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相似文献
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1.
目的:采用网络药理学方法筛选三棱-莪术药对治疗肝癌的作用靶点以及相关信号通路,明确治疗肝癌的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出三棱、莪术的有效药物成分及作用靶点,构建有效成分-靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。从OMIM、DrugBank、TTD数据库检索与肝癌相关的疾病靶点,并通过R语言软件分析获得三棱-莪术成分与肝癌的交集靶点。应用Cytoscape 3.2.1软件绘制成分-靶点网络,并运用DAVID数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:共筛选出三棱-莪术药对与肝癌的相对应作用靶点共31个。共涉及与肝癌相关的GO分析125条,主要包括分子功能、生物过程、细胞组分3个方面。KEGG通路82条,主要从一氧化氮生物合成过程的正调控、细胞对脂多糖的反应、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控等多处通路治疗肝癌。结论:本研究初步验证了三棱-莪术药对通过肿瘤坏死因子信号通路、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、类固醇激素介导的信号通路等治疗肝癌。本研究表明三棱-莪术药对具有多成分、多靶点的特点,其作用机制多样,对进一步研究肝癌的治疗提供了参考。  相似文献   

2.
目的 基于网络药理学与分子对接技术探讨地骨皮调血脂的作用机制。方法 使用TCMSP数据库并查阅相关文献确定地骨皮活性成分;采用SwissTargetPrediction、GeneCard和OMIM数据库预测地骨皮活性成分靶点和高脂血症相关靶点,应用Venny 2.1取两者交集;运用Cytoscape 3.8.2软件绘制成分-靶点-疾病网络;应用String数据库构建交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络;将交集靶点输入Metascape数据库进行基因本体(gene ontology,GO)功能及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,利用Cytoscape3.8.2软件绘制地骨皮活性成分-靶点-通路网络,预测其调血脂作用机制;采用分子对接和细胞实验进一步探究地骨皮的调血脂作用机制。结果 共筛选出地骨皮潜在活性成分14个以及153个交集靶点;GO功能和KEGG通路分析发现主要涉及过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome prol...  相似文献   

3.
目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨“陈皮-山楂”药对治疗高脂血症(HLP)的作用机制。方法 通过使用TCMSP、ETCM和BATMAN-TCM数据库筛选陈皮、山楂的活性成分和作用靶点;通过Genecards、Disgenet和OMIM数据库获取HLP潜在作用靶点;通过Venny网站获取“陈皮-山楂”药对与疾病的交集靶点;使用Cytoscape软件构建活性“成分-疾病-交集靶点”网络图;使用String数据库和Cytoscape软件构建交集靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;利用Metascape数据库对交集靶点进行基因本体(GO)生物功能分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;最后利用AutoDock Vina软件对主要活性成分和关键靶点进行分子对接。结果 得到“陈皮-山楂”药对潜在活性成分71个、潜在作用靶点414个,HPL疾病靶点1056个,其中成分与疾病交集靶点共88个;GO生物过程作用于激素反应、细胞对激素刺激的反应等602个条目,GO细胞组分富集作用于转录调节复合物、囊泡腔等23个条目,GO分子功能富集作用于核受体活性、配体激活转录因子活性等47个条目;KEGG通路分析共得到127条通路,与脂肪细胞因子信号通路、PPAR信号通路和AMPK信号通路等有关;分子对接结果证实主要活性成分槲皮素、柚皮素与关键靶点PPARA、TP53结合能力良好。结论 “陈皮-山楂”药对可通过多成分、多靶点、多途径发挥对高脂血症的治疗作用。  相似文献   

4.
目的:基于网络药理学探讨通窍活血汤治疗颅脑损伤(TBI)的作用机制。方法:通过检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库筛选出通窍活血汤潜在活性成分及靶点,采用GeneCard与OMIM数据库获得颅脑损伤疾病靶点,得到通窍活血汤的中药与TBI的交集靶点,使用Cytoscape 372软件绘制活性成分靶点疾病交互网络图。采用String数据库构建靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果:筛选后收集得所有中药成分127个,收集疾病靶点1 811个,疾病与药物交集靶点共62个。PPI网络提示核心靶点为ALB、IL6、CASP3、EGFR、VEGFA等;GO功能注释得到73条富集结果,包括DNA结合转录激活剂活性,RNA聚合酶Ⅱ特异性等,富集得到PI3K-AKT等75条核心的KEGG通路。结论:通窍活血汤治疗颅脑损伤具有多成分、多靶点、多通路的作用机制特点。  相似文献   

5.
目的:通过网络药理学研究紫苏-百合药对治疗原发性失眠的有效活性成分及相应基因靶点、信号通路,并探讨其作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中药综合数据库(TCMID)和文献检索紫苏-百合药对的主要化合物及其相应的作用靶点;通过GeneCards、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)检索原发性失眠的疾病靶点;紫苏-百合药对和原发性失眠的交集基因靶点通过String数据库和Cytoscape软件构建网络可视化;利用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果:本研究共筛选到紫苏-百合药对主要有效活性成分共22个,其中紫苏16个,百合7个(包含1个重复活性成分);有效活性成分与原发性失眠共同作用靶点53个;GO富集分析结果显示生物过程(BP)共有284条;细胞组分(CC)共有35条;分子功能(MF)共有58条;KEGG信号通路富集结果显示102条通路。结论:紫苏-百合药对能够通过多靶点、多通路治疗原发性失眠,为深入揭示其作用机制提供了生物信息学基础。  相似文献   

6.
张涤  李慧洁  邓跃毅 《新中医》2024,56(5):187-199
目的:通过网络药理学探讨尿C 方治疗IgA 肾病(IgAN) 的关键成分和作用机制。方法:通过中 药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、PubChem、Swiss ADEM 和SwissTargetPrediction 获得尿C 方作用 靶点;应用Cytoscape 3.9.1 软件构建“药物-成分-靶点”相互作用网络;通过GeneCards、OMIM 和DisGeNET 平台获得IgAN 作用靶点;通过Venn 2.1 制作韦恩图获得尿C 方和IgAN 之间的交叉靶点并进行鉴定和可视 化,并利用STRING 数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI);借助DAVID 数据库对交集靶点进行GO 和KEGG 富集分析并运用微生信在线平台对交集靶点进行GO 和KEGG 富集分析可视化;使用Autodock Vina 软件进行分子对接验证,并利用PyMol 软件得出对接结果。结果:共筛选得到尿C 方有效成分70 种及对应 1 363 个作用靶点,其中确定了10 个关键活性成分。IgAN 相关靶点1 593 个,除重复项后获得823 个疾病靶 点,交集靶点111 个。GO 富集分析得到706 个BP 条目,63 个CC 条目,123 个MF 条目。KEGG 富集分析得 到161 条与IgAN 显著相关的通路。分子对接结果表明,核心活性成分与核心靶点之间存在较强的结合活性。 结论:尿C 方治疗IgAN 的作用机制可能是通过槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇、黄芩素等调控AGE-RAGE 信号 通路、IL-17 信号通路、脂质和动脉粥样硬化等发挥治疗作用。  相似文献   

7.
目的:运用网络药理学方法探究丹参饮治疗心绞痛的作用机制。方法:本研究通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出丹参饮中丹参、檀香、砂仁的有效活性成分及其相关靶点蛋白,通过GeneCards数据库挖掘心绞痛的疾病靶点,将其与药物靶点蛋白取其交集,并将交集靶点运用Cytoscape 372构建活性成分-靶点-疾病网络图。运用STRING数据库对交集靶点构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)I网络图,并进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:共筛选出丹参饮的活性成分78个,靶点334个,心绞痛的靶点2 578个,其交集靶点93个,对应的活性成分59个。GO生物过程20条,包括肾上腺素能受体活性、G蛋白偶联胺受体活性、泛素样蛋白连接酶结合、细胞因子受体结合、酰胺结合等;KEGG相关信号通路,涉及HIF-1信号通路、IL-17信号通路、T细胞受体信号通路等。结论:本研究体现了丹参饮治疗心绞痛的作用机制,体现了中药多成分、多靶点、多途径的作用特点,为临床应用及药理学研究提供了思路和依据。  相似文献   

8.
目的:运用网络药理学方法探讨枸杞子-菟丝子“异病同治”2型糖尿病性骨质疏松症(DOP)和肾病综合征(NS)的作用机制。方法:通过TCMSP数据库筛选枸杞子-菟丝子的主要活性成分和作用靶点,利用UniProt数据库及Perl语言进行规范以及转化为标准基因名称,利用Cytoscape3.9.1软件构建药物-活性成分-靶点网络。通过GeneCards、OMIM及PharmGkb数据库搜集DOP和NS相关疾病靶点,将疾病靶点与药物靶点取交集,通过STRING数据库构建交集靶点的蛋白相互作用网络并筛选核心蛋白;对交集蛋白运用Rx4.1.3软件及R脚本进行GO功能富集和KEGG通路分析,运用Autodock 4.2软件进行分子对接。结果:筛选后得到枸杞子-菟丝子活性成分42个,作用靶点208个;DOP、NS疾病靶点分别为2834个、2114个,共有靶点915个,疾病和药物交集靶点86个。GO富集分析得到分子功能121条;KEGG通路富集分析获得126条信号通路,靠前的通路为糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、脂质与动脉粥样硬化信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路、IL-17信号通路,...  相似文献   

9.
邱嘉菡  邝梓君  曾蕾  袁烁  曾诚 《新中医》2022,54(6):5-13
目的:利用网络药理学方法探讨血府逐瘀汤治疗继发性闭经的潜在作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)以及ETCM数据库查找出血府逐瘀汤中所有药物的活性成分,通过DrugBank数据库、DisGeNET数据库、GeneCards数据库查找继发性闭经相关靶点,利用Cytoscape 3.8.0软件构建血府逐瘀汤中所有中药的活性成分及对应靶点(活性成分-靶点)网络。利用STRING网络数据库构建及扩增血府逐瘀汤与继发性闭经之间的交集靶点蛋白相互作用(PPI)网络,使用Cytoscape 3.8.0软件绘制PPI网络图。通过DAVID数据库对核心靶点进行基因本体(GO)分类富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:筛选出163个血府逐瘀汤作用靶点,其中与继发性闭经相关的作用靶点有34个,扩增以后一共得到64个相关靶点。血府逐瘀汤主要通过作用于白细胞介素-6、肿瘤抑制因子P53等靶点,调控类固醇功能、肿瘤信号通路等多个生物过程及通路,来发挥治疗继发性闭经的作用。结论:血府逐瘀汤可作用于继发性闭经患者的多个靶点,参与多条信号通路的调控。  相似文献   

10.
目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨半夏治疗糖尿病胃轻瘫(DGP)的可能作用机制。方法:从中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)中检索半夏的活性成分和对应靶点,利用SwissTargetPrediction对半夏活性成分进行靶点预测补充;从Genecards、TTD、NCBI数据库中检索DGP相关靶点基因;取半夏活性成分与DGP的交集靶点,利用Cytoscape 3.8.0构建“半夏活性成分-交集靶点”网络;借助Cytoscape 3.8.0的BisoGenet构建交集靶点的蛋白互作(PPI)网络图,利用CytoNCA对PPI网络进行拓扑分析并筛选核心靶点;借助ClueGO对核心靶点进行基因本体(GO)功能富集和京都基因组与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。运用Autodock 4.2软件对关键活性成分与核心靶点进行分子对接。结果:半夏13个活性成分靶点与DGP相关靶点的交集靶点共68个;PPI网络拓扑分析得到核心靶点327个;核心靶点的GO功能富集分析显示其与黏着斑、泛素蛋白连接酶结合及mRNA分解代谢过程等调控相关;KEGG通路富集分析显示其与细胞周期、甲状腺激素信号...  相似文献   

11.
不同栽培年限和采收季节的知母质量考察   总被引:4,自引:0,他引:4  
各类知母及其原植物各部位所含成分,除茎叶不含菝葜皂甙元外,其他成分基本相同而含量不同。知母毛根和知母皮均可以2~3倍量代知母入药。  相似文献   

12.
本文报道用EDTA络合滴定方法,对不同来源的天南星、白附子、半夏的炮制品中白矾进行含量测定,其含量范围在3%~20%之间。作者认为应规定白矾在炮制品中的限量。  相似文献   

13.
目的:建立HPLC测定天南星、半夏、白附子中8种核苷成分含量的方法.方法:采用Phenomenex Luna PFP(2)柱(4.6 mm ×250 mm,5 μm),以甲醇-水为流动相,梯度洗脱,流速0.8 mL· min-1,柱温35℃,检测波长260 nm.结果:尿嘧啶、次黄嘌呤、黄嘌呤、尿苷、肌苷、鸟苷、胸苷、腺苷进样量分别在0.00434~0.434 μg(r=0.9999),0.00234 ~0.234 μg(r=0.9999),0.00407 ~0.407μg(r=0.9997),0.01090 ~1.090μg(r=0.9999),0.00201 ~0.201 μg(r=0.9999),0.00732 ~0.732 μg(r=0.9999),0.00122 ~0.122 μg(r=0.9997),0.00207 ~0.207 μg(r=0.9999)有良好的线性关系;平均回收率分别为104.2% (RSD 2.1%),98.7% (RSD 2.4%),103.7% (RSD 3.0%),99.4% (RSD 1.4%),101.8% (RSD 2.0%),102.9% (RSD 1.9%),98.3% (RSD 2.8%),102.3% (RSD 2.7%).结论:方法简便、准确、快速,结果可靠,为测定天南星、半夏、白附子中8种核苷成分提供依据.  相似文献   

14.
目的:比较四川、甘肃和云南产川芎与其近缘植物藁本挥发油的成分及含量.方法:采用气相色谱-质谱-计算机联用分析方法.结果:从四川、甘肃、云南产川芎及藁本挥发油中共鉴定出69个成分,其挥发油总含量分别为0.51%,0.44%,0.47%和0.70%.结论:3个产地的川芎的挥发油主成分相同,含量上有差异;藁本与上述3个产地川芎的挥发油成分差异较大.  相似文献   

15.
目的:探讨电子鼻技术应用于白及及其近似饮片快速辨识的可行性。方法:收集134批白及及其近似饮片(白及45批、天麻30批、玉竹30批、黄花白及29批)作为待测样品,使用PEN3型电子鼻采集样品嗅觉感官数据作为自变量X,基于2020年版《中华人民共和国药典》和地方标准的鉴别结果,以及各饮片高效液相色谱法(HPLC)指纹图谱和原始采购信息,获得辨识模型的标杆数据Y,分别采用主成分分析-判别分析(PCA-DA)、偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)、最小二乘法-支持向量机(LS-SVM)及K-最近邻(KNN)4种化学计量学方法建立45批白及与89批非白及的二分类辨识模型和上述4种饮片的四分类辨识模型Y=F(X)。结果:经留一法交互验证,在二分类辨识中,上述4种模型分类正判率分别为97.01%、97.01%、98.51%和97.01%;在四分类辨识中,这4种模型分类正判率分别为97.76%、89.55%、98.51%和97.01%。二分类和四分类辨识模型的最高正判率均可达到98.51%,且均以LS-SVM算法为最优,最优核函数分别选择径向基核函数和线性核函数。最优模型判别结果良好,没有未分类样...  相似文献   

16.
黄精玉竹及其制剂的药理学研究进展   总被引:5,自引:1,他引:5  
收集和整理目前我国黄精、玉竹及其制剂在药理学研究方面的科学资料,并做了简要的概述  相似文献   

17.
"根茎"与"根状茎"辨析   总被引:1,自引:1,他引:0  
目的:对中药材中经常使用的"根茎"与"根状茎"进行辨析。方法:参考文献资料,结合专业实践,总结并分析2010年版《中国药典》中根茎类药材。结果:对部分药材用药部分的描述和拉丁用语进行商榷,提出修改建议。结论:对根茎类中药材"根茎"与"根状茎"规范使用提供参考。  相似文献   

18.
目的 对主要产地不同批号半夏及水半夏中氨基酸含量进行了测定和比较.方法 采用L-8800全自动氨基酸分析仪进行测定.结果 半夏总氨基酸含量低于水半夏.结论 为半夏药材资源的开发利用提供了依据.  相似文献   

19.
小白及高效液相指纹图谱分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
目的:通过建立小白及高效液相指纹图谱,研究小白及化学成分及其有效成分在指纹图谱中的分布特征。方法:采用HPLC,建立小白及指纹图谱,选择militarine,coelonin,山药素Ⅲ,4-甲氧基-9,10-双氢菲-1,2,7-三醇4个成分对色谱峰进行指认,通过相似性评价软件,结合化学计量学方法对17批小白及指纹图谱进行分析、比较,同时与正品白及相比较。结果:建立了小白及HPLC指纹图谱,重复性、稳定性较好;小白及对照指纹图谱共确定了20个共有峰,指认了4个共有峰,militarine为8号峰,山药素Ⅲ,4-甲氧基-9,10-双氢菲-1,2,7-三醇分别对应10,14,18号峰;相似度评价除S4较低之外,其余小白及样品的相似度 0. 85,样品共有峰相对峰面积差异较大;聚类分析的距离10时,样品聚为5类,具有一定的产地相关性;主成分分析表明引起差异的共有峰主要位于9号峰之后,是二氢菲类、联苄类等有效成分的分布区域。小白及与白及的化学成分相似,指纹图谱相似度较高。结论:该方法为小白及质量控制提供了方法支撑,并为其作为白及替代品的进一步临床应用提供了理论依据。  相似文献   

20.
目的运用大数据方法,探讨在中医理论指导下的临床真实环境中,风湿科常用中药(泽泻、细辛、寻骨风、威灵仙)饮片的肾毒性情况及其相关影响因素。方法将储存于计算机系统中的龙华医院近5年间使用过泽泻、细辛、寻骨风、威灵仙的所有患者的个人资料(年龄、用药记录等)、处方以及肾功能(肌酐、尿素氮、24 h尿蛋白定量)等信息共1 256万条,通过大数据系统处理,分析肾毒性情况及其相关影响因素。结果使用泽泻、细辛、寻骨风、威灵仙四味中药的患者肾毒性的发生率分别为,泽泻1.15%,细辛2.46%,威灵仙1.50%,寻骨风0.00%。泽泻肾毒性的发生随着累积用药剂量的增加呈现上升趋势,而威灵仙、细辛未出现此情况。5年间临床使用寻骨风者仅有1例,累积用量300 g,未发生肾毒性情况。泽泻、威灵仙、细辛肾毒性的发生有随着年龄增加而上升的趋势。结论在中医理论指导下,通过君臣佐使配伍使用泽泻、细辛、威灵仙较为安全,肾毒性的发生率远低于相关的文献报道。  相似文献   

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