3例新型冠状病毒肺炎患者不同标本检测分析

目的 分析新型冠状病毒肺炎（COVID-19）患者临床表现及治疗后咽拭子、粪便、尿液的严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）核酸检测阴转情况,探讨新型冠状病毒肺炎（COVID-19）病人的出院标准。方法 回顾性分析3例海南省人民医院收治的COVID-19病例,对其临床表现及治疗后咽拭子、粪便、尿液的严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）核酸检测结果进行描述。结果 3例COVID-19病例治疗后咽拭子核酸转阴性,粪便核酸检测仍呈阳性,合并尿液核酸阳性1例,1例患者病程3周后出现SARS-CoV-2抗体lgM、lgG均阳性(滴度分别为4.416和18.485)。结论 建议严格把握出院标准,推荐增加粪便、尿液核酸检测,出院后仍需集中医学观察14 d以最大限度降低消化道传播风险的可能。     

新型冠状病毒肺炎病例不同标本核酸检测结果分析

目的 了解不同类型和疾病进展阶段新型冠状病毒肺炎（coronavirus disease 2019,COVID-19）病例的标本新型冠状病毒（SARS-CoV-2）核酸检测结果及影响因素。方法 对桂林市新型冠状病毒肺炎疑似病例及密切接触者分别采集深咳痰液、咽拭子、粪便及眼结膜拭子,采用双重实时荧光RT-PCR方法进行SARS-CoV-2核酸检测,收集流行病学、临床实验室及辅助诊断等资料,分析提高核酸检测敏感性的因素。结果 共采集537例COVID-19疑似病例及密切接触者标本654份,其中,深咳痰液569份,咽拭子26份,粪便28份,眼结膜拭子31份。SARS-CoV-2核酸阳性32例,核酸阳性检出率6.00％（32/537）;首次核酸阳性的深咳痰液的采样时间与发病时间的间隔天数0~23 d。在2种样本检测比较中,深咳痰液中SARS-CoV-2核酸阳性检出率明显高于咽拭子标本的检出率（P=0.000）。粪便和眼结膜拭子中 SARS-CoV-2核酸阳性分别有19例和5例,它们的采样时间与首次核酸阳性的深咳痰液样本的采样时间比较平均晚7 d。在32例新型冠状病毒肺炎确诊病例中,28例单次采集深咳痰液样本为核酸阳性,其中,于发病第1、2、3、4和5 d及以上分别有6、6、3、4和9例;4例病例需采集2次及以上深咳痰液样本才出现核酸阳性结果。1例病例在采样前有发热及治疗史,作为密切接触者排查隔离观察,分别于发病后第21天（阴性）、第23天（阳性）采集2份深咳痰液标本检测。结论 SARS-CoV-2核酸检测中深咳痰液标本优于咽拭子标本,粪便和眼结膜拭子也可检测到病毒核酸,采样方式、采样时机及治疗史为核酸检测敏感性的影响因素,对疑似病例或密切接触者需隔离观察并多次采样检测,以免漏检。     

西安市一起新型冠状病毒肺炎家族聚集性疫情调查分析

目的 调查分析西安市一起新型冠状病毒肺炎(COVID-19)家族聚集性疫情传播特征,为制定防控策略提供科学依据。 方法 对COVID-19确诊病例、无症状感染者及密切接触者进行流行病学调查,分析疫情的传播链,采集病例及相关人员的鼻咽拭子标本进行SARS-CoV-2核酸检测。 结果 本次疫情累计发现4例普通型、1例危重症型确诊病例和2例无症状感染者,危重症病例最终死亡。首例病例A于2020年1月31日发病,其他病例在首例病例发病后的1~13 d内发病,病例B、C和D、E分别为二、三、四代病例。 结论 家族聚集性疫情是COVID-19的防控重点,及早发现传染源,对密切接触者进行筛查隔离,防止传播扩散有重要意义。     

奥密克戎BA.2变异株感染者不同部位样本核酸阴转时间及影响因素分析

目的 分析严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）奥密克戎BA.2变异株感染者不同样本的核酸阴转时间及其影响因素。方法 采用荧光定量PCR法（RT-PCR）序贯检测海军军医大学（第二军医大学）第一附属医院217例确诊为新型冠状病毒肺炎（COVID-19）且基因测序确认病毒株为奥密克戎BA.2变异株患者的鼻咽拭子、痰液和肛拭子SARS-CoV-2核酸,比较不同样本核酸阴转时间。采用分层分析及多元线性回归分析方法探讨不同样本核酸阴转时间的影响因素。结果 217例COVID-19确诊患者的年龄为32.0（24.0,50.5）岁,男128例（59.0%）、女89例（41.0%）;无症状感染8例（3.7%）、轻型184例（84.8%）、普通型21例（9.7%）、重型3例（1.4%）、危重型1例（0.5%）;接受莫努匹韦抗病毒治疗者70例（32.3%）。鼻咽拭子、痰液和肛拭子的SARS-CoV-2核酸阴转时间分别是13.0（11.0,17.0）、16.5（13.0,21.0）、10.0（5.3,11.0）d,两两比较差异均有统计学意义（P均<0.001）。年龄≥60岁、合并基础疾病尤其是高血压、冠状动脉疾病或神经系统疾病、临床分型为普通型是鼻咽拭子标本核酸阴转时间延长的危险因素;男性、合并基础疾病是痰液标本核酸阴转时间延长的危险因素;男性是肛拭子标本核酸阴转时间延长的危险因素。多元线性回归分析显示,临床分型为危重型是鼻咽拭子SARS-CoV-2核酸阴转时间延长的独立危险因素（P<0.05）,男性是痰液核酸阴转时间延长的独立危险因素（P<0.05）。结论 在奥密克戎BA.2变异株感染患者中,痰液标本核酸阳性持续时间最长、肛拭子最短;男性、合并基础疾病患者痰液标本核酸阴转时间较长。     

214例新型冠状病毒肺炎疑似病例临床分析

目的 回顾分析214例新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疑似病例的流行病学史、临床表现、CT影像学、血常规和核酸检测结果,为COVID-19防治提供参考资料。 方法 收集2020年1月24日—3月5日三亚市人民医院收治的214例新型冠状病毒肺炎疑似病例临床和实验室及新型冠状病毒（SARS-CoV-2）核酸检测结果资料,分析疑似病例在不同性别和年龄的分布情况。 结果 214例新型冠状病毒肺炎疑似病例中,SARS-CoV-2核酸检测阳性24例,SARS-CoV-2核酸阳性率为11.2%。不同性别和不同年龄段确诊感染率差异无统计学意义（P>0.05）。白细胞计数、淋巴细胞计数和C反应蛋白的变化在新型冠状病毒肺炎确诊病例和排除的疑似病例中差异无统计学意义（P>0.05）。24例确诊病例中,有明确的流行病学史23例（占95.8%）,呼吸道症状以发热和咳嗽为主。CT影像学表现为肺内可见不同程度的磨玻璃样密度影或双侧浸润等。 结论 新型冠状病毒肺炎疑似病例的确诊,在综合考虑其流行病学史和相应临床表现的基础上,仍需依靠病原学核酸检测。     

55例新型冠状病毒肺炎患者临床特征

目的 探讨新型冠状病毒肺炎（COVID-19）患者的临床和流行病学特征,为疫情的防控提供参考。方法 以2020年1月23日—2月16日在某院确诊并收治的COVID-19患者55例为研究对象,收集患者近期是否到湖北出行,是否接触过来自湖北的人员,近期是否接触呼吸道疾病患者等流行病学资料,临床症状资料包括发热、乏力、干咳、肌肉疼痛、咳痰等,收集相关的实验室检测和影像学检查指标,分析COVID-19患者临床和流行病学特征。结果 55例患者中男性27例,女性28例,平均年龄（43.11±17.91）岁。临床分型：轻型3例,普通型48例,重型3例,危重型1例,以普通型为主（87.27%）。家庭聚集性病例29例（52.73%）,输入性病例19例（34.55%）,近期接触到过湖北的人员27例（49.09%）。临床症状为干咳34例（61.82%）,发热30例（54.55%）,咳痰19例（34.55%）,乏力18例（32.73%）,无症状者6例（10.91%）。首次住院检测白细胞总数正常或降低者52例（94.55%）,淋巴细胞计数减少12例（21.82%）。出现症状后5 d CT双肺毛玻璃样变46例（83.64%）。结论 COVID-19患者以普通型为主,主要为输入性和家庭聚集性病例,同时也存在着无症状感染者。对COVID-19防控要严防输入性病例和人员的聚集,加强体温的监测。加强对确诊患者密切接触者的COVID-19核酸检测,及时发现无症状病例并进行隔离和治疗。     

广州市59例新型冠状病毒肺炎病例的临床特征

目的 探讨并分析广州市部分新型冠状病毒肺炎（COVID-19）患者的临床特征、治疗方法及转归。方法 对广州市第八人民医院隔离三区病房收治并治愈出院的59例COVID-19患者进行流行病学史、一般情况、临床症状、血液检验、呼吸道标本核酸及CT影像学的临床特征、治疗方法及转归进行分析。结果 (1) 38例患者（64.4%）为武汉疫区来源或有武汉旅行史人员,25起家庭聚集性感染;(2)轻型患者4例（6.8 %）,普通型41例（69.5%）,重型14例（23.7%）,31例（52.5%）患者合并基础疾病,发热（79.7%）、咳嗽（71.2%）、乏力（44.1%）、纳差（42.4%）为主要临床表现,8例（23.6%）呼吸困难;(3)患者外周血白细胞总数降低17例（28.8%）,淋巴细胞计数低下29例（47.5%）,38例CRP升高（64.4%）,25例SAA升高（42.4%）,重型与非重型差异有统计学意义;24例ALT、AST升高（40.7%）;4例血肌酐升高（6.8%）,5例心肌酶CK-MB升高（8.5%）。(4)咽拭子核酸多于病程第（15.4±7.9）天转阴,最快3 d,最慢35 d;(5) CT典型影像学表现：35例磨玻璃样改变（GGO）（59.3%）,28例混合GGO（47.5%）,13例实变影（22.0%）, 8例合并胸腔积液（13.6%）,25例遗留纤维条索影（42.4%）。(6)52例（88.1%）进行了抗病毒治疗,11例重型患者使用了小剂量糖皮质激素,16例低流量吸氧,14例经鼻高流量湿化氧疗,3例无创呼吸机辅助通气。结论 广州市COVID-19以输入型为主,家庭聚集起病多见。疾病类型以普通型为主。血常规以淋巴细胞计数下降更明显,SAA、CRP对重型有预测价值,肝功能损害多见,咽拭子核酸多于病程第（15.4±7.9）天转阴,痰标本的阳性率高于咽拭子,胸部CT影像学有一定特征性,氧疗等综合治疗有效。     

南宁市50例新型冠状病毒肺炎疑似病例临床分析

目的 收集疑似和确诊的新型冠状病毒肺炎（COVID-19）患者病历资料,分析患者相关病例特点,为疫情防控提供相关临床依据。 方法 本研究回顾性收集2020年1月24日—2月11日在南宁市第四人民医院就诊,符合新型冠状病毒肺炎疑似病例诊断标准的患者50例的临床资料,根据咽拭子进行SARS-CoV-2实时逆转录聚合酶链反应检测结果,确诊或除外SARS-CoV-2感染,分析其一般情况、流行病学、临床表现等方面特征。 结果 本研究疑似患者共50例,男22例,女28例,平均年龄（36±16）岁,各年龄段人群均有分布;大部分为输入性病例,86%患者为武汉相关人员。最终有13例确诊为SARS-CoV-2感染者,7例经2次及其以上咽拭子核酸检测方可确诊,1例合并甲型HIN1。37例为非SARS-CoV-2感染患者,其中26例细菌性肺炎,6例为单纯性甲型HIN1,5例乙型流感病毒感染;最常见的症状是发热（32/50）和咳嗽（24/50）,周身症状以乏力多见（12/50）,消化道症状少见。94%的患者白细胞计数正常/降低,30%的淋巴细胞计数减少,无心肝肾功能损害表现,86%患者胸部CT提示肺炎表现,以毛磨玻璃影（60%）和斑片状影（56%）为主,胸腔积液少见。 结论 流行病学史是筛查新型冠状病毒肺炎疑似病例的重要条件之一,诊断需注意警惕同流感病毒的鉴别及混合叠加感染;疑似病例的早期发现及隔离诊治对疫情防控有重要影响。     

上海2株严重急性呼吸综合征冠状病毒2的分离与鉴定

目的 从新型冠状病毒肺炎（COVID-19）患者鼻/咽拭子样本中分离、培养严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）。方法 将来自上海市COVID-19患者的3份鼻/咽拭子样本以TPCK胰酶处理,然后接种Vero E6细胞;待大部分细胞出现明显病变时,取细胞培养上清用qRT-PCR法检测病毒核酸,并用反转录PCR扩增病毒受体结合区（RBD）基因片段;将病毒扩增培养后感染接种于96孔板中的Vero E6细胞,观察细胞病变效应,并用免疫荧光法检测病毒蛋白。结果 2份COVID-19患者鼻/咽拭子样本接种的Vero E6细胞出现明显细胞病变效应,细胞培养上清中检测出新复制产生的SARS-CoV-2核酸,扩增出的RBD序列与早期分离出的SARS-CoV-2相应序列完全一致;病毒感染的Vero E6细胞病变迅速,并能与SARS-CoV-2核衣壳蛋白（N蛋白）单克隆抗体、刺突蛋白（S蛋白）单克隆抗体及COVID-19患者恢复期血清发生反应。结论 从2份COVID-19患者鼻/咽拭子样本中成功分离出SARS-CoV-2,为后续开展SARS-CoV-2感染与致病机制研究、防治药物与疫苗的研发奠定了基础。     

昆明地区COVID-19患者多种生物样本的病毒核酸检测结果

目的 通过国产2019-nCoV(新型冠状病毒)核酸测定试剂,测定确诊的COVID-19(新型冠状病毒肺炎)患者的多种生物样本内SARS-CoV-2核酸的携病毒情况,对机体不同系统中SARS-CoV-2的状态展开观察,并分析其临床价值,为诊断和治疗提供参考.方法 收集昆明市第三人民医院53例确诊的新型冠状病毒肺(COVID-19)患者的鼻拭子、咽拭子、痰液、粪便和尿液样本,实时荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)测定法,来平行测定病毒ORF1ab基因与N基因核酸,比较不同类型样本的阳性率和一致性.结果 患者的多种生物标本核酸Ct值的变化与病程都高度相关,发病15 d前后来分析核酸检测结果,发现在发病15 d后病毒核酸Ct值与15 d内相比病毒核酸载量,差异有统计学意义(P＜0.05).在发病第1～7天和8～14d,鼻拭子阳性检出率为88.67％(47/53)和79.24％(42/53),而咽拭子阳性检出率为73.58％(39/53)和53.85％(28/52).粪便样本核酸检测阳性率12.28％(7/57),尿液样本均未检测出病毒核酸.结论 在新冠肺炎患者发病的不同阶段,鼻拭子、咽拭子、痰液样本有较高的核酸检出率;在阳性检出率方面,鼻拭子相较咽拭子偏高;SARS-CoV-2有粪-口传播可能,同时病毒液可能会潜在感染消化道.     

新型冠状病毒肺炎临床实验室监测分析

目的 探讨5例新型冠状病毒肺炎(COVID-19)实验室检查的价值,为临床诊治和疫情防控提供参考。方法 选取2020年1月23日至2020年2月22日延安市第二人民医院收治的5例确诊COVID-19患者,采用RT-PCR检测不同部位采集的核酸标本及其它实验室数据进行统计学分析。结果 入院时5例患者外周血检查均有不同程度异常,其中3例淋巴细胞计数减少,3例CRP升高,3例有ESR加快;总共采集107份标本进行SARS-CoV-2核酸检测,其中咽拭子25份,阳性率44.0%(11/25),鼻拭子35份,阳性率25.7%(9/35),粪便(肛拭子)31份,阳性率77.4%(25/31),16份血标本核酸检测均阴性,5例患者符合出院标准时粪便核酸检测均阳性,截至2月27日对3例患者出院后追踪发现,出院2周或更长时间粪便SARS-CoV-2核酸仍阳性。结论 监测新冠肺炎外周血细胞计数变化有助于病情的及时判断,新冠肺炎的确诊鼻咽肛拭子组合送检是较好的策略,病毒有持续经粪便排泄现象,需对出院患者进行有效隔离和追踪随访,以避免粪-口及接触传播的风险和复发的可能。     

31例新型冠状病毒感染病例咽拭子与痰标本病毒核酸检测的比较

目的 比较新型冠状病毒病例咽拭子标本与痰标本的病毒核酸检测结果。方法 对31例新型冠状病毒确诊病例的咽拭子与痰标本分别进行病毒ORF1ab基因、N基因及人体上皮细胞（ribonucleoprotein,RNP）基因（试剂内标基因）RT-PCR核酸检测与比较。结果 31例病例的咽拭子和痰标本中,人体上皮细胞RNP基因均呈现明显典型的扩增信号曲线;病毒ORF1ab基因、N基因的检测结果：31例患者的咽拭子核酸结果中,28例患者均显示阴性,第9例和第16例患者的咽拭子为单基因阳性,第17例为双基因阳性;同时采集的痰标本结果显示,18例患者均为单基因阳性,13例患者为双基因阳性。痰标本的病毒ORF1ab基因和N基因核酸检测扩增曲线的Ct值小于咽拭子标本的Ct值。结论 在开展新型冠状病毒实验室核酸检测中,痰标本的病毒含量高于咽拭子标本,其检测效果优于咽拭子标本,更能准确体现患者病情。     

鼻拭子和痰标本在新型冠状病毒核酸检测的对比研究

目的 分析新型冠状病毒肺炎（coronavirus disease 2019,COVID-19）患者鼻拭子和痰标本病毒核酸检测结果,为临床采样方式的选择提供参考依据。方法 收集深圳市第三人民医院新型冠状病毒肺炎78例患者共170例次同一天鼻拭子与痰配对标本,进行实时荧光PCR核酸检测,分析比较鼻拭子和痰标本检测情况。结果 78例患者中男性33例,女性45例,年龄1~86岁,中青年（20~<60岁）患者居多（占59.0%）,其次为老年（≥60岁）患者（占33.0%）, 4例为儿童。170例次配对标本中,鼻拭子和痰标本核酸阳性的阳性率分别为34.7%（59/170）和46.5%（79/170）,差异有统计学意义（P<0.01）。鼻拭子和痰标本同时阳性共46例次,结果显示27例痰标本Ct值低于鼻拭子Ct值（占58.7%）, 17例痰标本Ct值高于鼻拭子Ct值（占37.0%）,2例痰标本Ct值等于鼻拭子Ct值（占4.3%）,提示痰标本的病毒载量比鼻拭子的病毒载量更高。结论 在新型冠状病毒肺炎患者病毒核酸检测中,痰标本的阳性率高于鼻拭子标本,且漏检率低,痰标本的病毒载量比鼻拭子的病毒载量更高,更有利于病毒核酸的检出,同时患者更易接受,建议有痰患者优先采集痰标本。     

10例新型冠状病毒肺炎的回顾性分析

目的了解新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎)患者的临床特点,为该病的早期防控、诊断及治疗提供依据。方法回顾性分析本院2020年1—3月确诊的10例新冠肺炎患者的临床资料。分析患者病历资料、实验室检查及辅助检查结果。结果10例患者均出现发热症状,其中咳嗽9例(90%),咳痰6例(60%),咽痛6例(60%),畏寒5例(50%),全身肌肉酸痛6例(60%)。10例患者中,血白细胞(WBC)<4.0×10;/L1例,(4~10)×10;/L 9例,淋巴细胞下降2例。C-反应蛋白(CRP)>10 mg/L 6例。10例患者核酸第1次阳性平均病程时间(4.0±3.1)d,1例患者分别在病程的第6、8、10天检测核酸阴性,而第11天即第4次核酸检测阳性确诊。胸部CT主要表现为多发小斑片影、磨玻璃样及间质改变,累及单肺者4例,累及双肺者6例,其中3例表现为典型的双肺多发磨玻璃样改变。结论新冠肺炎患者以发热、咳嗽为主要症状,且中低热为主。影像学表现对疾病诊断具有重要价值。在病程7 d内核酸检测阳性率最高,需特别关注临床特征高度符合、核酸检测反复阴性患者,以免造成漏诊、误诊。     

延安市新型冠状病毒肺炎流行病学特征分析

目的 分析延安市报告的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)病例的流行病学特征,为开展疫情防控提供参考。方法 收集2020年1月22日至6月19日延安市疾控中心检测确诊的COVID-19病例数据信息,采用描述性流行病学方法,分析COVID-19的流行情况和分布特征。结果 共检测送检样本1070例,核酸检测确诊呈阳性者8例,阳性检出率0.78%。病例感染来源以输入性为主,主要分布在宝塔区和延川县,发病中位年龄38.3岁,集中在18~45岁(占50%)。确诊病例的临床分型以普通型为主,从发病到确诊平均间隔3 d。发生一起家庭聚集性疫情,涉及5例病例。结论 延安市COVID-19病例感染来源以输入性为主,疫情风险等级处于低风险区,但是仍需要坚持“外防输入、内防反弹”的防控策略,全力做好常态化疫情防控工作,持续巩固防控成果。