可疑肺癌患者纤支镜后痰液标本的p53基因突变检测

目的：探讨纤支镜后痰液标本的p53基因突变检测用于肺癌早期诊断的可行性。方法：采用聚合酶链反应－单链构象多态性分析（PCR－SSCP）银染技术,对29例怀疑为肺癌患者的痰液标本行p53基因5－8号外显子突就检测。结果：8例患者有p53突变,突变率为27．6％,其中以6号外显子突变率最高（17．2％）。p53突变率明显高于相应细胞学阳性率（P＜0．05）。结论：纤支镜后痰标本p53突变检测对肺癌的早期诊断具有一定价值,可作为肺癌早期诊断的辅助方法之一。     

结核分支杆菌耐链霉素耐药基因的检测

目的：探讨结核分支杆菌对链霉素(SM)的耐药分子机制,评估应用聚合酶链反应－单链构象多态性（PCR－SSCP）技术检测rpsL基因突变在结核分支杆菌对SM耐药性测定中的应用价值。方法：采用PCR－SSCP方法对71株结核分支杆菌临床分离株（其中药物敏感株35株,耐SM或含耐SM耐多药株36株）和30例耐SM肺结核病人痰标本的rpsL基因突变进行检测。结果：以结核分支杆菌H37RV为对照,35株药物敏感株的rpsL基因PCR扩增产物267bp片段SSCP图谱正常;36株耐SM分离株中,26株rpsL基因SSCP图谱异常,其突变率为72．2％。30例耐SM肺结核病人痰标本有22例PCR扩增阳性,14例SSCP图谱与H37RV株有差异,rpsL突变率为63．6％。结论：rpsL基因突变是SM耐药性的重要分子机制,PCR－SSCP技术可以快速、准确地检测结核分支杆菌rpsL基因突变,该技术有望直接用于临床标本耐药性检测。     

非小细胞肺癌患者p53基因突变检测的临床意义

目的探讨非小细胞肺癌（NSCLC）患者呼出气冷凝液（EBC）中p53基因突变检测的临床意义。方法采用巢式PCR结合DNA测序法,检测53例NSCLC患者EBC中p53基因第5～8外显子的突变情况,并以32例健康体检者EBC标本作为对照。结果肺癌组53例EBC标本中扩增到1）53基因26例,其中10例检测到p53基因突变,突变率为38．5％（10／26）;正常对照组32例EBC标本中扩增到p53基因15例,但未检测到p53基因突变。结论p53基因突变可能参与NSCLC的发生发展,检测EBC中p53基因的突变对肺癌的早期诊断有一定的价值。     

检测结核分枝杆菌rpoB基因突变的研究

目的：建立聚合酶链反应－单链构象多态性（PCR－SSCP）检测结核分枝杆菌rpoB基因突变的方法，并评价共临床应用的价值。方法：依据结核分枝杆菌rpoB基因的耐利福平决定区设计引物，用PCR从临床分离株和直接从痰标本中扩增rpoB基因片段；对扩得的rpoB基因片段做DNA SSCP分析，并随机测定rpoB片段的序列。结果：PCR从所有212株结核分枝杆菌中均扩得230bp片段135份抗酸染色阳性的痰标本中，有113份扩得阳性片段（83．7％），在SSCP分析中，140份经L－J药敏试验检测为利福平耐受的结核分枝杆菌，有130份有rpoB基因突变（符合率为92．9％），72份经L－J药敏试验检测为利福平敏感的菌，有67份的rpoB基因无突变（符合率为93．1％），测序分析发现57份经SSCP检测为突变的rpoB片段均有序列改变，10份经SSCP分析为无突变的有8份无序列改变，SSCP与测序结果的符合率为94．0％，在本研究的菌株中，耐多药结核病（MDR－TB）占76．4％（107／140），有92．5％（99／107）耐多药菌株经SSCP检测有rpoB突变。结论：建立的PCR－SSCP分析方法，是一种较准确和稳定的检测结核分枝杆菌rpoB基因突变的方法，可用于临床快速分析患者结核分枝杆菌对利福平的耐药性，并可作为MDR－TB判断的一个重要指标。     

三种方法在检测Leber′s视神经萎缩mt-DNA突变的比较

比较MSP PCR、SSCP、RFLP在检测Leber s视神经萎缩 (LHON)线粒体DNA (mt DNA) 11778突变中的优缺点。 77例受试者 ,分别用MSP PCR、SSCP、RFLP法检测mt DNA11778突变。被MSP PCR检出的 48例阳性者同时也被SSCP检出 ,另外SSCP还检出 6例杂合性突变 ;MSP PCR和SSCP检测阳性的 9例患者 ,再用RFLP (MaeⅢ )检测也得出一致结果。表明多条件SSCP在mt DNA未知突变筛查中具有优势 ,而MSP PCR有助于确定突变的性质。     

乳腺增生病p53基因第7外显子突变检测

目的：探讨p53基因在乳腺癌发生早期的作用及早期诊断乳腺癌的分子病理指标。方法：用PCR－SSCP法检测36例乳腺单纯性增生、31例不典型增生、14例原位癌和16例浸润癌中p53基因第7外显子突变，并用DNA直接测序技术确定突变的碱基及其所在的密码子。结果：乳腺单纯性增生、不典型增生、原位癌、浸润癌中p53基因第7外显子的突变率分别为0％、6．5％（2／31）、21．4％（3／14）、18．8％（3／16）。8例突变中，3例发生于251密码子，4例发生于248密码子，1例发生于236密码子。表现为碱基替换（5例）、缺失（2例）、插入（1例）共三种突变方式。并在1例原位癌中首次发现了251密码子的同义突变（ATC→ATT,异亮氨酸→异亮氨酸）。结论：乳腺癌不典型增生中存在p53基因第7外显子突变，该突变可能在乳腺不典型增生发展到乳腺癌的过程中起重要作用，可作为早期诊断乳腺癌的辅助指标。     

粪便脱落细胞中p53基因突变检测对大肠癌诊断价值的探讨

目的探讨利用PCR—SSCP分析技术进行粪便脱落细胞中p53基因突变检测用于大肠癌早期筛选诊断的可能性。方法对40例大肠癌患者留取手术切除的癌组织及术前保存的粪便。分别从肿瘤组织及粪便中提取DNA。应用基因扩增．单链多态性分析。溴乙锭（PCR—SSCP—EB）染色方法检测两种标本中p53基因扩增情况及第5、6、7、8外显子突变情况，进行对照分析。结果p53基因特异性扩增产物及5，8外显子突变在肿瘤组织及粪便脱落细胞中广泛存在。肿瘤组织中p53基因突变27例，粪便中24例，其p53突变检出的敏感性为60％，无粪便中检出突变而肿瘤组织未检出者，两种标本中突变检出部分符合率为100％。结论检测粪便脱落细胞中p53基因突变为大肠癌的早期诊断提供了可能性。     

PCR-SSCP快速检测结核分枝杆菌耐利福平rpoB基因的研究

目的探讨PCR—SSCP技术检测结核分枝杆菌耐利福平rpoB基因作为新的分子药敏试验方法的价值。方法应用PCR—SSCP技术检测结核分枝杆菌耐利福平rpoB基因核心区的突变，同时对片段长度为215bp的PCR扩增产物进行测序分析。受试菌为23株利福平敏感结核分枝杆菌以72．35株利福平抗性结核分枝杆菌。结果23株利福平敏感结核分枝杆菌分别用PCR—SSCP和PCR扩增片段测序均没有检测到巾0B碱基突变。而在35株利福平抗性菌株中，PCR—SSCP检测到31株与H37Rv标准株不同的带谱，PCR—SSCP检测基因突变的敏感度和特异度分别为88．6％（31／35）和100％（23／23）。对35株利福平抗性菌株PCR扩增产物进行测序分析，在其中32株中检出了基因突变。测序分析检测基因突变的敏感度和特异度分别为91．4％（32／35）和100％（23／23）。卡方检验，PCR—SSCP和PCR扩增片段测序两种方法的敏感度之间没有显著性差异（P〉0．05）。若以DNA测序为标准，则PCR—SSCP检测基因突变的准确度、敏感度和特异度分别为93．1％（54／58），96．9％（31／32）和100％（23／23）。结论PCR—SSCP检测结核分枝杆菌耐利福平rpoB基因突变可用于利福平药物敏感度的快速测定。     

PCR—SSCP快速检测结核分枝杆菌耐利福平rpoB基因的研究

目的探讨PCR—SSCP技术检测结核分枝杆菌耐利福平rpoB基因作为新的分子药敏试验方法的价值。方法应用PCR—SSCP技术检测结核分枝杆菌耐利福平rpoB基因核心区的突变，同时对片段长度为215bp的PCR扩增产物进行测序分析。受试菌为23株利福平敏感结核分枝杆菌以72．35株利福平抗性结核分枝杆菌。结果23株利福平敏感结核分枝杆菌分别用PCR—SSCP和PCR扩增片段测序均没有检测到巾0B碱基突变。而在35株利福平抗性菌株中，PCR—SSCP检测到31株与H37Rv标准株不同的带谱，PCR—SSCP检测基因突变的敏感度和特异度分别为88．6％（31／35）和100％（23／23）。对35株利福平抗性菌株PCR扩增产物进行测序分析，在其中32株中检出了基因突变。测序分析检测基因突变的敏感度和特异度分别为91．4％（32／35）和100％（23／23）。卡方检验，PCR—SSCP和PCR扩增片段测序两种方法的敏感度之间没有显著性差异（P〉0．05）。若以DNA测序为标准，则PCR—SSCP检测基因突变的准确度、敏感度和特异度分别为93．1％（54／58），96．9％（31／32）和100％（23／23）。结论PCR—SSCP检测结核分枝杆菌耐利福平rpoB基因突变可用于利福平药物敏感度的快速测定。     

PCR—SSCP直接检测临床标本中的结核杆菌rpoB基因突变—附50例报告

目的：探讨聚合酶链反应－单链构象多态性（PCR－SSCP）直接检测痰标本中的结核杆菌核糖核酸聚合酶亚单位基因（ropB基因,该基因突变便形成结核杆菌利福平耐药株）突变在评价结核杆菌对利福平的耐药性方面的应用价值。方法：以结构杆菌H37Rv株（标准菌株）为对照,应用PCR－SSCP技术直接检测50例痰标本中结核杆菌及培养分离的结核杆菌的rpoB基因突变,并将PCR－SSCP和细菌培养的结果进行比较分析,结果：以细菌培养作为参考方法,PR－SSCP直接检测50例痰标本中的结核杆菌ropB基因突变的敏感性和特异性分别是92％（23／25）和100％（10／10）,用于检测培养分离得到的35株结核杆菌,PCR－SSCP的敏感性和特异性分别为96％（24／25）和100％（10／10）。结论：PCR－SSCP操作简单,快速,准确,可望用于直接检测临床标本中的结核杆菌ropB基因突变,以评价结核杆菌是否对利福平产生耐药性。     

端粒酶活性与P53基因突变在乳腺癌诊断上的意义

目的探讨端粒酶活性在乳腺癌诊断中的临床意义并分析端粒酶表达与P53基因突变的关系.方法采用TRAP-Hyb以及PCR/SSCP法检测乳腺肿块中端粒酶的活性和P53基因突变.结果乳腺癌标本端粒酶的阳性率88.1%,乳腺良性病变标本端粒酶的阳性率5.7%,两者差异显著(P＜0.005).端粒酶表达和肿瘤大小、淋巴结转移无相关性.P53基因突变率在乳腺癌标本中为85.7%,在乳腺良性病变标本中为2.9%,两者差异显著(P＜0.005).结论端粒酶活性在乳腺组织中可作为一种新的肿瘤标记物,在乳腺癌诊断中具有一定应用价值.其与P53基因突变有关,推测P53基因突变可能是导致端粒酶被激活的原因之一.     

结直肠癌p53基因点突变和蛋白表达的研究

目的了解中国人结直肠癌ｐ５３基因的突变谱，探讨聚合酶链反应－单链构象多态（ＰＣＲ－ＳＳＣＰ）银染技术用于研究结直肠癌中ｐ５３基因突变的可行性。方法应用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ银染技术检测４１例结直肠癌ｐ５３基因突变，以ＡＢＣ免疫组织化学染色检测结直肠癌Ｐ５３蛋白的表达。结果３４％（１４／４１）的病例显示有ｐ５３基因突变，其中外显子５，６，７和８各有４，１，５和４例突变。２０例有Ｐ５３蛋白异常表达，阳性率为４９％。结论导致Ｐ５３蛋白异常堆积的ｐ５３基因突变是结直肠癌的一种常见的分子结构改变，可能在结直肠癌的发生和发展中起着重要的作用。ＰＣＲ－ＳＳＣＰ银染技术是一简便、快速、有效的检测基因点突变的方法     

应用PCR-SSCP方法检测非小细胞肺癌患者血浆p53基因突变

目的探讨应用聚合酶链反应(PCR)-单链构象多态性分析(SSCP)检测非小细胞肺癌(N SCLC)患者血浆循环核酸p53基因突变检测的可行性,研究N SCLC患者血浆p53基因突变对N SCLC发生、发展和预后估计的意义。方法应用PCR扩增p53基因外显子5~8,并用SSCP分析产物突变情况,再与各生物参数进行相关研究。结果10例健康人血浆循环核酸p53基因突变检测结果均为阴性,60例N SCLC患者血浆中p53基因5~8外显子突变测定的结果显示有28例出现突变,占47%(28/60)。p53基因突变率与术后肿瘤残留、对治疗的反应显著相关(P<0.05),与临床分期、年龄、性别、病理分型无关(P>0.05)。结论血浆循环核酸p53基因突变对N SCLC的早期诊断、病情监测、预后评估都具有指导意义。PCR-SSCP分析简便、可靠,可作为检测大量标本的突变的可行性方法。     

肺癌切除组织和支气管切缘P~(53)基因突变的研究

目的 检测肺癌切除组织和支气管切缘P53基因突变 ,了解肺癌手术切除后的效果及局部复发情况。方法 用PCR -SSCP方法将40例肺癌和10例肺部良性肿瘤手术切除标本的支气管切缘 (切缘病理切片无癌细胞残留 ) ,肺癌组织和正常肺组织中的P53基因突变 ,同时对手术后切缘癌复发及转移情况作了随访。结果 12例 (30 % )肺癌支气管切缘和24例肺癌组织存在P53 基因突变 ,至于正常肺组织和良性病变肺组织未发现P53基因突变。本组研究表明 ,肺癌组织P53基因突变以小细胞癌 (98% )最高 ,次为鳞癌 (70% ) ,腺癌(40% ) ,P53基因突变以TNM分期的 ,Ⅲ期 (71.4 % )最高 ,次为Ⅱ期 (58% ) ,Ⅰ期 (26% ) ,术后3～8个月随访 ,支气管切缘P53阳性中5例(41.6% )发生支气管残端复发 ,肺癌组织中P53 阳性有13例 (54% ) ,通过随访发现有癌复发及转移 ;P53 阴性者有3例 (27 % )发现癌复发。两组复发有显著差异 (P<0.05)。结论 本文通过分子检测支气管切缘P53基因突变 ,对早期预测部份肺癌术后残留复发具有重要临床意义。     

P53与肺癌病理、CT征象及预后的关系

目的　探讨 P5 3基因突变与肺癌的临床病理、CT征象、TNM分期及预后的关系。方法　收集 146例肺癌患者的标本 ,分别行 HE染色观察基本病理情况和 SP法免疫组化染色检测 P5 3表达结果。结果　 146例周围型肺癌中 ,有深分叶、细毛刺、棘状突起、肿瘤强化增 CT值 >2 0 Hu者 ,其 P5 3基因表达率明显高于无深分叶、细毛刺、棘状突起、肿瘤强化增 CT值 <2 0 Hu(P<0 .0 1)。肿瘤大小、空洞、空泡征、空气支气管征、胸膜凹陷征与 P5 3表达无关 (P>0 .0 5 )。P5 3蛋白免疫组化阳性 75例 (5 1.36 % ) ,5 a生存率分析 ,P5 3基因表达组明显低于无 P5 3异常表达组。结论　 P5 3基因突变可作为判断周围型肺癌恶性程度及预后的重要指标之一。 CT表现有深分叶、细毛刺、棘状突起、肿瘤强化增 CT值 >2 0 Hu者可能与 P5 3基因异常表达有关 ,这些征象的出现提示肿瘤预后差     

二代测序技术在肺癌组织相关基因突变检测中的临床应用价值

目的基于二代测序技术分析肺癌相关基因突变及位点分布状况,探讨突变基因与临床病理特征之间的关系及临床应用价值。 方法收集唐都医院呼吸与危重症医学科2017年12月至2018年6月行支气管镜活检和手术切除的肺癌组织样本53例,采用Illumina二代测序平台分别检测22个基因共103个突变热点区域,描述检测结果,统计分析高频突变基因与临床病理特征之间的关系。 结果22个肺癌相关基因中共检测到19个基因突变;103个肺癌相关突变位点中共检测到71个突变,其中肿瘤蛋白P53(TP53)基因的突变率为45.07%(32/71),表皮生长因子受体(EGFR)基因突变率为9.86%(7/71),细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2A(CDKN2A)基因的突变率为8.45%(6/71),大肠癌K-鼠肉瘤病毒癌基因(KRAS)突变率为5.63%(4/71),肿瘤组织腺瘤样息肉病基因(APC)的突变率为4.23%(3/71),磷酸酰肌醇-3-激酶催化亚基(PIK3CA)、ERBB4、神经营养性酪氨酸激酶受体1(NTRK1)、SMO、KIT基因的突变率均为2.82%(2/71),GNAQ、CTNNB1、MAP2K1、ATM、成纤维细胞生长因子受体(FGFR3)、NOTCH1、上皮钙黏蛋白编码基因(CDH1)、成视网膜细胞瘤1(RB1)、HRAS基因的突变率均为1.41%(1/71)。TP53突变者共有29例,其中3例患者具有双位点突变,共有32个突变位点。EGFR突变者共有6例,其中1例患者具有双位点突变,共有7个突变位点。CDKN2A突变均为单位点突变。TP53的5号外显子Val173Glu错义突变、8号外显子Arg273Leu错义突变、9号外显子Lys320Ter无义突变的突变率均为6.25%(2/32),其他位点突变率均为3.13%(1/32)。EGFR的19号外显子Glu746Ala750del缺失突变、21号外显子Arg868Leu错义突变的突变率分别为42.86%(3/7)、28.57%(2/7),其他位点突变率均为14.29%(1/7)。CDKN2A所有突变位点的突变率均为16.67%(1/6)。TP53突变频率在低、中分化肺癌患者中较高,差异具有统计学意义(χ²＝7.58,P＝0.023)。EGFR突变在病理类型(χ²＝7.45,P＝0.024)和分化程度(χ²＝14.51,P＝0.001)方面的差异具有统计学意义;临床各分期间比较,差异无统计学意义(χ²＝6.37,P＝0.081)。 结论Illumina二代测序平台可作为分析肺癌多基因突变的检测手段,TP53、EGFR和CDKN2A突变频率较高,对肺癌的临床诊疗具有一定的指导意义。     

C-erbB-2 expression and its relationship with ploidy, p53 abnormalities and epidermal growth factor receptor content in human non-small cell lung cancer.

This study attempts to clarify the role of c-erbB-2 overexpression in human non-small cell lung cancer (NSCLC) and relate it with the p53 alterations, DNA index (D.I.) and epidermal growth factor receptor (EGFR) content in sixty four patients with NSCLC. c-erbB-2 and EGFR quantification were carried out from tissue homogenates using quantitative ELISA procedures. p53 alterations were determined by immunohistochemical (IHC) detection with the monoclonal antibody DO-7 and analysis for p53 mutations on exons 4 to 8 by single strand conformation polymorphism (SSCP). The D.I. was performed by flow cytometry. c-erbB-2 hyperexpression was found in 13 of 58 LC (22%), and it was closely associated with hyperdiploid tumors (D.I. >1.3; P = 0.00). The p53 abnormalities detected by SSCP were statistically more frequent in hyperdiploid tumors (16/25; P = 0.015) than in diploid ones (8/30). No relationship between the results of IHC p53 and SSCP was found. The patients with c-erbB-2 hyperexpressing tumors were prone to have frequent relapses (P = 0.03), although the patients with hyperdiploid NSCLC are the ones with the highest relapse rate (P = 0.008). From the results obtained in this study the following conclusions can be drawn: (a) c-erbB-2 hyperexpressing NSCLC are associated with abnormalities in other biological markers and with a greater rate of relapses; (b) SSCP seemed to be more specific that IHC to detect p53 molecular abnormalities; and (c) the D.I. is the parameter more tightly related with relapse.     

Detection of DNA aberrations in human cancers by single-strand conformation polymorphism analysis of polymerase chain reaction products.

We have developed a simple, sensitive method, single-strand conformation polymorphism (SSCP) analysis, to detect a single nucleotide substitution in a DNA fragment amplified and labeled by the polymerase chain reaction (PCR). Mobility shift of single-stranded DNAs due to their specific conformations on non-denaturing polyacrylamide gel electrophoresis can reveal DNA aberrations. By the PCR-SSCP analysis of DNAs from surgical specimens of human cancers, mutated ras genes (17%) and aberrations of tumor suppressor p53 gene (53%) including loss of one of the two alleles and a mutation in the remaining allele were detected in lung carcinomas and aberrations of both of the p53 and retinoblastoma (RB) genes were detected exclusively in advanced hepatocellular carcinomas.