基于全基因组测序的耐碳青霉烯类抗生素鲍曼不动杆菌耐药基因、毒力因子及同源性分析

摘要：目的 通过应用全基因组测序(whole genome sequencing, WGS)技术分析某三级医疗机构耐碳青霉烯类抗生素鲍曼不 动杆菌(carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii, CRAB)的耐药基因、毒力因子及同源性。方法 收集该院2020年1月至3月 重症监护病房(Intensive care unit, ICU)、神经外科分离的11株医院感染CRAB菌株，通过二代测序平台进行全基因组测序, 应用 基因组流行病学中心(Center for genomic epidemiology, CGE)ResFinder 4. 0软件分析其耐药基因型，并应用MORPHEUS在线制作 热图，应用毒力因子数据库(virulence factors of pathogenic bacteria, VFDB)VFanalyzer软件筛选毒力因子，应用MLST软件检测菌 株的ST型，应用Kaptive软件检测荚膜型，应用CSI Phylogeny 1. 4软件及FigTree v1. 4. 4软件构建最大似然树(maximum likelihood tree, MLT)以分析其同源性。结果 11株CRAB对亚胺培南、美罗培南、头孢菌素、环丙沙星均呈现耐药，而对阿米卡星、左氧 氟沙星耐药的菌株株数较少。11株CRAB共检测出18种耐药基因，11株同时携带碳青霉烯酶耐药基因blaOXA-23和blaOXA-66，β-内酰 胺酶耐药基因以blaTEM-1D和blaADC-25为主，大部分菌株携带多种外排泵相关耐药基因及抗菌药物修饰酶耐药基因。11株CRAB均携 带多种毒力因子，包括外膜孔蛋白、脂多糖、生物膜、外排泵、磷脂酶和效应蛋白等，如OmpA、Lps、Csu、Pga、Ade、Plc、 Bas、Bau、Ent、Hem、Aba、Bfm、Pbp和Kat等。11株CRAB均为ST2-K22型，同源性分析结果显示C组内同源性关系相近，存 在院内传播的可能。结论 该院CRAB的耐药性、毒力特征复杂多样，同源性分析显示该院存在1种优势克隆株，该克隆株有医 院内传播的风险。     

论文中阿拉伯与汉字数字的使用规律

1阿拉伯数字使用规则:(1)凡是可以使用阿拉伯数字且很得体的地方,均应使用阿拉伯数字。(2)公历世纪、年代、年、月、日、时刻必须使用阿拉伯数字。年份不能简写。例如:2021年不能写成21年。日期的表示采用全数字式写法。例如:2020年2月18日写作2020-02-18或20200218或2020.02.18。日的时间表示:如下午3时9分38秒写作:15:09:38。(3)计量单位前的数字和统计表中的数值一律使用阿拉伯数字。(4)引文标注中的版次、卷号、期号、页码等使用阿拉伯数字。(5)多位数的阿拉伯数字不能拆开转行。(6)多位数和小数分节,从小数点起向左向右3位数空半个阿拉伯数字(1/4汉字)的空隙,不用千分撇","分节法。     

1972—2016年江苏省启东市胃癌死亡流行特征分析

目的分析江苏省启东市1972—2016年胃癌死亡流行特征。方法收集启东市1972—2016年恶性肿瘤死亡登记数据库及历年人口资料, 计算死亡率、中国人口标化率(中标率)、世界人口标化率(世标率)、35～64岁截缩率、0～74岁累积死亡率、累积死亡风险、变化百分比、死亡率年均变化百分比。结果 1972—2016年启东市胃癌死亡例数为15 863例, 占全部恶性肿瘤死亡例数的16.04%, 胃癌死亡率为31.37/10万, 中标率为12.97/10万, 世标率为21.39/10万, 35～64岁截缩死亡率为28.86/10万, 0～74岁累积死亡率为2.54%, 胃癌死亡累积风险为2.51%。男性死亡10 114例, 男性死亡率、中标率、世标率分别为40.53/10万、17.98/10万和30.13/10万;女性死亡5 749例, 女性死亡率、中标率、世标率分别为22.45/10万、8.52/10万和13.92/10万。25岁以下各年龄组的死亡率<1/10万, 死亡率随年龄的增长而升高, 50～岁组达到并超过人群的平均死亡率水平, 80～岁组达到死亡高峰。1972—2016年间胃癌死...     

以宫腔积液为首发症状的胃型宫颈腺癌1例报道并文献复习

宫腔积液指宫腔内液体积存(积水、积血或积脓),是绝经后女性常见体征之一,常于超声检查时发现。持续宫腔积液患者,需宫腔镜检查寻找病因。本文报道1例以宫腔积液为首发症状,经宫腔镜检查确诊为胃型宫颈腺癌的患者。通过病例回顾并文献复习,以期为更多绝经后宫腔积液及宫颈病变的诊断提供参考,避免漏诊及误诊。1病例资料患者67岁,女,主因"绝经18年,不规则阴道出血2月"于2020年5月就诊于首都医科大学附属北京妇产医院妇科微创中心。     

胃癌中LINC00659的表达及其通过调控PI3K/AKT信号通路影响胃癌细胞增殖

目的 探讨LINC00659在胃癌组织及胃癌细胞中的表达，并探讨其通过调控PI3K/AKT信号通路影响胃癌细胞增殖的分子机制。方法 采用qRT-PCR法检测LINC00659在胃癌组织及人胃癌细胞株中的表达情况；构建慢病毒介导LINC00659敲减或过表达胃癌细胞株模型，qRT-PCR法检测转染效率；CCK-8法检测LINC00659对胃癌细胞增殖能力的影响；克隆形成实验检测细胞集落形成能力；Western blot法检测敲减或过表达LINC00659后胃癌细胞中Ki-67、PCNA、PI3K和p-AKT蛋白表达水平。结果 LINC00659在胃癌组织和人胃癌细胞株中高表达(P<0.01);qRT-PCR结果显示，慢病毒感染胃癌细胞后，成功敲减或过表达LINC00659(P<0.01);CCK-8法结果显示：敲减LINC00659显著抑制胃癌AGS细胞的增殖活力，过表达LINC00659促进HGC-27细胞增殖活力(P<0.05);克隆形成实验结果显示，敲减LINC00659抑制AGS细胞的集落形成能力，过表达LINC00659促进胃癌HGC-27细胞集落形成能力(P...     

Barrett食管伴滑动性食管裂孔疝腹腔镜治疗疗效观察

目的探究合并滑动性食管裂孔疝的Barrett食管患者经腹腔镜下治疗后生活质量和食管黏膜病变的改善情况。 方法回顾性收集首都医科大学宣武医院胃食管反流中心2016年1月至2020年12月诊断为Barrett食管伴滑动性食管裂孔疝患者23例，接受腹腔镜食管裂孔疝修补+胃底折叠术，于术前和术后12周时行胃镜、胃食管反流病自测量表（Gerd Q）评分、反流症状指数（RSI）评分、健康调查量表36（SF-36）调查问卷，评估患者术后生活质量和食管黏膜改善情况。 结果23例伴滑动性食管裂孔疝的Barrett患者术后12周随访显示3例患者黏膜病变部分消退。患者术后GerdQ、RSI相较术前均有明显改善（GerdQ：5.78±1.54 vs 11.65±1.50，P=0.00；RSI：9.70±1.92 vs 18.57±3.01，P=0.00），SF-36量表仅在生理功能方面改善不明显（85.87±4.16 vs 86.43±3.12，P=0.31），生理职能、情感职能、活力、精神健康、社会功能、躯体疼痛和总体健康方面均明显改善（生理职能：66.43±6.13 vs 35.48±2.86，P=0.00；情感职能：73.74±4.91 vs 65.22±2.58，P=0.00；活力：56.96±3.80 vs 50.30±4.56，P=0.00；精神健康：62.09±4.89 vs 53.26±2.07，P=0.00；社会功能：81.39±4.42 vs 74.00±3.59，P=0.00；躯体疼痛：80.00±6.84 vs 75.30±10.27，P=0.00；总体健康：69.17±5.68 vs 60.17±4.61，P=0.00）。 结论腹腔镜食管裂孔疝修补+胃底折叠术对伴滑动性食管裂孔疝的Barrett食管患者生活质量和黏膜病变均有一定改善。