川乌遗传多样性的ISSR鉴定

目的应用ISSR标记技术分析川乌遗传多样性。方法对江油附子和9个野生乌头居进行了ISSR分析,探索川乌各居群间的遗传多样性。结果8个引物共扩增出98条带。其中68条具有多态性,多态位点百分率为69.39%;观测等位基因数(Na)为1.6939,有效等位基因数(Ne)为1.3715,Nei′s基因多样性指数为0.2308,Shannon信息指数(I)为0.3530;用ISSR855引物能够区分川乌的10个供试居群。结论ISSR标记适合于构建川乌的DNA指纹图谱、品种鉴定和遗传多样性分析。     

食蟹猴微卫星DNA标记遗传监测及多态性分析

目的 研究国内食蟹猴种群的遗传背景特性,建立食蟹猴种群遗传质量监测方法.方法 采用微卫星DNA遗传标记技术对50只食蟹猴种群个体进行遗传质量监测及DNA多态性分析.结果 从100个微卫星DNA位点中筛选出20个多态性高的位点,其食蟹猴种群个体的等位基因数目为5-10条,个体间均呈现高度的多态性;其观察等位基因数(Na)为5.0～10.0,有效等位基因数(Ne)为4.6118～8.3404,基因多样性(H)为0.7832～0.8801和香隆信息指数(I)为1.5651～2.1592.结论 本实验有效地分析了食蟹猴种群的遗传多态性,为今后筛选特异性微卫星位点来建立食蟹猴种群遗传质量监测方法提供了理论依据.     

中华鳖两个地理种群遗传多样性的ISSR分析

利用ISSR分子标记技术对中华鳖2个不同地理种群(淮河群体、台湾群体)的群体遗传多样性进行分析研究.从32个ISSR引物中筛选出8个引物对2个中华鳖群体37个个体进行扩增,获得77个重复性好且谱带清晰的扩增位点,其中多态性位点47个,多态位点百分率为61.04％;2个群体的多态位点比例分别为59.57％和51.06％.Nei基因多样性分别为0.165 7和0.1524,Shannon信息指数分别为0.2164和0.1977.淮河群体的遗传多样性略高于台湾群体,群体间遗传距离为0.083 7.UPGMA聚类分析显示37个个体聚成两个类群.分析结果表明2个中华鳖群体的遗传多样性相对贫乏,2个养殖群体经过较多世代的人工选育与繁殖可能形成了趋于稳定的独立遗传结构.     

栀子遗传多样性及遗传分化的RAPD分析

目的 应用随机扩增多态性DNA(random amplifed polymorphic DNA,RAPD)标记技术对栀子8个种群遗传多样性和遗传分化进行研究.方法 18种随机引物对92个个体进行检测,应用POPGENE软件和AMOVA软件对结果进行处理.结果 共得到120个可重复的位点,其中多态位点75个,多态百分率为62.5%.各种群内多态位点百分率在39.17%～68.83%之间,平均为56.98%.河南南阳(POP1)种群最高,其次是江西新干县野生种群(POP7),最低是江西抚州水栀子种群(POP3).Shannon指数和Nei指数均反映出栀子各种群具有较高的遗传多样性.Shannon指数为0.431 3,各种群Shannon指数在0.2256～0.380 6之间,Nei指数为0.289 2,各种群Nei指数在0.148 2～0.263 0之间.AMOVA揭示种群内遗传多样性占总遗传多样性的76.05%,而种群间遗传多样性只占23.95%.运用POPGENE也得出种群内遗传变异(69.34%)大于种群间(30.66%)的结论.种群间的遗传分化系数为0.306 6.栀子种群间的基因流为1.130 6,遗传相似度平均为0.129 09,遗传距离平均为0.880 72.根据遗传距离聚类分析,河南南阳种群(POP1)与江西樟树新干种群(POP4,POP5,POP6,POP7)聚为一类,湖南种群(POP8)与江西抚州栀子种群(POP2)聚为一类,江西抚州水栀子种群(POP3)与其他各种群间的遗传关系较远.结论 目前,虽然野生资源逐年减少以及多年栽培中的品种选育,栀子遗传多样性仍较丰富,且种群内大于种群间,种群间存在较少的遗传分化.     

香鳞毛蕨种质资源遗传多样性的AFLP分析

目的 利用AFLP技术分析香鳞毛蕨种质资源多样性。 方法 对46个香鳞毛蕨个体进行AFLP分析,利用NTSYS-PC 2.10、PopGene32软件分析各居群的遗传多样性。 结果香鳞毛蕨居群多态位点百分率(PPB)为7667%;观测等位基因数(Na)为1.766 7,有效等位基因数(Ne)为1.504 6, Nei′s基因多样性指数(H)为0.292 1,Shannon信息指数(I)为0.431 6;遗传分化指数(Gst)为0.412 5。结论 香鳞毛蕨遗传多样性较高。群体内的基因多样性(Hs)为0.170 5,群体间的基因多样性(Dst)为0.119 8,且由于生境特殊性,对香鳞毛蕨资源应采取就地保护策略。     

黄连遗传多样性的ISSR分析

目的 对野生黄连进行遗传多样性研究。方法 通过ISSR技术对7个野生黄连居群共78个个体进行遗传多样性分析。结果 用12个随机引物共扩增出106条清晰条带,其中72条具多态性,平均多态性位点比率为67.92%,Nei′s基因多样性指数H=0.180 3,Shannon多样性指数I=0.283 2,遗传分化指数Gst=0.681 5,遗传距离和遗传一致度分别为：0.089 4～0.184 6和0.832 1～0.912 7。结论 黄连种水平上具有较高的遗传多样性,遗传变异主要存在于居群间,遗传多样性与地理关系表现出明显的相关性,ISSR可以作为研究遗传多样性及遗传分化的有效标记。     

药用菊花种质资源遗传多样性的 ISSR 分析

目的 分析药用菊花遗传多样性,为其种质资源评价和合理开发利用提供分子佐证。方法 用 ISSR 分子标记对不同采集地的31份种源(菊花29份、野菊1份、菊花脑1份)进行遗传关系分析。结果 22个引物共扩增出182个条带,其中149条具有多态性,多态位点百分率为 81.87%,有效等位基因数(Ne)为 1.348 1,Nei′s 基因多样性指数(He)为 0.219 1,Shannon 信息指数(I)为 0.345 1。聚类分析和主坐标分析结果相近,将31份种源大致分为野菊和菊花脑、北方药用菊花、南方药用菊花3个类群。结论 ISSR 分子标记适合于药用菊花的品种鉴定和遗传多样性分析。     

肉苁蓉种质资源多样性的AFLP分析

目的分析栽培与野生肉苁蓉Cistanche deserticola种质资源多样性。方法对58个种植基地和野生肉苁蓉单株进行AFLP分析,利用PopGene32软件分析群体的遗传多样性。结果栽培肉苁蓉多态位点百分率79.16%,野生居群总计多态位点百分率89.53%,4个居群平均Nei's基因多样性指数为0.1938,Shannon's多态性信息指数为0.3004,基因分化系数Gst为0.0979。结论栽培与野生肉苁蓉遗传多样性均较高,遗传分化很小。说明现阶段该物种的种内丰度较高,其濒危原因不在于此。因此,野生抚育和人工栽培是保护肉苁蓉资源并实现可持续利用的根本方向。     

ISSR分子标记对金荞麦8个野生居群的遗传多样性分析

目的 对野生金荞麦进行遗传多样性研究。方法 通过ISSR技术对8个野生金荞麦居群的共92个个体进行遗传多样性分析。结果 用12个随机引物共扩增出103条清晰条带,其中90条具多态性,平均多态性位点比率为87.38%,Nei′s基因多样性指数H=0.374 7,Shannon多样性指数I=0.572 8,遗传分化指数Gst=0.171 8。遗传距离和遗传一致度分别为：0.043 1～0.384 9和0.684 3～0.954 5。结论 金荞麦种内具有较高的遗传多样性,遗传变异主要存在于居群内部,遗传多样性与地理关系表现出明显的相关性。ISSR可以作为研究遗传多样性及遗传分化的有效标记。     

川产羌活种质遗传多样性的RAPD分析

目的考察羌活Notopterygium incisum的遗传特征,探讨不同产地且有形态变异的羌活种质资源的遗传多样性、遗传分化及与环境因子的相关性。方法用RAPD方法选择15个随机引物对四川西部4个居群33株个体叶片DNA进行扩增,从个体间遗传关系及居群间遗传分化方面对羌活的遗传结构进行分析。结果RAPD共检测到185条谱带,其中128个位点为多态位点,多态性百分率为69.19%,Nei's基因多样性为0.2237,Shannon's信息指数为0.3375;壤塘和九龙居群聚为一类,理县和泸定居群聚为一类;茎秆颜色花纹性状与遗传差异间未表现明显相关性,不同性状的羌活个体仍主要按居群,即产地来源聚类;羌活居群内和居群间的变异分别占总变异的74.67%和25.33%;羌活居群间的遗传距离与地理距离间没有明显相关性(r=-0.1105,P=0.5855);羌活4个居群遗传多样性大小与年均温负相关,未达到显著水平(r=-0.771,P=0.229);与年均降雨量正相关,但相关不显著(r=0.291,P=0.709)。结论本研究表明羌活遗传多样性水平较高;羌活的遗传变异主要分布在居群内,但居群间已形成一定的遗传分化;壤塘和九龙羌活个体间的遗传距离较小,各自遗传背景较为相似。产地差异对遗传变异的影响大于因其茎秆颜色花纹不同所造成的影响。     

应用微卫星标记分析中华白海豚遗传多样性

[目的]初步了解中华白海豚的遗传多样性.[方法]利用4个微卫星标记检测中华白海豚的多态信息含量、杂合度和等位基因数.[结果]微卫星座位PMC2、PMC4在珠海海域的中华白海豚中呈中度多态,PMC2、PMC3在厦门海域的中华白海豚中呈中度多态,在两个海域中均检测出多态性的座位有PMC2和PMC4.[结论]微卫星座位PMC2、PMC4可用于中华白海豚遗传多样性水平的评估.中华白海豚在本研究采用的4个座位中显示的遗传多样性程度不高.     

基于简单重复序列间扩增分子标记的金钗石斛遗传多样性研究

[目的]对不同产地金钗石斛进行遗传多样性分析为金钗石斛的种质资源保护及新品种选育提供参考。[方法]利用简单重复序列间扩增(inter simple sequence repeat,ISSR)分子标记技术对金钗石斛7个地区21个居群的152个样本进行分析,利用POPGENE1.32软件进行遗传多样性指数分析用NTSYSpc 2.10e软件构建居群间非加权配对算术平均法(unweighted pair group with arithmetic average,UPGMA)聚类图。[结果]筛选出不同产地金钗石斛10条ISSR引物,共扩增出多态性条带292条多态性百分率为100%。在物种水平,等位基因数是2.0000,有效等位基因数是1.3 863期望杂合度是0.2398,香农信息指数为0.3783;在居群水平多态百分率为9.93%～47.95%期望杂合度为0.0411～0.1674,香农信息指数为0.0601-0.2519。遗传结构分析表明,21个居群遗传一致性为0.7149～0.9527,平均为0.8506,居群间的遗传变异(57.79%)略高于居群内(42.21%)。在物种水平上,金钗石斛较小的基因流(0.1826)导致了居群的分化。遗传距离聚类分析表明,金钗石斛的遗传距离与地理分布有一定的相关性。[结论]金钗石斛具有丰富的遗传多样性,栽培居群与野生居群的遗传多样性均较高表明金钗石斛在栽培过程中遗传多样性基本上没有丧失,居群间的遗传变异略高于居群内,说明金钗石斛居群在地区间有遗传分化的趋势。云南居群具有较高的遗传多样性建议在该地区进行大面积的人工栽培,以栽培品替代野生品作药用,缓解资源紧缺的状况。     

白花蛇舌草的简单重复序列区间(ISSR)遗传多样性分析

采用简单重复序列区间(ISSR)分子标记对不同产地白花蛇舌草的遗传多样性进行分析。分别在广西壮族自治区、广东省、湖南省、浙江省、福建省、江西省和安徽省共采集23份白花蛇舌草样品,选用150条ISSR引物进行PCR扩增,运用POPGENE1.32、NTSYS2.10软件进行遗传多样性分析。筛选出11条引物,扩增出115条多态性条带,多态性比率为85.22%,等位基因数(Na)为1.852 2,有效等位基因(Ne)为1.543 4,Neis基因多样性指数(H)为0.316 5,Shannon′s信息指数(I)为0.470 0。聚类分析结果表明白花蛇舌草可分成3类,实验结果表明ISSR分子标记可以为白花蛇舌草的系统分类和鉴定提供分子水平的科学依据。     

利用RAPD标记分析长白山越桔的遗传多样性及亲缘关系

目的分析长白山越桔遗传多样性及其亲缘关系。方法用随机扩增多态DNA(RAPD)标记方法对1种野生越桔和2种不同的栽培越桔进行遗传多样性检测和遗传分析。结果采用40个随机引物共检测72个位点,其中多态位点27个,占37.5%;相似系数矩阵表明野生越桔和栽培越桔Ⅰ、栽培越桔Ⅱ的遗传距离分别为0.764和0.809;聚类图表明野生越桔和栽培越桔Ⅱ亲缘关系较近。结论长白山越桔的遗传多样性水平较低,野生越桔和栽培越桔之间的遗传变异不大,遗传因素在越桔形态变异上的作用小于环境因素。     

壮药战骨种质资源遗传多样性ISSR分析

目的 对壮药战骨种质资源的遗传多样性进行研究。方法 采用ISSR分子标记技术分析9个战骨种群的遗传多样性。结果 13条引物共检测到73个位点,其中65个位点具有多态性,多态位点百分率（PPL）为89.04%。战骨总的Nei’s基因多样度指数（H）为0.226 5,Shannon’s 多样性信息指数（I）为0.357 2,各种群的平均H、I为0.147 6、0.221 9。种群间基因分化系数（G_st）为0.348 4,基因流（N_m）为0.935 1。9个种群可聚类划分为2个大种群组。结论 战骨种群遗传多样性为中等偏低水平;战骨种群的遗传变异主要存在于种群内;战骨的生物学特性和分布区域的片段化是导致种群间出现一定的遗传分化和种群遗传多样性较低的主要原因。     

石蒜属植物遗传多样性的ISSR和RAPD标记比较研究

目的研究石蒜属4种植物的种间亲缘关系和同一种内不同采集地材料的遗传多样性,为其种质资源评价和合理开发利用提供分子佐证。方法用ISSR和RAPD标记分别对不同采集地的37份石蒜属植物(石蒜18份、中国石蒜10份、换锦花5份、忽地笑4份)的基因组DNA的遗传多样性进行检测。结果(1)16条ISSR和17条RAPD引物分别扩增出229和215条带,多态比率分别为85.59%和69.77%,显然,ISSR检测出的多态性条带的能力优于RAPD;(2)ISSR和RAPD标记检测同组供试材料种间或种内的Nei′s遗传相似系数范围分别为0.5459～0.9345,0.6419～1.0000,平均为0.6836,0.7428。两者相关系数r=0.8582,达极显著水平。(3)ISSR和RAPD标记的分子聚类结果相近,两种标记均能准确地把不同来源的材料先按种聚类,种间的分子分类结果与传统经典分类相符;种内不同采集地材料间存在一定的遗传差异,其遗传多样性较为丰富。(4)用POPGENE3.2分析的种间基因分化系数(Gst)与用AMOVA进行的遗传变异巢式方差分析所得结果基本一致。结论两种标记均可用于石蒜属植物种间亲缘关系与种内的遗传多样性研究,虽然ISSR标记在种间遗传多样性检测上分辨力较RAPD标记低,但ISSR标记能检测到更高的种内遗传差异性,更适合种下水平的遗传多样性研究。     

应用微卫星标记对两个SD大鼠封闭群的遗传分析

目的检测来自北京和上海两个单位SD大鼠封闭群的遗传多样性与遗传关系。方法利用微卫星标记技术,采用7对微卫星引物对两个群体60个个体进行Hardy-Weinberg平衡(HWE)检验,统计每个微卫星位点的基因频率、基因杂合度、多态信息含量(PIC)、遗传距离等信息。结果两个种群平均观测等位基因数(Na)分别为4.857 1、5.142 9,平均观测杂合度(Ho)为0.647 6、0.585 7。7个位点平均PIC为0.644 5、0.667 6,北京某单位SD大鼠有3个位点HWE检验显著偏离HWE(P0.05),上海某单位SD大鼠有2个位点显著偏离HWE(P0.05)。两个种群的Nei(1978)无偏遗传距离为0.158 2。结论北京和上海两个单位SD大鼠群体均具有较好的遗传多样性,两群体间具有中等水平的遗传差异和分化程度;微卫星标记技术或可作为封闭群SD大鼠遗传检测的有效手段。     

不同产地牛膝ISSR遗传多样性研究

目的:探索不同产地牛膝的遗传相似性。方法:以采自牛膝主产区的39份样品为试材,采用简单序列重复区间扩增多态性分子标记(intersimple sequence repeat,ISSR)技术分析其遗传多样性。结果:从50对引物中筛选出16对反应体系较稳定、扩增条带较清晰且多态性较多的引物,16对引物在39份样品中共扩增出251条带,多态性条带中有效条带数为233条,有效条带数占总条带数92.83%;多态性位点百分率P为78.09%,Nei′s基因多样性指数为0.2170,Shannon多样性指数为0.3376,遗传分化系数为0.4003,种群间的基因流为0.7492,牛膝种群间的遗传变异为40.03%;牛膝各产地之间遗传一致度为0.7891~0.9506,遗传距离为0.0507~0.2369。根据遗传相似系数对牛膝产地进行聚类分析,在0.87处将牛膝聚为2类;同时对39份样品进行聚类分析,在相似系数0.75处划分为2类,个体聚类与产地聚类结果相似。结论:本研究揭示了不同产地牛膝的遗传相似度,为牛膝亲缘关系鉴定、规范化种植、资源利用奠定了基础。     

ISSR分析3种类型黄连的遗传多样性和遗传结构

目的 研究3种类型黄连的遗传多样性和遗传结构。方法 对3种类型黄连的90个单株进行ISSR分析,运用POPGENE 1.31软件计算相关参数。结果 22个引物共检测到164个位点,其中108个为多态位点;黄连3种类型具有较丰富的遗传多样性,在物种水平上,多态位点百分率（PPB）为65.85%,有效等位基因数（N_e）为1.229 8,Nei’s基因多样度指数（H）为0.144 0,物种水平Shannon’s多样性信息指数（H_sp）为0.230 2;在类型水平上,PPB为55.08%,N_e为1.218 9,H为0.136 0,类型水平Shannon’s多样性信息指数（H_pop）为0.215 1。Nei’s基因多样性指数计算的类型间遗传分化系数与Shannon’s类型分化系数分别为0.056 1和0.065 2,均说明大部分遗传变异存在于类型内;ISSR标记检测到类型间存在着广泛的基因流（N_m＝8.405 4）,遗传分化程度较低;两两类型间的Nei’s遗传一致度（I）的范围为0.983 1～0.989 7;根据Nei’s遗传距离进行各类型间的UPGMA聚类,基于ISSR分子标记的聚类结果与形态分类基本一致。结论 3种类型的黄连遗传多样性较高,为新品种的培育提供了丰富的遗传基础。     

鄂尔多斯高原锦鸡儿属药用植物的ISSR分析

目的分析鄂尔多斯高原分布的8种锦鸡儿的遗传多样性。方法采用ISSR技术进行研究。结果8种锦鸡儿总的多态位点百分率(PPB)很高,达100%,表明它们的遗传多样性很丰富。但是在种间的分布是不均匀的,藏锦鸡儿、柠条锦鸡儿、狭叶锦鸡儿、荒漠锦鸡儿和中间锦鸡儿的遗传多样性较高,甘蒙锦鸡儿和秦晋锦鸡儿较低,短脚锦鸡儿最低。此结果与Nei′s基因多样度和Shannon信息指数的遗传多样性分析结果一致。根据非加全算术平均聚类法以及ISSR特征图谱可以将不同种区分开来。结论ISSR分子标记可很好地用于锦鸡儿物种的分子鉴定和遗传背景研究,其结果为制定有效的保护策略和措施提供了科学依据。