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目的在生物信息学分析基础上初步构建卵巢癌微小RNA(miRNA)及长链非编码RNA(lncRNA)调控网络,探讨miRNA在卵巢癌细胞中的分子调控机制。方法通过miRwalk 2.0及HMDD v2.0精准查询与卵巢癌相关且功能明确的miRNA,根据miRwalk 2.0软件出现频次进行筛选,明确其对应靶基因表达情况。在lncRNA疾病数据库中查询与卵巢癌相关的lncRNA,运用starBase v2.0对所得到的miRNA和lncRNA进行综合分析,筛选出与上述miRNA相互作用的且与卵巢癌相关的lncRNA。通过Cytoscape软件绘制miRNA在卵巢癌中的分子调控网络。结果 hsa-let-7a、hsa-mir-21、hsa-miR-16、hsa-mir-17、hsa-mir-19b、hsa-mir-29a、hsa-mir-92a是介导卵巢癌调控的高频miRNA,成功获取了有关miRNA在卵巢癌中的分子调控网络;初步明确了高频miRNA。lncRNA与miRNA匹配分析发现,lncRNA X(染色体)失活特异性转录物(XIST)作为核心调控因子与高频miRNA相互作用介导卵巢癌基因调控。结论利用生物信息学分析技术成功描绘了一张与卵巢癌相关的miRNA分子调控网络,miRwalk、HMDD、starBase等数据库可有效地用于miRNA与疾病关系的研究。 相似文献
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目的:建立金属β-内酰胺酶IMP-1的表达,纯化和鉴定方法,并探讨实验条件对分离纯化的影响.方法:pET9a/d-IMP-1质粒转化至E.coli Competent BL21(DE3)Cell并在LB培养基中表达后,通过SP Sepharose离子交换柱,得到粗提物,浓缩后用Sephadex G-75凝胶柱进一步纯化,得到IMP-1的精提物,对纯化产物用SDS-PAGE和MALDI-TOF-MS进行鉴定,同时用Nitrocefin作底物,测定纯化的金属β-内酰胺酶IMP-1的活性.结果:纯化的IMP-1具有较高的活性,能水解大多数抗生素.其米氏常数Km=9.28μmol/L;用MALDI-TOF-MS法测得的分子量为Mr=25111.9.结论:本文建立了金属β-内酰胺酶IMP-1的表达、纯化、鉴定方法,该法可用于其它的金属β-内酰胺酶的表达和纯化. 相似文献
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反相高效液相色谱法同时测定肝癌相关酪氨酸、缬氨酸对映体 总被引:1,自引:0,他引:1
目的:建立柱前衍生反向高效液相色谱荧光检测法同时对肝癌相关L-酪氨酸(L-tyrosine,L-Tyr)、D-酪氨酸(D-tyro-sine,D-Tyr)、L-缬氨酸(L-valine,L-Val)、D-缬氨酸(D-valine,D-Val)进行拆分测定。比较正常人与原发性肝细胞癌(hepato-cellular carcinoma,HCC)(以下简称原发性肝癌)患者血浆中酪氨酸与缬氨酸对映体含量的变化,考察它们与原发性肝癌的关系。方法:柱前衍生化试剂:邻苯二甲醛(O-phthaldialdehyde,OPA)和N-乙酰-L-半胱氨酸(N-acetyl-L-cysteine,NAC);色谱柱:菲罗门Gemini C18柱(250 mm×4.6 mm,5 μm);流动相:20.0 mmol/L 磷酸二氢钠(pH 6.8)-乙腈为流动相的梯度洗脱;荧光检测波长设定:激发波长(λex)为350 nm,发射波长(λem)为450 nm;流速1 ml/min;柱温30 ℃;进样量10 μl。结果:4种物质的回收率在90.74%~106.80%之间,线性关系良好,检出限分别为6.79 pg/ml(L-Tyr),7.81 pg/ml(D-Tyr),1.86 pg/ml(L-Val),1.95 pg/ml(D-Val)。利用该方法,对20名健康志愿者和23名HCC患者的血浆进行测定,统计分析结果表明,L-Tyr明显升高(P=0.011),L-Val(P=0.019)、D-Val(P=0.006)显著性降低,D-Tyr(P=0.973)无明显变化。结论:该方法准确、灵敏、重复性好,适用于实验室研究与临床检测。 相似文献
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目的 建立气相色谱质谱( GC - MS)检测人体血液中乙醇代谢产物乙基葡萄糖醛酸苷(EtG)的方法.方法 1ml乙二胺四乙酸二钠( EDTA - Na2)抗凝全血离心后取上层血浆,采用高氯酸去蛋白,并经氨基固相萃取小柱富集净化,提取物经BSTFA +TMCS(99∶1,v/v)衍生化,采用气相色谱-质谱法检测,总离子和选择离子模式(SIM)同时扫描,内标法定量分析.结果 样品在0.2~4.0 mg/L范围内线性关系良好(0.998 8),检出限为0.17 mg/L,绝对回收率位于75.3%~85.6%之间,相对标准偏差(RSD)为5.6% ~7.6%.结论 该方法灵敏度高,特异性好,分析结果准确可靠,适用于法医学鉴定和临床检验中EtG的分析测定. 相似文献
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本研究了Mg(Ⅱ)--铬黑T配合物的乙二胺-氢氧化钾体系中测定血清Mg(Ⅱ),发现在-0.70V(vs.SCE)处有一灵敏的配位吸附波产生,此波波高与Mg(Ⅱ)浓度呈良好线性关系。用此法测定了血清、尿中Mg(Ⅱ),且与原子吸收分光光度法对照,二结果较为接近。 相似文献
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【摘 要】目的:建立气相色谱-质谱(Gas chromatograph-mass spectrometry,GC/MS)法检测硫化氢中毒血液中硫化物的方法并用于实际检案分析。方法:血样本中加入苯扎氯铵与四硼酸钠混合溶液,在碱性条件下中毒血液中多种形态的硫化物转化成硫离子,用五氟溴卞(Pentafluorobenzyl bromide,PFBBr)衍生化,1,3,5-三溴苯(1,3,5-tribromobenzene,TBB)作为内标,通过液-液萃取法提取衍生物五氟苄基硫醚(Bis-pentaflu-orobenzyl-disulfide,BPFBD),采用GC/MS仪检测,选择离子检测扫描(Select-ed ion monitoring,SIM)模式,内标法定量分析。结果:在硫化钠浓度为0.05~10.0 μmol/ml范围的血样本中检测信号与硫化钠浓度有良好线性关系,相关系数为0.997 2,最低检出限为0.007 2 μmol/ml。结论:本文建立的方法灵敏度高,特异性好,简便省时,分析结果准确可靠,适用于法医鉴定和临床检验血液中硫化氢的快速分析。 相似文献
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