深度挖掘肝细胞癌中遗传变异对可选择性多聚腺苷酸化的影响

摘要:目的 通过整合组学和临床信息,深度挖掘肝细胞癌中重要的可选择性多聚腺苷酸化(alternativepolyadenylation,APA)数量性状基因位点(alternativepolyadenylationquantitativetraitlocus,apaQTL),并研究这些重要位点相关 的下游靶基因及上游 RNA 结合蛋白(RNA-bindingprotein,RBP)。方法 从 SNP2APA 数据库下载泛癌顺式和反式 apaQTL数据,用 R语言分析肝细胞癌apaQTL的分布特征。根据位置提取apaQTL上下游50bp范围内的序列,使用 STREME进行特征基序富集,进一步结合肝细胞癌临床信息,筛选改变基序和临床预后相关的apaQTL。利用 Tomtom 挖掘潜在调控 APA 的上游 RBP,并通过 ENCODE以及 TCGA 预后数据分别验证 RBP在 APA 调控和肝细胞癌发生发 展中的重要性。将apaQTL和表达数量性状位点(expressionquantitativetraitlocus,eQTL)进行共定位,并结合差异表 达和预后分析,筛选影响表达和预后的apaQTL和下游靶基因。结果 通过对肝细胞癌apaQTL进行特征分析,发现肝 细胞癌顺式apaQTL在其他癌症中广泛出现,而反式apaQTL在肝细胞癌中具有特异性。通过对apaQTL进行基序分 析,筛选出20个可以改变多聚腺苷酸化基序的apaQTL。其中rs16742可以生成新的多聚腺苷酸化基序,从而导致赖氨 酰-tRNA 合成酶(leucyl-tRNAsynthetase,LARS)基因的转录本增长。进一步分析表明,rs16742与肝细胞癌的预后相 关。通过预测新的apaQTL基序和上游靶基因,并结合外部数据验证,发现 RBP聚(RC)结合蛋白2[poly(RC)binding protein2,PCBP2]参与肝细胞癌 APA 事件的调控,并与预后相关。进一步分析表明,预后显著的apaQTLrs115865883 和rs150628203可能影响 PCBP2与转录本的结合。通过apaQTL和eQTL共定位分析,筛选出30个潜在的影响表达和 肝细胞癌发生发展的apaQTL和下游靶基因。结论 研究发现了一系列功能性肝细胞癌apaQTL及下游靶基因,基于 apaQTL相关分析,发现 RBPPCBP2可调控肝细胞癌的 APA 事件及预后。     

关节镜治疗膝关节类风湿性关节炎

目的　探讨关节镜下实施膝关节滑膜切除术治疗膝关节类风湿性关节炎 (RA)的方法。方法　 34例RA患者根据美国风湿病学会 (ARA)进行分期 ,按Lysholm标准评分〔1〕。采用关节镜下滑膜切除的方法进行治疗 ,术后随访 6个月后 ,按Lysholm标准评分 ,判断手术疗效。结果　所有随访患者Lysholm评分增加 ,以Ⅰ、Ⅱ期疗效显著。结论　关节镜下治疗膝关节类风湿性关节炎是一种方便可行的微创治疗方法 ,尤其适合于Ⅰ、Ⅱ期患者。     

口服吡嗪酰胺后白癜风患者皮肤恢复正常一例

患者张庆森，男，６７岁，住院号：３８４０３，于１９９６年１１月２６日因咳嗽、咯痰、气短、乏力入院治疗。既往史：患白癜风２０余年，面部、四肢等部位有白斑。入院后。经痰及Ｘ线检查确诊肺结核。给予链霉素、雷米封、复合利福平、吡嗪酰胺治疗，２个月后病人结核症...     

印度洋地震海啸中国大陆受灾者心理状况调查与分析

目的通过对2004年12月发生的印度洋地震海啸给人们造成巨大的有形和无形心理创痛的调查分析,进一步探讨受灾人员的心理健康状况及影响因素、心理健康和应付的关系,为心理救助提供依据。方法对52名在印度洋地震海啸中国大陆受灾者,采用心理学症状自评量表(SCL-90)和应付方式进行测试,对获得的数据使用SPSS10.0进行统计分析。结果52名在印度洋地震海啸中国大陆受灾者,躯体化、强迫、焦虑、恐怖、偏执和精神病性上高于全国常模;在人际关系敏感、抑郁、敌对上低于全国常模。结论受灾者及相关人员在没有任何心理准备情况下遭受打击,在短时间内完全打破了个人常规反应模式,对人们的心理损害是巨大的,潜藏在心中的恐惧和忧虑难以消除,因此,我们应及时地采取心理救助技术,减轻或避免"创伤后应激障碍"的发生。