二氢嘧啶脱氢酶基因的T85C和A1627G联合突变对乳腺癌患者预后的影响

目的:探讨二氢嘧啶脱氢酶基因(DPYD)的T85C和A1627G突变对浸润性乳腺癌患者生存的影响。方法:采用SPSS19.0软件进行统计学分析,使用临床资料完整的173例浸润性乳腺癌患者的石蜡包埋组织标本,检测并分析了DPYD基因编码序列的第85位点和第1627位点的核苷酸突变情况,并分析其与患者预后的关系。结果: T85C和A1627G位点联合突变与患者的淋巴结转移状态呈正相关。T85C和A1627G位点单突变对乳腺癌患者预后无影响,而与对照组相比,存在T85C和A1627G位点联合突变的乳腺癌患者预后较差,差异具有统计学意义。结论:中国乳腺癌患者中,DPYD基因T85C和A1627G联合突变与患者的淋巴结转移状态相关,且对患者预后具有重要影响,T85C和A1627G联合突变的患者预后较差。     

二氢嘧啶脱氢酶基因单核苷酸多态性与结直肠癌患者5-FU化疗毒副作用的关系

目的:探讨二氢嘧啶脱氢酶基因(DPYD)单核苷酸多态性(SNP)与5—氟尿嘧啶(5-FU)化疗毒性反应的相关性,为结直肠癌的个体化治疗提供依据.方法:对60份结直肠癌患者的EDTA抗凝外周血提取基因组DNA后进行实时定量PCR,测定DPYD的14G1A、G2194A、T85C、G1156T和T464A等位点的SNP,并...     

DPYD多态性与中国人群胃癌患者应用氟尿嘧啶为基础的辅助化疗的临床结果

背景:二氢嘧啶还原酶,5-FU代谢的关键酶,是药物遗传学研究5-FU疗效及毒副作用的热点之一。本研究旨在探讨DPYD多态性与中国人群中胃癌患者应用氟尿嘧啶为基础的辅助化疗的临床结果之间的关联性。 方法：362名中国胃癌患者应用氟尿嘧啶为基础的方案化疗。采用基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术对治疗前从患者外周血中提取的DNA样本进行DPYD基因单核苷酸多态性的检测。 结果：平均化疗有效率为46.7%。rs1801159位点的基因型分布在化疗有效组及无效组中存在显著性差异(χ2=8.76, p=0.012)。其中rs1801159A/A野生纯合子在化疗有效组中更多见,而rs1801159A/G基因型携带者在化疗无效组中更常见。单倍型分析发现两组间的单倍型分布有显著性差异(χ2 = 3.96,p = 0.0465)。 结论：rs1801159位点多态性也许可用以预测中国胃癌患者应用氟尿嘧啶为基础的方案的化疗反应,进一步明确DPYD基因多态性的预测价值还需要设计更优的、综合的、前瞻性的研究。     

9例家族性乳腺癌患者BRCA1基因序列突变分析

目的 :研究中国汉族家族性乳腺癌 (familiarbreastcancer ,FBC)患者BRCA1的突变情况。方法 :选取中国汉族 9个乳腺癌家系中各 1例乳腺癌患者 ,1例无肿瘤家族史的正常人 ,32例散发性乳腺癌患者和 33例正常献血者。从外周血淋巴细胞中提取DNA ,经PCR扩增后 ,以变性高效液相色谱 (denaturinghighperformanceliquidchromatography ,DHPLC)初筛BRCA1所有编码外显子及部分内含子的多态性 ,对异常峰型者直接测序。 结果 :在9例家族性乳腺癌患者中 ,1例患者在外显子 11上发现一处致病性突变 (3870delTGTC) ,该突变因缺失 4个碱基导致框架移位。 1例患者发现尚未见报道的密码子 86 7单个碱基替换导致编码氨基酸的变异 (E86 7R)。 8例患者在内含子 18(IVS18+6 5 )上检出已知的G→A变异 ,变异率为 88.9% (8/ 9)。该位点变异在散发性乳腺癌和一般人群中的检出率分别为 37.5 % (12 / 32 )和 33.3% (11/ 33)。该 8例患者同时检出密码子 871已知的错义变异(P871L)与内含子 9(IVS8 5 7delT)的变异 ,且有 1例患者在此 3处的变异为纯合变异。这 8例患者的检测结果提示 ,IVS18+6 5G→A、IVS8 5 7delT与 2 731C→T这 3个位点存在连锁。该连锁情况尚未见报道。 2例患者在密码子 14 36发现已知为多态的改变 (S14 36S)。 1例患     

海南汉族、黎族人葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症的基因突变

目的:阐明海南汉族、黎族人群中葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症的分子基础。方法:用聚合酶链反应、限制性内切酶消化筛查了1388G→A、1376G→T、1360C→T、1024C→T、592C→T、517T→C、493A→G、487G→A、392G→T和95A→G突变;用单链构象多态性分析筛查其它突变;用核苷酸顺序分析鉴定具有SSCP异常区带样品的突变。结果:在59例汉族G6PD缺乏症患者中,发现1388G→A14例(23.7%)、1376G→T19例(32.2%)、871G→A3例(5.1%)、835A→T1例(1.7%)、517T→C1例(1.7%)、392G→T3例(5.1%)、95A→G4例(6.8%);在32例黎族G6PD缺乏症患者中,发现1388G→A6例(18.8%)、1376G→T18例(56.2%)、871G→A3例(9.4%)、95A→G2例(6.3%);结论:海南汉族、黎族人群中具有共同的常见G6PD基因突变型,提示一些G6PD基因突变是中国南方人群的遗传特征。     

海南地区人群中凝血因子ⅩⅢA链567位点多态性的研究

目的 研究海南地区汉族人群、黎族人群凝血因子ⅩⅢA链567位点(GAA→GAG)分布频率.方法 用聚合酶链反应、限制性片段长度多态性分析检测205名汉族正常人、236名黎族正常人凝血因子ⅩⅢA链567位点多态性.结果 汉族人群和黎族人群均未发现567位点GAA→GAG突变.结论 凝血因子ⅩⅢA链567位点变异在中国海南人群中很少见.     

中国人群MEF2A基因突变与冠心病易感性的关系

目的 研究冠心病相关基因MEF2A在中国人群的突变和多态性位点.方法 利用聚合酶链反应-单链构象多态性(polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism,PCR-SSCP)和DNA测序技术检测210例冠心病(CAD)患者及190名健康人MEF2A基因第11外显子.结果 冠心病患者SSCP电泳条带异常样本测序分析发现突变:①密码子451G/T(147191位点G→T)杂合或纯合同义突变;②147108～147131位点之间分别发生1个氨基酸(Q)、2个氨基酸(QQ)、3个氨基酸(QQP)、6个氨基酸(425QQQQQQ430)、7个氨基酸(424QQQQQQQ430)缺失;③密码子435G/A(147143位点)杂合突变.密码子451G/T杂合或纯合同义突变以及氨基酸的缺失是基因多态性,密码子435G/A考虑为新的突变.结论 中国人群在MEF2A基因第11外显子也存在多种基因多态性,其中6或7个氨基酸的缺失和1个147143位点突变可能与冠心病易感性有关.     

单纯性家族性热性惊厥与日HCN2基因的相关研究

目的研究HCN2基因是否为中国儿童单纯性家族性热性惊厥(FC)的易感基因。方法选择60例北方汉族单纯性家族性热性惊厥患儿，对位于染色体：19p13．3区域的HCN2基因的外显子进行PCR扩增，PCR产物纯化后进行测序用以寻找可能的突变。对发现突变的区域，加入101名来自同一地区的正常人作对照。结果3～8外显子均没有发现突变，找到14个单核苷酸多态性位点(SNP)，其中8个还没有报道(714T→C、723T→C、8581→C、915C→T、921C→T、963C→T、IVS4 6C→T、IVS5-157G→A)。选择9个SNP作为遗传标记，进行相关分析。各SNP的等位基因频率和基因型频率在FC组(60例)和对照组(101名)之间差异无统计学意义。结论HCN2基因可能不是单纯性家族性热性惊厥的易感基因。     

9例家族性乳腺癌患者BRCAl基因序列突变分析

目的：研究中国汉族家族性乳腺癌（familiar breast cancer，FBC)患者BRCA1的突变情况。方法：选取中国汉族9个乳腺癌家系中各1例乳腺癌患者，1例无肿瘤家族史的正常人，32例散发性乳腺癌患者和33例正常献血者。从外周血淋巴细胞中提取DNA，经PCR扩增后，以变性高效液相色谱(denaturing high performance liquid chromatography，DHPLC)初筛BRCA1所有编码外显子及部分内含子的多态性，对异常峰型者直接测序。结果：在9例家族性乳腺癌患者中，1例患者在外显子11上发现一处致病性突变(3870delTGTC)，该突变因缺失4个碱基导致框架移位。1例患者发现尚未见报道的密码子867单个碱基替换导致编码氨基酸的变异(E867R)。8例患者在内含子18(IVS18 65)上检出已知的G→A变异，变异率为88．9％(8／9)。该位点变异在散发性乳腺癌和一般人群中的检出率分别为37．5％(12／32)和33．3％(11／33)。该8例患者同时检出密码子871已知的错义变异(P871L)与内含子9(IVS8—57delT)的变异，且有1例患者在此3处的变异为纯合变异。这8例患者的检测结果提示，IVS18 65G→A、IVS8—57delT与2731C→T这3个位点存在连锁。该连锁情况尚未见报道。2例患者在密码子1436发现已知为多态的改变(S1436S)。1例患者在密码子771检出已知为多态的改变(L771L)。另外在内含子区发现多处变异(IVS2 48C→T，IVS2 133C→T，IVS12 112C→A)。结论：BRCA1突变在中国汉族家族性乳腺癌患者中有其自身特点，其突变热点有别于白人和犹太人。在中国家族性乳腺癌患者中进行BRCA1突变的进一步研究及寻找其它致病基因具有重要意义。     

重庆地区5-氟尿嘧啶代谢相关酶的基因多态性分布

目的 分析5-氟尿嘧啶(5-Fu)代谢相关酶二氢嘧啶脱氢酶(DPYD)、胸苷酸合成酶(TS)和亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因多态性位点在重庆地区肿瘤患者中的分布特点,为临床提供预测5-Fu疗效及不良反应的遗传学依据.方法 采用PCR产物直接测序法分别检测重庆地区60例肿瘤患者DPYD IVSI4+1位点、TS3'-UTR位点以及MTHFR C667T和A1298C的基因型.结果 (1)60例肿瘤患者中DPYD IVSI4+1位点均为G/G基因型,未检测出可引起5-Fu相关毒性的G/C和C/C基因型;(2)TS 3'-UTR+6/+6bp、+6/-6bp,-/-6bp基因型分布概率分别是1.6%(1/60)、61.7%(37/60)和36.7%(22/60);(3)MTHFR的C667T位点C/C、C/T、T/T基因型分布概率分别是33.3%(20/60)、61.7%(37/60)和5%(3/60);A1298G位点A/A、A/C、C/C基因型分布概率分别是63.3 0A(38/60)、36.7%(22/60),C/C基因型0.1%.结论 重庆地区肿瘤患者DPYD IVSI4+1位点以G/G基因型为主,提示5-Fu对该地区肿瘤患者的毒性较弱;TS3'UTR、MTHFR的C667T和A1298G位点基因多态性分布与国内其他地区相似,结果提示5-Fu对重庆地区患者有效性中等.肿瘤患者最好采用联合化疗制定个体化治疗方案,从而达到最佳治疗效果.     

Polymorphisms of dihydropyrimidine dehydrogenase gene and clinical outcomes of gastric cancer patients treated with fluorouracil-based adjuvant chemotherapy in Chinese population

Background  Dihydropyrimidine dehydrogenase (DPD), a key enzyme involved in the catabolism of 5-fluorouracil (5-FU), is the attractive candidate for pharmacogenetic research on efficacies and toxicities of 5-FU. The aim of this study is to explore the association between polymorphisms of dihydropyrimidine dehydrogenase gene (DPYD) and clinical outcomes of gastric cancer patients treated with fluorouracil-based adjuvant chemotherapy in the Chinese population.

Methods  Three hundred and sixty-two patients with gastric cancer in the Chinese population were treated with fluorouracil-based adjuvant chemotherapy. The single nucleotide polymorphic genotypes of DPYD were determined by matrix-assisted laser desorption/ionization-time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS) using DNA samples isolated from peripheral blood collected before treatment.

Results  The average response rate for chemotherapy was 46.7%. A significantly different distribution of the rs1801159 (c²=8.76, P=0.012) genotypes was observed. Homozygous genotype rs1801159A/A was over-represented in responsive patients. Conversely, carriers of the rs1801159A/G genotype were prevalent in non-responsive patients. In the haplotype association analysis, there was significant difference in global haplotype distribution between the groups (c²=3.96, P=0.0465).

Conclusions  These results suggest that polymorphisms of rs1801159 in DPYD may be used as valuable predictors of the response to fluorouracil-based chemotherapy for gastric cancer patients in the Chinese population. Well-designed, comprehensive, and prospective studies on determining these polymorphisms of DPYD as predictive markers for gastric cancer in response to fluorouracil-based therapies are warranted.

     

贵州土家族葡萄糖-6-磷酸脱氢酶基因突变型

目的研究贵州土家族葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)基因致病突变型,检测G6PD缺乏症发生率及基因频率。方法通过硝基四氮唑蓝纸片法对2 789例土家族男性进行G6PD缺乏症定性筛查,用变性高效液相色谱技术和DNA测序对78例个体进行基因突变型鉴定。结果在2 789例纯系土家族男性中,发现2例酶活性异常。在印江县采集的78例(2例酶活性异常和76例正常)纯系土家族男性血样中,共检出G6PD c.1388G>A突变2例、c.1376G>T突变1例和c.1311C>T/IVS 11+93T>C突变2例,基因突变型分别占2.6%、1.3%和2.6%。结论在贵州土家族人群中发现c.1388G>A、c.1376G>T和c.1311C>T/IVS11+93T>C 3种突变型,是共同存在于中国人群的G6PD基因突变型,中华民族可能源于共同的祖先;贵州省印江县土家族男性G6PD缺乏症的基因频率为6.5%,可为上述地区G6PD缺乏症的防治提供依据。     

DPYD基因表达与胃癌患者5-氟尿嘧啶敏感性及毒副反应的相关性

目的 观察二氢嘧啶脱氢酶基因（DPYD）表达与胃癌患者5-氟尿嘧啶（5-FU）敏感性及毒副反应的相关性。方法 选取2018年1月—2023年1月在广安市人民医院治疗的胃癌患者60例,取新鲜切除的肿瘤非坏死组织。采用免疫组织化学法检测肿瘤组织DPYD表达强度,实时荧光定量聚合酶链反应检测DPYD mRNA表达,体外药敏试验检测胃癌原代细胞对5-FU的敏感性。术后均采用以5-FU为基础的综合化疗方案,化疗结束后统计化疗效果、毒副反应发生率及严重程度。比较不同DPYD表达强度患者5-FU敏感性;采用Pearson法分析DPYD mRNA表达与药敏指数的相关性;比较不同DPYD表达强度患者毒副反应。结果 60例患者的肿瘤组织中,DPYD低表达34例,高表达26例,高表达患者DPYD光密度值高于低表达患者（P <0.05）。DPYD低表达患者化疗总有效率、5-FU敏感率高于高表达患者（P <0.05）。DPYD mRNA表达与化疗效果（r=-0.664）、药敏指数（rs=-0.892）呈负相关（P <0.05）。DPYD低表达患者3、4级上消化道反应、神经毒性、骨髓抑制、皮肤感...     

OPRT,DPYD,TS的mRNA水平与胃癌对氟尿嘧啶敏感性的相关性研究

目的:探讨胃癌细胞中乳清酸磷酸核糖转移酶(orotate phosphoribosyltransferase,OPRT)?二氢嘧啶脱氢酶(dihydropyrimidine dehydrogenase,DPYD)?胸腺嘧啶合成酶(thymidylate synthase,TS)的表达水平对氟尿嘧啶药物敏感性的预测价值?方法:采用ATP生物荧光法检测47例胃癌原代细胞对氟尿嘧啶的体外药物敏感性,RT-PCR法检测胃癌细胞内OPRT?DPYD?TS的mRNA表达水平,并分析胃癌细胞对氟尿嘧啶体外敏感性与这3种酶表达的关系?结果:OPRT的mRNA表达水平为0.74±0.36,DPYD的mRNA表达水平为0.85±0.35,TS的mRNA表达水平为0.57±0.28?药敏指数与OPRTmRNA表达水平呈正相关(rs=0.744,P=0.001);与TSmRNA表达水平呈负相关(rs=-0.375,P=0.009);与DPYDmRNA表达水平呈负相关(rs=-0.159,P=0.287),但无统计学显著性?结论:胃癌细胞中OPRT和TSmRNA的表达水平对氟尿嘧啶药物的治疗敏感性可能具有较好的预测价值?     

1552例中重度感音神经性聋患者SLC26A4基因外显子7和8序列测定及热点突变分析

目的 调查全国21个地区聋哑学生SLC26A4基因热点突变及其发病频率,由此分析和推测中国人大前庭水管综合征的流行病学状况。方法调查对象来自全国21个省市自治区的聋哑学校学生1552例,其中汉族1290人,维吾尔族69人,回族37人,蒙古族31人,其他125人来自彝族、壮族、白族、苗族等18个民族,所有受检患者均采集外周血并提取DNA,以序列分析方法检测SLC26A4基因IVS7~A〉G突变及其他位点突变情况。结果 SLC26A4基因外显子7＋8序列分析结果显示1552例来自全国各地的耳聋患者中199例携带外显子7＋8及内含子7的突变,其中83例携带IVS7-2A〉G纯合突变,114例携带IVS7-2A〉G杂合突变,另有2人分别携带此区域内的其他位点突变;IVS7-2A〉G总检出率达到12．7％（197／1552）,其中1290例汉族患者中IVS7-2A〉G检出率达到14．3％,69例维吾尔族患者群中IVS7-2A〉G检出率为0。河北涿州高碑店、河南安阳患者群中的IVS7-2A〉G检出率均明显高于全国平均水平。结论通过SLC26A4基因热点突变的筛查发现在中国由SLC26A4基因突变引起的遗传性耳聋比例较高,揭示SLC26A4基因筛查和诊断在耳聋的病因学诊断中将起重要作用,并且在大规模耳聋患者的病因学筛查方面具有一定的优势。     

海南黎族自治县地区新生儿G6PD缺乏症基因分析

目的了解海南省黎族自治县地区葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(glucose-6-phosphate dehydrogenase, G6PD)缺乏症发病情况和基因突变特点。方法收集该地区2017年1—12月出生的新生儿干血片,采用荧光分析法进行G6PD酶活性筛查,对初筛阳性的干血片样本采用多色探针荧光PCR熔解曲线法(MMCA)进行基因突变分析。结果共收集14 130例新生儿干血片,G6PD酶活性筛查共筛出1 059例阳性,初筛阳性率为7.49%,其中男性682例,女性377例,男性新生儿G6PD初筛阳性率9.13%,女性5.66%,男女初筛阳性率差异有统计学意义(P<0.01)。黎族新生儿初筛阳性率8.33%,汉族6.25%,不同民族比较差异有统计学意义(P<0.01)。通过MMCA法对1 059例初筛阳性干血片进行基因检测分析,共检出864例样本发生突变,突变率81.59%;男性突变率86.07%,女性73.47%,男女间差异有统计学意义(P<0.01);黎族突变率83.26%,汉族77.71%,突变率差异有统计学意义(P=0.033)。本次共检出11种G6PD基因单一突变型(c.1376 G>T、c.1388 G>A、c.95 A>G、c.871 G>A、c.519 C>T、c.1024 G>T、c.392G>T、c.1360C>T、c.517T>C、c.592C>T和c.86C>T)和5种复合突变型,其中c.1376 G>T复合c.871 G>A突变、c.1376 G>T复合c.517 T>C突变和c.392 G>T复合c.871G>A突变在海南省尚属首次报道。结论海南省黎族自治县地区是G6PD缺乏症高发区,黎族为高发人群,基因突变类型复杂多样,突变以c.1376G>T、c.1388G>A、c.95 A>G和c.871 G>A四种最为普遍。在G6PD缺乏症高发地区开展G6PD的活性筛查和基因检测,有利于G6PD缺乏症的确诊和防治,提高出生人口素质。     

我国汉族正常人群内皮型一氧化氮合酶基因G894T突变的观察

目的 :探讨我国汉族人群内皮型一氧化氮合酶 (e NOS)基因 G894 T突变的分布特点。方法 :应用聚合酶链反应 -限制性片断长度多态性分析 ,研究了 10 8名我国汉族正常人群 e N OS基因 G894 T突变分布情况。结果 :我国汉族正常人群 e NOS基因 G894 T突变的 GG、GT、TT基因型频率分别为 0 .90 95、0 .0 883和 0 .0 0 2 1;与国外其他种族人群比较 ,我国汉族正常人群 GT+TT基因型频率低于日本人、英国白种人 (P均 <0 .0 5 )。结论 :我国汉族正常人群 e NOS基因 G894 T突变的基因型分布不同于国外其他种族 ,以 GG基因型分布频率较高 ,而 GT+TT基因型低于日本人和英国白种人。     

海南省新生儿葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症发生情况及基因突变分析研究

背景　葡萄糖-6-磷酸脱氢酶（G6PD）缺乏症会因遇到某些诱因而引起急性的溶血性贫血,严重者可危及生命。海南省是G6PD缺乏症的高发地区,并且该病具有地域和种族特异性,通过筛查和最终基因确诊可做到积极有效的预防。但是目前还未见海南省人群G6PD缺乏症基因层面的报道。目的　调查2017年度海南省新生儿G6PD缺乏症发生率,并分析其基因突变特点。方法　选取全海南省内各助产单位2017-01-01至2017-12-31出生的活产新生儿130 512例。采集符合纳入标准的新生儿的足跟血制成滤纸干血片用于G6PD基因初筛。对于初筛可疑样本,采用G6PD/6-磷酸葡萄糖脱氢酶（6GPD）比值法进行生化检查确诊。生化检查确诊为G6PD缺乏症的患儿,找出其干血片进行基因分型。结果　2017年度海南省全省新生儿G6PD缺乏症初筛样本中初筛阳性率为4.00%（5 221/130 512）,G6PD/6GPD确诊2 993例,经基因检测该2 993例新生儿均有G6PD基因突变。海南省新生儿G6PD/6GPD确诊G6PD缺乏症发生率和G6PD基因突变率均为2.29%（2 993/130 512）。G6PD/6GPD确诊G6PD缺乏症发生率汉族为1.80%（1 972/109 590）,黎族为5.28%（934/17 698）,其他民族为2.70%（87/3 224）。黎族G6PD缺乏症发生率高于汉族（χ2=826.206,P<0.001）。本次共检出10种基因突变类型：1 636例（54.66%）c.1376G>T,659例（22.02%）c.1388G>A,254例（8.49%）c.95A>G,204例（6.82%）c.1024C>T,93例（3.11%）c.871G>A,64例（2.14%）c.519C>T,25例（0.84%）c.392G>T,22例（0.74%）c.1360C>T,19例（0.63%）517T>C,11例（0.37%）c.592C>T,并检出8例（0.27%）c.1376G>T复合c.1388G>A突变,3例（0.10%）c.1376G>T复合c.871G>A突变,3例（0.10%）c.1376G>T复合c.517T>C突变。并发现5例（0.17%）未知突变,其中1例487G>A、1例1004C>A和1例c.86C>T,在海南省人群未见报道。结论　海南省新生儿G6PD缺乏症发生率较高,且显著高于汉族。同时,G6PD缺乏症基因突变类型以c.1376G>T、c.1388G>A、c.95A>G 和c.1024C>T为主;且发现5例未知突变,其中c.86C>T、c.487G>A和c.1004C>A突变各有1例。