基于rDNA ITS序列探讨我国冬虫夏草的遗传分化及分布格局

目的 探讨我国冬虫夏草的遗传分化及分布格局。方法 分析冬虫夏草rDNA ITS序列差异及构建分子系统树。结果 冬虫夏草ITS1-5.8S-ITS2序列在我国主要冬虫夏草产地21个居群间的差异较小,遗传距离仅为0～0.018。ITS1和ITS2序列中的GC的量与冬虫夏草居群的纬度呈极显著正相关,与居群的经度和海拔相关不显著。基于ITS序列的碱基变异将我国主要产地冬虫夏草分成4支,其地理位置与纬度有关,分别是环青海湖地区、青海中南部-甘肃-四川-西藏东北部区域、云南、西藏林芝米林地区。结论 基于rDNA ITS序列微小差异更能反映我国冬虫夏草资源在大尺度地理范围的分布格局,进一步证实了冬虫夏草的遗传分化主要发生于不同纬度间。     

人参种源遗传关系的ISSR分析

目的 阐明不同种源人参的遗传关系。方法 用ISSR分子标记研究来自人参主要分布区17个种源样本。结果 从100个ISSR引物中筛选出10个条带清晰、多态性高的引物,共扩增出95条带,其中80条带为多态性位点,多态性条带比率(PPB)为84.21%,通过聚类分析,可将17个人参种源聚为4类。结论 分子标记研究结果与人参的形态性状存在显著的相关性,较好地揭示了人参种源间的遗传关系,可为人参资源保育和良种选育提供科学依据。     

石蒜属植物遗传多样性的ISSR和RAPD标记比较研究

目的研究石蒜属4种植物的种间亲缘关系和同一种内不同采集地材料的遗传多样性,为其种质资源评价和合理开发利用提供分子佐证。方法用ISSR和RAPD标记分别对不同采集地的37份石蒜属植物(石蒜18份、中国石蒜10份、换锦花5份、忽地笑4份)的基因组DNA的遗传多样性进行检测。结果(1)16条ISSR和17条RAPD引物分别扩增出229和215条带,多态比率分别为85.59%和69.77%,显然,ISSR检测出的多态性条带的能力优于RAPD;(2)ISSR和RAPD标记检测同组供试材料种间或种内的Nei′s遗传相似系数范围分别为0.5459～0.9345,0.6419～1.0000,平均为0.6836,0.7428。两者相关系数r=0.8582,达极显著水平。(3)ISSR和RAPD标记的分子聚类结果相近,两种标记均能准确地把不同来源的材料先按种聚类,种间的分子分类结果与传统经典分类相符;种内不同采集地材料间存在一定的遗传差异,其遗传多样性较为丰富。(4)用POPGENE3.2分析的种间基因分化系数(Gst)与用AMOVA进行的遗传变异巢式方差分析所得结果基本一致。结论两种标记均可用于石蒜属植物种间亲缘关系与种内的遗传多样性研究,虽然ISSR标记在种间遗传多样性检测上分辨力较RAPD标记低,但ISSR标记能检测到更高的种内遗传差异性,更适合种下水平的遗传多样性研究。     

新疆特产7种乌头类药材的 ISSR 特征分析

目的：探讨新疆特产准噶尔乌头、多根乌头、白喉乌头、那拉提乌头、空茎乌头、林地乌头、拟黄花乌头共7个种共41个居群间的遗传多样性和变异情况,为药材鉴定提供 DNA 特征。方法利用植物基因组提取试剂盒提取 DNA,采用紫外分光光度法检测 DNA 的浓度和纯度,使用60种哥伦比亚引物分别对7个种共41个居群的乌头基因进行 ISSR 分析,应用 NTSYS-PC2．10和 POPGEN32对所得数据进行处理,计算不同种乌头的遗传相似系数和遗传距离,采用非加权平均法（UPGMA）进行聚类,构建亲缘关系系统图,用主坐标分析法绘制二维、三维散点图。结果从60个引物中筛选出13个条带清晰、多态性明显且重复性好的引物用于扩增,共扩增得到163个条带,其中多样性条带151个。根据 ISSR 聚类分析,41个居群的乌头可聚为7大类群,与种的分类相当符合;而且乌头类药材在多个引物下具有特征的 DNA 标记。结论乌头种质资源间具有很高的多态性,遗传变异较大;ISSR 分子标记法可用于7种药材的鉴别,提供了分子水平依据,也为构建其 DNA 指纹图谱提供可能。     

人参农家类型遗传多样性的ISSR分析

目的探讨人参农家类型的遗传多样性和亲缘关系,为人参的栽培和选育种提供遗传学依据。方法采用ISSR分子标记分析5种人参农家类型7个居群120个样本的遗传多样性。结果人参农家类型有较丰富的遗传多样性,平均多态位点百分率为48.85%;不同农家类型的遗传多样性水平有差异,和其他农家类型相比,长脖和竹节芦的遗传变异较小,且两者之间的相似性系数高达97%;不同产地的同一人参农家类型间也存在很大的遗传差异。结论研究表明人参农家类型的遗传差异主要存在于各类型内部,而且可能更多地存在于同一类型的不同居群内部。为促进人参新品种的选育,有必要在现有的栽培群体中补充不同产地的同一类型的种质资源。     

百合种质资源间亲缘关系及RAPD指纹图谱分析

目的探讨百合种质资源间亲缘关系的遗传多样性。方法利用随机扩增多态性DNA标记(RAPD)分子标记技术进行遗传多样性研究。结果35条随机引物用于PCR扩增,共得到769个扩增位点,628个位点具有多态性,占81.7%,其中江苏省引种栽培的2个农家品系(尖头系和平头系)种源之间的遗传变异最小,湖南衡山野外的大百合和甘肃引种的细叶百合种源之间遗传变异最大;根据RAPD标记划分l6个百合种源在阈值为0.940 7时分为2个RAPD群,即分别属于百合科的百合属和大百合属;阈值为0.579 0时,百合属分为3个种,即分别为百合、卷丹和细叶百合。结论分子标记可用于百合种质资源的分类、真伪鉴定、选育良种。     

采用ISSR分子标记进行草珊瑚8个种源的遗传多样性分析

目的研究草珊瑚的遗传多样性及不同种源之间的遗传关系,为保护种质资源奠定基础。方法采用ISSR分子标记对8个种源共51个草珊瑚样品进行了DNA分子水平的分析评价,用Popgen32软件计算遗传多样性和遗传距离,通过UPCMA法进行聚类分析。结果筛选出10条多态性ISSR引物用于草珊瑚不同样品的ISSR-PCR,检测得到111个位点,其中106个为多态性位点,约占95.50%。草珊瑚不同种源间遗传距离在0.0347～0.1850。8个种源总遗传多样性主要来自种源内遗传变异,种源间分化指数Gst=0.3403。结论8个草珊瑚种源大体可以分成2大类群。且根据遗传距离与产地海拔高度的关系,可以将其划分为较高海拔类群(800～900m)、较低海拔类群(250～300m)、中等海拔类群(600m)。     

应用简单序列重复区间扩增多态性分子标记鉴定我国12个城市与地区常见嗜尸蝇类的研究

目的 探讨应用ISSR分子标记鉴定我国不同地区常见嗜尸蝇类,分析其亲源关系及基因差异.方法 采集广州、深圳、阳江、南京、长春、宜昌、北京、武汉等12个城市与地区常见嗜尸蝇类:家蝇(Musca domestica),丝光绿蝇(Luciliase ricata),大头金蝇(Chrysomyia megocephala),黑尾麻蝇(Helicophagella melanura),棕尾别麻蝇(Boetthcherisca peregrina).设计22个ISSR引物,对采集的蝇类基因组DNA进行PCR扩增,从中筛选出8个引物用于我国不同地区法医蝇类的鉴定.进行ISSR分析,用PAUP聚类分析软件绘制聚类图.结果 8种ISSR引物鉴定我国部分城市与地区5种蝇类,总共扩增样品次数为121,可放大679个清晰和稳定的带,其中516个是多态性.结果 表明我国不同城市与地区的家蝇、大头金蝇、丝光绿蝇、棕尾麻蝇、黑尾麻蝇分别呈现不同带谱,不同地区的家蝇呈现种内与地域多态性的遗传带谱.而5种腐尸性蝇种间呈现完全不同的带谱,发现种特异性的片段.聚类分析结果 显示:10个不同地区的家蝇聚类为一棵分枝树,细分为4个不同层次的类群,不同地区的大头金蝇、丝光绿蝇的绝大多数种类聚类在一起,亦存在种内基因型与地理株的基因组DNA差异.结论 应用ISSR技术,首次对我国12个城市和地区的常见嗜尸蝇类做出鉴定,揭示我国10个城市与地区的家蝇种类存在种内基因型和遗传的差异;不同地区的大头金蝇、丝光绿蝇亦存在种内基因型与地理株基因组DNA的差异.     

山东地区丹参种质多样性分析

从山东省3个丹参主产区搜集25个种质,对其植株形态特征与遗传变异进行了研究,分析发现山东产丹参种质资源丰富,其遗传变异与地理环境密切相关,地理位置相近的丹参种质居群遗传相似度高。根据不同种质植株根长、根直径变化与其他形态特征之间的关系,初步确定了优良种质应具备的形态特征指标。     

白花蛇舌草的简单重复序列区间(ISSR)遗传多样性分析

采用简单重复序列区间(ISSR)分子标记对不同产地白花蛇舌草的遗传多样性进行分析。分别在广西壮族自治区、广东省、湖南省、浙江省、福建省、江西省和安徽省共采集23份白花蛇舌草样品,选用150条ISSR引物进行PCR扩增,运用POPGENE1.32、NTSYS2.10软件进行遗传多样性分析。筛选出11条引物,扩增出115条多态性条带,多态性比率为85.22%,等位基因数(Na)为1.852 2,有效等位基因(Ne)为1.543 4,Neis基因多样性指数(H)为0.316 5,Shannon′s信息指数(I)为0.470 0。聚类分析结果表明白花蛇舌草可分成3类,实验结果表明ISSR分子标记可以为白花蛇舌草的系统分类和鉴定提供分子水平的科学依据。     

Interspecies Phylogenetic Analysis of Clonorchis sinensis in High-incidence Areas of Hunan Province,China

Objective This study aims to investigate the infection of Clonorchis sinensis (C. sinensis) in high-incidence areas of Hunan Province, China. The phylogenetic analysis of the C. sinensis species in the highly infected areas was carried out.Method Infection of the definitive human host and intermediate fish host by C. sinensis was investigated, and the mitochondrial genes cox1 and Nad1 were used as genetic markers for phylogenetic analysis. Results In 2016–2020, the average population infection rate of Hunan was 1.38％, while in Tongdao County the rate was up to 26.90％, and the highest fish infection rate was detected in Qiyang County (99.44％ in the dorsal fin of crucian carp). High genetic sequence similarity was observed in the samples from Qiyang and Lengshuitan which exhibited high homology with those from Guangdong and Gansu, whereas the parasitic species from Tongdao was highly homologous with those located in high-latitude areas. Moreover, no significant difference was found in the gene sequence of the parasitic species in definitive hosts dogs and cats. Conclusion The systematically study of C. sinensis infection in the high-incidence areas will contribute greatly to the prevention and effectively controlling the spread of Clonorchis sinensis in Hunan Province The endemic of C. sinensis infection in Hunan Province is the result of co-action of local and foreign parasite species.     

ISSR标记不同产地的大戟科狼毒种质资源多样性分析简

目的：利用ISSR分子标记技术对不同产地的大戟科狼毒进行了遗传多样性分析。方法：从100条引物中挑选出12条合适的引物对不同产地的大戟科狼毒进行遗传多样性分析。结果：12条引物一共扩增出353条带,用SPSS16.0软件分析,建立了Jaccard相关系数矩阵,构建了遗传树状图,从该图中可知各产地大戟科狼毒的相似系数在0.258~0.845;大戟科狼毒遗传变异与地理分布呈现较明显的相关性。结论：ISSR标记适合于大戟科狼毒基因组DNA多样性分析;ISSR分子标记技术对于大戟科狼毒种质资源划分上有十分重要的影响。     

大盘山自然保护区白术种质资源遗传特征研究

目的 研究大盘山自然保护区内不同品系白术之间的形态学特征、遗传多样性基础,为保护和选育优质种质资源奠定基础。方法 对11个品系的白术样品进行了形态学、生理学比较分析,并利用ISSR分子标记技术分析其遗传多样性,通过UPCMA法进行聚类分析。结果 11份白术样品在叶片形状、叶色、根茎形态、产量、抗病性方面存在很大的差异,且这些差异并没有一定的相关性;各品系白术的光合速率也存在显著的差异,且产量和光合速率间高度相关。筛选出的15条ISSR引物共检测得到129个位点,其中107个为多态性位点,占82.95%,聚类分析表明白术各品系之间都发生了一定程度的分化现象,个别品系之间遗传分化现象严重。结论 大盘山白术资源丰富,各品系间具有一定遗传差异基础,为选育优质白术资源提供基础。     

不同产地和不同环境生长的金线莲的ISSR遗传特性分析

研究不同产地及生长方式的金线莲样本间遗传多样性和亲缘关系。 方法 以20份福建金线莲新鲜叶片为实验材料,采用ISSR-PCR分子标记技术,筛选出15条多态性好、扩增条带清晰的ISSR引物。经琼脂糖凝胶电泳成像后,统计其扩增条带数,运用NTSYS-Pc 2.1和POPGENE 32软件进行UPGMA聚类分析。 结果 共扩增出130条清晰可见的条带,多态性比率达100%,遗传相似系数分布在0.647 6～0.971 4,遗传距离分布在0.029 0～0.434 5,其中编号为3和4的样本具有较近的亲缘关系。聚类分析结果显示,当相似系数取0.78时,20份样本被分为3类,可以区分不同的产地和种类。 结论 运用ISSR标记技术,可以从分子水平上揭示福建省内金线莲的遗传多样性。     

白芷种质资源遗传多样性的ISSR研究

目的 应用ISSR分子标记技术分析中药白芷的遗传多样性。方法 对4大类商品白芷及白芷近缘野生种兴安白芷共20个居群的白芷种质进行ISSR分析,利用NTSYS2.1e软件分析遗传相似系数,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系系统图。结果 9条引物共得到97条扩增条带,其中多态性条带37条,占38%;20个居群的样品聚为两大类。结论 不同产地栽培白芷的遗传多样性水平较低,种质间的亲缘关系较近;而兴安白芷与4大类商品白芷存在遗传差异。     

陕西产秦艽质量变异与遗传多样性研究

目的 研究陕西省不同产地秦艽的质量差异,对其遗传多样性进行检测,探讨药材质量和其遗传基础的关系。方法 采用HPLC法测定不同产区秦艽药材中的指标成分,进行HPLC指纹图谱分析,计算并比较相似度。依据指纹图谱中的共有峰特征,对不同药材样品进行聚类分析。对药材中提取的总DNA进行RAPD分析,计算遗传距离并聚类。结果 陕西省不同产区秦艽药材的质量具有一定的差异,不同产区秦艽药材也表现出一定的遗传多样性。陕西省不同产区的秦艽药材质量变异与遗传多样性之间不具有明显的相关性,而表现出与产地的相关性。结论 产地对陕西秦艽药材质量的影响更为重要,提示道地秦艽质量的形成可能属于生境主导型。     

当归药材道地性的RAPD分析

目的 从DNA分子水平上探讨当归药材道地性的生物学基础。方法 对来自不同产地的18个当归样品,提取其基因组DNA,并进行PAPD分析。对筛选出的10个引物的RAPD结果进行聚类分析,得出18个当归样品的聚合树状图。结果 显示地理分布距离越小,当归的遗传差异越小;反之,越大。但生态环境特别是小生境对当归遗传差异的作用亦不可忽视。结论 为我们从分子生物学角度研究当归药材道地性提供了新的启示。     

湖南不同地区居民锑的膳食暴露水平及地理分布趋势分析

目的 掌握湖南不同地区居民总锑的膳食暴露水平及地理分布趋势。方法 收集2014—2016年湖南省14地州市食品样品1 586份,样品取可食部分切碎、粉碎（匀浆）、混匀后称取试样0.5~1 g（精确至0.001 g）于微波消解罐内,加4 mL浓硝酸和2 mL 30%过氧化氢,放置30 min后,密闭旋紧内罐置于微波炉内,调节升温程序进行消解,其消解液采用AFS-230E型双道原子荧光光度计进行荧光强度测定,通过标准曲线法计算样品中总锑含量。将食品中锑含量×居民食物每日摄入量/标准人体重,计算得出各地区居民每人每日单位体重锑的平均膳食暴露量（居民食物摄入量数据源自《湖南省常住居民营养与健康状况现状分析》）。再取每个地区中心位置的经度和纬度值作为坐标值(x,y),使用Suffer 8.0软件把拟合的最优趋势方程得出的各地区居民锑的膳食暴露趋势数据和坐标数据,绘制趋势分析等值线图,分析其地理分布趋势特征。结果 湖南各区域食品中总锑含量中位数由高到低分别为湘中（0.021 0 mg/kg）、湘北（0.009 2 mg/kg）、湘东（0.009 0 mg/kg）、湘南（0.007 8 mg/kg）和湘西（0.007 7 mg/kg）。湘东、湘南、湘中、湘西和湘北地区的居民锑膳食平均暴露量分别为1.19、0.90、0.75、0.55、0.40 μg/(kg·BW)。结论 湖南东部地区居民膳食锑的暴露量明显偏高,并且在湘东、湘中地区均有高峰值出现,其他区域都处于一个相对较低范围。