基于网络药理学与分子对接技术的荆银合剂干预新型冠状病毒肺炎的作用机制研究

目的 应用网络药理学和分子对接的方法 ,探讨荆银合剂干预新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的分子靶点及可能机制.方法 ? 利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索荆银合剂的潜在入血活性成分和靶点.通过GeneCard数据库检索COVID-19相关靶点.利用STRING 10.5软件构建荆银合剂成分靶点与COVID-19靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络.利用R 3.6软件进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;采用AutoDock Tools 1.5.6和AutoDock Vina 1.1.2软件进行分子对接研究.结果 根据药动学参数口服生物利用度和类药性筛选出120种活性成分,并获得了与这些成分相关的232个靶点.从GeneCard数据库中获得350个与COVID-19直接相关的靶点,从成分靶点与疾病靶点网络的交集中获得47个靶点,这些靶点主要参与细胞内脂多糖反应、氧化应激反应、对机械刺激的反应等生物学过程.分子功能主要包括细胞因子受体结合、细胞因子活性、受体配体活性等,其机制与低氧诱导因子1信号通路、NF-κB信号通路、细胞凋亡等有关.分子对接结果 显示荆银合剂中槲皮素、木樨草素与6LU7和6M3M蛋白具有一定的亲和力.结论 荆银合剂的活性成分可能通过抗病毒、抗炎、调控细胞周期对COVID-19及其导致的炎症和肺损伤具有潜在的干预作用,研究结果 可为中医药干预COVID-19提供一定的理论基础与科学依据.     

基于网络药理学的青风藤治疗类风湿关节炎的作用机制研究

目的应用网络药理学研究方法,探讨青风藤治疗类风湿关节炎(RA)的可能作用机制。方法使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选青风藤的化学成分,并依据TCMSP数据库的口服生物利用度(OB)和类药性指数(DL)筛选出主要有效活性成分。借助DRAR-CPI分子对接服务器得到有效活性成分的潜在作用靶点。通过Genecards、OMIM数据库筛选出RA的靶点,利用Venn软件获取药物与疾病的共同靶点,运用Cytoscape软件构建“化合物-靶点-疾病”网络图。使用String数据库绘制靶蛋白相互作用(PPI)网络,利用clusterProfiler程序包对有效作用靶点进行GO功能、KEGG通路富集分析。结果该研究共筛选出青风藤有效活性成分6个,作用靶点176个;RA靶点305个;青风藤治疗RA的靶点15个。GO功能富集分析显示500个生物过程(BP)、18个细胞组成(CC)、28个分子功能(MF)。KEGG通路富集分析显示77条通路。结论该研究初步揭示了青风藤中以青藤碱为主的6种有效活性成分发挥了抗RA的作用,治疗的关键靶点与IL-10、IL-4、INS、MAPK8、ELANE、MAPK1、MAPK14有关,涉及的生物学过程及信号通路主要与感染、炎症及免疫相关,为进一步的分子生物学实验研究奠定了基础。     

基于铁死亡基因的乳腺癌预后模型构建

目的 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库挖掘与乳腺癌预后相关的铁死亡基因,构建乳腺癌预后模型.方法 下载TCGA数据库中转录组与临床数据,获取与预后相关的在乳腺癌组织与癌旁正常组织中存在差异表达的铁死亡基因,利用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归法构建风险评分模型.将TCGA数据库中获取的患者信息作为模型测试集...     

热毒宁与血必净“同病异治”新型冠状病毒肺炎的网络药理学作用机制研究

目的:采用网络药理学的方法,研究热毒宁与血必净的活性成分、作用靶点及生物学意义,探讨其“同病异治”新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)的作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)获取热毒宁与血必净的成分和靶点。采用GeneCards筛选COVID-19相关的蛋白,利用Cytoscape软件和STRING分别构建活性成分靶点网络和蛋白相互作用网络。借助Cytoscape的ClueGo工具和分子对接先后进行通路富集分析和验证。结果:网络分析结果表明,两方共有成分包括木犀草素、槲皮素、山奈酚、异鼠李素和植物甾醇等,其中槲皮素、木犀草素和山奈酚对新型冠状病毒产生的主要蛋白酶(3CLpro)有一定的结合能力;血必净中含有65个特有成分,热毒宁中含有24个特有成分。这些成分可能通过血管内皮生长因子A(VEGF-A)、胱天蛋白酶3(CASP3)、白介素6(IL-6)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、MAPK8等关键蛋白,以及Jak-STAT信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、TGF-β信号通路发挥抗COVID-19的作用。结论:热毒宁与血必净由于组方差异,在抗COVID-19靶点方面既有相同也有不同。本研究通过对其靶点和通路的分析,初步阐明了两方对COVID-19“同病异治”的科学内涵。     

不同产地南五味子和北五味子中2种三萜酸的含量测定

目的 建立HPLC法同时测定五味子中2种三萜酸类成分甘五酸和黑老虎酸的含量,并考察不同产地五味子中甘五酸、黑老虎酸的含量差异,为提高药材质量研究提供依据.方法 色谱柱为Waters Symmetry C18柱(4.6 mm×250 mm,5μm),流动相为甲醇-1％甲酸水(86:14),检测波长220 nm,流速1.0 mL/min,柱温30℃,进样量10μL.进行方法学考察,测定辽宁、吉林、湖北、湖南、陕西、山西、河南7个产地五味子样品中甘五酸、黑老虎酸的含量.运用SPSS软件(SPSSAU)对数据进行分析.结果 甘五酸、黑老虎酸在10～800μg/mL范围内线性关系良好,相关系数均为0.9997,平均加样回收率分别为97.25％(RSD=2.04％,n=6)和96.02％(RSD=2.03％,n=6).不同产地五味子样品中的甘五酸和黑老虎酸含量变化较大.5个产地的南五味子(湖北、湖南、陕西、山西、河南产五味子)中甘五酸、黑老虎酸的含量均高于北五味子(辽宁、吉林产五味子),甘五酸含量最高的为河南产五味子[(0.285±0.015)mg/g],最低的为吉林产五味子[(0.068±0.017)mg/g];黑老虎酸含量最高的为山西产五味子[(0.927±0.017)mg/g],最低为吉林产五味子[(0.039±0.010)mg/g].结论 本研究建立的方法简单、准确、可靠、重复性好,适合同时对这2种三萜酸类成分甘五酸和黑老虎酸的定量分析.     

基于网络药理学对降脂护肝胶囊干预脂肪肝的机制研究

目的 应用网络药理学方法,探讨降脂护肝胶囊（JZHG）治疗脂肪肝（FL）的可能机制,为其临床用药提供理论指导。方法 利用TCMSP与TCMID检索JZHG的活性成分和靶点,通过GeneCard与OMIM数据库检索FL的相关靶点,并采用交集法筛选出二者的共同靶点,运用Cytoscape构建“活性成分-靶点”网络,利用STRING软件构建PPI网络。通过 Bioconductor 数据库以及R软件进行GO和KEGG富集分析。结果 根据口服生物利用度和类药性筛选出46种活性成分,从GeneCard与OMIM数据库中筛选靶点7406个。成分靶点与疾病靶点取交集,获得118个共同靶点。这些靶点主要参与氧化应激、细胞凋亡、炎症反应、激素抵抗等生物学过程。其作用机制与PI3K-Akt信号通路,人巨细胞病毒感染和癌症中的微小RNA等信号通路有关。结论 JZHG中的活性化合物干预脂肪肝的机制可能是通过抗氧化应激和抗炎等作用改善脂代谢,降低肝脏脂肪堆积实现的。     

基于数据挖掘的中医药治疗盆腔静脉淤血综合征用药规律研究

[目的]分析中医药治疗盆腔静脉淤血综合征(pelvic congestion syndrome,PCS)的用药规律,为中医药临床诊治PCS提供依据。[方法]检索1994年1月至2019年6月Sinomed、Pubmed、中国知网(China National Knowledge Infrastructure,CNKI)、维普、万方数据库中以中医药治疗PCS的相关研究文献,采用SPSS 21.0统计软件,分别对药物频次、药类、性味、归经进行频次分析,得出PCS用药在文献中的大致分布规律。[结果]根据文献检索策略,经过筛选和排除动物实验和重复研究,最终纳入83篇相关研究文献。口服给药频次前6位的中药依次为当归、川芎、延胡索、丹参、赤芍及桃仁,药物功效频次前4类的为活血化瘀药、补益药、清热药及理气药;外治法给药频次前6位中药依次为丹参、赤芍、桃仁、延胡索、当归及三棱,药物功效频次前4类的依次为活血化瘀药、清热药、补益药及解表药。两种给药方法的中药四气分布温性均多于寒性,五味分布前3位是苦、辛、甘,归经前4位均是肝经、脾经、心经、肾经。[结论]在用药特点上,治疗PCS最常用的中药为当归、丹参、赤芍、延胡索;治法上,主要采用活血祛瘀法,同时重视扶正,辨证运用清热、理气、解表等治法。