新疆维吾尔族慢性乙型肝炎病毒感染者病毒基因型及亚型分布特点

目的 了解新疆维吾尔自治区(简称新疆)维吾尔族慢性HBV感染者基因型、基因亚型分布情况及其与预后的关系.方法 采用聚合酶链反应限制性片段长度多态性分析方法,分析109例新疆维吾尔族慢性HBV感染者感染病毒的基因型及基因亚型.多标本均数比较采用单向方差分析.结果 109例新疆维吾尔族慢性HBV感染者,其中慢性乙型肝炎88例,乙型肝炎肝硬化17例,肝癌4例.13基因型HBV感染者9例,占8.3%,C基因型感染者50例,占45.9%,C/D基因型重组体32例,占29.4%,D基因型感染者18例,占16.5%,C基因型、C/D基因型重组体为主要基因型.经过聚合酶链反应限制性片段长度多态性分析及测序检测,鉴定9份B基因型HBV,均为Ba亚型.50例C基因型HBV感染者病毒基因亚型分布情况:Cl亚型27例,占54%,C2亚型23例,Cl亚型比C2亚型感染者多.在慢性乙型肝炎、乙型肝炎肝硬化、肝癌患者中,HBV Ba基因亚型感染者分别为8例(9.1%)、1例(5.8%)和0例;C2基因亚型感染者分别为17例(19.3%)、8例(47.5%)和2例(50%);C/D基因型感染者分别为29例(33.0%)、2例(11.9%)和1例(25%),随着病情加重,Ba基因亚型和C/D基因型感染者所占比例呈下降趋势,C2基因亚型感染者所占比例增加.结论 新疆地区维吾尔族慢性HBV感染者以Cl基因亚型为主,新疆维吾尔族慢性HBV感染者存在C/D基因型重组体.C2基因亚型HBV感染预示病情严重,预后差.     

拉米夫定治疗无良好应答患者乙型肝炎病毒P区突变与基因型的关系

目的 观察拉米夫定治疗后无良好应答的慢性乙型肝炎患者HBV P区变异情况与基因型的关系.方法 对631例拉米夫定治疗后无良好应答的慢性乙型肝炎患者进行研究.通过荧光定量PCR或核酸测序确定HBV基因型,直接测序观察P区突变,实时荧光定量PCR方法检测患者病毒载量,比较不同基因型患者的HBV DNA水平及HBV P区变异情况.计量资料采用成组设计资料t检验,计数资料采用x~2检验或Fisher精确检验.结果 631例慢性乙型肝炎患者中,B基因型HBV感染者272例,C基因型感染者359例,C基因型感染者患者年龄为(39.1±11.4)岁,明显大于B基因型感染患者的(33.7±9.7)岁(t=-6.55,P<0.01).C基因患者病毒载量为(5.96±1.22)log_(10)拷贝/ml,高于B基因型患者的(5.58±1.21)log_(10)拷贝/ml,t=-2.01,P<0.05.A181V/T变异在C基因型的发生率高于B基因型(0.4%比5.3%,χ~2=12.23,P<0.01),M204I/V,L180M、T184A/G/I/S、S202G/I和V173L变异发生率在B、C基因型之间差异无统计学意义(P值均>0.05).M204I在B基因型的发生率为20.6%,高于C基因型的13.9%(χ~2=4.91,P<0.05);M204V和M201Ⅳ变异在B、C基因型中的发生率差异无统计学意义(χ~2值分别为1.70和2.21,P值均>0.05).拉米夫定耐药发生率在B、C基因型间差异无统计学意义(χ~2=0.00,P>0.05).结论 拉米夫定常见耐药位点在B、C基因型之间无明显差异,但是C基因HBV感染患者病毒载量高于B基因型HBV感染患者;M204I变异在B基因型中出现频率高于C基因型,拉米夫定加用或改用阿德福韦酯后可能会使A181V/T变异在C基因型出现的概率高于B基因型;年龄、免疫因素和非常见位点的变异或许是影响拉米夫定疗效的重要因素.     

乙型肝炎病毒基因型及亚型与YMDD、前C和C基因启动子变异的关系

目的 探讨乙型肝炎病毒(HBV)基因型及亚型与YMDD变异的关系,以及前C基因区终止密码变异(A1896)、基本核心启动子(BCP)区T1762/A1764变异在Ba、C1和C2三种基因亚型中的发生情况.方法 采用聚合酶链反应-限制性片断长度多态性(PCR-RFLP)法对211例服用拉米夫定后发生YMDD耐药变异的患者HBV进行基因型、基因亚型、A1896及T1762/A1764变异检测.结果 211份标本中B基因型占50.7%(1071211),C基因型占49.3%(104/211),与广东地区对照人群HBV基因型分布情况相比无统计学差异(χ2=0.508,P=0.476).进一步亚型分析发现,107份B基因型全部为Ba亚型;C基因型有C1和C2两种亚型,其中C1亚型占64.4%(67/104),C2亚型占35.6%(37/104),与广东地区对照人群C基因亚型分布情况相比也无统计学差异(χ2=0.043,P=0.836).A1896变异在Ba亚型中的分布最高(41/107,38.3%),C2亚型次之(13/39,33.3%),C1亚型最低(9/65,13.8%),变异在不同基因亚型中的分布有统计学差异(χ2=11.839,P=0.03).T1762/A1764变异在C1亚型中的分布最高(34/65,52.3%),C2亚型次之(17/39,43.6%),Ba亚型最低(23/107,21.5%),T1762/A1764变异在不同基因亚型中的分布有统计学差异(χ2=18.384,P＜0.001).结论 HBV基因型及亚型并不影响YMDD变异的发生,但3种基因亚型发生A1896及T1762/A1764变异的模式存在明显不同.     

泉州地区慢性乙型肝炎患者HBV基因型、基因亚型及血清型分布调查

目的调查泉州地区慢性乙型肝炎患者HBV基因型、基因亚型及血清型的分布。方法采用巢式PCR法对48例样本S基因扩增后进行测序,应用Neighbor Joining构建系统进化树并分析其基因型和基因亚型,应用Magnius和Norder法进行血清型分析。结果48例慢性乙型肝炎患者中,检测出B基因型35例（68.8%）,C型13例（31.2%）;B基因型中Ba亚型占97.0%,adw2血清型占93.9%;C基因型中C2亚型占93.3%,adrq+血清型占80.0%。结论泉州地区慢性乙型肝炎患者以B基因型为主,其次是C基因型;B基因型样本中,以Ba亚型和adw2血清型为主,C基因型样本中,以C2亚型和adrq+血清型为主。     

不同乙型肝炎病毒基因型感染与阿德福韦酯疗效的相关性

目的探讨HBV基因型对阿德福韦酯的抗病毒治疗效果的影响及HBV耐药变异情况。方法对应用阿德福韦酯初治的336例慢性乙型肝炎(乙肝)患者治疗前行HBV基因分型检测;治疗48周和96周分别对临床疗效及HBV耐药变异率进行比较。结果治疗48周B基因型HBV感染者(B基因型)血清HBV-DNA均值较基线下降幅度及血清HBV-DNA转阴(血清HBV-DNA<1×103copies/mL)率优于C基因型HBV感染者(C基因型),P<0.05;B基因型与C基因型者血清ALT复常率及血清学应答(血清HBeAg转阴或血清HBeAg/抗-HBe转换)率比较无统计学意义。血清HBV-DNA阴性者继续阿德福韦酯单药治疗至96周,B基因型与C基因型者血清学应答率和HBV耐药变异率比较均无统计学意义。结论感染B基因型HBV者阿德福韦酯的治疗效果优于感染C基因型者;血清ALT复常率、血清学应答率及HBV耐药变异率与HBV基因型无明显关系。     

秦皇岛市136例慢性乙型肝炎患者拉米夫定的疗效及其与HBV基因型的关系

目的:探讨秦皇岛市慢性乙型肝炎(CHB)患者拉米夫定治疗疗效与基因型的关系。方法:136例CHB患者口服拉米夫定,100mg/次,1次/d,疗程48周,用药前采用PCR方法测定乙型肝炎病毒(HBV)A～D基因型。结果:秦皇岛市CHB患者基因型以C型为主,占75.74%,其次为B基因型占16.91%,B/C混合型占7.35%,B基因型在拉米夫定抗病毒治疗48周时显示HBV DNA阴转率、HBeAg血清转换率、ALT复常率、治疗有效率4方面均高于C型及B/C基因型(P0.05),B基因型HBV感染者有较低的YMDD变异发生率。结论:拉米夫定抗病毒疗效与基因型有关,HBV基因型测定可作为预测拉米夫定抗病毒疗效的指标。     

慢性乙型肝炎病毒感染者病毒YMDD的自然变异

目的 了解慢性HBV感染患者外周血HBV YMDD自然变异情况及其影响因素.方法 采用引物特异性实时荧光PCR法检测慢性HBV感染者外周血HBV YMDD变异情况,并对影响YMDD自然变异检出率的可能因素进行单因素及多因素分析.根据不同资料分别采用χ~2检验、Fisher's确切概率法、t检验、秩和检验及Logistic回归分析进行统计学处理. 结果在196例未经抗病毒治疗的慢性HBV感染者中,检出存在YMDD自然变异株感染者21例(10.70%),其中YVDD阳性20例,YIDD阳性例1变;变异毒株占总病毒株超过50%者1例,25%～500者5例,9%～25%者15例.B基因型HBV感染病例中YMDD变异株的检出率(20.00%,12/60)显著高于C基因型HBV感染病例(7.38%,9/122),χ~2=6.28,P<0.05.患者性别、年龄、HBeAg状态、HBVDNA载量、疾病状态、病毒感染时间对YMDD自然变异株的检出率无显著影响. 结论 在未经抗病毒治疗的慢性HBV感染者中存在HBV YMDD自然变异;YMDD自然变异的发生率与患者性别、年龄、HBeAg状态,HBV DNA载量、疾病状态、感染时间无显著相关性.B基因型较C基因型HBV更易出现YMDD自然变异.     

乙型肝炎病毒RT区原发性耐药变异的研究

目的探讨核苷(酸)类似物(NA)治疗前乙型肝炎病毒(HBV)RT区原发性耐药变异的发生情况。方法采用PCR产物直接测序技术对61例未接受NA治疗的慢性HBV感染者进行HBV RT区序列测定,分析NA治疗前HBV RT区原发性耐药变异的发生率。结果通过HBV基因扩增、PCR产物直接测序后,共获得61个HBV RT区基因序列,采用HBV RT区基因进化树基因分型共分出B型42例(42/61,68.85%),C型19例(19/61,31.15%),未检出其他基因型。通过核苷酸序列及氨基酸序列分析,对NA常见的10个耐药变异位点(rtI169T、rtV173L、rtL180M、rtA181V/T、rtT184G/S/A/I、rtA194T、rtS202I/G、rtM204I/V、rtN236T、rtM250V)进行比对后,61例患者中共检出HBV RT区变异3例(rtM204I 2例,rtM204I+L180M 1例),自然耐药变异的检出率为4.92%。结论慢性HBV感染者存在少量RT区原发性耐药变异位点,与原发性无应答有关。     

新疆地区HBV基因型分布特点及其与肝硬化的相关性分析

目的探讨新疆地区HBV基因分型构成特点及其与肝硬化之间的关系。方法收集2011年10月至2013年6月新疆维吾尔自治区中医医院收治的慢性HBV感染者1018例。其中检测出基因型、资料完整的828例。根据实验室检查及彩超或CT结果将患者分为慢性乙型肝炎组、肝硬化组、原发性肝癌组。采用PCR法对HBV基因分型,运用列联卡方、秩和检验、多因素Logistic回归分析等方法对HBV基因型与临床病情及相关慢性肝病结局进行分析。结果 828例患者中,以C型为主,占总样本的54.11%(448/828),B型占25.15%(200/828),D型占16.18%(134/828);各基因型病情程度构成差异无统计学意义(H=0.1689,P0.05);116例肝硬化患者中基因C型占20.84%,与B型和D型相比较差异均有统计学意义(χ2值分别为25.486、20.947,P值均为0.000);乙型肝炎病程10年以上、基因C型、HBV DNA高病毒载量、ALTULN进入回归模型(P0.05)。其中基因C型与肝硬化的相关度最高(OR=2.819,95%CI:1.582~5.021)。结论新疆地区HBV基因分型以C型为主,其次为B型、D型。基因C型是HBV相关肝硬化患者的独立危险因素。     

慢性乙型肝炎、乙型肝炎肝硬化及原发性肝癌患者HBV-X基因突变分析

目的研究慢性HBV感染者,如慢性乙型肝炎(CHB)、乙型肝炎肝硬化(LC)、原发性肝癌(PLC)患者血清中HBV-X基因序列的突变与肝癌发生的关系。方法收集2011-2013年间于重庆医科大学附属第二医院就诊的慢性HBV感染者血清共89例,从血清中提取HBV DNA,扩增全长HBV-X基因序列,经测序后与已知HBV-X基因相应序列比较该患者体内HBV-X基因变异位点以及变异形式,并用卡方检验、单因素方差分析处理数据,NCBI的genotype工具测定基因型。结果所有患者均属于B/C基因型,HBeAg阳性患者中B基因型占46.2%,C基因型占53.8%;HBeAg阴性患性中B基因型占81.2%,C基因型占18.8%(P=0.001)。在PLC组中,启动子(BCP)区的突变显著高于CHB、LC(69.2%vs34.4%和61.3%,P0.05),且nt1821位点存在明显的T碱基的缺失(88.5%vs 53.1%和71%,P=0.014)。在CHB、LC中,C基因型BCP的双突变率显著高于B基因型(61.5%vs 15.8%,P=0.007;83.3%vs 47.4%,P=0.045),HBV DNA低病毒载量(≤106拷贝/ml)中BCP的突变率较高病毒载量(106拷贝/ml)更显著(81.3%vs 47.9%,P=0.015)。结论 BCP区的双突变及nt1821位点的缺失可能与PLC的发生密切相关。     

厦门市乙型肝炎病毒亚基因型分布的初步研究

目的探讨厦门地区乙型肝炎患者血清乙型肝炎病毒（HBV）基因型的分布情况。方法应用混合性型特异性引物聚合酶链反应法结合琼脂糖电泳，根据PCR产物片段大小直接判定HBV基因型；应用PCR扩增全S基因序列-DNA测序-生物信息学分析方法确定部分样本的亚基因型，并探讨前前S区编码的流行情况。结果在217例可以通过混合性型特异性引物聚合酶链反应法确定基因型的感染者中，B型83例（38．2％）、C型71例（32．7％），B／C混合型63例（29．0％）。HBeAg阳性患者中感染B基因型占50％，B／C型混合感染占22％；抗-HBe阳性患者中B／C型混合感染36％，B型38％；在慢性乙型肝炎患者中，以B基因型多见（46％），在肝硬化和肝癌患者中，以C（41％和42％）或B／C混合基因型（38％和33％）感染为主；20例患者血清经过DNA测序-生物信息学分析方法确定了亚基因型，其中B2亚型2例，C2亚型18例，其中混合性型特异性引物聚合酶链反应判断为B型的4例经过测序分析为C2亚型。B2亚型不编码前前S区，18例C2亚型均编码前前S区。结论本研究提示厦门地区乙型肝炎患者群的HBV基因型B、C型的感染率大致相同，亚基因型分析提示C2亚基因型占90％，可能是B／C基因型重组的结果。C2亚基因型病毒株均编码前前S区，提示前前S区的编码可能具有亚基因型特异性。     

广州地区424例乙型肝炎患者病毒基因亚型分布与乙型肝炎疾病谱的关系探讨*

目的调查广州地区乙型肝炎病毒（HBV）基因亚型分布情况, 并探讨其与HBV感染疾病谱的关系。方法采用直接测序法测定S基因序列并构建基于S基因进化树,对424例HBV感染者进行研究,随机选择慢性乙型肝炎（CHB）137例,HBV相关慢加急性肝衰竭（HB-ACLF）90例,肝硬化（LC）90例和肝细胞癌（HCC）107例,应用SPSS 13.0软件进行x²检验、方差分析和多元Logistic回归分析。结果在424例HBV感染者中,B2亚型 269例（63.44%）,C1亚型117例（27.59%）,C2亚型36例（8.49%）,C5亚型 2例（0.47%）,未发现其他亚型;CHB患者感染HBV B2亚型、C1亚型、C2亚型和C5亚型分别为70.1%、24.09%、5.11%和0.73%;HB-ACLF患者感染HBV B2亚型、C1亚型和C2亚型分别为87.78%、7.78%、4.44%,其中HBV B2基因亚型显著高于CHB（x²=9.641,P=0.002）、LC（x²=19.565,P=0.000）、HCC患者（x²=26.789,P=0.000）;LC患者感染HBV B2亚型、C1亚型和C2亚型分别为50.00%、36.67%、13.33%,其中HBV C1和C2亚型显著高于CHB患者（x²=6.262,P=0.012;x²=4.790,P=0.029）或HB-ACLF患者（x²=25.894,P=0.000;x²=4.390,P=0.036）;HCC患者感染HBV B2亚型、C1亚型、C2亚型和C5亚型分别为45.79%、41.12%、12.15%、0.93%,其中HBV C1和C2亚型也显著高于CHB患者（x²=11.264,P=0.001;x²=3.957,P=0.047）或HB-ACLF患者（x²=28.327,P=0.000;x²=3.904,P=0.048）;LC和HCC患者HBV C1和C2基因亚型无明显差异（x²=0.429,P=0.512;x²=0.804,P=0.833）;多因素Logistic回归分析提示B2亚型是HB-ACLF发生的危险因素（OR=2.597,95%CI=1.145~5.891,P=0.022）,C型是HCC发生的危险因素（OR=3.257,95%CI=1.49~7.194,P=0.003）。结论广州地区HBV基因亚型主要由B2、C1和C2亚型构成,同时也存在C5亚型;广州地区B2亚型感染者可能更易发生HBV相关慢加急性肝衰竭,而C1和C2亚型感染者可能更易进展为肝硬化和肝细胞癌。     

Clinical relevance and public health significance of hepatitis B virus genomic variations

Ten hepatitis B virus (HBV) genotypes (A-J) and 34 HBV subgenotypes have been identified so far. HBV genotypes and subgenotypes have distinct geographical distributions, and have been shown to differ with regard to clinical outcome, prognosis, and response to interferon treatment. Infection with subgenotype A2 is frequently associated with high viral load, resulting in acute infection via horizontal transmission. Genotypes A and B are more sensitive to interferon treatment than genotypes D and C, respectively. Genotype B is more frequent in acute hepatitis than genotype C, whereas genotype C (C2) is more frequently associated with an increased risk of hepatocellular carcinoma (HCC), mostly cirrhotic, as compared with genotype B (B2). Genotype mixture is associated with high viral load and worse outcome of HBV infection. HBV mutations in the S genes, especially amino acids substitution at position 145 (G145R), are associated with immune escape, whereas mutations in the PreS or S genes which impair HBsAg secretion could present a risk to blood safety. HBV variants harboring mutations in the viral polymerase gene that confer resistance to nucleoside analogs may be selected during antiviral therapy. Different genotypes have distinct mutation patterns in the PreS and EnhⅡ/BCP/Precore regions.PreS deletions, C1653T, T1753V, and A1762T/G1764A are associated with an increased risk of HCC. HCCassociated HBV mutants may not transmit via motherto- child transmission, and are likely generated during HBV-induced pathogenesis. Examination of HBV mutations alone or in combination and host genetic suscep susceptibility will be helpful in classifying the HBV-infected subjects who will develop HCC and need active antiviral treatments.     

中国广东地区乙型肝炎病毒基因亚型的分布

目的调查中国广东地区乙型肝炎病毒(HBV)基因型,主要是基因亚型的分布情况.方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法以及序列测定法,对广东地区417例慢性HBV感染者血清进行研究.结果广东地区流行的HBV基因型主要为B型和C型,其中B型为Ba亚型,未发现Bj亚型的存在.C亚型有C1和C2两个亚型,其中C1占63%,C2占37%.结论广东地区流行的HBV基因型以Ba和C1亚型为主,C2亚型较少,Bj亚型极为罕见.     

山西省HBV基因型及亚型分布调查

目的了解山西省乙型肝炎病毒(HBV)的基因型及亚型分布情况。方法对136例乙型肝炎表面抗原(HBsAg)阳性者血清采用PCR-PFLP结合基因型特异性引物-PCR法进行HBV基因型及亚型检测。结果 136例HBV感染者的血清标本经PCR-PFLP分析,B基因型18例,均为Ba亚型,占13.2%;C基因型113例,占83.1%,除4例未分型外均为Ce亚型;D基因型5例,占3.7%。经型特异性引物-PCR分析,18例HBV B基因型中有4例为B/C基因型混合感染;5例经PCR-PFLP确定的D基因型病毒经型特异性引物法分析有2例扩增出E基因型条带。C、B基因型病毒感染者的平均年龄分别为(39.5±13.1)岁和(30.5±14.1)岁,差异有统计学意义(P<0.05);与B基因型相比,C基因型病毒感染者的HBeAg阴转率减慢。结论山西省HBV基因型主要为C(Ce),有少量的B(Ba)和D基因型,且存在B/C混合基因型,且可能存在D和E基因型病毒的重组体;与B基因型比较,感染C基因型病毒更难被机体清除,疾病更易慢性化。     

Hepatitis B virus genotypes and subgenotypes in China

Eight Hepatitis B virus (HBV) genotypes (A to H) have been identified based on an intergenotype divergence of 8% or more in the entire nucleotide sequence. Subgenotypes have also been identified in different HBV genotypes. As a highly endemic area for HBV infection, the prevalence of chronic HBV infection in China is between 8 and 20% of the general population. Genotypes B and C were identified as the most common HBV strains and account for approximately 95% of Chinese patients. Further study confirmed all genotype B strains belong to subgenotype Ba. Two of genotype C subgenotypes, C1 (Cs) and C2 (Ce), were found in China and they showed different geographic distributions. Genotype A was very rarely found, while genotypes E, F, G and H have not beenreported until now. Two types of HBV C/Drecombinant viruses have been identified in west China and distinct geographic and ethnic distributions were observed. Significant differences were observed ( P  < 0.001) in the prevalence of A1896 and T1762/A1764 mutations among HBV Ba, C1 and C2 subgenotypes in Chinese patients. Accumulating evidence showed the response rate to antiviral therapy in Chinese patients is higher in genotype B than genotype C patients on interferon treatment, but no difference was observed on nucleoside/nucleotide analog treatment.     

e抗原阳性慢性乙型肝炎患者感染病毒的基因型与抗病毒治疗疗效的关系

目的 探讨HBV基因型与抗病毒治疗疗效的关系。方法 应用PCR-微板核酸分子杂交ELISA法检测90例HBeAg阳性CHB患者的HBV基因型,对其中41例患者给予拉米夫定（100 mg／d）抗病毒治疗48周,49例患者给子干扰素α（3 MU／次,隔日1次）抗病毒治疗48周,治疗前、治疗过程中和治疗结束时分别检测血清生化指标（ALT）、病毒学血清标志物（HBeAg和抗-HBe）和HBV DNA水平。结果 90例CHB患者中HBV B基因型者16例,C基因型者74例。41例患者应用拉米夫定治疗,感染B和C基因型患者48周时对拉米夫定治疗应答率分别为33.3％和20%,差异无统计学意义;49例患者应用干扰素α治疗,48周时感染基因B型患者的ALT复常率、HBeAg消失率和HBV DNA阴转率均高于感染基因C型患者（分别为60.0％和20．5％,50．0％和17．9％, 50．0％和17．9％）,两组比较差异有统计学意义,但HBeAg血清转换率差异无统计学意义。结论 基因B和C型对拉米夫定抗病毒治疗的疗效无影响,基因B型对干扰素α治疗的疗效优于C型。