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相似文献
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1.
目的 基于全基因组测序数据,通过内源性激活期间菌株基因组突变分析,开展结核分枝杆菌(MTB)分子钟研究。方法 筛选MTB内源性激活全基因组研究文献,下载全基因组测序数据,提取初治-复发配对样本单核苷酸多态性(SNP)差异和菌株分离时间,运用Poisson回归模型拟合初治-复发时间间隔与差异SNP的关系,计算MTB分子钟,估算突变率。结果 若MTB传代时间为18 h,0~2年短期内源性激活突变率为6.47×10-10(95%CI:5.59×10-10~7.44×10-10),明显高于2~14年长期内源性激活突变率(3.27×10-10,95%CI:2.88×10-10~3.69×10-10)。0~、1~、2~、3~、5~、7~14年突变率分别为7.10×10-10、6.06×10-10、4.24×10-10、5.34×10-10、2.59×10-10、1.26×10-10结论 内源性激活复发期间,MTB突变率随初治-复发时间间隔增加而下降,本研究从微观层面验证了临床实践观察到的初治结核病2年内易复发现象。  相似文献   

2.
目的 分析台州市2006-2019年HIV/AIDS抗病毒治疗免疫学失败情况、基线贫血与免疫学失败关联及其影响因素。方法 采用回顾性队列研究设计和Cox回归分析免疫学失败的影响因素,采用logistic回归分析HIV/AIDS基线贫血的影响因素。结果 共纳入2 904例HIV/AIDS,抗病毒治疗随访时间中位数为28(P25P75:12~53)个月。抗病毒治疗免疫学失败177例(占6.1%),失败率为2.17人/100人年,第1、3、5和10年免疫学失败累积发生率分别为5.49%、6.94%、7.30%和8.82%。多因素logistic回归分析结果显示,HIV/AIDS基线贫血的影响因素中,≥66岁组是18~25岁组的4.17倍(95% CI:1.68~10.33)、男性是女性的0.67倍(95% CI:0.50~0.89)、CD4<200个/μl是CD4≥350个/μl的4.35倍(95% CI:2.81~6.72)、基线白细胞计数<4.0×109/L是4.0×109/L~9.9×109/L的1.73倍(95% CI:1.31~2.29)、基线血小板计数<100×109/L和>300×109/L分别是100×109/L~299×109/L的2.02倍(95% CI:1.36~3.01)和4.45倍(95% CI:3.05~6.50)、WHO临床Ⅲ/Ⅳ期是Ⅰ/Ⅱ期的2.15倍(95% CI:1.61~2.87)、异性性传播是同性性传播的2.03倍(95% CI:1.42~2.92)。多因素Cox比例风险回归分析结果显示,HIV/AIDS抗病毒治疗免疫学失败的影响因素中,基线贫血是无贫血的1.77倍(95% CI:1.20~2.60)、WHO临床Ⅲ/Ⅳ期是Ⅰ/Ⅱ期的1.66倍(95% CI:1.10~2.48)、随访状态为退出和死亡分别是在治的3.18倍(95% CI:1.96~5.19)和4.61倍(95% CI:2.98~7.13)。结论 台州市HIV/AIDS抗病毒治疗免疫学效果受贫血、临床分期、随访状态等因素影响。应加强HIV/AIDS基线贫血监测,及时纠正老年贫血等危险因素,以进一步提高抗病毒治疗效果。  相似文献   

3.
北京市2010-2015年法定报告传染病流行特征分析   总被引:4,自引:0,他引:4       下载免费PDF全文
目的 分析北京市2010-2015年法定报告传染病发病趋势和流行特征,为完善法定报告传染病防控策略提供数据参考。方法 收集2010-2015年中国疾病预防控制信息系统中北京市报告的甲乙丙类法定报告传染病监测数据,进行流行病学分析。结果 2010-2015年,北京市共报告法定报告传染病病例764290例,年报告发病率在498.95/10万~828.45/10万之间,呈逐年下降趋势(χ2=1.25×104,P<0.01)。肠道传染病和呼吸道传染病年报告发病率均呈逐年下降趋势(χ2=1.25×104,P<0.01;χ2=4.97×102,P<0.01);分别占甲乙类报告总例数的39.72%和33.01%。男性报告发病率高于女性,7岁以下学龄前儿童年均发病率高于其他年龄组人群,占报告总例数的47.79%,高发职业主要是散居儿童,占全部报告病例的31.64%。发病顺位居前三位的病种连续6年均为其他感染性腹泻病、手足口病和痢疾。法定报告传染病实验室诊断率为16.67%,呈逐年升高趋势。结论 肠道传染病是目前北京市较为严重的法定报告传染病,应加强学龄前儿童尤其是散居儿童的传染病预防控制,进一步提高实验室诊断率以有效控制传染病的流行。  相似文献   

4.
目的 非综合征型唇裂合并或不合并腭裂(NSCL/P)是一类常见的出生缺陷,遗传致病因素一直是其病因学研究的热点。本研究拟基于家系设计在WNT代谢通路基因中探索亲源效应对NSCL/P发病风险的影响。方法 本研究人群为“唇腭裂的基因组学国际合作组研究”项目在中国地区募集的806个NSCL/P核心家系。利用对数线性模型探索WNT基因及其单体型的亲源效应与疾病的关联,采用Wald检验探索亲源效应与环境因素的交互作用。经过Bonferroni多重检验校正后,统计学检验的显著性阈值设为P<3.47×10-4结果 质量控制后共纳入7个基因上144个单核苷酸多态性位点进行分析。结果显示,NSCL/P家系中有8个位点具有潜在的亲源效应(P<0.05),但经Bonferroni多重检验校正后,均未达到统计学显著性水平(P>3.47×10-4)。NSCL/P家系中位于WNT9A rs4074668-rs12725747单体型(T-A)具有亲源效应,且经Bonferroni校正后差异仍有统计学意义(P=2.74×10-4)。但该单体型的亲源效应与环境因素(被动吸烟、复合维生素补充)的交互作用并未达到统计学显著水平。结论 WNT代谢通路基因可能通过亲源效应影响NSCL/P的发生风险。位于WNT9A基因rs4074668-rs12725747单体型(T-A)亲源效应与NSCL/P发病风险存在显著关联。未来仍需其他独立样本验证以进一步确认WNT代谢通路在NSCL/P发生中的作用。  相似文献   

5.
2008年和2018年广州市乙型肝炎流行病学特征比较   总被引:2,自引:1,他引:1       下载免费PDF全文
目的 比较2008年和2018年广州市1~59岁人群乙型肝炎(乙肝)血清流行病学调查结果。方法 采用二阶段整群抽样法,于2008年和2018年在广州市随机抽取1~59岁常住人口进行乙肝血清流行病学调查。结果 2008年调查1~59岁人群4 989名,2018年3 980名。2018年1~59岁人群HBsAg阳性率为9.50%(95%CI:7.34%~11.66%),较2008年(12.45%,95%CI:10.58%~14.33%)略有下降,差异无统计学意义(χ2=18.302,P=0.075);下降主要为7~16岁人群,2018年HBsAg阳性率为0.88%(95%CI:0.35%~1.42%),较2008年(4.54%,95%CI:2.71%~6.36%)下降80.62%,差异有统计学意义(χ2=34.144,P=0.000)。2018年1~59岁人群抗-HBs阳性率为72.30%(95%CI:69.56%~75.04%),较2008年(64.93%,95%CI:61.65%~68.22%)升高11.35%,差异有统计学意义(χ2=51.618,P=0.001);升高主要为17~59岁人群,2018年抗-HBs阳性率为71.93%(95%CI:68.90%~74.96%),较2008年(63.77%,95%CI:60.16%~67.37%)升高12.80%,差异有统计学意义(χ2=28.422,P=0.001)。2018年1~59岁人群HBV感染率为48.10%(95%CI:43.20%~53.00%),较2008年(62.27%,95%CI:59.11%~65.44%)下降22.76%,差异有统计学意义(χ2=167.138,P=0.000);其中1~、7~和17~59岁人群HBV感染率分别为4.58%、5.13%和56.56%(降幅分别为81.83%、85.91%和18.47%),高流行区域人群HBV感染率为48.87%(降幅24.70%),有乙肝疫苗接种史人群HBV感染率为28.81%(降幅38.75%)。结论 自2008年以来,广州市乙肝防控效果显著,儿童HBV感染率达到WHO消除乙肝2020年的目标,但仍属于高流行区,降低乙肝死亡率的目标任务相当艰巨,需继续做好新生儿乙肝疫苗接种工作和成年人的监测筛查工作。  相似文献   

6.
目的 分析福州市15~24岁MSM艾滋病监测数据,了解其HIV感染状况及其相关因素。方法 2016-2021年通过网络方式招募年龄15~24岁最近6个月与男性发生口交/肛交性行为的MSM,分析其社会人口学和行为学特征、HIV感染状况及其相关因素。结果 2016-2021年网络招募15~24岁MSM共4 234人。户籍为福建省外的比例由13.00%(85/654)上升到23.42%(163/696)(趋势χ2=60.23,P<0.001);通过网络寻找男性性伴的比例由93.27%(610/654)上升到99.71%(694/696)(趋势χ2=65.20,P<0.001);最近6个月最近1次肛交使用安全套比例由88.16%(484/549)下降至74.11%(415/560)(趋势χ2=32.32,P<0.001);最近6个月肛交每次使用安全套比例由65.76%(361/549)下降至55.54%(311/560)(趋势χ2=6.82,P<0.001);既往接受HIV抗体检测比例由5.66%(37/654)上升到25.29%(176/696)(趋势χ2=98.51,P<0.001)。累计监测15~24岁MSM HIV抗体阳性率为3.64%(154/4 234),历年监测15~24岁MSM的HIV抗体阳性率差异无统计学意义(趋势χ2=0.50,P=0.453)。初中及以下文化程度、居住时间1~2年者HIV抗体阳性率均呈上升趋势(P<0.05)。HIV感染风险的多因素logistic回归分析结果显示,高中/中专、大专及以上文化程度者分别是初中及以下文化程度者的0.54(95%CI:0.30~0.99)倍、0.29(95%CI:0.17~0.51)倍,本地居住时间1~2年、>2年者是本地居住时间<1年者的0.35(95%CI:0.16~0.74)倍、0.58(95%CI:0.37~0.91)倍,每次肛交坚持使用安全套者是从未使用者的0.18(95%CI:0.08~0.42)倍,未患过性病者是患过性病者的0.25(95%CI:0.13~0.50)倍。结论 福州市15~24岁MSM存在较高HIV感染风险,应加强对流动和较低文化程度青少年MSM的互联网干预。  相似文献   

7.
ARIMA乘积季节模型在陕西省手足口病预测中的应用   总被引:2,自引:2,他引:0       下载免费PDF全文
目的 应用自回归求和移动平均(ARIMA)乘积季节模型预测陕西省手足口病发病人数。方法 利用R软件对2009年1月至2015年6月手足口病数据构建ARIMA乘积季节模型,同时利用2015年7-12月实际发病人数与模型拟合数据比较,评价模型的预测性能,预测2016-2017年的手足口病发病人数。结果 陕西省手足口病发病人数具有明显的季节性,建立了ARIMA(2,1,0)×(1,1,0)12乘积季节模型,预测方程为(1-B)(1-B12)Ln(Xt)=((1-1.000B)/((1-0.532B-0.363B2)(1-0.644B12-0.454B122)))εt,与2015年7-12月实际发病人数比较,绝对误差的平均值为531.535,相对误差的平均值为0.114,预测2016-2017年陕西省手足口病发病人数与2015年基本保持一致。结论 ARIMA(2,1,0)×(1,1,0)12乘积季节模型可用于陕西省手足口病的发病人数预测。  相似文献   

8.
目的 了解浙江省台州市2009-2012年新报告成年HIV感染者中合并感染HCV的情况, 分析HIV/HCV合并感染者中血浆HCV病毒载量水平。 方法 对2009-2012年浙江省台州市新报告的572例成年HIV感染者检测HCV抗体, 并对HCV抗体阳性的标本进行HCV RNA定量检测。 结果 共有42例HCV抗体检测阳性, HIV感染者中HCV合并感染率为7.3%(95%CI: 5.2%~9.5%)。46~86岁HIV感染者的HCV合并感染率显著低于18~45岁年龄组(OR=0.12, 95%CI: 0.02~0.58);高中及以上文化程度的HIV感染者HCV合并感染率显著低于小学及以下文化程度者(OR=0.13, 95%CI: 0.02~0.78);经血传播HIV感染者HCV合并感染率显著高于异性传播HIV感染者(OR=49.46, 95%CI: 13.71~178.48);同性传播HIV感染者HCV合并感染率则低于异性传播HIV感染者(OR=0.11, 95%CI: 0.01~0.86)。42例HIV/HCV合并感染者中33例(78.6%)血浆HCV病毒载量在检测限以上, HCV复制相对活跃, 其中HBsAg阳性者血浆HCV RNA检出率(100%)显著高于HBsAg阴性者(75.7%)(P=0.002)。9例(21.4%)血浆HCV病毒载量则低于检测下限(5.0×102 IU/ml), 处于相对抑制状态。单因素logistic回归分析未发现HIV/HCV合并感染者HCV相对抑制率与其社会人口学特征、HIV传播途径、CD4+T淋巴细胞计数等有关联。 结论 浙江省台州市HIV感染者中HCV感染率较高, 多数HIV/HCV合并感染者血浆HCV病毒载量也较高, 其对病情进展影响有待持续观察。  相似文献   

9.
目的 探讨不同BMI水平对新发急性胰腺炎(AP)发病风险的影响。方法 观察人群来自开滦研究队列,按基线BMI水平分为:正常体重组(BMI<24 kg/m2),超重组(BMI 24~28 kg/m2)和肥胖组(BMI ≥ 28 kg/m2),观察不同BMI组人群新发AP发病密度。经Kaplan-Meier法绘制生存曲线,计算累积发病率,以log-rank法进行检验,并采用多因素Cox比例风险回归模型分析基线BMI水平对新发AP事件的影响。结果 共纳入统计分析者123 841人,随访(11.94±2.13)年,共发生AP 395例,总人群AP发病密度为2.67例/万人年,正常体重组、超重组和肥胖组AP发病密度分别为2.20、2.72和3.58例/万人年,累积发病率分别为0.32%、0.40%和0.49%。经log-rank检验,累积发病率的组间比较差异有统计学意义(χ2=13.17,P<0.01)。校正多因素Cox比例风险回归模型分析显示,与正常体重组比较,肥胖组AP发病风险增加,HR=1.45(95%CI:1.10~1.92)。对年龄及性别进行分层,年龄<60岁时,肥胖组发生AP的HR=1.58(95%CI:1.14~2.19);男性肥胖组发生AP的HR=1.40(95%CI:1.03~1.90)。排除随访2年内发生的AP病例,肥胖组发生AP的HR=1.60(95%CI:1.18~2.15)。结论 肥胖是新发AP的危险因素,中青年男性肥胖人群发病风险更高。  相似文献   

10.
目的 探讨在不同血压水平人群中,血小板参数与新发脑卒中发生风险的关联。方法 研究人群来源于东风-同济队列第1次随访调查到的38 295名东风汽车公司离、退休职工。选取基线未患冠心病、脑卒中、癌症以及未失访者,排除有抗血小板用药史以及血小板参数和血压缺失者,最终纳入21 294名研究对象。纳入分析的研究对象均完成了问卷调查、体格检查、生化指标检查和血液样本采集。采用Cox比例风险回归模型分析不同血压水平人群中各血小板参数与脑卒中及其亚型发生风险的关联,并计算风险比(HR)和95% CI结果 平均随访8.0年后,1 578人发生脑卒中,其中缺血性脑卒中(IS)1 266例,出血性脑卒中(HS)312例。在高血压人群中,与血小板计数(PLT)<188×109/L者相比,PLT ≥ 188×109/L者脑卒中及IS的发生风险显著增加,HR值(95% CI)分别为1.27(1.12~1.44)和1.39(1.21~1.60)。在高血压人群中,与血小板压积(PCT)<0.165%者相比,PCT ≥ 0.165%者的脑卒中(HR=1.15,95% CI:1.01~1.30)发生风险显著增加,HS(HR=0.70,95% CI:0.53~0.93)发生风险显著降低;在非高血压和高血压人群中,PCT ≥ 0.165%者IS的发生风险均显著增加,HR值(95% CI)分别为1.27(1.05~1.54)和1.31(1.14~1.50)。在各血压水平分类人群中均未发现平均血小板体积、血小板分布宽度水平与脑卒中发生风险之间的关联。与血小板参数水平较低的非高血压人群相比,在各血小板参数水平下高血压人群的脑卒中发生风险均明显升高。结论 高水平PLT和PCT显著增加中老年高血压人群脑卒中及IS发生风险,低PCT水平显著降低高血压人群HS发生风险。  相似文献   

11.
Banna virus (BAV) is an emerging pathogen that causes human viral encephalitis and has been isolated from types of blood-sucking insects and mammals in Asia. However, there are no reported systematic studies that describe the origin and evolution of BAV. Here, a phylogenetic analysis of BAVs isolated from a variety of potential vectors and vertebrate hosts worldwide revealed that BAVs emerged in the beginning of the 20th century and do not exhibit a species barrier. The mean substitution rate of BAVs was 2.467 × 10 2 substitution/site/year (95% HPD, 1.093 × 10 3 to 5.628 × 10 2). The lineage is mainly composed of BAVs from high-latitude regions, which are the most recently emerged viruses with significantly higher substitution rates compared with the lineage comprised of the isolates from middle or low-latitude regions. The genetic differences between BAV strains are positively correlated with the geographic distribution. Strains from the same latitude regions are almost 100% identical, whereas the differences between strains from long distance regions with different latitudes could be > 60%. Our results demonstrate that BAV is an emerging virus at a stage that involves rapid evolution and has great potential for introduction into non-endemic areas. Thus, enhanced surveillance of BAV is highly recommended worldwide.  相似文献   

12.
目的 探讨孕期增重及其总增重与妊娠期糖尿病(GDM)的关系。方法 采用前瞻性队列研究,于2013年3-9月选取成都市妇幼医疗机构产前门诊829名单胎健康孕妇作为基线调查对象,通过问卷调查于首次纳入时收集孕妇孕前等基线资料,于孕第(12±1)、(28±1)、(36±1)周及分娩前分别收集孕妇锻炼习惯、膳食摄入情况等信息和测量孕妇体重,分娩后收集分娩孕周等分娩信息。GDM诊断按中国妊娠合并糖尿病防治指南(2014),采用多因素logistic回归分析孕早、中、晚期增重和孕期总增重与GDM的关系。结果 共682名孕妇纳入数据分析。控制生育年龄、孕前BMI、糖尿病家族史、高血压家族史、孕早期锻炼、产次、文化程度、家庭人均月收入及膳食能量等混杂因素后,多因素logistic回归分析显示:与孕早期增重适宜组相比,孕早期增重不足组和增重过多组GDM发生风险均增加(分别为OR=1.23,95% CI:0.63~2.38和OR=2.20,95% CI:1.12~4.35);与孕中期增重适宜组相比,孕中期增重不足组和过多组GDM发生风险均降低(OR=0.47,95% CI:0.18~1.19和OR=0.78,95% CI:0.43~1.42);与孕晚期增重适宜组相比,孕晚期增重不足组GDM发生风险增加(OR=1.48,95% CI:0.77~2.84),增重过多组GDM发生风险降低(OR=0.53,95% CI:0.28~0.99);与孕期总增重适宜组相比,总增重不足组GDM发生风险增加(OR=2.16,95% CI:1.04~4.46),总增重过多组GDM发生风险降低(OR=0.74,95% CI:0.38~1.46)。结论 孕早期增重不足和过多均可能增加GDM发生风险,孕早期可能是影响GDM发生的关键时期,孕中晚期增重对GDM的影响还有待进一步论证。  相似文献   

13.
目的 了解杭州市城区成年居民步行与建成环境主观感知之间的关系。方法 2012年采用多阶段分层随机抽样方法选取杭州市城区25~59岁居民开展面对面问卷调查。采用国际体力活动量表长版(IPAQ-L)和社区步行环境量表简版(NEWS-A)评价居民过去1周交通出行相关步行时间、休闲性步行时间以及建成环境主观感知。利用多因素logistic回归法分析步行与建成环境主观感知得分的关联性。结果 杭州市城区成年居民过去1周总体力活动得分M=2 766 met·min-1·week-1,平均1周休闲相关步行时间为90 min,平均1周交通相关步行时间则为100 min。控制年龄、BMI、婚姻状况、工作状态、文化程度、居住社区类型、总体力活动水平后,男性(OR=0.764,95%CI:0.588~0.992)和女性(OR=0.633,95%CI:0.481~0.833)的休闲性步行时间均与场所设施可及性维度得分呈负相关,女性休闲性步行时间还与住宅密度维度得分呈负相关(OR=0.997,95%CI:0.996~0.999),女性交通出行相关步行时间则与步行道/自行车道维度得分呈正相关(OR=1.537,95%CI:1.138~2.075)。男性交通出行相关步行时间与建成环境主观感知各维度得分的关联均无统计学意义。结论 可通过改善步行道/自行车道等建成环境促进成年居民的交通相关步行时间,开展成年人步行的环境干预时需要考虑性别差异。  相似文献   

14.
目的 分析N-亚硝胺与消化道恶性肿瘤发生/死亡风险的关系。方法 通过系统检索中国生物医学文献数据库、中文期刊全文数据库、万方电子期刊、PubMed、EBSCO等文献数据库,纳入N-亚硝胺与消化道恶性肿瘤发生/死亡风险队列研究文献,采用RevMan 5.1软件进行Meta分析。结果 共检索到相关文献13篇,纳入其中7篇含有消化道恶性肿瘤的文献进行Meta分析;N-亚硝胺显著增加消化道癌症的发生风险(RR=1.12,95%CI:1.03~1.21);与食管癌发生风险无显著性关联(RR=1.18,95%CI:0.98~1.41),但显著增加食管鳞状细胞癌发生风险(RR=1.72,95%CI:1.01~2.96),而与食管腺癌无显著性相关(RR=0.88,95%CI:0.57~1.37);N-亚硝胺能显著提高胃癌的发生风险(RR=1.08,95%CI:1.00~1.18),但对贲门癌与胃腺癌发生风险的影响无显著性。结论 现有人群队列研究证据显示,N-亚硝胺会显著增加消化道恶性肿瘤的发生风险,但是对不同亚型食管癌和胃癌的影响不同,由于队列研究数量较少且在研究设计、人群选择、暴露测量等方面存在差异,仍需进一步积累相关研究证据。  相似文献   

15.
目的 探讨气象因素对我国手足口病患病的影响。方法 采用层次Bayes模型[Besag, York, and Mollie''(BYM) model]对数据进行拟合, 比较空间异质模型(UH)、空间相关模型(CH)和时空交互效应模型对数据的拟合效果, 选取最优模型结合生态学分析手足口病的气象影响因素。结果 加入协变量的时空交互CH+UH拟合效果较优(DIC=35 507.2), 降水量(RR=1.051 7, 95%CI:1.050 4~1.052 5)、平均气压(RR=1.076 4, 95%CI:1.074 8~1.077 9)、平均温度(RR=1.089 6, 95%CI:1.078 1~1.106 9)、平均相对湿度(RR=1.089 0, 95%CI:1.082 1~1.091 2)和日照时数(RR=1.085 1, 95%CI:1.079 8 ~1.087 5)是手足口病的危险因素。结论 手足口病的发生具有时空聚集的特点, 气象因素与手足口病的发生关系密切。  相似文献   

16.
目的了解北京市35~75岁居民心血管病高危的特征与现状, 对心血管病防控策略与措施的制定完善提供科学参考依据。方法根据北京市2016年9月至2019年11月心血管病高危人群早期筛查与综合干预项目资料, 纳入北京市8个区93 520名35~75岁常住居民为调查对象进行分析。采用χ2检验比较不同特征人群心血管病高危比例, 采用多因素logistic回归模型分析人群特征与心血管病高危之间的关系。结果心血管病高危人群比例为20.82%(19 471/93 520)。65~75岁年龄组高危人群比例较高, 为29.05%(5 151/17 733), 不同年龄调查对象高危人群比例差异有统计学意义(χ2=3 359.37, P<0.001), 且高危人群比例随年龄增加而增高(趋势χ2=3 121.75, P<0.05)。男性高危人群比例为31.19%(10 752/34 476), 高于女性的14.77%(8 719/59 044), 差异有统计学意义(χ2=3 559.87, P<0.05)。多个危险因素聚集分布情况中最多为高血压合并糖尿病(29.80%, 5 802/19 47...  相似文献   

17.
A major limitation when reconstructing the origin and evolution of HPV-16 is the lack of reliable substitution rate estimates for the viral genes. On the basis of the hypothesis of human HPV-16 co-divergence, we estimated a mean evolutionary rate of 1.47 × 10 7 (95% HPD = 0.64–2.47 × 10 7) subs/site/year for the viral LCR region. The results of a Bayesian phylogeographical analysis suggest that the currently circulating HPV-16 most probably originated in Africa about 110 thousand years ago (Kya), before giving rise to four known geographical lineages: the Asian/European lineage, which most probably originated in Asia a mean 38 Kya, and the Asian/American and two African lineages, which probably respectively originated about 33 and 27 Kya. These data closely reflect current hypotheses concerning modern human expansion based on studies of mitochondrial DNA phylogeny. The correlation between ancient human migration and the present HPV phylogeny may be explained by the co-existence of modes of transmission other than sexual transmission.  相似文献   

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