基于全基因组测序的耐碳青霉烯类抗生素鲍曼不动杆菌耐药基因、毒力因子及同源性分析

摘要：目的 通过应用全基因组测序(whole genome sequencing, WGS)技术分析某三级医疗机构耐碳青霉烯类抗生素鲍曼不 动杆菌(carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii, CRAB)的耐药基因、毒力因子及同源性。方法 收集该院2020年1月至3月 重症监护病房(Intensive care unit, ICU)、神经外科分离的11株医院感染CRAB菌株，通过二代测序平台进行全基因组测序, 应用 基因组流行病学中心(Center for genomic epidemiology, CGE)ResFinder 4. 0软件分析其耐药基因型，并应用MORPHEUS在线制作 热图，应用毒力因子数据库(virulence factors of pathogenic bacteria, VFDB)VFanalyzer软件筛选毒力因子，应用MLST软件检测菌 株的ST型，应用Kaptive软件检测荚膜型，应用CSI Phylogeny 1. 4软件及FigTree v1. 4. 4软件构建最大似然树(maximum likelihood tree, MLT)以分析其同源性。结果 11株CRAB对亚胺培南、美罗培南、头孢菌素、环丙沙星均呈现耐药，而对阿米卡星、左氧 氟沙星耐药的菌株株数较少。11株CRAB共检测出18种耐药基因，11株同时携带碳青霉烯酶耐药基因blaOXA-23和blaOXA-66，β-内酰 胺酶耐药基因以blaTEM-1D和blaADC-25为主，大部分菌株携带多种外排泵相关耐药基因及抗菌药物修饰酶耐药基因。11株CRAB均携 带多种毒力因子，包括外膜孔蛋白、脂多糖、生物膜、外排泵、磷脂酶和效应蛋白等，如OmpA、Lps、Csu、Pga、Ade、Plc、 Bas、Bau、Ent、Hem、Aba、Bfm、Pbp和Kat等。11株CRAB均为ST2-K22型，同源性分析结果显示C组内同源性关系相近，存 在院内传播的可能。结论 该院CRAB的耐药性、毒力特征复杂多样，同源性分析显示该院存在1种优势克隆株，该克隆株有医 院内传播的风险。     

论文中阿拉伯与汉字数字的使用规律

1阿拉伯数字使用规则:(1)凡是可以使用阿拉伯数字且很得体的地方,均应使用阿拉伯数字。(2)公历世纪、年代、年、月、日、时刻必须使用阿拉伯数字。年份不能简写。例如:2021年不能写成21年。日期的表示采用全数字式写法。例如:2020年2月18日写作2020-02-18或20200218或2020.02.18。日的时间表示:如下午3时9分38秒写作:15:09:38。(3)计量单位前的数字和统计表中的数值一律使用阿拉伯数字。(4)引文标注中的版次、卷号、期号、页码等使用阿拉伯数字。(5)多位数的阿拉伯数字不能拆开转行。(6)多位数和小数分节,从小数点起向左向右3位数空半个阿拉伯数字(1/4汉字)的空隙,不用千分撇","分节法。     

常规MRI特征在弥漫性星形细胞瘤IDH基因突变预测中的临床价值

目的：分析常规MRI特征在弥漫性星形细胞瘤异柠檬酸脱氢酶（isocitrate dehydrogenase，IDH）基因突变预测中的临床应用价值。方法：回顾性分析经手术病理证实的85例弥漫性星形细胞瘤患者（58例IDH突变型，27例IDH野生型）的临床及术前常规MRI图像资料。由2名中枢神经影像医师独立依据伦勃朗视觉感受图像（visually accessible Rembrandt images，VASARI）特征集的标准进行影像学特征的定量分析。运用Kappa检验评价2名医生对影像学特征评分结果的一致性。应用Mann?Whitney U检验、卡方检验或Fisher精确检验评价IDH突变型组与野生型组影像学特征的统计学差异。运用Logistic回归分析及受试者工作特征（receiver operating characteristic，ROC）曲线分析评价影像学特征对于预测弥漫性星形细胞瘤IDH突变的诊断效能。结果：2名中枢神经影像医师VASARI特征评分的一致性较好（Kappa值：0.737~0.960）。年龄、肿瘤定位、脑室受累、深部脑白质受累、跨中线、T2/FLAIR不匹配征对于弥漫性星形细胞瘤IDH基因突变的预测具有统计学意义（P < 0.05）。其中年龄、肿瘤定位、T2/FLAIR不匹配征为独立预测危险因素，ROC曲线下面积（area under curve，AUC）分别为0.779、0.705和0.840；联合三者对预测弥漫性星形细胞瘤IDH基因突变的诊断效能最高，AUC为0.927。结论：术前常规MRI特征有助于非侵入性地预测弥漫性星形细胞瘤IDH基因突变。     

基于红外热成像技术探讨扶正温阳法对阳虚体质的影响

目的 基于红外热成像技术探讨“扶正温阳法”对阳虚质的影响，探讨阳虚质者红外热图的共性规律，分析判断“扶正温阳法”干预阳虚质人群的疗效。方法 纳入30例阳虚质患者给予益气温阳药物在大椎、肾俞（双侧）、命门等进行穴位贴敷，分别在干预前后运用红外热成像技术测定督脉、腰部、腹部、双手及双足局部温度的变化。结果 干预后阳虚体质患者的督脉、腰部、腹部、双手、双足温度均升高（P<0.05），阳虚体质局部温度得以改善。结论 本研究发现“扶正温阳法”可诱发循经热传导现象，通过调节热能代谢而起到调治阳虚体质的作用，红外热成像技术可用来辅助评价阳虚质的治疗效果，对临床指导制定阳虚质人群的干预方案疗效判定具有指导意义。     

基于超声影像组学的乳腺癌预测模型的诊断性能研究

目的评估并比较基于不同机器学习算法建立的乳腺癌超声影像组学预测模型的诊断性能。 方法回顾性收集2017年1月至2019年4月就诊皖南医学院第一附属医院、有明确病理结果的乳腺肿块病例828例，以2018年8月31日为节点将其分为训练集（526例）和验证集（302例），提取肿块的超声影像组学特征并进行特征筛选，运用k最近邻（kNN）、逻辑回归（LR）、朴素贝叶斯（NB）、随机森林（RF）和支持向量机（SVM）5种机器学习算法分别建立预测模型，使用重复交叉验证方法做内部验证，计算比较各模型的敏感度、特异度、阳性预测值（PPV）和阴性预测值（NPV），并实施外部验证，绘制ROC曲线并比较ROC曲线下面积（AUC）以评价模型的鉴别诊断性能，绘制校准曲线评价模型校准度。 结果从提取的109个影像组学特征中筛选出19个特征建立了5种机器学习算法模型。在内部验证中，5种模型的敏感度、特异度、PPV、NPV比较，总体差异均有统计学意义（P均＜0.001）。LR模型的特异度、PPV、NPV中位数分别为0.769、0.816、0.778，3项指标均高于其他4种模型；敏感度中位数为0.824，高于kNN、RF和SVM模型。此外，SVM模型的特异度、PPV、NPV中位数分别为0.706、0.774、0.759，虽均低于LR模型，但均高于其他3种模型。在外部验证中，LR、SVM、RF、kNN和NB的AUC依次为0.890、0.832、0.821、0.746和0.703，其中LR与SVM的AUC差异有统计学意义（P=0.012）；此外，各模型在校准性能上表现并不一致，LR和SVM模型的校准曲线显示乳腺癌实际概率与预测概率之间的一致性较好。 结论以超声影像组学特征为基础，运用不同机器学习算法建立的乳腺癌超声预测模型，均表现出较高的诊断性能，其中LR模型表现最为突出；选择合适的机器学习算法有助于进一步提高预测模型的诊断性能，提供更加准确的量化预测结果。