基于16S rDNA高通量测序分析2型糖尿病腹泻患者肠道菌群的变化

目的 利用16S rDNA高通量测序技术,研究2型糖尿病腹泻患者肠道菌群的变化。方法 收集18例2型糖尿病腹泻患者和23例健康受试者的粪便样本,提取肠道菌群基因组,采用二代高通量基因测序技术,对16S rDNA V3～V4高变区进行扩增测序、生物信息学分析,比较两组人群肠道菌群结构和种类的差异。结果 Alpha多样性分析显示2型糖尿病腹泻患者肠道中菌群的丰度和多样性低于健康对照组,P<0.05。在门水平上,2型糖尿病腹泻患者组拟杆菌门占比低于健康组,P<0.05;而厚壁菌门,疣微菌门高于健康组,P均<0.05。另外,厚壁菌门/拟杆菌门比值,患者组高于健康组,P<0.05。在属水平上,2型糖尿病腹泻患者组中粪杆菌属低于健康对照组,P<0.05。结论 16S rDNA高通量测序技术有助于分析2型糖尿病腹泻患者肠道菌群多样性,为研究肠道菌群与2型糖尿病腹泻的关系提供新的思路和理论依据。     

SPF鸡不同生长阶段粪便菌群组成及多样性研究

目的 提供SPF鸡不同生长阶段肠道菌群的组成及多样性数据.方法 采集10日龄、12周龄、23周龄和52周龄SPF鸡粪便,利用Illumina HiSeq 2500高通量测序方法,对样品16S rRNA的两个高变区(V3-V4)进-测序分析,并进行了α-多样性指数、β-多样性指数和粪便群落特征分析.结果 四个生长阶段粪便样品菌群具有相似的较高的丰富度和良好的均匀度,物种多样性无显著差异(P＞0.05);厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacte ria)和拟杆菌门(Bacte roidetes丰度占95％以上;乳杆菌属(Lactobacillus)、链球菌属(Streptococcus)、拟杆菌属(Bacteroides)、肠球菌属(Enterococcus)为优势菌属,不同时期丰度差异达显著水平(P＜0.05).结论 四个生长阶段菌群组成多样,且优势菌群主要为有益菌.该实验结果能够为SPF鸡品质评定、健康监测和安全性评价提供依据.     

氨基酸配方替代喂养对重度牛奶蛋白过敏婴儿肠道菌群特征的影响

目的 探讨氨基酸配方（AAF）替代喂养对重度牛奶蛋白过敏（CMPA）婴儿肠道菌群特征的影响。方法 纳入23例确诊为重度CMPA且人工喂养的≤3月龄婴儿,采用同一品牌AAF进行喂养干预。干预前及干预3个月后,收集所有婴儿的粪便样本,通过16S rRNA高通量测序及生物信息学分析评估肠道菌群的特征变化。结果 干预前后,重度CMPA婴儿肠道菌群Chao1指数、Shannon指数、observed species指数、 Simpson指数差异具有统计学意义（P<0.05）,Beta多样性具有差异,且组间差异大于组内差异。门水平的相对丰度分析及LEfSe分析结果均显示,AAF干预后重度CMPA婴儿肠道中厚壁菌门、拟杆菌门显著富集。属水平的相对丰度分析结果显示,AAF干预后重度CMPA婴儿肠道中拟杆菌属、粪杆菌属、双歧杆菌属的相对丰度较干预前明显升高,弓形菌属、克雷伯菌属、梭菌属的相对丰度较干预前降低,LEfSe分析结果显示拟杆菌属、粪杆菌属、弓形菌属、克雷伯菌属为在丰度上有显著差异的标志物种。在种水平上相对丰度排名前10的菌群中,产气荚膜梭菌、产酸拟杆菌、丁酸梭菌、格氏乳杆菌、罗伊氏乳杆菌...     

亚健康状态人群肠道菌群结构明显失调：基于某医院150例护理人员分析

目的 探索亚健康状态人群（SHS）和健康人群之间肠道菌群是否存在差异。 方法 于2020年11月~2021年5月选取南方医科大学南方医院工作的护理人员150例作为研究对象,其中亚健康人群75例为亚健康组（SHS组）,选择75例同期健康人群作为对照组（H组）。针对16S rRNA基因的V3-V4区采用高通量测序技术,对测序结果进行多样性和物种组成差异分析。 结果 α多样性分析显示,Chao1指数在SHS组和H组间差异无统计学意义（P=0.619）,SHS组的Shannon指数升高且2组之间差异有统计学意义（P<0.001）;β多样性分析显示,2组间肠道菌群组成结构上差异具有统计学意义（R=0.227,P=0.001）;在门水平上2组均主要由拟杆菌门（Bacteroidota）、厚壁菌门（Firmicutes）、放线菌门（Actinobacteriota）组成;在属水平均主要由普雷沃菌属（Prevotella）、拟杆菌属（Bacteroides）、布劳特氏菌属（Blautia）、栖粪杆菌属（Faecalibacterium）组成;物种差异分析表明,2组在4个门3个纲3个目3个科3个属的相对丰度差异有统计学意义（P<0.05）。结论 与健康人群相比,亚健康状态人群肠道菌群结构明显失衡。     

基于16S rRNA基因测序的黄褐斑病人肠道菌群差异研究

目的：利用新一代16S rRNA测序技术比较黄褐斑病人与健康人的肠道菌群多样性和细菌表型差异。方法：纳入30例黄褐斑病人为研究组,以20名正常人作为健康对照,测序分析粪便样品中细菌群落的结构组成和表型特征。结果：研究组肠道微生物群落丰度、多样性相对降低。研究组拟杆菌门、拟杆菌纲、拟杆菌目、普雷沃菌科、拟杆菌科、普雷沃氏菌、拟杆菌属等丰度显著降低,而厚壁菌门、放射菌门、放线菌纲、乳杆菌目、双歧杆菌目、毛螺菌科、布劳特氏菌等升高,差异均有统计学意义(P<0.05～P<0.01)。结论：黄褐斑病人与健康人肠道菌群存在一定差异。     

甲亢患者肠道微生态的特征

目的 探讨甲亢患者肠道菌群的特征。方法 以15例甲亢患者作为甲亢组,15例健康志愿者作为对照组。采用Illumina Miseq高通量测序平台对甲亢组和对照组新鲜粪便样本中所有细菌的16S rRNA (16S ribosome RNA)-V3区进行DNA测序,分析操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)数量,分析肠道菌群物种的丰度,并进行聚类分析和代谢通路相关性分析。结果 样本稀疏曲线表明测序深度充分,物种多样性分析显示OTU值为24 578,微生物丰度较高,测序覆盖深度(Coverage指数)>0.99。与对照组相比,在属水平,甲亢组肠道菌群的3个丰度指数(Ace、Sobs和Chao)均低于对照组(P<0.05),2个多样性指数(Shannon和Simpson)分别低于和高于对照组(P<0.05)。30份样品共检测到13个菌门,均以厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和变形菌门占优势,差异无统计学意义。在属水平,共检测到246种菌群,对照组含有51种特有菌群,而甲亢患者肠道菌群种类显著减少,仅含有7种特有肠道菌群。甲亢组的直肠真杆菌属丰度明显低于对照组(P<0.05),ROC曲线的曲线下面积(area under the curve,AUC)为0.72。在同与免疫有关的功能代谢的相关性分析中,发现直肠真杆菌属与上皮细胞的细菌侵入这一代谢通路呈负相关(r=-0.367,P=0.046)。结论 甲亢患者肠道菌群的丰度和多样性下降,直肠真杆菌属是甲亢患者区别于健康人的明显差异菌,直肠真杆菌属丰度的降低可能与甲亢免疫机制相关。菌群的定量分析可能早期预测甲亢。     

多系统萎缩患者肠道菌群的变化

目的:探讨多系统萎缩(MSA)患者肠道菌群的变化。方法:收集2020年6月至2022年1月于郑州大学第一附属医院招募的MSA患者(MSA组)22例及其健康配偶(HC组)21例的临床资料及粪便样本,基于粪便菌群16S rRNA的测序结果,分析MSA患者肠道菌群组成和丰度的变化。结果:MSA组菌群丰度及多样性小于HC组(P<0.05)。在门水平,MSA组变形菌门丰度高于HC组,而拟杆菌门丰度低于HC组(P<0.05)。在科水平,MSA组乳杆菌科、链球菌科、肠杆菌科、肠球菌科、拜叶林克氏菌科、鞘脂单胞菌科、韦荣球菌科相对丰度高于HC组,而拟杆菌科、瘤胃球菌科相对丰度降于HC组(P<0.05)。在属水平,MSA组克雷伯氏杆菌属、柠檬酸杆菌属和利莫西乳杆菌属相对丰度明显高于HC组,而拟杆菌属、粪杆菌属、另枝菌属、芽孢杆菌属、毛螺旋菌属、副杆菌属、罗氏菌属、链球菌属、丁酸球菌属相对丰度低于HC组(P<0.05)。结论:MSA患者肠道菌群结构在门、科及属水平上均有明显变化,这些变化可能与MSA的发生有关。     

基于16S rDNA测序的帕金森病患者肠道菌群初步分析

目的对帕金森病患者的肠道菌群进行初步分析。方法收集2018年10月～2019年4月某三甲医院收治的7例帕金森病患者及7例健康对照者的粪便样本,提取菌群DNA,选取细菌16S r DNA的V3～V4区序列进行基因扩增及Illumina测序,生物信息学分析肠道菌群测序数据。结果 Alpha多样性分析中,Chao指数、Ace指数、Shannon指数、Simpson指数在两组样本间无显著统计学差异(P0.05)。在界、门分类水平上PD组及健康对照组物种数目相等,在纲、目、科、属、种、OTU分类水平上PD组所包含的物种数目依次高于健康对照组。受试样本中肠道菌群结构由4个主要的菌门组成,分别为厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门和放线菌门。在PD组中,检测到了12种显著升高的肠道菌群组分(P0.05)。结论帕金森病患者与健康对照者的肠道菌群结构在大体上是相似的,有部分菌群在两组间存在着差异,深入分析肠道菌群变化有望为研究帕金森病的发病机制、疾病预防及治疗提供新思路。     

男女泌尿生殖道微生物菌群结构分析

目的探讨男女泌尿生殖道中菌群结构差异,为临床男女泌尿生殖系统疾病研究提供可靠的病原学依据。方法运用高通量二代测序技术检测30名健康正常成年男性泌尿生殖道分泌物、29名无性生活史女性阴道分泌物和20名妊娠妇女阴道分泌物中微生物,使用生物信息学软件对三组标本进行OTU丰度分析、UPGMA聚类分析、Heatmap聚类分析、Alpha多样性分析和样品组间显著性差异分析。结果 16S r RNA基因OTU共注释出36个门、23个纲、36个目、73个科、108个属和61个物种,ITS序列OTU共注释出4个门、12个纲、23个目、28个科、43个属和52个物种。Alpha多样性分析Sobs指数、Chao指数、Ace指数、Shannon指数、Simpson指数和Coverage指数显示,各组间物种多样性差异有统计学意义(P0.05)。男性尿道分泌物与女性阴道分泌物菌群结构存在显著性差异,无性生活史女性和妊娠妇女阴道分泌物菌群结构部分相似,男性尿道分泌物与无性生活史女性阴道分泌物之间菌群组成及丰度相似的前5名物种分别为乳杆菌属、链球菌属、棒状杆菌属、葡萄球菌属和普雷沃菌属。三组之间菌群结构整体上差异显著,但仍有40种菌完全相同,均以乳杆菌属为优势菌,其次是链球菌属、假单胞菌属、加德纳菌属、芽孢杆菌属、葡萄球菌属、棒状杆菌属、普雷沃菌属、苍白杆菌属、拟杆菌属和不动杆菌属。结论乳杆菌属菌群结构改变可能会引起男女泌尿生殖系统疾病;妊娠可能改变菌群结构,性生活可能在调节男女泌尿生殖道菌群结构方面起到重要作用。     

基于宏基因组学的慢性阻塞性肺疾病急性加重患者肠道菌群结构与功能相关性研究

目的研究慢性阻塞性肺疾病急性加重（acute exacerbation of chronic obstructive pulmonary disease, AECOPD）患者的肠道菌群结构与功能基因、耐药基因、毒力因子的表达差异,探索肠道菌群在AECOPD发生发展中的作用。方法2020年12月—2021年10月,入选符合AECOPD诊断的患者共15例,并选取年龄、吸烟史相匹配的健康对照组5例,收集所有肠道粪便标本,进行宏基因测序,结合临床数据,分析AECOPD与对照组肠道菌群结构及功能等方面的差异性。结果AECOPD患者肠道微生物α多样性与对照组无统计学差异,β多样性存在差异（P=0.022）。AECOPD组栖粪杆菌属（Faecalibacterium）、布劳特氏菌属（Blautia）、厌氧棒菌属（Anaerostipes）相对丰度低于对照组,肠球菌属（Enterococcus）、Lachnoclostridium相对丰度高于对照组（P<0.05）,AECOPD信号通路富集在糖酵解Ⅰ、Ⅱ通路,肠球菌属相关的耐药基因及毒力因子表达丰度增加。AECOPD在属水平表达相对丰度较高的肠道微生物菌群为肠球菌属（Enterococcus）,其表达相对丰度与年龄呈正相关（P<0.05）;肠球菌属表达丰度与耐药基因msrC、efmA表达丰度呈正相关（P<0.05）,与毒力因子acm、EcbA/fss3表达丰度呈正相关（P<0.05）。栖粪杆菌属、布劳特氏菌属、厌氧棒菌属的表达丰度与AECOPD用力肺活量（force vital capacity, FVC）呈正相关（P<0.05）;布劳特氏菌属、厌氧棒菌属的表达丰度与BMI呈正相关（P<0.05）;布劳特氏菌属、厌氧棒菌属两者的表达丰度呈正相关（P<0.05）;Lachnoclostridium属的表达丰度与血液中CD4+/CD8+T淋巴细胞比例呈正相关（P<0.05）。结论AECOPD患者肠球菌属（Enterococcus）相对丰度高,栖粪杆菌属、布劳特氏菌属、厌氧棒菌属相对丰度较低,信号通路富集在糖酵解相关代谢通路。栖粪杆菌属、布劳特氏菌属、厌氧棒菌属的表达丰度与临床指标FVC及T淋巴细胞比例存在一定的相关性,提示肠道微生态的失衡可能通过“肠-肺轴”参与AECOPD的发生发展。     

基于16S rDNA测序探索食管鳞状细胞癌患者肠道菌群特征

背景 食管癌是我国的高发肿瘤之一,其发病与死亡人数均为世界平均水平的2倍以上。在我国大多数食管癌发现时已是中晚期,预后较差,所以迫切需要早期诊断及干预治疗,目前肠道菌群在食管癌诊断及治疗中的作用备受关注。目的 探索食管鳞状细胞癌患者肠道菌群基本特征。方法 纳入2022年4—8月就诊于河北医科大学第四医院未经任何抗肿瘤治疗的食管鳞状细胞癌患者35例作为食管癌组,健康志愿者35例作为对照组。收集两组人群粪便标本,应用16S rDNA技术检测肠道菌群,根据检测结果物种注释情况分析两组人群肠道菌群的Alpha多样性、Beta多样性[主坐标分析（PCoA）]及菌群物种差异性[线性判别分析及影响因子（LEfSe）分析]。结果 两组人群肠道菌群Alpha多样性香农（Shannon）、辛普森（Simpson）、Chao1、ACE及Goods＿coverage指数比较均无明显差异（P>0.05）;而PCoA图显示两组样本整体上相距较远,群落结构存在差异（t=10.837,P<0.001）。两组人群肠道菌群T-test检验结果在属水平共有16类菌属的丰度存在明显差异,相对丰度较高的前8位菌属中...     

树鼩粪便细菌分离培养与鉴定

目的 了解人工饲养树鼩粪便菌群多样性,为树鼩的正常饲养繁殖和微生物质量控制标准化提供依据。方法 随机采集10份树鼩粪便样品,利用有氧及厌氧培养基进行细菌分离培养,提取细菌基因组DNA后PCR扩增16SrRNA基因并测序鉴定。结果 本实验从树鼩粪便样品中,经有氧培养分离鉴定出25株、12种细菌,经厌氧培养分离鉴定出25株、10种细菌,包括变形杆菌属、肠球菌属、埃希菌属、志贺菌属、葡萄球菌属、气单胞菌属、拉恩氏菌属、拉乌尔菌属、微小杆菌属、链球菌属、明串珠菌属。结论 树鼩肠道好氧菌及厌氧菌具有丰富的种属多样性,普通变形杆菌群、费格森埃希菌群和屎肠球菌群可能是树鼩肠道的主要寄生菌群。     

初诊IgA肾病患者的肠道菌群及其与疾病进展因素的相关分析

目的: 观察慢性肾脏病(chronic kidney disease，CKD)1~2期的初诊IgA肾病患者肠道微生物群的特征，进一步探索IgA肾病疾病进展因素与肠道微生物之间的关系。方法: 收集19例CKD 1~2期的初诊IgA肾病患者和15例年龄、性别相匹配的健康对照组的新鲜粪便样本，提取粪便细菌DNA，针对V3-V4区域进行16S核糖体RNA(16S ribosomal RNA，16S rRNA)高通量测序分析肠道菌群的组成，应用Illumina Miseq平台对粪便菌群测序结果进行分析。收集初诊IgA肾病患者的疾病进展因素，研究肠道菌群与IgA肾病疾病进展因素之间的相关性。结果: (1) 与健康对照组相比，在门水平上，拟杆菌门(Bacteroidetes)的丰度显著降低(P=0.046)，放线菌门(Actinobacteria)的丰度显著升高(P=0.001)。在属水平上，埃希菌-志贺菌属(Escherichia-Shigella)、双歧杆菌属(Bifidobacterium)、Dorea等菌属的丰度显著升高(P < 0.05)，毛螺菌属(Lachnospira)、粪球菌属_2(Coprococcus_2)、萨特氏菌属(Sutterella)等菌属的丰度显著降低(P < 0.05)。(2)初诊IgA肾病患者与健康对照组之间肠道菌群的丰度比较差异无统计学意义(P>0.05)，但两组肠道菌群的组成存在差异。LEfSe分析结果显示，初诊IgA肾病患者和健康对照组比较有16个差异菌，其中，初诊IgA肾病患者肠杆菌目(Enterobacteriales)、放线菌门、埃希菌-志贺菌属等的丰度升高，健康对照组拟杆菌门、毛螺菌属的丰度升高。(3)冗余分析(redundancy analysis，RDA)的结果显示，初诊IgA肾病患者粪便中双歧杆菌属与血清IgA水平、24 h尿蛋白定量和合并高血压呈正相关，Lachnoclostridium菌属与合并高血压呈正相关，埃希菌-志贺菌属与尿红细胞数量呈正相关，双歧杆菌属与毛细血管内增殖呈正相关，粪杆菌属与细胞/纤维细胞性新月体呈正相关，瘤胃球菌属_2(Ruminococcus_2)与系膜细胞增殖、肾小球节段硬化、肾小管萎缩/间质纤维化呈正相关。结论: 初诊CKD 1~2期IgA肾病患者的肠道菌群与健康对照相比存在差异，肠道的某些菌属与IgA肾病疾病进展因素呈相关性，需要进一步的研究来了解这些菌属在IgA肾病中的潜在作用。     

中老年痰湿质人群肠道菌群结构特征研究

目的 探究中老年痰湿质与平和质人群肠道菌群样品在物种分类、丰度及多样性等方面的差异,找出中老年痰湿质人群肠道的特征功能菌群,以期为痰湿质与代谢性疾病相关性研究提供肠道微生物层面的依据。 方法 选择于2017年5月—12月在浙江医院中医内科就诊或体检中心行健康体检的人群为研究样本,通过中医体质辨识软件结合专业人员辨证,纳入痰湿质与平和质各30人,采集粪便样品并对其总RNA进行提纯,用Miseq测序仪进行基于16SrRNA的生物多样性测序,利用R(v3.1.1)软件对样品的物种分类、丰度、多样性及组间差异等进行统计分析。 结果 ①各样品间菌群构成及相对丰度均存在差异,但主要构成菌种均为拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)及放线菌门(Actinobacteria)。②痰湿质组的observed species指数、chao指数、ACE指数及shannon指数均小于平和质组(均P<0.05),simpson指数大于平和质组(P<0.05)。③痰湿质组拟杆菌门(38.439±13.545)相对丰度低于平和质组(46.669±12.984),厚壁菌门(52.802±13.861)相对丰度高于平和质组(45.742±12.990),差异有统计学意义(均P<0.05)。 结论 痰湿质人群肠道菌群的丰度及多样性均显著降低;拟杆菌门相对丰度降低及厚壁菌门相对丰度升高为痰湿质人群肠道菌群的重要结构特征。      

成都地区中老年人肠道菌群与其血糖、血脂代谢关系的初探

目的 调查成都地区中老年人肠道菌群组成与其血脂、血糖代谢间的可能关系。方法 于2016年11月在成都市纳入51例中老年人,收集其血液及粪便样本,测定其血糖、血脂,使用Illumina高通量测序技术对粪便样本中肠道菌群的丰度、多样性及菌种组成进行详细分析。结果 受试中老年人粪便细菌主要为厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、梭杆菌门、放线菌门、疣微菌门。高血糖受试中老年人的粪便细菌多样性（Shannon指数）低于血糖正常的受试中老年人（P<0.05）,但是Shannon指数和血脂无明显关系。在粪便细菌门水平上:变形菌门、拟杆菌门分别在高血糖的中年、老年女性受试者粪便中的比例高于血糖正常受试中年、老年女性（P<0.05）。在粪便细菌属水平上:粪杆菌在高血糖受试中老年人粪便中的比例降低（P<0.05）,且其丰度与血糖水平呈负相关（r=－0.278,P=0.048）;普氏菌属、帕拉普氏菌属在高血脂组的比例降低（P<0.05）,且均与血脂水平呈负相关（r=－0.357,P=0.10;r=－0.365,P=0.008）。结论 不同血糖、血脂水平的中老年人其肠道菌群的构成和数量存在显著差异,表明肠道菌群与中老年人血糖、血脂代谢可能有着密切的关系,在中老年人血糖、血脂相关疾病的预防及治疗中可能有重要意义。     

基于16S rRNA测序对树鼩肠道菌群特征与高级别肉瘤的相关性分析

目的检测高级别肉瘤的树鼩肠道微生物菌群结构,为探讨肠道微生物菌群结构的改变与肿瘤发生的相关性提供科学依据。方法选取3例患有恶性高级别肉瘤树鼩粪便为CA组,6例健康树鼩粪便为对照NO组。通过16SV3+4区引物进行细菌多样性的鉴定,通过对Reads剪切过滤,OTUs聚类,并进行物种注释及丰度分析,得出两组树鼩肠道微生物结构、丰度以及多样性。结果比较CA组和NO组树鼩肠道微生物结构,多样性指数Chao1指数值、ACE指数值、Shannon指数值差异无统计学意义(P0.05)。NO组的树鼩肠道菌群OTUs为640种,而CA组为494种,健康树鼩肠道菌群结构呈多样性。在门水平上比较,其中CA组中螺旋体门(Spirochaetes)丰度为0.03%,低于NO组(丰度为0.12%),且差异有统计学意义(P0.05);CA组厚壁菌门(Firmicutes)丰度为77.79%高于NO组(47.65%),但差异无统计学意义;CA组的拟杆菌门(Bacteroidetes)丰度为0.75%低于NO组(8.31%),但差异无统计学意义。CA组中的乳杆菌属(lactobacillus)是具有统计学意义的生物标识。结论患有高级别肉瘤树鼩的肠道菌群结构丰度和多样性低于健康树鼩,肠道菌群的结构改变及厚壁菌门含量增加可能增加恶性肿瘤的发生。     

清肺通络合剂对气阴两虚兼痰热型社区获得性肺炎患者肠道菌群多样性的影响

目的 探讨中药清肺通络合剂（QFTLM）对气阴两虚兼痰热型社区获得性肺炎（CAP）患者肠道菌群多样性的影响。方法 采用前瞻性临床对照研究方法,根据患者采用的治疗方法不同,将23例气阴两虚兼痰热型CAP患者分为两组：予抗菌药物治疗组10例,予抗菌药物联合QFTLM治疗组13例。收集治疗前后患者粪便样本46份,利用PacBio测序平台进行16S rRNA测序,分析两组患者治疗前后样本中肠道菌群的组成、多样性和显著性差异物种。结果 （1）两组治疗前后肠道菌群的组成：在门水平为厚壁菌门、变形杆菌门、拟杆菌门、疣微菌门和放线菌门;在纲水平为梭菌纲、革兰阴性菌纲、芽孢杆菌纲、丹毒丝菌纲、拟杆菌纲、γ-变形杆菌纲、疣微菌纲和放线菌纲;在目水平为拟杆菌目、梭菌目、单胞菌目、肠杆菌目、乳杆菌目、丹毒丝菌目和颤螺菌目;在科水平为拟杆菌科、乳球菌科、肠杆菌科、韦荣球菌科、艾克曼菌科、毛螺菌科、喜热菌科、链球菌科、丹毒丝菌科和肠球菌科;在属水平为拟杆菌属、粪杆菌属、埃希氏菌属、罕见小球菌属、巨单胞菌属、艾克曼菌属、梭菌属、链球菌属和肠球菌属。（2）两组治疗前后梭菌纲的相对丰度抗菌药物组治疗前后为（0.48±0...     

弥漫大B细胞淋巴瘤患者肠道菌群动态分析

目的:追踪1例弥漫大B细胞淋巴瘤,观察该患者肠道菌群结构的动态变化,研究肠道菌群与疾病进展的联系。方法:收集1例初诊血液恶性肿瘤中的弥漫大B细胞淋巴瘤患者入院当天、第16天时第1次化疗及第30天时第2次化疗后样本,通过16S rDNA技术分析肠道菌群多样性和差异性。结果:初诊时肠道菌群分布主要为韦荣球菌属、拟杆菌属、粪杆菌属、萨特菌属、链球菌和普氏菌属。16 d后韦荣球菌属、拟杆菌属、普氏菌属占优势。30 d后菌群主要为梭状芽孢杆菌属、拟杆菌属及布劳特氏菌。该例血液恶性肿瘤淋巴瘤患者厚壁菌门丰度始终占明显优势,而益生菌双歧杆菌属及乳杆菌属始终丰度极低,随疾病的进展,梭杆菌门几乎消失。粪球菌属及布劳特氏菌随病情进展逐渐上升,梭状芽孢杆菌属及大肠埃希菌属总体也呈上升趋势。萨特菌属、链球菌、副杆菌属明显下降,普氏菌属、小杆菌属及梭杆菌属及丁酸球菌属几乎消失。香茅梭菌增加,益生菌狄氏副杆菌及Butyricicoccus pullicaecorum减少。而被认为与肿瘤细胞凋亡有关的糖精梭菌增加,考虑与治疗有效相关。结论:随病程的进展,血液恶性肿瘤患者的肠道菌群结构发生改变,可为血液恶性肿瘤的治疗方案提供新思路。     

神曲消食口服液对肠道微生态影响的动物研究

目的 探讨神曲消食口服液治疗儿童消化不良的机制。方法 采用盐酸林可霉素灌胃C57小鼠进行小鼠消化不良造模,灌胃给药“妈咪爱”或神曲消食口服液进行治疗,正常组灌胃等体积的无菌生理盐水。利用16S r DNA高通量测序技术,检测各组小鼠肠道菌群多样性变化。结果 与空白组相比,模型组小鼠体重显著降低(P0.05)。高通量测序结果显示,与空白组相比,模型组小鼠肠道微生物多样性指数降低(Shannon指数,P0.05),在门和属的水平上,肠道微生物多样性均降低。经神曲消食口服液治疗后,小鼠体重明显增加(P0.05),肠道微生物多样性指数升高(Shannon指数,P0.05),肠道微生物多样性增加。在门的水平上,硬壁菌门(Firmicutes)丰度增加(P0.05),变形菌门(Proteobacteria)丰度降低(P0.05)。在属的水平上,小鼠肠道内益生菌乳酸杆菌属(Lactobacillus)的丰度增加(P0.05),有害菌巴氏杆菌属(Pasteurella)的丰度显著降低(P0.05)。结论 采用神曲消食口服液治疗能增加小鼠肠道菌群多样性,恢复小鼠肠道微生态平衡。神曲消食口服液治疗儿童消化不良可能与肠道乳酸杆菌增加有关。     

过敏性哮喘患者肠道菌群特征分析

目的 分析过敏性性哮喘患者肠道菌群组成特点,以期为开发新的临床治疗方法提供理论基础。方法 收集2021年1月—2021年12月就诊于河北省中医院的过敏性哮喘患者（14例）以及同期健康人群（15例）的粪便标本,采用16S rRNA分析入组人员肠道菌群的菌群结构组成和多样性特征。结果 过敏性哮喘组和对照组的年龄、性别、体重指数及吸烟史差异无统计学意义（均P>0.05）。α多样性分析结果表明两组菌群丰富度存在显著差异（P<0.05）,而两组肠道菌群的多样性程度差异无统计学意义（P>0.05）。β多样性分析结果提示过敏性哮喘组与对照组的菌群结构组成存在显著差异（P<0.05）。两组在属水平的差异菌为粪杆菌属（Faecalibacterium）、罗氏菌属（Roseburia）、另枝菌属（Alistipes）、鞘脂单胞菌属（Sphingomonas）、多尔氏菌属（Dorea）、瘤胃球菌科（Ruminococcaceae＿UCG-002）、链霉菌属（Streptomyces）、凸腹真杆菌属（[Eubacterium]＿ventriosum＿group）、丁酸球菌属（Butyr...