EMA-PCR方法快速检测铜绿假单胞菌活菌研究

目的 探讨将叠氮溴乙锭(ethidium monoazide bromide,EMA)选择渗透性与PCR技术相结合（EMA-PCR）,建立有效快速检测铜绿假单胞菌活菌的方法。方法 以铜绿假单胞菌oprI基因为PCR检测靶基因,纯培养物提取模板进行PCR,检测PCR灵敏度、EMA使用浓度和曝光时间优化试验。结果 PCR检测灵敏度为3×103 CFU/mL;曝光处理时间为10 min;EMA浓度≤5 μg/mL对活菌DNA扩增没有明显抑制,终浓度为1 μg/mL EMA能有效抑制3×106 CFU/mL死菌扩增;1%活菌混合体系检测结果阳性。结论 EMA-PCR方法能有效快速检测铜绿假单胞菌活菌,能避免PCR检测可能造成的假阳性结果。     

促血管生成素-1腺病毒表达载体构建及鉴定

目的构建表达促血管生成素-1（Ang-1）的腺病毒载体,为研究Ang-1防治慢性缺血性疾病提供前期基础。方法通过PCR从pMD18-Ang-1质粒中扩增Ang-1基因,酶切连接入载体pDC315-GFP并转化大肠杆菌感受态细胞,PCR鉴定测序分析;借助AdMax腺病毒包装系统实现重组,提取质粒DNA并转染HEK293细胞,观察GFP荧光并以Western Blot检测目的蛋白的表达,以终点稀释法测定病毒滴度。结果重组质粒pDC315-GFP-Ang-1经PCR鉴定阳性克隆,测序分析比对正确,重组腺病毒转染HEK293细胞后可观察到GFP-Ang-1融合蛋白,病毒滴度1×1011PFU/ml。结论成功构建了表达Ang-1基因的腺病毒载体。     

重组腺病毒Ad-p16的扩增及病毒滴度检测

目的 :探讨高效扩增腺病毒载体的方法。　方法 :用人胚胎肾 2 93细胞株扩增重组腺病毒 ,并测定病毒滴度。　结果 :扩增得到腺病毒的滴度约为 5× 10 8PFU/ ml。　结论 :用人胚胎肾 2 93细胞株扩增重组腺病毒 ,在不进行任何浓缩时可达较高病毒滴度 ,为腺病毒介导的基因转移方法提供了理论基础。     

HEK293T细胞扩增重组腺病毒研究

目的探讨HEK293T细胞扩增重组腺病毒的可行性。方法重组腺病毒保存液稀释后感染HEK293T细胞,观察细胞病变效应,半数组织培养感染量测定扩增病毒的滴度,通过体外感染心肌细胞,成纤维细胞验证其感染活性。结果HEK293T细胞可以扩增带有绿色荧光蛋白基因的重组腺病毒,病毒滴度为5×10^6PFU/mL,扩增后的腺病毒可以感染体外培养的心肌细胞和成纤维细胞。结论HEK293T细胞可有效扩增带有绿色荧光蛋白基因的重组腺病毒。     

HIF-1α和EGFP双基因共表达重组腺病毒载体的构建及鉴定

目的 构建pAdeno-EGFP-HIF-1α 重组腺病毒载体,探讨其在脊髓损伤中的作用。 方法 采用聚合酶链反应（polymerase chain reaction,PCR） 法扩增目的基因HIF-1α 并亚克隆到含有报告基因EGFP 的pShuttle-CMV-EGFP 穿梭载体中,得到pShuttle-EGFP-HIF-1α 重组穿梭质粒。将已构建的重组穿梭质粒转移至pAdeno 骨架载体上,获得pAdeno-EGFP-HIF-1α 重组腺病毒质粒,继而在H293 细胞中扩增,纯化后进行PCR 鉴定并测定病毒滴度。 结果 pShuttle-EGFPHIF-1 α 经KpnI/BamHI 双酶切后琼脂糖凝胶电泳可见阳性克隆组在2.5 kb 和5.1 kb 处出现两条带,而阴性克隆组只有5.1 kb 处一条带,证明pShuttle-EGFP-HIF-1α 重组穿梭质粒构建成功;pShuttle-EGFP-HIF-1α 重组穿梭质粒与pAdeno 载体重组后,经XhoI 单酶切后琼脂糖凝胶电泳可见阳性克隆组出现14.5 kb,11.7 kb,2.66 kb,2.6 kb,2.48 kb,2.47 kb,1.45 kb,0.6 kb 八条带,而阴性克隆的腺病毒空载组有14 kb,11.8 kb,4.0 kb,2.47 kb,1.45 kb,0.6 kb 六条带,证明重组pAdeno-EGFP-HIF1α 腺病毒质粒构建成功;pAdeno-EGFP-HIF-1α 重组腺病毒成功包装纯化后经PCR 鉴定,实验组和阳性对照组中均扩增到2.5 kb 片段,证明目的病毒中成功整合了HIF-1α 基因;TCID50 法测定纯化后的病毒滴度为2×10 10 PUF/ml 。 结论 成功构建了HIF-1α 和EGFP 双基因共表达重组腺病毒载体,为进一步研究其在脊髓损伤中的作用奠定了基础。     

Hyper-IL-6重组腺病毒的制备

目的 探讨大量制备高滴度重组腺病毒的方法 .方法 以Pac-1酶切Hyper-IL-6重组腺病毒(AdHIL-6)质粒,乙醇沉淀回收DNA,将线性化的AdHIL-6质粒经脂质体转染293细胞进行病毒的包装扩增,以氯化铯密度梯度离心法纯化重组腺病毒,根据GFP(绿色荧光蛋白)计数法和有限稀释法原理测定病毒滴度及感染293细胞、L02细胞的MOI(Multiplicity of infection,感染复数),并以免疫细胞化学检测感染L02细胞后目的 蛋白Hyper-lL-6的表达.结果 收集的病毒液经PCIL扩增出目的 条带,测得病毒滴度为1.6×109pfu/mL,AdHIL-6感染293细胞、L02细胞的MO1分别是7和54,感染L02细胞后Hyper-IL-6强阳性表达.结论 成功地完成了Hyper-IL-6重组腺病毒的制备,为后续的腺病毒载体介导的基因治疗奠定了基础.     

应用AdMax载体系统构建SCL基因重组腺病毒表达载体

目的 用AdMax载体系统构建人SCL基因重组腺病毒载体,为研究SCL基因对ICC样细胞功能恢复奠定基础.方法 采用PCR方法从含人SCL基因质粒中扩增SCL基因,连接到腺病毒穿梭质粒的多克隆位点上,构建重组穿梭质粒pDC315-EGFP/SCL,在脂质体介导下与腺病毒辅助大质粒pBHGlox(delta)E1、3Cre共转染293细胞,包装产生复制缺陷型重组腺病毒pDC315-SCL经HEK293细胞扩增,纯化后测定病毒滴度.结果 PCR结果和Western blotting检测证实pDC315-SCL重组腺病毒载体构建成功,滴度达到1×1010 PFU/mL.结论 AdMax载体系统可成功构建pDC315-SCL重组腺病毒载体.     

重组Lac-Z、反义c-myc腺病毒载体的增殖及鉴定

目的：建立重组反义c-myc腺病毒载体（Ad-AS-c-myc）、LacZ腺病毒（AD-Lac-Z）的增殖的方法。方法：对培养的293细胞转染重组反义c-myc、Lac-Z腺病毒载体,使重组反义c-myc、Lac-Z腺病毒载体在293细胞内大量复制,及时收集病变细胞,反复冻融以释放293细胞中的病毒载体,过滤除细胞碎片,利用倍比稀释法测定病毒载体滴度。PCR技术对扩增重组反义c-myc、Lac-Z腺病毒载体进行鉴定。结果：利用293细胞扩增重组腺病毒载体,获得的Ad-AS-c-myc滴度为：2.3×109pfu/ml;Ad-LacZ滴度为：1.2×1010pfu/ml。在Ad-LacZ可见在800bp出现一特异性PCR扩增条带,为腺病毒特异扩增带。Ad-AS-c-myc在800及608bp处出现两条特异扩增条带,分别为腺病毒及反义c-myc特异扩增条带。结论：对转染的293细胞冻融后收集重组腺病毒载体具有高效、可靠、简便、相对经济实用的优点,有推广价值。     

四种腺病毒核酸提取方法的比较

目的通过蛋白酶K法、苯酚法、病毒DNA/RNA提取试剂盒、腺病毒荧光PCR检测试剂盒等四种腺病毒核酸提取方法的比较,为进一步研究腺病毒的分子生物学特性选择合适的方法提供参考。方法以腺病毒感染的A549细胞为样品,分别以蛋白酶K法、苯酚法、病毒DNA/RNA提取试剂盒、腺病毒荧光PCR检测试剂盒等四种方法提取核酸,核酸经紫外分光光度计检测A260/A280的比值后,用荧光定量PCR方法检测核酸中腺病毒拷贝数浓度,并记录四种腺病毒核酸提取方法所需的操作时间。结果蛋白酶K法、苯酚法、病毒DNA/RNA提取试剂盒、腺病毒荧光PCR检测试剂盒等四种方法提取核酸的A260/A280的比值依次为1.85532、1.7377、1.81474和1.43934,核酸中腺病毒拷贝数浓度依次为4.9×105copies/mL、3.94×103copies/mL、2.66×106copies/mL和6.15×106copies/mL,提取核酸所需的时间分别为1.5、15、0.5和0.5h。结论四种腺病毒核酸提取方法中,蛋白酶K法简单快捷、成本低廉,适合一般实验室使用;苯酚法适合用于提取细胞培养上清中病毒的核酸;病毒DNA/RNA试剂盒...     

重组人hSERCA2a基因腺病毒载体构建和包装

目的：构建携带人肌浆网钙 ATP酶2 a（SERCA2 a）基因重组腺病毒载体,获得重组腺病毒 rAd-SER-CA2a-EGFP,为进一步在细胞和动物水平研究 SERCA2a基因的功能奠定基础。方法根据细菌内同源重组的方法,使用AdEasy腺病毒包装系统将人SERCA2a基因克隆到腺病毒穿梭载体质粒pshuttle-CMV中,腺病毒穿梭质粒 pshuttle-CMV-SERCA2a线性化后与腺病毒载体 pAdEasy发生同源重组,通过脂质体共转染 HEK293细胞,产生重组腺病毒rAd-SERCA2 a,DNA测序鉴定正确后进行扩增、纯化和滴度测定。结果通过酶切鉴定和DNA测序鉴定,证实重组腺病毒载体 pAdEasy-SERCA2a-EGFP构建成功,PCR鉴定扩增出2998 bp的目的条带,rAd-SERCA2a-EGFP滴度高达1×10^12μg/mL。结论成功构建和包装携带 hSERCA2a 基因的 rAd-SERCA2a-EGFP,为 SERCA2a基因治疗心力衰竭动物实验及临床试验研究奠定基础。     

携带人分泌型内皮抑素基因重组腺病毒的制备和鉴定

目的制备包含人分泌型内皮抑素基因的重组腺病毒,为下一步探讨其在血管生成依赖性疾病的治疗研究中的应用提供基础。方法以T-Endostatin质粒为模板,通过PCR扩增回收hEndostatin,将hEndostatin连接到pShuttle2中,构建pShuttle2-hEndostatin表达质粒,将此表达质粒连接到缺陷型腺病毒载体,构建Ad-hEndo。其线性化后转染HEK293T细胞,纯化后的重组腺病毒Ad-hEndo在HEK293T细胞中大量扩增并通过氯化铯密度梯度离心法纯化,并测定其滴度。结果利用PCR反应进行鉴定,扩增得到的hEndostatin经酶切鉴定,DNA测序证实为重组腺病毒,测定病毒滴度为5.2×109PFU/ml。结论本实验成功构建了人分泌型内皮抑素重组腺病毒Ad-hEndo,可直接用于血管生成依赖性疾病基因治疗的实验研究。     

过表达人TSHR-A亚单位的重组腺病毒Ad-TSHR289/6xHis载体构建与鉴定

目的：构建以促甲状腺激素受体（thyroid stimulating hormone receptor,TSHR）A亚单位（TSHR289）基因片段为免疫原的重组腺病毒载体,以期建立Graves病（Graves’s disease,ＧＤ）动物模型,为探讨中药复方对GＤ的防治作用提供条件。方法：利用重叠PCR技术从 pSV2neoECE-TSHR289-6H-dhfr 质粒中将目的基因TSHR289扩增至载体attB1-Kozak-TSHR289/6xHis/IRES/eGFP-attB2,琼脂糖凝胶电泳回收,GatewayR技术构建重组腺病毒载体（pAV.EX1d-TSHR289/6xHis/IRES/eGFP,pAd-TSHR289/6xHis）,转化到大肠杆菌Stbl3中,菌落PCR筛选阳性克隆、测序鉴定。将pAd-TSHR289/6xHis转染HEK293A细胞包装腺病毒,CsCl梯度离心法纯化腺病毒,TCID50法检测病毒滴度。RT-PCR法检测HEK293A中TSHR289的mRNA表达。应用该腺病毒免疫BALB/c小鼠制备GＤ模型。结果：菌落 PCR 筛选阳性克隆,测序证明构建正确;细胞感染腺病毒后出现明显细胞病变及增强型绿色荧光蛋白（enhanced green fluorescent protein,eGFP）表达;RT-PCR 检测证实重组腺病毒转染的细胞中TSHR289的mRNA表达量是未转染的285倍;实验测得病毒滴度为3.16×1010 PFU/ml;BALB/c小鼠免疫第10周T4、TSHR抗体（TRAb）阳性率7/10。结论：成功构建了过表达人TSHR289基因的重组腺病毒载体,动物实验证明该腺病毒诱发自身免疫,产生TRAb。为下一步体内药物治疗GＤ试验提供了条件。     

EMA-PCR技术检测肠出血性大肠杆菌O157∶H7

目的 将叠氮溴化乙锭 （ethidium monoazide bromide,EMA）与PCR技术相结合,建立一种有效、快速检测活肠出血性大肠杆菌O157∶H7的方法。方法 以rfbE为PCR检测靶基因,O157∶H7培养物经EMA处理后制备模板进行PCR检测,并对EMA使用浓度、作用时间等进行优化。结果 不抑制O157∶H7活菌PCR扩增的最大EMA浓度为10 μg/mL;抑制2×107 CFU/mL死菌PCR反应的最小EMA浓度为0.5 μg/mL;该法对O157∶H7检测的灵敏度为2×104 CFU/mL,结果显示能检出混合体系中含有的1%的活菌。结论 EMA-PCR技术能有效检测活的O157∶H7,在突发公共卫生事件的快速检测中具有良好的应用前景。     

大鼠shRNA-Slfn5重组腺病毒载体的构建及其在EPCs中的转染效率

目的 构建大鼠shRNA-Slfn5重组腺病毒载体并观察在内皮祖细胞(EPCs)中的转染效率.方法 根据Rat Slfn5基因的mRNA序列设计合成siRNA片段5个,分别克隆到pDKD-CMV-U6-shRNA上转入大肠杆菌感受态细胞,PCR筛选转化子,阳性克隆进行测序;利用Admax系统选取目的穿梭质粒shRNA-Slfn5(5)包装和扩增重组腺病毒shRNA-Slfn5及病毒滴度测定;利用Slfn5过表达腺病毒质粒中目的基因携带Flag标签,通过Western blot法检测Slfn5过表达腺病毒质粒与靶点质粒共转染293T细胞中Flag表达,观察靶点质粒对Slfn5表达的影响;最后用病毒感染EPCs并用绿色荧光蛋白量检测转染效率.结果 经测序验证5组目的质粒构建成功;重组腺病毒质粒shRNA-Slfn5(1)、shRNA-Slfn5(4)、shRNA-Slfn5(5)可明显抑制Flag蛋白的表达;shRNA-Slfn5病毒滴度为3.95×1010 PFU/mL;EPCs的转染效率为(85.64±2.58)％.结论 构建了shRNA-Slfn5重组腺病毒载体,其在EPCs转染效率高.     

构建重组人SERCA2a基因9型腺相关病毒载体和病毒包装

目的探讨构建重组人SERCA2a基因9型腺相关病毒载体和病毒包装的方法,并包装出rAAV9-hSERCA2a-EGFP。方法根据细菌内同源重组的方法使用腺相关病毒包装系统,将hSERCA2a基因克隆到腺相关病毒载体中,与腺相关病毒包装质粒pAAV pHelper发生重组,通过脂质体共转染人胚肾293(HEK293)细胞,产生重组腺相关病毒,通过酶切鉴定和DNA测序鉴定正确后进行扩增、纯化和滴度测定(采用荧光滴度检测法)。结果酶切鉴定和DNA测序证明重组腺相关病毒载体rAAV9-hSERCA2a-EGFP构建成功,PCR鉴定可见到阳性扩增条带,rAAV9-hSERCA2a-EGFP滴度高达1×1012 vg(virus genomes,vg)/mL。结论本方法成功构建和包装滴度为1×1012 vg/mL携带hSERCA2a基因的rAAV9-hSERCA2a-EGFP。     

大鼠MMP-13重组腺病毒载体的构建

目的　构建大鼠MMP1 3重组腺病毒载体。方法　将MMP1 3cDNA目的片段插入腺病毒柯氏质粒中 ,再将此质粒与腺病毒DNA末端蛋白复合物共转染 2 93细胞 ,通过同源重组构建MMP1 3 重组腺病毒载体。结果　MMP1 3 重组腺病毒载体经PCR鉴定正确 ,包装纯化后 ,检测病毒滴度为 4× 1 0 9PFU/ml。结论　成功地构建了RatMMP1 3 重组腺病毒载体 ,为下一步行MMP 1 3转基因治疗低顺应性膀胱的研究提供了条件     

应用实时荧光定量PCR测定AdEasy系统中重组腺病毒滴度

目的:确立一种高效、简便的荧光实时定量PCR方法,对AdEasy系统中的重组腺病毒滴度进行测定.方法:采用Stratagene公司的AdEasyTM载体系统在293细胞中构建重组腺病毒,经10倍梯度稀释的病毒母液用以提取基因组DNA及空斑测定.以10倍梯度稀释的pAdEasy质粒作为标准模板进行实时PCR反应扩增六邻体基因片段,并绘制标准曲线.然后以上述的重组腺病毒DNA为模板,采用同样体系进行实时PCR反应,同时用琼脂糖空斑法测定病毒母液的滴度.结果:成功构建了重组腺病毒并对其进行了空斑测定.运用标准模板进行的PCR反应显示该方法的线性范围为101～108拷贝.病毒母液的DNA拷贝浓度(vg/ml)值,约为空斑滴度(pfu/ml)值的10倍.结论:荧光实时定量PCR方法可在较大的线性范围内检测重组腺病毒滴度,较之空斑法更为准确地反映了重组腺病毒的实际数量.     

Rho鸟苷酸解离抑制因子-2过表达载体的构建与慢病毒包装

目的:为研究β2肾上腺素能受体减敏的机制,构建Rho鸟苷酸解离抑制因子-2(Rho GDI2)过表达慢病毒载体.方法:GenBank搜索Rho-GDI2基因序列(Gene ID:14570,序列号:NM_008113),设计PCR引物扩增目的基因,双酶切后凝胶电泳回收酶切产物.质粒双酶切获得线性载体,将目的基因和线性载体进行琼脂糖凝胶电泳分离回收目的条带.再行目的基因和载体的连接,连接产物转化感受态细胞;菌液PCR阳性克隆鉴定并抽提质粒并测序.最后293T细胞内包装慢病毒质粒并测其病毒活力与滴度.结果:通过DNAStar SeqMan软件对测序结果进行分析,测序结果与目标序列一致.病毒质粒转染细胞效率较高,病毒活力较高,通过标准曲线测得病毒滴度pLenti-GDI慢病毒液:1.22×108 vp/mL.结论:成功构建了Rho GDI2过表达慢病毒载体.     

复制型HBV重组腺病毒的制备

目的 通过细茼体内同源重组方法,构建含1.3拷贝HBV DNA片段(HBV4.1)的HBV复制型重组腺病毒.方法 从质粒pTh-HBV4.1上获取HBV4.1片段,插入腺病毒穿梭质粒载体pAdTrack-CMV中,构建含HBV4.1的重组穿梭质粒pAdTrack-CMV/HBV4.1.然后在大肠杆菌BJ5183内与pAdEasy-1进行同源重组,形成重组腺病毒质粒pAd-GFP/HBV4.1,经脂质体2000转染HEK293细胞进行包装和扩增,获得腺病毒Ad-CFP/HBV4.1.通过荧光显微镜下观察GFP绿色荧光蛋白的表达,检测腺病毒滴度和感染效率;采用PCR法检测腺病毒DNA上有无HBV基因组存在.结果 经酶切鉴定确认含HBV穿梭质粒pAdTrack-CMV/HBV4.1和重组腺病毒基因组质粒pad-GFP/HBV4.1构建成功;GFP荧光检测提示重组腺病毒Ad-GFP/HBV4.1已成功包装;PCR扩增表明重组腺病毒内携带有HBV DNA片段.在HEK293细胞中获得的病毒滴度可达(4.2～4.8)×107 efu/ml;当MOI为100时,感染HEK293细胞的效率>90%.结论 成功构建了携带1.3拷贝HBV基因组的重组腺病毒Ad-GFP/HBV4.1,为进一步建立高水平HBV复制型细胞和动物模型以用于HBV生物学特性的研究英定了基础.     

重组腺病毒TGF-β的扩增及病毒滴度检测

目的：探讨高效扩增腺病毒载体的方法。方法：用人胚胎肾细胞株扩增重组腺病毒，并测定病毒滴度。结果：扩增病毒滴度约为5×10^8pfu／mL。结论：用人胚胎肾293细胞株扩增重组腺病毒，在不进行任何浓缩时可达到较高病毒滴度，为腺病毒介导的基因转载提供了有效途径。