2012年5—12月上海市感染性腹泻细菌和病毒病原学监测结果分析

目的了解2012年5—12月上海市感染性腹泻的病原谱和流行病学特征。方法随机抽取6所不同级别医院,对在其肠道门诊就诊的感染性腹泻病例按一定的抽样间隔进行调查,并采集粪便标本,进行细菌培养和病毒检测。结果从1001例病例粪便标本中检出阳性465例,检出率为46.45%。检出细菌7种、病毒5种。细菌检出率为12.09%,主要为副溶血性弧菌(61例)、沙门菌(35例)。病毒检出率为32.07%,主要为诺如病毒(262例)、轮状病毒(40例)。阳性例数呈较明显的夏季高峰和秋冬季高峰。465例阳性病例的平均年龄为(44.20±17.56)岁,病原阳性组和阴性组的年龄构成差异无统计学意义(P0.05)。细菌阳性组中有腹痛和发热症状的构成比均高于病毒阳性组,有呕吐和恶心症状的构成比均低于病毒阳性组;细菌阳性组发病前5天有聚餐史和外出史的构成比均高于病毒阳性组,二组有宠物接触史的比例均高于阴性组,上述差异均有统计学意义(P0.05)。结论上海地区腹泻病原谱较为广泛,季节高峰较为明显,应针对各病原检出率的差异在不同季节开展相应的防控措施。     

上海市社区获得性肺炎发病情况和危险因素

[目的]了解上海市社区获得性肺炎的发病情况和危险因素。[方法]以2所医院诊断的134例社区获得性肺炎患者为病例组,病例同一社区的健康者作为对照组,开展1：1病例、对照调查,研究发病危险因素;随机选择上海市4家社区居委（村）并对所有居民开展入户调查,初步估计上海市社区获得性肺炎发病人数。[结果]上海市社区获得性肺炎患者以50岁以上离、退休人员居多;临床表现以发热（体温≥38℃）、咳嗽、咳痰为主;多因素条件logistic回归分析结果提示,吸烟（OR=2．051）、哮喘（OR=6．152）、慢性疾病史（OR=2．230）是社区获得性肺炎发病的主要危险因素;初步估计上海市每年发生社区获得性肺炎约26997人。[结论]上海市社区获得性肺炎发病水平较高;控烟和治疗哮喘与相关慢性疾病是预防社区获得性肺炎的关键措施,应进一步加强疾病监测和健康宣传普及。     

BP人工神经网络模型在上海市感染性腹泻日发病例数预测中的应用

目的 建立基于气象因素的上海市感染性腹泻逐H发病例数BP人工神经网络预测模型。方法 收集上海市2005-2008年感染性腹泻逐日发病例数与同期气象资料包括气温、相对湿度、降雨量、气压、日照时数、风速,通过SPearman相关分析选出与感染性腹泻相关的气象因素,用主成分分析(PCA)去除气象因素间的共线性影响。利用MatLabR2012b软件的神经网络工具箱建立感染性腹泻日发病例数的BP神经网络预测模型,并对拟合效果、外推预测能力和等级预报效果进行评价。结果 SPearman相关性分析显示,日感染性腹泻与前两天的日最高气温、最低气温、平均气温、最低相对湿度、平均相对湿度呈正相关(PP<0.01)。输入PCA提取的4个气象主成分构建BP神经网络预测模型,训练和预测样本平均绝对误差、均方根误差、相关系数、决定系数分别为4.7811、6.8921、0.7918、0.8418和5.8163、7.8062、0。7202、0.8180。模型预测值对2008年实际发病数的年平均误差率为5,30%,对感染性腹泻的等级预报正确率为95.63%+H26。结论 温度和气压对感染性腹泻日发病例数影响较大。BP神经网络模型的拟合及预测误差较小,预报正确率较高,预报效果理想。     

上海市鼠伤寒沙门菌流行特征及分子分型研究

[目的]研究上海市2006—2007年鼠伤寒沙门菌腹泻病例株的分子流行病学特征。[方法]追溯2002—2007年食品中分离的鼠伤寒沙门菌来源,比较鼠伤寒沙门菌食源株与腹泻株的抗生素耐药性;对全球沙门菌监测(GSS)病例和食品中分离的鼠伤寒沙门菌进行血清、耐药表型和脉冲凝胶电泳(PFGE)分子分型。[结果]经培养确认的鼠伤寒沙门菌腹泻病例数,在2006—2007年本市非伤寒沙门菌型病例构成中仅次于肠炎沙门菌,食品菌株多源于禽(64.4%)和畜肉制品(17.8%),其多重耐药菌株显著高于腹泻株(P0.05)。PFGE将7株食品株和44株腹泻株分为23种带型,优势型为1型(8株)、2型(6株)、29型(4株)、49型(8株)和6型(4株),与食源菌株完全匹配的仅有49型、6型共7个病例(15.9%,7/44)。PFGE-1型腹泻株在2006和2007年分别为2例和6例,2型分别为4例和2例。[结论]上海市鼠伤寒沙门菌腹泻病例存在高度散发和分散爆发的流行特征,没有与本地食品菌株相匹配的优势克隆型分别是PFGE 2型和1型,与市售生鲜类肉食品污染株之间的遗传同源性低。推测传染源可能由输入性传染源对食品等媒介形成二次污染所致。建议加强流行病学调查,以揭示潜在的传染源和传播途径。     

上海市腹泻病综合监测的创新探索、构建及应用

为满足肠道传染病防控需要,2012年起上海市创新探索腹泻病综合监测模式,监测科学布点、系统采样、多病原集合、联通医院信息系统,实现了"一个监测、多个病种;一份样本,多种病原"的监测模式,对全年龄段人群进行持续的主动监测,监测内容包括人口学、临床医学、流行病学、病原检测、药敏监测等病例信息。监测取得了如下初步成效:掌握真实世界的腹泻疾病特征及周期变化规律,发现本市腹泻的最主要病原体为诺如病毒;发现了少见病原体或病原体血清型,提供疫情溯源线索;促进了公共卫生机构和临床医疗机构的信息共享,为临床诊疗提供科学依据。未来腹泻病综合监测将朝扩展监测广度和监测深度、智能化辅助诊疗、暴发疫情预警、流行趋势预测、应用检测新技术等方向提升。     

上海市罕见沙门菌型腹泻的溯源研究

[目的]初步了解本市罕见沙门菌血清型菌株的分子流行病学特征。[方法]对分离自不同来源标本的22株7种不同血清型沙门菌进行脉冲凝胶电泳(PFGE)分析,脉冲凝胶电泳选用XbaⅠ限制性内切酶。[结果]2株列克星敦、2株非丁伏斯沙门菌的电泳图谱显示有较大差异,2株蒙得维的亚、2株朗根萨尔查、2株乌普萨拉、5株胥戈成格隆、4株波摩那的图谱显示存在同源性。[结论]本市沙门菌罕见血清型的流行菌株和食品菌株之间既存在分子水平的同源性也存在非同源性,加强沙门菌综合监测和即时分子分型可预警罕见沙门菌血清型流行。     

上海市肠炎沙门菌流行特征和分子分型研究

[目的]分析上海市2006—2007年肠炎沙门菌菌株,了解上海市肠炎沙门菌分子流行病学特征。[方法]回顾2002—2007年肠炎沙门菌食品株来源并与肠炎沙门菌腹泻株作耐药性比较;对2006—2007年全球沙门菌监测(GSS)病例和食品分离的肠炎沙门菌进行表型验证、药敏试验和脉冲凝胶电泳(PFGE)分析。[结果]2006—2007年肠炎沙门菌在本市非伤寒沙门菌病例中列首位,而80%的食品株源自禽及禽肉制品,食品株的抗生素耐药性高于腹泻株。2007年肠炎沙门菌腹泻株的耐药谱和2006年有较大差异。包括13株食品株在内共76株肠炎菌株可分为21种PFGE带型,遗传同源性接近80%,优势带型依次为3型(34株)、1型(12株)、2型(5株)和5型(5株),除2型外均发现有与腹泻株同型的食源株。2006和2007年的PFGE 1/2型病例分别为4例和12例。[结论]上海市肠炎沙门菌病例与食用污染的鸡肉等禽类制品有密切关系,PFGE 3型肠炎沙门菌是目前上海市肠炎沙门菌流行株的优势菌型,2007年发现由鹅肝传播的1/2型肠炎沙门菌可能是3型的变异株并有取代之成为流行菌株的趋势。开展对腹泻病例和食物链的综合监测和以实验室为主的实时分子分型检测能快速预警肠炎沙门菌散在爆发和追溯污染源。     

2006-2012年上海市基于网络实验室的肠炎沙门菌耐药监测

目的 建立区域性网络实验室监测和分析肠炎沙门菌的耐药特征变化为科学防治提供参考依据。 方法 2006-2012年,上海市8个区域公共卫生实验室和24家临床实验室依据标化方法分离184株肠炎沙门菌食源环境菌株与1146株肠炎沙门菌腹泻病例菌株,使用纸片扩散法(K-B法)检测菌株对16种抗生素的耐药性,应用WHONET软件建立耐药数据库。 结果 历年中肠炎沙门菌在禽肉中污染率最高(155/184);实验室诊断病例主要分布在5岁以下和18~59岁、1~4岁病例明显高于1岁以下、60岁以上病例呈逐年上升趋势。所有肠炎沙门菌对萘啶酸耐药率均超过90%;多重耐药株(对氨苄西林-氯霉素-链霉素-磺胺异噁唑-四环素耐药型,ACSSuT)存在于鸡肉和2009年的1例食物中毒暴发病例中;耐头孢吡肟食源和腹泻株分别出现在2011年和2008年;腹泻株对环丙沙星和头孢噻肟的耐药率高于食源株;低年龄组病例对三代头孢和环丙沙星耐药的菌株分别约占2/3和1/2。 结论 上海市肠炎沙门菌腹泻病例存在社区内获得和食源性感染等不同因素,肠炎沙门菌多重耐药型ACSSuT可能是潜在的高致病性流行株。提高临床实验室常规诊断能力,优化和减少老年人和婴幼儿对抗生素暴露,重视多重耐药菌株导致的疾病负担。     

上海市2013-2018年成年人诺如病毒引发感染性腹泻的流行特征研究

目的 了解上海市成年人感染性腹泻患者中诺如病毒的流行特征,为上海市诺如病毒感染性腹泻防控策略的制定提供科学依据。方法 在上海市22家监测点医院的肠道门诊中开展腹泻症状监测,收集患者人口学信息、流行病学资料和主要症状,同时采集患者粪便标本,送至医院所在区CDC检测诺如病毒,分析2013-2018年不同人群和季节的诺如病毒检出率,利用logistic回归分析探讨人群感染诺如病毒的影响因素。结果 在12 083例感染性腹泻患者中,诺如病毒阳性检出率为19.28%（2 330/12 083）,主要型别为GⅡ群（83.63%）。其中男性检出率（20.78%）高于女性（17.73%）,30~44岁组人群诺如病毒检出率最高（21.51%）,2015年检出率最高（23.60%）,以上差异均有统计学意义（P<0.05）。诺如病毒感染以10月至次年4月为高发季节。诺如病毒阳性患者以水样便居多（75.94%）,35.84%患者伴有呕吐症状。多因素logistic回归分析显示,男性、30~44岁组、干部职员、冬季及外出史是感染诺如病毒的危险因素。结论 上海市成年人腹泻患者诺如病毒感染率高,引起的感染性腹泻全年均可发生,冬、春季高发,在诺如病毒引发的感染性腹泻的防控工作中应针对不同年龄、性别、季节采取特异性防控措施。     

基于动态风险评估第三届中国国际进口博览会传染病风险防控研究

  目的  识别和评估上海市中国国际进口博览会（进博会）筹备和举办期间潜在的传染病风险,为制定针对性的防控措施提供依据。  方法  采用专家会商法和风险矩阵法,对本市第三届进博会筹备和举办期间各种传染病风险进行识别和分析,动态评估其综合风险大小。  结果  共识别出17种传染病风险。 第一轮评估中,极高风险传染病1种（新型冠状病毒肺炎,COVID-19）,高风险3种［流行性感冒（流感）、诺如病毒感染性腹泻和水痘］,中风险9种,低风险4种。 第二轮评估后,高风险3种（COVID-19、诺如病毒感染性腹泻和水痘）,中风险1种（流感）,其余均为低风险。 COVID-19风险由极高降为高,流感风险由高降为中。 根据两轮的评估结果,调整了相应的风险管控措施。  结论  本研究发现的17种传染病风险及动态评估结果,为完善第三届进博会公共卫生安全保障工作方案和细化防控流程提供了较好的依据和参考,并提示第三届进博会期间的传染病防控需要各部门密切配合。