蛋白质组研究技术及其在筛选肿瘤标志物中的应用

肿瘤标志物是细胞在特定疾病状态下的分子信号．是检测、诊断、治疗、监测肿瘤和判断肿瘤预后的重要工具。如何发现新的、具有高度特异度和灵敏度的肿瘤标志物多年来一直是肿瘤研究的热点之，蛋白质和蛋白质组学研究的快速发展给肿瘤标志物研究注入了新的活力。蛋白质组一词由Wilkins于1994年首次提出，意指一种基因组或一种细胞所表达的全套蛋白质，近年迅速发展为一门新兴学科——蛋白质组学(pmteomics)，其含义主要包括3个方     

乙型肝炎病毒全长基因组的扩增

目的:探讨扩增乙肝病毒全长基因组合适的PCR反应条件。方法:设计针对负链5′末端引物,PCR一步法扩增乙肝病毒全长基因。改变PCR反应条件,决定最佳退火温度和最佳引物浓度,并观察不同乙肝病毒DNA模板量对PCR扩增效率的影响。结果:最佳退火温度为68℃,最佳引物浓度为0.5μmol/L,模板量在150拷贝以上能扩增出乙肝病毒全长基因,但模板量达到105拷贝抑制扩增效率。结论:退火温度为68℃、引物浓度为0.5μmol/L、乙肝病毒DNA模板量在150～105拷贝为乙肝病毒全长基因扩增的合适PCR反应条件。     

结核杆菌的后基因组研究进展

结核病仍然是影响全球人类健康的主要威胁 ,1998年结核杆菌全基因组序列公布以来 ,结核病研究领域十分活跃。进展最快的是比较基因组学和功能基因组学 ,特别是转录组和蛋白质组的研究 ,以及细胞壁合成机制 ,因为它与抗结核药物作用机制有关。总之 ,结核杆菌全基因组序列为抗结核新药开发、耐多药结核病的诊断试剂和抗结核疫苗的研制提供一个重要的信息平台。     

EB病毒引起的表观遗传学改变在鼻咽癌中的作用

鼻咽癌是东南亚地区常见的头颈部恶性肿瘤之一,EB病毒导致的表观遗传学改变与其发生、发展有着密切关系。我们通过查阅相关文献,从DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重构和非编码RNA 4个方面,综述EB病毒引起的表观遗传学改变在鼻咽癌中的作用,为临床易感人群筛查、早期诊断、治疗及预后判断提供新的思路。     

植入前胚胎非整倍体筛查的临床应用研究进展

研究证明基于囊胚期活检和全基因组分析技术的"第二代植入前遗传学筛查(PGS)"可以显著提高IVF治疗的临床结局。目前认为囊胚期活检是PGS活检的最佳时间,也是第二代PGS采用的活检方法。具体为通过单细胞全基因组扩增技术使样本达到可检测的量,再利用微阵列技术、高通量测序技术完成全基因组检测。除了技术方面的改进,第二代PGS还应在适用人群的选择方面综合考虑不孕者胚胎非整倍体的发生率和可用于移植的囊胚数2个方面,PGS的最适宜人群应该是排除了内膜因素的影响后其染色体异常发生率较高、同时可移植胚胎数较多者。     

胃腺癌的详细分子特征鉴定

<正>胃癌是癌症死亡的主要原因之一,但其分子和临床特征的分析由于组织学和病原学的异质性而变得错综复杂。作为癌症基因组图集(The Cancer Genome Atlas,TCGA)计划的一部分,科学家们对295位原发性胃腺癌患者进行了详细的分子鉴定。他们提出一种分子分类方法,将胃癌分为四种亚型:(1)EB病毒阳性型肿瘤,其分子特征表现为周期性的PIK3CA基因     

砷与氟单独及联合染毒对SGC-7901细胞基因组DNA损伤作用的SCGE法观察

目的观察砷、氟及砷氟联合染毒对SGC-7901细胞基因组DNA的损伤作用及特点。方法砷、氟染毒剂量10μmol／L，染毒后4h应用单细胞凝胶电泳技术结合彗星图像分析系统检测DNA损伤。结果①NaAsO2组尾长和尾动量明显大于对照组，NaF组拖尾率显著高于对照组；②氟砷联合染毒组拖尾率、尾DNA含量、尾长和尾动量与对照组差异均有显著意义，但氟与砷引起的DNA损伤作用之间没有观察到交互作用。结论NaAsO2与NaF均可引起DNA损伤，但它们的损伤机理可能是不同的；氟与砷联合染毒仅表现为简单相加作用。     

利什曼原虫基因组研究计划的进展

对于感染人类寄生虫的基因组研究计划主要针对七种主要人体寄生虫病:疟疾、利什曼病、非洲锥虫病、美洲锥虫病、弓形虫病、血吸虫病和丝虫病。本文介绍了利什曼原虫基因组研究计划的最新进展,包括简要论述脉冲电泳核型图谱的绘制及基因序列分析工作。该计划的顺利开展将有助于更好地了解利什曼原虫的生物学特征。     

药用亲缘学论纲——知识谱系,认识论和范式转换

中药资源是我国中医药事业发展的基础,采用创新的理论和方法寻找和发现中药新资源是中药资源可持续利用研究的热点和重点。药用亲缘学研究药用生物(特别是药用植物)的生物亲缘关系,化学成分和疗效(传统疗效和药理活性)间的相关性,该学科的建立对于开发中药植物资源具有重要指导意义;系统发育基因组学方法可用于药物发现和开发的相关问题研究,在组学水平拓展了药用亲缘学的领域,由此衍生出药用基因组亲缘学的新概念。该文简述药用亲缘学的知识谱系,研究方法和范式转换,凸显药用基因组亲缘学的理论和实践价值,建议选择《中国药典》2010年版收录最多的毛茛科为例,对药用基因组亲缘学进行深入的实证研究。在基因组,转录组和代谢组水平探讨毛茛科及其重要族属系统发育和进化关系,揭示药用植物基因型和代谢表型,以及近缘种遗传多样性和化学多样性的内在关联。通过毛茛科示范研究,丰富药用亲缘学研究的内涵,扩展其外延,将药用基因组亲缘学视为药用亲缘学的升级版,开放地吸收有关领域的新知识和新技术,促进中药资源学科的成长,推动中药植物资源的开发和可持续利用。     

肺炎链球菌不同菌株自溶酶基因的克隆、序列分析及重组表达

目的克隆肺炎链球菌自溶酶(LytA)的基因序列，并进行重组表达。方法分别提取不同临床分离株的基因组DNA，根据已知肺炎链球菌野生R6株LytA基因序列设计引物，进行PCR扩增，将获得的目的基因片段克隆人原核表达质粒，然后测序；利用生物信息学方法，对不同临床分离株LytA基因序列进行比较分析，同时进行LytA基因的重组表达。结果从不同临床分离株的基因组中均扩增出完整的LytA基因片段，成功构建了重组质粒pGEX-4T-1-LytA。比较不同临床分离株LytA基因的DNA序列及推测的氨基酸序列，发现各株LytA基因序列及氨基酸序列间存在差异。通过异丙基巯基半乳糖(IPTG)诱导，LytA基因在大肠埃希菌JM109中得到高效表达，十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)结果显示pGEX-4T-1-LytA融合蛋白相对分子质量约62000，与理论预测一致。结论序列分析发现各分离株的LytA基因序列及氨基酸序列间存在差异，但同源性极高，推测LytA基因序列保守，可用于疫苗研发。