基于网络药理学及分子对接探讨乌梅丸治疗腹泻型肠易激综合征的作用机制

基于网络药理学及分子对接探讨乌梅丸改善腹泻型肠易激综合征(IBS-D)的作用机制。方法 通过中医药系统药理学平台 (TCMSP 数据库) 检索和预测乌梅丸中各药物活性成分及对应靶点,在 GeneCard、OMIM 等数据库筛选 IBS-D 靶点,利用相关软件分别构建Venn图、“中药-活性成分-靶点”作用网络及 PPI 网络,并进行 GO、KEGG分析和分子对接及相关结果的可视化。结果 乌梅丸治疗 IBS-D 的活性成分129个,治疗靶点191个。 PPI 网络分析得到30个核心靶点,其中包括 HSP90AA1、 JUN、RELA、MAPK1、AKT1、ESR1、IL6、FOS、MAPK8、NCOA1 等。GO分析显示生物过程有2177条,分子功能有169条,细胞成分有77条。 KEGG 分析提示 IL-17 信号通路、TNF 信号通路、Toll-like 受体信号通路和 NF-κB 信号通路在乌梅丸治 IBS-D 过程中起着关键作用。分子对接显示,核心靶点JUN、MAPK1、FOS 与部分活性成分结合较为稳定。结论 乌梅丸可能通过活性成分槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚与HSP90AA1、JUN、RELA、MAPK1、AKT1、ESR1、IL6等蛋白结合,进而调节 IL-17、TNF、Toll-like 受体、NF-κB 等信号通路,从而减少炎症反应、调节肠道微生物、提高免疫力,治疗IBS-D     

基于网络药理学探讨四妙丸治疗痛风及高尿酸血症作用机制

目的采用网络药理学的方法,对四妙丸治疗痛风及高尿酸血症的作用机制进行研究探讨。方法通过在中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)对四妙丸进行活性成分筛选,运用Cytoscape 3.7.1构建化合物-靶点网络;检索治疗靶点数据库(Therapeutic Target Database,TTD)和DisGenet数据库获取疾病靶标;通过韦恩图,得到疾病与药物的共同靶点;对四妙丸治疗痛风及高尿酸血症的关键靶点进行基因本体(Gene Ontology,GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析;构建四妙丸化合物-共同靶点-信号通路网络。结果研究显示共挖掘到四妙丸中64种成分及163个潜在靶点,痛风及高尿酸血症165个相关靶点,得到四妙丸-痛风及高尿酸血症共同靶点9个,共同作用靶点主要富集于533个生物过程和20条信号通路上。结论四妙丸可能是通过调节前列腺素内过氧化物合酶2(Prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)、前列腺素内过氧化物合酶1(Prostaglandin-endoperoxide synthase 1,PTGS1)、肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor,TNF-α)、白介素1β(interlukin-1β,IL-1β)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(peroxisome proliferative activated receptor gamma,PPARG)等靶点,调控破骨细胞分化、c型凝集素受体信号通路、核转录因子κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)信号通路、白介素17(interlukin-17,IL-17)信号通路等通路,从而发挥抗炎、细胞凋亡、细胞周期调控、抗氧化应激来治疗痛风及高尿酸血症。     

应用网络药理学对鸡血藤治疗动脉粥样硬化的机制探讨

目的:预测鸡血藤在治疗动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)的主要活性成分的作用靶点,来探究其多成分-多靶点-多通路的作用机制。方法:借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索鸡血藤的化学成分及作用靶点。在借助OMIM、Drugbank、TDD等数据库检索AS相关基因,并根据UniProt数据库分析靶点所对应的基因。应用Cytoscape 3.6.1构建化合物靶点关系网络,应用STRING数据库构建蛋白质相互作用关系网络,最后在DAVID数据库进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:化合物靶点关系网络包括23个化合物和对应的110个靶点,其中涉及关键靶点包括BCL2,BAX,CASP9,JUN,CASP3,CASP8,PRKCA,PON1,NOS2,ESR1,AR等。GO功能富集分析得到GO条目535个,其中涵盖生物过程(BP)条目415个,涵盖分子功能(CC)43个,涵盖细胞组成(MF)77个。在KEGG通路富集筛选得到117条信号通路,其中已证实与AS相关的28条信号通路,包括HIF-1信号通路、TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、FoxO信号通路等通路。结论:鸡血藤中活性成分主要通过PRKCA、IL6、AKT1等靶点调节炎症相关通路来治疗AS。     

基于网络药理学和动物实验探讨白藜芦醇抗脊髓损伤作用机制

目的：使用网络药理学方法和动物实验探讨白藜芦醇抗脊髓损伤的作用机制。方法：使用TCMSP搜集及Swiss平台预测，获得白藜芦醇作用靶点。使用Gene card、OMIM、TTD、Drug bank数据库搜集脊髓损伤相关靶点。韦恩图对二者取交集，即为白藜芦醇抗脊髓损伤的作用靶点。利用STRING网站和cytoscape软件构建交集靶点蛋白的互作网络图(PPI)。根据网络中拓扑参数的大小筛选关键作用靶点。使用DAVID网站进行GO和KEGG分析。通过免疫组化、RT-qPCR实验验证白藜芦醇对脊髓损伤模型大鼠中部分关键靶点的调控作用。结果：共获得白藜芦醇抗脊髓损伤作用靶点48个，其中关键作用靶点8个即AKT1、TNF、VEGFA、 IL-1B、IL-6、JUN、CASP3、HIF1A。KEGG分析富集显著的通路主要有：TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、IL-17信号通路等。动物实验发现，白藜芦醇对脊髓损伤后大鼠运动功能具有明显改善作用，并可明显干预AKT1、TNF、 VEGFA mRNA表达。结论：白藜芦醇可能通过作用于AKT1、TNF、 VEGFA等靶点，调控TNF信号通路、PI3...     

基于网络药理学及分子生物学验证探讨畲药黄荆条黄酮类成分抗类风湿关节炎的作用机制

目的 运用网络药理学及分子生物学验证探讨畲药黄荆条黄酮类成分治疗类风湿关节炎（RA）的作用机制。方法 在中国知网、万方、维普和TCMSP数据库筛选黄荆条的黄酮类成分,通过Swiss Target Prediction平台获取活性成分的靶点;通过Gene Cards和CTD数据库获取RA的治疗靶点;利用Cytoscape软件构建黄荆条抗RA的活性成分-作用靶点网络和蛋白质相互作用（PPI）网络;应用R软件对黄荆条抗RA的作用靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集分析;应用Autodock vina软件对关键活性成分和靶点进行分子对接验证。采用Western blot验证黄荆条醇提物（HJT-E）及关键成分木犀草素（LUT）对LPS刺激的RAW264.7细胞MMP9、COX-2和AKT1蛋白的调控作用。结果 共得到活性成分靶点309个,RA治疗靶点455个,黄荆条黄酮类成分抗RA的50个靶点;黄荆条治疗RA的关键黄酮类成分主要有LUT、槲皮素、芹菜素、金合欢素等,关键靶蛋白主要有CASP3、MMP9、PTGS2、AKT1等;GO富集分析及KEGG富集分析表明,黄荆条黄酮类成分可调控多种生物学过程及通路,包括AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路等;细胞实验验证结果显示,HJT-E及LUT可通过抑制MMP9、COX-2和AKT1蛋白的表达发挥抗炎作用,证实了本研究中网络药理学分析结果的可靠性。结论 畲药黄荆条黄酮类成分通过多靶点和多途径调控成纤维样滑膜细胞增殖、促进其凋亡及缓解炎症反应以发挥抗RA的作用。     

基于锦灯笼对白血病作用机制的网络药理学和分子对接技术的生物信息学分析

目的 基于网络药理学探讨锦灯笼（PCF）在白血病发生发展过程的作用,阐明其生物活性成分主要作用靶点和信号通路相关机制。 方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库以“锦灯笼”为关键词检索其生物活性成分及对应的潜在靶点,并采用蛋白质数据库（PDB）和小分子药物靶点预测在线平台（Swiss Target Prediction）网站对其潜在靶点进行评估预测。采用GeneCards、OMIM和DrugBank数据库以“Leukemia”为关键词对相关靶点进行检索。利用Draw Veen Diagram在线软件将PCF生物活性成分靶点与白血病靶点交集,得到的交集靶点即为PCF作用于白血病的靶点;利用基因/蛋白相互作用检索搜查工具（STRING）数据库获取交集靶点蛋白的蛋白-蛋白互作（PPI）网络信息并进行可视化处理;采用注释可视化和集成发现数据库（DAVID）对交集基因进行基因本体（GO）生物功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析,并利用Cytoscape 3.7.2软件对PPI网络进行拓扑分析筛选核心靶点和核心活性成分,采用 AutoDock 和PyMol软件进行分子对接验证。 结果 对TCMSP数据库检索结果进行筛选后得到6个PCF活性成分,收集PCF与白血病的共同靶点29个。GO富集分析主要涉及造血或淋巴器官的发育、蛋白代谢调控和细胞凋亡等生物进程;KEGG信号通路富集分析主要包括癌症通路、肿瘤坏死因子 （TNF）和T细胞受体 （TCR） 等信号通路。拓扑网络分析得到蛋白激酶B1 （AKT1）、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶3 （Caspase-3） 等10个核心靶点,结合KEGG信号通路筛选出核心活性成分谷甾醇和禾本甾醇。分子对接,PCF活性成分谷甾醇与原癌基因 JUN及禾本甾醇与AKT1和Caspase-3对接能均<－6.0 kcal·mol^－1,表明对接较好。 结论 PCF的主要活性成分谷甾醇和禾本甾醇可能通过调控JUN、AKT1和Caspase-3等基因参与癌症通路和TCR等信号通路,进而影响白血病的发生发展。     

通过综合网络信息方法深入了解EPA治疗ANCA相关血管炎的分子机制

通过网络药理学和分子对接的研究方法预测二十碳五烯酸（EPA）辅助治疗ANCA相关性血管炎(AAV)的分子作用机制。方法 通过 PubChem获取EPA的三维结构和相应的结构式,在STITCH、Swiss Target Prediction、Pharmmapper和CTD 数据库获取药效团预测靶点,并将获取药效团预测靶点并与GeneCards、OMIM和Disgenet数据库获取的AAV疾病靶点做交集,得到关键靶点,运用STRING 数据库和Cytoscape 软件构建蛋白互作网络;对有效靶点进行GO 分析及KEGG 相关通路的富集分析;通过Autodock对成分靶点进行分子对接验证。结果 获得116个EPA治疗AAV 潜在作用靶点,关键靶点包括TNF,IL6,ALB,TP53,IL1β,MAPK3,CASP3,PTGS2,PPARG,CCL2 等。GO富集分析有1503个GO术语（P＜0.05）,KEGG中有1503个信号通路（P＜0.05）主要富集在癌症、脂质和动脉硬化、TNF信号传导途径、神经变性的途径——多种疾病和IL-17信号传导途径等多个信号通路。分子对接结果发现EPA与免疫炎症、细胞凋亡及脂质代谢相关目标靶点能很好结合。结论 本研究初步揭示了EPA治疗AAV 的潜在靶点、涉及的生物过程及信号通路,为进一步研究奠定了基础     

基于网络药理学与分子对接探讨紫草治疗银屑病的作用机制

目的运用网络药理学与分子对接探索紫草治疗银屑病的作用机制。方法通过TCMSP、PubChem及Swiss Targe Prediction数据库和Gene Cards、OMIM数据库筛选紫草活性成分、疾病靶点,运用Cytoscape软件构建药物与疾病间相互作用网络,筛选紫草治疗银屑病的活性成分及靶点;基于R软件进行GO功能注释和KEGG通路富集分析;将活性成分与核心靶点进行分子对接验证。结果预测得到17个紫草治疗银屑病的活性成分和55个差异基因,并推断其作用机制可能与乙型肝炎、糖尿病并发症、胰腺癌、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、Rap1信号通路、IL-17信号通路等有关。其中TNF、EGFR、MMP3、PTGS2等基因可能为关键靶点;分子对接结果显示:去氧紫草素与PTGS2蛋白的亲和力较好。结论紫草治疗银屑病具有多成分-多靶点-多通路的作用特点,为阐述紫草治疗银屑病的作用机制和开展进一步的研究提供依据。     

基于网络药理学和分子对接分析豆根管食通口服液治疗食管癌的分子机制

目的:通过网络药理学和分子对接技术分析豆根管食通口服液治疗食管癌的分子机制。方法:检索多个数据库并筛选豆根管食通口服液有效活性成分和其作用于食管癌(esophageal carcinoma,EC)的相关靶点,并采用Cytoscape软件分别构建"药物-活性成分-靶点""靶点-通路"网络图;采用CytoHubba插件中多种算法筛选豆根管食通口服液治疗EC关键靶点,并采用R软件对关键靶点进行基因本体(gene discovery,GO)生物功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopodia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析;采用分子对接技术对有效活性化合物和靶蛋白的结合能力进行验证。结果:从豆根管食通口服液方中药中共筛选出59种活性成分,治疗EC靶点106个,其中关键靶点21个。KEGG信号通路富集分析发现,关键靶点主要富集在白细胞介素-17(interleukin 17,IL-17)信号通路、缺氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)信号通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路等107个通路;GO生物功能富集分析发现,关键靶点主要涉及DNA结合转录因子活性的调节、细胞对氧化应激的反应等1341个生物过程,丝裂原活化蛋白激酶(mitogen activated protein kinases,MAPK)活性、生长因子活性等59个分子功能,细胞定位在囊泡腔、膜区等26个细胞组分。分子对接提示药物活性成分β-谷甾醇、山柰酚、槲皮素与表皮生长因子受体和MAPK3靶点对接良好。结论:豆根管食通口服液治疗EC具有多成分、多途径、多靶点的优势。     

基于网络药理学及分子对接技术分析艾迪注射液治疗鼻咽癌的作用机制

目的:利用网络药理学和分子对接技术对艾迪注射液治疗鼻咽癌的作用机制进行初步探讨。方法：从TCMSP 及TCM Database@Taiwan 数据库中收集和分析艾迪注射液的有效化学成分，在TCMSP 和Swiss Target Prediction 网站预测作用靶点，在GeneCards、DisGeNET、OMIM 和TTD 数据库中检索鼻咽癌的相关靶点。绘制艾迪注射液治疗鼻咽癌的活性成分—靶点网络图，运用拓扑学方法筛选其核心化学成分。将二者交集靶点在STRING 数据库和Metascape 数据库分别进行蛋白质互作分析、GO 富集及KEGG 富集分析。最后运用Auto Dock软件对核心活性成分和关键靶点进行分子对接验证。结果：经筛选整理得到艾迪注射液有63 种活性成分和对应的852 个靶点，鼻咽癌有1989 个潜在靶点，其中二者共同靶点有308 个。应用GO 数据库功能富集分析得到310 个GO条目,应用KEGG 数据库富集筛选得到198 条有关通路，其中包含PI3K/AKT 信号通路、HIF-1α信号通路、TNF 信号通路等已报道与鼻咽癌相关的通路。分子对接结果显示，艾迪注射液的核心化学成分（quercetin、kaempferol、isorhamnetin、7-O-methylisomucronulatol 及Jaranol）对SRC、STAT3、MAPK1、PIK3R1 及RELA 蛋白具有良好的亲和力。结论：对艾迪注射液治疗鼻咽癌的作用机制进行了初步探索，并对其药效物质基础进行了预测，为进一步明确艾迪注射液治疗鼻咽癌的有效成分和作用机制提供依据。     

基于网络药理学和分子对接探讨凉血消斑汤治疗寻常型银屑病的作用机制

目的: 使用网络药理学和分子对接技术研究凉血消斑汤治疗寻常型银屑病的关键成分与靶标,并探讨其可能的作用机制。方法: 从中药系统药理学数据库（traditional Chinese medicine systems pharmacology, TCMSP）、中医药分子机制生物信息学数据库（bioinformatics analysis tool for molecular mechanism of traditional Chinese medicine, BATMAN-TCM）挖掘凉血消斑汤的有效成分并进行靶点预测。在GeneCards数据库中获取寻常型银屑病相关基因。通过Cytoscape 3.7.2软件构建凉血消斑汤成分靶点疾病网络,通过STRING和Metascape分析药物与疾病映射靶标蛋白质的相互作用,并进行富集分析,最后借助AutoDock Vina等软件将核心靶标蛋白与有效成分进行对接验证。结果： 凉血消斑汤治疗寻常型银屑病的关键靶点包括蛋白激酶1（AKT1）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、白介素6（IL-6）、JUN蛋白（JUN）及前列腺素内过氧化物合酶2（PTGS2）等,关键的KEGG通路包括IL-17信号通路、PI3K-Akt信号通路及AGE-RAGE信号通路等,其中薯蓣皂苷元、山柰酚、木犀草素、黄芩素与PTGS2、AKT1等靶点的结合能较小。结论： 凉血消斑汤通过直接或间接调控IL-17及PI3K/AKT等信号通路,改善银屑病炎性浸润、角质形成细胞异常分化及异常新生血管生成等病理因素,从而发挥对银屑病的治疗作用。     

基于网络药理学和实验验证探讨苦参治疗乙型病毒性肝炎的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接技术,探讨苦参治疗乙型病毒性肝炎的作用机制,为临床防治提供指导.方法 通过GeneCards、OMIM和TTD数据库获取乙型病毒性肝炎靶点,使用TCMSP、BATMAN-TCM、ETCM、HERB数据库及查阅相关文献获取苦参活性成分及靶点,并利用VENNY作图取两者的交集.用Cytosca...     

基于网络药理学的炙甘草汤治疗原发性低血压机制研究

目的运用网络药理学的研究方法,分析炙甘草汤治疗原发性低血压的作用靶点和潜在机制。方法使用TCMSP,TCMID,BAT-MAN等数据库获取炙甘草汤的化学成分和对应的靶点,在OMIM,Genecards疾病数据库以hypotension为关键词检索低血压的疾病靶点,在string网站对炙甘草汤和低血压的靶点分别进行蛋白相互作用网络构建,取交集后得到炙甘草汤治疗低血压的网络,筛选出发挥作用的关键成分和关键靶点,对关键靶点进行GO和KEGG分析得到炙甘草汤治疗低血压的潜在作用机制。结果预测得到炙甘草汤治疗低血压的有效成分180个,靶点909个。关键成分为山奈酚,木犀草素,槲皮素等11个,关键靶点有INS,AKT1,MAPK3,IL-6,FOS,CASP3,TNF,MAPK8等20个。GO和KEGG分析结果显示,炙甘草汤治疗原发性低血压与HIF-1信号通路,TNF信号通路,IL-17信号通路,Toll样受体信号通路,Fox O信号通路,流体剪切应力与动脉粥样硬化,内分泌抵抗等通路相关。结论调节炎症反应、干预血管内皮细胞、平滑肌细胞,调节能量代谢可能是炙甘草汤治疗低血压的关键机制,为进一步揭示和阐明炙甘草汤治疗低血压的机制提出方向。     

参附注射液治疗心肌缺血再灌注损伤网络药理学分析

目的 基于网络药理学研究预测参附注射液治疗心肌缺血再灌注损伤的主要活性成分、作用靶标和相关信号通路,并应用体外实验验证,揭示参附注射液治疗心肌缺血再灌注损伤潜在作用机制.方法 应用中药系统药理学数据库与分析平台收集参附注射液的有效活性成分和靶点信息;在GeneCards疾病数据和DisGeNET疾病数据库中收集缺血再灌...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨葛花-枳椇子治疗酒精性肝损伤的潜在作用机制

目的: 利用网络药理学和分子对接技术对葛花-枳椇子治疗酒精性肝损伤（ALI）的潜在作用机制进行研究。方法: 先利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和Swiss数据库搜集与葛花、枳椇子药材相关的化学成分及作用靶点,并以口服利用度（OB）≥30%和类药性（DL）≥0.18对化合物进行筛选;同时,使用GeneCard、DrugBank数据库获取与ALI相关的靶点,借助韦恩图映射葛花-枳椇子治疗ALI的潜在作用靶点,再采用String数据库和Cytoscape软件构建蛋白-蛋白相互作用网络及“药材-潜在活性成分-作用靶点”相互作用网络;接着在DAVID和Reactome数据库中对潜在作用靶点进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;最后,使用AutoDock Vina软件将潜在活性成分与核心靶点进行分子对接验证。结果: 在葛花-枳椇子中,共筛选出21个与疾病相关的潜在活性成分和431个潜在作用靶点,涉及蛋白结合、ATP结合等273种生物功能及磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B（PI3K-Akt）信号通路、TNF信号通路等90条KEGG代谢通路和信号转导、免疫系统等362条Reactome通路。分子对接结果显示,21个潜在活性成分与核心靶点蛋白激酶B（Akt）1、肿瘤蛋白p53（TP53）、IL-6均有较好的亲和力。结论: 本研究结果揭示了葛花-枳椇子治疗ALI的多成分、多靶点、多途径的作用特点,并预测了可能的药效物质、关键靶点和作用通路,为其新药开发和作用机制研究提供了理论基础。     

网络药理学联合分子对接技术分析高良姜治疗抑郁症的可能机制

目的　借助网络药理学联合分子对接技术探讨高良姜治疗抑郁症的作用机制。方法　通过TCMSP数据库 检索高良姜有效成分及靶点,使用GeneCards数据库获取抑郁症疾病靶点基因,利用STRING数据库和Cytoscape 3.9.1 软 件构建PPI网络图并获取蛋白互作关系,筛选出高良姜治疗抑郁症的核心靶点;借助David数据库对相交靶点进行GO功 能分析以及KEGG通路富集分析,得到高良姜治疗抑郁症的潜在作用通路。结果　筛选出高良姜 13 种活性成分和 169 个高良姜治疗抑郁症的潜在作用靶点,包括JUN、MAPK1、AKT1、RELA、ESR1、IL6、MAPK14、MAPK8、RXRA等核心 靶点;GO功能解析得到 654 个生物相关过程、85 个细胞组分及 147 个分子功能;KEGG富集解析获得 171 条相关通路, 分子对接验证了核心靶点与高良姜主要成分具有较强结合力。结论　高良姜可通过多个靶点、多条通路治疗抑郁症。     

基于网络药理学探讨三物白散治疗胃癌的分子机制及初步验证

目的运用网络药理学联合分子对接探讨三物白散治疗胃癌的作用机制,通过体外细胞实验对相关靶点作初步验证。方法利用TCMSP数据库获取三物白散的活性成分及潜在靶点;通过Genecards、OMIM、TTD数据库,收集胃癌相关的作用靶点;将三物白散潜在靶点与胃癌靶点相匹配,获得三物白散抗胃癌的作用靶点,使用STRING数据库对作用靶点进行蛋白互作分析,构建PPI网络,并进行拓扑分析筛选核心靶点;用R语言对作用靶点进行GO生物学过程和KEGG通路富集分析;采用Auto Dock Vina软件对核心靶点与对应活性成分进行分子对接;运用qPCR验证三物白散对胃癌细胞SGC-7901中Caspase-3、Caspase-7作用靶点的调控作用。结果经筛选获得三物白散活性成分17个,三物白散作用靶点84个,经拓扑分析得到12个核心作用靶点,包括TP53、AKT1、MAPK1、JUN、CASP3等。三物白散作用靶点涉及PI3K-AKT、p53、HIF-1、IL-17等多条信号通路,通过诱导细胞凋亡、抑制细胞增殖、调节缺氧及炎性微环境发挥抗肿瘤作用。分子对接结果表明,活性成分与核心靶点有良好的结合能力。体外实验结果证实,三物白散可上调凋亡相关分子Caspase-3、Caspase-7的表达,这在一定程度上证实了网络药理学预测及指导实验设计的可靠性。结论本研究结果体现了三物白散多成分、多靶点、多通路的治疗特点,系统地揭示了其抗胃癌的药效物质、核心靶点和信号通路,为后续深入研究作用机制提供参考。     

黄芪四君子汤治疗乳腺癌癌因性疲乏的疗效及机制：基于94例临床随机对照试验和网络药理学

目的 探讨黄芪四君子汤治疗乳腺癌化疗后致脾胃气虚型癌因性疲乏（CRF）患者的临床疗效及作用机制。方法 94例脾胃气虚型癌因性疲乏的乳腺癌化疗患者随机分为化疗组47例和中药+化疗组47例。化疗组常规行多柔比星+环磷酰胺或表柔比星+环磷酰胺（AC/EC）方案化疗及心理疏导等非药物性干预,中药+化疗组是在化疗组基础上加用黄芪四君子汤口服治疗,21 d 为1个疗程,观察服药1个疗程后疲乏情况（Piper疲乏修订量）。依托中药系统药理学分析平台（TCMSP）、GeneCards、NCBI基因以及OMIM数据库检索得到黄芪四君子汤的活性成分和靶点蛋白以及CRF、乳腺癌相关疾病靶点,构建蛋白互作（PPI）网络,并对靶标进行基因本体（GO）功能富集分析、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,运用AutoDock软件预测主要药物化合物与CRF关键靶点的结合度。结果 中药+化疗组对CRF患者的躯体疲乏、情感疲乏、认知疲乏3个维度评分及疲乏总评分情况明显好于化疗组（P<0.001）;本研究共筛得黄芪四君汤250个靶标、癌因疲乏相关基因2653个、乳腺癌相关基因15 329个,方药与疾病交集靶标161个,构建PPI网络,拓扑分析筛得最可能的关键靶点66个,GO及KEGG富集分析预测出与疾病相关的多条作用通路;分子对接研究提示黄芪四君子汤的核心成分均与AKT1、CASP3、IL6、JUN、VEGFA关键靶点有较好的亲和力, 且AKT1可能是黄芪四君子汤治疗癌因性疲乏的最重要核心靶点。结论 黄芪四君子汤可明显改善乳腺癌癌因性疲乏,其作用机制可能主要通过AKT1调控 PI3K-Akt等信号通路相关基因的表达,进而发挥抗CRF的药理效应。     

运用网络药理学与分子对接法探讨阳和汤治疗股骨头坏死的核心作用机制

目的 运用网络药理学与分子对接法,探究阳和汤(Yanghe Tang,YHT)治疗股骨头坏死(osteonecrosis of the femoral head, ONFH)的分子作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库(TCMSP数据库)、Uniprot数据库、GeneCards数据库和DAVID数据库,探究阳和汤方中有效化合物治疗ONFH的核心化合物、核心靶点和信号通路,并将YHT核心化合物与ONFH的重要靶点HIF-1a和血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)进行分子对接。结果 通过TCMSP数据库搜索中药的化合物成分与对应靶点,依据口服吸收利用度(OB)≥30%,药物相似性(DL)≥0.18的筛选标准,去除重复值,最终检索到阳和汤方中主要活性化合物119个。靶点通过Uniprot基因校正后,得到226个靶点基因。通过GeneCards数据库共获得284个疾病靶点基因,将疾病靶点与化合物靶点交叉映射,进而获得阳和汤治疗ONFH的潜在作用靶点40个,并在STRING数据库中获得40个潜在作用靶点的PPI蛋白互作网络,通过Cytoscape 3.7.1软件对PPI网络进行拓扑分析,得到5个核心作用靶点:IL-6、TNF、TP53、VEGFA、CASP3。此外,与ONFH直接相关的重要靶点包括VEGFA、CASP3、HIF-1α、IL-6、TNF等。通过DAVID数据库,对潜在靶点进行GO功能注释和KEGG功能富集分析,最终获得与骨质代谢相关作用通路有PI3K-Akt 信号通路,与免疫与炎症反应相关的通路有TNF 信号通路,与血液供应作用相关的通路为HIF-1 信号通路、VEGF 信号通路、 血管生成的正调控等。分子对接显示槲皮素与HIF-1α的结合能最低,豆甾醇与VEGFA的结合能最低,这两种分子对接方式更易发生。结论 预测YHT可通过HIF-1 信号通路、TNF 信号通路、PI3K-Akt 信号通路等途径,调控股骨头坏死进程中的免疫炎症反应、骨代谢和血液循环,达到干预和治疗ONFH的作用。