妊娠高血压综合征胎盘中病理相关基因的表达改变

目的研究与细胞因子信号转导等相关的病理基因在妊娠高血压综合征(妊高征)胎盘组织中的表达变化.方法采用分别包含220余种人类细胞因子相关基因或人类环境激素相关基因cDNA片段的基因芯片,检测严格配伍的正常和妊高征胎盘组织中基因表达谱的差异.结果一些疾病相关基因(GenBank:U82828、X15183)在妊高征患者胎盘中的表达高于正常,另外一些与基因表达调控有关的转录因子基因(GenBank:AL022312、M15990、U15009、L49380等)也表达增强.此外,妊高征胎盘中与细胞因子信号转导有关的大多数受体/激酶表达增强,例如GenBank登录号为M76125、U73531、L76191、L06139、AF035121、M23379、U43195等基因.结论细胞因子信号转导相关基因等的表达增强提示细胞因子的功能活跃,进一步说明胎盘局部细胞因子水平的变化与妊高征的病理发生密切相关.     

基因芯片筛选大肠侧向发育型肿瘤相关基因的初步研究

目的 应用基因芯片初步筛选大肠侧向发育型肿瘤(LST)相关基因，为进一步研究大肠癌的发病机制提供新的思路和线索。方法 抽提大肠侧向发育型肿瘤癌细胞株、SW480细胞株、LoVo细胞株的总RNA并纯化mRNA；将18816种人类基因及LST片段PCR产物用Bioroboties公司的BG600点样仪点样于纤维膜上，制成基因芯片。将3个样品的mRNA分别逆转录合成探针并^33 P标记，同芯片杂交。严格洗片后Fuji film公司FLA 3000扫描仪扫描芯片信号图象，ArrayGauge 1．0软件分析比较3种细胞株中差异表达基因。结果和结论 在18816种人类基因中存在着一系列LST同普通大肠癌细胞株之间的差异表达基因。在本研究中共有差异表达基因97个，其中共上调58个，共下调39个。表明其可能存在不同的肿瘤发生机制．故进一步研究其相关基因，在分子水平上阐明其发生机制及与大肠癌的关系具有重要意义。     

CPP-SOM整合cDNA基因芯片平台的建立

目的　在转录组水平全面迅速地了解疾病发生和药物作用的分子机理 ,以及寻找潜在的治疗靶标。方法　通过建立基因芯片平台 ,用全反式维甲酸诱导急性早幼粒细胞白血病来源的 NB4细胞分化作为模型 ,并应用自主开发的自组织图结合成分平面展示 (componentplane presentation integrated self-organizing map,CPP- SOM)的方法对数据进行初步分析。结果　建立的 c DNA芯片共有 12 6 30条克隆 ,其中已知基因 94 36条。应用该芯片进行实验 ,结果重复性好、准确性高。CPP- SOM不仅可以将功能相关的基因进行聚类 ,而且可以动态性地从全基因组水平观察药物作用过程中基因的表达变化。结论　我们建立的芯片平台是稳定、可靠的技术平台 ,CPP- SOM是一种新型有效的芯片数据的处理方法。     

HLA分型进展

HLA在免疫应答中占有重要地位 ,其在器官移植中的作用 ,与疾病相关性的意义 ,以及在亲子鉴定 ,人类学研究等方面的应用一直为临床所关注 ,建立快速而准确的HLA分型技术具有重要的临床与社会价值。现就HLA分型的各种方法及每种方法的长处与不足加以比较 ,综述如下。     

大鼠创伤性深静脉血栓形成中纤溶、凝血相关基因表达分析

在急性、亚急性创伤性深静脉血栓形成大鼠模型中,动态检测并比较分析血管内皮纤溶、凝血相关基因的表达变化和差异,探讨其在创伤性深静脉血栓形成中的作用和意义。分别取150只SD大鼠建立急性、亚急性血栓形成模型。急性血栓模型组采用直接钳夹股静脉 双后肢石膏固定、亚急性组采用定量击打双侧大腿 双后肢石膏固定的方式造模。根据深静脉血栓形成过程中不同的生物学状态,将实验动物分为正常对照、创伤即刻、血栓形成初始期、血栓形成高峰期、血栓消退、血栓不消退和血栓不形成7组。采用Genechip Rat Genome4302.0芯片,测定股静脉RNA表达情况,运用基因芯片数据分析方法(倍数变化分析)筛选出差异性表达基因。重点分析血管内皮纤溶、凝血相关基因在两种模型中的变化和差异。结果显示:内皮细胞抗凝和纤溶功能相关基因如ThbdN、os及Plat等基因的表达变化与创伤性深静脉血栓形成关系密切。内皮细胞抗凝和纤溶功能的减弱是创伤性深静脉血栓形成的重要因素之一。这一机制在血管直接受损的急性血栓模型中更显著。     

THP-1单核细胞氧化低密度脂蛋白过程中基因表达谱的改变

目的检测与巨噬细胞氧化低密度脂蛋白可能相关的信号传导相关蛋白基因。方法利用低密度脂蛋白作用人单核细胞系THP-1,通过基因芯片分析人信号相关蛋白的表达谱,期望获得阐明氧化机制的有价值的线索。结果在被检测的1 651个基因中,13个基因的表达变化超过了2倍以上,其中9个基因表达增加,4个基因表达减少。在表达增加的基因中,有2个基因已在新近的报道中被认为可能与动脉粥样硬化相关。结论我们的发现可能为揭示巨噬细胞氧化低密度脂蛋白的机制提供全新的思路。     

基因芯片对大鼠肝移植急性排斥反应T淋巴细胞信号传导基因表达变化的研究

目的：从基因水平研究肝移植急性排斥反应中T淋巴细胞信号传导途径。方法：利用4096条大鼠cDNA克隆的基因芯片对从急性排斥组Wistar→SD(n=5)和对照组SD→SD(n=5)两组肝移植大鼠T细胞中抽提、纯化mRNA，扩增、逆转录成cDNA，荧光标记后与芯片杂交，扫描后筛选出差异表达的基因。结果：在4096个基因中共发现差异表达基因190条，其中ll条与细胞信号传导有关的基因差异表达明显：MHC(3条)、CD3抗原(1条)相关基因；蛋白酶类：蛋白激酶C结合蛋白、蛋白酪氨酸磷酸酯酶D型受体、磷脂酰肌醇二磷酸酶基因各l条；涉及核酸信号传导、激活、转录、翻译的基因3条。结论：T细胞在肝移植术后排斥反应中信号传导机制涉及多个基因，基因芯片技术的大规模筛选为进一步研究T细胞在排斥反应中的信号传导途径提供了客观依据和目标。     

基因芯片技术检测鉴定临床常见致病真菌的初步研究

目的为了快速、简便、高通量地鉴定临床常见致病真菌,建立了一种采用基因芯片技术对临床常见的致病真菌鉴定的分子生物学方法。方法以5.8S rDNA与28S rDNA间的内转录间区2(internal transcribed spacer-2,ITS-2)为靶标,针对待检的临床常见致病真菌设计合成一系列寡核苷酸探针,制成寡核苷酸芯片。待检真菌DNA经通用引物扩增标记后,与芯片杂交,对杂交图谱分析归纳,得到一套种特异性的典型杂交图谱。待检的样品菌与基因芯片杂交,得到的杂交结果与典型图谱比对即可判断出样品的种类。结果以涉及8个属20个种的标准致病真菌菌株对芯片的特异性、重复性、灵敏度进行考察,结果表明,该研究建立的基因芯片技术可以有效地区分20种临床常见致病真菌,特异性良好,重复性良好(信噪比CV<10%),灵敏度为15 pg/ml真菌DNA。收集从临床分离的84株致病真菌菌株对基因芯片进行试用,结果显示基因芯片的鉴定结果与常规鉴定方法的鉴定结果一致。结论这项技术的建立可以稳定、特异性地实现临床常见致病真菌的高通量鉴定,为进一步检测研究奠定了基础。     

白细胞介素及肿瘤坏死因子基因超家族在先兆子痫胎盘中的表达

为探讨白细胞介素和肿瘤坏死因子 (受体 )超家族基因表达与先兆子痫病理发生的关系 ,以包含 2 4 3种人类细胞因子相关基因cDNA片段的基因芯片 ,检测严格配对的先兆子痫和正常胎盘组织中基因表达谱的差异。结果显示受检的白细胞介素和 (或 )白细胞介素受体基因共 2 2种 ,绝大多数基因在先兆子痫胎盘中的表达增强 ,而IL 2受体 (IL 2Rα )基因 (Gen Bank :X0 10 5 7)在先兆子痫胎盘中的表达低于正常胎盘。肿瘤坏死因子 (GenBank :X0 2 910 )及其配体 (GenBank :U0 3398、U375 18、AF0 5 3712、AF0 5 5 872 )、受体 (GenBank :X6 0 5 92、X6 3717、M835 5 4、AF0 16 2 6 6、AF0 16 2 6 7、U812 32 )等 10余种肿瘤坏死因子 (受体 )超家族基因在先兆子痫胎盘中的表达也较高。说明 ,白细胞介素及肿瘤坏死因子 (受体 )基因超家族的高表达可能与先兆子痫的病理发生关系密切     

伤寒减毒活疫苗Ty21a免疫前后小鼠肠细胞差异表达的基因

以基因表达谱芯片对Ty2 1a免疫前后小鼠肠细胞 (包括肠粘膜上皮细胞和肠上皮间淋巴细胞 )基因表达的差异性进行研究比较。将 490条经抑制消减杂交法筛选出的与小鼠Ty2 1a免疫相关的cDNA制备成表达谱芯片 ;利用免疫前后小鼠肠细胞的mRNA通过逆转录方法 ,将Cy3和Cy5两种荧光分别标记到两种组织的cDNA上 ,制备成cDNA探针 ,并与表达谱芯片进行杂交及扫描 ,单点重复 2次实验 ,通过计算机数据处理判定基因是否在上述两种细胞群中有表达差异。筛选出差异表达基因共 98条 ,其中 92条为表达上调基因 ,6条为表达降低基因。提示 ,基因表达谱芯片技术是高通量进行基因表达模式研究的方法 ,可同时定量研究大量的基因表达水平 ,从而鉴定可能参与免疫的基因。