深度挖掘肝细胞癌中遗传变异对可选择性多聚腺苷酸化的影响

摘要:目的 通过整合组学和临床信息,深度挖掘肝细胞癌中重要的可选择性多聚腺苷酸化(alternativepolyadenylation,APA)数量性状基因位点(alternativepolyadenylationquantitativetraitlocus,apaQTL),并研究这些重要位点相关 的下游靶基因及上游 RNA 结合蛋白(RNA-bindingprotein,RBP)。方法 从 SNP2APA 数据库下载泛癌顺式和反式 apaQTL数据,用 R语言分析肝细胞癌apaQTL的分布特征。根据位置提取apaQTL上下游50bp范围内的序列,使用 STREME进行特征基序富集,进一步结合肝细胞癌临床信息,筛选改变基序和临床预后相关的apaQTL。利用 Tomtom 挖掘潜在调控 APA 的上游 RBP,并通过 ENCODE以及 TCGA 预后数据分别验证 RBP在 APA 调控和肝细胞癌发生发 展中的重要性。将apaQTL和表达数量性状位点(expressionquantitativetraitlocus,eQTL)进行共定位,并结合差异表 达和预后分析,筛选影响表达和预后的apaQTL和下游靶基因。结果 通过对肝细胞癌apaQTL进行特征分析,发现肝 细胞癌顺式apaQTL在其他癌症中广泛出现,而反式apaQTL在肝细胞癌中具有特异性。通过对apaQTL进行基序分 析,筛选出20个可以改变多聚腺苷酸化基序的apaQTL。其中rs16742可以生成新的多聚腺苷酸化基序,从而导致赖氨 酰-tRNA 合成酶(leucyl-tRNAsynthetase,LARS)基因的转录本增长。进一步分析表明,rs16742与肝细胞癌的预后相 关。通过预测新的apaQTL基序和上游靶基因,并结合外部数据验证,发现 RBP聚(RC)结合蛋白2[poly(RC)binding protein2,PCBP2]参与肝细胞癌 APA 事件的调控,并与预后相关。进一步分析表明,预后显著的apaQTLrs115865883 和rs150628203可能影响 PCBP2与转录本的结合。通过apaQTL和eQTL共定位分析,筛选出30个潜在的影响表达和 肝细胞癌发生发展的apaQTL和下游靶基因。结论 研究发现了一系列功能性肝细胞癌apaQTL及下游靶基因,基于 apaQTL相关分析,发现 RBPPCBP2可调控肝细胞癌的 APA 事件及预后。     

探讨动态增强MRI强化曲线对椎管内肿瘤的诊断价值及其病理基础

目的探讨动态增强MRI(DCE-MRI)强化曲线对各种椎管内肿瘤的诊断价值及其病理学基础。方法用DCE-MRI方法对已手术和病理证实的62例椎管内肿瘤(包括髓内肿瘤12例;髓外硬膜下肿瘤49例;硬膜外肿瘤1例)进行前瞻性研究,并对16例椎管内肿瘤(包括神经鞘瘤10例,脊膜瘤3例,星形细胞瘤、室管膜瘤及血管母细胞瘤各1例)的多种病理指标与强化曲线进行相关性分析。结果将椎管内肿瘤CER-Time曲线分为快升快降型、快升慢降型、较快升持续型、缓慢上升型4型,其中血管母细胞瘤属于快升快降型;骨母细胞瘤、原始神经外胚层肿瘤属于快升慢降型;脊膜瘤、室管膜瘤属于较快升持续型;星形细胞瘤、神经鞘瘤、神经纤维瘤、神经节细胞瘤属于缓慢上升型。对16例椎管内肿瘤病理指标与动态增强结果的相关性分析显示强化曲线类型与大血管数、30sCER呈负相关,与8minCER呈正相关;30sCER与小血管增生、内皮增生、大血管数呈正相关;8minCER与小血管增生、大血管数呈负相关;最大增强率与出血、小血管数呈正相关。结论 DCE-MRI不仅有助于各类椎管内肿瘤的鉴别诊断,还能提供肿瘤的血供等微观情况,为临床选择治疗方案及估计预后提供较为可靠的依据。     

超声实时三平面法评价右房容积的临床初步研究

目的 探讨超声实时三平面法（Triplane）评估右房容积的可行性及准确性。 方法 应用超声实时Triplane法与二维超声心动图（2DE）测量15例健康志愿者（正常对照组）和18例右房扩大患者（右房扩大组）的右房舒张末期容积、右房收缩末期容积、右房射血分数，分别在正常对照组和右房扩大组组内及组间比较2DE与实时Tri—plane法的测量结果。 结果 （1）正常对照组、右房扩大组组内比较，2DE和实时Tri—plane法测值无显著性差异（p〉0．05）；（2）正常对照组与右房扩大组组间比较，2DE与实时Tri—plane法测值差异有显著性意义（P〈0．05）。 结论 超声实时三平面法能准确测量右房容积，具有重要的临床应用价值。     

657例高血压病患者病性证素分布及其组合特点研究

目的:通过大样本流行病学调查,分析高血压病中医病性证素分布及组合特点,指导中医临床辨证。方法:收集2012~2015年本院门诊及住院的高血压病患者657例,分析统计证素分布情况。结果:657例高血压病患者中,青年高血压患者以阳亢、痰浊多见,均占该年龄组的35.5%;中老年患者以阴虚、阳亢、痰浊、瘀血、气虚等多见,表现为阴虚瘀血痰浊阳亢气虚,分别占48.72%,34.2%,30.51%,26.52%,21.73%;在二种证素兼夹组合中,以阴虚兼夹证素最多,共计177例,占26.94%,其次为痰浊及瘀血,分别占13.09%及14.31%。结论:高血压病多以阴虚阳亢、气阴两虚及痰瘀互阻为主要病机,青年患者多以实证为主,中老年患者虚证多见,且多表现为虚实夹杂。     

胰腺囊性肿瘤39例临床分析

目的：探讨胰腺囊性肿瘤临床特点及治疗方法。方法回顾性分析2004年1~12月深圳市人民医院收治的39例胰腺囊性肿瘤病例的临床资料,包括诊断、治疗方案、病理结果以及随访情况。结果39例胰腺囊性肿瘤中,导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)10例(25.6%),黏液性囊腺瘤(MCN)7例(17.9%),浆液性囊腺瘤(SCN)12例(30.8%),实性假乳头状瘤6例(15.4%),无功能性神经内分泌肿瘤4例(10.3%)。患者无特征性的临床表现;CT和MRI对胰腺囊性肿瘤的鉴别诊断具有重要的意义。39例中手术治疗30例,B超引导下穿刺活检1例,内镜下胰管支架内引流2例,保守治疗6例。胰腺囊性肿瘤术后并发症总发生率为33.3%,无手术死亡病例。所有患者随访3~60个月,1例发生术后远处转移;保守治疗及内引流术患者均有不同程度肿瘤进展或症状反复。结论 CT及MRI是胰腺囊性肿瘤术前诊断的主要手段;胰腺囊性肿瘤总体预后好,主张积极手术,功能保留性手术及腹腔镜手术值得临床推广。     

T3、T4期直肠癌术前新辅助治疗疗效评估中MRI的应用价值研究

目的:研究MRI在T3、T4期直肠癌术前新辅助治疗疗效评估中的应用价值。方法:选择本院2013年1月-2015年1月收治的40例经病理证实为T3、T4期直肠癌患者为研究对象,回顾性分析其术前新辅助治疗前后的MRI资料。结果:术前新辅助治疗前肿瘤≤5 cm的患者为13例,5 cm的患者为27例;40例患者的DWI均表现为高信号,而ADC均表现为降低;16例处于T3期,24例处于T4期。经过治疗后肿瘤1.0 cm有9例,1.0~3.0 cm有11例,3.0~5.0 cm有15例,≥5.0 cm有5例;40例患者均表现为DWI的低信号,ADC信号升高。T1期4例,T2期22例,T3期10例,T4期4例。术后的病理分期为:T1期5例,T2期21例,T3期10例,T4a期1例,T4b期3例。结论:MRI可以对直肠癌T3、T4期患者术前新辅助治疗前后肿瘤大小和分期给出良好的判定。     

基于常见遗传变异和传统风险因素的中国南方汉族人群结直肠癌风险预测模型研究

目的 基于结直肠癌全基因组关联研究(GWAS)发现的易感位点,联合传统风险因素建立中国南方汉族人群结直肠癌风险预测模型。方法 对1 066例结直肠癌患者和3 880例健康对照的21个GWAS候选位点进行基因分型,分析其与结直肠癌易感性之间的关联。通过遗传风险评分(GRS)和加权遗传风险评分(wGRS)计算显著候选位点的联合效应。以不同方式组合遗传风险评分和传统风险因素,构建结直肠癌风险预测模型,并绘制受试者工作特征曲线评价模型优劣性。结果 7个候选位点与结直肠癌易感性显著相关。随着风险评分的升高,人群患结直肠癌的风险也随之升高(GRS:P=0.002 6,wGRS:P<0.000 1),相比于四分位分组中最低一组,GRS和wGRS最高的一组OR值分别为1.33(95%CI:1.12~1.58,P=0.001 0)和1.76(95%CI:1.45~2.14,P<0.000 1)。联合传统风险因素和wGRS的模型为最优模型,其曲线下面积为0.593(95%CI:0.573~0.613)。结论 结直肠癌易感位点间存在显著的联合作用。相比于传统风险因素模型,传统风险因素结合加权遗传风险评分模型能更好预测结直肠癌的患病风险。     

新生儿皮肤软组织扩张术的手术配合体会

皮肤软组织扩张术的出现是整形外科发展的一个重要里程碑。皮肤扩张技术具有供区继发损伤小、可多次提供额外皮肤软组织量，以及扩张皮瓣的质地、色泽、毛发分布、感觉功能与修复区域极为相似等优点。目前，皮肤软组织扩张术已在整形再造外科得到广泛应用。我院2010～2012年共收治11例局部皮肤病变的新生儿，I期置入皮肤软组织扩张器，Ⅱ期做局部皮肤修复，疗效较好。现将皮肤软组织扩张术护理体会总结如下。