染色体1q22区域遗传变异影响胃癌易感性的生物学机制研究

  目的  探索染色体1q22区域易感基因在胃癌发生中的作用和机制。  方法  基于genotype-tissue expression（GTEx）数据库，鉴定候选易感基因；通过人群样本进行基因差异表达分析，并通过细胞和动物实验探究易感基因在胃癌发生中的作用；通过全转录组测序探究候选易感基因在胃癌发生中参与的下游通路和机制。  结果  表达数量性状基因座（expression quantitative trait loci，eQTL）分析证实rs760077基因型与THBS3、GBA和GBAP1基因的表达水平均显著相关（P值分别为1.20×10-21，1.80×10-4和3.49×10-17）。差异表达分析和功能学实验证实GBAP1在胃癌组织中呈现高表达状态，并且敲低GBAP1后能够显著抑制胃癌细胞增殖能力。全转录组测序表明GBAP1能够影响PHGDH、PSAT1和PSPH基因的表达水平并参与包括甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸代谢和一碳代谢在内的多种代谢通路。  结论  本研究证实1q22区域的遗传变异可以通过调控促癌基因GBAP1的表达，影响氨基酸合成代谢通路关键酶基因PHGDH、PSAT1和PSPH的表达，从而促进胃癌的发生。      

规律服药的糖尿病患者体力活动水平与糖化血红蛋白控制状况的关系

  目的  了解遵医嘱规律服药的糖尿病患者体力活动水平与糖化血红蛋白控制状况之间的关系，为糖尿病患者的健康干预提供依据。  方法  于2014-2016年间收集南京化工园区5家社区卫生服务中心纳入管理的遵医嘱规律服药的2型糖尿病患者作为研究对象。采用单因素和多因素非条件Logistic回归模型，研究不同性别2型糖尿病患者体力活动水平与糖化血红蛋白的关系。  结果  本研究纳入分析1 272人，其中男596例(46.9%)，女676例(53.1%)，平均年龄为(64.63±9.04)岁。按性别分层分析结果显示，体力活动水平充足的男性糖尿病患者的糖化血红蛋白达标率为体力活动水平不充足男性患者的2.11倍(95%CI:1.17~3.78，P=0.013)，女性患者中二者差异无统计学意义。  结论  加强遵医嘱规律服药的糖尿病患者体力活动水平可以帮助血糖的控制。     

大数据时代的临床医学研究——机遇和挑战

临床医学研究是医学发展的核心驱动力。在大数据背景下,国家高度重视、重点支持,通过顶层设计为我国临床医学研究提供制度保障和资源支撑。多组学与信息技术的飞速发展,为我国临床医学研究提供了宝贵的资源,助力临床医学研究内容的持续创新,催化临床诊疗模式的不断变革,我国临床医学研究正面临新的机遇。然而,目前我国生物医学大数据还存在存储碎片化、数据交汇机制缺乏等问题,亟需建立政府主导的数据共享机制,寻求通力合作的研究模式。在新的时代背景下,依托大数据的真实世界研究将逐渐成为临床干预的重要证据来源,我们要加强临床数据资源和生物样本资源的积累,创新研究方法,打破传统思维模式,迎接新的机遇与挑战。     

外周血相对端粒长度与头颈部鳞癌死亡风险的关联研究

目的:探讨中国汉族人群中端粒长度与头颈部鳞癌患者死亡风险的关联?方法:应用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)技术检测241例头颈部鳞癌患者外周血DNA端粒相对长度,结合临床信息和随访资料,进行端粒长度与头颈部鳞癌死亡风险的关联分析?通过Kaplan-Meier方法和Log-rank检验比较生存时间差异,COX比例风险回归模型估计风险比(hazard ratio,HR)及95%CI?结果:将头颈部鳞癌病例按照端粒长度的三分位数分为3组后,端粒长度由短至长的第1?2和3组的平均生存期显著增加(分别为40.46?41.76和46.18个月,趋势性P=0.009)?与相对端粒长度<1.19的患者相比,相对端粒长度>1.49的患者死亡风险显著降低(HR:0.40,95%CI:0.20~0.80)?分层分析结果表明,较长的端粒长度与头颈部鳞癌患者死亡风险的关联在<62岁的患者?女性?不吸烟者以及不饮酒者中更为显著?结论:端粒长度可能与头颈部鳞癌患者的预后存在一定关联,还需要其他更大样本的研究进一步验证?     

孕中晚期胎儿宫内生长的影响因素研究

目的：探讨影响胎儿孕中晚期宫内生长的母体和孕期相关因素。方法：收集在南京医科大学附属妇产医院产检并分娩的孕妇孕期B超监测数据及母体和孕期健康相关信息。纳入在2016年8月—2019年5月孕满20周并在孕22~24周、孕30~32周和孕34~36周均有B超检查的单胎活产家庭,共计1 457个家庭。本研究通过B超采集的胎儿双顶径（biparietal diameter,BPD）、头围（head circumference,HC）、腹围（abdomen circumference,AC）和股骨长（femur length,FL）数据,计算获得胎儿估计体重（estimated fetal weight,EFW）,并采用混合线性模型分析孕中晚期宫内生长的影响因素。结果：在多因素分析中发现,母亲年龄与孕22~24周、孕30~32周和孕34~36周的EFW均呈正相关;与孕前体重指数（body mass index,BMI）在正常范围（18.5 kg/m2≤BMI<24 kg/m2）的母亲相比,孕前BMI偏低（BMI<18.5 kg/m2）的母亲孕30~32周和孕34~36周胎儿更小,孕前超重或肥胖的母亲（BMI>24 kg/m2）胎儿更大;女胎EFW在孕22~24周、孕30~32周和孕34~36周始终显著小于男胎。此外,发现孕前痛经与孕期EFW呈显著负相关。结论：母亲年龄、孕前BMI、胎儿性别以及痛经可能影响胎儿估计体重。     

利用因果森林估计异质性人群下个体的处理效应

目的 探讨因果森林在异质性人群中估计个体处理效应的有效性及如何应用于实例数据以挖掘异质性人群特征。方法 设计4种模拟方案,通过模拟试验验证因果森林在不同处理效应环境设置下对个体处理效应进行估计的效果,并应用于右心导管插入术实例数据集进行分析。结果 模拟试验结果表明,在4种不同效应值设置下,用因果森林方法所估计的个体处理效应值都能与总体效应相吻合,符合预期分布;实例数据分析结果显示绝大多数患者个体处理效应为正值,使用RHC会导致该样本人群180 d死亡率增高,2月生存模型估计概率和白蛋白含量偏低的患者在使用RHC后更倾向于有较低的死亡风险。结论 因果森林能够有效地估计个体处理效应,为个体是否接受某种处理提供建议。     

全球结核分枝杆菌谱系分布与耐药分析

  目的  绘制全球结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis complex, MTBC)地理分布图,描述不同地区的MTBC主要谱系分布及耐药情况。  方法  利用TB-Profiler平台MTBC全基因组测序数据和耐药检测结果,绘制全球MTBC谱系分布图,并根据不同地域、亚谱系的层次结构进行可视化分析。  结果  Lineage 4谱系在全球分布最广,Lineage 2谱系耐药发生率最高。  结论  世界范围内MTBC谱系的地理分布及不同谱系间耐药情况存在差异。     

多基因遗传风险评分指导肺癌个体化筛查的前瞻性队列研究

目的探索如何利用遗传风险评分,制订个体化的肺癌筛查方案。方法利用中国慢性病前瞻性研究(CKB)队列10个地区100615例具有全基因组基因分型信息的样本,根据前期课题组发表的19个遗传变异构建肺癌多基因遗传风险评分PRS-19。以55岁且吸烟剂量30包/年人群的5年绝对发病风险为参考届值,在吸烟者和非吸烟者中分别计算不同遗传风险人群5年肺癌绝对发病风险随年龄和吸烟剂量的变化趋势,并绘制5年绝对发病风险分布图,从而判断不同遗传风险人群达到参考界值时的理论年龄或吸烟剂量。根据上述结果给出不同遗传风险人群参加肺癌筛查起始年龄的具体建议。结果CKB队列中55岁吸烟者,当吸烟量为30包/年时,5年内发生肺癌的绝对风险为0.67%。在吸烟者中,随着遗传风险增加,其5年绝对发病风险呈不断上升趋势,对于高遗传风险人群应降低筛查起始年龄,遗传风险最高的1%人群建议从50岁开始进行筛查;若保持筛查起始年龄55岁不变,则应在高遗传风险人群中降低吸烟剂量标准;不管累积吸烟剂量为多少,遗传风险最高的1%人群都应纳入肺癌筛查。在非吸烟者中,高遗传风险人群同样具备筛查价值,建议遗传风险最高的1%人群从62岁起进行肺癌筛查,而对于遗传风险最低的5%人群,当年龄达到74岁时才可达到参考届值。结论对于不同遗传风险的个体,可采用个体化的肺癌筛查方案,对于高遗传风险的吸烟者可减小肺癌筛查起始年龄或吸烟剂量,而我国高遗传风险的非吸烟者同样具备筛查价值。     

中国国家出生队列研究质量控制策略与措施

出生队列是研究孕前和孕期各种环境暴露因素与胎儿、婴幼儿、青少年健康之间关系的有效方法。出生队列建设周期长、环节众多,研究质量可能受到多种因素的影响。本文对中国国家出生队列建设过程中的各项质量保证和质量控制措施进行梳理,归纳总结建设经验。以期为相关队列研究提供经验,减少相关因素对队列研究的影响,提升队列研究质量。中国国家出生队列在质量保证的顶层设计方面采取一系列措施保障研究质量,包括研究中心筛选、成员管理系统开发、标准化操作流程制定及工作人员规范化培训;在质量控制方面,包括针对队列数据产生过程的实时、及时、定时质控,针对生物样本采集、处理及保存的全周期质控,以及针对参与工作人员的培训、督查和量化考核的全面立体质控。     

中国国家出生队列建设背景和设计简介

随着生活行为方式、自然和社会环境的急剧变化,育龄人口生殖健康状况持续下降,快速增加的由辅助生殖技术（ART）孕育的子代的远期健康状况亟待评估。因此,妇幼保健和生殖健康相关研究关注的重点亟需从妊娠期、围产期的死亡和严重疾病表型逐渐向全生命周期和全疾病谱拓展。为了满足这样的研究需求,在我国12个省（自治区、直辖市）启动了中国国家出生队列（China National Birth Cohort）建设,计划以家庭为单位,招募3万个自然妊娠家庭和3万个ART家庭的人群,并对夫妻双方以及孕育的子代开展长期随访,收集夫妻和子代的环境暴露、生殖生育、精神心理、行为习惯等多方面暴露数据。同时采集外周血、尿液、脐血、卵泡液和精浆、精子等多种类型的生物样本。该出生队列对于我国妇幼健康和生殖医学研究具有极其重要支撑作用和深远影响。本文即是对国家出生队列的建设概况和基本设计做简要介绍。