岗梅全长转录组测序及其三萜皂苷生物合成相关基因的挖掘

目的:获得岗梅全长转录组数据库,为深入挖掘岗梅功能基因奠定基础。方法:采用基于PacBio Sequel平台的单分子实时测序技术获取岗梅的根、茎、叶样品的转录组数据,并利用非冗余蛋白(NR)、核苷酸序列(NT)、SwissProt蛋白序列数据库、京都基因与基因组百科全书(KEGG)、真核生物相邻类的聚簇(KOG)、蛋白家族(Pfam)、基因本体(GO)进行注释,分析并鉴定编码三萜皂苷生物合成的关键酶的转录本。结果:全长转录组共获得89629个转录本,其中81313个在公共数据库进行了注释。KEEG代谢通路富集分析表明,623个转录本参与岗梅中三萜皂苷合成相关的3条代谢通路,其中263个转录本编码了三萜皂苷生物合成途径的21个关键酶。此外,还预测了2471个转录因子、40421个简单重复序列位点、22119个长链非编码RNA(lncRNA)和29131个mRNA。结论:丰富了岗梅的转录组数据,并为鉴定参与三萜皂苷和其他次生代谢物生物合成的候选基因提供参考,促进其分子生物学和基因组学的研究。     

非靶向代谢组学揭示天葵不同部位差异代谢物及其主要代谢途径

目的:利用非靶向代谢组学挖掘天葵非药用部位潜在的药用价值。方法:以天葵茎、叶、花为材料,利用超高效液相色谱-质谱法对其进行非靶向代谢组学分析。结果:天葵茎、叶、花中共鉴定出16大类101个差异代谢物(DAMs),其中包含羧酸及其衍生物、有机含氧化合物、脂质、苯及其取代衍生物、生物碱、黄酮类、萜类、苯丙素类、酚酸类、核苷酸、有机盐、内酯、有机酸、内源性植物激素、氨基酸和13个其他物质。通过聚类和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析发现,天葵不同部位的DAMs代谢模式存在一定的差异;其主要代谢途径为苯丙氨酸代谢途径、ABC转运途径、氨酰-tRNA合成途径及苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸生物合成途径。结论:通过天葵不同部位间DAMs的鉴定及其生物合成途径的分析,确定天葵茎、叶、花富含多种具有药用功效的代谢活性物质,可为天葵茎、叶、花的资源开发利用提供参考。     

天仙藤全长转录组测序及分析

目的:获得天仙藤全长转录组数据库,挖掘天仙藤功能基因。方法:采用PacBio SequeⅠ高通量测序系统,对天仙藤的茎、叶、果3个部位的混合样品进行全长转录组测序及分析。结果:共获得176354条环形一致性序列(CCS),获得184439个高质量isoforms,并注释了139826个isoforms,检测出3058个转录因子和135527个简单序列重复(SSR)位点,还预测到76862个长链非编码RNA(lncRNA)和36204个mRNAs。结论:获得了较可靠的天仙藤全长转录组数据,可为深入研究天仙藤基因组、生物学特性、相关代谢途径、信号通路及其分子机制提供数据支持。     

仙鹤草茎与叶的代谢组学比较分析

目的 通过代谢组学分析仙鹤草茎与叶中代谢物及其代谢通路差异,进一步阐明仙鹤草药效物质基础,促进仙鹤草合理开发利用。方法 取仙鹤草茎、叶新鲜样本,经液氮冷冻后提取代谢物,采用液相色谱-质谱法检测,所得数据运用统计学方法分析并与数据库比对鉴定。结果 筛选并鉴定出105个具有明显差异的代谢物,其中茎与叶相比有34个代谢物上调、71个代谢物下调。差异代谢物共注释到62条代谢通路中。茎中叶黄素、天冬酰胺、胍丁胺及多种氨基酸等物质含量更高,氨基酸代谢更强;叶中酚酸类、黄酮类物质积累更为丰富,次生代谢更强。结论 仙鹤草茎与叶均含有丰富的药效活性成分,但叶的次生代谢更强,次生代谢物积累更为丰富,此差异或可为仙鹤草针对性开发利用提供参考。     

马鞭草全长转录组测序分析

目的:利用高通量测序技术获得马鞭草Verbena officinalis L.的全长转录组基因信息。方法:通过PacBio Sequel高通量测序平台,对马鞭草根、茎、叶3个部位的混合样品进行全长转录组测序,并基于序列同源性对转录本进行功能注释,得到马鞭草全长转录组的遗传信息。结果:测序数据经过质控后获得197542个高质量的转录本及169063条环形一致性序列(CCS),检测出4955个转录因子。其中161062个(81.53%)转录本在非冗余蛋白(NR)、真核生物相邻类的聚簇(KOG)数据库、京都基因与基因组百科全书(KEGG)、基因本体(GO)数据库、蛋白家族(Pfam)数据库和SwissProt蛋白序列数据库中均得到注释。MISA分析发现54063个简单重复序列(SSR)位点,还预测到70050个长链非编码RNAs(lncRNAs)和45499个信使核糖核酸(mRNAs),并在马鞭草全长转录组中共鉴定到了60个转录本可能参与单萜类化合物的生物合成。结论:利用高通量测序技术和生物信息学分析获得了马鞭草的全长转录组信息特征,可为后期开展马鞭草功能基因鉴定、解析萜类化合物次生代谢途径及其调控机制提供参考。     

论生物多样性与中药资源可持续发展

通过对生物多样性、中药资源以及可持续发展三个概念的论述,讨论了中药资源开发和利用对生物多样性保护所构成或潜在的威胁,阐述了生物多样性保护在现代中药资源开发中的重要作用,针对面临的情况提出相应的解决办法及措施,实现中药资源的可持续发展与保护生物多样性的协调发展.     

人参皂苷Re拮抗肠缺血/再灌注致肺损伤机制中抗炎抗氧化作用研究

目的建立大鼠肠缺血/再灌注(Ⅱ/R)致肺损伤模型,观察人参皂苷Re的抗炎抗氧化作用。方法 32只SPF级雄性SD大鼠(240²60 g)随机分为4组(n=8),假手术组(S组)、肠缺血/再灌注组(Ⅱ/R组,即M组)、Ⅱ/R+人参皂苷Re高剂量组(Re-H组)、Ⅱ/R+人参皂苷Re低剂量组(Re-L组)。建立肠缺血1 h再灌注2 h损伤模型。大鼠再灌注末取腹主动脉血,检测血清中TNF-α、IL-6、IL-10、SOD和MDA水平;取肺组织标本进行病理学检查和湿/干比测定。结果与S组相比,M组肺组织湿/干比明显增加(P<0.01),肺脏损伤明显,血清中IL-6、TNF-α、IL-10和MDA含量显著升高,同时SOD活力下降(P<0.05或P<0.01);与M组比较,Re-H组和Re-L组可显著改善上述变化(P<0.05或P<0.01),肺组织损伤程度减轻。结论人参皂苷Re预处理可通过提高机体抗氧化、抗炎能力对肠缺血/再灌注所致肺损伤起到保护作用。     

八角果实及枝叶亚临界CO2萃取挥发油化学成分的GC-MS分析

八角Illicium verumHook.f.,为木兰科八角属植物,又叫八角茴香(《本草纲目》)、大茴香、唛角(广西壮语),是我国南方重要的“药食同源”经济树种,主产于广西,福建、广东,云南也有部分种植[1]。八角是我国传统著名的调味香料,也供药用,其味辛、性温,有祛风理气、和胃调中、温阳散     

苦石莲化学成分研究

目的：系统研究苦石莲的化学成分，为进-步开发苦石莲和制定苦石莲药材定量分析标准提供科学根据。方法：利用硅胶、凝胶和制备薄层等常规色谱分离方法进行化合物分离，采用波谱技术和化学方法鉴定化合物的结构，并对苦石莲各萃取物、水溶部位和caesalmin C（化合物2）进行了流感甲型病毒活性的抑制作用试验。结果：从苦石莲乙醇提取物中分离得到9个化合物，分别鉴定为norcaesalnin E（化合物1）、caesalmin C（化合物2）、5-羟甲基-2-呋喃醛（化合物3）、胡萝卜苷（化合物4）、蔗糖（化合物5）、β-谷甾醇（化合物6）、硬脂酸（化合物7）、咖啡酸十八醇酯（化合物8）、2，5-二羟基苯甲酸乙酯（化合物9），活性试验结果表明，乙酸乙酯萃取物和化合物2对流感甲型病毒活性的抑制作用最强。结论：除化合物2外，其他8个化合物均为首次从该植物中分离得到；化合物2可以作为有效成分定量分析苦石莲质量。     

八角果实及枝叶亚临界C02萃取挥发油化学成分的GC-MS分析

八角Illicium verum Hook.f.,为木兰科八角属植物,又叫八角茴香(<本草纲目>)、大茴香、唛角(广西壮语),是我国南方重要的"药食同源"经济树种,主产于广西,福建、广东,云南也有部分种植[1].