基于多组学数据构建肺腺癌预后相关风险预测模型

目的：通过整合肺腺癌（lung adenocarcinoma,LUAD）临床信息组、基因组和转录组的多组学信息,构建预后相关风险预测模型,为肺腺癌患者的预后风险预测提供依据。方法：通过肿瘤基因图谱（the cancer genome atlas,TCGA）网站下载522例肺腺癌患者数据,完成肺腺癌患者多组学数据库构建。对经过质量控制的数据库,采用Cox比例风险模型评价多组学数据对LUAD预后的影响,构建基于临床信息、基因分型和基因表达多组学信息的预后风险预测模型,并使用受试者工作特征（receiver operating characteristic,ROC）曲线和曲线下面积（area under curve,AUC）评估预后模型风险识别的能力。结果：共386例肺腺癌患者纳入多组学数据库,分别筛选出1个临床信息组、5个基因组单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms,SNP）和4个转录组mRNA预后相关特征因素与肺腺癌的预后相关。与肺腺癌低风险组相比,高风险组患者较低风险组的预后更差（HR=3.67,95%CI=2.46~5.49,P=1.96×10-10）,联合基因组、转录组与临床信息构建多组学预后指数后,其ROC曲线下面积为0.694（95%CI=0.633~0.754）。结论：采用联合临床信息组、基因组和转录组特征的多组学信息构建的预后风险预测指数可有效区分肺腺癌患者预后好坏,其研究结果将为肺腺癌患者的精准治疗提供有效支撑。     

人工智能一体化三维重建应用于胸外科的中国专家共识

为进一步规范三维重建在胸外科中的应用，《人工智能一体化三维重建应用于胸外科的中国专家共识》专家组讨论制定了本共识。本共识依据目前三维重建技术在胸外科各种场景中使用的临床经验和已有的前瞻性或回顾性研究，总结形成推荐意见，并附录目前存在争议、尚未进行充分的临床研究或仍在探索阶段的三维重建技术应用场景，为未来的临床研究和临床疾病诊治提供方向和证据，以期达成共识。     

泛素及其类似物的蛋白质组学研究进展

作为蛋白质的翻译后修饰,泛素及其类似物(ubiquitin-like modifiers,Ubls)对底物的修饰被认为是真核细胞内一种重要的调节机制。根据以往的研究表明,泛素/ubls与各种各样的底物蛋白形成共价结合以后,通过介导蛋白质降解、改变蛋白质的细胞定位、改变蛋白质的酶活性、改变蛋白质之间的相互作用等影响这些底物的功能与活性。可以想象,通过影响成百上千的不同底物蛋白,泛素和Ubls在各个细胞生理活动中都发挥着重要的调节作用。运用蛋白质组学的方法对泛素/Ubls进行研究,可以发现更多新的泛素和ubls的底物,帮助人们从整体水平上了解泛素/Ubls这个复杂的修饰系统。而利用质谱技术精确的鉴定泛素/Ubls在底物上的修饰位点则为进一步研究修饰发生的分子机制,以及对底物蛋白功能的影响提供了明确的线索和方向。到目前为止,已有越来越多的科学家们对泛素/Ubls修饰的蛋白质组学感兴趣并致力于这方面的研究,取得了很大进展。本文对泛素及Ubls的蛋白质组学研究进展进行了归纳和总结。     

人SUMO1蛋白表达纯化及单克隆抗体的制备、鉴定

目的 表达重组人SUMO1(small ubiquitin-related modifier 1)蛋白并制备单克隆抗体.方法 构建含人SUMO1基因的重组表达质粒pET32a-HIS-SUMO1,在大肠杆菌中表达重组蛋白HIS-SUMO1;以纯化后的HIS-SUMO1蛋白为抗原免疫BALB/c小鼠,利用杂交瘤技术,通过ELISA和Western blot方法筛选稳定分泌抗体的杂交瘤细胞株,用免疫双向扩散法鉴定抗体Ig的类型及亚类;取一株筛选细胞按照常规方法制备腹水,利用Millipore抗体纯化试剂盒进行抗体纯化,Western blot方法检测抗体效价.结果 表达纯化了重组人HIS-SUMO1蛋白;3株稳定分泌特异性抗人SUMO1的单克隆抗体杂交瘤细胞株被筛选出,其免疫球蛋白类型均为IgG1类;通过腹水制备和纯化获得效价较高的鼠抗人SUMO1单克隆抗体.结论 通过表达纯化人SUMO1重组蛋白,制备出高效价鼠抗人SUMO1的单克隆抗体,该抗体可用于蛋白质SUMO化的研究.     

精准医学时代的肺癌外科治疗走向

精准医学是根据每个人从宏观到微观层面的个体差异,制定最为合适的个性化治疗方案。基因组、蛋白组、代谢组等海量生物学数据及大数据分析方法是精准医学模式的精髓。精准医学为人类攻克肿瘤带来了希望。肺癌是对人类危害最大的肿瘤。本文就肺癌的外科治疗在精准医学时代发展的方向进行了综述。     

全国食管癌规范化诊治推广之路

我国食管癌的临床诊治一直以来以参照西方国家的经验或依据自己的经验来实施,没有形成一套适合我国国情的规范化诊治标准.由于缺乏相互交流学习的机会,我国整体规范化诊治水平低、先进技术应用少和各地诊治方案各不相同,食管癌的治疗效果一直不理想,术后总体5年生存率长期徘徊在30％～40％.本文总结了自本世纪初逐步开展的系列食管癌巡讲学术推广活动及食管癌规范化诊治指南的编写与解读历程,并对其在食管癌诊治领域所产生的影响进行评述.     

解剖性部分肺叶切除术及围术期加速康复外科的临床综合应用

目的: 总结分析解剖性部分肺叶切除术(APL)以及围术期加速康复外科(ERAS)的统筹应用经验,以期为肺癌外科微创治疗的综合管理提供临床参考与理论支持。方法: 回顾性分析中国医学科学院肿瘤医院胸外科肺癌数据库2013年11月1日至2021年10月31日接受APL手术的6 449例患者的临床病理学资料以及围手术期数据,包括性别、年龄、吸烟史、手术方式、病理、术后住院日等指标。以2014—2018年作为经验积累阶段,2019—2021年作为技术成熟阶段。比较两阶段在手术量、良性结节占比、术后平均住院日、术后住院日超7 d的差异。结果: 纳入患者6 449例,其中男2 094例,女4 355例。分期完成两侧肺部手术88台,同期完成双侧手术8台,共完成APL手术6 493台。技术成熟阶段较经验积累阶段的年度月均手术量增加、良性结节占比减少、术后平均住院日缩短、术后住院日超7 d占比减少(P＜0.05)。通过结合ERAS理念优化本中心APL围术期管理细节,成功使得患者术后平均住院日从6.98 d显著降至3.96 d。术后住院日超7 d患者占比由23.80%降至2.87%,多因素Logistic回归分析结果显示性别、年龄、手术术式、手术阶段是APL术后住院日超7 d的独立危险因素。结论: ERAS能够优化APL围术期管理流程,加速患者术后康复。而APL手术可以在保证肿瘤学原则的前提下,为患者保留更多的健康肺组织,实现手术切除范围、手术创伤的最小化,为ERAS理念能够更好地在肺癌根治手术中应用推广提供了必要的临床实践基础。     

人乳头状瘤病毒感染与肺癌预后相关性的Meta分析

目的 采用Meta分析方法探索人乳头瘤状病毒(Human papillomavirus, HPV)感染与肺癌预后的相关性。方法 利用主题词与自由词结合的方式, 检索PubMed、Embase和Cochrane文献数据库。截至2018年10月, 共检索获得123篇相关文献。根据纳入和排除标准筛选文献后, 摘录研究基本信息、HPV检测方法、肺癌患者、风险比(Hazard ratio, HR)值和95%可信区间(Confidence interval, CI)等指标。利用随机效应模型的Meta分析, 评价HPV感染与肺癌患者预后相关性。利用Q检验和I²统计量评价异质性, 利用Egger's和Begg's法检验发表偏倚。结果 本研究最终纳入文献11篇(亚洲地区9篇, 欧洲地区和美国2篇), 纳入肺癌患者1501例。使用随机效应模型的Meta分析结果显示, HPV感染与肺癌预后无统计学关联, 合并HR=0.90, 95% CI:0.71~1.13。针对肺癌病理亚型进行分层分析, 结果提示, HPV感染肺腺癌患者的预后明显优于无HPV感染肺腺癌患者, 合并HR=0.65, 95% CI:0.49~0.85。通过依次剔除纳入的研究, 进行敏感性分析, 结果无统计学变化。Egger's检验(P=0.708)和Begg's检验(P=0.784)的结果提示, 本研究不存在发表偏倚。结论 HPV感染与肺腺癌患者预后可能相关, 未来仍需更多基础和临床研究进一步探索HPV感染和肺腺癌的关联及其背后的机理机制。