巴戟天遗传多样性的RAPD研究

目的应用随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)标记技术对广东产5个类群的栽培巴戟天进行遗传多样性研究。方法应用15种引物对64个个体进行检测,应用Popgen32软件分析群体的遗传多样性。结果共得到224条带,其中多态位点112个,多态百分率为50.00%。种群内多态位点百分率在37.05%～53.13%,平均为45.86%。Shannon指数和Nei指数均反映出巴戟天各类群遗传多样性有一定的变化。Shannon指数为0.287 6,各类群的Shannon指数在0.103 3～0.236 2,Nei指数为0.175 6,各类群的Nei指数在0.074 5～0.154 0。结论目前栽培巴戟天居群间有一定的分化,并产生了多种农家类型,其中小叶巴戟天(POP2)遗传多样性明显高于其他类型,这些可能是导致目前栽培巴戟天质量产生变异的主要原因。     

金铁锁种质资源的遗传多样性分析

目的研究中国西南特有濒危药用植物金铁锁的遗传多样性。方法应用AFLP分子标记技术对具有代表性的7个金铁锁居群,共137个个体进行分析。结果在金铁锁的物种水平上,Nei’s基因多样性指数(He)、Shan-non’s信息指数(I)、多态位点百分率(PPB)分别为0.2434±0.1791、0.3735±0.2485、82.30%;在其居群水平上分别为0.0918±0.1610、0.1402±0.2362、30.48%。居群间Nei遗传分化指数(Gst):0.6244;Shannon’s多样性基因遗传分化系数(Ist):0.6246。聚类表明:地理距离相对远的丽江居群与个旧居群遗传距离最近;昆明居群与其他居群遗传距离较远。统计获得9条可区分各地方居群的特征指纹带。结论金铁锁种内的遗传多样性水平丰富,而居群内遗传多样性水平较低,居群间遗传分化显著;各居群间亲缘关系与地理距离无明显相关性;其种内特征带与各居群特征带结合,可以为AFLP分子标记技术用于其种质资源的鉴定、遗传育种提供重要的依据。     

ISSR分析3种类型黄连的遗传多样性和遗传结构

目的 研究3种类型黄连的遗传多样性和遗传结构。方法 对3种类型黄连的90个单株进行ISSR分析,运用POPGENE 1.31软件计算相关参数。结果 22个引物共检测到164个位点,其中108个为多态位点;黄连3种类型具有较丰富的遗传多样性,在物种水平上,多态位点百分率（PPB）为65.85%,有效等位基因数（N_e）为1.229 8,Nei’s基因多样度指数（H）为0.144 0,物种水平Shannon’s多样性信息指数（H_sp）为0.230 2;在类型水平上,PPB为55.08%,N_e为1.218 9,H为0.136 0,类型水平Shannon’s多样性信息指数（H_pop）为0.215 1。Nei’s基因多样性指数计算的类型间遗传分化系数与Shannon’s类型分化系数分别为0.056 1和0.065 2,均说明大部分遗传变异存在于类型内;ISSR标记检测到类型间存在着广泛的基因流（N_m＝8.405 4）,遗传分化程度较低;两两类型间的Nei’s遗传一致度（I）的范围为0.983 1～0.989 7;根据Nei’s遗传距离进行各类型间的UPGMA聚类,基于ISSR分子标记的聚类结果与形态分类基本一致。结论 3种类型的黄连遗传多样性较高,为新品种的培育提供了丰富的遗传基础。     

中华鳖两个地理种群遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术对中华鳖2个不同地理种群(淮河群体、台湾群体)的群体遗传多样性进行分析研究.从32个ISSR引物中筛选出8个引物对2个中华鳖群体37个个体进行扩增,获得77个重复性好且谱带清晰的扩增位点,其中多态性位点47个,多态位点百分率为61.04％;2个群体的多态位点比例分别为59.57％和51.06％.Nei基因多样性分别为0.165 7和0.1524,Shannon信息指数分别为0.2164和0.1977.淮河群体的遗传多样性略高于台湾群体,群体间遗传距离为0.083 7.UPGMA聚类分析显示37个个体聚成两个类群.分析结果表明2个中华鳖群体的遗传多样性相对贫乏,2个养殖群体经过较多世代的人工选育与繁殖可能形成了趋于稳定的独立遗传结构.     

香鳞毛蕨种质资源遗传多样性的AFLP分析

目的 利用AFLP技术分析香鳞毛蕨种质资源多样性。 方法 对46个香鳞毛蕨个体进行AFLP分析,利用NTSYS-PC 2.10、PopGene32软件分析各居群的遗传多样性。 结果香鳞毛蕨居群多态位点百分率(PPB)为7667%;观测等位基因数(Na)为1.766 7,有效等位基因数(Ne)为1.504 6, Nei′s基因多样性指数(H)为0.292 1,Shannon信息指数(I)为0.431 6;遗传分化指数(Gst)为0.412 5。结论 香鳞毛蕨遗传多样性较高。群体内的基因多样性(Hs)为0.170 5,群体间的基因多样性(Dst)为0.119 8,且由于生境特殊性,对香鳞毛蕨资源应采取就地保护策略。     

川乌遗传多样性的ISSR鉴定

目的应用ISSR标记技术分析川乌遗传多样性。方法对江油附子和9个野生乌头居进行了ISSR分析,探索川乌各居群间的遗传多样性。结果8个引物共扩增出98条带。其中68条具有多态性,多态位点百分率为69.39%;观测等位基因数(Na)为1.6939,有效等位基因数(Ne)为1.3715,Nei′s基因多样性指数为0.2308,Shannon信息指数(I)为0.3530;用ISSR855引物能够区分川乌的10个供试居群。结论ISSR标记适合于构建川乌的DNA指纹图谱、品种鉴定和遗传多样性分析。     

浙南海域野生坛紫菜遗传多样性的ISSR分析

目的:研究浙南海域野生坛紫菜的遗传多样性.方法:采用简单序列重复区间扩增多态性(ISSR)分子标记技术,分析采自浙江南部海域的苍南铁钉岛、洞头竹屿岛、南麂列岛、温岭斜头岛等地坛紫菜(Porphyra hai tanesis)的4个野生种群.结果:6条ISSR引物共获得268个位点,257个多态位点,4个种群野生坛紫菜多态位点百分率(PPL)为95,90％,等位基因数(Na)为1.8081,有效等位基因数(Ne)为1.5326,Nei's基因多样性(H)为0.1618,Shannon's指数(I)为0.3509,均高于个体水平;种群内和种群间Nei's基因多样性计算遗传分化水平(Gst)为0.2832,种群间的基因交流为Nm=2.3591,表明野生坛紫菜种群间存在着较高的遗传多样性,遗传变异中有28.32％发生于群体间.108株坛紫菜的聚类分析结果同样也表明坛紫菜种群间的遗传分化水平较低,遗传变异主要存在于种群的个体间.结论:浙南海域野生坛紫菜种群间遗传差异较大,遗传多样性水平较高,个体间的遗传差异较小.表明目前浙南野生坛紫菜的种质资源较好.     

栀子种质资源遗传多样性的ISSR研究

目的进行栀子种质资源的遗传多样性研究。方法对12份栀子种质资源进行ISSR分析。利用POPGENE32软件分析遗传相似系数,UPGMA方法聚类,构建亲缘关系系统图。结果12个引物共扩增出126条谱带,其中多态性谱带92个,多态带百分率（PPB）73．02％;观测等住基因数（Na）1．7302,有效等位基因数（Ne_1．4643;Nei’s基因多样性（He）27．09％;Shannon’s信息指数（I）0．4027。UPGMA聚类分析可将所有样品分为4类。聚类结果显示栀子种质亲缘关系与地理分布具有一定的相关性,并呈现出一定的地域性分布规律。结论栀子的遗传多样性水平较低,种质问的亲缘关系较近。     

浙江主产区栽培浙贝母种质遗传多样性的AFLP分析

目的 研究中国浙江省道地药材浙贝母的遗传多样性。方法 应用扩增片段长度多态性技术(AFLP)对具有代表性的6个浙贝母居群,共32份个体进行分析。结果 在浙贝母的物种水平上,Nei′s基因多样性指数(He)为0.169 0±0.175 7,Shannon′s信息指数(I)为0.269 8±0.245 3,多态位点百分率(PPB)76.85%;总遗传多样性(Ht)0.169 0±0.030 9,其居群水平上遗传多样性(Hs)0.150 8±0.024 0,Shannon′s信息指数(I)0.233 3±0.261 9,多态位点百分率(PPB)50.38%,Nei′s遗传分化指数(Gst)为0.107 6,基因流(Nm)为4.147 0。东阳和永康种群之间的遗传距离最小(0.015 0),而象山与缙云最远(0.032 4)。结论 浙江省主产区栽培浙贝母物种的遗传多样性水平丰富,高的遗传多样性能够维持浙贝母的长期生存,居群间的多样性水平明显低于居群内的多样性水平,居群间遗传分化不明显,种植资源相对比较稳定,这些居群适宜作为浙贝母优良品种的选育基地。     

壮药战骨种质资源遗传多样性ISSR分析

目的 对壮药战骨种质资源的遗传多样性进行研究。方法 采用ISSR分子标记技术分析9个战骨种群的遗传多样性。结果 13条引物共检测到73个位点,其中65个位点具有多态性,多态位点百分率（PPL）为89.04%。战骨总的Nei’s基因多样度指数（H）为0.226 5,Shannon’s 多样性信息指数（I）为0.357 2,各种群的平均H、I为0.147 6、0.221 9。种群间基因分化系数（G_st）为0.348 4,基因流（N_m）为0.935 1。9个种群可聚类划分为2个大种群组。结论 战骨种群遗传多样性为中等偏低水平;战骨种群的遗传变异主要存在于种群内;战骨的生物学特性和分布区域的片段化是导致种群间出现一定的遗传分化和种群遗传多样性较低的主要原因。     

黄连遗传多样性的ISSR分析

目的 对野生黄连进行遗传多样性研究。方法 通过ISSR技术对7个野生黄连居群共78个个体进行遗传多样性分析。结果 用12个随机引物共扩增出106条清晰条带,其中72条具多态性,平均多态性位点比率为67.92%,Nei′s基因多样性指数H=0.180 3,Shannon多样性指数I=0.283 2,遗传分化指数Gst=0.681 5,遗传距离和遗传一致度分别为：0.089 4～0.184 6和0.832 1～0.912 7。结论 黄连种水平上具有较高的遗传多样性,遗传变异主要存在于居群间,遗传多样性与地理关系表现出明显的相关性,ISSR可以作为研究遗传多样性及遗传分化的有效标记。     

栀子道地药材遗传关系的ISSR证据

目的 分析来自江西省樟树、丰城、新干等3个栀子GAP基地的样品在DNA水平上的差异,了解栀子的遗传变异及其相互关系,为栀子育种提供参考。方法 采用ISSR分子标记技术结合实地考察。结果 10个ISSR引物共扩增出58个位点,其中32个位点为多态位点,多态位点百分率(PPB)值为55.17%。Nei′s遗传多样性指数变化范围在0.005～0.167,Shannon信息指数(I)变化范围在0.008～0.254。居群内变异占总变异的75.12%,居群间变异占总变异的24.88%。用NJ法建立聚类图大体上可以将栀子样品分为两组：第一组由樟树的样品组成,而第二组主要由新干和丰城的样品组成,内含樟树的个别样品。结论 来自同一个地方的样品,遗传距离比较近,遗传上比较相似,说明栀子种源基本上来自当地。ISSR分子标记大体上可以将不同地方的栀子分开。产于樟树的栀子遗传多样性最高,可能种源相对比较广。丰城和新干的样品地理距离比较远,但是遗传距离却比较近,可能是各地之间存在相互引种现象。有少数樟树的样品在遗传上更接近丰城或新干的样品,除了种源交流外,在种下水平平行遗传突变也可能导致这种结果。     

不同产地牛膝ISSR遗传多样性研究

目的:探索不同产地牛膝的遗传相似性。方法:以采自牛膝主产区的39份样品为试材,采用简单序列重复区间扩增多态性分子标记(intersimple sequence repeat,ISSR)技术分析其遗传多样性。结果:从50对引物中筛选出16对反应体系较稳定、扩增条带较清晰且多态性较多的引物,16对引物在39份样品中共扩增出251条带,多态性条带中有效条带数为233条,有效条带数占总条带数92.83%;多态性位点百分率P为78.09%,Nei′s基因多样性指数为0.2170,Shannon多样性指数为0.3376,遗传分化系数为0.4003,种群间的基因流为0.7492,牛膝种群间的遗传变异为40.03%;牛膝各产地之间遗传一致度为0.7891~0.9506,遗传距离为0.0507~0.2369。根据遗传相似系数对牛膝产地进行聚类分析,在0.87处将牛膝聚为2类;同时对39份样品进行聚类分析,在相似系数0.75处划分为2类,个体聚类与产地聚类结果相似。结论:本研究揭示了不同产地牛膝的遗传相似度,为牛膝亲缘关系鉴定、规范化种植、资源利用奠定了基础。     

我国仙茅属植物遗传关系的RAPD分析

目的 从分子水平研究我国仙茅属（Curculigo Gaertn.）植物的遗传关系。方法 对我国仙茅属植物7个国产种30个单株进行RAPD分析。运用Popgene Version1.31软件计算相关参数,采用UPGMA聚类法进行聚类分析。结果 11个RAPD引物共扩增出157条带,其中有145条呈多态性。我国仙茅属植物的遗传多样性极为丰富,在物种水平上,多态位点百分率（PPB）为92.36%,平均每个位点的有效等位基因数（N_e）为1.493 7, Nei’s基因多样性指数（H）为0.300 1,Shannon’s多样性信息指数H_sp为0.457 7。在种内水平上,PPB＝5.09%,N_e＝1.036 6,H＝0.020 4,种内Shannon’s多样性信息指数（H_pop）为0.029 8。Nei’s 基因多样性指数计算的种间遗传分化系数（G_st＝0.931 3）与Shannon’s分化系数（0.934 9）基本一致,均说明大部分遗传变异存在于种间。种间基因流（N_m）为0.036 9,说明种间基因流动较少,遗传分化程度较高。两种间的Nei’s遗传一致度（I）的范围为0.520 8～0.823 7。根据Nei’s遗传距离进行UPGMA聚类,基于RAPD分子标记的聚类结果与传统分类一致。结论 我国仙茅属植物的遗传多样性十分丰富,且种间的遗传差异大于种内的遗传差异。     

药用菊花种质资源遗传多样性的 ISSR 分析

目的 分析药用菊花遗传多样性,为其种质资源评价和合理开发利用提供分子佐证。方法 用 ISSR 分子标记对不同采集地的31份种源(菊花29份、野菊1份、菊花脑1份)进行遗传关系分析。结果 22个引物共扩增出182个条带,其中149条具有多态性,多态位点百分率为 81.87%,有效等位基因数(Ne)为 1.348 1,Nei′s 基因多样性指数(He)为 0.219 1,Shannon 信息指数(I)为 0.345 1。聚类分析和主坐标分析结果相近,将31份种源大致分为野菊和菊花脑、北方药用菊花、南方药用菊花3个类群。结论 ISSR 分子标记适合于药用菊花的品种鉴定和遗传多样性分析。     

ISSR分子标记对金荞麦8个野生居群的遗传多样性分析

目的 对野生金荞麦进行遗传多样性研究。方法 通过ISSR技术对8个野生金荞麦居群的共92个个体进行遗传多样性分析。结果 用12个随机引物共扩增出103条清晰条带,其中90条具多态性,平均多态性位点比率为87.38%,Nei′s基因多样性指数H=0.374 7,Shannon多样性指数I=0.572 8,遗传分化指数Gst=0.171 8。遗传距离和遗传一致度分别为：0.043 1～0.384 9和0.684 3～0.954 5。结论 金荞麦种内具有较高的遗传多样性,遗传变异主要存在于居群内部,遗传多样性与地理关系表现出明显的相关性。ISSR可以作为研究遗传多样性及遗传分化的有效标记。     

短葶山麦冬遗传多样性SRAP标记研究

目的 对短葶山麦冬进行遗传多样性分析。方法 利用SRAP分子标记技术对47份短葶山麦冬材料进行遗传多样性分析。结果 15对引物共扩增出323条多态性带,平均多态位点百分率为88.47%。平均引物多态信息量（PIC）为0.90。Nei’s基因多样性指数（H）为0.197 7,Shannon’s信息指数（I）为0.319 0。遗传分化系数（G_st）为0.252 8。UPGMA聚类表明遗传相似系数为0.59～0.99。结论 短葶山麦冬遗传多样性水平较高,遗传变异主要在居群内。     

中国不同地理居群鱼腥草遗传多样性分析

目的 研究中国不同地理居群鱼腥草药材的遗传多样性。方法 选取分布于我国13个省市的15个不同居群288份鱼腥草样本,进行AFLP分析,POPGENE及MEGA软件分析处理数据。结果 通过筛选得到10对AFLP引物,扩增得到110条带,其中70.51%条为多态性条带;有效等位基因数为1.210,Nei′s多样性指数 H为0.119,Shannon多样性指数I为0.186;15个居群遗传距离系数0.008 9～0.181 8;用MEGA软件进行UPMGA聚类分析,15个居群的鱼腥草材料被分为3个大分支。其中峨眉蕺菜最先与其他居群分开,表明它与其他居群之 间的亲缘关系较远。其他2个大的分支按地域聚在一起。结论 我国鱼腥草居群间存在较高多态性,遗传多样性较为丰富。     

封闭群树鼩的微卫星遗传特性分析

目的比较分析远交繁殖的I~IV代次的滇西亚种树鼩群体的遗传差异和分化程度,为培育封闭群树鼩种群提供遗传学依据。方法提取I~IV四个代次共49只滇西亚种树鼩的全血基因组DNA,选取树鼩的18个微卫星位点,结合荧光标记(FAM)PCR扩增技术,通过毛细管电泳技术检测扩增产物,并利用POPGENE、FSTAT等软件比较各代次树鼩的遗传相关指标。结果四个代次的树鼩群体共检测到等位基因(Na)89个,平均有效等位基因数(Ne)为3.779,平均观察杂合度(Ho)为0.523,平均期望杂合度(He)为0.613,平均多态信息含量(PIC)为0.558,平均Shannon信息指数(I)为1.277,平均等位基因丰富度(AR)为2.938,遗传分化系数(Fst)平均值为0.046;其遗传距离及无偏遗传距离分别为0.049~0.159和0.022~0.109。结论培育的树鼩群体的遗传多样性较丰富,且不存在较大的遗传差异和分化程度。     

石蒜属植物遗传多样性的ISSR和RAPD标记比较研究

目的研究石蒜属4种植物的种间亲缘关系和同一种内不同采集地材料的遗传多样性,为其种质资源评价和合理开发利用提供分子佐证。方法用ISSR和RAPD标记分别对不同采集地的37份石蒜属植物(石蒜18份、中国石蒜10份、换锦花5份、忽地笑4份)的基因组DNA的遗传多样性进行检测。结果(1)16条ISSR和17条RAPD引物分别扩增出229和215条带,多态比率分别为85.59%和69.77%,显然,ISSR检测出的多态性条带的能力优于RAPD;(2)ISSR和RAPD标记检测同组供试材料种间或种内的Nei′s遗传相似系数范围分别为0.5459～0.9345,0.6419～1.0000,平均为0.6836,0.7428。两者相关系数r=0.8582,达极显著水平。(3)ISSR和RAPD标记的分子聚类结果相近,两种标记均能准确地把不同来源的材料先按种聚类,种间的分子分类结果与传统经典分类相符;种内不同采集地材料间存在一定的遗传差异,其遗传多样性较为丰富。(4)用POPGENE3.2分析的种间基因分化系数(Gst)与用AMOVA进行的遗传变异巢式方差分析所得结果基本一致。结论两种标记均可用于石蒜属植物种间亲缘关系与种内的遗传多样性研究,虽然ISSR标记在种间遗传多样性检测上分辨力较RAPD标记低,但ISSR标记能检测到更高的种内遗传差异性,更适合种下水平的遗传多样性研究。