“中东呼吸综合征”流行现状与研究进展

2012年9月全球首例＂中东呼吸综合征＂（Middle East respiratory syndrome,MERS）发现以来,截至2014年5月9日,共有16个国家和地区报告了536例确诊病例,其中145例死亡,病死率为27.05%。90%的MERS病例发生在中东地区,中东以外地区报告的原发病例都有中东旅行史。2013年以前,全球MERS疫情一直平稳,但是2014年3月以来,疫情明显上升,特别是在沙特阿拉伯,病例报告地区范围明显扩大,同时在部分国家与地区出现了MERS在家庭与医院的聚集性病例,其中约1/4的MERS病例来自医务人员,提示MERS病毒已具备有限的人传人能力,这引发人们对MERS是否会像2003年的严重急性呼吸道综合征（Severe acute respiratory syndrome,SARS）那样全球大流行而担忧。本文根据PubMed数据库中已经发表的MERS论文和WHO、美国CDC及欧州CDC等地区的官方网站发布的信息,对有关MERS的病原学、流行病学和临床学等方面的研究进展进行综述。     

北京市新发地市场新型冠状病毒肺炎疫情相关病例的流行病学特征分析

目的 分析并比较北京市新发地市场疫情中新型冠状病毒肺炎（COVID-19）确诊病例与无症状感染者的流行病学特征。方法 收集并整理传染病报告信息管理系统中北京市新发地市场疫情中COVID-19感染者数据和流行病学调查报告资料,应用SPSS 19.0软件分析并比较确诊病例和无症状感染者的流行病学特征。结果 2020年6月11日至7月10日北京市共诊断新型冠状病毒感染者368例,其中确诊病例335例（91.03%）,无症状感染者33例（8.97%）。病例分布于11个区,其中丰台区病例数占总病例数的68.48%（252/368）。发病曲线呈现暴发流行模式,发病高峰为6月13日。全部感染者年龄M（Q_R）为43（31~51）岁,无症状感染者的年龄M（Q_R）为32（29~49）岁,低于确诊病例的年龄M（Q_R）[43（31~52）岁],差异有统计学意义（Z=2.416,P=0.016）。感染者男女性别比为1.26：1。从事餐饮及商业服务和公共场所服务的人员最多,占64.13%（236/368）。73.91%（272/368）的感染者有新发地市场直接暴露史。通过核酸筛查发现全部感染者的54.08%（199/368）。确诊病例中轻型和普通型病例占99.10%（332/335）,无死亡病例。结论 北京市新发地市场疫情呈暴发流行模式,COVID-19病例以餐饮和服务业人员为主。无症状感染者的年龄低于确诊病例。     

广州市新型冠状病毒肺炎病例密切接触者核酸检测灵敏度和特异度分析

目的 分析广州市新型冠状病毒肺炎（COVID-19）疫情防控不同阶段中,密切接触者新型冠状病毒（新冠病毒）核酸检测的灵敏度和特异度,为优化疫情防控策略提供科学依据。方法 2020年2月21日至9月22日广州市COVID-19病例的密切接触者20 348例,均已接受新冠病毒核酸检测。针对疫情防控的不同阶段,比较核酸检测的灵敏度和特异度。结果 20 348例密切接触者中,男性12 462例（61.24%）,年龄M（P₂₅,P₇₅）为31.0（23.0,43.0）岁,核酸检测次数M（P₂₅,P₇₅）为2.0（1.0,3.0）次,隔离天数M（P₂₅,P₇₅）为12.0（8.0,13.0）d。研究对象经过7次核酸检测后,共确诊病例256例。第1、2、3和第7次核酸检测的灵敏度与特异度分别为69.14%与99.99%（确诊177例）、89.84%与99.99%（确诊230例）、97.27%与99.99%（确诊249例）、100.00%与99.98%。基于我国COVID-19疫情防控分为3个阶段（国内输入、境外输入和境外输入关联）,首次核酸检测的灵敏度分别为70.68%、68.00%和67.35%,特异度分别为99.98%、100.00%和100.00%。结论 建议做核酸检测3次,可提高灵敏度并降低假阴性风险。对于广州市COVID-19疫情防控3个阶段,密切接触者核酸检测的灵敏度结果较为一致,但略有降低趋势,这可能与疫情防控后期阶段的无症状感染者比例增多相关。     

上海市2010－2014年确认和疑似诺如病毒感染聚集性疫情流行病学分析

目的 分析2010－2014年上海市确认或疑似诺如病毒感染聚集性疫情及其流行病学特征。方法 统计分析2010年1月至2014年11月上海市报告的确认或疑似诺如病毒聚集性疫情的调查报告。结果 共报告80起聚集性疫情,报告病例总数为2 399例,总罹患率为4.17%。聚集性疫情持续时间M=4.5 d,疫情达到峰值时间M=2 d。秋冬季疫情高发,10月至翌年2月共发生53起,占总例数的66.25%。发生在学校、幼儿园和养老院的疫情共75起(93.75%)。医院住院病例和养老院老年人罹患率高于托幼儿童及学生,差异有统计学意义(χ²=683.12,P< 0.01);集体机构员工罹患率均低于其服务对象的罹患率。临床症状以呕吐为主,共1 900例(79.20%),腹泻和发热仅分别为694例(28.93%)和364例(15.17%),差异有统计学意义(χ²=2 251.48,P< 0.01)。短期共同来源为主要暴露形式,接触传播是主要感染途径。结论 2010－2014年上海市诺如病毒聚集性疫情主要发生在秋冬季和集体机构,应加强重点地区和人员监测及防护。     

武汉市武昌区新型冠状病毒肺炎流行病学特征分析

目的 分析武汉市武昌区新型冠状病毒肺炎（COVID-19）流行病学特征,为COVID-19疫情防控策略调整提供参考依据。方法 从中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息系统中收集截至2020年3月19日武昌区报告COVID-19病例资料。分别采用Excel 2010、SPSS 22.0、Arc GIS10.2和Joinpoint regression program 4.8.0.0软件进行统计学分析。结果 截至2020年3月19日武昌区报告COVID-19病例7 547例,其中确诊病例5 448例（占72.19%）,临床诊断病例2 009例（占26.62%）,无症状感染者90例（占1.19%）。确诊病例中,年龄（56.65±16.25）岁,年龄范围2 d龄~105岁,男性2 634例（占48.35%）,女性2 814例（占51.65%）,离/退休人员2 492例（占45.74%）。医务人员新型冠状病毒感染例数为545例（占7.22%,545/7 547）,确诊365例,死亡5例。确诊病例死亡430例,病死率为7.89%（430/5 448）,且男性病死率（10.09%,266/2 634）高于女性（5.82%,164/2 814）。第1个流行高峰为1月24－26日,第2个流行高峰为2月1－5日,3月18日首次报告单日无新增确诊病例。确诊病例的发病率位居前4位的街道分别为黄鹤楼街道（1043.77/10万）、紫阳街道（627.97/10万）、杨园街道（503.67/10万）和水果湖街道（486.02/10万）。相比于女性、≤50岁者、临床分型为轻型病例,男性（RR=0.690,95% CI：0.322~1.478）、>50岁者（RR=11.745,95% CI：6.878~20.058）、临床分型分别为重（RR=2.317,95% CI：1.789~3.000）、危重型（RR=10.794,95% CI：7.997~14.569）和性别时间相依协变量（RR=1.392,95% CI：1.053~1.840）是COVID-19确诊病例预后的相关影响因素。结论 武昌区COVID-19病例的性别、年龄和职业分布较为广泛。男性、>50岁者、重/危重型临床分型是确诊病例预后的相关影响因素。针对出院复阳病例、无症状感染者和密切接触者实施规范管理,是降低COVID-19发病率的主要措施。     

甘肃省新型冠状病毒肺炎流行病学特征分析

目的 对甘肃省确诊的新型冠状病毒肺炎（COVID-19）病例进行流行病学特征分析,探索疫情流行的阶段性特征。方法 通过流行病学调查收集甘肃省COVID-19病例资料,包括基本资料、流行病学史、发病、就诊和确诊时间、临床表现等信息。结果 截至2020年2月25日,甘肃省共报告91例确诊病例,COVID-19流行分为输入病例期、输入病例与本地病例并存期、本地病例为主期3个阶段。聚集性疫情病例共63例（69.23%）。医务人员有3例,均为非职业暴露感染。首发症状为发热、咳嗽和乏力的比例分别为54.95%（50/91）、52.75%（48/91）和28.57%（26/91）,且在3个阶段中的比例呈下降趋势,但只有发热与乏力症状的差异有统计学意义（趋势χ²值分别为2.20和3.18,P<0.05）;3个阶段的重型/危重型病例比例分别为42.86%（6/14）、23.73%（14/59）和16.67%（3/18）,呈下降趋势（H=6.40,P<0.05）;潜伏期随着疫情的3个阶段有延长的趋势（F=51.65,P<0.01）;发病到就诊、发病到确诊的时间间隔随着疫情进展有缩短的趋势（F值分别为5.32和5.25,P<0.01）;基本再生数（R₀）从输入病例期的2.61降至本地病例为主期的0.66。结论 甘肃省COVID-19流行早期均为湖北省输入,聚集性疫情占三分之二,未发现医务人员职业性暴露感染。总体流行呈阶段性变化特征,随着疫情进展有首发症状不明显和潜伏期延长的特点,并提示体温监测不能作为单一的早期筛查手段。     

1 052例新型冠状病毒肺炎聚集性病例流行病学特征分析

目的 了解新型冠状病毒肺炎聚集性病例的流行病学特征,探讨家庭因素以及集体活动等对本病传播的影响。方法 于2020年1月19日至2月25日每日从中国6个省份公布聚集性病例的36个地市官方平台收集积聚性病例数量、个案信息,采用描述性统计方法、χ²检验以及曲线拟合对聚集性病例的流行病学特征进行分析。结果 共收集聚集性病例366起1 052例,家庭聚集性病例占86.9%（914/1 052）;1 046例有性别信息的聚集性病例中,男性513例（49.0%）,女性533例（51.0%）;病例以18～59岁青壮年为主,占68.5%（711/1 038）。在366起聚集性疫情中,有47.0%（172/366）聚集性疫情的首例确诊病例曾有武汉市或湖北省旅居史。1月19日至2月3日,首例确诊病例有武汉市或湖北省旅居史占66.5%;2月4-25日聚集性病例首例确诊病例有武汉市或湖北省旅居史仅占18.2%。一代病例与二代病例发病时间间隔M为5（2～8）d,首发病例的发病—确诊时间间隔M为6（3～9）d,续发病例的发病—确诊时间间隔M为5（3～8） d。结论 聚集性疫情在武汉市和湖北省以外多地市普遍出现,家庭密切接触是造成家庭内传播的主要原因之一。2月4日后聚集性病例以当地一代或二代以后的病例传播为主,确诊时间缩短。     

天津市新型冠状病毒肺炎聚集性疫情病例分析

目的 分析天津市新型冠状病毒肺炎（COVID-19）聚集性疫情病例情况,掌握不同类型聚集性病例发病特征,为COVID-19防控提供流行病学证据和经验。方法 收集截至2020年2月22日天津市全部COVID-19确诊病例的聚集性资料,梳理和分析不同类型聚集性疫情发病特点。结果 截至2月22日,天津市共报告COVID-19聚集性疫情33起,涉及病例115例。聚集性病例分为4类：家庭聚集（28起,71例）、单位聚集（1起,10例）、交通工具（3起,8例）和公共场所（1起,26例）,其中单位和公共场所聚集性疫情中的病例又导致了14起家庭聚集性疫情。家庭聚集的续发病例1~7例,中位数为2例。家庭首发病例发病到确诊时间长于续发病例（Z=-2.406,P=0.016）。公共场所聚集的潜伏期中位数为7 d。家庭、单位和公共场所3类聚集性疫情相比较,病例发病到确诊时间差异有统计学意义（H=8.843,P=0.012）,续发病例发病时间差异有统计学意义（H=16.607,P=0.000）。结论 COVID-19疫情监测应特别关注容易发生聚集性疫情场所,及时开展细致的流行病学调查和排查。出现聚集性疫情的场所内部,应及时将密切接触者转至统一的隔离观察点,严格单间管理,避免疫情扩散。部分农村地区防疫意识不强,聚集活动较多,且发病后就诊不及时,在疫情初期应该加强防控的宣传和控制措施。     

河南省2017-2020年发热伴血小板减少综合征监测分析

目的 了解河南省2017-2020年发热伴血小板减少综合征（SFTS）监测病例的流行病学和病原学特征。方法 利用描述流行病学方法对河南省2017-2020年SFTS病例特征进行分析。采集急性期病例血标本，应用实时荧光RT-PCR法检测新布尼亚病毒核酸。对部分分离到的病毒株扩增S片段基因，进行同源性分析，构建系统进化树。结果 2017-2020年河南省共报告SFTS 1 767例（疑似病例1 000例、确诊病例767例），累计死亡11例（疑似病例3例、确诊病例8例），平均病死率为0.62%（11/1 767）；发病呈逐年下降趋势（趋势χ²=12.018，P=0.001）。病例分布在6个城市28个县（区），信阳市报告1 681例，占病例总数的95.13%（1 681/1 767）。病例主要发生在4-10月，占病例总数的96.10%（1 698/1 767）。男性发病率（0.38/10万）低于女性（0.54/10万）（χ²=54.855，P<0.001）；40~84岁占病例总数的93.44%（1 651/1 767）；农民占病例总数的96.10%（1 698/1 767）。发生家庭聚集性疫情1起。共检测标本1 110份，新布尼亚病毒的平均阳性率为39.19%（435/1 110），不同年份的差异有统计学意义（χ²=25.405，P<0.001）。分离到39株新布尼亚病毒中，S片段核苷酸同源性为94.76%~99.82%。39株病毒株完整S片段遗传进化分析结果显示，34株为A基因型、2株为B基因型，3株为D基因型。结论 2017-2020年河南省SFTS以散发为主，发病呈逐年下降趋势，发病具有明显的地域性和季节性，发病范围不断扩大，女性、≥ 40岁和农民多发，不同年份新布尼亚病毒阳性率差异较大，新布尼亚病毒主要流行型别为A基因型，但仍需持续开展病原学监测。     

山东省2017－2018年境外输入性疟疾流行病学特征分析

目的 了解山东省境外输入性疟疾流行特征,为及时调整防控措施提供科学依据。方法 收集2017－2018年山东省疟疾疫情资料、病例个案调查资料及省级参比实验室病例复核资料,采用SPSS 18.0软件进行统计分析,采用QGIS 2.18软件绘制地图。结果 2017－2018年山东省共报告境外输入性疟疾442例,感染来源主要为非洲地区（占97.96%,433/442）。17个地市均有病例报告,主要集中在济宁市（88例）、烟台市（65例）、威海市（46例）、青岛市（44例）和德州市（42例）,共报告285例（占64.48%,285/442）。病例分布于山东省77.37%（106/137）的县（市、区）。每月均有病例报告,未呈现明显的季节特征。发病-初诊时间间隔M=2 d（P₂₅~P₇₅：3 d）。初诊-确诊时间间隔M=0 d（P₂₅~P₇₅：3 d）。病例发病当天就诊率为27.83%（123/442）。69.68%（308/442）的病例初诊被诊断为疟疾,经χ²检验,县级以下医疗机构诊断正确率低于其他医疗机构（均P<0.01）。51.13%（226/442）的病例就诊当天确诊,经χ²检验,各级医疗机构当天确诊率差异无统计学意义（P>0.05）。结论 2017－2018年山东省境外输入性疟疾具有病例数量多、感染来源广、地区分布广等特征,病例及时就诊意识淡薄,基层医疗机构疟疾诊治意识和能力尚弱,应针对性的调整防控措施。     

Costly Lessons From the 2015 Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus Outbreak in Korea

Since the Middle East respiratory syndrome (MERS) outbreak in the Republic of Korea (hereafter Korea) began on May 11, 2015, a total of 186 persons have been infected by the MERS coronavirus, 38 of whom have died. With this number, Korea becomes second only to the Kingdom of Saudi Arabia in the ranking of cumulative MERS cases. In this paper Korea’s unique experience of an outbreak of MERS will be summarized and discussed briefly.     

Evaluation of Patients under Investigation for MERS-CoV Infection,United States,January 2013–October 2014

Middle East respiratory syndrome (MERS) cases continue to be reported from the Middle East. Evaluation and testing of patients under investigation (PUIs) for MERS are recommended. In 2013–2014, two imported cases were detected among 490 US PUIs. Continued awareness is needed for early case detection and implementation of infection control measures.     

Middle East Respiratory Syndrome in 3 Persons,South Korea, 2015

In May 2015, Middle East respiratory syndrome coronavirus infection was laboratory confirmed in South Korea. Patients were a man who had visited the Middle East, his wife, and a man who shared a hospital room with the index patient. Rapid laboratory confirmation will facilitate subsequent prevention and control for imported cases.     

中国首例输入性中东呼吸综合征患者收治单位的消毒隔离措施及效果评价

目的评价中国首例输入性中东呼吸综合征（MERS）患者收治单位的消毒隔离措施及效果。方法2015年5月28日某院ICU负压病房收治中国首例输入性MERS患者,医院制定和落实一系列消毒隔离措施,以治疗和预防中东呼吸综合征冠状病毒（MERS CoV）感染。结果2015年5月28日2：30该院收治1例经广东省疾病预防控制中心（CDC）和国家CDC确诊的MERS患者：患者咽拭子、血液样本实时荧光定量聚合酶链反应(real time PCR)检测均为MERS CoV阳性。患者入院后第3天咽拭子即转阴,入院后第8天血转阴,入院2周后粪便转阴,6月21日痰转阴,出院前连续2次咽拭子、痰、血、粪便检测均为阴性,连续10 d无发热,临床症状好转, 6月26日康复出院。采集所有参与人员的鼻拭子、咽拭子、血标本,检测均为MERS CoV阴性;从患者6月26日出院至7月10日对所有参与救治的医务人员进行健康监测,均未出现不适,医务人员零感染。患者入院后第7天、第13天,以及终末消毒后采集环境和物体表面标本,检测均为MERS CoV阴性。结论严格执行消毒隔离措施, 可有效切断MERS的传播途径,保护医务人员的安全。     

MERS-CoV vaccine candidates in development: The current landscape

Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV), an emerging infectious disease of growing global importance, has caused severe acute respiratory disease in more than 1600 people, resulting in more than 600 deaths. The high case fatality rate, growing geographic distribution and vaguely defined epidemiology of MERS-CoV have created an urgent need for effective public health countermeasures, paramount of which is an effective means of prevention through a vaccine or antibody prophylaxis. Despite the relatively few number of cases to-date, research and development of MERS-CoV vaccine candidates is advancing quickly. This review surveys the landscape of these efforts across multiple groups in academia, government and industry.     

Multifacility Outbreak of Middle East Respiratory Syndrome in Taif,Saudi Arabia

Middle East respiratory syndrome (MERS) coronavirus (MERS-CoV) is a novel respiratory pathogen first reported in 2012. During September 2014–January 2015, an outbreak of 38 cases of MERS was reported from 4 healthcare facilities in Taif, Saudi Arabia; 21 of the 38 case-patients died. Clinical and public health records showed that 13 patients were healthcare personnel (HCP). Fifteen patients, including 4 HCP, were associated with 1 dialysis unit. Three additional HCP in this dialysis unit had serologic evidence of MERS-CoV infection. Viral RNA was amplified from acute-phase serum specimens of 15 patients, and full spike gene-coding sequencing was obtained from 10 patients who formed a discrete cluster; sequences from specimens of 9 patients were closely related. Similar gene sequences among patients unlinked by time or location suggest unrecognized viral transmission. Circulation persisted in multiple healthcare settings over an extended period, underscoring the importance of strengthening MERS-CoV surveillance and infection-control practices.     

Enhanced MERS Coronavirus Surveillance of Travelers from the Middle East to England

During the first year of enhanced MERS coronavirus surveillance in England, 77 persons traveling from the Middle East had acute respiratory illness and were tested for the virus. Infection was confirmed in 2 travelers with acute respiratory distress syndrome and 2 of their contacts. Patients with less severe manifestations tested negative.     

Variations in Spike Glycoprotein Gene of MERS-CoV,South Korea, 2015

An outbreak of nosocomial infections with Middle East respiratory syndrome coronavirus occurred in South Korea in May 2015. Spike glycoprotein genes of virus strains from South Korea were closely related to those of strains from Riyadh, Saudi Arabia. However, virus strains from South Korea showed strain-specific variations.     

Molecular Epidemiology of Hospital Outbreak of Middle East Respiratory Syndrome,Riyadh, Saudi Arabia, 2014

We investigated an outbreak of Middle East respiratory syndrome (MERS) at King Fahad Medical City (KFMC), Riyadh, Saudi Arabia, during March 29–May 21, 2014. This outbreak involved 45 patients: 8 infected outside KFMC, 13 long-term patients at KFMC, 23 health care workers, and 1 who had an indeterminate source of infection. Sequences of full-length MERS coronavirus (MERS-CoV) from 10 patients and a partial sequence of MERS-CoV from another patient, when compared with other MERS-CoV sequences, demonstrated that this outbreak was part of a larger outbreak that affected multiple health care facilities in Riyadh and possibly arose from a single zoonotic transmission event that occurred in December 2013 (95% highest posterior density interval November 8, 2013–February 10, 2014). This finding suggested continued health care–associated transmission for 5 months. Molecular epidemiology documented multiple external introductions in a seemingly contiguous outbreak and helped support or refute transmission pathways suspected through epidemiologic investigation.