深度挖掘肝细胞癌中遗传变异对可选择性多聚腺苷酸化的影响

摘要:目的 通过整合组学和临床信息,深度挖掘肝细胞癌中重要的可选择性多聚腺苷酸化(alternativepolyadenylation,APA)数量性状基因位点(alternativepolyadenylationquantitativetraitlocus,apaQTL),并研究这些重要位点相关 的下游靶基因及上游 RNA 结合蛋白(RNA-bindingprotein,RBP)。方法 从 SNP2APA 数据库下载泛癌顺式和反式 apaQTL数据,用 R语言分析肝细胞癌apaQTL的分布特征。根据位置提取apaQTL上下游50bp范围内的序列,使用 STREME进行特征基序富集,进一步结合肝细胞癌临床信息,筛选改变基序和临床预后相关的apaQTL。利用 Tomtom 挖掘潜在调控 APA 的上游 RBP,并通过 ENCODE以及 TCGA 预后数据分别验证 RBP在 APA 调控和肝细胞癌发生发 展中的重要性。将apaQTL和表达数量性状位点(expressionquantitativetraitlocus,eQTL)进行共定位,并结合差异表 达和预后分析,筛选影响表达和预后的apaQTL和下游靶基因。结果 通过对肝细胞癌apaQTL进行特征分析,发现肝 细胞癌顺式apaQTL在其他癌症中广泛出现,而反式apaQTL在肝细胞癌中具有特异性。通过对apaQTL进行基序分 析,筛选出20个可以改变多聚腺苷酸化基序的apaQTL。其中rs16742可以生成新的多聚腺苷酸化基序,从而导致赖氨 酰-tRNA 合成酶(leucyl-tRNAsynthetase,LARS)基因的转录本增长。进一步分析表明,rs16742与肝细胞癌的预后相 关。通过预测新的apaQTL基序和上游靶基因,并结合外部数据验证,发现 RBP聚(RC)结合蛋白2[poly(RC)binding protein2,PCBP2]参与肝细胞癌 APA 事件的调控,并与预后相关。进一步分析表明,预后显著的apaQTLrs115865883 和rs150628203可能影响 PCBP2与转录本的结合。通过apaQTL和eQTL共定位分析,筛选出30个潜在的影响表达和 肝细胞癌发生发展的apaQTL和下游靶基因。结论 研究发现了一系列功能性肝细胞癌apaQTL及下游靶基因,基于 apaQTL相关分析,发现 RBPPCBP2可调控肝细胞癌的 APA 事件及预后。     

成人心脏术后心源性休克患者接受体外膜肺氧合辅助的临床结果荟萃分析

目的本研究旨在通过检索相关文献,系统评价体外膜肺氧合(ECMO)对心脏术后心源性休克(PCS)患者的临床疗效。方法通过搜索PubMed,Embase及Cochrane Library for English等数据库查找PCS行ECMO患者的相关研究进行荟萃分析。结果最终选取14项观察性研究进行荟萃分析。接受ECMO的PCS患者的院内死亡率为66.0%(95%CI 61%～71%)。合并1年生存率为24%(95%CI 19%～30%)。合并中期生存率为19%(95%CI 10%～34%)。下肢缺血发生合并率为14%(95%CI 10%～20%)。二次手术发生合并率为44%(95%CI 21%～70%)。肾功能衰竭发生的合并率为49%(95%CI38%～61%)。神经系统并发症发生的合并率为18%(95%CI 11%～29%)。感染发生的合并率为23%(95%CI 16%～31%)。大部分纳入的研究表明,年龄65岁、ECMO前或ECMO后血乳酸值升高、肾功能不全、ECMO持续时间长以及神经系统并发症是接受ECMO治疗的PCS患者院内死亡的危险因素。结论接受ECMO治疗的PCS患者的短期和中期生存率较低,EC-MO并发症的发生率相对较高,许多危险因素与院内死亡率有关。     

基于网络药理学与分子对接探讨木瓜治疗膝骨关节炎的分子机制

目的:基于网络药理学探索木瓜治疗膝骨性关节炎的分子作用机制。方法:基于口服生物利用度(OB)及药物相似性(DL),通过中药系统药理学数据库(TCMSP)筛选木瓜的主要活性成分。运用GeneCards、OMIM数据库建立膝骨性关节炎靶标数据库。通过Cytoscape 3.7.1软件构建"活性成分-作用靶标-疾病"可视化交互网络;运用STRING数据库构建蛋白互作网络,分析相关蛋白互作关系;对核心靶点进行京都基因与基因百科全书(KEGG)通路及基因本体(GO)生物过程富集分析。通过Discovery Studio软件对药物活性成分与疾病靶点进行分子对接验证。结果:筛选得到木瓜活性成分3个,涉及44个作用靶点。网络分析结果表明,靶点主要涉及调节细胞代谢、凋亡等生物学过程,通过调节细胞凋亡、肿瘤坏死因子(TNF)、p53、核转录因子-κB(NF-κB)、糖基化终末产物(AGE)及其受体(RAGE)等信号通路来发挥治疗膝骨关节炎的作用。分子对接结果表明,木瓜活性成分与膝骨性关节炎的血管内皮生长因子A(VEGFA)、白细胞介素-6(IL-6)、雌激素受体1(ESR1)等靶点对接吻合度较好。结论:木瓜治疗膝骨性关节炎具有多系统、多成分、多靶点的特点;其可能的作用机制包括控制炎症,调控关节软骨代谢、生长和修复,促进细胞增殖、分化,抑制细胞凋亡和抵抗氧化应激等以达到控制疾病发生发展的目的;木瓜中槲皮素、白桦脂酸、表儿茶酸等活性成分可能是其治疗膝骨性关节炎的物质基础。     

无锡地区60年气象数据与运气理论相关分析

目的:基于无锡地区60年气象数据探讨气象变化与五运六气理论的相关性。方法:从无锡市气象局收集1958年1月20日至2018年1月19日,共计60年连续观察的7项气象指标,即日平均气温、日最高气温、日最低气温、日平均相对湿度、日平均水汽压、日平均降水量、日平均风速,按照运气理论的时间分段进行归纳整理,与运气理论推演结果进行对比分析。结果:无锡地区60年7项气象指标的平均最高、最低数值与不同干支甲子对应年运气理论推演结果存在较大关联性,符合率为65.0%。天干(五运)对应年实际气象数据与按运气推演气候模式结果符合率达80.0%(8/10)。地支(六气)对应年的司天和司天结合在泉的实际气象数据与按运气推演气候模式结果符合率分别为83.3%(10/12)和91.7%(11/12)。实际气象资料与六主气推演相符率达100%(6/6)。结论:无锡地区实际气象变化与五运六气理论之间存在明显相关性。     

DBS对帕金森病病人精神症状及认知功能的影响

目的 探讨丘脑底核（STN）-深部脑刺激术（DBS）对帕金森病（PD）病人精神症状及认知功能的影响。方法 回顾性分析2016年1月至2019年1月STN-DBS治疗的65例PD的临床资料。术前、术后1年，采用第三版统一帕金森病评分量表（UPDRS-Ⅲ）评估PD开关期运动症状；采用H-Y分期评估病情严重度；采用日常生活能力量表（ADL）评估日常生活能力；采用汉密尔顿焦虑量表（HAMA）评估焦虑情况；采用汉密尔顿抑郁量表（HAMD）评估抑郁情况；采用帕金森睡眠量表（PDSS）评估睡眠障碍情况；采用蒙特利尔认知评估量表（MoCA）和简易智力状态检查量表（MMSE）评估认知功能；采用帕金森患者生活质量问卷（PDQ39）测评生活质量。结果 术后1年，UPDRS-Ⅲ评分、H-Y分期、ADL评分、HAMA评分、HAMD评分、PDQ39评分、MoCA评分及MMSE评分均明显改善（P<0.05）。结论 STN-DBS能够显著改善PD病人运动症状、精神症状、认知功能及生活质量。     

胰腺癌大阴唇皮肤转移一例

患者女，49岁，因外阴丘疹、红肿2个月入院。病程中偶有气短、咳嗽、咳白痰，体重无明显变化。既往高血压病史2年，对磺胺类药物过敏……     

分化型甲状腺癌患者口服131I后体内活度变化及剂量水平

目的 研究¹³¹I治疗分化型甲状腺癌（DTC）患者体内放射性活度及外部剂量水平的变化规律，分析二者之间的关系，并估算400 MBq患者剂量当量率的修正因子。方法 研究对象为43例甲状腺全切术后，首次行¹³¹I"清甲"治疗的DTC患者，服药量为1 850~3 700 MBq，平均服药量（2 405±777）MBq。分别于口服¹³¹I后2、6、20、22、24、27、30、44、46、48、54、68及72 h，测定患者的体内剩余放射性活度以及患者前部0.3、1及3 m处的剂量当量率。结果 患者服¹³¹I后的体内剩余放射性活度随时间变化函数为A=A₀（1.033 16e^{-0.062 4t}+0.017 17）。可估算出"清甲"治疗的DTC患者有效半减期为12.19 h，体内放射性活度降至400 MBq仅需26.4~38.9 h。患者服用¹³¹I后距其0.3、1及3 m的标准化剂量当量率随时间变化函数分别为：Ḣ_0.3=127.220 7e^{-0.054 8t}+3.765 71、Ḣ₁=30.225 8e^{-0.064 4t}+0.824 67、Ḣ₃=4.161 9e^{-0.061 5t}+0.167 97。患者服¹³¹I后体内剩余放射性活度与1 m处剂量当量率呈正相关（r=0.982，P<0.05），函数为Ḣ₁=0.025A+1.245。DTC患者体内剩余活度分别为1 000、700和400 MBq时，距患者1 m处对应的剂量当量率分为26.2、18.7和11.2 μSv/h。估算活度为400 MBq的患者0.3、1及3 m处剂量当量率的修正因子分别为0.25、0.49及0.70。结论 服用¹³¹I活度在3 700 MBq以下的DTC患者仅需住院2日便可达到出院标准。当DTC患者体内活度降至400 MBq时，其1 m处的剂量当量率远小于25 μSv/h。单纯利用点源公式估算患者周围剂量当量率会造成高估的情况，因此对于公式估算患者周围辐射水平时使用的修正因子还需进一步研究，使模型估算结果更贴合实际情况。     

T大颗粒淋巴细胞白血病合并原发性骨髓纤维化1例

大颗粒淋巴细胞白血病(large granular lympho-cytic leukemia,LGLL)是一类罕见的起源于T淋巴细胞和NK细胞的淋巴增殖性肿瘤(lymphoprolifer-ative neoplasm,LPN),以肿瘤细胞胞浆中含有嗜苯胺蓝颗粒为特征.原发性骨髓纤维化(primary my-elofibrosis,PMF)是一种BCR-ABL阴性的骨髓增殖性肿瘤(myeloproliferative neoplasm,MPN),常伴有JAK2、CALR或MPL基因突变,临床表现为贫血、脾脏肿大、骨髓网状纤维增多、髓外造血、细胞因子异常表达等.有8％ ～ 20％的机率转化成急性白血病,以急性粒系或粒单核系细胞白血病为主,转化为急性淋巴细胞白血病极为少见.MPN患者合并慢性淋巴细胞增殖性疾病较少见,本研究报告1例T大颗粒淋巴细胞白血病合并原发性骨髓纤维化的患者,其临床资料如下.     

以问题为导向的学习在神经外科本科学历教育中的应用探索

以问题为导向的学习(PBL)教学模式是以问题为导向的教学方法,通过总结PBL教学模式在该院神经外科本科学历教育临床授课中的实施经验及具体措施,作者认为,PBL教学模式在神经外科本科学历教育临床授课中具有可行性,在提高本科学历教育学员临床思维、基本理论及基本操作方面具有明显优势,值得提倡与推广。