基于中药整合药理学平台探讨补中益气汤治疗甲状腺功能减退症的作用机制研究

目的：基于整合药理学思路和方法,对经典名方补中益气汤治疗甲状腺功能减退症的物质基础及分子机制进行初步分析。方法：利用中药整合药理学计算平台（TCMIP,www.tcmip.cn）预测补中益气汤治疗甲减的主要活性成分及作用靶点,筛选关键靶标并进行通路富集分析,构建补中益气汤“中药材-核心成分-关键靶标-主要通路”多维网络,探索其治疗甲减的可能机制。结果：共预测得到517个活性成分。其作用机制涉及1466个关键药靶及线粒体氧化应激、嘌呤代谢、内分泌系统、雌激素信号通路等相关生物过程和代谢通路。“关键成分-核心靶标-关键通路”分析显示36个化学成分与63个靶点可能参与了补中益气汤治疗甲减。结论：补中益气汤是以多成分交互作用于多靶点,通过多通路对甲减发挥一定的治疗作用。     

基于网络药理学研究复方钩藤降压片治疗高血压的作用机制

该文通过网络药理学研究预测复方钩藤降压片潜在的主要活性成分和作用靶点,探讨其多成分-多靶点-多通路的治疗高血压的可能作用机制。采用整合药理学平台(TCMIP)构建复方钩藤降压片成分靶标-疾病靶标网络,通过网络分析方法筛选关键节点,并在此基础上对关键节点进行通路富集分析,探索复方钩藤降压片治疗高血压可能参与的生物过程。靶点网络特征分析显示,所预测复方钩藤降压片中有35个活性成分与前列腺素内源性过氧化物合酶(PTGS1,PTGS2)、ATP合成酶(ATP1A1,ATP5A1,ATP5C1,ATP5B)等29个主要蛋白有很强的相互作用,富集到血压调节、G-蛋白耦合受体激活、心肌细胞肾上腺素能信号转导和血小板激活等15条通路,参与对高血压病理过程不同环节的调控。该研究初步揭示了复方钩藤降压片治疗高血压的潜在活性成分及其可能的作用机制,为进一步的药效物质基础和作用机制实验研究提供了理论依据。     

基于网络药理学方法研究补肾活血方治疗肾纤维化药效物质基础及分子作用机制*

目的:探讨补肾活血方治疗肾纤维化的药效物质基础及分子作用机制。方法:基于网络药理学理论框架,结合ADME性质筛选、靶点预测、网络构建及KEGG通路富集分析等方法进行研究。结果:补肾活血方中5味药材共包含491个化合物,其中具有良好的ADME性质的188个潜在活性成分中,共有136个活性成分及其对应的59个靶标与补肾活血方治疗肾纤维化密切相关。通过构建“药材-活性成分-靶标”网络及对网络进行分析,共获得19个关键化合物和5个关键靶标。此外,在对靶标进行KEGG通路分析时,共获得19条与补肾活血方治疗肾纤维化相关的通路,其中,PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路为主要通路。结论:补肾活血方可通过多成分、多靶标及多通路的作用模式治疗肾纤维化。本研究为补肾活血方治疗肾纤维化的药效物质及潜在作用机制研究提供了一种新的研究思路,为该方剂的进一步升级改造及临床研究提供了必要的理论依据。     

基于网络药理学的黄芪建中汤治疗慢性萎缩性胃炎作用机制研究

目的筛选黄芪建中汤中治疗慢性萎缩性胃炎的主要活性成分,预测活性成分的作用靶点,建立单味药-活性成分-作用靶点网络,进一步探讨黄芪建中汤治疗慢性萎缩性胃炎的潜在作用机制。方法采用中药系统药理学技术平台(TCMSP)中的药动学参数[口服利用度(OB)和药物相似性(DL)]筛选黄芪建中汤的潜在活性成分,整合靶点预测网站服务器(STPD)与人类基因数据库(Genecard)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)预测和筛选其治疗慢性萎缩性胃炎的作用靶点,借助Cytoscape构建"单味药-活性成分-作用靶点"网络。通过Systems Dock Web Site对4个主要活性成分与作用靶点进行分子对接验证。采用String数据库与Cytoscape软件绘制蛋白质相互作用网络,并利用Dis Ge NET数据库对作用靶点类型进行归属。采用DAVID数据库对黄芪建中汤作用靶点进行生物功能及代谢通路分析。结果通过OB和DL参数筛选得到118个潜在活性成分,共涉及16个作用靶点,与疾病靶点有关的活性成分为52个,主要通过调控癌症通路、病灶黏连、精氨酸和脯氨酸代谢、血管内皮生长因子(VEGF)信号转导与神经营养因子信号通路等发挥对慢性萎缩性胃炎的治疗作用。结论黄芪建中汤对慢性萎缩性胃炎的治疗作用体现了中药多成分-多靶点-多途径的特点,为阐释其治疗慢性萎缩性胃炎的作用机制与物质基础提供了科学依据。     

基于网络药理学的四物汤治疗原发性痛经的作用机制研究

该文通过网络药理学研究预测四物汤治疗原发性痛经的多成分、多靶标、多途径作用机制,建立其"化合物-靶标-通路-疾病"的网络药理研究模式。利用网络药理学方法,针对已报道的四物汤活性成分,采用Swiss Target Prediction服务器依据反向药效团匹配方法预测四物汤活性成分靶标,并通过DrugBank,OMIM,TTD等数据库筛选出FDA批准的治疗原发性痛经靶标。通过对靶标的KEGG通路富集分析,采用Cytoscape软件构建四物汤"成分-靶标-通路-疾病"网络。网络分析表明,20个活性成分共涉及通路114条,预测出16个成分、16个靶标蛋白和24条通路与原发性痛经相关。四物汤可能通过作用于激素调节、中枢镇痛、解痉、炎症及免疫相关的蛋白靶标及通路,起到治疗原发性痛经的作用。该研究初步揭示了四物汤治疗原发性痛经的潜在活性成分及其可能的作用机制,为进一步的药效物质基础和作用机制实验研究提供了理论依据。     

基于中药整合药理学计算平台的当归贝母苦参丸治疗前列腺疾病分子机制研究

目的基于整合药理学思路和方法,对经方当归贝母苦参丸治疗前列腺疾病的物质基础及分子机制进行初步分析。方法利用中药整合药理学计算平台(TCM-IP,www.tcmip.cn)预测当归贝母苦参丸治疗前列腺疾病的主要活性成分及作用靶点,筛选关键靶标并进行通路富集分析,构建当归贝母苦参丸"中药材-核心成分-关键靶标-主要通路"多维网络,探索其治疗前列腺疾病的可能机制。结果筛选出当归贝母苦参丸治疗前列腺疾病的候选关键靶标532个,获得候选关键靶标的gene ontology(GO)分析结果 1 840条,KEGG通路富集分析结果 194条。"中药材-核心成分-关键靶标-主要通路"网络关联分析结果获得当归贝母苦参丸治疗前列腺疾病的核心成分65个(当归29个、浙贝母11个、苦参26个,其中有1个成分为当归和浙贝母的共有成分),作用于转录因子结合、凋亡负性调控等关键靶标,通过雌激素、凋亡、趋化因子等信号通路,发挥细胞周期、细胞凋亡与增殖失衡调控等作用,这可能是其治疗前列腺疾病的相关分子机制。结论当归贝母苦参丸是以多成分交互作用于多靶点,通过多通路参与调控良性前列腺增生症(BPH)、前列腺癌等疾病发生发展过程,从而发挥一定的治疗作用。     

牡丹叶治疗原发性痛经机制研究

目的:探究牡丹叶治疗原发性痛经的多成分、多靶点、多途径作用机制,尝试建立其可能的"药物-核心成分-关键靶标-主要通路"的网络药理研究模式。方法:针对牡丹叶中15个入血成分,利用中药整合药理学计算平台建立牡丹叶调节疾病的候选靶标网络图,再根据网络拓扑特征参数值筛选出牡丹叶治疗疾病的关键靶标名称及其所参与的通路,并最终绘制出"药物-核心成分-关键靶标-主要通路"多维网络关系图。结果:预测实验表明,15个入血成分的作用靶点约为299个,共涉及主要通路20条与原发性痛经相关。结论:牡丹叶可能通过作用于镇痛、解痉、抗炎、激素调节以及免疫调节等相关的蛋白靶点和通路起到治疗原发性痛经的作用。     

基于网络药理学的苓桂术甘汤治疗阿尔茨海默病的潜在作用机制研究

目的利用网络药理学技术研究苓桂术甘汤治疗阿尔茨海默病(AD)的潜在作用机制。方法利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)、Swiss、SuperPred和Stitch数据库寻找与苓桂术甘汤中4味中药相关的化学成分及其作用靶点,并以口服利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18为阈值对化合物进行筛选,再通过文献查找加以补充;通过OMIM、TTD、GAD、Pharm Gkb数据库获取与AD疾病相关的靶标,并进一步筛选得到苓桂术甘汤治疗AD的潜在作用靶点;采用DAVID6.8数据库对相关潜在作用靶点进行GO分析及KEGG代谢通路富集分析;利用Cytoscape软件构建"单味药-活性成分-作用靶点"相互作用网络并进行度值和中介度分析,确认可能的关键靶点和关键通路。结果在苓桂术甘汤中,共筛选出126个与AD相关的潜在活性成分和120个潜在作用靶点;GO生物功能分析共包含565条富集结果,其中生物过程396条,分子功能121条,细胞组成48条,主要涉及蛋白结合、细胞、氧化还原过程等;KEGG富集得到67条代谢通路,主要包括神经活性配体-受体相互作用通路、癌症通路、5-羟色胺能突触通路和钙信号通路等。结论网络药理学研究结果揭示了苓桂术甘汤治疗AD的多成分、多靶点、多途径的作用特点,并预测了其可能的活性成分、作用通路和关键靶点,为其药效物质基础和作用机制研究提供了理论基础。     

探讨中药剂肝复乐治疗肝硬化基于网络药理学的作用机制

目的 通过网络药理学研究预测中药剂肝复乐的主要活性成分的作用靶点与通路,建立其“化合物-靶点-通路”的网络模型。方法 利用网络药理学,获得肝复乐中抗肝硬化的活性成分及其相关靶点。通过与MalaCards、OMIM数据库中肝硬化相关基因以及从基因芯片筛选比对,选择既关键的靶点基因进行后续分析,靶点经KEGG通路富集分析后,使用Cytoscape软件构建肝复乐“化合物-靶点-通路-疾病”网络。结果 对该网络进行分析发现,预测出60个化合物、16个靶点蛋白和15条通路与肝硬化相关。中药方剂肝复乐可能通过作用于炎症、物质代谢、肿瘤发生相关的蛋白/基因靶点及通路,起到治疗肝硬化的作用。结论 该研究初步揭示了中药剂肝复乐治疗肝硬化的活性成分及其可能的作用机制,为以后的药效物质基础和作用机制实验研究提供了理论依据。     

基于网络药理探讨四妙散治疗骨性关节炎的作用机制

目的:基于网络药理学探讨四妙散治疗骨性关节炎(OA)的作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中检索四妙散中黄柏、苍术、薏苡仁、牛膝的活性成分,以口服生物利用度(OB)≥30%,类药性(DL)≥0.18为条件进行筛选,通过Uniprot数据库进行靶点预测;通过TTD、Drugbank、CTD、Gencards、OMIM、PharmGKB、GAD、KEGG数据库获取OA的相关靶标,并进一步对药物和疾病靶点相映射得到四妙散治疗OA的潜在靶点,运用Cytoscape和STRING软件构建“中药-成分-靶点”与蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,筛选可能发挥治疗作用的重要成分及靶点,并对相关靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析获知其潜在的作用机制。结果:从四妙散中共筛选出活性成分67个,包括槲皮素、豆甾醇、β-谷甾醇、汉黄芩素、非洲防己碱等,与骨关节炎相关的作用靶点524个,包括TNF、IL6、MAPK1、PTGS2、MAPK8等。四妙散主要通过调节TNF信号通路、HIF-1信号通路、NOD样受体、Toll样受体信号通路等发挥治疗骨关节炎的作用。结论:本研究运用网络药理学预测了四妙散治疗OA可能的活性成分、关键靶点及作用通路,体现了中药治疗疾病具有“多成分、多靶点、多途径”的特点,为其药效物质基础和作用机制研究提供了理论基础。     

Network pharmacology unveils spleen-fortifying effect of Codonopsis Radix on different gastric diseases based on theory of ‘‘same treatment for different diseases” in traditional Chinese medicine

Objective: "Same treatment for different diseases" is a unique treatment strategy under the guidance of traditional Chinese medicine(TCM) theory.Codonopsis Radix(Codonopsis pilosula,Dangshen in Chinese)with spleen-fortifying effect was employed to understand the strategy of "Same treatment for different diseases",based on its common mechanism in the treatment of gastric diseases including gastric ulcer,gastritis and gastric cancer via network pharmacology research.Methods:Network pharmacology research methods were used to analyze the interaction network and potential mechanisms of Dangshen in treating gastric ulcer,gastritis and gastric cancer.The active components and their target proteins of Dangshen were integrated from TCMSP,BATMAN-TCM databases.The targets of gastric ulcer,gastritis and gastric cancer were collected through GeneCards,PubMed,TDD and DisGeNET Database.Through screening,the key components and the key targets of Dangshen in treating gastric ulcer,gastritis and gastric cancer were obtained.After KEGG pathway analysis and GO analysis,the important pathways and biological processes were analyzed.Results:Through data and literature mining,the common and specific pharmaceutical effects and mechanism of Dangshen were summarized in these three gastric lesions.It was shown that Dangshen mainly acted on gastric ulcer,gastritis and gastric cancer through the overall regulation of the PI3K-AkT signaling pathway.With the development of the disease,it will gradually increase the control of inflammation through TNF,NF-κB and other inflammation-related signaling pathways to reduce inflammatory damage.For tumorigenesis,it pays more attention to inhibiting the ErbB signaling pathways to reduce the proliferation and migration of tumor cells.In addition,Dangshen's regulation of HIF-1 signaling pathway may also be beneficial for the treatment of gastric ulcer,gastritis and gastric cancer.Conclusion:Dangshen achieves spleen-fortifying effect on gastric diseases including gastric ulcer,gastritis and gastric cancer through multiple targets in multiple pathways,especially PI3K-AKT pathway and HIF-1 pathway.It could provide a scientific basis for understanding the strategy of "Same treatment for different diseases" in traditional Chinese medicine.     

理中汤治疗胃溃疡的分子网络调控机制研究

目的 基于网络药理学和生物信息学方法探讨理中汤（LZT）治疗胃溃疡(GU)的分子网络调控机制。方法 通过检索中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)中LZT的所有成分数据，筛选并预测其入血活性成分和作用靶点；通过疾病数据库检索与GU发病相关的基因，构建LZT成分靶点与GU疾病靶点的交互网络，获得LZT治疗胃溃疡的特征性基因；通过DAVID数据库对特征性基因进行基因本体（GO）和KEGG信号通路分析，利用Cytohubba筛选出LZT治疗胃溃疡的关键靶点。结果 在TCMSP中共检索出LZT的化学成分629个，根据ADME参数筛选获得入血的活性成分100个，预测靶点208个；通过疾病靶点数据库共检索到与GU发生、发展密切相关的靶点486个；运用Cytoscape筛选出LZT治疗GU的直接或间接靶点231个；GO和KEGG结果显示LZT可能通过调控Erb、JAK-STAT、FoxO、MAPK、PI3K-Akt等信号通路、细胞因子之间的相互作用等发挥治疗效应，其作用的关键靶点主要包括AKT1、EGF、ERBB2、STAT3和TP53等。结论 LZT治疗GU具有多成分、多途径和多靶点的特点，其治疗GU的分子网络机制主要与调控JAK-STAT、MAPK、PI3K-Akt等信号通路和EGF、AKT1、STAT3等关键靶点密切相关。本研究可为LZT临床应用于GU的治疗提供理论依据。     

基于网络药理学探讨黄芪治疗糖尿病肾病作用机制

目的利用网络药理学方法研究黄芪治疗糖尿病肾病(DN)的作用机制。方法以化合物的口服生物利用度(OB)和类药性(DL)为标准,依据中药药理学技术平台(TCMSP)数据库、小分子靶点预测平台(Swiss Target Prediction)、人类基因组注释数据库(Genecards)预测和筛选黄芪的活性成分及治疗DN的作用靶点。采用Metascape数据库对作用靶点的基因本体(GO)注释和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路进行富集分析和蛋白功能归属。结果从黄芪中筛选得到槲皮素、山柰酚、异鼠李素、芒柄花素、黄芪皂苷I～IV等24个活性成分,作用于172个DN靶点,筛选出表皮生长因子受体、血管内皮生长因子受体、丝裂原活化蛋白激酶、白细胞介素-6、肿瘤坏死因子等18个关键靶点。调节晚期糖基化终末产物及其受体(AGEs-RAGE)介导的信号通路、磷酯酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B/叉头框转录因子O(PI3K/Akt/Fox O)信号通路、核转录因子-κB(NF-κB)信号通路、Janus激酶/信号转导子和转录激活因子信号通路等关键代谢通路。参与物质代谢、氧化还原、信号转导、炎症反应等多种生物过程。结论黄芪及其活性成分通过多个靶点、多条通路发挥治疗DN的作用。     

基于网络药理学的黄芪治疗肾病综合征的机制研究

目的运用网络药理学的方法探讨黄芪治疗肾病综合征(NS)的分子作用机制。方法通过TCMSP数据库和文献挖掘获取黄芪主要活性成分,利用Pharm Mapper服务器、GeneCards和CoolGeN数据库预测和筛选黄芪活性成分的作用靶点。采用String数据库和Cytoscape软件绘制蛋白相互作用网络,通过Systems Dock Web Site对成分与靶点进行分子对接验证。借助DAVID数据库对靶点进行GO分析和KEGG通路分析,采用Cytoscape软件构建成分-靶点-通路-疾病网络。结果筛选得到黄芪25个活性成分,涉及47个作用靶点。网络分析结果表明,靶点主要涉及氧化应激、足细胞凋亡和脂质代谢等生物过程,通过调节Ras、Rap1、MAPK、PI3K-Akt和AGE-RAGE等信号通路来发挥治疗NS的作用。结论黄芪中黄酮类、皂苷类等活性成分可能是其治疗NS的物质基础,其作用机制涉及抗细胞凋亡、抗氧化应激和调节脂质代谢等。     

五子衍宗丸治疗男性不育症的网络药理学探讨

目的:基于网络药理学探讨五子衍宗丸治疗男性不育症的物质基础及作用机制。方法:应用中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选五子衍宗丸中的活性成分和作用靶点;应用Gene Cards,OMIM,Pharm Gkb数据库筛选男性不育症的疾病靶点;应用R语言软件筛选药物与疾病共同靶点,应用Cytoscape软件构建药物-活性成分-疾病-靶点互作网络;应用STRING平台构建共同靶点蛋白互作网络(PPI);应用Clue Go插件对共同靶点进行基因本体(GO)分析,并应用R语言软件对共同靶点进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集。结果:从五子衍宗丸中共获得72个有效活性成分,得到35个五子衍宗丸治疗男性不育症的可能靶点,这些靶点主要涉及氧化与抗氧化活性等生物学过程,并主要富集在磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt),缺氧诱导因子-1(HIF-1)等信号通路上。结论:通过网络药理学证实了五子衍宗丸多成分、多靶点、多途径的作用特点,预测了五子衍宗丸治疗男性不育症的可能作用机制,为进一步研究其活性成分和作用机制提供理论依据。     

面向隐结构模型和网络药理学探讨“调肝守恒”治疗慢性胃炎的潜在生物学机制＊

目的 通过隐结构模型方法诠释名老中医“调肝守恒”治疗慢性胃炎经验，运用网络药理学探讨“调肝守恒”核心组方治疗慢性胃炎的潜在靶标及作用机制。方法 利用TCMSP数据库筛选组方具有成药可能性较大以及口服吸收较佳的候选活性成分；通过GeneCards数据库筛选获得慢性胃炎相关预测靶点，并与潜在活性成分的作用靶点进行交集分析，获得组方治疗慢性胃炎的靶点；采用Cytoscape软件，构建“药物-活性成分-作用靶点”网络图；借助String数据库平台构建蛋白质相互作用网络，筛选核心靶点；利用Cytoscape软件中的ClueGO插件对共同作用靶蛋白进行GO生物功能注释与KEGG富集分析。结果 发现组方中包含的59个候选成分可能作用于疾病的101个靶点，候选成分中槲皮素、木犀草素、山柰酚可能是组方发挥作用的关键成分，生物学功能涉及凋亡、增殖、炎症反应等多方面，交集基因富集于MAPK信号通路、PI3K/AKT信号通路等经典炎症-肿瘤信号通路。结论 隐结构模型方法诠释名老中医遣方用药以“调肝守恒”为路法，提供临床实践用药范式与借鉴。组方治疗慢性胃炎是多靶点、多成分、多通路的复杂过程，其可能是通过调节以上关键蛋白表达及信号通路，来发挥改善慢性胃炎相关症状，延缓、阻断炎-癌转化的作用。     

基于网络药理学和分子对接探讨地稔治疗宫颈癌的分子机制＊

目的 运用网络药理学方法探索地稔治疗宫颈癌的潜在作用机制。方法 通过检索相关文献得到地稔化学成分并筛选出地稔的活性成分，利用SwissTargetPrediction平台预测活性成分的潜在靶点。利用Genecards数据库检索宫颈癌相关靶点。利用Cytoscape3.7.2软件构建“地稔-活性成分-宫颈癌靶点”网络，并运用String数据库构建蛋白互作网络（protein-protein interaction，PPI）。使用OmicShare Tools数据库进行基因本体（Gene Ontology，GO）分析和京东基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，KEGG）富集分析。结果 得到地稔中活性成分28个、活性成分靶点420个、宫颈癌靶点150个，最后获得关键靶点7个，与地稔治疗宫颈癌显著相关的信号通路20条。地稔的主要活性成分为3-甲氧基鞣花酸、柚皮素、芹菜素等。地稔治疗宫颈癌关键靶点为STAT3、PIK3CA、AKT1、ESR1等；关键的生物进程和通路可能包括免疫系统过程、转录调节活性、内分泌与代谢相关信号通路、细胞周期信号转导通路等。另外，3-甲氧基鞣花酸成剂量依赖性地抑制人宫颈癌细胞Hela细胞的增殖。结论 本研究通过筛选发现地稔治疗宫颈癌的关键靶点及通路与细胞信号转导、细胞的增殖、分化、凋亡以及免疫调节等过程密切相关。因此，3-甲氧基鞣花酸可能主要通过影响宫颈癌细胞增殖和凋亡，从而达到治疗宫颈癌的目的。     

基于网络药理学的女贞子-黄芪药对的抗癌机制

目的:筛选女贞子-黄芪药对抗癌治疗的主要活性成分,预测活性成分的作用靶点,建立药物成分-活性成分-作用靶点网络,进一步探讨女贞子-黄芪药对抗癌治疗的潜在作用机制。方法:采用中药系统药理学技术平台(TCMSP)中筛选女贞子-黄芪的潜在活性成分,采用Dis Ge NET数据库与人类孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)预测和筛选其治疗癌症的作用靶点,采用omicshare平台(http://www. omicshare. com/)对药物靶点和疾病靶点进行匹配。借助Cytoscape软件构建"药物-活性成分-关键作用靶点"网络。采用String数据库构建蛋白质相互作用网络。采用DAVID数据库对女贞子-黄芪关键作用靶点进行生物功能及代谢通路分析。结果:通过筛选得到33个药物活性成分,共涉及203个作用靶点,与疾病靶点有关的活性成分为14个,主要通过调控ERBB2,AR,SRC,EGFR,ESR1等靶蛋白及癌症中的蛋白多糖通路、癌症通路、癌症中的微小mRNA(micro RNA)等通路等发挥抗癌治疗作用。结论:女贞子-黄芪药对对癌症的治疗作用体现了中药多成分-多靶点-多途径的特点,为阐释其抗癌治疗的作用机制与物质基础提供了科学依据。     

基于网络药理学和分子对接的当归六黄汤治疗围绝经期综合征作用机制研究

目的 采用网络药理学和分子对接技术研究当归六黄汤治疗围绝经期综合征（PMS）的作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和UniProt数据库检索当归六黄汤的活性成分和相应的靶点。基于GeneCards、DrugBank、OMIM数据库获取与PMS相关的靶点,并得到当归六黄汤与PMS的交集靶点。构建当归六黄汤活性成分-交集靶点相互作用网络。利用STRING在线数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析,筛选核心靶点。采用Metascape在线数据库进行基因本体（GO）功能注释及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集。通过Discovery Studio 2016进行分子对接,确定关键活性成分与核心靶点相互作用的分子基础。结果 共获取当归六黄汤112个活性成分,经筛选得到5个关键活性成分,分别为槲皮素、豆甾醇、β-谷甾醇、山柰酚、7-O-甲基-异微凸剑叶莎醇,主要发挥抗炎和雌激素样作用。获取当归六黄汤与PMS的交集靶点52个,经筛选得到5个核心靶点,分别是白细胞介素-6（IL-6）、前列腺素G/H合酶2（PTGS2）、雌激素受体1（ESR1）、IL-1B和糖皮质激素受体基因亚科3 C组成员1（NR3C1）,主要参与炎症反应和激素调节。KEGG富集分析显示,当归六黄汤治疗PMS主要通过化学致癌-受体激活、脂质和动脉粥样硬化、癌症、神经活性配体-受体相互作用、流体剪切应力和动脉粥样硬化、5-羟色胺能突触、雌激素信号通路、突触小泡循环、腺苷酸依赖的蛋白激酶（AMPK）信号通路等发挥作用。分子对接结果验证了当归六黄汤的关键活性成分可以与核心靶点蛋白形成稳定的对接模型。结论 基于网络药理学和分子对接技术,筛选出当归六黄汤治疗PMS的关键活性成分、核心靶点和主要信号通路,为当归六黄汤治疗PMS提供了参考。     

基于网络药理学探讨昆明山海棠-益母草药对治疗类风湿关节炎的机制

目的:运用计算机网络药理学技术筛选昆明山海棠-益母草药对治疗RA的的主要活性成分,预测活性成分的作用靶点,建立药物成分-活性成分-作用靶点网络,进一步探讨昆明山海棠-益母草药对治疗类风湿关节炎(RA)的潜在作用机制。方法:通过Dis Ge NET,TTD,Drugbank数据库收集RA疾病作用靶点;从中药系统药理学分析平台(TCMSP)获得昆明山海棠、益母草的潜在活性成分及其对应的靶点;使用Image GP平台筛选药物与疾病共有靶点;使用String数据库构建共有靶点互作(PPI)网络模型;采用Cytoscape软件建立"药物-活性成分-关键作用靶点"网络;采用String数据库构建蛋白质相互作用网络;利用Clue GO插件对靶点进行基因功能(GO)分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:通过筛选得到9个药物活性成分,共涉及235个作用靶点,与疾病靶点有关的活性成分为7个,得到昆明山海棠-益母草药对-疾病共同靶点24个,共同靶点主要富集于278个生物过程和141条信号通路上发挥治疗RA的作用。结论:昆明山海棠-益母草药对对RA的治疗作用体现了中药多成分-多靶点-多途径的特点,为阐释其治疗RA的作用机制与临床应用提供了科学依据。