Genetic variation of the 8-kDa glycoprotein family from Echinococcus granulosus, Taenia multiceps and Taenia hydatigena

Background  Echinococcosis, coenurosis and cysticercosis are debilitating diseases which prevail in China. Immunological diagnosis of metacestodosis is important in disease control. The 8-kDa glycoproteins from taeniid cestodes have successfully been used for diagnosis of human cysticercosis in immunological assays. The aim of the present study was to investigate genetic variations and phylogenetic relationships of the 8-kDa proteins for evaluating the possibility of utilizing these proteins as diagnostic antigens for other metacestode infections.

Methods  The genes and complementary DNAs (cDNAs) encoding the 8-kDa proteins from Echinococcus (E.) granulosus, Taenia (T.) multiceps and T. hydatigena were amplified using PCR method. Their amplicons were cloned into the vector pMD18 and the positive clones were sequenced. Sequence data were analyzed with the SeqMan program, and sequence homology searches were performed using the BLAST program. Alignments were conducted using the ClustalX program, and the phylogenetic analyses were performed with the Protein Sequences Program and the Puzzle Program using the Neighbor-joining method.

Results  Fifteen, 18 and 22 different genomic DNA sequences were identified as members of the 8-kDa protein gene family from E. granulosus, T. multiceps and T. hydatigena, respectively. Eight, four and six different cDNA clones respectively from E. granulosus, T. multiceps and T. hydatigena were characterized. Analysis of these sequences revealed 54 unique 8-kDa protein sequences. Phylogenetic trees demonstrated that the taeniid 8-kDa proteins are clustered into eight clades at least: Ts18, Ts14, TsRS1, TsRS2, T8kDa-1, T8kDa-2, T8kDa-3 and T8kDa-4.

Conclusion  We found that the gene family encoding for the taeniid 8-kDa antigens is comprised of many members with high diversity, which will provide molecular evidence for cross-reaction or specific reaction among metacestode infections and may contribute to the development of promising immunological methods for diagnosis of metacestodosis.

     

4个长爪沙鼠选育群体基因多态性的RAPD分析

目的分析我国人工饲养的长爪沙鼠群体的遗传多态性。方法用50个随机引物对4个长爪沙鼠群体的混合DNA池扩增筛选RAPD位点，筛选的引物经重新优化反应条件体系后，对4个群体的136个样本DNA进行扩增。结果50个引物中有20个引物产生多态性。4个长爪沙鼠的基因多样性指数分别为0．247，0．220，0．196，0．188；香隆指数为0．366，0．327，0．292，0．277，其均值为0．316。群体内平均遗传多样性指数为0．1688，总群体遗传多样性指数为0．213。结论人工饲养的长爪沙鼠群体遗传多样偏低。     

日本血吸虫中间宿主湖北钉螺遗传变异的空间相关分析

目的探讨湖北钉螺的空间遗传结构。方法采用扩增片段长度多态性（AFLP）分子标记技术对10省或自治区（云南、四川、广西、福建、湖南、湖北、江西、安徽、江苏和浙江）25个钉螺种群基因组DNA进行扩增，分析钉螺种群问的遗传距离与地理距离的相关性。结果25个钉螺种群间的遗传距离D和Nei无偏遗传距离，都与其地理距离存在明显的正相关性（P〈0．001），相关系数分别为0．5234和0．5622；湖北钉螺指名亚种种群问的遗传距离与地理距离也存在正相关（P〈0．001），遗传距离D的相关系数为0．5276，Nei无偏遗传距离的为0．5770；无论是肋壳钉螺还是光壳钉螺，钉螺种群间的遗传距离都与地理距离存在正相关（P〈0．001），肋壳钉螺种群间的遗传距离D和Nei无偏遗传距离与地理距离的相关系数分别为0．3612和0．3916，光壳钉螺的相关系数分别为0．7535和0．7500。结论在我国大陆广泛分布的湖北钉螺种群间具有明显的空间遗传结构。     

论单核苷酸多态性与中医证的个体差异

单核苷酸(nucleotide)是基因的基本组成单位，单核苷酸多态性(Single Nacl eotide Poly morPhism,SNP)是指任何两个不同个体之间的单核苷酸序列中均有不同的排列次序，导致遗传变异而形成不同个体的差异性和多样性。它是决定人的个体差异的主要因素，是遗传的变异性所引起。个体差异是个体机体功能相对偏差以保持动态稳定的特征，是潜在的病理因素，其发病具有质化特点。证以质为基础，质以证的形式表现出来，证的特征包含着质的特征，证往往随质而转移，证的个体差异与单核苷酸多态性有关，这是中西医结合研究的最佳切入点。建立证与药的单核苷酸组学，可阐明中医药防治疾病原理，实现个体化医学治疗的理想，体现中医治病求本和防治未病的思想。     

环氧化酶2启动子区遗传变异及其与胃癌发病风险的关系

目的筛查环氧化酶2(COX-2)启动子区遗传变异并探讨其与胃癌发病风险的关系。方法以单链构象多态及测序的方法筛查COX-2启动子区遗传变异,以PCR-限制性片断长度多态性方法对筛查到的变异在323例胃癌患者和646名健康对照中进行基因分型。以logistic回归计算比值比(OR)及其95%可信区限(CI)。单体型由Haplo·stat软件构建。结果筛查到COX-2启动子区3个单核苷酸变异,即-1290A>G、-1195G>A和-765G>C。-1290AG、-1195AA和-765CG基因型与胃癌风险增高相关,OR分别为1·64(95%CI1·03~2·61)、2·68(95%CI1·65~4·33)和2·66(95%CI1·53~4·64)。单体型分析结果显示,与A-1290-G-1195-G-765单体型比较,A-1290-A-1195-C-765单体型发生胃癌的风险较高,OR为11·80(95%CI2·43~57·25)。结论COX-2启动子区遗传变异与胃癌易感性相关。     

与精神分裂症有关的遗传变异

2008年9月11日出版的Nature刊载一篇“与精神分裂症有关的遗传变异”的论文。因精神分裂症和其他精神疾病的遗传原因复杂，目前人们对其了解尚少。由于复制速率降低，对风险等位基因造成负选择压力，因此使该类疾病的研究难度进一步增大。虽然一些染色体上发现的基因组版本号变化与精神分裂症相联系，但研究相对较少。目前，由两个国际合作课题组对数千例的患者（试验组）和对照组所做的2项独立的大规模基因组范围研究工作，证实一个以前识别出来的位点，而且揭示了新的关联性。     

珍稀中草药金线莲的RAPD研究

为了鉴别金线莲的品种,探索同属植物之间的亲缘关系及同种植物不同产地的遗传变异,并制定正品金线莲的DNA指纹图谱,采用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对兰科开唇兰属植物花叶开唇兰Anoectochilus roxburghii(Wall．)．Lindl．、台湾开唇兰A.formosanus Hay．进行了鉴定,结果选择的7个引物对3个品种共扩增出98个位点,其中3个引物为高特异性引物。结论 RAPD技术不仅能鉴别种间差异,而且能揭示同种不同产地植物的遗传变异。     

珍稀中草药金线莲的RAPD研究

为了鉴别金线莲的品种,探索同属植物之间的亲缘关系及同种植物不同产地的遗传变异,并制定正品金线莲的DNA指纹图谱,采用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对兰科开唇兰属植物花叶开唇兰Anoectochilus roxburghii(Wall．)．Lindl．、台湾开唇兰A.formosanus Hay．进行了鉴定,结果选择的7个引物对3个品种共扩增出98个位点,其中3个引物为高特异性引物。结论 RAPD技术不仅能鉴别种间差异,而且能揭示同种不同产地植物的遗传变异。     

乳本脱氢酶遗传变异的筛选方法

目的：建立人乳酸脱氢酶亚单位遗传变异的筛选方法。方法：在Ｐａｒａｇｏｎ电泳仪上用涤纶膜作载体测定血清、红细胞中的乳酸脱氢酶同工酶,并计算亚单位比值Ｈ／Ｍ。结果：血清Ｈ／Ｍ比值受各种疾病影响,而红细胞Ｈ／Ｍ比值主要与遗传有关。结论：红细胞Ｈ／Ｍ比值可作为乳酸脱氢酶遗传变异的初步筛选标准。     

卫星搭载药用植物曼陀罗遗传变异的随机扩增多态性DNA分析

以曼陀罗种子为材料探讨太空环境对药用植物的影响。方法利用返回式卫星搭曼陀罗的种子,返回地面后播于实验田中,应用随机扩增多态性ＤＮＡ（ＲＮＡ（ＲＡＰＤ）分子标记技术分析不同组曼陀罗基因组的变异情况。结果从６５个供试引物中筛选出１５个能够产生可重复多态性增产物的引物。与地面对照组相比,失重组共产生３９条多态性片段,基因组的多态性频率为２３．１％,击中组共产生４５条多态性片段,基因组的多态性频率为２４．