在实践中推广和应用临床微生物学的行业标准和指南

在病原学诊断技术快速发展, 检验新技术逐渐应用于微生物检测的背景下, 检验工作者与临床相关学科应及时提出中国标准、中国指南、中国方案, 始终坚持在临床实践中推广和应用临床微生物学相关行业标准和指南, 持续推动病原学诊断标准化建设的良性循环, 逐步提高我国感染性疾病的实验室诊断能力和行业进步。     

血浆游离DNA测序在肺部感染病原学诊断中的应用价值

基于宏基因测序技术的血浆微生物游离DNA(mcfDNA)测序为感染性疾病提供了一种非侵袭性的病原学诊断技术, 在脓毒症和血流感染中, 与血培养等传统病原学诊断技术相比, mcfDNA测序在敏感性、时效性和致病原覆盖面方面具有优势, 但在用于肺部感染时, 其敏感性与支气管肺泡灌洗液等高质量下呼吸道标本的宏基因二代测序仍有较大差距, 而且缺乏高质量临床研究数据, 因此, 还不宜将其作为肺部感染病原学诊断的一线技术, 其临床应用尚需控制在亟须明确病原学诊断、传统病原学诊断技术难以达到目的、侵袭性病原学检测标本无法获得的少数疑难危重肺部感染患者中。通过改进测序技术提高其敏感性, 通过高质量临床研究明确其适应用对象和最佳应用时机, 是未来能够在肺部感染中高效运用这一新的非侵袭性病原学诊断技术的关键。     

宏基因组二代测序技术在临床病原学诊断中的应用

感染性疾病是威胁人类生命健康的主要疾病,病原学诊断是感染性疾病诊治的关键环节.近年来,宏基因组二代测序技术(mNGS)迅速发展.与传统病原学检测技术相比,mNGS能无偏倚性直接分析出标本中的病原体谱、丰度和分布情况,改变传统病原学诊断模式,具有良好的应用前景.该文对mNGS在病原体检测、感染性疾病诊断、检测影响因素和结...     

“感染性疾病病原学诊断的新技术和新进展”学习班招生通知

细菌感染性疾病涉及医院临床各科室,为使临床微生物实验室技术人员更好地了解和掌握感染性疾病病原学诊断的新技术和新近展,以提高感染性疾病病原的诊断水平。复旦大学附属华山医院抗生素研究所将于2 0 0 4年6月中、下旬在上海举办国家级继续医学教育“感染性疾病病原学诊断的新技术和新进展”学习班。本学习班面向临床微生物实验室技术人员和重视感染性疾病诊治的各科临床医师,完成课程并经考核合格者,将授予国家级继续教育I类学分1 0分。授课包括感染性疾病病原学诊断的新近展,非典型病原菌的基因诊断及免疫荧光诊断技术;细菌耐药性现状…     

目前在感染性疾病诊治中存在的问题

引言感染性疾病是由细菌、病毒、真菌、原虫以及蠕虫等引起的一大类疾病，虽在病原学诊断与抗感染治疗两方面取得巨大成绩，但仍面临着若干关系到诊疗水平提高的问题。２病原学诊断存在问题及其处理感染性疾病病原的多样性，决定了病原学诊断任务的复杂性和重要性。通常是...     

加强感染性疾病病原体分子生物学诊断的研究

在感染性疾病的诊断中，病原学诊断具有十分重要的地位。以PCR技术为基础的病原体分子诊断技术是感染性疾病诊断、治疗、预防中的重要方法之一。对感染性疾病病原体进行分子生物学诊断时，必须考虑到准种（quasispecies）因素。因准种几乎是所有病原体的一个共同特点，其对感染性疾病病原学诊断十分重要。随着抗微生物药物的广泛应用，感染性疾病的病原体也随之产生了耐药（resistance），这是困扰感染性疾病治疗的一个突出的问题。耐药的检测结果，有助于药物的选择、治疗方案的调整，同时也可避免多药耐药以及耐药病原体的扩散。根据病原体核酸序列的差别，可以将病原体分成不同的基因型，通常不同基因型病原体感染的临床结局不同，而更为重要的是对治疗的应答率不同。因此，必须根据病原体基因分型的结果，制定个体化的治疗方案，方能提高临床疗效。     

高通量测序技术在脓毒症病原微生物检测中的价值

脓毒症是急危重症医学面临的重要临床问题,发病率、病死率居高不下,早期病原微生物诊断对尽早实施目标治疗、降低病死率至关重要。目前的病原微生物检测技术在及时性和准确性等方面仍有欠缺。高通量测序技术一定程度上能够克服传统病原学检测技术的缺点,并正在逐步应用于临床,但目前仍存在一系列问题。本文将对该技术在脓毒症病原微生物检测中的价值及其优缺点作一综述。     

综合医院感染性疾病专科医师教学体会

感染性疾病科是大内科的分支学科,是研究各种致病微生物在人体中发生、发展、传播以及病原学诊断、治疗和预防的学科。学科发展离不开人才培养,而人才培养的关键是能力提高。北京朝阳医院感染和临床微生物科5年来学科建设和感染科专科医师培养经验是:(1)认清感染性疾病科专科医师职责,做到专科医师培养有的放矢;(2)加强临床微生物教学,提高病原学诊断能力;(3)加强大内科基本功教学,提高临床救治能力;(4)强化英语教学和科研论文写作,提高科研能力。     

环介导等温扩增技术在病原微生物临床检测中的应用

病原微生物是威胁人类健康的重要因素之一,快速、准确的检测方法对于感染性疾病的诊断具有重要意义。环介导等温扩增(LAMP)是一种恒温扩增方法,具有反应时间短、操作简便、灵敏度高、特异度高、检测成本低等优点,因此被广泛应用于感染性疾病的快速诊断。基于这种情况,该文主要阐述了LAMP的原理、特点及其在临床常见病原微生物检测方面的应用与研究进展。LAMP技术现在已经被应用于病原微生物的检测,且具有较高的灵敏度及特异度,但该技术仍有易产生假阳性、引物设计复杂等不足之处。该文综述了近年来LAMP技术在病原微生物感染中的应用与进展,并对其未来的发展前景进行了展望,以期在资源有限的环境中为病原微生物感染的快速诊断提供合理的研究方向。     

简讯

国家级继续医学教育基地项目"感染性疾病病原学诊断的新技术和新进展"学习班第十一期招生通知(第一轮)一、学习班内容简介由复旦大学附属华山医院抗生素研究所主办的第十一期"感染性疾病病原学诊断的新技术和新进展"学习班报名即将开始。学习班将邀请国内知名教授讲授最新版的CLSI手册(2012年),感染性疾病病原学诊断的新进展;中国细菌耐药性现状及其临床重要耐药菌的实验室检测;从临床医师视角看对临床微生物工作的要求;细菌的药物敏感性试验和CLSI规范化的操作标准及药敏试验的临床意义;真菌的分离培养、鉴定和药敏;抗菌药物的合理应用及药动学和药效学的关系(PK/PD);     

新型冠状病毒实验室诊断技术进展

2019年12月,一种可引起人呼吸道感染的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)开始在我国武汉地区感染流行,并在短时间内蔓延至全国及世界其他国家。面对新发传染病,及早发现已感染病毒的携带者或患者对于控制传染源、切断传播途径、保护易感人群至关重要。因此,我国迅速推出了基于实时RT-PCR技术的新型冠状病毒RNA检测技术,病毒核酸检测阳性成为现行新型冠状病毒肺炎(COVID-19)诊疗方案对疑似病例确诊的主要依据。但由于SARS-CoV-2的感染特性,核酸检测的阳性率不足50%。在感染性疾病中,特异性抗体的产生是判断感染发生的重要标准之一,目前基于免疫学检验技术的抗-SARS-CoV-2特异性抗体检测也受到越来越多的重视,并被纳入了最新版诊疗方案中。现回顾COVID-19疫情爆发以来诊断标准的变迁,并在对各种检测方法的优缺点进行概述的基础上,对确诊和患者治愈出院相关标准的制定提出了新的见解。     

蛋白质体外扩增技术在神经退行性疾病诊断中的应用

神经退行性疾病患者被诊断时通常已经处于疾病晚期,该类疾病的诊断主要取决于临床症状的鉴别,给诊断造成一定的困难.目前已经逐渐开始尝试对神经退行性疾病进行早期诊断.蛋白质体外扩增技术包括蛋白质错误折叠循环扩增(Protein Misfolding Cyclic Amplification,PMCA)和实时震动诱导转化(Re...     

基于CRISPR/Cas系统诊断平台的研究进展

目前核酸检测技术已被广泛应用于临床实验室诊断,常规检测技术如实时荧光定量PCR技术耗时长且依赖特定的仪器设备。成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)/CRISPR相关蛋白(Cas)系统是细菌和古细菌在与病毒斗争过程中获得的适应性免疫防御机制,已被发展成强大的基因组编辑技术。最近CRISPR领域的先驱团队基于Cas13a、Cas12a和新发现的Cas14蛋白开发出SHERLOCK、DETECTR等新型核酸检测工具,在传染性疾病的快速诊断、癌症中基因突变的检测和基因分型等方面意义重大,其灵敏度高、特异性强且快速经济,在临床分子诊断领域具有巨大潜力。本文综述了CRISPR/Cas系统的作用机制及新型诊断平台的原理和应用进展,总结了新型检测技术的优缺点并对其发展前景进行展望。     

Procedural overview of molecular genetics technology in the clinical laboratory.

Basic concepts of molecular technology and diagnostic applications in the clinical laboratory are discussed. Advances in molecular biology have led to an increased number of clinical laboratories providing diagnostic support at the genetic level. The clinical applications of such a technology at present is broad, perhaps limited only by the regions mapped on the human genome. As the rapid discovery of new genes ignites a chain reaction of opportunities, the clinical laboratory scientist should be kept informed of the exciting technologic advances in the diagnosis of infectious diseases, genetic-related diseases, and leukemia and lymphomas. Many future diagnostic applications are now being researched.     

超声和MRI影像学及影像组学在乳腺癌中的研究进展

乳腺癌是全球女性最常见的恶性肿瘤之一,发病率和致死率居癌症首位,早期诊断和早期治疗可以提高疾病预后效果,降低疾病相关死亡率。超声和MRI影像学是乳腺癌诊疗指南推荐对原发肿瘤评估无创检查方式,随着科技的发展,越来越多的影像学新技术应用于临床实践,乳腺癌检出率和诊断准确率都有了很大提高。人工智能的出现,拓展了影像组学的应用,推动了乳腺癌精准医疗的发展。本文针对超声和MRI影像学及影像组学在乳腺癌临床诊疗中的应用进展进行了综述。      

实时三维超声成像对胆囊病变的诊断意义

目的评价实时三维超声成像对胆囊病变的诊断意义。方法实时三维超声检查胆囊疾病患者105例,并对比其二维声像图。结果实时三维超声成像能更快速、更直观地显示胆囊病变的部位、数目、累及范围、形态特征,及其与周围组织的关系。结论实时三维超声成像为胆囊病变的临床确诊及治疗提供了更丰富的信息。     

From single cell gene-based diagnostics to diagnostic genomics: current applications and future perspectives.

Molecular diagnostics is a branch of clinical diagnostics that uses primarily DNA or RNA as a biomarker for clinical testing. It combines various gene-based amplification technologies with highly sophisticated detection methods for the clinical diagnosis of a vast variety of diseases including infectious diseases, cancer, and inherited diseases. The principal application of gene-based amplification technology is to identify pathogen or gene-specific nucleic acid sequences that are used as surrogate markers for the identification of either infectious pathogens or alteration of disease-related genes. There are generally three classes of gene-based amplification technologies: target-based, e.g., PCR; probe-based, e.g., LCR; and signal-based, e.g., bDNA. Real-time detection of PCR allows us to quantify amplified amplicons with a broad dynamic range and it offers a unique way to detect genetic mutations. Other technologies such as immuno-PCR and bio-barcode assay (BCA) combine different amplification tactics offering extreme detection sensitivity ranging from femtogram (10(-15)) to zeptogram (10(-21)). Even though quantum dots technology is in its infant stage, its potential to further increase diagnostic sensitivity and specificity is likely beyond our current imagination. Future diagnostic technologies include the use of genomic and proteomic approaches especially in pure cell types or even in the single-cell level, which open up endless new possibilities for gene-based diagnostics at entirely different levels. In this article, principles of various current gene-based amplification and detection technologies along with their clinical applications are discussed. New technologies that could potentially be used in future gene-based diagnosis are introduced.     

肺部超声的临床应用及进展

目前肺部超声已应用于多种肺部疾病的临床诊断,尤其在肺间质综合征、气胸、肺实变、胸腔积液、肺栓塞等疾病诊断中均有较高的敏感性及特异性。近年来肺部超声与心血管超声的联合应用,实现了床旁超声对多种常见危重症疾病的快速排除及诊断,为抢救患者赢得了宝贵的时间。本文就肺部超声的临床应用及进展进行综述。     

分子诊断技术在心血管疾病诊疗中的应用

心血管疾病已成为危害我国人民群众生命和健康的重大疾病。分子诊断技术已取得了长足的发展,可应用于心血管疾病诊的筛查,实现治疗模式向预测、预防及个体化模式的转变。在心血管疾病诊断方面,可针对不同的疾病需求采用不同的分子诊断策略对相关疾病进行诊断,主要包括免疫法检测转录因子、染色体检测、聚合酶链反应法检测外显因子、基因单核苷酸多态性（SNP）检测、基因突变检测、致病基因DNA测序、DNA甲基化检测、miRNA检测等技术。在治疗及疗效监测方面．可应用分子诊断技术进行相关的新药研发、个性化药物治疗、治疗方案选择等。同时,还可以应用于疾病的预后评价。     

The application of biofilm science to the study and control of chronic bacterial infections

Unequivocal direct observations have established that the bacteria that cause device-related and other chronic infections grow in matrix-enclosed biofilms. The diagnostic and therapeutic strategies that have served us so well in the partial eradication of acute epidemic bacterial diseases have not yielded accurate data or favorable outcomes when applied to these biofilm diseases. We discuss the potential benefits of the application of the new methods and concepts developed by biofilm science and engineering to the clinical management of infectious diseases.