基于网络药理学预测沙苑子的抗炎作用机制

目的 预测沙苑子的活性化学成分和作用靶点,揭示沙苑子抗炎作用的分子机制。 方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中药台湾数据库(TDT)和中药中医药综合数据库(TCMID)检索沙苑子的所有化学成分,以药代动力(ADME)参数(OB≥30%和DL≥0.15)为标准,筛选沙苑子的活性化学成分,然后通过中药靶标数据库、TCMSP 数据库和中医分子机制生物信息学分析数据库(BATMAN-TCM),查找活性化学成分的作用靶点,建立靶点数据集;使用 Cytoscape 3.6.1软件构建“成分-靶点-疾病”复杂网络关系图;利用蛋白互作(PPI)网络分析—STRING数据库,构建沙苑子作用靶点和炎症作用靶点的PPI关系网络;利用生物学信息注释数据库(DAVID)进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;将沙苑子与炎症相关联的潜在靶点导入KEGG Pathway数据库中,验证沙苑子的抗炎机制。 结果 共检索出41个化合物,其中以kaempferid、formononetin、calycosin-7-O-beta-D-glucopyranoside等11个化合物作为活性化合物;共检索出414个作用靶点,筛选出50个潜在作用靶点与沙苑子的抗炎作用机制最为密切,进而分析出261个生物过程和80条信号通路参与沙苑子的抗炎作用。与沙苑子抗炎最密切的信号通路包括RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、炎症反应、I-κB激酶/NF-κB信号通路的正调控、NF-κB转录因子活性的正调控、细胞对脂多糖的反应、细胞增殖调节、依赖TRIF的Toll样受体信号通路等,其主要涉及的生物过程包括TNF信号通路、细胞凋亡、Toll样受体信号通路、NF-κB信号通路、RIG-I样受体信号通路、NOD样受体信号通路等。 结论 通过网络药理学预测了沙苑子的11个活性化学成分、50个潜在作用靶点及相关信号通路,发挥多成分、多靶点、多途径抗炎的生物学效应。     

基于网络药理学和分子对接的三九胃泰颗粒抗炎镇痛作用机制研究

目的:基于网络药理学探讨三九胃泰颗粒抗炎镇痛的潜在作用机制。方法:通过TCMSP数据库和相关文献筛选出三九胃泰颗粒的活性成分，并对其活性成分作用靶点进行预测，运用Cytoscape软件构建“三九胃泰颗粒-潜在活性成分-靶点”网络。通过GeneCards数据库收集炎症、疼痛相关靶点并与药物靶点相交集。通过STRING数据库对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析，京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集、基因本体(GO)分析于DAVID数据库中进行。Cytoscape软件构建“三九胃泰颗粒潜在活性成分-炎症疼痛相关靶点-通路”网络。AutoDockTools和PyMOL软件用于三九胃泰颗粒抗炎镇痛核心成分和核心靶点的分子对接。结果:共获取三九胃泰颗粒的潜在活性成分73种，其中核心活性成分15个，包括槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等；三九胃泰颗粒发挥抗炎镇痛作用的核心靶点22个，包括PTGS2、HSP90AB1、PTGS1等，参与药物的应答、炎症应答、MAPK级联的正调节等生物过程，涉及脂质和动脉粥样硬化、TNF、PI3K-AKT、MAPK等信号通路。核心成分槲皮素、山柰酚、β-...     

蒙药小秦艽花的抗炎作用机制研究

目的：采用网络药理学研究小秦艽花抗炎作用的潜在作用机制。方法：通过文献检索,并结合 Swiss Target Prediction等数据库筛选小秦艽花中的化学成分及其作用靶点。通过TTD等数据库筛选炎症相关靶点,使用Cytoscape 3.7.2 软件构建“活性成分-靶点”网络和蛋白质相互作用网络,采用 DAVID 数据库对靶点进行GO分析及 KEGG 通路分析。结果：筛选出小秦艽花活性成分23个,预测出27个作用靶点。网络分析结果表明,小秦艽花主要涉及PTGS2(前列腺素内过氧化物合酶2)等关键蛋白以及response to oxidative stress(氧化应激反应)等生物过程,通过调节TNF-α signaling pathway(肿瘤坏死因子α信号通路)等通路来发挥抗炎作用。结论：小秦艽花的抗炎作用体现了其多成分、多靶点、多通路的作用特点,为深入阐释小秦艽花抗炎作用机制提供科学依据。     

基于网络药理学探讨逍遥散治疗非酒精性脂肪性肝炎的作用机制

目的通过网络药理学分析逍遥散治疗非酒精性脂肪性肝炎(nonalcoholic steatohepatitis,NASH)的作用靶点及信号通路,探讨其潜在的作用机制。方法采用中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选逍遥散的活性成分并预测其作用靶点,构建活性成分-靶点网络。通过人类孟德尔遗传综合数据库(OMIM)、基因组注释数据库(GeneCards)检索NASH的潜在靶点,采用STRING平台获取NASH靶点蛋白相互作用的网络,并对数据进行可视化分析,构建NASH靶点的蛋白互作网络。将逍遥散的预测靶点与NASH靶点重合,其交集靶点即为逍遥散治疗NASH的潜在靶点。继而运用R软件3.6.3进行生物功能及信号通路富集分析。再通过Cytoscape 3.7.1软件构建逍遥散治疗NASH的潜在靶点-信号通路网络。结果筛选出162个逍遥散的活性成分,预测出逍遥散治疗NASH的潜在靶点44个。通过GO及KEGG富集分析,筛选出与逍遥散主要成分相关的信号通路127条。结论逍遥散可能通过降脂、抗炎、抗细胞凋亡等多靶点、多通路发挥对NASH的治疗作用,可为其后续临床疗效评价指标的筛选提供研究方向。     

基于网络药理学的鸦胆子活性成分抗肿瘤分子机制

目的 利用网络药理学方法探索鸦胆子抗肿瘤有效成分、潜在靶点及通路,探讨其“多成分-多靶点-多通路”的抗肿瘤作用机制。方法 ①从中药系统药理学数据库和分析平台中筛选出鸦胆子潜在的15个活性成分,根据DrugBank获取这15个活性成分的158个潜在靶分子。②利用String数据库构建这些靶分子的蛋白质-蛋白质相互作用网络,其中节点度值最高的基因JUN定义为核心基因,利用癌症和肿瘤基因图谱分析其在多个肿瘤中的作用。③利用R语言Cluster profiler包将这些靶分子进行基因功能分析和基因功能富集分析。结果 获取了鸦胆子潜在的15个活性成分,158个潜在靶分子及活性成分-靶蛋白网络,并发现了其在多种肿瘤、多种成分、多种通路有着不同的比重和作用。结论 网络药理学方法可为解析鸦胆子多成分、多靶点、多通路、多肿瘤的关系网络,阐述其抗肿瘤的分子机制提供思路和方法,为其临床应用提供相应的理论依据。     

基于网络药理学探讨松花粉抗疟原虫的机制

[目的]应用网络药理学结合生物信息学方法探讨松花粉抗疟原虫的可能机制.[方法]通过检索TCMSP数据库筛选出松花粉活性成分及其相关靶点,并查阅文献进行补充,得到候选有效成分.通过Uniprot数据库将靶点名称转换成基因名称,在GeneCards数据库中寻找疟原虫相关靶点,选择松花粉作用靶点与疟原虫相关靶点的交集筛选出松花粉抗疟原虫的活性成分及作用靶点.利用Cytoscape 3.8.0软件构建松花粉活性成分-作用靶点网络,筛选出关键化合物,通过STRING平台构建靶蛋白相互作用网络,筛选出关键靶点.采用DAVID在线分析平台对靶点基因进行GO富集分析和KEGG代谢通路分析,明确生物学机制.最后利用AutoDockTools 1.5.6和AutoDockVina软件对与抗疟原虫的相关核心靶点进行分子对接.[结果]从松花粉中筛选出10个有效成分及120个作用靶点,其中与疟原虫相关的作用靶点42个,关键靶点6个.功能分析结果显示,交集基因主要集中在氧化还原过程中.与松花粉抗疟原虫有关系的作用通路可能涉及药物代谢-细胞色素P450、细胞色素P450对异生物的代谢、NF-κB信号通路、细胞黏附分子、代谢途径等.分子对接结果显示,核心靶点与山奈酚、谷甾醇、柚皮素、花旗松素和氯化花青素有较强的亲和力.[结论]网络药理学及生物信息学方法对研究松花粉及其类似物的基因靶点、揭示潜在抗疟原虫生物学活性机制、研究疟原虫有关疾病的治疗机制具有重要意义.     

木香-砂仁药对治疗功能性消化不良的分子机制探讨

目的通过网络药理学及分子对接技术探讨木香-砂仁药对治疗功能性消化不良的作用机制。方法借助TCMSP、TCMID、ETCM等数据库检索筛选出木香-砂仁药对的化学成分,通过Swiss Target Prediction数据库检索化合物的潜在靶点信息,从OMIM、Genecards、TTD中获取功能性消化不良的疾病相关基因,应用Venny 2.1线上作图平台将两者进行映射得到交集基因。运用Cytoscape构建"药物-活性成分-作用靶点"网络,使用R软件进行基因本体(GO)功能富集分析和基因相互作用(KEGG)通路富集分析,预测其作用机制。将"药物-活性成分-作用靶点"网络中degree排名较前的4个化合物与部分靶点进行分子对接,进一步验证预测结果的可靠性。结果经过"药物-活性成分-作用靶点"网络的构建,发现关键靶点涉及NR3C1、PTGS2、ACHE、ESR1、ESR2、CYP19A1等蛋白。GO分析的生物学过程条目与炎症、免疫以及神经递质水平调节有密切联系。KEGG通路富集结果主要与神经调节、免疫炎症、内分泌调节等方面相关。结论通过网络药理学和分子对接技术,为阐释木香-砂仁治疗功能性消化不良的作用机制提供了科学依据,木香-砂仁药对可能通过抗炎、改善抑郁情绪等发挥治疗功能性消化不良的作用。     

基于网络药理学预测四妙勇安汤干预心力衰竭的作用机制研究

[目的]借助网络药理学技术预测并筛选四妙勇安汤干预心力衰竭的主要活性成分及其潜在靶点,探讨四妙勇安汤对心力衰竭的疾病-多靶点-多成分的干预作用机制。[方法]依据在线中医药生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)疾病分类预测和筛选四妙勇安汤活性成分的作用靶点。采用Cytoscape软件构建四妙勇安汤活性治疗心力衰竭的成分-靶点网络。[结果]在四妙勇安汤中筛选出89个活性成分,共涉及心力衰竭等15个靶点,且活性成分与预测的靶点有较好的相互作用,预测的15个靶点主要与ACE、ADRA2A、ADRA2B、等靶点有关。[结论]表明四妙勇安汤改善心功能的机制可能与血管紧张素Ⅱ(AngⅡ)抑制肾素血管紧张素系统(RAS)活性、调节交感神经系统等有关,并且在四妙勇安汤治疗心力衰竭中金银花药味的贡献度可能最大。     

基于网络药理学的甘草黄酮类成分药效作用研究

目的:以甘草黄酮类成分预测其作用靶点和药效作用,构建甘草黄酮多成分-多靶点网络。方法:依托中药系统药理学分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索甘草的化学成分,把口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥50%和类药性(drug likeness,DL)≥0.18作为筛选条件,并根据分子结构筛选黄酮类成分;通过TCMSP和Swiss Target Prediction数据库获取黄酮类活性成分的相关靶点。通过UniProt数据库提取作用靶点的基因名称,并利用生物学信息注释数据库(database for annotation,visualization and integrated discovery,DAVID)对靶点进行相关通路富集。最后用Cytoscape 3.2.0软件构建"成分-靶点"和"靶点-通路"网络图。结果:筛选得到28个黄酮类活性成分,可作用于97个潜在靶点和61条相关通路,涉及抗肿瘤、抗炎、内分泌调节和氨基酸代谢等多个环节,预测结果得到文献印证。结论:通过网络药理学验证了甘草黄酮多成分、多靶点、多通路的作用特点,为系统研究甘草活性成分药效作用及机制提供了参考。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨脑血疏口服液治疗缺血性卒中的作用机制

目的 采用网络药理学和分子对接技术探索脑血疏口服液治疗缺血性卒中的药效物质基础与潜在作用机制。方法 基于脑血疏口服液与缺血性卒中的共同靶点构建“单味药-活性成分-作用靶点”网络;通过String数据库构建蛋白互作(PPI)网络;Metascape数据库进行GO功能和KEGG通路注释与富集分析;分子对接分析预测关键的活性成分与靶点的结合互作。结果 “单味药-活性成分-作用靶点”网络中获得脑血疏口服液治疗缺血性卒中的可能活性成分29个,作用靶点67个,其中关键活性成分包括山柰酚、β-胡萝卜苷、胡萝卜苷等;PPI网络分析获得AKT1、PTGS2、EGFR、SRC等关键靶点,其中山柰酚与以上四个关键靶点均有较高的亲和力;脑血疏口服液治疗缺血性卒中的机制可能主要涉及激酶活性、炎症反应、氧化应激应答、免疫系统过程等多种分子功能和生物过程,以及EGFR酪氨酸激酶抑制剂抗性、PI3K-Akt信号通路等165个通路。结论 脑血疏口服液通过多成分、多靶点、多通路和功能的复杂网络调控炎症反应、血管损伤、神经元损伤或凋亡及脑损伤等防治缺血性卒中,为其后续深入药理学研究奠定了基础。     

基于网络药理学挖掘玉米须干预糖尿病的机制研究

[目的] 运用网络药理学挖掘玉米须干预糖尿病的主要活性成分及其潜在靶标,探讨玉米须对糖尿病的干预机制。[方法] 运用中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）筛选玉米须活性成分的作用靶标。运用人类表型术语集（HPO）,毒性与基因比较数据库（CTD）筛选糖尿病的靶标。采用STRING软件构建玉米须干预糖尿病的中药-疾病靶标网络。[结果] 得到12个活性成分和92个关键靶标,涉及糖尿病的靶标有8个。预测主要与AKT1,INSR,PRKACA等靶标有关。主要参与胰岛素信号通路和AMPK信号通路等途径。[结论] 玉米须可能通过调节AKT1和INSR蛋白参与胰岛素信号通路或AMPK信号通路对2型糖尿病起效,相关靶点及通路和现有的文献报道较为一致,可为其药用、食用的进一步开发提供参考依据。     

基于网络药理学的理气化痰活血方治疗心脏X综合征分子机制研究

[目的]运用网络药理学分析理气化痰活血方治疗心脏X综合征的分子机制。[方法]从TCMSP平台获取理气化痰活血方12味中药的化学成分和靶点,利用TTD、Drugbank、DisGeNET数据库筛选心脏X综合征的靶点,将心脏X综合征靶点与药物靶点进行Venn分析,筛选两者共同靶点,利用Cytoscape3.5.1软件构建化合物-靶点、化合物-基因靶点-通路-疾病网络,应用string平台构建蛋白-蛋白相互作用网络。最后,通过DAVID(6.8)在线分析数据工具对共同靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。[结果]共筛选出理气化痰活血方165种化学成分及与治疗心脏X综合征相关的关键靶点35个,靶点主要涉及炎症反应、细胞增殖与凋亡、物质代谢、激素分泌等过程,可能通过调节TNF、MAPK、IL-17、TLRs、NLRs、HIF-1、TCR、PI3K-Akt等信号通路治疗心脏X综合征。[结论]理气化痰活血方主要以抗炎、抗氧化、抗心肌缺血、保护血管内皮功能、调节代谢等多成分、多靶点和多途径协同作用治疗心脏X综合征,为其临床应用及进一步研究其药效作用机制奠定基础。     

基于网络药理学探讨女贞子治疗动脉粥样硬化的作用机制

[目的] 基于网络药理学和生物信息学方法分析女贞子治疗动脉粥样硬化的分子生物学机制。[方法] 基于TCMSP数据库与文献挖掘女贞子中化学成分; 利用PharmMapper网站预测女贞子化学成分靶点, 构建"成分-靶点"网络; 利用TTD、DisGeNET、DrugBank数据库筛选与AS疾病作用相关靶点。利用Cytoscape软件对化合物靶点和AS疾病靶点进行网络拓扑分析。利用STRING数据库对共有靶点构建PPI网络, 进行GO分析和KEGG分析。采用油红O染色和检测细胞内总胆固醇含量评价红景天苷和毛蕊花糖苷抗动脉粥样硬化活性。[结果] "成分-AS疾病靶点"网络显示14个活性成分和170个疾病靶点; 女贞子化学成分和动脉粥样硬化共同靶点9个; GO分析确定352个条目, KEGG通路富集结果确定了14条与AS相关的通路。细胞实验显示红景天苷和毛蕊花糖苷显著减少泡沫细胞的形成, 降低细胞内胆固醇含量。[结论] 女贞子中苯乙醇苷类化合物可能通过调节AMPK、PPAR信号通路调节胆固醇代谢发挥抗动脉粥样硬化作用。     

基于网络药理学的葱白提取物治疗非酒精性脂肪性肝病的机制研究和验证

[目的] 应用网络药理学的研究方法分析葱白提取物治疗非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）的潜在作用靶点，并通过小分子RNA干扰（RNAi）技术在NAFLD大鼠进行验证。[方法] 通过中药系统药理学分析平台（TCMSP）检索葱白的有效成分及作用靶点，再利用GeneCards网络数据库搜索NAFLD关键靶点，运用Perl语言软件对数据进行预处理，再通过R语言软件、Cytoscape软件以及String网络数据平台进行数据分析及作图。最后以RNAi技术抑制过氧化物酶体增殖物受体γ（PPARG）辅助活化因子A（PPARGC1A）PPARGC1A的表达，在NAFLD模型大鼠中验证葱白提取物的疗效。[结果] 通过网络药理学的方法得到两个化合物，即山奈酚（kaempferol）与儿茶素（catechin），具有潜在疗效，并得到关键作用靶点PPARGC1A和PPARG。动物实验结果证实，与模型组相比葱白提取物可以改善脂肪肝病变，同时上调PPARGC1A及PPARG的表达（P<0.01）。[结论] 运用网络药理学的方法预测了葱白治疗NAFLD的关键靶分子，并进行动物实验验证了葱白提取物通过诱导PPARGC1A治疗NAFLD的可行性。     

基于网络药理学探讨荷丹片治疗高脂血症的作用机制

[目的] 旨在通过网络药理学方法探究荷丹片治疗高脂血症的可能作用机制。[方法] 在中药系统药理学数据库（TCMSP）和中医药百科全书（ETCM）数据库中检索得到荷丹片中5味药材类药成分与作用靶点，借助Uniprot数据库查询靶点对应基因，在DisGeNET数据库搜索得到高脂血症的疾病靶点。利用STRING数据平台构建活性组分-作用靶点和蛋白-蛋白相互作用网络（PPI）的网络图，采用Cytoscape软件构建"中药-活性成分-疾病-靶点"网络，利用DAVID生物信息学资源对相关靶点进行GO功能与KEGG通路富集分析。[结果] 从荷丹片中共筛选出61个活性化合物，对应于281个类药活性成分作用靶点，231个疾病靶点与高脂血症密切相关，其中20个疾病靶点与药物作用靶点重叠，为荷丹片治疗高脂血症具有重要意义的作用靶点。中药-活性成分-疾病-靶点可视化网络图推测发挥调节血脂作用的中药主要是丹参、山楂、补骨脂，其中关键的化合物为Ergosterol、Guercetol、Corylinal等，关键的作用靶点为PTGS1、ADRB2、F2、PPARG等。GO富集分析表明，荷丹片主要参与调节氧化还原酶活性、脂质结合、离子结合、信号转导活性、核酸结合转录因子活性、脂质代谢过程、单一有机体代谢过程、小分子代谢过程、细胞增殖等生命过程。KEGG通路富集分析结果表明，荷丹片通过调节含血清素的神经突触、PPAR信号通路、药物代谢细胞色素P450、花生四烯酸代谢、亚油酸的新陈代谢等多种途径在高脂血症中发挥药理作用。[结论] 本研究揭示了荷丹片治疗高脂血症的可能作用机制，体现了中药复方多成分、多途径、多靶点协同作用的特点，为进一步研究荷丹片治疗高脂血症的机理提供了新的思路和方法。     

基于关联分析的吴茱萸与8味甘味药配伍作用规律研究

[目的] 以关联分析和高效液相色谱法（HPLC）探讨甘味中药在配伍过程中对吴茱萸的作用规律，以期为吴茱萸配伍机制研究提供参考。[方法] 通过收集整理含有吴茱萸的处方，利用Apriori算法挖掘其潜在配伍规律并获取常与吴茱萸配伍的甘味中药；采用HPLC分析法，检测配伍前后吴茱萸中3种主要成分柠檬苦素、吴茱萸碱、吴茱萸次碱在提取物中的含量变化。[结果] 8种甘味中药均可不同程度的降低吴茱萸中3种主要成分的含量；黄芪使3种有效成分的含量明显下降，甘草可明显地降低吴茱萸碱和吴茱萸次碱的含量但对柠檬苦素的作用较小。[结论] 甘味中药能够降低吴茱萸中主要毒性成分兼活性成分的含量进而降低其毒性；黄芪对3种成分的降低作用最显著，甘草有良好的"减毒存效"作用。本研究应用数据挖掘技术结合HPLC发掘吴茱萸配伍规律并进行分析，为探索药物配伍的合理性和规律性提供参考。     

基于网络药理学技术探究冠心七味片治疗冠心病的作用机制

目的 阐明冠心七味片的药效物质,探索其药效成分的潜在靶点.方法 采用融合了口服可利用度预测、类药性评估、主成分分析、分子对接模拟,以及药效分子-靶点-疾病网络分析等方法为一体的网络药理学模型,研究冠心七味片所含中药组分和靶点间的相互作用.结果 冠心七味片的18个主要药效分子与治疗冠心病的41个靶点其有高网络度,且与分子对接计算得出的18个潜在靶点具有较强的结合能.筛选出的7个冠心七味片关键靶点与冠心病的治疗密切相关.结论 筛选出冠心七味片中18个可能的药效分子和7个关键作用靶点,初步阐明了冠心七味片多成分、多靶点、协同作用的分子机制.     

基于网络药理学的健脾祛痰和血方治疗冠心病的分子机制研究

[目的] 以网络药理学作为研究手段，研究健脾祛痰和血方治疗冠心病的作用靶点及信号通路，揭示健脾祛痰和血方治疗稳定型心绞痛的分子机制。[方法] 采用中药系统药理数据库和分析平台（TCMSP）、中医药信息数据库（TCMID）、中药潜在药物靶标数据库（TCM-PTD）检索该方剂对应的药物化合物，通过ChemMapper数据库预测药物靶点，通过TTD、disgenet、human phenotype ontology数据库进行检索，获得冠心病相关靶点，以venny图得到疾病及药物的共同靶点，应用功能蛋白结合网络string平台构建蛋白互作模型，采用cytoscape的cluego插件富集分析，得到该方剂治疗冠心病相关靶标基因及代谢通路。[结果] 获得药物靶点103个，疾病靶点980个，健脾祛痰和血方42个药物靶点与冠心病相关，通过筛选得到主要药物成分9个，最终预测到25个相关的信号通路，在此基础上构建了主要药物成分-病药共性靶点-信号通路共表达网络。[结论] 健脾祛痰和血方可能通过多靶点、多途径干预冠心病稳定型心绞痛，为后续基础及进一步临床研究提供思路和线索。     

基于网络药理学与分子对接技术的荆银合剂干预新型冠状病毒肺炎的作用机制研究

目的 应用网络药理学和分子对接的方法 ,探讨荆银合剂干预新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的分子靶点及可能机制.方法 ? 利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索荆银合剂的潜在入血活性成分和靶点.通过GeneCard数据库检索COVID-19相关靶点.利用STRING 10.5软件构建荆银合剂成分靶点与COVID-19靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络.利用R 3.6软件进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;采用AutoDock Tools 1.5.6和AutoDock Vina 1.1.2软件进行分子对接研究.结果 根据药动学参数口服生物利用度和类药性筛选出120种活性成分,并获得了与这些成分相关的232个靶点.从GeneCard数据库中获得350个与COVID-19直接相关的靶点,从成分靶点与疾病靶点网络的交集中获得47个靶点,这些靶点主要参与细胞内脂多糖反应、氧化应激反应、对机械刺激的反应等生物学过程.分子功能主要包括细胞因子受体结合、细胞因子活性、受体配体活性等,其机制与低氧诱导因子1信号通路、NF-κB信号通路、细胞凋亡等有关.分子对接结果 显示荆银合剂中槲皮素、木樨草素与6LU7和6M3M蛋白具有一定的亲和力.结论 荆银合剂的活性成分可能通过抗病毒、抗炎、调控细胞周期对COVID-19及其导致的炎症和肺损伤具有潜在的干预作用,研究结果 可为中医药干预COVID-19提供一定的理论基础与科学依据.     

基于网络药理学的墨旱莲-女贞子药对“异病同治”糖尿病肾病与糖尿病视网膜病变的机制研究

[目的]通过网络药理学的方法,研究墨旱莲-女贞子药对"异病同治"糖尿病肾病(DN)与糖尿病视网膜病变(DR)的药理作用机制,验证国医大师吕仁和教授治疗DN与DR的临床经验。[方法]利用TCMSP、TCMID和Uniprot数据库,搜集并获取墨旱莲、女贞子的化学成分及其作用靶点。利用NCBI-gene、Genecards和OMIM数据库搜集DN和DR的疾病相关靶点。通过String数据库、Cytoscape3.7.2软件、TBtools软件构建药物靶点蛋白相互作用网络,获取交集靶点。利用BioGPS数据库和Cytoscape3.7.2软件构建作用靶点-组织分布网络图,运用GO数据库和Cytoscape3.7.2软件的ClueGO插件对交集靶点进行GO和KEGG富集分析。[结果]墨旱莲-女贞子药对主要含有14个活性成分和124个潜在作用靶点,DN相关靶点2 614个,DR相关靶点2 587个,其中药对同时作用于DN和DR的共同靶点有63个。有11个作用靶点在胰岛、视网膜和肾脏高表达,KEGG富集分析得到共同靶点主要富集在糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路和IL-17信号通路等115条通路上,涉及对含氧化合物的反应、细胞对化学刺激的反应、对脂质的反应和细胞群增殖的调节等1 686个生物过程。[结论]墨旱莲-女贞子药对可能通过调节多个靶点、多条通路和多个生物反应过程,达到对DN与DR的"异病同治"作用,为吕仁和教授的临床经验用药提供了网络药理学验证,也为今后进一步研究墨旱莲-女贞子药对的药理作用机制提供了依据。