长沙市沙门菌表型特征及PFGE分子分型

目的研究长沙市沙门菌的血清型分布、耐药特点及分子流行病学特征。方法对分离自长沙地区食源性疾病粪便标本及市售食品中的70株沙门菌,用玻片凝集试验确定血清型,微量肉汤稀释法检测14种抗生素的敏感性,脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型。结果鼠伤寒沙门菌为优势血清型,占51.43%,其次是肠炎沙门菌,占7.15%。在抗生素敏感性测试中,对氨苄青霉素、磺胺嘧啶和氯霉素的耐药率较高,分别为68.57%、61.43%和57.14%。62.86%(44/70)的沙门菌呈多重耐药,且鼠伤寒沙门菌的多重耐药率比其他血清型高,差异有统计学意义(χ2=7.068,P0.01)。PFGE分型结果显示69株沙门菌按照100%的相似度可分为57个PFGE型,36株鼠伤寒沙门菌可分为4个聚类,相似度在58.1%~100%之间。结论本市的沙门菌以鼠伤寒和肠炎沙门菌为主,PFGE分型结果显示可能存在沙门菌的流行株,且菌株耐药形势严峻。     

自贡市2007-2010年鼠伤寒沙门菌感染的脉冲场凝胶电泳分析

目的 回顾性分析自贡市2007-2010年分离到的沙门菌菌株,评估分子分型技术在食源性传染病暴发识别和处置中的价值。 方法 对自贡市2007-2010年从食品和腹泻患者中分离的沙门菌进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)实验,用 BioNumerics软件分析菌株之间的相似度。 结果 55株沙门菌中,来源于2007-2008年的10个腹泻患者粪便和2008年的15个皮蛋中的25株鼠伤寒沙门菌菌株PFGE带型相似度为100%,均为P9带型。 结论 感染鼠伤寒沙门菌的皮蛋是导致自贡市2007-2008年10名患者腹泻暴发的污染源,为快速准确识别食源性疾病暴发并及时溯源、控制,应在食品安全监测中普及PFGE等分子分型技术。     

一起肠炎沙门菌食物中毒实验室检测及溯源分析

目的对一起沙门菌引起的食物中毒进行病原菌检测及溯源分型分析。方法常规分离沙门菌,对分离到的肠炎沙门菌进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型。结果 14名食物中毒学生标本检出肠炎沙门菌4株;57名食堂工作人员肛拭标本检出肠炎沙门菌6株、纽波特沙门菌1株;9份冷冻预包装食品中检出肠炎沙门菌1株。对11株肠炎沙门菌进行脉冲场凝胶电泳分型,学生、食堂工作人员检出的10株菌株PFGE条带完全一致,与1份冷冻预包装食品中检出的肠炎沙门菌的PFGE聚类分析的同源性为86%。结论这起食物中毒是由肠炎沙门菌引起,通过PFGE分型分析,本次食物中毒与预包装食品肠炎沙门菌污染无关联。PFGE可有效应用于食物中毒溯源分析及分子流行病学研究。     

上海市闵行区鼠伤寒沙门菌病原学与PFGE分型研究

目的了解2015年-2017年闵行区腹泻病监测点鼠伤寒沙门菌的病原学及脉冲场凝胶电泳(PFGE)特征。方法按照《上海市腹泻病综合监测实施方案》进行沙门菌分离鉴定;药物敏感试验采用纸片扩散法(K-B法);PFGE参照Pulse Net China沙门菌PFGE分子分型标准操作规程。结果鼠伤寒沙门菌在2015年-2017年检出率呈逐年增长趋势;鼠伤寒沙门菌对10种抗生素耐药率为四环素56.32%、萘啶酸31.03%、氯霉素20.69%、复方新诺明17.24%、头孢噻肟8.05%、头孢呋辛8.05%、庆大霉素5.75%、环丙沙星3.45%、头孢西丁1.15%、诺氟沙星1.15%,存在多重耐药。PFGE将87株鼠伤寒沙门菌分为62个带型,每个带型含1株~5株菌,分为A、B两大聚类,相似度为57.2%~100%。结论经过多种抗生素共同作用筛选得到的菌株成为鼠伤寒沙门菌扩散的主要来源,在PFGE优势克隆系中能体现。PFGE技术为聚集性病例的追踪溯源提供了分子生物学依据。     

长沙市沙门菌表型特征及PFGE分子分型研究

目的研究长沙市沙门菌的血清型分布、耐药特点及分子流行病学特征。方法对分离自长沙地区食源性疾病粪便标本及市售食品中的70株沙门菌,用玻片凝集试验确定血清型,微量肉汤稀释法检测14种抗生素的敏感性,脉冲场凝胶电泳（PFGE）进行分子分型。结果鼠伤寒沙门菌为优势血清型,占51.43%,其次是肠炎沙门菌,占7.15%。在抗生素敏感性测试中,对氨苄青霉素、磺胺嘧啶和氯霉素的耐药率较高,分别为68.57%、61.43%和57.14%。62.86%（44/70）的沙门菌呈多重耐药,且鼠伤寒沙门菌的多重耐药率比其他血清型高（χ²=7.068,P≤0.01）,差别有统计学意义。PFGE分型结果显示69株沙门菌按照100%的相似度可分为57个PFGE型,36株鼠伤寒沙门菌可分为4个聚类,相似度在58.1%~100%之间。结论本市的沙门菌以鼠伤寒和肠炎沙门菌为主,PFGE分型结果显示可能存在沙门菌的流行株,且菌株耐药形势严峻。     

贵港市沙门菌血清型、耐药性及PFGE分型特征研究

目的 了解2021年贵港市哨点医院腹泻患者中沙门菌血清型分布、脉冲场凝胶电泳（PFGE）分型特征、对抗生素的耐药情况以及腹泻患者（患者株）与生鲜猪肉（猪肉株）中鼠伤寒沙门菌的同源性。方法 对110株患者株与100株猪肉株沙门菌进行血清学分型鉴定,采用微量肉汤稀释法对患者株进行15种药物敏感试验,并应用PFGE对腹泻患者的110株沙门菌、生鲜猪肉中分离出的鼠伤寒沙门菌进行指纹图谱分析。结果 患者株中共分离出12个血清型,鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌为优势菌,所占比例分别为62.73%和9.09%;猪肉株中占比最高的也是鼠伤寒沙门菌,共40株（40.00%）。患者株普遍耐药,耐药菌株占比为91.82%,对氨苄西林的耐药率最高（88.18%）;多重耐药率高达83.64%。患者株可分为73种PFGE带型,有13种带型各包含2～6株相同带型;患者株与猪肉株间鼠伤寒沙门菌PFGE条带相似度为53.8%～100.0%,含5组大的克隆群,每组克隆群均含有患者株和猪肉株。结论 贵港市哨点医院腹泻患者中鼠伤寒沙门菌所占比例相对较高;沙门菌耐药较为严重;PFGE指纹图谱具有多样性,存在可能由散发的沙门菌引起食物...     

北京市40株肠炎沙门菌多重耐药和分子分型研究

目的分析2009-2010年北京市肠炎沙门菌多重耐药和脉冲场凝胶电泳（pulsed-field gel electropho-resis,PFGE）分子分型。方法对2009-2010年北京市肠道门诊监测系统分离到的40株肠炎沙门菌进行生化鉴定、血清分型并运用纸片法进行药敏检测,并采用PFGE进行分子分型。结果发现40株肠炎沙门菌中,32株多重耐药菌株,其中4～5种抗生素耐药27株（84.38%）,10种抗生素耐药1株（3.13%）;可分为14个PFGE带型,其中4个PFGE型的菌株数超过1株。结论北京市肠炎沙门菌分离株多重耐药性比较严重,PFGE分子型别较多,且存在差异明显的多个克隆系,但同一PFGE型菌株的多重耐药谱较为接近。     

2021年长沙市食源性疾病沙门菌血清分型及PFGE分子分型分析

目的 了解长沙市食源性疾病沙门菌的血清分型和PFGE分子分型情况,为食源性疾病防控提供依据。 方法 按《食源性疾病监测工作手册》收集长沙市4所哨点医院食源性疾病病例粪便标本,从中分离沙门菌,并对沙门菌进行血清分型和凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE),通过Bionumerics 7.6 软件对电泳图谱进行分析。 结果 全年共监测528份标本,检出沙门菌50株,检出率为9.47%,阳性病例主要集中在5岁及以下年龄段,占74.00%(37/50),发病主要在夏秋5—9月,占全年的76.00%(38/50)。血清型共有12种,主要血清型是鼠伤寒沙门菌占60.00%(30/50),其次为斯坦利沙门菌4株占8.00%,肠炎沙门菌3株占6.00%。 50株沙门菌PFGE分型为41种带型,相似度为55.7％～100％,呈现多态性,主要分成两个簇,有8组相似度 100％ 的菌株,共17株(占34.00%,17/50),主要是鼠伤寒沙门菌;有10簇相似度90%以上的克隆系,包含32株沙门菌。 结论 长沙市2021年食源性疾病沙门菌感染的优势血清型是鼠伤寒沙门菌,沙门菌PFGE分子分型带型呈多态化,PFGE分型可识别共同感染来源的病例,可用于暴发疫情识别和控制。     

沙门菌血清及脉冲场凝胶电泳分型

目的 分析吉林省食品中分离的沙门菌血清型和脉冲场凝胶电泳(PFGE)型别,探讨吉林省食品中沙门菌污染的同源性.方法 于2011年3月—2012年4月,对从市售生鸡肉和中式凉拌菜中分离出的28株沙门菌进行血清学和PFGE分子分型,采用BioNumerics version 6.0软件分析比较同源性.结果 28株沙门菌血清型分别为15株肠炎沙门菌、4株印弟安纳沙门菌、2株猪伤寒沙门菌、2株亚利桑那菌和5株血清未定型沙门菌;PFGE结果主要分为4个大群,其中1群包括14株,相似度为87.3％～100％;2群包括7株,分为2个亚群,2A亚群包括6株,相似度为91.9％ ～100％,2B亚群1株,相似度为73.6％;3群包括3株,相似度为88.9％～100％;4群包括4株,分为2个亚群,4A亚群包括3株,相似度为84.6％ ～94.7％,4B亚群1株,相似度为72.7％.结论 吉林省食品中沙门菌血清型以肠炎沙门菌为主;PFGE结果显示相同血清型别菌株具有高度同源性.     

辽宁省肠炎沙门菌耐药性及分子分型特征

目的分析近年辽宁省腹泻病例中检出的肠炎沙门菌血清型、耐药性及分子分型。方法对辽宁地区50株沙门菌临床分离株进行血清型分型;采用微量肉汤法,进行16种抗菌药物的药敏试验;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法对选取的16株肠炎沙门菌株进行基因分型。结果肠炎沙门菌是沙门菌中的优势血清型。所有菌都对链霉素耐药。16株肠炎沙门菌分成7种型别,其中6个PFGE型别间仅有1条~3条带的差异,相似度在78.68%~100%,菌株间具有很近的亲缘关系。结论辽宁省感染性腹泻病例中沙门菌感染率较低。PFGE分子分型较多,无明显聚集性。     

2007年四川省鼠伤寒沙门菌PFGE分型及溯源

目的 用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型技术.研究四川省2007年鼠伤寒沙门菌分子流行病学,查找沙门菌污染源,为预测疫情和制定防治措施提供依据.方法 选择Xba I酶对12株鼠伤寒沙门菌全基因组DNA进行酶切,用PFGE对菌株进行分子分型,Bionumerisc统计软件聚类分析.结果 12株鼠伤寒沙门菌用XbaI限制性酶切后,分成5个PFGE图谱类型,其中1个PFGE图谱类型有7株菌株,其指纹图谱的相似性达到100%,该型别占分析菌株的58.33%.其余4个PFGE图谱类型分别有2株菌和1株菌.含7株菌的PFGE图谱型中,源于成都市的菌株4株,攀枝花、自贡和内江市的菌株各1株.结论 PFGE分子分型与流行病学资料紧密结合可增强对鼠伤寒沙门菌食源性疾病的溯源和预警.     

北京市昌平区临床分离沙门菌株分子分型与耐药分析

目的了解北京市昌平区沙门菌临床菌株血清型、分子特征及耐药性。方法对2017年昌平区分离的沙门菌进行血清分型、脉冲场凝胶电泳分型分析及药敏实验。结果 42株沙门菌主要血清型为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌。PFGE分析得到31种PFGE带型,菌株相似系数为56.9%～100.0%。沙门菌对萘啶酸、链霉素、氨苄西林和磺胺异恶唑的耐药率较高,分别为57.14%、42.86%、40.48%和40.48%;19株(45.24%)沙门菌同时耐受3种及以上抗生素。结论北京市昌平区引起腹泻的沙门菌主要为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌,对萘啶酸、磺胺异恶唑、链霉素和氨苄西林等抗生素耐药率高,多重耐药严重,且PFGE带型呈高度多态性。     

2011-2012年杭州市肠道沙门菌临床分离株的分子型别分析

目的研究2011-2012年杭州市肠道沙门菌临床分离株的型别,了解本地菌株分子流行病学特征。方法对66株肠道沙门菌临床分离株进行血清分型和多位点序列分型(MLST)。对其中主要血清型:鼠伤寒、甲型副伤寒、萨雷甲尼和肠炎沙门菌菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型。结果分布于21个血清型的66株沙门菌分成26个ST型别。发现一株纽波特沙门菌为新型ST1690。菌株血清型与MLST型别数据库中所对应的血清型符合率为100.00%。9株甲型副伤寒沙门菌的PFGE带型完全一致(P7型),与先前杭州流行菌株有差异(P1-P6型)。6株肠炎沙门菌分成4个PFGE型,型间最小相似性为92.70%。13株鼠伤寒沙门菌分为11个PFGE型,型间最小相似性为71.70%。7株萨雷甲尼沙门菌分成4个PFGE型别,型间最小相似性为91.00%。结论近年杭州腹泻病人中流行的肠道沙门菌菌株主要血清型为鼠伤寒、甲型副伤寒、萨雷甲尼和肠炎等。甲型副伤寒沙门菌菌株在杭州出现了新PFGE型别。MLST数据可以对沙门菌血清学鉴定提供一定的帮助。     

北京市不同来源非伤寒沙门菌的分子分型和耐药性分析

目的分析北京市不同来源非伤寒沙门菌的分子流行病学特征及耐药情况。方法对腹泻患者粪便和食品中分离的53株非伤寒沙门菌进行血清分型,并对所有菌株进行PFGE分型和抗生素敏感性检测。结果腹泻患者粪便来源和食品来源沙门菌的血清型分布不同,食品中分离到6株鼠伤寒沙门菌单项变种1,4,[5],12:i:-。53株非伤寒沙门菌通过PFGE分型分为31个不同的带型,每个带型包含1~10株菌,同一血清型菌株PFGE带型聚集成簇。抗生素敏感性结果显示,79.25%的菌株对至少一种抗生素耐药,其中多重耐药菌株14株。耐药率高的前三种抗生素分别是:萘啶酸60.38%、四环素35.85%、甲氧苄啶/磺胺甲恶唑18.88%。两种来源的印第安纳沙门菌的耐药情况严重。结论北京市不同来源非伤寒沙门菌的耐药情况比严重,多重耐药菌株的PFGE带型多样,加强耐药监测和分子分型网络化、合理使用抗生素意义重大。     

一起肠炎沙门菌引起的食源性疾病的溯源分析

目的查明一起食源性疾病事件的发生原因,同时对致病菌药物敏感性和同源性进行分析。方法对此次事件的7株分离株进行血清学分离鉴定、抗生素敏感性实验和脉冲场凝胶电泳(PFGE)同源性分析研究。结果此次事件的患者样本和剩余食品共检出7株肠炎沙门菌,并具有同源性,条带图谱相似度为100%。7株肠炎沙门菌抗生素敏感结果完全一致,对萘啶酸为100%耐药,对环丙沙星为100%中介,其他药物为100%敏感。结论分离到的肠炎沙门菌进行PFGE分型结果一致,提示来自同一克隆群,均为萘啶酸耐药株,本次事件确认是由肠炎沙门菌引起的食源性疾病事件,为食源性疾病的溯源和药物敏感性提供了可靠的依据。     

2017年扬州市广陵区食品和公共场所从业人员沙门菌血清学及PFGE分型研究

目的探讨扬州市广陵区食品和公共场所从业人员沙门菌感染情况与血清型和分子分型特征。方法 2017年采集食品和公共卫生服务行业从业人员肛拭子标本,进行肠道致病菌的分离培养,对分离株进行血清学分型,再以脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型和聚类分析。结果 2017年共采集肛拭子标本22 522份,检出沙门菌34株,检出率0.15%;男性0.10%,女性0.18%,差异无统计学意义(χ2=2.15,P=0.14);夏秋季检出率(0.24%)高于冬春季(0.021%),差异有统计学意义(χ2=16.9,P0.01)。分离株以C1群最多(占35.29%),其次为B群(占32.35%);以里森沙门菌(占17.64%)和鼠伤寒沙门菌(占11.76%)为优势株。将血清凝集能分型的33株沙门菌进行PFGE分型分析,检出30个型别(P1～P30),其中3株为P29型、2株为P30型,上述5株相似度为85.42%,具有高度同源性;分离出的6株里森沙门菌中5株相似度相似度为60.56%,B群中的2株和E4群中的1株相似度为64.85%、C1群中的2株相似度为69.70%,均为相似菌株;其余型别相似度50%,为流行病学不相关。结论 2017年扬州市广陵区食品从业人员沙门氏血清型以C1群和B群为主。优势株为里森沙门菌、鼠伤寒沙门菌。菌株PFGE带型较分散。     

上海市肠炎沙门菌流行特征和分子分型研究

[目的]分析上海市2006—2007年肠炎沙门菌菌株,了解上海市肠炎沙门菌分子流行病学特征。[方法]回顾2002—2007年肠炎沙门菌食品株来源并与肠炎沙门菌腹泻株作耐药性比较;对2006—2007年全球沙门菌监测(GSS)病例和食品分离的肠炎沙门菌进行表型验证、药敏试验和脉冲凝胶电泳(PFGE)分析。[结果]2006—2007年肠炎沙门菌在本市非伤寒沙门菌病例中列首位,而80%的食品株源自禽及禽肉制品,食品株的抗生素耐药性高于腹泻株。2007年肠炎沙门菌腹泻株的耐药谱和2006年有较大差异。包括13株食品株在内共76株肠炎菌株可分为21种PFGE带型,遗传同源性接近80%,优势带型依次为3型(34株)、1型(12株)、2型(5株)和5型(5株),除2型外均发现有与腹泻株同型的食源株。2006和2007年的PFGE 1/2型病例分别为4例和12例。[结论]上海市肠炎沙门菌病例与食用污染的鸡肉等禽类制品有密切关系,PFGE 3型肠炎沙门菌是目前上海市肠炎沙门菌流行株的优势菌型,2007年发现由鹅肝传播的1/2型肠炎沙门菌可能是3型的变异株并有取代之成为流行菌株的趋势。开展对腹泻病例和食物链的综合监测和以实验室为主的实时分子分型检测能快速预警肠炎沙门菌散在爆发和追溯污染源。     

2014-2016年武汉与宁波常见沙门菌血清型分离株的PFGE分型与耐药谱分析

目的分析武汉和宁波医疗机构分离的我国常见血清型沙门菌的脉冲场凝胶电泳指纹图谱及耐药谱,了解两市间沙门菌株流行病学特征及溯源关联。方法收集2014-2016年武汉和宁波医疗机构检出的114株我国最常见血清型(鼠伤寒、肠炎和德尔俾)沙门菌株,开展PFGE分型和微量稀释法检测耐药谱及聚类分析。结果在两市地方株聚类分析中,鼠伤寒分13型(相似度51.70%～100.00%),肠炎分7型(相似度76.50%～100.00%),德尔俾分21型(相似度52.40%～100.00%)。各血清型均存在源自同一个克隆株(相似度≥85.00%)而耐药谱不同的两地同源菌株,尤其检出4株宁波肠炎沙门菌与1株武汉肠炎沙门菌为无差异同一克隆株(相似度100.00%)。在两市同种类耐药谱检测中,耐药株达35.96%,氨苄青霉素耐药率最高(17.54%),多药耐药株达6.14%。在58株武汉地方株中,鼠伤寒沙门菌对四环素耐药率最高(37.50%),肠炎沙门菌对哌拉西林、头孢唑林和氨苄青霉素耐药率最高(58.33%),德尔俾沙门菌对米诺环素耐药率最高(16.67%)。在56株宁波地方株中,鼠伤寒与肠炎沙门菌对甲氧苄氨嘧啶耐药率均最高(43.75%、54.55%),德尔俾沙门菌对奈啶酸和氨苄青霉素耐药率最高(34.48%)。结论在两地PFGE分型方面,肠炎沙门菌同源性相对较高;鼠伤寒和德尔俾沙门菌同源性低、差异性大,相互传播引起遗传重组变异的概率大。在临床经验性用药方面,哌拉西林、头孢唑林和氨苄青霉素在武汉应谨慎使用,甲氧苄氨嘧啶在宁波应谨慎使用。     

上海市鼠伤寒沙门菌流行特征及分子分型研究

[目的]研究上海市2006—2007年鼠伤寒沙门菌腹泻病例株的分子流行病学特征。[方法]追溯2002—2007年食品中分离的鼠伤寒沙门菌来源,比较鼠伤寒沙门菌食源株与腹泻株的抗生素耐药性;对全球沙门菌监测(GSS)病例和食品中分离的鼠伤寒沙门菌进行血清、耐药表型和脉冲凝胶电泳(PFGE)分子分型。[结果]经培养确认的鼠伤寒沙门菌腹泻病例数,在2006—2007年本市非伤寒沙门菌型病例构成中仅次于肠炎沙门菌,食品菌株多源于禽(64.4%)和畜肉制品(17.8%),其多重耐药菌株显著高于腹泻株(P0.05)。PFGE将7株食品株和44株腹泻株分为23种带型,优势型为1型(8株)、2型(6株)、29型(4株)、49型(8株)和6型(4株),与食源菌株完全匹配的仅有49型、6型共7个病例(15.9%,7/44)。PFGE-1型腹泻株在2006和2007年分别为2例和6例,2型分别为4例和2例。[结论]上海市鼠伤寒沙门菌腹泻病例存在高度散发和分散爆发的流行特征,没有与本地食品菌株相匹配的优势克隆型分别是PFGE 2型和1型,与市售生鲜类肉食品污染株之间的遗传同源性低。推测传染源可能由输入性传染源对食品等媒介形成二次污染所致。建议加强流行病学调查,以揭示潜在的传染源和传播途径。     

温州市伦敦沙门菌和德尔卑沙门菌耐药性和分子特征研究

目的 分析2014年-2018年温州市伦敦沙门菌和德尔卑沙门菌临床分离株耐药性和分子型别特征。方法 对2014年-2018年食源性疾病腹泻患者分离得到的25株伦敦沙门菌和20株德尔卑沙门菌采用微量肉汤稀释法进行15种抗菌药物的敏感试验,并运用脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)进行分子分型。结果 实验菌株除对3种抗生素敏感外,对其余12种抗生素均有不同程度的耐药,有34株多重耐药(占75. 56%)。四环素耐药率最高(占91. 11%); 25株伦敦沙门菌用XbaⅠ酶切获得16种带型,相似度为66. 5%～100%。20株德尔卑沙门菌用XbaⅠ酶切获得10种带型,相似度为75. 4%～100%。结论 温州市食源性沙门菌耐药状况严重,PFGE带型呈现出多样性的同时又具有较显著的优势带型特点。部分带型与其对应的耐药谱具有一定的关联性。