基于网络药理学及动物实验探讨银杏叶对肥胖症的作用

目的 基于网络药理学及动物实验探讨银杏叶干预肥胖症的潜在作用机制。方法 运用TCMSP数据库检索银杏叶活性成分及其靶点,Gene Cards及TCMSP数据库获取肥胖症相关靶点,将活性成分作用靶点与肥胖症相关靶点进行映射,筛选出银杏叶与肥胖症的共同靶点,构建“中药-活性成分-靶点-疾病”网络。运用String数据库构建靶点蛋白之间相互作用网络(PPI),并进行GO功能和KEGG通路富集分析。最后通过分子对接、肥胖犬模型进行验证。结果 共得到27种活性成分,108个银杏叶与肥胖症相交靶点。槲皮素、木犀草素、山柰酚等核心活性成分与肥胖症关系密切。TNF、Akt1、IL-6、PPARG等53个靶点为银杏叶治疗肥胖症的潜在核心靶点,主要富集于GO生物过程(BP)和KEGG通路中的TNF、癌症等信号通路。槲皮素、木犀草素、山柰酚能与TNF、Akt1、IL-6、PPARG靶点稳定结合。银杏叶干预后,肥胖犬体质量、血脂及血清TNF-α、IL-6水平降低(P<0.05),脂肪组织PPARγ、Akt1、TNF-α、IL-6 mRNA表达降低(P<0.05),PPARγ及Akt1磷酸化水平降低...     

药对“虎杖-土茯苓”治疗痛风性关节炎的网络药理学研究

目的:采用网络药理学、分子对接技术预测药对"虎杖-土茯苓"治疗痛风性关节炎(gouty arthritis,GA)的潜在机理。方法:利用TCMSP平台检索收集药对化学成分、对应靶点;借助五大疾病数据库获取GA已知靶点;利用Venny 2.1.0得到药对与GA两者间的交集靶点;运用SRTING数据库、CytoHubba插件构建交集靶点PPI网络;采用DAVID平台对交集靶点进行GO、KEGG通路富集分析;最后将筛选出的核心成分、关键靶点进行分子对接。结果:共获得23个化学成分,199个靶点,其中治疗GA的潜在靶点有76个。预测得知核心成分为槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇,关键靶点为JUN、TNF、RELA、IL6。GO功能富集分析显示,药对治疗GA的生物功能共287个(生物过程172个、细胞组分42个、分子功能73个);KEGG通路富集共筛选出信号通路共122条。分子对接结果显示,槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇与JUN、TNF有良好的结合活力。结论:药对"虎杖-土茯苓"通过槲皮素、木犀草素等成分,作用于JUN、TNF等靶点,在癌症通路、TNF信号通路等通路的参与下,发挥了抗炎、抗凋亡等治疗GA的作用。     

降糖消脂片治疗NAFLD的分子作用机制分析

目的:运用网络药理学和分子对接方法探讨降糖消脂片治疗非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的分子作用机制。方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),中医药综合数据库(TCMID),中医药百科全书数据库(ETCM)和中药分子机制的生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)获取降糖消脂片各药味的化学成分,于SwissTargetPrediction和STITCH数据库预测化学成分的靶点;借助人类基因数据库(GeneCards),在线《人类孟德尔遗传》数据库(OMIM),治疗靶标数据库(TTD)和疾病相关的基因与突变位点数据库(DisGeNET)筛选NAFLD靶点,并与降糖消脂片活性成分的靶点进行交集分析,获得降糖消脂片治疗NAFLD的靶点。借助STRING 11.0构建治疗靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并利用DAVID 6.8对治疗靶点进行富集分析。最后基于分子对接验证降糖消脂片关键成分与核心治疗靶点的作用特征。结果:降糖消脂片治疗NAFLD的关键成分包括槲皮素、木犀草素、山柰酚、小檗碱、异鼠李素、白桦脂酸、齐墩果酸、熊果酸、芒柄花黄素和己糖醇,核心靶点为丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1),Jun原癌基因(JUN),MAPK3,蛋白激酶B1(AKT1或者Akt1),肿瘤蛋白p53(TP53),E1A结合蛋白P300(EP300),Fos原癌基因(FOS),肿瘤坏死因子(TNF),β-淀粉样前体蛋白(APP)和细胞色素P450家族成员2E1(CYP2E1)。富集分析表明降糖消脂片主要通过外源代谢、氧化还原和胆固醇代谢等生物过程,调节磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路,MAPK信号通路,NAFLD及胰岛素信号通路发挥对NAFLD的治疗作用。分子对接结果显示降糖消脂片关键成分与降糖消脂片治疗NAFLD核心靶点有较好的亲和力。结论:降糖消脂片可通过多种活性成分、多个关键靶点及多种作用途径治疗NAFLD。     

基于网络药理学和分子对接研究化湿行瘀清热方治疗口腔扁平苔藓的作用机制

目的 研究化湿行瘀清热方治疗口腔扁平苔藓的主要活性成分和分子机制。方法 基于TCMSP数据库,BATMAN-TCM数据库和UniProt数据库筛选化湿行瘀清热方药物关键活性成分和对应靶点,应用GeneCards数据库获得疾病基因,Cytoscape软件用于构建“药物-语言数据包进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,预测其作用机制,最后使用AutoDock对化湿行瘀清热方中的关键活性化合物与PPI中的核心蛋白进行分子对接验证。结果 从化湿行瘀清热方中筛选出169个活性成分和260个治疗靶点,在GeneCards数据库中鉴定出387个有关口腔扁平苔藓的疾病靶点。两者取交集后,共得到58个药物-疾病共同靶标,化合物-疾病调控网络显示关键药物成分为槲皮素、木犀草素、汉黄芩素和山奈酚等。核心PPI包括蛋白激酶B1(Akt1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、肿瘤坏死因子(TNF)、细胞间黏附因子-1(ICAM-1)、基质金属蛋白酶9(MMP-9)等14个关键疾病靶点,共富集了2169个GO和131个KEGG项目,涉及炎症、感染、代谢、肿瘤等多种途径,其中白细胞介素17(IL-17)信号通路与TNF信号通路与口腔扁平苔藓的发生密切相关。分子对接结果表明,关键药物成分槲皮素、木犀草素、汉黄芩素和山奈酚能够与Akt1、VEGFA、TNF、ICAM-1、MMP-9等14个关键疾病靶点结合,并表现出良好的亲和力。结论 化湿行瘀清热方通过多成分、多靶点治疗口腔扁平苔藓,作用机制可能与IL-17信号通路和TNF信号通路相关。     

基于生物信息技术的荆防颗粒治疗冠状病毒感染疾病机制探析

目的采用网络药理学及分子对接等生物信息技术研究荆防颗粒治疗冠状病毒感染性疾病的机制。方法在TCMIP、TCMSP数据库中查询荆防颗粒药材的性味归经及成分,并通过Pub Chem、Swiss Target Prediction数据库得到成分对应的靶点信息;在Gene Cards数据库中收集冠状病毒相关靶点。成分靶点和疾病靶点交集后使用DAVID数据库对共有靶点进行富集分析。利用Cytoscape 3.7.2软件绘制"药材-成分-共有靶点"网络图,筛选荆防颗粒中的主要活性成分与关键靶点进行分子对接验证。结果共获得荆防颗粒活性成分139个,与冠状病毒共同的靶点27个,GO分析和KEGG信号通路发现,荆防颗粒治疗冠状病毒感染性疾病主要涉及癌症信号通路、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路。成功构建了"药材-成分-共有靶点"网络,分子对接结果显示该网络中的关键成分如β-谷甾醇、啤酒甾醇、异鼠李素、橙皮素、木犀草素等与关键靶点VEGFA、IL6、TNF、PPARγ、APP、ACE2及SARS-Co V-2 3CL水解酶的亲和力较好。结论荆防颗粒通过多味中药配伍发挥治疗冠状病毒感染性疾病的作用,其抗冠状病毒感染机制可能是通过β-谷甾醇、啤酒甾醇、异鼠李素、橙皮素、木犀草素等成分作用于VEGFA、IL6、TNF、PPARγ、APP等靶点,调控癌症信号通路、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路实现。     

基于网络药理学和分子对接探讨鸦胆子治疗结直肠癌的作用机制

目的 采用网络药理学结合分子对接及体内验证,探究鸦胆子Brucea javanica治疗结直肠癌的活性成分、关键作用靶点及潜在的分子机制。方法 从公共数据库中检索并收集鸦胆子的活性成分和对应的靶点以及结直肠癌相关的靶点,通过网络药理学分析出鸦胆子治疗结直肠癌的活性成分、成分-疾病的交集靶点以及可能的信号通路。通过分子对接预测活性成分与靶点蛋白的结合能力。通过体内实验进一步验证鸦胆子活性成分治疗结直肠癌的作用和作用机制。结果 在满足筛选条件的15个成分中共筛出鸦胆子苦醇、木犀草素、鸦胆子苷B、β-谷甾醇4个鸦胆子生物活性成分及32个鸦胆子治疗结直肠癌的作用靶点,表皮因子生长受体（epidermal growth factor receptor,EGFR）、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3(cysteinasparate protease-3,Caspase-3)及细胞周期蛋白D1(cyclin D1)是鸦胆子治疗结直肠癌的关键靶点,EGFR/磷脂酰肌醇3-激酶（phosphatidylinositol-3-kinase,PI3K）/蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)信号通路...     

网络药理学和分子对接探究鼻灵散治疗CRS的作用机制

目的 运用网络药理学和分子对接的方法探究鼻灵散治疗慢性鼻炎(CRS)的药理作用机制。方法 借助TCMSP数据库筛选得到鼻灵散方中的活性成分及其对应靶点,通过Genecards、OMIM、DRUGBANK数据库筛选获取鼻炎治疗靶点。结果 鼻灵散治疗鼻炎的核心活性成分包括槲皮素、山奈酚、木犀草素、豆甾醇等,相关核心靶点有PTGS2、NOS2、GABRA2等,分子对接验证亦显示大部分活性成分与核心靶点的结合活性较好。KEGG富集分析显示涉及的生物学通路主要是IL-17和TNF信号通路。结论 鼻灵散以各种成分通过调控靶点PTGS2、NOS2、GABRA2,有可能是作用于IL-17和TNF信号通路,收缩鼻腔,减轻炎症反应,从而起到治疗鼻炎的作用。     

基于网络药理学和分子对接探讨正元胶囊治疗癌因性疲乏的作用机制

目的：采用网络药理学和分子对接方法，探索正元胶囊治疗癌因性疲乏(cancer-related fatigue，CRF)的作用机理。 方法：从TCMSP及HERB数据库采集正元胶囊组方药物的活性成分及靶点，从 OMIM数据库、Genecards数据库、TTD数据库 收集CRF靶点，二者进行交集筛选出正元胶囊治疗CRF潜在作用靶点，然后绘制“中药-成分-靶点-疾病”网络图并对其关键成 分进行分析，构建靶点蛋白-蛋白互作网络、筛选出关键靶点，同时进行GO和KEGG通路富集分析，利用分子对接技术探索关 键成分与靶点间的相互作用。结果:正元胶囊治疗 CRF的关键成分为槲皮素、山柰酚、木犀草素、7-棕榈酸、五味子酯乙等，涉 及的关键靶点包括TNF、STAT3、TP53、AKT1、MYC、VEGFA、EGFR、JUN、PTEN等，其作用机制可能与癌症的通路、PI3K/AKT 信号通路、癌症的蛋白聚糖、MAPK信号通路以及病毒感染等信号通路有关。分子对接结果表明，槲皮素与TNF、木犀草素与 STAT3的结合能力最强。结论：正元胶囊可通过多靶点、多途径的作用机理治疗 CRF，可为今后阐明正元胶囊治疗 CRF的深 入机制提供思路。     

基于网络药理学探讨国医大师张磊运脾汤治疗高脂血症的分子机制＊

目的 基于网络药理学探讨运脾汤治疗高脂血症的分子作用机制。方法 通过TCMSP、Pharm Mapper、GeneCards、DisGeNET等多个数据库检索，预测并收集运脾汤的有效化学成分和对应的靶蛋白以及高脂血症的相关疾病基因，筛选关键靶点，对关键靶点及相关有效化学成分做分子对接验证，利用DAVID数据库的富集分析功能，得到运脾汤的有效化学成分干预高脂血症的过程中涉及的相关功能和通路，并构建“中药材-有效化学成分-靶点-通路”综合网络。结果 运脾汤干预高脂血症的核心成分为木犀草素、槲皮素、山奈酚、柚皮素等；核心靶点PPARG、NOS3、EGFR、APOB和ESR1，分子对接验证，大部分靶点与化合物有结合活性较好；DAVID富集分析，运脾汤可能通过细胞内外刺激、脂多糖反应和调节凋亡等生物过程和HIF-1信号通路、AGE-RAGE信号通路、胰岛素信号通路、TNF信号通路等途径干预高脂血症。结论 本研究初步预测了运脾汤干预高脂血症的多成分、多靶点、多通路的作用机制，为进一步实验研究提供理论依据。     

桂枝麻黄各半汤治疗尿毒症性瘙痒的网络药理学作用机制

目的运用网络药理学的方法探讨桂枝麻黄各半汤治疗尿毒症性瘙痒（Uremic pruritus,UP）的分子作用 机制。方法通过TCMSP 数据库获取桂枝麻黄各半汤主要活性成分,在疾病靶点筛选数据库Genecards 和 OMIM 以得到尿毒症性瘙痒的相关基因,与药物活性成分作交集。采用STRING 数据库和Cytoscape 软件绘制 蛋白相互作用（protein-protein interaction,PPI）网络,借助R studio 对靶点进行GO 分析和KEGG 通路分析,通 过AutoDOCK Vina 对成分与靶点进行分子对接验证。结果桂枝麻黄各半汤中的132 种成分参与治疗尿毒症 性瘙痒,槲皮素、山柰酚、谷固醇、柚皮素和木犀草素等活性成分为复方主要的活性成分。PPI 结果可见核心 靶点为IL-6、TNF、JUN、VEGFA 和MAPK8。GO 富集获得1 662 条结果,生物过程（BP）中主要富集条目为 脂多糖应答、对细菌来源分子的反应、细胞对化学应力的反应和氧化应激反应等。主要参与AGE-RAGE 信号 通路、流体剪切应力信号通路、TNF 信号通路、IL-17 信号通路等多种途径。分子对接结果可见靶点MAPK8 与槲皮素、谷固醇、木犀草素和山柰酚结合良好。结论本研究基于网络药理学分析了桂枝麻黄各半汤治疗尿 毒症性瘙痒的分子作用机制,呈现出了相互影响、复杂关联的网络调控机制,为后续研究提供了基础。     

基于网络药理学探讨清肺化痰方改善慢性阻塞性肺疾病的作用机制

目的:通过网络药理学及分子对接技术探究清肺化痰方改善慢性阻塞性肺疾病急性加重期(AECOPD)气道黏液高分泌的有效成分和潜在分子机制。方法:首先使用中药系统药理学分析平台(TCMSP)收集清肺化痰方的活性成分和潜在靶点,利用GeneGards等多个数据库筛选AECOPD气道黏液高分泌的疾病靶点;然后将疾病靶点与药物预测靶点取交集,借助Cytoscape3.7.2软件构建交集靶点网络以及蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用DAVID进行GO和KEGG富集分析。最后,将药物活性成分与疾病靶点进行分子对接。结果:清肺化痰方中54个有效活性成分可通过67个潜在靶标改善AECOPD的气道黏液高分泌,涉及TNF信号通路、IL-17、PI3K-Akt等相关信号通路。槲皮素、木犀草苷、β-谷甾醇等成分与AKT1、IL6、EGF等靶标蛋白结合稳定。结论:初步揭示清肺化痰方可直接改善AECOPD气道黏液高分泌,以及其多靶点、多通路的潜在作用机制,为后续研究提供思路。     

基于网络药理学-分子对接探讨茵陈蒿汤治疗妊娠期肝内胆汁淤积症的作用机制＊

目的 利用网络药理学及分子对接技术，研究茵陈蒿汤治疗妊娠期肝内胆汁淤积症（ICP）的物质基础及可能的作用机制。方法 使用TCMSP数据库挖掘茵陈蒿汤有效成分和作用靶点，利用GeneCard与OMIM数据库筛选疾病靶点。将药物与疾病靶点的交集导入String构建PPI网络，使用Cytoscape3.7.2软件筛选核心靶点，借助Metascape数据库对靶点进行基因本体论（GO）功能和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析，从筛选靶点-成分网络图中根据degree值筛选出前5个关键成分，并将该网络中的基因靶点以degree值高低进行排序，选择前5个核心靶点，然后从RCSB PDB数据库和Pub Chem数据库获取靶点与成分的三维结构和化学结构，使用Pymol软件对蛋白质分子进行去水、去磷酸根等操作，最后使用AutoDockTools进行分子对接。结果 茵陈蒿汤中共筛选出21种有效活性成分，关键成分5个，分别为槲皮素、山奈酚、芦荟大黄素、谷甾醇、大黄酸；其治疗ICP的的核心靶点14个，分别为JUN、CASP3、TNF、TP53、MYC、EGFR、AKT1、VEGFA、MMP9、MAPK1、EGF、IL6、CXCL8、MAPK8，靶点主要涉及细胞氧化应激反应、细胞运动的正向调节、受体配体活性、细胞因子受体结合、蛋白激酶活性等生物学过程，通过乙型、丙型肝炎途径、癌症途径、MAPK、 IL-17、TNF信号通路等多途径发挥治疗ICP的作用。分子对接结果显示关键成分与对应靶点具有较好的结合活性。结论 茵陈蒿汤治疗ICP是通过槲皮素、山奈酚、芦荟大黄素、谷甾醇、大黄酸等多种成分作用于JUN、CASP3、TNF、TP53、MYC、EGFR、AKT1、VEGFA、MMP9、MAPK1、EGF、IL6、CXCL8、MAPK8等多种基因靶点，从而影响MAPK、 IL-17、肿瘤坏死因子、ErbB、 Toll样受体以及乙型丙型肝炎病毒等多种相关信号通路发挥功效，该研究为进一步深入研究其作用机制奠定了基础。     

基于网络药理学的连花清瘟方抗冠状病毒的物质基础及机制探讨

目的探寻连花清瘟方抗冠状病毒的物质基础及作用机制,为新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的中医药治疗提供参考。方法借助TCMSP、Batman、Swiss Target Prediction等数据库检索连花清瘟方中药味的化学成分和作用靶点。通过Gene Cards筛选出冠状病毒的疾病靶点。使用Cytoscape软件构建"药物-成分-靶点-疾病"网络和潜在靶点的相互作用关系,通过富集分析预测作用机制,并将连花清瘟方的主要活性成分与新型冠状病毒(SARS-Co V-2)3CL水解酶(Mpro)、血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)进行分子对接验证。结果挖掘出连花清瘟方中100种活性成分、636个药物靶点,冠状病毒347个疾病靶点,得到药物-疾病共同靶点67个,关键靶点涉及PTGS2、IL6、CASP3、MAPK1、EGFR、ACE2等。GO富集分析共得到条目1 946个,主要涉及T细胞活化、病毒受体、炎症反应等。KEGG通路富集筛选出166条信号通路,包括肾素-血管紧张素系统、Toll样受体信号通路、JAK-STAT信号通路、T细胞受体信号通路、TNF信号通路等。分子对接结果显示山柰酚、槲皮素、木犀草素与Mpro有较好的结合能力;甘草次酸、豆甾醇、靛蓝与ACE2有较好的结合能力。结论连花清瘟方可通过多成分、多靶点、多通路作用于冠状病毒,其主要成分与Mpro、ACE2有较好的结合能力,从而可能对COVID-19有治疗作用。     

基于网络药理学和分子对接探讨钩藤-全蝎药对治疗支气管哮喘的作用机制＊

目的通过网络药理学和分子对接探究钩藤-全蝎药对治疗支气管哮喘的药理作用机制。方法通过TCMSP、TCMIP数据库搜集钩藤、全蝎的活性成分及其作用靶点,并使用Cytoscape软件进行可视化分析成分-靶点网。通过OMIM、GeneCards数据库搜集支气管哮喘的疾病靶点,整合钩藤-全蝎药对与支气管哮喘的共有靶点。利用String平台构建对共有靶点互作PPI网络,并进行GO和KEGG富集分析,通过Cytoscape软件构建成分-靶点-通路网络模型。最后通过Autodock分子对接进行验证。结果经过筛选发现钩藤-全蝎药对37个活性化合物和234个药物靶点,与哮喘6010个靶点取交集得到35个共有靶点。钩藤-全蝎包含槲皮素、山奈酚、育亨宾碱、β-谷甾醇等重要活性成分;根据PPI网络分析,核心网络连接度高的潜在治疗靶点有IL6、CASP3、ECFR、ESR1、MAPK8等;根据KEGG富集分析结果显示,钩藤-全蝎药对主要通过PI3 K-Akt信号通路、TNF信号通路,HIF-1信号通路、M APK信号通路、NF-κB信号通路等来治疗哮喘;钩藤-全蝎药对活性成分与核心靶点的分子对接结果均显示出较好的结合活性。结论钩藤-全蝎药对治疗哮喘呈现出多成分、多靶点、多通路的特点,其核心成分槲皮素、山奈酚、育亨宾碱、β-谷甾醇等可能通过CASP3、MAPK8、ESR1、IL6、ECFR等靶点调节多条通路发挥抗炎、调节免疫、抗氧化应激、改善气道重塑等作用,从而对哮喘达到有效的治疗。     

基于网络药理学和分子对接探讨柴胡-大黄药对防治胆石症的作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接技术初步探讨柴胡-大黄药对治疗胆石症的有效物质基础及作用机制.方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索柴胡、大黄的有效活性成分及潜在作用靶点;通过GeneCards、CTD、TTD数据库得出胆石症相关作用靶点.利用Cytoscape 3.7.2软件及STRING数据库构造...     

基于网络药理学探究防衰益寿丸抗衰老作用及实验验证＊

目的 使用网络药理学方法来探究防衰益寿丸中君药抗衰老作用并验证。方法 采用中药系统药理学数据库和分析平台等数据库筛选防衰益寿丸君药的活性成分及活性成分作用靶点；在GeneCards、DigSee和OMIM疾病数据库中检索衰老相关靶点；借助Uniprot数据库查询其活性成分对应靶点基因名称；采用Cytoscape 3.7.2软件构建成分、疾病、两者交集靶点网络图；借助STRING数据库和Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白互作网络；通过R 3.6.1软件对防衰益寿丸君药抗衰老靶基因进行GO和KEGG富集分析；将核心靶点与对应的化合物进行分子对接验证，并通过动物实验验证网络药理学预测结果。结果 研究共筛选出31个活性化合物，预测得到152个作用靶点，共收集2257个衰老靶点。通过靶点映射表明药物活性成分作用于AKT1、TNF、MAPK8、MPAK1、CASP3等97个共同表达靶基因，发现靶基因主要参与被动跨膜转运蛋白活性、铵离子结合、血红素结合、脂多糖的反应等生物过程。通过调节糖尿病并发症中AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、MAPK信号通路等发挥抗衰老作用。分子对接验证结果表明核心靶点AKT1、MAPK1、TNF及HMOX-1靶点可与活性成分原阿片碱、花生四烯酸及山奈酚小分子化合物稳定结合。动物实验结果表明防衰益寿丸能够调控多条通路改善小鼠的学习记忆能力，改善大脑胆碱能神经通路功能，增加脑内乙酰胆碱的含量，改善老龄小鼠血脂水平。结论 研究初步探究并验证了防衰益寿丸君药抗衰老作用的核心活性成分（人参皂苷类成分、山奈酚、花生四烯酸、原阿片碱等）及关键靶基因（如AKT1、TNF、CASP3、MAPK1、HMOX1等），网络关系构建及通路富集（如糖尿病并发症AGE-RAGE通路、TNF信号通路、MAPK信号通路等），揭示了药物抗衰老的潜在通路和机制，体现了中药的多成分-多靶点-多途径的药理作用，为进一步深入阐释其抗衰老机制奠定了基础。     

基于网络药理学及分子对接技术探讨清感冬饮治疗流行性感冒的作用机制

目的:通过网络药理学及分子对接技术探讨清感冬饮治疗流行性感冒(简称流感)的作用机制。方法:查询TCMSP、ETCM及相关文献获取清感冬饮的药物成分,在Swiss Target Prediction预测筛选后药物成分的作用靶点;运用Genecards及OMIM获取流感的疾病靶点,利用Venny 2.1获取清感冬饮治疗流感的作用靶点。使用STRING平台及Cytoscape软件构建蛋白质相互作用(PPI)网络,利用Metascape进行GO富集分析和KEGG信号通路分析。使用Cytoscape软件构建有效成分-主要靶点网络图。利用PubChem、PDB及PyMoL、AutoDock软件进行分子对接。结果:清感冬饮中的124个有效成分通过多个通路直接作用于109个疾病靶点治疗流感,其中槲皮素、木樨草素、山柰酚、异鼠李素、甘乌内酯是核心成分,EGFR、APP、SRC、MMP9、AKT1、PTK2、PIK3R1是至关重要的靶点。GO富集分析发现清感冬饮主要参与细胞迁移的正向调节、对外界刺激反应的正向调节、激酶活性的正向调节等生物进程,膜侧、囊腔、膜筏等细胞组分,醇基团为受体的磷酸转移酶活性、激酶结合、磷酸酶结合等分子功能。KEGG分析结果显示清感冬饮主要参与甲型流感、MAPK、PI3K/Akt等信号通路。分子对接结果表明核心成分与核心靶点结合性较好。结论:清感冬饮主要通过调节甲型流感、MAPK、PI3K/Akt等信号通路的EGFR、MMP9等疾病靶点,干预转移酶活性、炎症反应、氧化应激反应等生物学过程,进而治疗流感。     

采用网络药理学和分子对接技术研究麻黄连翘赤小豆汤治疗湿疹的作用机制

通过网络药理学和分子对接的方法研究麻黄连翘赤小豆汤治疗湿疹(eczema)的作用机制。首先利用TCMSP数据库挖掘麻黄连翘赤小豆汤中各个药物的活性成分并预测其作用靶点,借用Uniprot数据库将靶点蛋白名称标准化。然后通过GeneCards,OMIM,PharmGkb,DrugBank等数据库获得湿疹的疾病靶点。取药物靶点与疾病靶点共同作用的潜在靶点制作韦恩图,运用Cytoscape 3.6.1软件筛选并构建"活性成分-核心靶点"网络,利用STRING数据库构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络,利用R语言对核心作用靶点进行GO富集分析和KEGG通路分析。最后通过AutoDock软件对药物的主要活性成分及核心作用靶点进行分子对接验证。研究结果显示,筛选得到麻黄连翘赤小豆汤治疗湿疹的活性成分74个及靶点103个,主要活性成分为槲皮素、木犀草素、汉黄芩素、山柰酚等,主要靶点为PTGS1,ESR1,PPARG,MAPK3等,PPI网络主要计算出MAPK8,MAPK3,JUN,MAPK14,TP53,MAPK1,ESR1,RELA等8个关键靶点。GO富集分析共涉及到生物过程2 024个,细胞组分81个,分子功能140个,KEGG通路富集分析筛选得到158条与湿疹相关通路,主要作用于AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、病毒相关通路等。分子对接结果表明,主要活性化合物能够分别与代表性的靶点结合并展现出较好的亲和力。该研究表明麻黄连翘赤小豆汤治疗湿疹涉及多条信号通路及生物学过程,其主要活性成分槲皮素、木犀草素、汉黄芩素、山柰酚与关键靶点MAPK8,MAPK3,JUN,MAPK14,TP53,MAPK1,ESR1,RELA结合可能是发挥作用的重要机制之一。     

基于UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS和网络药理学探讨益气祛风方治疗糖尿病肾病作用机制

[目的] 借助超高效液相色谱-四级杆静电场轨道阱质谱仪（UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS）技术结合网络药理学和分子对接技术，分析益气祛风方防治糖尿病肾病（DN）的物质基础和作用机制。[方法] 采用UHPLC-Q-Exactive Orbitrap MS鉴定益气祛风方的主要化学成分，采用网络药理学方法构建“主要成分-核心靶点-信号通路”网络，进行基因本体（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析，对主要活性成分与核心靶点进行分子对接。[结果] 从益气祛风方共鉴定出115个化学成分，获得40个核心靶点，主要涉及磷脂酰肌醇-3激酶-蛋白激酶B（PI3K-Akt）信号通路、脂质及动脉硬化、糖基化终产物及受体（AGE-RAGE）信号通路、趋化因子信号通路及低氧诱导因子（HIF）1信号通路等。分子对接结果表明生松素、荠苧黄酮、槲皮素、N-乙酰多巴胺二聚体-1、N-乙酰多巴胺二聚体-2等成分与部分核心靶点有较好的结合活性。[结论] 本研究初步鉴定了益气祛风方治疗DN潜在的有效成分并预测了其作用靶点，为进一步研究中医“从风论治”法和益气祛风方治疗糖尿病肾病的作用机制提供了新的思路。