INTS10遗传变异及基因-环境交互作用对HBV相关肝癌病理特征的影响

目的 探讨INTS10遗传变异及基因-环境交互作用对HBV相关肝癌病理特征的影响。方法 募集705例新发HBV相关肝癌病例，对INTS10的4个遗传变异（rs4268139、rs4599828、rs7822495和rs7000921）进行检测。采用多因素logistic回归模型分析遗传变异与肿瘤淋巴结转移（tumor node metastasis, TNM）分期、远处转移的关联；应用相乘交互项和“Delta”法探讨基因-环境交互作用。结果 显性模型下，以rs4268139 CC基因型为参照，CG+GG基因型可增加病例首诊时已为晚期的风险（OR=1.64，95%CI=1.08~2.50）。rs4599828 TT基因型的病例首诊时出现远处转移的危险高于CC+CT基因型携带者（OR=2.04，95%CI=1.08~3.85）。叉生分析中，与有运动的rs4268139 CC基因型携带者相比，携带CG+GG基因型且缺乏运动的病例晚期和远处转移风险增高（OR=3.01，95%CI=1.62~5.58；OR=2.19，95%CI=1.12~4.26）。类似，rs4599828 CT+TT基因型且无运动共同增加病例晚期风险（OR=2.22，95%CI=1.34~3.68）。但未观察到有统计学意义的交互作用。结论 INST10 rs4268139 和rs4599828遗传变异可能单独以及联合缺乏运动影响HBV相关肝癌的病理特征。     

遗传性胰腺炎发病机制及治疗研究进展

遗传性胰腺炎是急性或慢性胰腺炎的一种罕见类型,临床表现与其他原因所致胰腺炎类似。1996年Whitcomb首次报道PRSS1基因突变为遗传性胰腺炎的病因。随后SPINK1基因、CFTR基因、CTRC基因被报道与遗传性胰腺炎相关,但它们是否为遗传性胰腺炎的致病基因仍存在争议。PRSS1编码阳离子胰蛋白酶原,该基因的突变可能导致胰蛋白原激活增加或失活减少,引起临床胰腺炎。目前已经报道了超过20种PRSS1的致病性突变,其中最常见的突变位点为R122H、N29I、和A16V。遗传性胰腺炎发病年龄较早,通常在20岁前起病,平均发病年龄为10岁,进展为慢性胰腺炎的平均年龄为20岁,50岁以后胰腺癌发病风险明显增加。遗传性胰腺炎患者的监管包括:避免环境触发,胰腺内分泌和外分泌功能不全的治疗,疼痛的管理,内镜或手术治疗以及胰腺癌的监测。笔者重点就PRSS1相关性遗传性胰腺炎的发病机制、治疗研究进展及疾病管理等方面进行综述。     

EDA基因新发变异致少汗性外胚层发育不良一例报道并文献复习

外胚层发育不良是一组罕见的先天性疾病，主要累及外胚层来源的器官，如指甲、牙齿、头发和汗腺等，造成其结构及功能异常。EDA基因是少汗性外胚层发育不良（HED）的致病基因。HED患儿易发生高热，高热严重者可造成死亡。本文总结了1例EDA基因c.852T>A新发变异所致HED患儿的临床及基因突变情况，丰富了该病的基因突变谱，以增强临床对该罕见病的认识。     

2013-2017年广州市住院儿童呼吸道合胞病毒流行特征及分子生物学分析

目的分析广州人呼吸道合胞病毒(HRSV)的流行特征及遗传变异特征。方法2013—2017年在广州两家哨点医院(广东省妇幼保健院和中山大学孙逸仙纪念医院)采集0~6岁急性呼吸道感染住院儿童的鼻咽拭子作为标本。采用逆转录PCR和巢式PCR方法进行HRSV的检测和分型,通过MEGA 6.0、NetNGlyc 1.0等软件对HRSV序列进行基因亲缘性分析以及N?糖基化位点的预测。结果共收集鼻咽试子标本1225份,其中男性783份,女性442份;月龄M(P25,P75)为8(3,24)月。共检出HRSV儿童感染者209例(17.06%),其中HRSV?A为117例(55.98%),HRSV?B为92例(44.02%)。2岁以下儿童HRSV检出率为18.83%(196例),占总阳性标本的93.78%。209例检出HRSV儿童中,32例(15.31%)还感染了至少1种其他呼吸道病毒。进化树分析显示,62株HRSV?A属于ON1基因型,2株属于NA1基因型,53株HRSV?B全部属于BA基因型。G蛋白的第二高变区在氨基酸替换,终止密码子的使用以及糖基化位点方面均具有多态性。结论广州2岁以下儿童是感染HRSV的高发人群,ON1为HRSV?A主导基因型,BA为HRSV?B的主导基因型。多样化的氨基酸替换,某些糖基化位点的缺失与插入,体现了G蛋白作为主要保护性抗原的多样性。     

甘肃省酒泉市狐狸源和犬源狮弓蛔虫线粒体pnad1和pnad5基因序列遗传变异研究

目的　探究甘肃省酒泉市不同宿主源狮弓蛔虫基因遗传变异。方法　应用PCR技术对甘肃省酒泉地区采集的11株分离自家犬、狐狸和宠物犬的狮弓蛔虫分离株线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶第1亚基部分序列基因（partial nicotinamide adenine dinucleotide dehydrogenase subunit 1, pnad1）和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶第5亚基部分序列基因（partial nicotinamide adenine dinucleotide dehydrogenase subunit 5, pnad5）进行基因扩增，并对PCR扩增产物进行测序，分析其遗传变异。结果　获得的犬源和狐狸源狮弓蛔虫分离株pnad1和pnad5基因序列大小分别为530 bp和550 bp，不同分离株间核苷酸序列同源性分别为99.4% ~ 100.0%和99.5% ~ 99.8%，与已知狮弓蛔虫分离株对应序列同源性分别为99.2% ~ 99.9%和99.1% ~ 99.9%；分别检测到19个和24个遗传变异位点，单倍型分别为10和9个，单倍型多样性分别为0.982和0.964，核苷酸多样性分别为0.039 4和0.034 2。基于两种基因序列构建的遗传进化树结果基本一致：11株不同宿主分离株与已知狮弓蛔虫分离株位于同一分支，且为随机分布；与犬弓首蛔虫所属分支相隔较近，与其他蛔虫所属分支相距较远。结论　甘肃省酒泉市不同宿主来源狮弓蛔虫分离株pnad1和pnad5基因遗传变异较小，pnad1基因较pnad5基因更适合作为分子标记用于分析狮弓蛔虫遗传变异。     

三地钉螺线粒体DNA两个分子的遗传变异研究

目的 分析广西、云南、湖南三地钉螺线粒体DNA细胞色素C氧化酶Ⅰ(CO1)基因和细胞色素氧化酶b(Cytb)基因的遗传变异。 方法 收集广西靖西、云南洱源和湖南岳阳三地钉螺，提取其基因组DNA，PCR法扩增线粒体CO1和Cytb基因并测序。用Clustal W(1.82)软件对所测基因序列排序，用MEGA(3.1)计算其碱基组成、转换及颠换；用Kimura双参数法计算遗传距离，用非加权组平均法(UPGMA)和最大简约法(MP)构建系统发生树。 结果 PCR扩增获得CO1和Cytb基因大小分别约为700及600 bp(含两侧引物)。三地钉螺CO1基因中共检测到106个多态性位点，约占核苷酸总数的15.9%，Cytb基因中多态性位点为165个，约占核苷酸总数的28.5%。广西靖西与湖南岳阳、广西靖西与云南洱源的钉螺CO1基因和Cytb基因的遗传距离分别为0.051、0.158和0.031、0.405。根据CO1和Cytb的基因序列，用上述两种方法构建的系统发生树结果均一致。广西靖西与湖南岳阳的钉螺同属一个支系，云南洱源钉螺单独形成另一支系。 结论 广西、湖南和云南的钉螺CO1和Cytb基因总体上具有相对丰富的多态性。     

分子遗传学方法在寄生虫鉴定和分类上的价值

目前有许多方法可供寄生虫学家鉴定寄生虫虫种并进行分类。本文主要阐述分子遗传学技术用于对寄生虫的鉴定和种系发生的研究。以检测ＤＮＡ为基础的各种方法随技术进步不断完善，具有很高的特异性和灵敏度，尤其是ＰＣＲ相关方法所需寄生虫材料极少，对未来的寄生虫研究肯有很高价值。     

应用ISSR-PCR技术对我国11株并殖吸虫遗传变异的研究

目的对我国3省9地11株并殖吸虫进行遗传变异研究,为并殖吸虫的基因分类提供依据方法采用简单重复序列间PCR(ISSR-PCR)技术对11株并殖吸虫基因组DNA进行扩增,根据扩增产物电泳结果计算遗传距离并绘制系统进化树。结果江西武宁、浙江兰亭、湖北温泉和湖北赤壁等4株与其余7株并殖吸虫扩增产物之间存在较明显的差异;湖北温泉和湖北赤壁株遗传距离为0.181 8;湖北五峰(a)、湖北五峰(b)和湖北走马(b)株之间扩增产物遗传距离在0.125~0.18之间;湖北走马(a)和湖北五里株间遗传距离为0.153 9;湖北红坪和湖北十堰株遗传距离为0.156 6。结论11株并殖吸虫在基因水平分为两大类:1)武宁株、兰亭株、赤壁株和温泉株,属卫氏并殖吸虫;2)红坪株、走马(a)株、走马(b)株、五峰(a)株、五峰(b)株、五里株和十堰株,属斯氏狸殖吸虫。湖北省存在卫氏并殖吸虫流行区和斯氏狸殖吸虫流行区。采用并殖吸虫不同虫期(成虫和囊蚴)标本及其不同保存方法对ISSR-PCR结果无影响。     

子一代实验室钉螺细胞色素c氧化酶I、细胞色素b基因序列分析

目的　了解钉螺子一代(F1)实验室钉螺群(湖北钉螺湖北亚种)内的遗传变异。　方法　实验室饲养的F1钉螺,单个抽提基因组DNA,PCR扩增细胞色素c氧化酶I(COI)、细胞色素b(Cytb)基因并测序,用GENETYX MACver.9软件进行同源排序、DNA和氨基酸序列分析,同时与GenBank相同基因序列比较。　结果　实验室螺群内,COI基因差异为12.2%,94个氨基酸发生变化。Cytb基因差异6.4%,有25个氨基酸发生变化。湖北亚种与滇川亚种COI基因序列差异率为 13 .5 %。与GenBank中湖北钉螺滇川亚种Cytb基因序列比较 ,差异为 13 .6% ,在 2 0 3个氨基酸中 6个氨基酸发生变化。　结论　F1实验室钉螺群内核苷酸与氨基酸序列均发生变异。