 结论 COVID-19的主要症状为发热,干咳。普通型病例为主。痰液样本核酸检测的阳性率高于鼻咽拭子样本,鼻咽拭子检测结果存在假阴性,两种样本联合送检可减少假阴性的发生。在发病的第4周及第5周病毒核酸转阴率最高。重症患者病毒的持续存在,可能是病情加重的主要因素之一。     

急性呼吸道感染门诊患者的临床特征和病毒谱分析

目的分析急性呼吸道感染门诊患者的临床特征和病毒谱,为患者的临床治疗提供依据。方法收集2015年1月~2016年12月具有急性呼吸道感染症状的门诊患者的临床资料,并采集患者的咽拭子样本。应用多重PCR方法检测15种呼吸道病毒,并利用实时荧光RT-PCR技术鉴别甲型流感病毒的3种常见亚型。结果 465例门诊患者中,呼吸道病毒阳性137例,检出率为29.5%(137/465),其中单一病毒感染94.2%(129/137),病毒共感染5.8%(8/137);单一病毒感染中,以流感病毒为主,其次为肠道;病毒共检出中以鼻病毒和季节性H3N2流感病毒共检出为主。临床特征显示,病毒阳性患者的部分临床症状比病毒阴性患者重,更容易出现高热、咽喉痛、乏力、鼻涕、痰液及呼吸急促等症状,且肺部异常多见。不同年龄段患者的感染率存在一定的差异,5岁患儿最高(50.0%),其次为≥60岁的老年人(38.6%)。结论呼吸道病毒是导致门诊患者发生急性呼吸道感染的常见原因,特别是婴幼儿和老年人,因此,加强呼吸道病毒的检测将有助于急性呼吸道感染患者的防治。     

昆明地区COVID-19患者多种生物样本的病毒核酸检测结果

目的 通过国产2019-nCoV(新型冠状病毒)核酸测定试剂,测定确诊的COVID-19(新型冠状病毒肺炎)患者的多种生物样本内SARS-CoV-2核酸的携病毒情况,对机体不同系统中SARS-CoV-2的状态展开观察,并分析其临床价值,为诊断和治疗提供参考.方法 收集昆明市第三人民医院53例确诊的新型冠状病毒肺(COVID-19)患者的鼻拭子、咽拭子、痰液、粪便和尿液样本,实时荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)测定法,来平行测定病毒ORF1ab基因与N基因核酸,比较不同类型样本的阳性率和一致性.结果 患者的多种生物标本核酸Ct值的变化与病程都高度相关,发病15 d前后来分析核酸检测结果,发现在发病15 d后病毒核酸Ct值与15 d内相比病毒核酸载量,差异有统计学意义(P＜0.05).在发病第1～7天和8～14d,鼻拭子阳性检出率为88.67％(47/53)和79.24％(42/53),而咽拭子阳性检出率为73.58％(39/53)和53.85％(28/52).粪便样本核酸检测阳性率12.28％(7/57),尿液样本均未检测出病毒核酸.结论 在新冠肺炎患者发病的不同阶段,鼻拭子、咽拭子、痰液样本有较高的核酸检出率;在阳性检出率方面,鼻拭子相较咽拭子偏高;SARS-CoV-2有粪-口传播可能,同时病毒液可能会潜在感染消化道.     

不同临床标本微生物检验的阳性率结果对比分析

目的:对比分析不同临床标本微生物检验的阳性率.方法:研究对象为2014年12月到2016年12月的6 000份包括呼吸道、伤口分泌物、血液、粪便以及尿液的临床微生物检测样本,分析比较其微生物检验的阳性率.结果:微生物检测结果显示,进行样本微生物检测的阳性率为24.43%.其中,微生物检验阳性率由高到低分别为:尿液样本的检验阳性率为33.01%,呼吸道样本的检验阳性率最高为30.01%,伤口分泌物的检验阳性率为22.76%,血液样本的微生物检验阳性率为16.31%,粪便样本的检验阳性率为8.73%为最低,微生物检验的阳性率在不同样本之间的数据差异存在统计学意义(P<0.05).结论:对于不同临床标本微生物检验的阳性率的不同能够大致了解到目前的疾病流行状况,为临床中进行疾病的预防以及诊断提供依据,具有进行临床上广泛推广价值.     

巫溪县长桂乡爆发性流感的流行病学分析

目的 了解巫溪县长桂乡2008年发生的48例流感病例的流行病学特征,为防治流感工作提供科学依据.方法 对巫溪县长桂乡中心小学及学校周围人群进行流行病学调查,填写调查问卷,并抽取有典型症状的12名病例采集咽拭子样标本和血清样本各6份进行实验室检测.结果 2008年5月巫溪县长桂乡48人出现发热、咳嗽等流行性感冒症状的爆发疫情,其中男性24人,占50.0%,女性24人,占50.0%;发病年龄在2～47岁,以11岁、12岁、13岁3个年龄组较多,发病23人,占47.91%.采集病人咽拭子标本6份,1份分离出B型流行性感冒病毒,阳性率为16.67%;采集血清标本6份进行快速检测,1份为阳性,阳性率为16.67%.结论 及时对初发病例,采取有效的隔离和治疗措施,加强改善中小学校等人口聚集地的环境,宣传良好的卫生习惯,普及流行性感冒的卫生知识,是防治流行性感冒爆发流行的有效措施.     

一步法RT-PCR检测手足口病EV71、CA16病毒核酸

目的检测手足口病病原核酸,了解濮阳市手足口病病因和不同标本检测状况。方法对濮阳市辖区内手足口病43例住院患者的咽拭子、疱疹液和血清样本进行一步法RT-PCR检测。结果 43例患者的72份标本中,病原核酸EV71阳性23份,阳性率为31.94%。其中,咽拭子阳性率为39.53%(17/43),疱疹液阳性率为66.67%(6/9),血清阳性率为0%(0/20),CoxA16未检出。结论濮阳市手足口病流行由肠道病毒EV71引起,不同标本中疱疹液和咽拭子病毒含量多。     

分析不同临床标本对微生物检验阳性率结果的影响及其原因

目的分析不同临床标本对微生物检验阳性率结果所产生的影响,并分析其原因,为提升临床检测准确率提供参考。方法选择我院在2014年6月至2015年7月进行微生物检验的样本600例进行检验分析,其中呼吸道样本150例,血液样本150例,尿液样本150例和粪便样本150例,比较不同检验样本的阳性检出率。结果尿液样本阳性率为30%,呼吸道样本阳性率为24.67%,血液样本阳性率为26.67%,粪便样本阳性率为16.7%,可以看出不同临床标本对微生物检验阳性率结果存在着影响,尿液标本最高,粪便最低。结论不同微生物检验样本的阳性检验率存在着一定的差异,尿液样本阳性检出率最高,粪便标本检验阳性率最低,临床检测时需要根据患者的疾病和检测条件选择最佳的检验方法,保证检验的阳性率,为疾病的准确诊断奠定基础。     

潼关县一起流感疫情暴发的调查分析

目的分析潼关县流感疫情暴发的流行病学特征,为防控流感等呼吸系统传染病提供经验。方法对临床诊断病例进行个案调查,采集发病初期未用药患者的鼻、咽拭子进行实验室检测和病毒培养,对收集的资料和流行过程进行流行病学分析。结果潼关县2所中小学共发生流感样病例42例,罹患率为2.19%;经对15例发病初期未用药患者鼻、咽拭子标本进行检测,11份甲型流感病毒抗原呈阳性;RT-PCR检测,甲型流感病毒核酸呈阳性,阳性率为73.30%。结论此次流感暴发疫情的病原体为甲型流感病毒,提示2008年流感流行病原体很有可能将以甲型为主。     

PCR-荧光探针法和核酸序列测 定法对呼吸道病原体的检测效能 比较及呼吸道病原体的流行特征 分析

目的 比较PCR-荧光探针法和核酸序列测定法对呼吸道病原体的检测效能，进一步分析呼吸道病原体的流行特 征。 方法 选择 2019 年 7 至 12 月浙江大学医学院附属杭州市第一人民医院呼吸道感染患者 309 例，采集鼻咽拭子标本，分别采 用核酸序列测定法和 PCR-荧光探针法进行同步盲法检测，以核酸序列测定法的检测结果为金标准，分析 PCR-荧光探针法检测 不同病原体的灵敏度、特异度、阳性预测值和阴性预测值，并分析不同呼吸道病原体的流行特征。 结果 309 例鼻咽拭子标本中， 两种方法检测结果不一致或不完全一致的样本共 2 例，针对不同病原体，PCR-荧光探针法的检测灵敏度均为 100.00%，特异度为 99.65%~100.00%，阴性预测值均为 100.00%，阳性预测值为 75.00%~100.00% 。309 例呼吸道感染患者，人鼻病毒检出率为 25.6%（79/309），人腺病毒检出率次之，为 11.3%（35/309）；学龄前儿童（＜6 岁）和 6~21 岁人群检测出 18 种呼吸道病原体，其中 以人鼻病毒检出率最高。 结论 与核酸序列测定法相比，PCR-荧光探针法检测鼻咽拭子标本中的呼吸道病原体更灵敏、安全、简 便、稳定，具有较高的临床应用价值。本院呼吸道感染以人鼻病毒为主。     

Taqman PCR检测人博卡病毒的阳性率

目的：建立核酸特异、快速、敏感的Taqman探针实时定量PCR检测方法筛选疑似人博卡病毒（HBoV）感染者鼻咽拭子临床样本中的阳性样本。方法：比对编码HBoV—sh9的基因序列,选取保守区序列设计引物和探针,建立Taqman PCR检测人博卡病毒的阳性率的方法,进行特异性实验,检测214例临床样本。结果：所建立的Taqman PCR方法可以用于检测人博卡病毒的阳性率,对所收集得到的214例急性上呼吸道感染者的咽拭子标本进行检测,结果显示,荧光定量PCR检测出8例阳性,其阳性率为3．74％。结论：建立了HBoV TaqMan探针实时定量PCR检测方法,可以快速灵敏的检测出阳性人博卡病毒,为临床治疗提供快速可靠的诊断依据。     

90例SARS患者含漱液内冠状病毒定量与临床转归的相关研究

目的通过对SARS患者含漱液内冠状病毒定量与临床转归的相关性的初步研究,以期能建立起客观的SARS重症救治早期预警指标.方法对2003年4～5月在本院诊断的90例SARS成年患者,77例SARS密切接触者进行含漱液的实时荧光定量(RT-PCR)方法检测SARS病毒定量,将其结果与临床转归进行对比分析.结果77例SARS密切接触者含漱液中病毒检测均为阴性,90例SARS病人病程第5～11天含漱液内病毒检测48例为阳性,且21例病毒定量>1.0×102copies/ml者中的9人出现ARDS,6人死亡,与病毒定量阴性或病毒定量<1.0×102copies/ml者比较仅各1例发展至ARDS,1例死亡,具有显著性差异.结论含漱液用于检测SARS病毒核酸对于早期诊断和未发病者的监测有着重要的意义.含漱液内SARS病毒定量高者有可能成为"超级传播者".SARS患者的含漱液内冠状病毒定量愈高提示疾病愈可能是重型,应加强监护,及早治疗,以期提高治愈率,降低病死率,是客观的SARS重症救治早期预警指标,应引起重视.     

辽阳市手足口病患者标本肠道病毒检测结果

目的 通过对辽阳市2016年手足口病的临床诊断病例的咽拭子标本和粪便标本进行肠道病毒核酸检测和病毒分离培养,比较不同病毒分型下两种标本类型阳性率的差异,探究不同类型标本对手足口病实验室诊断的指导意义。方法 收集107例辽阳市2016年手足口病的临床诊断病例的咽拭子和粪便标本,提取样本核酸,用实时定量PCR法检测肠道病毒通用引物、肠道病毒71型和柯萨奇病毒A组16型,通过McNemar检验以及Kappa检验对检测结果进行统计学分析。结果 配对采集病例两种类型标本共214份,肠道病毒通用引物、肠道病毒71型和柯萨奇病毒A组16型的咽拭子标本核酸检测阳性率分别为48.6%、8.4%、22.4%;粪便标本的核酸检测阳性率分别为59.8%、11.2%、18.7%。PE、EV71病毒的粪便标本的检出率均大于咽拭子标本的检出率,但CV-A16病毒的粪便标本的检出率却小于咽拭子标本的检出率。其他肠道病毒的咽拭子标本和粪便标本的病毒检出率差异有统计学意义（P<0.05）,粪便标本肠道病毒检测阳性率高于咽拭子标本,同时显示较差的一致性（P<0.05）。结论 在手足口病实验室肠道病毒检测中,粪便标本的肠道病毒检测阳性率高于咽拭子标本,今后的手足口病防治工作中为提高标本检测阳性率,若时间紧迫应首先考虑选择采集粪便标本加以检测。     

新型甲型H_1N_1流感检测方法的临床观察

目的:研究并探讨新型甲型H1N1流感病毒使用RNA荧光定量来检测的的方法,以及观察使用RNA荧光定量来检测是否具有临床的可行性以及安全性。方法:选取流感患者80例为研究对象。,所有患者都自愿接受调查并服从所有准则,有30例中鼻咽拭子混悬液患者,有28例咽拭子患者,有22例鼻拭子患者,收集的时间以患者去就诊的时间为标准,荧光定量PRC法是用来检测甲型H1N1流感病毒RNA,与此同时对这80例流感患者还要经常做季节性的流感病毒的检测。结果:B型流感病毒患者的人数为45例;其他流感有35例,占44%。根据取材方法来说,鼻咽拭子混悬液的阳性比重是68%,咽拭子所占的阳性比重为47%,鼻拭子所占的阳性比重为39%。结论:在检测新型甲型H1N1流感过程中,所取的材料应尽可能采取鼻拭子混悬液,同时要注意的是:采集样本的时间越早阳性率所占的比重越高。使用RNA荧光定量来检测更具有临床的可行性以及安全性。     

COVID-19患者早期咽拭子病毒载量与临床特征的关联分析

目的：探讨新型冠状病毒肺炎（coronavirus disease 2019,COVID-19）患者早期咽拭子病毒载量与临床症状及肺部影像学表现的关系。方法：回顾性分析2020年1月24日至2月9日在中南大学湘雅二医院确诊的30例COVID-19患者早期咽拭子病毒核酸载量与临床症状、肺部影像学特征的具体关联。结果：30例COVID-19患者就诊时,4例患者（13.33%）未出现临床症状,23例患者（76.67%）出现发热;20例患者（66.67%）出现COVID-19影像学改变,10例患者（33.33%）影像学无明显异常。COVID-19无症状患者的咽拭子病毒核酸Ct值与有症状患者相比差异无统计学意义;相比于影像学无异常的患者,出现肺炎影像学表现的患者咽拭子病毒核酸Ct值更大（P=0.001）,体温更高（P=0.014）;通过logistic回归模型校正性别和年龄后,咽拭子病毒核酸Ct值与出现肺炎影像学特征呈独立正相关（OR=1.34,95%CI=1.07~1.66,P=0.009）。结论：早期无临床症状的COVID-19患者与有症状患者的咽拭子病毒载量水平相当;COVID-19患者早期咽拭子病毒载量与肺部影像学特征呈负向关联。     

小儿肺炎支原体感染的临床检验分析

目的：探究分析小儿肺炎支原体感染的不同临床检验方法及其效果。方法：选取90名小儿肺炎支原体感染者作为研究对象,两组分别采用微生物培养法和血清学检验法来实行检验,分析检验的结果。结果：血清检验1次检验的阳性率是44.4%,明显低于第二次检验的阳性检测率72.2%;微生物培养检测组中,咽拭子检验阳性率显著低于痰液检测的阳性率;微生物培养检测肺炎的支原体的阳性率是88.9%,显著高于血清学检验的阳性率;低于1岁的患儿血清检验的支原体检出阳性率明显低于其他年龄段的患儿。灌洗液、痰液和血清抗体的监测阳性率无明显的统计学差异。结论：在小儿肺炎支原体感染的临床检验中,微生物法的诊断准确率高于血清学检验诊断法,值得临床推广应用。     

新型冠状病毒肺炎患者粪便与咽拭子病毒核酸检测结果分析

目的探讨新型冠状病毒肺炎患者粪便与咽拭子病毒核酸检测的临床价值。方法回顾性分析2020年1月22日至2月27日金华市中心医院收治的17例新型冠状病毒肺炎患者的临床资料（包括人口学、临床表现）及咽拭子标本与粪便标本病毒核酸检测结果。结果17例患者中男10例,女7例,比例为1.4:1;年龄中位数为37岁;重型1例。其中初诊发热者13例（76.4%）,无症状者1例（5.8%）;初诊咽拭子病毒核酸检测阳性17例（100.0%）;初诊胸部CT检查,未见病变2例（11.1%）,肺部炎症15例（88.2%）,其中磨玻璃片状影8例（47.0%）。17例患者均进行了粪便病毒核酸检测,阳性7例（41.1%）。其中咽拭子病毒核酸检测转阴性时间平均8.4d,咽拭子病毒核酸检测转阴性后粪便病毒核酸检测持续阳性7例,最长可达到24d。结论粪便新型冠状病毒核酸检测阳性持续时间长于咽拭子病毒核酸检测阳性持续时间。新型冠状病毒是否可经粪-口传播值得探讨。     

甲型和乙型流感病毒抗原检测新方法

目的寻找一种更加简便的方法来定性检测流感病毒抗原阳性细胞。方法设计流式的方法来检测甲型流感病毒(IA)和乙型流感病毒(IB)抗原阳性细胞。采用2种荧光素标记抗体进行流式标记鼻咽拭子的上皮细胞,对157份鼻咽拭子进行甲型和乙型流感病毒抗原检测。结果 157例样本中,直接免疫荧光法检测到甲型流感病毒阳性44例,乙型流感病毒阳性35例,流式法检测到甲型流感病毒阳性39例,乙型流感病毒阳性29例,两种方法检测甲型和乙型流感病毒的阳性率差异无统计学意义(P0.05)。两种方法检测IA的阳性与阴性总符合率为93.0%,阳性率差异无统计学意义(P0.05),一致性系数检验κ=0.820,提示两种检测方法一致性较强且有统计学意义(P0.05)。两种方法检测IB的阳性与阴性总符合率89.8%,阳性率差异无统计学意义(P0.05),一致性系数检验κ=0.687,两种检测方法一致性基本满意且有统计学意义(P0.05)。结论采用流式法可及早快速筛查甲型、乙型流感标本,操作步骤简便,只需不到2 h就可完成检测,可以推广应用。     

奥密克戎BA.2变异株感染者不同部位样本核酸阴转时间及影响因素分析

目的 分析严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）奥密克戎BA.2变异株感染者不同样本的核酸阴转时间及其影响因素。方法 采用荧光定量PCR法（RT-PCR）序贯检测海军军医大学（第二军医大学）第一附属医院217例确诊为新型冠状病毒肺炎（COVID-19）且基因测序确认病毒株为奥密克戎BA.2变异株患者的鼻咽拭子、痰液和肛拭子SARS-CoV-2核酸,比较不同样本核酸阴转时间。采用分层分析及多元线性回归分析方法探讨不同样本核酸阴转时间的影响因素。结果 217例COVID-19确诊患者的年龄为32.0（24.0,50.5）岁,男128例（59.0%）、女89例（41.0%）;无症状感染8例（3.7%）、轻型184例（84.8%）、普通型21例（9.7%）、重型3例（1.4%）、危重型1例（0.5%）;接受莫努匹韦抗病毒治疗者70例（32.3%）。鼻咽拭子、痰液和肛拭子的SARS-CoV-2核酸阴转时间分别是13.0（11.0,17.0）、16.5（13.0,21.0）、10.0（5.3,11.0）d,两两比较差异均有统计学意义（P均<0.001）。年龄≥60岁、合并基础疾病尤其是高血压、冠状动脉疾病或神经系统疾病、临床分型为普通型是鼻咽拭子标本核酸阴转时间延长的危险因素;男性、合并基础疾病是痰液标本核酸阴转时间延长的危险因素;男性是肛拭子标本核酸阴转时间延长的危险因素。多元线性回归分析显示,临床分型为危重型是鼻咽拭子SARS-CoV-2核酸阴转时间延长的独立危险因素（P<0.05）,男性是痰液核酸阴转时间延长的独立危险因素（P<0.05）。结论 在奥密克戎BA.2变异株感染患者中,痰液标本核酸阳性持续时间最长、肛拭子最短;男性、合并基础疾病患者痰液标本核酸阴转时间较长。     

胃内幽门螺杆菌在口腔中的分布特点

目的：通过多聚酶链反应（PCR）检测胃病患者口腔中的幽门螺杆菌（HP）。方法：从13例有上消化道症状、经内镜检查证实的胃病患者采集胃黏膜、口腔含漱液和6个牙位的龈上及龈下菌斑,应用（PCR）检测标本中的HP。同时用酶联免疫法检测静脉血、唾液、龈沟液中抗HP特异性IgG抗体。结果PCR检测胃黏膜均为HP阳性。6例患者（46.2%）的含漱液和11例患者（84.6%）的至少一份菌斑样本中检测出HP。口腔黏膜与胃黏膜HP阳性率高于一般人,此外从患者静脉血、唾液、龈沟液中均可检测到HP特异性IgG抗体。结论：本研究结果表明龈沟或牙周袋可能是口腔HP聚集的适宜环境。